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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI014860 | Chr1 | 5931956 | 5937364 | + | CRC domain-containing protein TSO1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI014860.m1 | 503 | 538 | PF03638.18 | TCR | Domain | 44.3 | 1.70E-11 |
LITCHI014860.m1 | 589 | 624 | PF03638.18 | TCR | Domain | 43.9 | 2.30E-11 |
LITCHI014860.m2 | 406 | 441 | PF03638.18 | TCR | Domain | 44.6 | 1.50E-11 |
LITCHI014860.m2 | 492 | 527 | PF03638.18 | TCR | Domain | 44.1 | 2.00E-11 |
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>LITCHI014860.m1 ATGGACACCCCAGATAAGGCAACCCAGATCGCTACTCCACTCTCTAAATTCGAGGATTCC CCTGTCTTTAACTATATCAATAGTCTTTCTCCTATCAAGCCTGTTAAGTCTATACACATT ACTCAGACATTCAACTCGCTGAATTTTGCATCCCTTCCATCGATATTCACTTCGCCCCAT GTCAGCGCTCACAAGGAAACCAGATTCCTGAAAAGGATTAATAACTGTTCAGATCCAACA AAAGCGGGTTTGGAAAATGTGAATAAAGTCTGTAGAGACGATGGAGTTGCAATGGATGCA CCTCAGCTTTATGACAACTCCGCTCAACTACAGGAAAACTTTGATCCTGGTATTGAAGAA GATTCTGTTGAGCCTGCTAGTGATTCGAAGTTTGTGATCGAGCTGCCACGAGCTTTGAAA TATGATTGTGGTAGTCCTGACTGCGATCCAACAGGTTCTGTAATTGAGACAAACTGTGTG TCAGAAATGGCTAGAACATCTGCTTTAGTTGCGCCGTTTGTTGAAAAGGCCCCTGAAAAG AATTCATTTGATGATGAAATGCATCCACAAGGCGCATCCCAGATTGAGCGAAAAAAAGAA GAGGCGGGATGTGACTGGGAGAGTTTGATTGCTGATTCTCAAGACTTGTTAATTTTCAAT TACCCCAATGAGTCAGAGACCTTTAACCTTATTCAGAAATCAGTGGACCCTGGGGCAAGA TTTTGTACTTCTCTCCTGGCGCAATTCTCGCAAAGTGATCTTAGTGGGGAGCCAAAATTA CAAATGGTTGATTCAGTTGGTTCTTGTCAACAACATGAAATGGAAGGTCGATCTGCACAG CCCGGAGAAACCAGCGAGCTGAGGGAAATAAACGAGGCAGAAGACAACCTTGCTAGTGAT GATCTAAATAATTGCTTAAGTGGGAATCCAAATGAGAAAGTGGGTGATGAGGTCGGAGTG TGTGTTCAAGATGCTTCTAAGCATGTTCCTACTTCGCATCGTGGTATGCTGAGGCGCTGT CTAGATTTTGAACGGGTGGCTCGGAGGAAGAACTTAAATGATGGTTCAAACTGTAGTTCT TCTATGATGCTGCAGTCCAATGAGAATTTAGCCTCTAAGGATAAGCAACTGGTGCCCCTT AAGCCTACCAGTGATTCTCCTCTGTGTGTTTTGCCTGGAATTGGTTTGCACTTGAATGCT TTAGCATTATCTTCACAGGACAACAAAAATTTCAAGCATGAAATTTTGTCTTCTTCTGGA AGACATCTAAGCGTGCCCAGCTCTACTGCCTCCTTTCATTCTCCCAAAATTGGTCAAGAA CCAGTTCAAGAAATCTTGACTTCAACCTCTGCTGAAAGAGACATGGTTCCTGTTGATGAT GGAGTTGCACTGGCAGAAGATGCTTCTCAGTCATCTGCATATTTAATCGGTGAAGAATCT AATCAGAATAGCCCAAAGAAGAAAAGGCGTAGGTTGGAACAGGCAGGAGAAACTGAGGCT TCTTGCAAGCGTTGCAATTGTAAAAAGTCAAAGTGTTTGAAACTTTACTGTGAATGCTTT GCTGCTGGAGTCTATTGTATAGAACCATGTTCCTGTCAGGATTGCTTCAACAAGCCTATT CATGAAGATACCGTTCTTGCAACTCGTAAACAGATTGAATCTCGAAACCCTCTTGCGTTT GCTCCTAAAGTGATTAGGAGCTCGGATTCAGTACCCGAACATGGGGACGAATCTAGCAAA ACCCCCGCTTCAGCTAGACATAAAAGAGGATGCAACTGCAAGAAATCAAGTTGTCTTAAG AAATACTGTGAATGCTACCAGGGTGGTGTTGGATGCTCCATTAACTGCAGATGTGAAGGG TGTAAGAATGCATTTGGTCGTAAGGATGGGTCTGCAATTATAGAAACAGAAGCTGAACCA GAAGAGGAAGAAACTGAGACAAGTGAAAAGAGTGGAGTGGATCCAATTTTGCAGAGAACT GAAATTCCAAATAATGAAGAGCAGAATCCTGGTTCTGCTCTTCCTACAACACCACTCCAA TTTTCCAGATCATTGGTTCAGGTACCATTTTCGTCCAAGTTCAAGCCACCGCGGTCCTTA CTTTCTATCGGATCCTCCACTGCATTTTACACTGGACTCAATTATGGAAAGCCTAATATT CTCCGATCACAACCCAAGTTTCAGAAGCGTCTCCAAACTGATGCTCCAGAAGACGAAATG CCTGAGATTCTACAAGGCAACGGCTCTCCTGGTTCTGGTGTCAAGACCGTTTCTCCCAAC AGCAAGAGGGTCTCTCCACCAAACACCGGCTTGGGGTCATCTCCTACTCGTAGGAGTGGG CGGAAATTGATACTACAGTCTATACCATCGTTCCCTTCGCTGACTCCACAGCACTGA >LITCHI014860.m2 ATGGATGCACCTCAGCTTTATGACAACTCCGCTCAACTACAGGAAAACTTTGATCCTGGT ATTGAAGAAGATTCTGTTGAGCCTGCTAGTGATTCGAAGTTTGTGATCGAGCTGCCACGA GCTTTGAAATATGATTGTGGTAGTCCTGACTGCGATCCAACAGGTTCTGTAATTGAGACA AACTGTGTGTCAGAAATGGCTAGAACATCTGCTTTAGTTGCGCCGTTTGTTGAAAAGGCC CCTGAAAAGAATTCATTTGATGATGAAATGCATCCACAAGGCGCATCCCAGATTGAGCGA AAAAAAGAAGAGGCGGGATGTGACTGGGAGAGTTTGATTGCTGATTCTCAAGACTTGTTA ATTTTCAATTACCCCAATGAGTCAGAGACCTTTAACCTTATTCAGAAATCAGTGGACCCT GGGGCAAGATTTTGTACTTCTCTCCTGGCGCAATTCTCGCAAAGTGATCTTAGTGGGGAG CCAAAATTACAAATGGTTGATTCAGTTGGTTCTTGTCAACAACATGAAATGGAAGGTCGA TCTGCACAGCCCGGAGAAACCAGCGAGCTGAGGGAAATAAACGAGGCAGAAGACAACCTT GCTAGTGATGATCTAAATAATTGCTTAAGTGGGAATCCAAATGAGAAAGTGGGTGATGAG GTCGGAGTGTGTGTTCAAGATGCTTCTAAGCATGTTCCTACTTCGCATCGTGGTATGCTG AGGCGCTGTCTAGATTTTGAACGGGTGGCTCGGAGGAAGAACTTAAATGATGGTTCAAAC TGTAGTTCTTCTATGATGCTGCAGTCCAATGAGAATTTAGCCTCTAAGGATAAGCAACTG GTGCCCCTTAAGCCTACCAGTGATTCTCCTCTGTGTGTTTTGCCTGGAATTGGTTTGCAC TTGAATGCTTTAGCATTATCTTCACAGGACAACAAAAATTTCAAGCATGAAATTTTGTCT TCTTCTGGAAGACATCTAAGCGTGCCCAGCTCTACTGCCTCCTTTCATTCTCCCAAAATT GGTCAAGAACCAGTTCAAGAAATCTTGACTTCAACCTCTGCTGAAAGAGACATGGTTCCT GTTGATGATGGAGTTGCACTGGCAGAAGATGCTTCTCAGTCATCTGCATATTTAATCGGT GAAGAATCTAATCAGAATAGCCCAAAGAAGAAAAGGCGTAGGTTGGAACAGGCAGGAGAA ACTGAGGCTTCTTGCAAGCGTTGCAATTGTAAAAAGTCAAAGTGTTTGAAACTTTACTGT GAATGCTTTGCTGCTGGAGTCTATTGTATAGAACCATGTTCCTGTCAGGATTGCTTCAAC AAGCCTATTCATGAAGATACCGTTCTTGCAACTCGTAAACAGATTGAATCTCGAAACCCT CTTGCGTTTGCTCCTAAAGTGATTAGGAGCTCGGATTCAGTACCCGAACATGGGGACGAA TCTAGCAAAACCCCCGCTTCAGCTAGACATAAAAGAGGATGCAACTGCAAGAAATCAAGT TGTCTTAAGAAATACTGTGAATGCTACCAGGGTGGTGTTGGATGCTCCATTAACTGCAGA TGTGAAGGGTGTAAGAATGCATTTGGTCGTAAGGATGGGTCTGCAATTATAGAAACAGAA GCTGAACCAGAAGAGGAAGAAACTGAGACAAGTGAAAAGAGTGGAGTGGATCCAATTTTG CAGAGAACTGAAATTCCAAATAATGAAGAGCAGAATCCTGGTTCTGCTCTTCCTACAACA CCACTCCAATTTTCCAGATCATTGGTTCAGGTACCATTTTCGTCCAAGTTCAAGCCACCG CGGTCCTTACTTTCTATCGGATCCTCCACTGCATTTTACACTGGACTCAATTATGGAAAG CCTAATATTCTCCGATCACAACCCAAGTTTCAGAAGCGTCTCCAAACTGATGCTCCAGAA GACGAAATGCCTGAGATTCTACAAGGCAACGGCTCTCCTGGTTCTGGTGTCAAGACCGTT TCTCCCAACAGCAAGAGGGTCTCTCCACCAAACACCGGCTTGGGGTCATCTCCTACTCGT AGGAGTGGGCGGAAATTGATACTACAGTCTATACCATCGTTCCCTTCGCTGACTCCACAG CACTGA
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>LITCHI014860.m1 MDTPDKATQIATPLSKFEDSPVFNYINSLSPIKPVKSIHITQTFNSLNFASLPSIFTSPH VSAHKETRFLKRINNCSDPTKAGLENVNKVCRDDGVAMDAPQLYDNSAQLQENFDPGIEE DSVEPASDSKFVIELPRALKYDCGSPDCDPTGSVIETNCVSEMARTSALVAPFVEKAPEK NSFDDEMHPQGASQIERKKEEAGCDWESLIADSQDLLIFNYPNESETFNLIQKSVDPGAR FCTSLLAQFSQSDLSGEPKLQMVDSVGSCQQHEMEGRSAQPGETSELREINEAEDNLASD DLNNCLSGNPNEKVGDEVGVCVQDASKHVPTSHRGMLRRCLDFERVARRKNLNDGSNCSS SMMLQSNENLASKDKQLVPLKPTSDSPLCVLPGIGLHLNALALSSQDNKNFKHEILSSSG RHLSVPSSTASFHSPKIGQEPVQEILTSTSAERDMVPVDDGVALAEDASQSSAYLIGEES NQNSPKKKRRRLEQAGETEASCKRCNCKKSKCLKLYCECFAAGVYCIEPCSCQDCFNKPI HEDTVLATRKQIESRNPLAFAPKVIRSSDSVPEHGDESSKTPASARHKRGCNCKKSSCLK KYCECYQGGVGCSINCRCEGCKNAFGRKDGSAIIETEAEPEEEETETSEKSGVDPILQRT EIPNNEEQNPGSALPTTPLQFSRSLVQVPFSSKFKPPRSLLSIGSSTAFYTGLNYGKPNI LRSQPKFQKRLQTDAPEDEMPEILQGNGSPGSGVKTVSPNSKRVSPPNTGLGSSPTRRSG RKLILQSIPSFPSLTPQH. >LITCHI014860.m2 MDAPQLYDNSAQLQENFDPGIEEDSVEPASDSKFVIELPRALKYDCGSPDCDPTGSVIET NCVSEMARTSALVAPFVEKAPEKNSFDDEMHPQGASQIERKKEEAGCDWESLIADSQDLL IFNYPNESETFNLIQKSVDPGARFCTSLLAQFSQSDLSGEPKLQMVDSVGSCQQHEMEGR SAQPGETSELREINEAEDNLASDDLNNCLSGNPNEKVGDEVGVCVQDASKHVPTSHRGML RRCLDFERVARRKNLNDGSNCSSSMMLQSNENLASKDKQLVPLKPTSDSPLCVLPGIGLH LNALALSSQDNKNFKHEILSSSGRHLSVPSSTASFHSPKIGQEPVQEILTSTSAERDMVP VDDGVALAEDASQSSAYLIGEESNQNSPKKKRRRLEQAGETEASCKRCNCKKSKCLKLYC ECFAAGVYCIEPCSCQDCFNKPIHEDTVLATRKQIESRNPLAFAPKVIRSSDSVPEHGDE SSKTPASARHKRGCNCKKSSCLKKYCECYQGGVGCSINCRCEGCKNAFGRKDGSAIIETE AEPEEEETETSEKSGVDPILQRTEIPNNEEQNPGSALPTTPLQFSRSLVQVPFSSKFKPP RSLLSIGSSTAFYTGLNYGKPNILRSQPKFQKRLQTDAPEDEMPEILQGNGSPGSGVKTV SPNSKRVSPPNTGLGSSPTRRSGRKLILQSIPSFPSLTPQH.
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>LITCHI014860.m2 GAGAAAAAGAAAAATAAAGAGAAGAAGATCCTAGTATCAACAACAATAACCACAGTAGGA GAGCGTTACTTTATTTAAAGCGAAACAATTGTTTATGTTGAGAGAGAGCGAAAGAGAGAG ACAGCTGTTGCACAGAGGTGGGGTTGTGTTGGTAGGGTCTCTTCATGAATTTTTGTGGGT TATCTACACGAGAAAAATAATAGTCCCACCACACACACACATACACGCATACAAACACAA ACGCATTCCCGCCTTCCCGCTCCCTCTTGAATGTCTCCATAGGAATATAGTACACACAGA CAACTAGACAAACTAATTTCACTCATTGAGAGAGAAAGTGTTTTTAGTTGGCTGTTGTAG ATATGGATGGATAGATTGTGTGTGTCTGTGAGAGTGAGTGAGTGAGTGAGTATGTGTGAG TGAAAGAAAGATGTGTGTGGTGTGAGATACGCTGCAAGTGTTTCTTGGGTAAACATGGAC ACCCCAGATAAGGCAACCCAGATCGCTACTCCACTCTCTAAATTCGAGGTGTGTGGTTTT TTTGTTGCATGTTGTTTGGTTTCGTTTCTGGGGTGTGTTGACTTTTCTGTGTCTTGGTGG ATTTGGGTTTTTTGTTTGTTGAATTGGTGTTTTTTTTTTTAAAAATTTATTATTATTATT TTGTATGGAGTTGTGTTTTGTGGTTATGAGTTTTGGAAAGTGGTTTCATTTGAGTGAATT CCTGAATTATGGTTCATGCTGATGTAGATCTTCAGTCTAACTTCAAGTTTATCAGTTTTT TATGGTCATTTGCTGCTTTCTGCTTTCTAGTGTTTGCGTTTGCTTGGATACTGTTTTTTT TCTTTTGTTGAGATCCTTTCAGTTTATACTTCTATGAAACTAGTTGTCCTACCCACTCAA CTCGGTTATCCATGTAAAGGATTCCCCTGTCTTTAACTATATCAATAGTCTTTCTCCTAT 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