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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI014746 | Chr1 | 4844437;4848658 | 4859344 | + | Probable ATP-dependent DNA helicase CHR12 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI014746.m1 | 406 | 568 | PF04851.18 | ResIII | Family | 35.7 | 8.70E-09 |
LITCHI014746.m1 | 410 | 698 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 245.1 | 8.70E-73 |
LITCHI014746.m1 | 679 | 857 | PF11496.11 | HDA2-3 | Domain | 28.6 | 8.30E-07 |
LITCHI014746.m1 | 717 | 830 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 74.2 | 1.10E-20 |
LITCHI014746.m1 | 923 | 987 | PF14619.9 | SnAC | Domain | 42.2 | 9.50E-11 |
LITCHI014746.m2 | 406 | 568 | PF04851.18 | ResIII | Family | 35.7 | 8.70E-09 |
LITCHI014746.m2 | 410 | 698 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 245.1 | 8.70E-73 |
LITCHI014746.m2 | 679 | 857 | PF11496.11 | HDA2-3 | Domain | 28.6 | 8.30E-07 |
LITCHI014746.m2 | 717 | 830 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 74.2 | 1.10E-20 |
LITCHI014746.m2 | 923 | 987 | PF14619.9 | SnAC | Domain | 42.2 | 9.50E-11 |
LITCHI014746.m3 | 406 | 568 | PF04851.18 | ResIII | Family | 35.7 | 8.70E-09 |
LITCHI014746.m3 | 410 | 698 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 245.1 | 8.70E-73 |
LITCHI014746.m3 | 679 | 857 | PF11496.11 | HDA2-3 | Domain | 28.6 | 8.30E-07 |
LITCHI014746.m3 | 717 | 830 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 74.2 | 1.10E-20 |
LITCHI014746.m3 | 923 | 987 | PF14619.9 | SnAC | Domain | 42.2 | 9.50E-11 |
LITCHI014746.m4 | 406 | 568 | PF04851.18 | ResIII | Family | 36.3 | 6.00E-09 |
LITCHI014746.m4 | 410 | 698 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 245.7 | 5.60E-73 |
LITCHI014746.m4 | 679 | 865 | PF11496.11 | HDA2-3 | Domain | 29.5 | 4.40E-07 |
LITCHI014746.m4 | 717 | 830 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 74.7 | 7.60E-21 |
LITCHI014746.m5 | 406 | 568 | PF04851.18 | ResIII | Family | 35.7 | 8.70E-09 |
LITCHI014746.m5 | 410 | 698 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 245.1 | 8.70E-73 |
LITCHI014746.m5 | 679 | 857 | PF11496.11 | HDA2-3 | Domain | 28.6 | 8.30E-07 |
LITCHI014746.m5 | 717 | 830 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 74.2 | 1.10E-20 |
LITCHI014746.m5 | 923 | 987 | PF14619.9 | SnAC | Domain | 42.2 | 9.50E-11 |
LITCHI014746.m6 | 238 | 400 | PF04851.18 | ResIII | Family | 36.1 | 6.80E-09 |
LITCHI014746.m6 | 242 | 530 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 245.5 | 6.50E-73 |
LITCHI014746.m6 | 511 | 689 | PF11496.11 | HDA2-3 | Domain | 29 | 6.30E-07 |
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LITCHI014746.m7 | 242 | 530 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 245.5 | 6.50E-73 |
LITCHI014746.m7 | 511 | 689 | PF11496.11 | HDA2-3 | Domain | 29 | 6.30E-07 |
LITCHI014746.m7 | 549 | 662 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 74.5 | 8.50E-21 |
LITCHI014746.m7 | 755 | 819 | PF14619.9 | SnAC | Domain | 42.5 | 7.70E-11 |
LITCHI014746.m8 | 406 | 568 | PF04851.18 | ResIII | Family | 35.7 | 8.70E-09 |
LITCHI014746.m8 | 410 | 698 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 245.1 | 8.70E-73 |
LITCHI014746.m8 | 679 | 857 | PF11496.11 | HDA2-3 | Domain | 28.6 | 8.30E-07 |
LITCHI014746.m8 | 717 | 830 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 74.2 | 1.10E-20 |
LITCHI014746.m8 | 923 | 987 | PF14619.9 | SnAC | Domain | 42.2 | 9.50E-11 |
LITCHI014746.m9 | 406 | 568 | PF04851.18 | ResIII | Family | 36.9 | 3.90E-09 |
LITCHI014746.m9 | 410 | 664 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 229.9 | 3.60E-68 |
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CTACAATCAGCAGATACTGTAATAATCTTTGATAGTGATTGGAATCCACAAATGGATCAA CAAGCAGAAGATCGGGCCCATCGAATTGGACAAAAGAAAGAAGTTAGAGTTTTTGTTTTG GTTAGTGTTGGATCAATTGAAGAGGTAATCTTAGAACGTGCCAAGCAGAAGATGGGCATT GATGCCAAGGTCATCCAGGCAGGACTTTTCAATACAACGTCTACCGCTCAGGACAGAAGA GATATGTTGAGGGAGATAATGCGCAGAGGTACAAGCTCCCTTGGAACAGATGTTCCAAGT GAGAGAGAAATCAACCGCCTTGCAGCCCGCACAGAAGAGGAGTACTGGTTGTTTGAGAAG ATGGATGAAGAGAGAAGACAGAAAGAGAATTACCGATCTCGTCTCATGGAAGAACATGAA GTTCCTGAGTGGGCATACTCTGCACCTGAAACTAAGGAAGATCAGAACAAAGGTTTTGAG CAAGATAGCAGTGCCATCACAGGAAAACGAAAAAGAAAGGAGGTGGTTTATGCTGATACA TTAAGTGATTTACAATGGATGAAAGCTGTGGAAAACGGACAAGACATATCAAAGCTCTCG ACTAAAGGAAAGAGAAGGGACCATCTTCCACCAGAGGGCAATGAGTCGGTTAGTAACAAT TCAGGAACAGAGAAAAGGTTATTGGAATCGAAGAATGAGAGTATGCCTATGGTGAGTGAG GGAACAAGTGAGGATACCTATGGTTCTGCCCCAAAGAGGCTGAAGTTTGAAAGGGGTAGT TCAGAAAAATCTGAATACCAGAGTGTCGACAAATCTGAATATATGGGTGTTCAAGGAAGT AGTTTGAACGGGCATTTATTTACATGGAATACCCACAAGAAGAAGAGATCAAGTTATGCC GTCCAGAGCTCCTCATCCGATTCCAGACAGAATTCAAATGGAAGAGGAAATGGTTGGACT TGA >LITCHI014746.m3 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>LITCHI014746.m3 GenomeSequence + GGATTATACACACAAAACATAGAGTGTGAGTGTGTGGTTTGTTGATCTCTCTCTCTCTCT TTAAGCACCAGATAAATTTAGTTTTAAAAATACCGCTAAAATTAACCCCCTCTCACACAC AAAAATATTGAAATTATTAGACATATATTAATTTAACCGTTTTGATACTCTTATTCGCGC GCTCTCTGCTCTCATGGTTACTCAGCTAGAGCACCGTCAACCTGAGACGACCTGCCTCGA CCCTGCCGAGACCACCAAGTCCTTGATCTGCGCCTTGAACTTCATATCCCGTGACCTCCC GCTCCCTCCTGACCTGTTGGACACCGTCTCGTCTATCTATCATGCCGACGGGGACGCGAT TGATTGCGACGCTCCCGCCGATGGAAACGACGCCGCTCGCGGATCTGGCAAGGGTTCGGT GAGTGTTTTTTTTGGATTGTTGTGGATTTGAGGGTTTTGCGGTGGATTTTGGGGGTTTTG TGGTTTTTTGGAATGTGGTTTTGTTGGTTTGATGTGTTTTTGGATTGGGCATTTTTGTGA GATTTGTCTCTAGGGTTCTTTGTTGTTGTTTTGGTCTGTCTTAGTCTGAAATTGGCTTGA GTTTTTGTCTTTTATGTGTGTTTTGGTGTTGGAATTGTTGTGATTTTGAAGTGAATTTTT AGGTGAGGGTTTGATTGGATTGATGAGTTTTTAGTGAAATTGCTTGTCAATGAGATAGCT AGTTGTTTTGTTTGATTTTTAATTTGTGAAAATTGCATTTTGAAATTGCTTGTCAATGGG GCATCTGTTGAAAGAATTTTGGTTAAGATTTAACTAGAAATTAATTAGTCTTCTGCTTTG AAATTGTCTATGAAATCAATGTTTGATAAGTTGATTTTGTGGTTTTTAATTAGCTTTTGG 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