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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI014612 | Chr1 | 3086347 | 3093419 | + | Squamosa promoter-binding-like protein 7 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI014612.m1 | 130 | 204 | PF03110.17 | SBP | Domain | 96.3 | 1.10E-27 |
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>LITCHI014612.m1 ATGGAACCGCACGGCGTTCAACGGCCGCTGAATCTTCCAGAGACGAACGTCCACGCCCCG GAGACGGAGGATGACTTGTCCACTTCAGCGATCTGGGACTGGGGCGATCTCCTGGACTTC GCCACTGACGATCACTTACACCTCCCTCTCGACTCCGATTATATCCAATTCACCGACACT ACCCTCCCGGACCCTCCACCGGAGCCTCCGATTATCAGTTCGGATCGGATTCGGAAGCGC GACCCGAGGTTGACTTGTTCTAATTTCCTGGCTGGTCGGATCCCTTGCGCGTGTCCGGAG CTCGACGAGAAGCTGGAGGAGGAGGAGGCTGCACTTCCCGGCAAGAAGCGGGCCCGGACG GTTCGGGCGGGGCTGAATAAGACCCGGTGCCAGGTGCCTGGTTGCGAGGCGGATATCAGC GAGCTAAAAGGCTATCATCGGAGGCATAGGGTTTGTCTCCGCTGCGCCAACGCCAGCGTT GTCTTGCTTGAAGGAGAGAGCAAGAGATACTGTCAACAGTGTGGCAAGTTTCATGTGTTA TCGGACTTTGATGAAGGTAAGAGAAGTTGTCGAAGGAAATTGGAGCGTCACAACAATAGA CGGAGAAGAAAGTCTGTAGATTCGAAAGGTGTTTTGGAGAAGGAGCTGCCGGGGTCATCG CATAGTGAAGATCTTGTTTGCGATGGTGAAGCGGGAAAAGATAGTTTATGTGTTAGCAGC CAGTTGGATGATCAAGAACCGTTGTTTGACTGTGAAGATGGTCGTGTTTCGACTCTTAAC TCAGAGCCTAGTTCGCAGAATGTTAATAGTGATAGTGGAGTTTCATTCGCTGCTTCTGGT GAAACTCAAACGGATGGAAGAAAGGATGACTCAAAAGTTTCGCATTCCCCTTCGTATTGT GACAATAAGAGTGCTTATTCATCTTTGTGTCCAACAGGCCGAATCTCATTCAAGCTGTAT GATTGGAACCCGGCAGAATTTCCCAGAAGACTTCGGCACCAAATATTCGAATGGTTGTCT AGTATGCCAGTTGAGTTGGAGGGGTATATCCGTCCTGGATGTACTATCTTTACTGTATTT ATTGCGATGCCTACGATTATGTGGTTGAAGTTGTCTAAAGATCCTGTCACATATGTTCAT GACTTTGTTGTTGCACCTGGAAGGATGCTATCTGGAAGAGGCTTTGTAATTGTTAATCTA AACGGCATGATCTTCCATGTTAAAGATGGAGCTTCTGTGATTAAAGTCAATGCGGAGGTG CGAGCCCTGAAGCTTCACTATGTACATCCTACATGTTTTGAGGCTGGCAAGCCCCTGGAG TTTGTTGCTTGTGGAAGTAATTTGCTACAACCCAAATTTCGGTTTCTAATATCTTTTGCT GGAAAGTATCTGCCATATGATTTTTGTATTACATCTCCACACGGTCAAAGTGAAGGGGGT TCTGTTGTGTTTGACCATCAATTATACAAGATATCTGTCCCTCAAACAGAACCAAATCTC TTTGGTCCTGCGTTTATTGAGGTAAGCATTCAAATACATAGAATTGAAGCATCTCTCTTT CCTGAAAGATCTCAGTTTGAGGCTGGTGGTTCTAAGTGTAACTTGTGTGGGGTTTCTGTG TTGAGGCAAACAGCAGTAAGTGAATTTCTCTTAGACATAGCATGGCTACTGAGGGCACCA GAATCAGAAAGTTTTCAACAGTTTATGTCTGCTTCACAAATTCAGAGAGTCAATTCCCTA TTAAGTTTTTTGGTACGTAACGAGTCAATCACCATTTTGGAGAAAGTGATGCAACATCTG ACAGTCTTAATAGATAAGATGGGGTTAAACAGTGCAGTTTTGGTCTCCACGGACAGTGAT ATTGGGCGATTACTAAAATATATGGATTCTGCAAGAGATATTCTTCATCAGAAACTTCAA AAAGATGGAGGGTTAATGCAACAGTCAAGGGACATAGTGCCAAAATTGTGTTCAGGTTCT CAATACTGCTTACAAAGCGACTCGCTTGTTTCAATCATGGATCAGGATTTGGAGGCAAGA TCAAAGGATAAGTTAGGAGAAAGGGTGGATATGGATTCAACCACTGTCCATACATTCGAA ATTGATCCTCTTCTTAACAAAGAAGTTGTTATGAATGTGAGCCTTAACAAGGAATTTCCA AGGAAATCATGTGGTCAAATTTTCTCTGGCAGAGTCCTGATAACTCGTCCGGCAATACTT GTAGCATCTATTGTTGCTGTTTGTTTTGGGTTATGTGTGGTCCTTCTTCACCCTCGGAAG GTTGGTGATTTGGCAGTATCCATACGTCGATCTTTGTTTGGCAGATTTTAG
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>LITCHI014612.m1 MEPHGVQRPLNLPETNVHAPETEDDLSTSAIWDWGDLLDFATDDHLHLPLDSDYIQFTDT TLPDPPPEPPIISSDRIRKRDPRLTCSNFLAGRIPCACPELDEKLEEEEAALPGKKRART VRAGLNKTRCQVPGCEADISELKGYHRRHRVCLRCANASVVLLEGESKRYCQQCGKFHVL SDFDEGKRSCRRKLERHNNRRRRKSVDSKGVLEKELPGSSHSEDLVCDGEAGKDSLCVSS QLDDQEPLFDCEDGRVSTLNSEPSSQNVNSDSGVSFAASGETQTDGRKDDSKVSHSPSYC DNKSAYSSLCPTGRISFKLYDWNPAEFPRRLRHQIFEWLSSMPVELEGYIRPGCTIFTVF IAMPTIMWLKLSKDPVTYVHDFVVAPGRMLSGRGFVIVNLNGMIFHVKDGASVIKVNAEV RALKLHYVHPTCFEAGKPLEFVACGSNLLQPKFRFLISFAGKYLPYDFCITSPHGQSEGG SVVFDHQLYKISVPQTEPNLFGPAFIEVSIQIHRIEASLFPERSQFEAGGSKCNLCGVSV LRQTAVSEFLLDIAWLLRAPESESFQQFMSASQIQRVNSLLSFLVRNESITILEKVMQHL TVLIDKMGLNSAVLVSTDSDIGRLLKYMDSARDILHQKLQKDGGLMQQSRDIVPKLCSGS QYCLQSDSLVSIMDQDLEARSKDKLGERVDMDSTTVHTFEIDPLLNKEVVMNVSLNKEFP RKSCGQIFSGRVLITRPAILVASIVAVCFGLCVVLLHPRKVGDLAVSIRRSLFGRF.
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>LITCHI014612.m1 GTCGCGTCCATGGAAGTTATAATATATTTACTTAAACAAAATAAAAAAGACAATAATTAA AAAAAGACCTTTCGGAGTCGAGTCACCACCACCTAAAGTTCTGTGGTAGTTACTGACCAT CCCTTTTACGCCACCTCTGTATTTGTTTTTTTAATTCATTTCTTAATTTTCGTATTAATC TTAAAAAACACACTCCCACGCGCACAGATTTGCAGAGTCCAGAAGATATGGAACCGCACG GCGTTCAACGGCCGCTGAATCTTCCAGAGACGAACGTCCACGCCCCGGAGACGGAGGATG ACTTGTCCACTTCAGCGATCTGGGACTGGGGCGATCTCCTGGACTTCGCCACTGACGATC ACTTACACCTCCCTCTCGACTCCGATTATATCCAATTCACCGACACTACCCTCCCGGACC CTCCACCGGAGCCTCCGATTATCAGTTCGGATCGGATTCGGAAGCGCGACCCGAGGTTGA CTTGTTCTAATTTCCTGGCTGGTCGGATCCCTTGCGCGTGTCCGGAGCTCGACGAGAAGC TGGAGGAGGAGGAGGCTGCACTTCCCGGCAAGAAGCGGGCCCGGACGGTTCGGGCGGGGC TGAATAAGACCCGGTGCCAGGTGCCTGGTTGCGAGGCGGATATCAGCGAGCTAAAAGGCT ATCATCGGAGGCATAGGGTTTGTCTCCGCTGCGCCAACGCCAGCGTTGTCTTGCTTGAAG GAGAGAGCAAGAGATACTGTCAACAGTGTGGCAAGTTTCATGTGTTATCGGACTTTGATG AAGGTAAGAGAAGTTGTCGAAGGAAATTGGAGCGTCACAACAATAGACGGAGAAGAAAGT CTGTAGATTCGAAAGGTGTTTTGGAGAAGGAGCTGCCGGGGTCATCGCATAGTGAAGATC TTGTTTGCGATGGTGAAGCGGGAAAAGATAGTTTATGTGTTAGCAGCCAGTTGGATGATC AAGAACCGTTGTTTGACTGTGAAGATGGTCGTGTTTCGACTCTTAACTCAGAGCCTAGTT CGCAGAATGTTAATAGTGATAGTGGAGTTTCATTCGCTGCTTCTGGTGAAACTCAAACGG ATGGAAGAAAGGATGACTCAAAAGTTTCGCATTCCCCTTCGTATTGTGACAATAAGAGTG CTTATTCATCTTTGTGTCCAACAGGCCGAATCTCATTCAAGCTGTATGATTGGAACCCGG CAGAATTTCCCAGAAGACTTCGGCACCAAATATTCGAATGGTTGTCTAGTATGCCAGTTG AGTTGGAGGGGTATATCCGTCCTGGATGTACTATCTTTACTGTATTTATTGCGATGCCTA CGATTATGTGGTTGAAGTTGTCTAAAGATCCTGTCACATATGTTCATGACTTTGTTGTTG CACCTGGAAGGATGCTATCTGGAAGAGGCTTTGTAATTGTTAATCTAAACGGCATGATCT TCCATGTTAAAGATGGAGCTTCTGTGATTAAAGTCAATGCGGAGGTGCGAGCCCTGAAGC TTCACTATGTACATCCTACATGTTTTGAGGCTGGCAAGCCCCTGGAGTTTGTTGCTTGTG GAAGTAATTTGCTACAACCCAAATTTCGGTTTCTAATATCTTTTGCTGGAAAGTATCTGC CATATGATTTTTGTATTACATCTCCACACGGTCAAAGTGAAGGGGGTTCTGTTGTGTTTG ACCATCAATTATACAAGATATCTGTCCCTCAAACAGAACCAAATCTCTTTGGTCCTGCGT TTATTGAGGTAAGCATTCAAATACATAGAATTGAAGCATCTCTCTTTCCTGAAAGATCTC AGTTTGAGGCTGGTGGTTCTAAGTGTAACTTGTGTGGGGTTTCTGTGTTGAGGCAAACAG CAGTAAGTGAATTTCTCTTAGACATAGCATGGCTACTGAGGGCACCAGAATCAGAAAGTT TTCAACAGTTTATGTCTGCTTCACAAATTCAGAGAGTCAATTCCCTATTAAGTTTTTTGG TACGTAACGAGTCAATCACCATTTTGGAGAAAGTGATGCAACATCTGACAGTCTTAATAG ATAAGATGGGGTTAAACAGTGCAGTTTTGGTCTCCACGGACAGTGATATTGGGCGATTAC TAAAATATATGGATTCTGCAAGAGATATTCTTCATCAGAAACTTCAAAAAGATGGAGGGT TAATGCAACAGTCAAGGGACATAGTGCCAAAATTGTGTTCAGGTTCTCAATACTGCTTAC AAAGCGACTCGCTTGTTTCAATCATGGATCAGGATTTGGAGGCAAGATCAAAGGATAAGT TAGGAGAAAGGGTGGATATGGATTCAACCACTGTCCATACATTCGAAATTGATCCTCTTC TTAACAAAGAAGTTGTTATGAATGTGAGCCTTAACAAGGAATTTCCAAGGAAATCATGTG GTCAAATTTTCTCTGGCAGAGTCCTGATAACTCGTCCGGCAATACTTGTAGCATCTATTG TTGCTGTTTGTTTTGGGTTATGTGTGGTCCTTCTTCACCCTCGGAAGGTTGGTGATTTGG CAGTATCCATACGTCGATCTTTGTTTGGCAGATTTTAGATGTTGTAAGAGGCCAGAAAAT GAAACAAGCTGTGTCGTCTCCCTATCTACATGTATTTATTGTACACTAGTAGATTAAGTT GGTTGAAGTGCAATCTAGCTCCTATCATGTATGTTAAATGGGTCAGGGGGCTTAATTGTC CAGTGATAGTCACCGATTCCAGTTCATCGAAATGCTTCTGTGTACTGCCTGGTGGATGTA ACATGATACAGCTTAATGTAATTCAGATTGAGAAGAAGATGATCAATGGTAGTAACCGGT TGAGAGAGGTTTGTTGTTGCCGAATCCAATCTTTAAAGTTATAACTCAGTTTCGTACAAA TATCCTGTTGTAATAACTTTAGATCTTCAGTTTTGCTGTATTGAAAATGATGGGAACAAT TAGAGAGGTAAGAAGGATTTGATAATATTTTGCCTGCAATGTAACTGTGTTCTTCAAATT TGGAAGCTCAATCAAGACACCAATGTCAGATCCTTATAGTTTTCTACCATACAGATTCAG TAGCTTTATTGAGTGATAACATATCCTCATAAAATCAAATAGTTAAAAGAGGACAATATT TTCAGATTAAAAAATATATATTGGTGGTATCTTTCTTGCAATGGAAACTATACAGCAGAA TGCAATTTTCAGTTTCTTTGAAAATATTTATCATGACCGGACAACCTTGGATTACAATTA TGGCAGATATTTCTTGTGCAAAAATCTACAAACTACACTGCAGGTAATGTTGTTGTAACA GTCAACTTCGGGCTTCATTGTCTTGTGACTGGAACTCAAGTAGTGTATTTCCTTTTCCAC TCTGGGCTTGATTATTCTGGTCCCTTGAACTCAAGGAGTGGTGTATTTAGTCAATAAGTG CTTTGCCGCAACCGTGACTGCACAACTCAACGTCTTTCATATCTTGGGTTCAACATCCAA TAGCCATTAATGTGGTTGACATCCTCCATCTTCATGTGAGTCGATCCCTTTCATATGAGT GCTGCTCCTCAAACCGCATCATCAGTGTTTCATTCATTTTGATCCCGATAGTTTTTTAAG TCAATCCCGACAATTAGAAAGAAAAAAATAAAAAGTAGTGGTGTATTTCCTTTCCATTTC GTGATAAAAAGTTTCTAATCTCTAGATGTATGCATTTACCAGC
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>LITCHI014612.m1 + Up_Stream_Len 2000 CTTAATATAAAACATGTCGTCACTTCATTTTATAATCTCCTTTGACAGCGATCCTCCACC CACCTATTCCCACTCGCCCAACCACCCACTTTACACTACCAACTCCCAACCCAACAAACG CGTGCCCCCCACCCGAGCGTGAACTCTCCCCCTTCCCTGTCGGCACGATAATAAGCTCAC ATCTTTTTACCCCTAAACACAAAAATAAAATAATAAAAAATAAAACAACGCACGACATTT TCAAACCCATTCCAACTTTGTAAGAAAGGAATTTGTCTTATTACAGACATTGGTGGGGAG TGTCACATGATTACGAATTAATTAATTCATTTCGATAGATTTAATAAATTCCTTATAACA ATAAGTAGATTTTTATAAATAAATAATAATTAACTTCAATAAATCATTAATAAATCTTTA ATTATTATAAATATCTTTGATTTTTATAAATAAATAAATAATAATAATTAATTTCAATAA ATCATAGATAAATCTCTTATTATTATGAATATCTTTTAAATCATAAATGACTGATAATTA TTTAAATAATTTTGACAAGCTCCCTAAATAACTGATTGCTTATTAATTTTGCACCTAAAT TGACTTATGTAGAGGGAAAAAAAAGAAGATTTCATAGTTGAAAAGATTGGTTGAAGTTCT TTCCACAGGCATTGCATCATAATTGATTGACATTTATGTCGAGAATGGTTAATGAATCTT CATCTTGATATACAACTTATTCATTTTTGTTGAAGGATTTGGAGGTCTGATTTAGCGATC GATATAAAACACACGTTTAGATTGTGGACAATATTGCTAAAAAGATTAAAGCTAATGGAA GACGAAATTGCTTTGTTGAAAAGGGCCTTGAACAACATAAATCATTCGGTGAAGACCTTG TTTCAAAATAAGGAAAAAACTAAAAATCCCTTAATGAAAATAATAACACCAAACCCCATT TTTAAGAGTAAAAATGAGTAGTTTCACCTTAGATTTATTTTCATGAGATATTTTGATAAT ATCTCTTCAAAGTCAAGGTGTCTTTAATGGCAGCACAAATATTGAAGAGTTACAAGAAGG ATTACCGATAGTGAGCATGTGAGCATCATAAGCATGCATTCAAGTAATGTCATGAAACTG CAGTGGCATCCAACGATGGCTGATGATCTAAGTGCAGACAAGCCAAAAATAGTAACATAA GAGACATTGAAGGAGGAATTAAACAACTGATTCTTGGTTCCTTCCTTGCAATATGTCGTG CGTTTCAAGGGAATCATTGAAAAAAATTAAGACAAACAGGTATTTACTACAAAATTCAAG TACCATCAAATACATTTGTCCATATTTACCTGACGTTTTCTTCTCCAATAATAAGAGCCA CACAATTATTAATTAATTAATTTCAGTATATTTGATAAATTTCTGATCACAAGTAGATTT TTTATTCCTATACTATTAATAATTAATTTCAATAGATCACATTAAATTCTTAATCGATAA AAATAAATTTTAACTTATAAATGATTAGTAACTAATTTATTGAAAGAATATTAATTTTTA AAAAAATTTATTTAAATTTATATTCAAATGATGTGACGTATGAATTATGTTATAAATTAT ATAATAATATGATAATTAATATAATATTAATAATTTATATATCATATTATTTAAATATAA ATTTAAATAAATATTTTGAAAATTCTATTTTATTAATTAATTTGACCTCACTGCACATAA GAACATATATTTTTATTCATATCCATTAATTTCGTCGCGTCCATGGAAGTTATAATATAT TTACTTAAACAAAATAAAAAAGACAATAATTAAAAAAAGACCTTTCGGAGTCGAGTCACC ACCACCTAAAGTTCTGTGGTAGTTACTGACCATCCCTTTTACGCCACCTCTGTATTTGTT TTTTTAATTCATTTCTTAATTTTCGTATTAATCTTAAAAAACACACTCCCACGCGCACAG ATTTGCAGAGTCCAGAAGAT
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>LITCHI014612.m1 GenomeSequence + GTCGCGTCCATGGAAGTTATAATATATTTACTTAAACAAAATAAAAAAGACAATAATTAA AAAAAGACCTTTCGGAGTCGAGTCACCACCACCTAAAGTTCTGTGGTAGTTACTGACCAT CCCTTTTACGCCACCTCTGTATTTGTTTTTTTAATTCATTTCTTAATTTTCGTATTAATC TTAAAAAACACACTCCCACGCGCACAGATTTGCAGAGTCCAGAAGATATGGAACCGCACG GCGTTCAACGGCCGCTGAATCTTCCAGAGACGAACGTCCACGCCCCGGAGACGGAGGATG ACTTGTCCACTTCAGCGATCTGGGACTGGGGCGATCTCCTGGACTTCGCCACTGACGATC ACTTACACCTCCCTCTCGACTCCGATTATATCCAATTCACCGACACTACCCTCCCGGACC CTCCACCGGAGCCTCCGATTATCAGTTCGGATCGGATTCGGAAGCGCGACCCGAGGTTGA CTTGTTCTAATTTCCTGGCTGGTCGGATCCCTTGCGCGTGTCCGGAGCTCGACGAGAAGC TGGAGGAGGAGGAGGCTGCACTTCCCGGCAAGAAGCGGGCCCGGACGGTTCGGGCGGGGC TGAATAAGACCCGGTGCCAGGTGCCTGGTTGCGAGGCGGATATCAGCGAGCTAAAAGGCT ATCATCGGAGGCATAGGGTTTGTCTCCGCTGCGCCAACGCCAGCGTTGTCTTGCTTGAAG GAGAGAGCAAGAGATACTGTCAACAGTGTGGCAAGTAAAGTTCGAATCTTTTTAACTTTT CGAATTCGAAAGAATGCTTACTTGCAAGTTTGTTTGATTATTTACAAGCTTGAATTTTGT AGTGGTGAATTGTGTTAGTGTTCAAAATAAACATAGGCTGACGTGGCATGAACGTGAAGT 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