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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI015049 | Chr1 | 8076213 | 8081801 | - | High mobility group B protein 15 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI015049.m1 | 42 | 125 | PF01388.24 | ARID | Domain | 63.4 | 2.60E-17 |
| LITCHI015049.m1 | 260 | 328 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 40.3 | 3.70E-10 |
| LITCHI015049.m1 | 262 | 329 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 57.7 | 1.30E-15 |
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>LITCHI015049.m1 ATGGCCTCAACTTCTTGCGCCAAGCAGAGCCCTCTTCCCATGAAAGAACCGCCCTCTACC TCTCCTCCTCATCCATGTCCACCACTGCCTCTTGCTAGATATGAGGATATTGTTAATAGT CCCAAGCTCTTCATGGCTTCTCTTGAGAAGCTTCATGCTACTATGGGAACTAAGTTTATG ATCCCTATTATTGGAGGAAAGGAGTTAGACTTGCATCTGCTTTTTGTGGAGGTGACTTCT CGTGGCGGTATTGAGAAGATTATAAAAGAGAGAAGATGGAAAGAAGTTACTGCTATATTC AACTTTCCATCCACTGCTACAAATGCTTCTTTTGTACTGCGCAAATACTACATCTCATTG CTTCACCATTACGAACAAGTTTACTACTTTAGATCCCACGATTCATGGCAGAGCCCATCA ACACCTTCTGTGCCAGTTCTAGGGACAGCATTGTCATCATCTCCAGATGTTCAAGCGGCT GATATCCAGCAGCCAAGGACTAATACTGGAGTGGTGTCTGGAGGAAAACCAGCTTCCTCT TCAGCAACTCAGGTGTTAGGGGTGATTGATGGGAAATTTGAAAGTGGGTATCTAGTTACT GTCACTATAGGCTCAGAGAAGCTAAAAGGTGTCCTTTATCTGGCTCCACAGAGCCGTGCA CACCAAGTACCACCTTCTTATAATCTTTCCACCAATAATAGTGACAATACTATCTCTGTC TCTGGGGTGCAACGTCGTCGCCGCCGGAAGAAATCCGAGATTAAAAGGAGGGATCCTGCT CATCCGAAGCCTAACAGAAGTGGGTACAATTTCTTCTTTGCTGAGCAGCATGCCAGACTG AAACCACTACATCCAGGGAAAGACAGGGAGATCAGTCGAATGATTGGTGAATTGTGGAAC AAGCTGAAGGAGTCTGAAAAGACTGTTTATCAGGAGAAAGCTCTGAAAGATAAAGAAAGG TACAGAATAGAGATGGAGGATTACAGGGAGAGGCTGAGGACAGGTCAAGTTGTCAGTGAT GCTGTGCCACTACAGCAGCGACTTCCTGAACCAGATGTAAATATGGTGGAAGCAGACATA AAACTTGATGAAGCTGGGGCTGATTCTCCTCAGACTCCAGAAAATGAGAGTAATTCTGAT GGAAGCGACTGTGAAGATGAAACTGCTGAGAAGGATATGGATATAGAAGCATCTCCAGTA GTGGGATTAGGTGCTGAATCTAGCAATGTGGGTGTGGAGACTTCAACTGAGGAGCCAGCT TTTCAGCTGCCTAAGGGTGAAGCAAATGTTGGAGAGAATAGAGATCAAAAAGTTGGCGAT TATGCTATCGCAGACGTGGTTGAAAAGGCCAGAGATGACAGTGGAGAAAGGTTAGCTGGT GCTTTGGTGGAGATAAAGCAACAATTGCTGCCCAGTGCAGAGCAGTAG
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>LITCHI015049.m1 MASTSCAKQSPLPMKEPPSTSPPHPCPPLPLARYEDIVNSPKLFMASLEKLHATMGTKFM IPIIGGKELDLHLLFVEVTSRGGIEKIIKERRWKEVTAIFNFPSTATNASFVLRKYYISL LHHYEQVYYFRSHDSWQSPSTPSVPVLGTALSSSPDVQAADIQQPRTNTGVVSGGKPASS SATQVLGVIDGKFESGYLVTVTIGSEKLKGVLYLAPQSRAHQVPPSYNLSTNNSDNTISV SGVQRRRRRKKSEIKRRDPAHPKPNRSGYNFFFAEQHARLKPLHPGKDREISRMIGELWN KLKESEKTVYQEKALKDKERYRIEMEDYRERLRTGQVVSDAVPLQQRLPEPDVNMVEADI KLDEAGADSPQTPENESNSDGSDCEDETAEKDMDIEASPVVGLGAESSNVGVETSTEEPA FQLPKGEANVGENRDQKVGDYAIADVVEKARDDSGERLAGALVEIKQQLLPSAEQ.
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>LITCHI015049.m1 ATGGCCTCAACTTCTTGCGCCAAGCAGAGCCCTCTTCCCATGAAAGAACCGCCCTCTACC TCTCCTCCTCATCCATGTCCACCACTGCCTCTTGCTAGATATGAGGATATTGTTAATAGT CCCAAGCTCTTCATGGCTTCTCTTGAGAAGCTTCATGCTACTATGGGAACTAAGTTTATG ATCCCTATTATTGGAGGAAAGGAGTTAGACTTGCATCTGCTTTTTGTGGAGGTGACTTCT CGTGGCGGTATTGAGAAGATTATAAAAGAGAGAAGATGGAAAGAAGTTACTGCTATATTC AACTTTCCATCCACTGCTACAAATGCTTCTTTTGTACTGCGCAAATACTACATCTCATTG CTTCACCATTACGAACAAGTTTACTACTTTAGATCCCACGATTCATGGCAGAGCCCATCA ACACCTTCTGTGCCAGTTCTAGGGACAGCATTGTCATCATCTCCAGATGTTCAAGCGGCT GATATCCAGCAGCCAAGGACTAATACTGGAGTGGTGTCTGGAGGAAAACCAGCTTCCTCT TCAGCAACTCAGGTGTTAGGGGTGATTGATGGGAAATTTGAAAGTGGGTATCTAGTTACT GTCACTATAGGCTCAGAGAAGCTAAAAGGTGTCCTTTATCTGGCTCCACAGAGCCGTGCA CACCAAGTACCACCTTCTTATAATCTTTCCACCAATAATAGTGACAATACTATCTCTGTC TCTGGGGTGCAACGTCGTCGCCGCCGGAAGAAATCCGAGATTAAAAGGAGGGATCCTGCT CATCCGAAGCCTAACAGAAGTGGGTACAATTTCTTCTTTGCTGAGCAGCATGCCAGACTG AAACCACTACATCCAGGGAAAGACAGGGAGATCAGTCGAATGATTGGTGAATTGTGGAAC AAGCTGAAGGAGTCTGAAAAGACTGTTTATCAGGAGAAAGCTCTGAAAGATAAAGAAAGG TACAGAATAGAGATGGAGGATTACAGGGAGAGGCTGAGGACAGGTCAAGTTGTCAGTGAT GCTGTGCCACTACAGCAGCGACTTCCTGAACCAGATGTAAATATGGTGGAAGCAGACATA AAACTTGATGAAGCTGGGGCTGATTCTCCTCAGACTCCAGAAAATGAGAGTAATTCTGAT GGAAGCGACTGTGAAGATGAAACTGCTGAGAAGGATATGGATATAGAAGCATCTCCAGTA GTGGGATTAGGTGCTGAATCTAGCAATGTGGGTGTGGAGACTTCAACTGAGGAGCCAGCT TTTCAGCTGCCTAAGGGTGAAGCAAATGTTGGAGAGAATAGAGATCAAAAAGTTGGCGAT TATGCTATCGCAGACGTGGTTGAAAAGGCCAGAGATGACAGTGGAGAAAGGTTAGCTGGT GCTTTGGTGGAGATAAAGCAACAATTGCTGCCCAGTGCAGAGCAGTAGGATCTTCTGGGA TGAAGTAGGTTAGCTTCATTATGTTAATTATAGCCTTTGCGAAGTATAGTTTCTATTAAA TAACAGAGTTTTCATTTGTTGATTCTCACCGATAGTTATTTTTCGTTTGTAAAAACTGCA TTGCTGTCAGGAATGTTGTTACCTTCTTGGGAGACAGCTAGAATGTTAGGCCTGTTTCAG GCAGTTTTGTAGTTATAAGTTTCGATGCTTTCGTCGAATCAACATTCTAGGCCATATGAC AGCGCCAGTAGGAATTAACATTACTGAGTAAAGATCCTTAGCAGTCTTTGGTAACAAATG CAAGTCTCAGGAAATTTTTCATGTTGATGTATTCTTTGTGAACTGTGCTGTGATGGTGAG TCTCTAAGCTTAATGAGTTGAAGTGATCTTGAAATGCATATTCGGTTG
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>LITCHI022146.m2 - Up_Stream_Len 2000 TTAGGGTTATGGTCCCCAAGTCAAATCAACATATTTTTGTTATCTTTTCTCTTCCCCCAT TTAAGAAGAAAAATATAGAGTAACCTAATGAGATTTGACTGTGAAATATTCAATTCTACT CAGATTTAACAATATGGATTCATGTATGTTTTCTATAATAATTCATATTGATTTAATATC AGTTTCTAGATTTTAATATATGTTCACCTATCAAGTTGTTTTCAACAGTGAAATCTCCAA AAAATTGAAAAAAAAAATACAAAAATTAGTAGGTAATCGAAAATATGATAAGTCGTCTAA GTCGAGTTTTATTTTATTTGAAAAATGTATATTATTGAAATTTAAATGGCAATGTTTAAA ATCTGAACTTAATGATAATAATTTAAGCTTAGATTAACGAAGGTTGAAGCAAAAACTCCA AAGCTGAGAAGGAAATTTAAAAAAATAAGTAAAGAGGCAAAAGTTTGTTAAACTAGTTAA GTTGTGTTTTTGCATTTGAAAATGCATATTATTAATATTCGATCGATGATCTTTGAAATT TGAATGCTCAATATTAATGATCTAAGCTTAAGTTACTTGAGATTGGGAAGAAAACTCCAA AACCAAAAAAAGAAACAATGAATTATCAACAGTTTGCGAAGTCTACTACGATGAGCTTTG ATTATTTTAATTGAAAAATATATATTAACGAAACTTGAACAATGATCCATAAAATTGGAT GGTTAATATTGATGATTTAAACCTAGATTATTTGAGACTGAAGTAAAAACTCAAAAGCAA AAAGGAAAAGAAATTAAAACATATATGTATATAATCAAAAGTCTGCTAAATCGATTTGGT CGAGTTTTGTCTGACTAAGTTAAAGGATGTATTAATATTGAAACTTAAACAATAATCTTT GAAGTCTGAATACTAAATATAGATGAATTAAACTTAGATTGATTGAGGTTGAAGTGAAAA CTATAAAGATAAGAGTGGATAAATTAAAATCTTTTGAGTTGGAAGGGTTGAGTTTTGATT ATTTAGAGAAAAATGGTTTGGTCTAATGATAAGACCAAACTCACCTACTAATTATCTTCA AATGGTGGGTTCGATTCAATAAAGTGTCGCTAATATGTGAGCAATTTTTCATTTTCGTGT GAATAGCTCTTTTTTATCTTTTAAAAGTAGAGATCCGGATTATAAAATTCTATTTCAGTT GGTTTCGATAGTCATGTGATCCGGTGTCAGTAAGTTAAAAAAAAAAAATGATTATTTTAG TTAAAAGTTTATGTTATATATATTTATTTATATTATCAAAACTCTGAACAATGATATTTG AAATTCGAATATTGAGATCACACATTATAAACCTCATGAATTAATATGGAAATTCAATTA AAAAATAACAACGAGACTTAAAAATTCGACTTCCCAACTGTCATCTAACTAGTCAACCAT CTTCCTTACTACATTCGACGTCTTCTCACTGGCTGCCACGTCTACACCACACCTAACTAA ACACACACAGTATCTCCAATCACATTCGCACCCACATGCTTCCCTTATCGCGTGAAACAA ACTCAAAATCTCAACCCTCCATCCATCAGCCCACAACCGTGCCAGCCCACCCCGCGTGAC ATCCGCTTGGTCTCGTCGGGCCAATAAACACGGCAAAACCCAACACAAAAGTATAAAAAC GATAGATCCGCATCCGATTCATGAAAACCTAAAATGGAGTTTTGCCATTTTCGTAATTAT TTCCATTTCCTGACCCAAAATATGCTACCATAAATATCCATATATAAACCGCCACTCTGC TGTTTAACAAACTCTCCCTCGAAATGGACTCACTATTCACTAACAACTACATCAACAACA GGTACGCCTAAAACCCTAGAATTCAAATTCGTTTATTTTTATTAAAAAATTGAATTGATA GAGGATTTATAGATGTATGTACGTGTTGATGCGATAGAGATAGTTAATTTCTTGTGTACG TGGTGGTGGTGGTGTTGTTA >LITCHI022146.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTAGGGTTATGGTCCCCAAGTCAAATCAACATATTTTTGTTATCTTTTCTCTTCCCCCAT TTAAGAAGAAAAATATAGAGTAACCTAATGAGATTTGACTGTGAAATATTCAATTCTACT CAGATTTAACAATATGGATTCATGTATGTTTTCTATAATAATTCATATTGATTTAATATC AGTTTCTAGATTTTAATATATGTTCACCTATCAAGTTGTTTTCAACAGTGAAATCTCCAA AAAATTGAAAAAAAAAATACAAAAATTAGTAGGTAATCGAAAATATGATAAGTCGTCTAA GTCGAGTTTTATTTTATTTGAAAAATGTATATTATTGAAATTTAAATGGCAATGTTTAAA ATCTGAACTTAATGATAATAATTTAAGCTTAGATTAACGAAGGTTGAAGCAAAAACTCCA AAGCTGAGAAGGAAATTTAAAAAAATAAGTAAAGAGGCAAAAGTTTGTTAAACTAGTTAA GTTGTGTTTTTGCATTTGAAAATGCATATTATTAATATTCGATCGATGATCTTTGAAATT TGAATGCTCAATATTAATGATCTAAGCTTAAGTTACTTGAGATTGGGAAGAAAACTCCAA AACCAAAAAAAGAAACAATGAATTATCAACAGTTTGCGAAGTCTACTACGATGAGCTTTG ATTATTTTAATTGAAAAATATATATTAACGAAACTTGAACAATGATCCATAAAATTGGAT GGTTAATATTGATGATTTAAACCTAGATTATTTGAGACTGAAGTAAAAACTCAAAAGCAA AAAGGAAAAGAAATTAAAACATATATGTATATAATCAAAAGTCTGCTAAATCGATTTGGT CGAGTTTTGTCTGACTAAGTTAAAGGATGTATTAATATTGAAACTTAAACAATAATCTTT GAAGTCTGAATACTAAATATAGATGAATTAAACTTAGATTGATTGAGGTTGAAGTGAAAA CTATAAAGATAAGAGTGGATAAATTAAAATCTTTTGAGTTGGAAGGGTTGAGTTTTGATT ATTTAGAGAAAAATGGTTTGGTCTAATGATAAGACCAAACTCACCTACTAATTATCTTCA AATGGTGGGTTCGATTCAATAAAGTGTCGCTAATATGTGAGCAATTTTTCATTTTCGTGT GAATAGCTCTTTTTTATCTTTTAAAAGTAGAGATCCGGATTATAAAATTCTATTTCAGTT GGTTTCGATAGTCATGTGATCCGGTGTCAGTAAGTTAAAAAAAAAAAATGATTATTTTAG TTAAAAGTTTATGTTATATATATTTATTTATATTATCAAAACTCTGAACAATGATATTTG AAATTCGAATATTGAGATCACACATTATAAACCTCATGAATTAATATGGAAATTCAATTA AAAAATAACAACGAGACTTAAAAATTCGACTTCCCAACTGTCATCTAACTAGTCAACCAT CTTCCTTACTACATTCGACGTCTTCTCACTGGCTGCCACGTCTACACCACACCTAACTAA ACACACACAGTATCTCCAATCACATTCGCACCCACATGCTTCCCTTATCGCGTGAAACAA ACTCAAAATCTCAACCCTCCATCCATCAGCCCACAACCGTGCCAGCCCACCCCGCGTGAC ATCCGCTTGGTCTCGTCGGGCCAATAAACACGGCAAAACCCAACACAAAAGTATAAAAAC GATAGATCCGCATCCGATTCATGAAAACCTAAAATGGAGTTTTGCCATTTTCGTAATTAT TTCCATTTCCTGACCCAAAATATGCTACCATAAATATCCATATATAAACCGCCACTCTGC TGTTTAACAAACTCTCCCTCGAAATGGACTCACTATTCACTAACAACTACATCAACAACA GGTACGCCTAAAACCCTAGAATTCAAATTCGTTTATTTTTATTAAAAAATTGAATTGATA GAGGATTTATAGATGTATGTACGTGTTGATGCGATAGAGATAGTTAATTTCTTGTGTACG TGGTGGTGGTGGTGTTGTTA
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>LITCHI022146.m2 GenomeSequence - CTAACTAAACACACACAGTATCTCCAATCACATTCGCACCCACATGCTTCCCTTATCGCG TGAAACAAACTCAAAATCTCAACCCTCCATCCATCAGCCCACAACCGTGCCAGCCCACCC CGCGTGACATCCGCTTGGTCTCGTCGGGCCAATAAACACGGCAAAACCCAACACAAAAGT ATAAAAACGATAGATCCGCATCCGATTCATGAAAACCTAAAATGGAGTTTTGCCATTTTC GTAATTATTTCCATTTCCTGACCCAAAATATGCTACCATAAATATCCATATATAAACCGC CACTCTGCTGTTTAACAAACTCTCCCTCGAAATGGACTCACTATTCACTAACAACTACAT CAACAACAGGTACGCCTAAAACCCTAGAATTCAAATTCGTTTATTTTTATTAAAAAATTG AATTGATAGAGGATTTATAGATGTATGTACGTGTTGATGCGATAGAGATAGTTAATTTCT TGTGTACGTGGTGGTGGTGGTGTTGTTAATGGGGAAGGGAAGAACTAGGGTTGTGTCTGG TCAGAATTTGGGTGTTTTATCGACTGTGAAGTCTGGGTTGTTGAATATACCATCTGGACC TGTTTATTATCCTAGTGAGGAGGAATTTAAGGATCCTTTAGAGTATGTGTATAAGATCAG GCCAGAGGCTGAGCCTTATGGGATTTGTAAGATTGTTCCGCCGAAGAGTTGGAGACCCCC GTTTGCGTTGGACTTAGATGCCTTTGAGTTTCCTACGAAAACGCAGGCGATCCATCAGTT GCAGGCGCGGCCTGCTGCATGTGATTCAAAGACTTTTGAGTTGGAGTATGGGAGGTTTTT GGAGGAGCATTGCGGGAAGAAGCTGAAGAAGAAGGTGTTGTTTGAGGGGGAGGAGTTGGA 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