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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI015034Chr179377667940213+Paired amphipathic helix protein Sin3-like 5

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI015034.m14890PF02671.24PAHRepeat30.14.20E-07
LITCHI015034.m1145188PF02671.24PAHRepeat22.40.0001
LITCHI015034.m1320411PF08295.15Sin3_corepressDomain68.15.70E-19
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>LITCHI015034.m1
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GTTGCTTGTGTTTTGTGGTAGTGGTTGTCTACTGTCATTTCGGCATTATCATCTTTTCTT
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>LITCHI011311.m6 +  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI011311.m5 +  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI011311.m4 +  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI011311.m3 +  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI011311.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI011311.m6 GenomeSequence + 
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GTCCTTGAATTGTTCAGGATATATTAGTATTAGAAGATAAGTAAGCAACTTTTAACATTA
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GTGTGACCTATGATGGAGGCTTTGTGGTGGGCTAGATTTTACTGAGACCTTTTCCTTTTA
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CTTATGAATTTGAATTTTTATATCATAAGTCAATCTCTTATGTATCCCATAAGTAGAAAA
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CTTTCATGCCTGAGAACATGTTCTTGGTGTTTTAGTTATTTTAGTTTTTAGGTCCTCTCA
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TTGTGGCTGCTTTGAACCCTTTTGTATTAGTTAACATGTTTGTTTTTCTTTTAGGTGGGA
GACTCATTACATGGAACATTTGATGAAGGAAAATATGAGGTAGAATTTCTTATCACAAAT
TACTTCTGTTTCCTGTTGTAATGCATATCAATATATTATTAGAAATATTAGGTTTCATTT
GGGGCCCCCAAAAAAAAATGATGTCTTTTGTCTGACCCGTTCATGTTTACTGCAACAATA
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GCTGATGGGAGGGATTGTTTAGTTTGTGATTCATGCGAGGACATGTACCATGTCTCCTGC
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GACCACTCCTTTTGTCCCAGTAAGTATTATCATGAGAGGTGCTTAACAGTTAAGCAGTTA
AATTCATATGGTCCCTCTTGGTACTGCCCTTCTTGTCTTTGTAGAGTCTGCCTTACTGAT
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>LITCHI011311.m5 GenomeSequence + 
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>LITCHI011311.m4 GenomeSequence + 
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TATCAGTTCTTTTTCCCCCTCTCTCTCTCTTTCCCAAGCTCAAATACATGGTTCTGTTGT
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CTTATGAATTTGAATTTTTATATCATAAGTCAATCTCTTATGTATCCCATAAGTAGAAAA
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CTTTCATGCCTGAGAACATGTTCTTGGTGTTTTAGTTATTTTAGTTTTTAGGTCCTCTCA
TGTATTTTAACTTCGAAAATTTTTTTCTCCAGGTTTGGAGAAAGCTTCAAGTGATTGGTT
CTGAAATGATTTCTCTTTCAAAGAGCCTAGCAGACTTTTCAAGGACTTCCTTTATTGAGC
AGGTAATACAACCAACGTGTATTACCTCTCTGTCTCTGTATACTTATTTTGGCTCTTTAT
GTTAAAGATAATAAATTATTAAAAATTCTTTCTTTGATTTTAAAATCTAATATACTCTCT
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GACTCATTACATGGAACATTTGATGAAGGAAAATATGAGGTAGAATTTCTTATCACAAAT
TACTTCTGTTTCCTGTTGTAATGCATATCAATATATTATTAGAAATATTAGGTTTCATTT
GGGGCCCCCAAAAAAAAATGATGTCTTTTGTCTGACCCGTTCATGTTTACTGCAACAATA
TTTGGAACTAATACATTATATTCAATCAACTGTCTGTGAAGTGCTTCTGAGTTGCGGTGA
CAGTTTCTGTCAAAAGAATTTTTAAAATGTTTCTCTTCATTTGGCTATTGAACAATTTGG
TGGCAAAAAGAAACACACTTTCTCTCAACTGTGAGTTTCGATGCTCCAGTCAATCAATAC
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TGCTGTTTTGATCATTCTTTTCCCTCATTTTAACTGCAGTCTGAATTGTTCCTGAGAAAT
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GCTGATGGGAGGGATTGTTTAGTTTGTGATTCATGCGAGGACATGTACCATGTCTCCTGC
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GACCACTCCTTTTGTCCCAGTAAGTATTATCATGAGAGGTGCTTAACAGTTAAGCAGTTA
AATTCATATGGTCCCTCTTGGTACTGCCCTTCTTGTCTTTGTAGAGTCTGCCTTACTGAT
AGAGATGATGACAAGATTGTTCTATGTGATGGGTGTGATCATGCATACCACATATATTGC
ATGAATCCGCCACATACATCAATTCCGAGTGGTAACTGGTTTTGCAGAAAATGTCATGCT
GGGATTCAAGAAATACGCAAGGCTAGAAGGGCCTATGAGAATAAAATGAAAGAGAAAGAT
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ATGGCTACCATTCAGACAGAGTTGAAATGAAGATAGTATCTGGAGTAGAATACAGGATCT
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>LITCHI011311.m3 GenomeSequence + 
TGCCACCCATAACTGACACGTGTCAGTTCTAACCAAACGATGCCGCCTGCTCTCAGCCCT
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CTACGCTCAGGTAAACCTGCTCTCTTCTCAAATTCTCTGTTCATTTTTGCTCTCTTTGTT
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>LITCHI011311.m2 GenomeSequence + 
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ACAACATGCTATTATAATGAAAAACAAGTGATAAATATTTTTCCTTATTTTGTTCGCGTT
>LITCHI011311.m1 GenomeSequence + 
TGCCACCCATAACTGACACGTGTCAGTTCTAACCAAACGATGCCGCCTGCTCTCAGCCCT
TGCGCGTTCACCGGTTCAGCCAGTGTTTGAAAAAAAATAATAATAATAAAAAAAGAGAGA
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