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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI015034 | Chr1 | 7937766 | 7940213 | + | Paired amphipathic helix protein Sin3-like 5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI015034.m1 | 48 | 90 | PF02671.24 | PAH | Repeat | 30.1 | 4.20E-07 |
LITCHI015034.m1 | 145 | 188 | PF02671.24 | PAH | Repeat | 22.4 | 0.0001 |
LITCHI015034.m1 | 320 | 411 | PF08295.15 | Sin3_corepress | Domain | 68.1 | 5.70E-19 |
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>LITCHI015034.m1 ATGAAGAGGGCTAGAGAAGATGATGACAAGGAGGACGTTGAGGTAGCATCACAATCAAAG AAAGCTGGTGGTAGCGGGGGGTCGGAGACAGCGGCATTCGCTTATCTGATGTCTGTCAAA GTTAAAGTCTCGAGTAGCTTGTACACCAAGTTTCTGGTTCTTTTGCGGGATTTCAGGACC TGTAGAATCAACGTGGACTTTGTTAGGCTTCAGGTAAAGAAGTTATTTGCAGGGTATGAA GATTTGATACTTGGGTTCAACGTGTTTTTGCCGGAGCCTTACAAGATCTCATTGGATGAG GAAGACGAGGAGGAGGAGACAAATACAGATCCAGAAATAGAGGAGGAAGATGAGAACTTG GATTCAGGTAAATTCGAAGAAGCTCTTGGTTTTGTTAACAAGGTAAAGTTGCGGTTTGGA AAGGGTGATCAGCATGTTTACAAGGCTTTCCTAGATCTTCTTCGGGCTCCGAGTCTTGAG AAGAAGAAGGTCTTCAACTTTGAAGATTACTCTAAGGCTGCTCAACTTCTTGGTGATCAT CCTGATTTGTTGCAGGACTTTGATAGATTGATTGGTCCTGCCTGGAAAGCTTCTGATGGC AGTAATCATCAAAGTATTACTGTTGAGGATCCTGATAGAGAGGTCAAAACCAAGCTTTTG AAACAAGGATTGAATTTATGTGATAAGGTTGAACAAGTGCTCTCCGCTTCAAACTATCGC GAATTCTTAAGAAAACTATATGATTACAGCAGTGGAAAGATTACAAGAGATGATTTGAAA GCTGCTGTTACTGATATTCTGGGGTCTGATGGAAATATCGATGGAAATCTTGTTGAGGAG TTCACTAGTTTCATCAATGCCCCTGAAGAACATTTATCCAAGTTGTGGAAGTTTGAAGAG AAAAACAAGGAGCAAAAACAGATAAAATCTGTTTACCAACTTGATCTTTCTAAATGCAAA AGAATCAGCCCCAGCTACTGGCTTTTGCCGAAAGCCTATCGCATCTCTTCGAGCACACAG ATATCAAAGAAAGATCAAGTTTTGAATGATAAGTTTGTCTGTTTGAGTGTGAGAGGCGGA AACTATTCGTTCAAGCATAGGCGGATACAAGAAGGCGAAGAAATCCTATTCAGATGCGAG GATGATAGGTATGAGATGGATATGTTAATGGAATATATAAGATCAGCAATTGAGAAAGTG AGGAAACTATTGAGTGCCATTGAAGAAAATAAAGTCAATCTGGAAATTGGAATGACGATT GAAGATCATCTGAGTATTTTCAATAGAAGATGCGTAGAGAAGTTGTATGGGGAATACGGG CTTGAAATGATGGATGTGATGCAGCAGAAACCAACTAAAGCTTTGCCTGTGATATTGAAG AGGCTGGAGCAGAAGCAAGAAGAGCTTACAAAGTTTCGAGACAATTTCAACAAGCTTTGT GCTCATATTTATGCTATAAACTTTTCGAAAAAGTCAAGCAGGGAATGTTCTGTAGAGGAA CACGATCATATGATGCAACAAACTGTCAATGAACAAGCACTAGCATTGCAAGGAGCAGTG GCTGGTGAATTATAA
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>LITCHI011311.m7 + Up_Stream_Len 2000 AGCAAACAAGCATGGGGTTGGTTATTTCAGTACATAATGTTTGGTTTGTATTTGTGAATG TTGGTGTTGGCAGTGGAAGCCCTAATTTGGTGGGTGTAAAGGTTGTGAAATTATTTGAAG ATGGGTGCTGAAGAGGGAACAAGCAATGGTGATGGTACGGAATGGTTGAAAAGAAGTGAG GTTAATAATGGGTTTGGAGTTCGAATTGAGCCTGAGTTTGGTGATGGGAGCTCAGGTGCA AGTGAGGGTTTGCGGACTTACAAGAGGCGGAAGTATGCAAGGTCAAGTTCAGAAAGCAAA GGTGTGGAGGATGGAAGAGCTTCTGTTGAACCCGGCAGTCAATTAGCAGATCAGGTATAT TTTCCTCAATCTATGTGCCATAGAGTATTTTGTATGTTTGTTCAAGGTTTTACTTTGAGT TTTTATGACTGGAAGATGATGTTGCTGCTAAAATATGCTATGCTGCTTTAAATAAAGTGA AAATTTTGGCTTGTGAATTACACATGTAACAGAGGAGGTGTGACTGAGACCATAAAAGCT TTAGACAACTGACTAAACTTGTAATATTGCTTAATAAAACTAGTGATTTGAATGAATGCT AACTTAAATGAGATTGCTGGACCGTTGGATTATGAATTGAAGTGGTTGAATGTCTTGCAG CTCTCATATGTTATACATAGAAAAATATATAAGTGTGCATGCAACAATGCATTTGAAATT GAAAATAACACATTGCAATACTTTGTGATGGCTTATATTATTCTACATGGTATCACATTT CTCTTGTTGGTTGACTGTTGTCTGTGCATAATAGATGGAATTGCATAACTGATTATACTA AATTCCATATCTGTTGGAAAATAAGTTGGAAGTTGGAACCTGTGTATTATTTTGGCATCG 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