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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI014711 | Chr1 | 4588417;4588681;4589010 | 4590614;4590506 | - | Transcription factor MUTE |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI014711.m1 | 2 | 49 | PF00010.29 | HLH | Domain | 33.2 | 4.20E-08 |
LITCHI014711.m3 | 2 | 49 | PF00010.29 | HLH | Domain | 33.6 | 3.10E-08 |
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>LITCHI014711.m1 ATGTCTCACATAGCTGTGGAGAGAAACAGAAGAAGACAGATGAATGAACATCTCAAGGTT TTGAGATCTTTAACCCCATGTTTTTATATCAAAAGGGGAGATCAAGCATCAATTATAGGG GGAGTGATAGAGTTTATCAAGGAGTTGCATCAAGTTCTACAAGCTTTGGAGTCAAAGAAA CAAAGGAAGAGTTTGAGCCCTAGCCCCAGTCCAAGTACTCCAAGGCCGGTAGTGGTGCAC CAAAGTCCTAATCAACCTGCAGGTGATCATACCTTATTAGGATTTGATAGTTTCAAGGAA CTGGGAGCAAGCTGCAACTCTTCGGTTGCAGATGTGGAGGCAAAAATCTCTGGATCAAAC GTGTTATTGAAAGTTATATCAAGGCGAATACCTGGTCAAGTTGTGAAGATAATCAGTGTG TTGGAGAAACTCTCGTTTGAGGTTCTCCATCTCAACATCAGTAGCATGGAGGACACTGTT CTATACTCCTTTATCATTAAGATAGGATTGGAATGCCAGGTGAGCTTGGAAGAACTGGCA CTTGAAGTTCAACAGAGCTTCTTTCCGAGTGCTGCTTTTGCTACCGAGATATAG >LITCHI014711.m2 ATGTCTCACATAGCTGTGGAGAGAAACAGAAGAAGACAGATGAATGAACATCTCAAGGGA GATCAAGCATCAATTATAGGGGGAGTGATAGAGTTTATCAAGGAGTTGCATCAAGTTCTA CAAGCTTTGGAGTCAAAGAAACAAAGGAAGAGTTTGAGCCCTAGCCCCAGTCCAAGTACT CCAAGGCCGGTAGTGGTGCACCAAAGTCCTAATCAACCTGCAGGTGATCATACCTTATTA GGATTTGATAGTTTCAAGGAACTGGGAGCAAGCTGCAACTCTTCGGTTGCAGATGTGGAG GCAAAAATCTCTGGATCAAACGTGTTATTGAAAGTTATATCAAGGCGAATACCTGGTCAA GTTGTGAAGATAATCAGTGTGTTGGAGAAACTCTCGTTTGAGGTTCTCCATCTCAACATC AGTAGCATGGAGGACACTGTTCTATACTCCTTTATCATTAAGATAGGATTGGAATGCCAG GTGAGCTTGGAAGAACTGGCACTTGAAGTTCAACAGAGCTTCTTTCCGAGTGCTGCTTTT GCTACCGAGATATAG >LITCHI014711.m3 ATGTCTCACATAGCTGTGGAGAGAAACAGAAGAAGACAGATGAATGAACATCTCAAGGTT TTGAGATCTTTAACCCCATGTTTTTATATCAAAAGGGGAGATCAAGCATCAATTATAGGG GGAGTGATAGAGTTTATCAAGGAGTTGCATCAAGTTCTACAAGCTTTGGAGTCAAAGAAA CAAAGGAAGAGTTTGAGCCCTAGCCCCAGTCCAAGTACTCCAAGGCCGGTAGTGGTGCAC CAAAGTCCTAATCAACCTGCAGGTGATCATACCTTATTAGGATTTGATAGTTTCAAGGAA CTGGGAGCAAGCTGCAACTCTTCGGTTGCAGATGTGGAGGCAAAAATCTCTGGATCAAAC GTGTTATTGAAAGTTATATCAAGGCGAATACCTGGTCAAGTTGTGAAGATAATCAGTGTG TTGGAGAAACTCTCGTTTGAGGTTCTCCATCTCAACATCAGTAGCATGGAGGACACTGTT CTATACTCCTTTATCATTAAGGTATAA
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>LITCHI014711.m3 - Up_Stream_Len 2000 TGTATTCATTTCATTCACTGAGAGAAACAATATTTTGGAGCTCCATTAATAACTTCCATG ATTTTCTTTGTATTTTTTTCCACCTATGTTTGAGACTTCATTAAACACATTTCATTTTAA TTAAGCTTTTGTTTTCATCTGCAAAAAATATAATAGATGTATATAAGCAACCTTTCATTA AATTAAACAATTATAGAACCTACCATATGTTAGATAATTTAATCAATTATCTATAAATTA ATTAGATGAACAAAATTAAATTAATTAGTTTATCCCTAAATTTTCTATATCTAAAAAGTA TAGTTACCCTAAAATTTTAATCAATATAATCAATTTATATAAACTATTCAAGTTCATAAC AAAATAAACTAACAATGATAATATCTAAATTTTCCTTAATTAAAAATTATAATATCTCTA AATTTTTAAACAAAATAATCATTTAAATTCATAAATTTCACAAAATAACATATTTAATTT GGAGACCAATTTTGATATAGATAAAAAGATGAAACTAGTTGTTGATGTTGACACAAAAAT GGAATGGAACCAAATCTAATAATGTAAATCAATAATTAAAATTAGTACAAATTTTAACAT TAAATAAAATAATTAAATATGTAAATTTCTTAAAATACATACCTAATATAAAGAATGGAG TCAACAAAAGTTATCTTTTGTTTGTTTCTACTATATGTTCAAGTAAAAAAAAAACAAACA AAGGAAATTGAAATGGTATGGAAGTAGAATCACAAAAAATTAGGGGCAACAGCAAGATTC ATTAGAAGCCAAGAATATGAAGTGGTGTACTTCAATAATAATAATAATAATAATAAAAGA ATATGGAGTGGTGTGCTGTCAGCTGTGGAGTGGCTATCAAGGAGGAGACAATTTAAAAAT TTTTATCAAGAGCTCTGCTGTAAGTCTTTGTAATTGGGCCAGCTAGTCTTTGAAAGAATT TTATAGTATGGTTTAAGCCTGAAGGACAATTTAGTAATTTTATGAAAAAAATTTTAAAAT GGGCTAGGGTGGCGGGAGCCCACCCTAGCCCAAACGTAGTTCCGTCCCTGTTTATGATCG ATTATTAATCCATATATGTACAACTTGCTTGTTCACGTTTTACGATAATAACAAAGCAAA AAAAAACTCGAAGTTCTTACTAAACAGATTCGGACATCTCATCTAATCGAAGTTCACTTT ATGAGCTTTATAAATGTACAAGTAGCTACACATACAAAAACAATATATCTAATTCAAAAT TTCAAATAATATTACATGTTACTTGGACCTTATTATTTTACGGACCATGAGAATATCAGG TAGCTTACGGGATATTGGTCAAATTAAGTGAAGTACTTAATGACATGAGCATGATAGTAC AAATAAATGTTGCCATTTCCAAATCTGGATTATTATTATTATTATTATTATTATTTACAT TTATTTTTTAACTATTCATCACAAATTGAGTCTTTGTCTAGATAAAAACATAGATCAAAG AGAGTATTCAGGCACATTCACTTGCTTAATCGACATGGGGAAACGAAAGCTCAAATCCAA AAACATTGTCACGTGTTGTCGAGAGAGAGAGACAAGTGTCATGGATGGTTGGTTGAGGAG GGAAGTACAAGCATGGGAAAGATTAAAAAGAAGTTAAAGTGGGAAGGCCTCCGTAGTTTC TAACTCACACGAGGAATGTAATTGACCCAAGATCATAAACGTGAGACGACGTAATATCTA CAAGAGAAAGAGAGGGAGAGAGAGAATAACGGGACACTTGCAAAAACTCTCTCACGGGAC TCCAACATTCAGCATTTAATATCCCTAAACAAATCCAAGTACCTAGCAGACTTCGATCGG CTACCTCATCCTCATCTCTCTGTCTCATACATACACTTCCTTGGCTTATAAATGGAAAAA AACCTTACATTTGAGGTGAAGGAGAATAATAACTTGGTTGAAACTTTGAAGAGATAGAGA GAAAAAAAAAACCCAAAAAA >LITCHI014711.m2 - 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>LITCHI014711.m3 GenomeSequence - TCTCTCTGTCTCATACATACACTTCCTTGGCTTATAAATGGAAAAAAACCTTACATTTGA GGTGAAGGAGAATAATAACTTGGTTGAAACTTTGAAGAGATAGAGAGAAAAAAAAAACCC AAAAAAATGTCTCACATAGCTGTGGAGAGAAACAGAAGAAGACAGATGAATGAACATCTC AAGGTTTTGAGATCTTTAACCCCATGTTTTTATATCAAAAGGGTAATAATATCTCTCTCT CTTTATTTATATATTTATAGTAAATACTGATTAGTTTAATTAATAAGATCTATTAATTAT CATTTTATCTGTTAAATATTAGTAGAGGAAACTTTTGATTTTTTTACTTCTTGGATTTGA AATTAAAGTGTTTATATTGTAATATTAACTTTTTGTTGTTTAACTGTAGGGAGATCAAGC ATCAATTATAGGGGGAGTGATAGAGTTTATCAAGGAGTTGCATCAAGTTCTACAAGCTTT GGAGTCAAAGAAACAAAGGAAGAGTTTGAGCCCTAGCCCCAGTCCAAGTACTCCAAGGCC GGTAGTGGTGCACCAAAGTCCTAATCAACCTGCAGGTGATCATACCTTATTAGGATTTGA TAGTTTCAAGGAACTGGGAGCAAGCTGCAACTCTTCGGTTGCAGATGTGGAGGCAAAAAT CTCTGGATCAAACGTGTTATTGAAAGTTATATCAAGGCGAATACCTGGTCAAGTTGTGAA GATAATCAGTGTGTTGGAGAAACTCTCGTTTGAGGTTCTCCATCTCAACATCAGTAGCAT GGAGGACACTGTTCTATACTCCTTTATCATTAAGGTATAAATTACCATTCCTCAAATAAG AGAAGTTTTATTGAGTCTAATTACTACGTTCTAATTAGCTTGAAGATCACGATAATATAT ACGGAACTATATGATCACTTTTAAATTAAAATTTCAATATGCAATTTGCGGAAGAGAAAT CTCTTGCTAGCCATGTTTCCATTGATTTTCAAATCTAAAAAGTGCATAAAATATTAGAAT ATCAAGTTGCTAGCCATGGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAAGAAGTACCATGAGAAT TTAAGTTTACGTTCGTATATACATGGTTGAAAATATCATGGTTTCATTGTCTTCATGATA TGCATCCATAGTGACATATTGGTCAATCATCCATACGAACGTTATGCGAAATTTAGGCGC CTCAGAAGCCGCAATAGCATGCATGCTCAATCATCATTTTTTGATATAATTCTCATCAGT TTTAACATCCATCGTTTAAAGTTATACACAATTGTAACTTCAAATTTTCTATATCATTTA TTTTACCAATAGAAGAAACTAAAATGTAACACATAAGATCATTTGCATAACAATATGTTT ACGTTAATATAAAACAGCAAAAATTTTAGTAAATTAATTGCATGCAATGCAAGACATTTC AAATTCAAATAAGTTAAGAGATAGAAAGTTTTCGAAAAGGCATGCTTTTGTCTTTCTTGC CATAGGATATGCATGCACGATCTTGTATCAATATTCATAAGCTTATAATAATAATATTTG GCTATTATATATATATATATATATATAGAACATATAACGATTGCT >LITCHI014711.m2 GenomeSequence - 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