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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI015049 | Chr1 | 8076213 | 8081801 | - | High mobility group B protein 15 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI015049.m1 | 42 | 125 | PF01388.24 | ARID | Domain | 63.4 | 2.60E-17 |
| LITCHI015049.m1 | 260 | 328 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 40.3 | 3.70E-10 |
| LITCHI015049.m1 | 262 | 329 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 57.7 | 1.30E-15 |
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>LITCHI015049.m1 ATGGCCTCAACTTCTTGCGCCAAGCAGAGCCCTCTTCCCATGAAAGAACCGCCCTCTACC TCTCCTCCTCATCCATGTCCACCACTGCCTCTTGCTAGATATGAGGATATTGTTAATAGT CCCAAGCTCTTCATGGCTTCTCTTGAGAAGCTTCATGCTACTATGGGAACTAAGTTTATG ATCCCTATTATTGGAGGAAAGGAGTTAGACTTGCATCTGCTTTTTGTGGAGGTGACTTCT CGTGGCGGTATTGAGAAGATTATAAAAGAGAGAAGATGGAAAGAAGTTACTGCTATATTC AACTTTCCATCCACTGCTACAAATGCTTCTTTTGTACTGCGCAAATACTACATCTCATTG CTTCACCATTACGAACAAGTTTACTACTTTAGATCCCACGATTCATGGCAGAGCCCATCA ACACCTTCTGTGCCAGTTCTAGGGACAGCATTGTCATCATCTCCAGATGTTCAAGCGGCT GATATCCAGCAGCCAAGGACTAATACTGGAGTGGTGTCTGGAGGAAAACCAGCTTCCTCT TCAGCAACTCAGGTGTTAGGGGTGATTGATGGGAAATTTGAAAGTGGGTATCTAGTTACT GTCACTATAGGCTCAGAGAAGCTAAAAGGTGTCCTTTATCTGGCTCCACAGAGCCGTGCA CACCAAGTACCACCTTCTTATAATCTTTCCACCAATAATAGTGACAATACTATCTCTGTC TCTGGGGTGCAACGTCGTCGCCGCCGGAAGAAATCCGAGATTAAAAGGAGGGATCCTGCT CATCCGAAGCCTAACAGAAGTGGGTACAATTTCTTCTTTGCTGAGCAGCATGCCAGACTG AAACCACTACATCCAGGGAAAGACAGGGAGATCAGTCGAATGATTGGTGAATTGTGGAAC AAGCTGAAGGAGTCTGAAAAGACTGTTTATCAGGAGAAAGCTCTGAAAGATAAAGAAAGG TACAGAATAGAGATGGAGGATTACAGGGAGAGGCTGAGGACAGGTCAAGTTGTCAGTGAT GCTGTGCCACTACAGCAGCGACTTCCTGAACCAGATGTAAATATGGTGGAAGCAGACATA AAACTTGATGAAGCTGGGGCTGATTCTCCTCAGACTCCAGAAAATGAGAGTAATTCTGAT GGAAGCGACTGTGAAGATGAAACTGCTGAGAAGGATATGGATATAGAAGCATCTCCAGTA GTGGGATTAGGTGCTGAATCTAGCAATGTGGGTGTGGAGACTTCAACTGAGGAGCCAGCT TTTCAGCTGCCTAAGGGTGAAGCAAATGTTGGAGAGAATAGAGATCAAAAAGTTGGCGAT TATGCTATCGCAGACGTGGTTGAAAAGGCCAGAGATGACAGTGGAGAAAGGTTAGCTGGT GCTTTGGTGGAGATAAAGCAACAATTGCTGCCCAGTGCAGAGCAGTAG
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>LITCHI015049.m1 MASTSCAKQSPLPMKEPPSTSPPHPCPPLPLARYEDIVNSPKLFMASLEKLHATMGTKFM IPIIGGKELDLHLLFVEVTSRGGIEKIIKERRWKEVTAIFNFPSTATNASFVLRKYYISL LHHYEQVYYFRSHDSWQSPSTPSVPVLGTALSSSPDVQAADIQQPRTNTGVVSGGKPASS SATQVLGVIDGKFESGYLVTVTIGSEKLKGVLYLAPQSRAHQVPPSYNLSTNNSDNTISV SGVQRRRRRKKSEIKRRDPAHPKPNRSGYNFFFAEQHARLKPLHPGKDREISRMIGELWN KLKESEKTVYQEKALKDKERYRIEMEDYRERLRTGQVVSDAVPLQQRLPEPDVNMVEADI KLDEAGADSPQTPENESNSDGSDCEDETAEKDMDIEASPVVGLGAESSNVGVETSTEEPA FQLPKGEANVGENRDQKVGDYAIADVVEKARDDSGERLAGALVEIKQQLLPSAEQ.
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>LITCHI015049.m1 ATGGCCTCAACTTCTTGCGCCAAGCAGAGCCCTCTTCCCATGAAAGAACCGCCCTCTACC TCTCCTCCTCATCCATGTCCACCACTGCCTCTTGCTAGATATGAGGATATTGTTAATAGT CCCAAGCTCTTCATGGCTTCTCTTGAGAAGCTTCATGCTACTATGGGAACTAAGTTTATG ATCCCTATTATTGGAGGAAAGGAGTTAGACTTGCATCTGCTTTTTGTGGAGGTGACTTCT CGTGGCGGTATTGAGAAGATTATAAAAGAGAGAAGATGGAAAGAAGTTACTGCTATATTC AACTTTCCATCCACTGCTACAAATGCTTCTTTTGTACTGCGCAAATACTACATCTCATTG CTTCACCATTACGAACAAGTTTACTACTTTAGATCCCACGATTCATGGCAGAGCCCATCA ACACCTTCTGTGCCAGTTCTAGGGACAGCATTGTCATCATCTCCAGATGTTCAAGCGGCT GATATCCAGCAGCCAAGGACTAATACTGGAGTGGTGTCTGGAGGAAAACCAGCTTCCTCT TCAGCAACTCAGGTGTTAGGGGTGATTGATGGGAAATTTGAAAGTGGGTATCTAGTTACT GTCACTATAGGCTCAGAGAAGCTAAAAGGTGTCCTTTATCTGGCTCCACAGAGCCGTGCA CACCAAGTACCACCTTCTTATAATCTTTCCACCAATAATAGTGACAATACTATCTCTGTC TCTGGGGTGCAACGTCGTCGCCGCCGGAAGAAATCCGAGATTAAAAGGAGGGATCCTGCT CATCCGAAGCCTAACAGAAGTGGGTACAATTTCTTCTTTGCTGAGCAGCATGCCAGACTG AAACCACTACATCCAGGGAAAGACAGGGAGATCAGTCGAATGATTGGTGAATTGTGGAAC AAGCTGAAGGAGTCTGAAAAGACTGTTTATCAGGAGAAAGCTCTGAAAGATAAAGAAAGG TACAGAATAGAGATGGAGGATTACAGGGAGAGGCTGAGGACAGGTCAAGTTGTCAGTGAT GCTGTGCCACTACAGCAGCGACTTCCTGAACCAGATGTAAATATGGTGGAAGCAGACATA AAACTTGATGAAGCTGGGGCTGATTCTCCTCAGACTCCAGAAAATGAGAGTAATTCTGAT GGAAGCGACTGTGAAGATGAAACTGCTGAGAAGGATATGGATATAGAAGCATCTCCAGTA GTGGGATTAGGTGCTGAATCTAGCAATGTGGGTGTGGAGACTTCAACTGAGGAGCCAGCT TTTCAGCTGCCTAAGGGTGAAGCAAATGTTGGAGAGAATAGAGATCAAAAAGTTGGCGAT TATGCTATCGCAGACGTGGTTGAAAAGGCCAGAGATGACAGTGGAGAAAGGTTAGCTGGT GCTTTGGTGGAGATAAAGCAACAATTGCTGCCCAGTGCAGAGCAGTAGGATCTTCTGGGA TGAAGTAGGTTAGCTTCATTATGTTAATTATAGCCTTTGCGAAGTATAGTTTCTATTAAA TAACAGAGTTTTCATTTGTTGATTCTCACCGATAGTTATTTTTCGTTTGTAAAAACTGCA TTGCTGTCAGGAATGTTGTTACCTTCTTGGGAGACAGCTAGAATGTTAGGCCTGTTTCAG GCAGTTTTGTAGTTATAAGTTTCGATGCTTTCGTCGAATCAACATTCTAGGCCATATGAC AGCGCCAGTAGGAATTAACATTACTGAGTAAAGATCCTTAGCAGTCTTTGGTAACAAATG CAAGTCTCAGGAAATTTTTCATGTTGATGTATTCTTTGTGAACTGTGCTGTGATGGTGAG TCTCTAAGCTTAATGAGTTGAAGTGATCTTGAAATGCATATTCGGTTG
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>LITCHI015049.m1 - Up_Stream_Len 2000 TAACTCAAAAATCTCGAATACAAATCAAATCATGGATGTTTAGTCCAAATGAGTTAAATT CTCATGGATGCGGTGCCATCAACAGCCATTTGCGTTCGTAATGTAAAAAAAAATCAACCC TTCGATGGGATAAACGCAAATGGAAAAGAGGGGGTGGAGGCGTATTTATTAAATATGCTA AAAACAAGGAGAGAGTTGGGACTTATTCTATATTGTGTGTTAAATGCACTTTTTATTAAT AACCATTACCAATTAAGAGCTGCTGTTACGGCACTCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCA TTTCATGGAAATGACTGACAAATTTTTCATCTTATCATTTTCTCTCTTTTTTAAAAAAGA GAGAGAGATAGAGATTATGTTTTGCCGTTTCAAAGGGGAAAAGTCAATTTGACACGTTAT TTGCCTCTTTTCCACCGACTCCCATAATTACATTTATTTACTCCTCTAATTAATTTTTAA ATTTTGAATAATCTAAAATTACAAAAACCACTGCACTTGCTTTTTATATTACCTTGGGCA CTCCTAGATTTGAAAACCCAAGCCTACCCTGGTTTTTTCCTGAAATACCAAGACCACCCT TGCCTTTTTTTCCTTGTATAAAGCACTTTCATGAGGGTATAGCAGTCTTTGCGAATTGGA ATTGCCTATATTTCTAAATAAGGGGCAAAACAAATTACCAAAATTATATAAATACAAGAT ATAATAAAAATTATGCTGTGTACTTGTATGAATAAAAATAAAAAAGGTTTATTAGTGATA AGCTAGAATCATCATTGTTAATGTCATTTTCAATTCTGTTTTTCACAACCCGTGGTAAGA TGCTTTACTTCTTTTCTTTATCTTAAAGTCTGATTTATTTATCTATCAGTTCTTCATCTG GGTATTTTATTCTCCTTATTATATATATTTATATATAATAATAGTAATAATATAACATAG AAATGAAAAATAAAAGTAATGAACTGGGTGTATATATATTTTTTGGGTTTGCTTATTTTT TTATTCATTTACATGTTTTGTTTTCATCCATGAACGAGGAAGGACAAGTCTTGATTTGAA AAATCAAGGTATTTATCTTTTTGCATTGGGGGGTTGATTTTGATTGATGGTGTGTCCCTG AAACAGTGTCAGATAAAAACAGAAAAAAGGAATGAGAAGGGTGGTGATGGATTGGATATG TGAATAAAAATATATATTAACGATATTAAATAAATGGCCAATAGATATGAGCATATCTTT AGAATGTCAGGTCAGGGCTAAAAGTGATAGATTTTTATGTAGGCCTGCAAGGTCTCTGTG GTTTGAGAGAGAGAGAGAGTGTGTGTTGTGTATCTGGGTCTTTATTGGCAGAGCCTAAAA GGGTGTTGTCTTTATAGGCTTGTTGAAAGCCTGAGAGGAGGCTTTCTTAGATGGCTTGTT TATGTTCAAATCCTCTGAAGGATAATGTCATGGATCTGCTGACACCTTTCCTGCTTTTCT TGGGTTTTGAATCTCTCCCTTCGCACTGGGAGTTATTGCTTCAACTCTCTTCTTCTTTTA GTTTTTGTCAAGGTGGTTGTGGTGTTGGTTGGTGCTCTTCTTTTATCTGTTGATTTTTTT TTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTCAATGTATTTCTCTTTATCCTTCTCTTTGTATTCTTGTT TGTCTCTATCTCACCATCTCCCACTATTTATTTTGGCTTTTGCATGAAACCAGTTTTTTT TTGGCAATATCTTTTGATGGTTTTTCTTTTTTAAAAAAATAAATTCTTTTTTTAAATTCA AGTGATTTATTGCTCTTTGCATGCAATTAGTATAACACTGCAACGTCAGTTTTGTTTCAA TTTGTTGATTTGACTTTCATTTATGTTTACTATGGTGCAGTGAAAAAGGAAGTGAATATT GGAGTCGTTGGTAGTTGAATAGAGGGAAGAAAGTACACAGAGGGAATGCGTGGGTGGTGA AAAAAAGAATTTTTTTGAGT
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>LITCHI015049.m1 GenomeSequence - ATGGCCTCAACTTCTTGCGCCAAGCAGAGCCCTCTTCCCATGAAAGAACCGCCCTCTACC TCTCCTCCTCATCCATGTCCACCACTGCCTCTTGCTAGATATGAGGATATTGTTAATAGT CCCAAGCTCTTCATGGCTTCTCTTGAGAAGCTTCATGCTACTATGGGAACTAAGTTTATG TAAGTTTTTCTTTCCCACCTTCCTACTTTAGTCTCCTTTATGGTTGTTTCAATGTTTTGG TGCTTAATTTGAGGGTTATATGGTCATTAAATCTTATATGGATGTGGTTGCTATTTAAAG TTTTGGATGCCATTTTTATGTTCTCATGATTGTACCATGTGTGTAACTAGTTTTATTGTT ATGTTGCACTTTTCATGGCTTTTTTGTAGTTGCCCCCCCAAAAGTTTGCAACCAAGTTTT CTATATTTATTTGTGGGCCAGTGGTTCTGTTGAGGATATATATAGTTTGGAACTTGATCT ATCTTATTTGTGGGGCCAAATTAGAATTTAAAAGGTGGTGGTTTCTAATTGAGTACATCT AGGTGGAAGATCATCTTACTTTATACAACATTTGGTGAAGAATATAATTATTTTAGGCTT ATTAGTGGAGTGATGTCAACTTTCACTCCCCTGTTCATAGTAATAGTGTAAGCATCTTGC AATGCATTTGATCACCGATTTACCTTCTGTATGGCAGAGCAGTGTTTTCAACCTTTCATA GAAATGATTGAAAATTTAACAATCCATTCAAGCATTCCTGACTCTGATCCATATTTATGG CAAGCTTAATGTTAGTAATGTTAATTAGTTTTCCTGGTTCATTAATTGTGCAAGTCTCTG TTGACTATTTGTGTTGTTAAAAGAAAATATCAGCTCAATGGGAGCCTTTGTATTCTTCTT 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