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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI015034 | Chr1 | 7937766 | 7940213 | + | Paired amphipathic helix protein Sin3-like 5 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI015034.m1 | 48 | 90 | PF02671.24 | PAH | Repeat | 30.1 | 4.20E-07 |
| LITCHI015034.m1 | 145 | 188 | PF02671.24 | PAH | Repeat | 22.4 | 0.0001 |
| LITCHI015034.m1 | 320 | 411 | PF08295.15 | Sin3_corepress | Domain | 68.1 | 5.70E-19 |
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>LITCHI026381.m1 ATGGAGTTGTACGGACGCAACAACGCGGCCAGGAACGGGTCGCAACCGGGTCACCCGACC AAATGGAGCACCGCCGGTCCGGCGACCGCCCTCGAAGAATCGATGTGGCAATTGGACTTG AGGGTGTCTGAATCGTATCCGGAGCGACCCGGAGTGCCTGACTGCGTTTACTATATGCGG ACGGGGGTTTGTGGATACGGTAACAGGTGCCGTTATAATCATCCTCGCAATCGTGCTGCG GTTGAGGCAGCTGTAAGAGCTACAGGGGAGTACCCAGATCGACCGGGGGAGCCCTTGTGT CAGTTTTACTTGAAAACTGGAACCTGTAAATTTGGCGCATCCTGCAAGTTCCACCACCCA AAACATTCAGGTGGATCCATGAGTCATGTTCCACTGAATATATATGGATACCCGCTACGA CTGGGTGAGAAAGAATGCTCCTACTATTTGAAAACGGGGCAGTGCAAATTTGGTAGAACT TGTAAATTCCATCATCCTCAAACAGCTGGCACGTCAATGCCGGCATCTGCACCTCAATTT TATCCGCCGGTGCAGTCTCCTTCAGTTCCAATGCCAGAACAGTATGCAGGGCCATCCACC AACTTGAGGGTGCCAAGGCCTCCACTTTTAGCTGGTTCTTATGTGCAAGGGGCATATGGT CCTGTGCTGTTTTCTCCTGGAGTAGTTCCCTTTTCTGGTTGGAGTCCTTATTCGGCGCCT GTAAGTCCCGTGTTATCTCCTGGTGCACAACCTGCTGTTGGAGCTACTAATCTTTATGGG GTAACGCAGCTATCTTCCTCGATTCAAGGACCTTATCCCCCATTGCCATCTTCTGCTGGT CTTTCAAGTAGTAGCCAGAAGGAACAATCATTCCCAGAGAGACCTGGTGAACCTGAATGC CAATACTATTTGAAAACTGGGAACTGTAAATTTGGGTCATCTTGTAGGTATCATCATCCT 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>LITCHI016198.m1 MAVEDKRVSSAREDGAIDRFPIGMRVLAVDDDPICLKVLENLLRKCQYEVTITSQAATAL KMLRENKNKYDLVISDVNMPDIDGFKLLELVGLEMDLPVIMLSAYSDTKLVMKGITHGAC DYLLKPVRIEELKNIWQHVIRKKKNEPKDQNKSPNEKGHVGTGEGGQTLTSTGNSDQSGK VSRKRKDQDEDEDEEAAEEDGNENEDSAAQKKPRVVWSVELHKKFVAAVNQLGFEKAVPK KILDLMNVEWLSRENVASHLQKYRLYLKRISQQPNMVATLGGKDPSFMHMTTVDGFGDFH TLTGPGRFSSTSISSYQPGGVLGRLNSSAGLTMRGIGSSSIIQSGHSQALGNSYNALGKL QNSMLPSNQSANFFDGVQKSLEVNQQPQSKSSSQIGELHHINDLTAFTSVTSFSDARVTL GSSSSSLCSPSSNPLMLQANLQAAQIRGSFGNQSSLSVASLNPGTFNMGASGSSTFLDHS RHDESWQGASQMSKFPSNSLPVSEPFSHDQLPHTNLNGNLSCQFGNNSLDHSTSMSAPIP LGDSRGDMQCQAGGITSAIQNMNYNHNLSHSFNNINSLGAGNCDMGPFSQSFEQNKAQDG FIQNNYESLDDLMNTIMKRVS. >LITCHI016198.m2 MAVEDKRVSSAREDGAIDRFPIGMRVLAVDDDPICLKVLENLLRKCQYEVTITSQAATAL KMLRENKNKYDLVISDVNMPDIDGFKLLELVGLEMDLPVIMLSAYSDTKLVMKGITHGAC DYLLKPVRIEELKNIWQHVIRKKKNEPKDQNKSPNEKGHVGTGEGGQTLTSTGNSDQSGK VSRKRKDQDEDEDEEAAEEDGNENEDSAAQKKPRVVWSVELHKKFVAAVNQLGFEKAVPK KILDLMNVEWLSRENVASHLQKYRLYLKRISQQPNMVATLGGKDPSFMHMTTVDGFGDFH TLTGPGRFSSTSISSYQPGGVLGRLNSSAGLTMRGIGSSSIIQSGHSQALGNSYNALGKL QNSMLPSNQSANFFDGVQKSLEVNQQPQSKSSSQIGELHHINDLTAFTSVTSFSDARVTL GSSSSSLCSPSSNPLMLQANLQAAQIRGSFGNQSSLSVASLNPGTFNMGASGSSTFLDHS RHDESWQGASQMSKFPSNSLPVSEPFSHDQLPHTNLNGNLSCQFGNNSLDHSTSMSAPIP LGDSRGDMQCQAGGITSAIQNMNYNHNLSHSFNNINSLGAGNCDMGPFSQSFEQNKAQDG FIQNNYESLDDLMNTIMKREQNDPLLGDAEFGFDDYSLGPCI.
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>LITCHI016198.m2 GTTTGGGTCGTGATATAGAAAAAGAAAGAAAAATAAAAAGCTAAAGACAAAACAGAGTCG ACAGAAGACAGAGAGAGAGAGTTTCTTCGGTGTACTTGAAAAAATATTATTAGATTTCTG GTTTTTGTTTTCTGGGGTGTTGAATTGAAGCACTCACTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT CTCTCTCTCTGCCCTCTCTTTAGAAAAGAGAAAAAAGGAAGAAAATCTGCTCTGCTCTGG CCATCACCATCATTGTCCATTTGTACAGCTTTTGGGTTCCTTGTTTTTGTATCAACTGCT TATTCTTCTTCTCTCTATTTTTCTTGTTTCTGTTGTTTTTTCATCTGGGGTTTGTGTTAA ACTCGCAAAGCCAACACCTTTGACAAATTTGAGCAATCAAAACCAAACCTTGTTTGTTGC TTTTTGAAGTGATATCTCTGTTCTTGCTCTGTTTTTGAACTAGTTGAAATGGCTGTGGAG GACAAAAGGGTCTCCTCCGCTCGTGAAGATGGAGCCATTGACCGGTTCCCGATTGGTATG CGTGTTCTTGCTGTTGATGATGACCCTATTTGTCTCAAAGTCTTAGAGAATCTCCTCAGG AAATGCCAATATGAAGTGACAATAACCAGTCAGGCCGCGACGGCCCTGAAAATGTTGAGG GAAAACAAAAACAAGTATGATTTGGTTATCAGTGATGTTAACATGCCTGATATAGATGGT TTCAAGCTTCTTGAGCTTGTGGGGCTTGAGATGGACCTACCAGTCATAATGTTGTCGGCG TATAGTGATACCAAGCTTGTAATGAAGGGGATCACTCATGGTGCGTGTGACTATTTGTTA AAACCTGTTCGGATTGAGGAGCTGAAGAACATATGGCAACATGTTATCAGGAAAAAGAAA AATGAACCCAAGGACCAAAACAAGTCTCCTAATGAGAAGGGTCATGTTGGAACTGGAGAA 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GTTTTTGTTTTCTGGGGTGTTGAATTGAAGCACTCACTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT CTCTCTCTCTGCCCTCTCTTTAGAAAAGAGAAAAAAGGAAGAAAATCTGCTCTGCTCTGG CCATCACCATCATTGTCCATTTGTACAGCTTTTGGGTTCCTTGTTTTTGTATCAACTGCT TATTCTTCTTCTCTCTATTTTTCTTGTTTCTGTTGTTTTTTCATCTGGGGTTTGTGTTAA ACTCGCAAAGCCAACACCTTTGACAAATTTGAGCAATCAAAACCAAACCTTGTTTGTTGC TTTTTGAAGTGATATCTCTGTTCTTGCTCTGTTTTTGAACTAGTTGAAATGGCTGTGGAG GACAAAAGGGTCTCCTCCGCTCGTGAAGATGGAGCCATTGACCGGTTCCCGATTGGTATG CGTGTTCTTGCTGTTGATGATGACCCTATTTGTCTCAAAGTCTTAGAGAATCTCCTCAGG AAATGCCAATATGAAGTGACAATAACCAGTCAGGCCGCGACGGCCCTGAAAATGTTGAGG GAAAACAAAAACAAGTATGATTTGGTTATCAGTGATGTTAACATGCCTGATATAGATGGT TTCAAGCTTCTTGAGCTTGTGGGGCTTGAGATGGACCTACCAGTCATAATGTTGTCGGCG TATAGTGATACCAAGCTTGTAATGAAGGGGATCACTCATGGTGCGTGTGACTATTTGTTA AAACCTGTTCGGATTGAGGAGCTGAAGAACATATGGCAACATGTTATCAGGAAAAAGAAA AATGAACCCAAGGACCAAAACAAGTCTCCTAATGAGAAGGGTCATGTTGGAACTGGAGAA GGTGGACAAACGTTAACATCTACGGGTAATTCTGATCAGAGTGGGAAAGTTAGTAGAAAA AGGAAGGACCAAGATGAAGATGAAGATGAAGAGGCAGCGGAAGAGGACGGGAATGAGAAT 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