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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI014860Chr159319565937364+CRC domain-containing protein TSO1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI014860.m1503538PF03638.18TCRDomain44.31.70E-11
LITCHI014860.m1589624PF03638.18TCRDomain43.92.30E-11
LITCHI014860.m2406441PF03638.18TCRDomain44.61.50E-11
LITCHI014860.m2492527PF03638.18TCRDomain44.12.00E-11
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>LITCHI014860.m1
ATGGACACCCCAGATAAGGCAACCCAGATCGCTACTCCACTCTCTAAATTCGAGGATTCC
CCTGTCTTTAACTATATCAATAGTCTTTCTCCTATCAAGCCTGTTAAGTCTATACACATT
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AGCAAGAGGGTCTCTCCACCAAACACCGGCTTGGGGTCATCTCCTACTCGTAGGAGTGGG
CGGAAATTGATACTACAGTCTATACCATCGTTCCCTTCGCTGACTCCACAGCACTGA
>LITCHI014860.m2
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ATTGAAGAAGATTCTGTTGAGCCTGCTAGTGATTCGAAGTTTGTGATCGAGCTGCCACGA
GCTTTGAAATATGATTGTGGTAGTCCTGACTGCGATCCAACAGGTTCTGTAATTGAGACA
AACTGTGTGTCAGAAATGGCTAGAACATCTGCTTTAGTTGCGCCGTTTGTTGAAAAGGCC
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GGGGCAAGATTTTGTACTTCTCTCCTGGCGCAATTCTCGCAAAGTGATCTTAGTGGGGAG
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GCTAGTGATGATCTAAATAATTGCTTAAGTGGGAATCCAAATGAGAAAGTGGGTGATGAG
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TGTAGTTCTTCTATGATGCTGCAGTCCAATGAGAATTTAGCCTCTAAGGATAAGCAACTG
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GGTCAAGAACCAGTTCAAGAAATCTTGACTTCAACCTCTGCTGAAAGAGACATGGTTCCT
GTTGATGATGGAGTTGCACTGGCAGAAGATGCTTCTCAGTCATCTGCATATTTAATCGGT
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CTTGCGTTTGCTCCTAAAGTGATTAGGAGCTCGGATTCAGTACCCGAACATGGGGACGAA
TCTAGCAAAACCCCCGCTTCAGCTAGACATAAAAGAGGATGCAACTGCAAGAAATCAAGT
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TGTGAAGGGTGTAAGAATGCATTTGGTCGTAAGGATGGGTCTGCAATTATAGAAACAGAA
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CGGTCCTTACTTTCTATCGGATCCTCCACTGCATTTTACACTGGACTCAATTATGGAAAG
CCTAATATTCTCCGATCACAACCCAAGTTTCAGAAGCGTCTCCAAACTGATGCTCCAGAA
GACGAAATGCCTGAGATTCTACAAGGCAACGGCTCTCCTGGTTCTGGTGTCAAGACCGTT
TCTCCCAACAGCAAGAGGGTCTCTCCACCAAACACCGGCTTGGGGTCATCTCCTACTCGT
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>LITCHI015290.m1
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>LITCHI015290.m1
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TGGTTAGTACTGCTGTATACTGTGAAGCTATGTG
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>LITCHI015290.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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TCCTATAACTGATAAAGTCAAAGTACATTTAATAAAAAAAATCAAAAAGAATAAAAGTAT
TTACGCGTATAAAAGCGTGTGCTGCATAAATTATTATTTATGGAATAGAATTAAGAAATC
ATTTATTTTTTTCACTTATAATTTAATGGTGCTGAATTGTACTTATTAAGTTGTTTACAT
TTTTTTAAGTGGTCAAACCACTTAAAATTACCAAAAAATAGATTAAAAAAAAAAACTAAA
ACTTTTTACATTTAACTTAATTGTAAATGACCGAAAGATATTTAAAATATTTTATTCCAA
ATTTATCATCCCCAAAATAACAATTTTTTTTTTTCAAATTTATCCTAATTTCTATTATAT
AAATTTATTTTTTCTTTTCCCTTGATACTTACAAGAAATATATTTAAAAATAAAAGTTTT
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GTAAAAATGATATAAATATTAAATTACTATTTTCAAATAATTTTAACTATAAAAACAAAC
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CTATCATAAATTTTAACAAAGCTGCTATTAAATATTTTCTTTTCATTCATGGAAAGATAA
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TAAAAAGAAAGGAAAAATAATCAGCCCACTGTTATGCAAGTTAATAAAACAATATCTGTA
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TGCAAATATATAACTGTCATTTTAAAATCATTTGTGTGCTTTCTTTTTCTTTTCTTCTTT
TTTTTGGATAATAAATTTATGTGCTTTCTTTAATGCCTGTGATAGCAATCCAATTTCCTG
CCTTTAGATTCTTAAATAAAAACTTTCATCATTTTATCTAAATATGCTCACTTTCATTAC
CTTCCTTCCCAAATTGGCTGTTTTGCTTTTAGTTTTATAATGACCAATATTGATTAGCAT
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CAGGAACAATTATTTAATGCTGTGCATGCCAGCCAACGCAGCATAGTACAAATAATTAAC
CTGAGAGGCTAAGATAACTCACCCAACTCAACTATAAATACACCACCTCTCTTCACAGTT
TTGGTGCACATCTTCTCTTCTCTTCTCTTTTCTTGCTTTTCTCTCTATTGTCACCCTCTT
CTTCTTGTCAACTTGATTCA
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>LITCHI024844.m1 GenomeSequence - 
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TGAAAACAATCACAACAACCATGGTATTTTACATATGTGACTATTGTTTCAGTGCATTTG
CAAACTACAGTGAACTTGCCCAACACGTTGCCAAACATCAGTACTCCTACTCCTGCTCCT
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ATTATTTAGTTTTTAGTTTGTTTTTAAATAGATTTTTCCAGTATTTCTAATAACTTTTTC
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AATCAGTGGGGTGGTGGCACGACGAGTCCAACTCTGGCGACGATAATCTAGGGAGGAAAG
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GTTTTATATATTTGTGTATGAATGGATCTGGAGAGAGGTTTCGGACTAGTTTTACAATTG
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ATGTTGTTGTATAATGTATAAAAACGATACACACACATATGTATATATACATATATATAT
ACATACACACCCACACACACACACACACATATATATATATAAGAAAGTTATTATTTTTCA
GCTAATGAAGCTAGTTCAACTGAAATGAGATATAGGATTACAAACGTTTATATGTTCCCA
GTAATGAGTCCAATCCTGTTCATGCTATAAATCCACCGTGTGCTATATATGGTTTAATCA
GTTATATGTAAGCGCCTTGCTAGTTGTAGCGGAGGGAATGATCTCCTTGGACAATTACAA
GATTGCATTGCAAGCTGGCATTGCGAGCAGCTGAGGAATCCTTAA