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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI014558 | Chr1 | 2642955 | 2649942;2650392 | + | Zinc finger CCCH domain-containing protein 58 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI014558.m1 | 49 | 74 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 36.8 | 2.90E-09 |
LITCHI014558.m1 | 52 | 73 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 11 | 0.56 |
LITCHI014558.m1 | 96 | 120 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 40.3 | 2.30E-10 |
LITCHI014558.m1 | 98 | 119 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 21.7 | 0.00023 |
LITCHI014558.m1 | 141 | 166 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 32.6 | 5.60E-08 |
LITCHI014558.m1 | 145 | 165 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 13.9 | 0.068 |
LITCHI014558.m1 | 297 | 322 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 37.5 | 1.60E-09 |
LITCHI014558.m1 | 301 | 321 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 21.6 | 0.00025 |
LITCHI014558.m1 | 344 | 368 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 33.5 | 3.00E-08 |
LITCHI014558.m1 | 346 | 367 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 14.4 | 0.047 |
LITCHI014558.m2 | 1 | 18 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 27.7 | 2.00E-06 |
LITCHI014558.m2 | 4 | 17 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 14.5 | 0.043 |
LITCHI014558.m2 | 39 | 64 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 33.8 | 2.50E-08 |
LITCHI014558.m2 | 43 | 63 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 15 | 0.031 |
LITCHI014558.m2 | 195 | 220 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 38.7 | 7.20E-10 |
LITCHI014558.m2 | 199 | 219 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 22.7 | 0.00011 |
LITCHI014558.m3 | 17 | 41 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 40.6 | 1.80E-10 |
LITCHI014558.m3 | 19 | 40 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 22 | 0.00019 |
LITCHI014558.m3 | 62 | 87 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 32.9 | 4.50E-08 |
LITCHI014558.m3 | 66 | 86 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 14.2 | 0.055 |
LITCHI014558.m3 | 218 | 243 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 37.8 | 1.30E-09 |
LITCHI014558.m3 | 222 | 242 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 21.9 | 0.0002 |
LITCHI014558.m3 | 265 | 289 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 33.8 | 2.40E-08 |
LITCHI014558.m3 | 267 | 288 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 14.7 | 0.038 |
LITCHI014558.m4 | 49 | 74 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 36.8 | 2.90E-09 |
LITCHI014558.m4 | 52 | 73 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 11 | 0.56 |
LITCHI014558.m4 | 96 | 120 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 40.3 | 2.30E-10 |
LITCHI014558.m4 | 98 | 119 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 21.7 | 0.00023 |
LITCHI014558.m4 | 141 | 166 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 32.6 | 5.60E-08 |
LITCHI014558.m4 | 145 | 165 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 13.9 | 0.068 |
LITCHI014558.m4 | 297 | 322 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 37.5 | 1.60E-09 |
LITCHI014558.m4 | 301 | 321 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 21.6 | 0.00025 |
LITCHI014558.m4 | 344 | 368 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 33.5 | 3.00E-08 |
LITCHI014558.m4 | 346 | 367 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 14.4 | 0.047 |
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>LITCHI014558.m1 ATGGAGCGGTACGGTCGGGTCAGTGAAGGCTCACAGTCCGATCCCTCACCGGAATGGACC GCTCCAGGAACCGAAACCGGGCTCGAAGAGTCTATGTGGCATTTGGAATTCGGAGCCGGT GTGGAGTCCTACCCGGAGCGGCCCGACGAGGCCGACTGTATCCACTATCTGAGAACCGGG TTCTGCGGGTACGGGGCGAGGTGTCGGTTCAATCATCCTCGTGACCGCGGCGCGGTTATG GGATCTGCTAGAGCTGTTGGAGGAGATTATCCGGAGCGGGTGGGCCAGCCAATATGTCAG TACTATATGAGGACTGGAACATGTAAATTTGGTGCATCGTGTAAATACCATCATCCTAGA CAGGGAGCTGGTTCTGGTAGCCATCCATCGCTTAATATTTATGGTTACCCATTACGTCCG GGTGAAAAAGAGTGTTCCTACTATATGAAAACGGGGCAATGTAAGTTTGCTGCGACATGT AAATTCCATCATCCACAGCCAGGTGCTCAAGTTCCTGCACCATCGCCGACACCTCAAGTT GCACCAGTGCCTGCACCAGTACCTGCACCAACTTTGTATCAGACGGTGCAGTCCCAATCC GTTCCGACTGCTCAACAATATGGGGTAGTACTTGCCAGGCCTCCTTTGGTGCCAGGCTCA TATGTTCAAGGCCCTTACGGTCCTATGCTGTTCTCCCCAGGCATGGTCCCCTTTCAGGGT TGGAGTCCTTACCAGGCCACTGTAAACCCAGTTGCCTCCCCTGGTACTCAACCTGCCGTT GGATCAAGCTCAATTTATGGGCTTCCCCAACTTGCTGGAAGCTATCAACCCATGCCTACA TCAGTTGGTCCATCAAGCAGTAGCCAGAAGGAGTTTCCAGAGAGACCTGGCCAACCGGAA TGTCAATATTACATGAAAACTGGGGACTGTAAATTTGGATCCTCATGTAGATACCATCAT CCTCGAGAGGTGATTGTACCCAGAACAGATGTGGTTCTCAGTCCCATAGGTCTTCCTTTG CGTCCAGGTGCACCACCTTGTACTCATTATGCCCAACGTGGAGTATGCAAGTTTGGACCT GCGTGTAAATTTGATCATCCAATGGGAACGCTAAGCTACAGCCCTTCTGCATCTTCGCTA GCAGATATGCCAGTTGCACCCTATCCTGTGGGAACTTCAATTGGTACCCTAGCCCCCTCA TCCTCATCTTCAGATTTGCGGCCAGAACTTATTTCTGGATCCAGTAAGGACGCTGTTGCG ACTCGTATGTCTTCGACAATTAGCTCATCTAGTGGATCAGTTGGTTCAATTTTTTCCAGG AGCGGACCTGTTCCGCTTTCAAGCATGCAACAATCTGGGCCGAGTTCTGGTCCTTCAAAT ACTGGTGCCAGCAGCAGCAGCACCGAGGCTCGTACTTCAAGTTAA >LITCHI014558.m2 ATGAGGACTGGAACATGTAAATTTGGTGCATCGTGTAAATACCATCATCCTAGACAGGGA GCTGGTTCTGGTAGCCATCCATCGCTTAATATTTATGGTTACCCATTACGTCCGGGTGAA AAAGAGTGTTCCTACTATATGAAAACGGGGCAATGTAAGTTTGCTGCGACATGTAAATTC CATCATCCACAGCCAGGTGCTCAAGTTCCTGCACCATCGCCGACACCTCAAGTTGCACCA GTGCCTGCACCAGTACCTGCACCAACTTTGTATCAGACGGTGCAGTCCCAATCCGTTCCG ACTGCTCAACAATATGGGGTAGTACTTGCCAGGCCTCCTTTGGTGCCAGGCTCATATGTT CAAGGCCCTTACGGTCCTATGCTGTTCTCCCCAGGCATGGTCCCCTTTCAGGGTTGGAGT CCTTACCAGGCCACTGTAAACCCAGTTGCCTCCCCTGGTACTCAACCTGCCGTTGGATCA AGCTCAATTTATGGGCTTCCCCAACTTGCTGGAAGCTATCAACCCATGCCTACATCAGTT GGTCCATCAAGCAGTAGCCAGAAGGAGTTTCCAGAGAGACCTGGCCAACCGGAATGTCAA TATTACATGAAAACTGGGGACTGTAAATTTGGATCCTCATGTAGATACCATCATCCTCGA GAGGTGATTGTACCCAGAACAGATGTGGTTCTCAGTCCCATAGGTCTTCCTTTGCGTCCA ATTATTGGATTAAACCTTTTTTGGCACACGTAG >LITCHI014558.m3 ATGGGATCTGCTAGAGCTGTTGGAGGAGATTATCCGGAGCGGGTGGGCCAGCCAATATGT CAGTACTATATGAGGACTGGAACATGTAAATTTGGTGCATCGTGTAAATACCATCATCCT AGACAGGGAGCTGGTTCTGGTAGCCATCCATCGCTTAATATTTATGGTTACCCATTACGT CCGGGTGAAAAAGAGTGTTCCTACTATATGAAAACGGGGCAATGTAAGTTTGCTGCGACA TGTAAATTCCATCATCCACAGCCAGGTGCTCAAGTTCCTGCACCATCGCCGACACCTCAA GTTGCACCAGTGCCTGCACCAGTACCTGCACCAACTTTGTATCAGACGGTGCAGTCCCAA TCCGTTCCGACTGCTCAACAATATGGGGTAGTACTTGCCAGGCCTCCTTTGGTGCCAGGC TCATATGTTCAAGGCCCTTACGGTCCTATGCTGTTCTCCCCAGGCATGGTCCCCTTTCAG GGTTGGAGTCCTTACCAGGCCACTGTAAACCCAGTTGCCTCCCCTGGTACTCAACCTGCC GTTGGATCAAGCTCAATTTATGGGCTTCCCCAACTTGCTGGAAGCTATCAACCCATGCCT ACATCAGTTGGTCCATCAAGCAGTAGCCAGAAGGAGTTTCCAGAGAGACCTGGCCAACCG GAATGTCAATATTACATGAAAACTGGGGACTGTAAATTTGGATCCTCATGTAGATACCAT CATCCTCGAGAGGTGATTGTACCCAGAACAGATGTGGTTCTCAGTCCCATAGGTCTTCCT TTGCGTCCAGGTGCACCACCTTGTACTCATTATGCCCAACGTGGAGTATGCAAGTTTGGA CCTGCGTGTAAATTTGATCATCCAATGGGAACGCTAAGCTACAGCCCTTCTGCATCTTCG CTAGCAGATATGCCAGTTGCACCCTATCCTGTGGGAACTTCAATTGGTACCCTAGCCCCC TCATCCTCATCTTCAGATTTGCGGCCAGAACTTATTTCTGGATCCAGTAAGGACGCTGTT GCGACTCGTATGTCTTCGACAATTAGCTCATCTAGTGGATCAGTTGGTTCAATTTTTTCC AGGAGCGGACCTGTTCCGCTTTCAAGCATGCAACAATCTGGGCCGAGTTCTGGTCCTTCA AATACTGGTGCCAGCAGCAGCAGCACCGAGGCTCGTACTTCAAGTTAA >LITCHI014558.m4 ATGGAGCGGTACGGTCGGGTCAGTGAAGGCTCACAGTCCGATCCCTCACCGGAATGGACC GCTCCAGGAACCGAAACCGGGCTCGAAGAGTCTATGTGGCATTTGGAATTCGGAGCCGGT GTGGAGTCCTACCCGGAGCGGCCCGACGAGGCCGACTGTATCCACTATCTGAGAACCGGG TTCTGCGGGTACGGGGCGAGGTGTCGGTTCAATCATCCTCGTGACCGCGGCGCGGTTATG GGATCTGCTAGAGCTGTTGGAGGAGATTATCCGGAGCGGGTGGGCCAGCCAATATGTCAG TACTATATGAGGACTGGAACATGTAAATTTGGTGCATCGTGTAAATACCATCATCCTAGA CAGGGAGCTGGTTCTGGTAGCCATCCATCGCTTAATATTTATGGTTACCCATTACGTCCG GGTGAAAAAGAGTGTTCCTACTATATGAAAACGGGGCAATGTAAGTTTGCTGCGACATGT AAATTCCATCATCCACAGCCAGGTGCTCAAGTTCCTGCACCATCGCCGACACCTCAAGTT GCACCAGTGCCTGCACCAGTACCTGCACCAACTTTGTATCAGACGGTGCAGTCCCAATCC GTTCCGACTGCTCAACAATATGGGGTAGTACTTGCCAGGCCTCCTTTGGTGCCAGGCTCA TATGTTCAAGGCCCTTACGGTCCTATGCTGTTCTCCCCAGGCATGGTCCCCTTTCAGGGT TGGAGTCCTTACCAGGCCACTGTAAACCCAGTTGCCTCCCCTGGTACTCAACCTGCCGTT GGATCAAGCTCAATTTATGGGCTTCCCCAACTTGCTGGAAGCTATCAACCCATGCCTACA TCAGTTGGTCCATCAAGCAGTAGCCAGAAGGAGTTTCCAGAGAGACCTGGCCAACCGGAA TGTCAATATTACATGAAAACTGGGGACTGTAAATTTGGATCCTCATGTAGATACCATCAT CCTCGAGAGGTGATTGTACCCAGAACAGATGTGGTTCTCAGTCCCATAGGTCTTCCTTTG CGTCCAGGTGCACCACCTTGTACTCATTATGCCCAACGTGGAGTATGCAAGTTTGGACCT GCGTGTAAATTTGATCATCCAATGGGAACGCTAAGCTACAGCCCTTCTGCATCTTCGCTA GCAGATATGCCAGTTGCACCCTATCCTGTGGGAACTTCAATTGGTACCCTAGCCCCCTCA TCCTCATCTTCAGATTTGCGGCCAGAACTTATTTCTGGATCCAGTAAGGACGCTGTTGCG ACTCGTATGTCTTCGACAATTAGCTCATCTAGTGGATCAGTTGGTTCAATTTTTTCCAGG AGCGGACCTGTTCCGCTTTCAAGCATGCAACAATCTGGGCCGAGTTCTGGTCCTTCAAAT ACTGGTGCCAGCAGCAGCAGCACCGAGGCTCGTACTTCAAGTTAA
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>LITCHI014558.m3 CTGTAATTTCCCCTTTTGGTAGTTTTCTACTGATTTTGGCGCGTATGCAAACCAACAACG CAACGCTAGTACACAATAGAACACACAACACACCCGCTAAGAAAAATAAAAAGAAAATAA ATTAAAAAAAGAAAAACAAAATAAAAGGGAAAAATAAAAATCAAGAACAAGCAACAACGC CACCCAACACCAACATCAACAACATCAAATAGCTTTGAAAACTGAAACGCAAGAGAGTGT GTGTATGTGTGTGTGTGAAAGAGAGAGTGTGTGTGAAAAAAGTAGAGAGAGAACACAAAA AACCCAAAAACCCCCCTCCCTCTCTCCCTTTCTCTATCTCTCACGAACCGAACCAAACAA AACTCGAAACAGTTTCGTGCTCGTGTCTGCGTCCGTGTCTTGTTTCAAGAAGAAGAACAA AAACGCGCGCACGAAGAAGAAGAAGAAGAGGACGAAGAGGAGGAGGAGGAGCGACCGAGT GATCGAAACTGTCGGCTTCTTGTCTTTGGTTGCGAGGACGGTCGTGTCCGATTCGATCGG GTGATCTCTCTTTCTCTCTCCCATTGTTGAACCGGACATTGGAGTAGTGTGATTGTCTCT CTCCGGTTAGTTTGCGGTCCGGTTCGGCGTCAGTAGGAGAATAATGGAGCGGTACGGTCG GGTCAGTGAAGGCTCACAGTCCGATCCCTCACCGGAATGGACCGCTCCAGGAACCGAAAC CGGGCTCGAAGAGTCTATGTGGCATTTGGAATTCGGAGCCGGTGTGGAGTCCTACCCGGA GCGGCCCGACGAGGCCGACTGTATCCACTATCTGAGAACCGGGTTCTGCGGGTACGGGGC GAGGTGTCGGTTCAATCATCCTCGTGACCGCGGCGCGGTACTTACTGAATTTTACTTTTA CAGGGTTTTGATTCTTTGTTGAATGTGATCATCATGTGGTCTTGTTCGTTTTGTTTTTAA TTGGTTTTGTCGCAGTTTATAATATAGTGTGATTGGATGATAACAACTCGTCGAATTTGT CGTTTGATATGTGGAAAAATTCTTGTTGCTTTGATGAAATTGGTTGTGTTGGTTGGTGAA ATGATCGAGAATATAGTTCGTGTTTGGTTAATGTTAAGAGGTTTGTGTTTATTAGGTTAT GGGATCTGCTAGAGCTGTTGGAGGAGATTATCCGGAGCGGGTGGGCCAGCCAATATGTCA GTACTATATGAGGACTGGAACATGTAAATTTGGTGCATCGTGTAAATACCATCATCCTAG ACAGGGAGCTGGTTCTGGTAGCCATCCATCGCTTAATATTTATGGTTACCCATTACGTCC GGGTGAAAAAGAGTGTTCCTACTATATGAAAACGGGGCAATGTAAGTTTGCTGCGACATG TAAATTCCATCATCCACAGCCAGGTGCTCAAGTTCCTGCACCATCGCCGACACCTCAAGT TGCACCAGTGCCTGCACCAGTACCTGCACCAACTTTGTATCAGACGGTGCAGTCCCAATC CGTTCCGACTGCTCAACAATATGGGGTAGTACTTGCCAGGCCTCCTTTGGTGCCAGGCTC ATATGTTCAAGGCCCTTACGGTCCTATGCTGTTCTCCCCAGGCATGGTCCCCTTTCAGGG TTGGAGTCCTTACCAGGCCACTGTAAACCCAGTTGCCTCCCCTGGTACTCAACCTGCCGT TGGATCAAGCTCAATTTATGGGCTTCCCCAACTTGCTGGAAGCTATCAACCCATGCCTAC ATCAGTTGGTCCATCAAGCAGTAGCCAGAAGGAGTTTCCAGAGAGACCTGGCCAACCGGA ATGTCAATATTACATGAAAACTGGGGACTGTAAATTTGGATCCTCATGTAGATACCATCA TCCTCGAGAGGTGATTGTACCCAGAACAGATGTGGTTCTCAGTCCCATAGGTCTTCCTTT GCGTCCAGGTGCACCACCTTGTACTCATTATGCCCAACGTGGAGTATGCAAGTTTGGACC TGCGTGTAAATTTGATCATCCAATGGGAACGCTAAGCTACAGCCCTTCTGCATCTTCGCT AGCAGATATGCCAGTTGCACCCTATCCTGTGGGAACTTCAATTGGTACCCTAGCCCCCTC ATCCTCATCTTCAGATTTGCGGCCAGAACTTATTTCTGGATCCAGTAAGGACGCTGTTGC GACTCGTATGTCTTCGACAATTAGCTCATCTAGTGGATCAGTTGGTTCAATTTTTTCCAG GAGCGGACCTGTTCCGCTTTCAAGCATGCAACAATCTGGGCCGAGTTCTGGTCCTTCAAA TACTGGTGCCAGCAGCAGCAGCACCGAGGCTCGTACTTCAAGTTAAACAAGAGGAACAGA GTTCTTCTTGACACCGCGTTTTGATCAAATTCACAAACCAAAACTTATTTTTTGTGCAAG CCGTCAAAATAGGAGGCTTCATTTCTCTGTTAGAGTTCCAAAATTCAGGTCTAGCCCTCA TCAGCTCTGATCATTTCTGTGTTTATATGATCTCTACGTGGCCATCCTTTTTATCTGAAT AAGCCATGGCCAACCTTCAGGACTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCGTATAGCCTTTAC ATCTTTGTTTACACTTTTGTTTCGAATAACCATGAAAGAATTTGCAGTTGTAGGCAAATC TGTGTCTGCCCCTCCAATTTTGGAGTTGTGTTTATTTATGCTCCAATATTTTTCGAAACA AAAAAGATCCAACCCACAGCATTCTTCCTTTACATCAATCGCGTGTTTATGCCAGTCATT TTTAGATTTTCTTTAATTCGGGAACAAGCTTCCAATTCAGCATAATAAGGGAATTGGAAG CTTTACTTGTTCCCCCACTTTTTTGTCTGGGGTTTATTGTTCAAAAAGAAAAGTAATTAA ACAGACTCAAGGAGGCACCGCAACGCTTCCTCATATGGGATTTAGATACACAGTTATGTT GTGACAATTGAAATGCTTGACATGGCTATTGATAAATTTATTATGATATACAAGTATATG AAGAATCACTTTTGACTTTGTAATAATTCTTCATTTCACTTACATCGCTGTGCTTTGTTT AGTTGCAAG >LITCHI014558.m4 CTGTAATTTCCCCTTTTGGTAGTTTTCTACTGATTTTGGCGCGTATGCAAACCAACAACG CAACGCTAGTACACAATAGAACACACAACACACCCGCTAAGAAAAATAAAAAGAAAATAA ATTAAAAAAAGAAAAACAAAATAAAAGGGAAAAATAAAAATCAAGAACAAGCAACAACGC CACCCAACACCAACATCAACAACATCAAATAGCTTTGAAAACTGAAACGCAAGAGAGTGT GTGTATGTGTGTGTGTGAAAGAGAGAGTGTGTGTGAAAAAAGTAGAGAGAGAACACAAAA AACCCAAAAACCCCCCTCCCTCTCTCCCTTTCTCTATCTCTCACGAACCGAACCAAACAA AACTCGAAACAGTTTCGTGCTCGTGTCTGCGTCCGTGTCTTGTTTCAAGAAGAAGAACAA AAACGCGCGCACGAAGAAGAAGAAGAAGAGGACGAAGAGGAGGAGGAGGAGCGACCGAGT GATCGAAACTGTCGGCTTCTTGTCTTTGGTTGCGAGGACGGTCGTGTCCGATTCGATCGG GTGATCTCTCTTTCTCTCTCCCATTGTTGAACCGGACATTGGAGTAGTGTGATTGTCTCT CTCCGGTTAGTTTGCGGTCCGGTTCGGCGTCAGTAGGAGAATAATGGAGCGGTACGGTCG GGTCAGTGAAGGCTCACAGTCCGATCCCTCACCGGAATGGACCGCTCCAGGAACCGAAAC 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