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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI014549Chr125858182601671-Protein ALWAYS EARLY 3

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI014549.m165100PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain38.31.20E-09
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LITCHI014549.m24681PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain38.41.20E-09
LITCHI014549.m2644745PF06584.16DIRPFamily111.32.40E-32
LITCHI014549.m2904970PF19438.2LIN9_CDomain26.63.80E-06
LITCHI014549.m3565666PF06584.16DIRPFamily111.52.20E-32
LITCHI014549.m3825891PF19438.2LIN9_CDomain26.73.50E-06
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>LITCHI014549.m1
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>LITCHI014549.m2
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>LITCHI014549.m3
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AGCTCTTACGTGCTTGGTGCTGCCTTGGGATTCACCATTTTGTGCAAAGCTGATGAGCCG
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GTAGTTCAACCTCCGAACTCAAGCCTTTGCCCTTCAGCTCTTACGTGCTTGGTGCTGCCT
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AAGGCTTTCATTTTATAACTTGCCTTGCAGAATGGAAAGCAAACAATTTTGCAGCTTGGA
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GGAGGACTAAAAGAATTCAAGGATAATAAGAATTAAAAGCAATATTATACTAATAACTGC
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TTCAACCTCCGAACTCAAGCCTTTGCCCTTCAGCTCTTACGTGCTTGGTGCTGCCTTGGG
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>LITCHI031774.m6
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TCAGAGACAGAGGAAGAGCTGGACTTAGAATCCAAAGCTCAGTAAAAAACTTTCAGCTTA
CTTTGGAGGTATAATGAAACAACTATTCAAGATCTTCCTGGAAAGGACCATTGGATCATT
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GCAAAGCTGATGAGCCGTCGTCTCATATGAATGGCAAGAAAAGTGACTATTGATATTTTA
ATATGATAATCCTTGTATGCTCATTTTGTATTATCATCTTAATGTGATTGATTCTGTTGT
TCACTTGTTCTTCTTGAGCACTTGATCTATCCCGTGCTCCTTTGCTTAAAAGACAAATGC
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>LITCHI031774.m7
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GCGGCCAAGCAGACGCATTTCAAGTCTCTGTCTACTGGCAGAGCGTTGAAGCCGTCGTCT
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CCTGCTTCTTCTTGGTCTACACTCCCAAATAGGGCATTGTTGTGCAGGCCGTTGCCAATG
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GGTCCTCTTTTTGCACTTTATACCAATGAAGGTCAAGGAAGACAGAACCGAAAACTAGCT
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GGAATAAAATCGACGAATGCAGATGATAGTTTCATTGGGATAGTGACAGCTAATCTCATG
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AAAATGGACAAAGTTCAAAAACTCTGTTCAAGGTTTCCACATTACAGTAATGTAAGTAAA
GATGTGTAGAGGGTGTATTTTTTCCTCAAACGTAAAAGGAACCGAATCCTTCAACTTTTT
CGTTCACTTTTTTCTCCTTGGATTGATGTCTTCAGATTTCAAAGCAATATGAGTTGGACT
TCAGAGACAGAGGAAGAGCTGGACTTAGAATCCAAAGCTCAGTAAAAAACTTTCAGCTTA
CTTTGGAGAATGGAAAGCAAACAATTTTGCAGCTTGGAAGGGTGGGAAAGTCCAAGTATG
TTATGGATTTCAGGTATGCTATAGTGAAATCTTCCTCTCAAGGGGGCTTAAAGAAACTAC
ATGAATTGCTGTTGACAAGACTACTTTGATGCACCTCTGGAGGACTAAAAGAATTCAAGG
ATAATAAGAATTAAAAGCAATATTATACTAATAACTGCTTCTCTCAAACTATGCAGATAT
CCTTTGACTGGTTACCAAGCATTCTGCATATGTTTGGCTTCAATTGATTCAAAGCTTTGT
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TTGCCCTTCAGCTCTTACGTGCTTGGTGCTGCCTTGGGATTCACCATTTTGTGCAAAGCT
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TCTTCTTGAGCACTTGATCTATCCCGTGCTCCTTTGCTTAAAAGACAAATGCTTTTAATT
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>LITCHI031774.m4
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ATTAATCCTCTCACCGACTACCCAAAGCACAGCCGCTGTTGCAGTGAAGGAGGAGGAGAC
CCCGTCACTGCATTCTTCGACAACAAAGAAAACGCCACACCTAACCACAACAAGCGAAAC
ATTAAAAATGGTTCCATGTCCGAGCAGTTAAAGTCGCTATCCGTAAATGGGCGGTGTGAT
GCGGCCAAGCAGACGCATTTCAAGTCTCTGTCTACTGGCAGAGCGTTGAAGCCGTCGTCT
CTTGAGTTTTGCATGCAAATGCATGAGCCTGAGAAGGCGAGAGTAGTCTGGGATGCGGCC
ACGGAGTCTGAGCATTCCAGTTCGTTGAAGATTTGGGATTATTCTGATTCAGAGGCTGCT
CCTGCTTCTTCTTGGTCTACACTCCCAAATAGGGCATTGTTGTGCAGGCCGTTGCCAATG
GATATAGGGAGATGCACATGTGTTATTGTGAAGGAAGCATCTCCACACGGACTTGATAAG
GGTCCTCTTTTTGCACTTTATACCAATGAAGGTCAAGGAAGACAGAACCGAAAACTAGCT
GTAGCTCACCACAGGCGGCGTAATGGCAAGTCAGAGTTTACCATAGCACAGAATACAAGG
GGAATAAAATCGACGAATGCAGATGATAGTTTCATTGGGATAGTGACAGCTAATCTCATG
GGTTCAAAATACCATATACAAGATCAGTCCCTTCTATTGCAGACTAGCCGACTCAGTTCC
ATTGACAAACAATCTAATCCTCTTCTTGCTGTTGTTATGTTCATGCCTACTATAGCCACT
TGGACTGGAAGTTATAGAAGTATGCGTGTGTATATACCCAAGCACCAGTCCATGCTGCTT
AAAAGCTCCACTCAGATGAACCCAACAGATTGTAAGGTGCAACACATTAAAGGGCTGCCA
AAGGACTGGGAAGGTAAAATGGACAAAGTTCAAAAACTCTGTTCAAGGTTTCCACATTAC
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ATCCTTCAACTTTTTCGTTCACTTTTTTCTCCTTGGATTGATGTCTTCAGATTTCAAAGC
AATATGAGTTGGACTTCAGAGACAGAGGAAGAGCTGGACTTAGAATCCAAAGCTCAGTAA
AAAACTTTCAGCTTACTTTGGAGAATGGAAAGCAAACAATTTTGCAGCTTGGAAGGGTGG
GAAAGTCCAAGTATGTTATGGATTTCAGATATCCTTTGACTGGTTACCAAGCATTCTGCA
TATGTTTGGCTTCAATTGATTCAAAGCTTTGTTGCACAATTTGAGTAAATTCGTGATCAT
CTTTTCGTAGTTCAACCTCCGAACTCAAGCCTTTGCCCTTCAGCTCTTACGTGCTTGGTG
CTGCCTTGGGATTCACCATTTTGTGCAAAGCTGATGAGCCGTCGTCTCATATGAATGGCA
AGAAAAGTGACTATTGATATTTTAATATGATAATCCTTGTATGCTCATTTTGTATTATCA
TCTTAATGTGATTGATTCTGTTGTTCACTTGTTCTTCTTGAGCACTTGATCTATCCCGTG
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CAAAATTAAG
>LITCHI031774.m5
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CCCGTCACTGCATTCTTCGACAACAAAGAAAACGCCACACCTAACCACAACAAGCGAAAC
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GCGGCCAAGCAGACGCATTTCAAGTCTCTGTCTACTGGCAGAGCGTTGAAGCCGTCGTCT
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ACGGAGTCTGAGCATTCCAGTTCGTTGAAGATTTGGGATTATTCTGATTCAGAGGCTGCT
CCTGCTTCTTCTTGGTCTACACTCCCAAATAGGGCATTGTTGTGCAGGCCGTTGCCAATG
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AAAATGGACAAAGTTCAAAAACTCTGTTCAAGGTTTCCACATTACAGTAATGTAAGTAAA
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CGTTCACTTTTTTCTCCTTGGATTGATGTCTTCAGATTTCAAAGCAATATGAGTTGGACT
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CTTTGGAGAATGGAAAGCAAACAATTTTGCAGCTTGGAAGGGTGGGAAAGTCCAAGTATG
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TTCTGTTGTTCACTTGTTCTTCTTGAGCACTTGATCTATCCCGTGCTCCTTTGCTTAAAA
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>LITCHI031774.m2
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CCTGCTTCTTCTTGGTCTACACTCCCAAATAGGGCATTGTTGTGCAGGCCGTTGCCAATG
GATATAGGGAGATGCACATGTGTTATTGTGAAGGAAGCATCTCCACACGGACTTGATAAG
GGTCCTCTTTTTGCACTTTATACCAATGAAGGTCAAGGAAGACAGAACCGAAAACTAGCT
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AATCCTCTTCTTGCTGTTGTTATGTTCATGCCTACTATAGCCACTTGGACTGGAAGTTAT
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AAAATGGACAAAGTTCAAAAACTCTGTTCAAGGTTTCCACATTACAGTAATATTTCAAAG
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AAAAACTTTCAGCTTACTTTGGAGAATGGAAAGCAAACAATTTTGCAGCTTGGAAGGGTG
GGAAAGTCCAAGTATGTTATGGATTTCAGGTATGCTATAGTGAAATCTTCCTCTCAAGGG
GGCTTAAAGAAACTACATGAATTGCTGTTGACAAGACTACTTTGATGCACCTCTGGAGGA
CTAAAAGAATTCAAGGATAATAAGAATTAAAAGCAATATTATACTAATAACTGCTTCTCT
CAAACTATGCAGATATCCTTTGACTGGTTACCAAGCATTCTGCATATGTTTGGCTTCAAT
TGATTCAAAGCTTTGTTGCACAATTTGAGTAAATTCGTGATCATCTTTTCGTAGTTCAAC
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ATATTTTAATATGATAATCCTTGTATGCTCATTTTGTATTATCATCTTAATGTGATTGAT
TCTGTTGTTCACTTGTTCTTCTTGAGCACTTGATCTATCCCGTGCTCCTTTGCTTAAAAG
ACAAATGCTTTTAATTATATACTAGAAGACTATATTGATTAAGTCAAAATTAAG
>LITCHI031774.m3
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AAAATGTCTGGATTCAAGAAACCAACAATACCAAACCATTCTTCCTACAACTCTCTCTAC
ATTAATCCTCTCACCGACTACCCAAAGCACAGCCGCTGTTGCAGTGAAGGAGGAGGAGAC
CCCGTCACTGCATTCTTCGACAACAAAGAAAACGCCACACCTAACCACAACAAGCGAAAC
ATTAAAAATGGTTCCATGTCCGAGCAGTTAAAGTCGCTATCCGTAAATGGGCGGTGTGAT
GCGGCCAAGCAGACGCATTTCAAGTCTCTGTCTACTGGCAGAGCGTTGAAGCCGTCGTCT
CTTGAGTTTTGCATGCAAATGCATGAGCCTGAGAAGGCGAGAGTAGTCTGGGATGCGGCC
ACGGAGTCTGAGCATTCCAGTTCGTTGAAGATTTGGGATTATTCTGATTCAGAGGCTGCT
CCTGCTTCTTCTTGGTCTACACTCCCAAATAGGGCATTGTTGTGCAGGCCGTTGCCAATG
GATATAGGGAGATGCACATGTGTTATTGTGAAGGAAGCATCTCCACACGGACTTGATAAG
GGTCCTCTTTTTGCACTTTATACCAATGAAGGTCAAGGAAGACAGAACCGAAAACTAGCT
GTAGCTCACCACAGGCGGCGTAATGGCAAGTCAGAGTTTACCATAGCACAGAATACAAGG
GGAATAAAATCGACGAATGCAGATGATAGTTTCATTGGGATAGTGACAGCTAATCTCATG
GGTTCAAAATACCATATACAAGATCAGTCCCTTCTATTGCAGACTAGCCGACTCAGTTCC
ATTGACAAACAATCTAATCCTCTTCTTGCTGTTGTTATGTTCATGCCTACTATAGCCACT
TGGACTGGAAGTTATAGAAGTATGCGTGTGTATATACCCAAGCACCAGTCCATGCTGCTT
AAAAGCTCCACTCAGATGAACCCAACAGATTGTAAGGTACCATTATAAGTCCCCTACCCA
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AAAAGTAAAACTTGATATATTGTATCTAACTTGTCTGTGGTAGGTGCAACACATTAAAGG
GCTGCCAAAGGACTGGGAAGGTAAAATGGACAAAGTTCAAAAACTCTGTTCAAGGTTTCC
ACATTACAGTAATATTTCAAAGCAATATGAGTTGGACTTCAGAGACAGAGGAAGAGCTGG
ACTTAGAATCCAAAGCTCAGTAAAAAACTTTCAGCTTACTTTGGAGAATGGAAAGCAAAC
AATTTTGCAGCTTGGAAGGGTGGGAAAGTCCAAGTATGTTATGGATTTCAGGTATGCTAT
AGTGAAATCTTCCTCTCAAGGGGGCTTAAAGAAACTACATGAATTGCTGTTGACAAGACT
ACTTTGATGCACCTCTGGAGGACTAAAAGAATTCAAGGATAATAAGAATTAAAAGCAATA
TTATACTAATAACTGCTTCTCTCAAACTATGCAGATATCCTTTGACTGGTTACCAAGCAT
TCTGCATATGTTTGGCTTCAATTGATTCAAAGCTTTGTTGCACAATTTGAGTAAATTCGT
GATCATCTTTTCGTAGTTCAACCTCCGAACTCAAGCCTTTGCCCTTCAGCTCTTACGTGC
TTGGTGCTGCCTTGGGATTCACCATTTTGTGCAAAGCTGATGAGCCGTCGTCTCATATGA
ATGGCAAGAAAAGTGACTATTGATATTTTAATATGATAATCCTTGTATGCTCATTTTGTA
TTATCATCTTAATGTGATTGATTCTGTTGTTCACTTGTTCTTCTTGAGCACTTGATCTAT
CCCGTGCTCCTTTGCTTAAAAGACAAATGCTTTTAATTATATACTAGAAGACTATATTGA
TTAAGTCAAAATTAAG
>LITCHI031774.m1
TCTGTTTTCAATTTTTTTTTCAAAAATTCAAATTCAAAAACCCAAACAAAAAAAAAATAT
ATGTATCGTACACTCACCTCCACCAACCGTCGAACTTGACTTAGTATATAAATAAAGACG
AAACTGAGCAAAGTCTCAATATTTGAAAAGCATCATCTTCCACTTACTTGCAGGTCTCCA
AAAATGTCTGGATTCAAGAAACCAACAATACCAAACCATTCTTCCTACAACTCTCTCTAC
ATTAATCCTCTCACCGACTACCCAAAGCACAGCCGCTGTTGCAGTGAAGGAGGAGGAGAC
CCCGTCACTGCATTCTTCGACAACAAAGAAAACGCCACACCTAACCACAACAAGCGAAAC
ATTAAAAATGGTTCCATGTCCGAGCAGTTAAAGTCGCTATCCGTAAATGGGCGGTGTGAT
GCGGCCAAGCAGACGCATTTCAAGTCTCTGTCTACTGGCAGAGCGTTGAAGCCGTCGTCT
CTTGAGTTTTGCATGCAAATGCATGAGCCTGAGAAGGCGAGAGTAGTCTGGGATGCGGCC
ACGGAGTCTGAGCATTCCAGTTCGTTGAAGATTTGGGATTATTCTGATTCAGAGGCTGCT
CCTGCTTCTTCTTGGTCTACACTCCCAAATAGGGCATTGTTGTGCAGGCCGTTGCCAATG
GATATAGGGAGATGCACATGTGTTATTGTGAAGGAAGCATCTCCACACGGACTTGATAAG
GGTCCTCTTTTTGCACTTTATACCAATGAAGGTCAAGGAAGACAGAACCGAAAACTAGCT
GTAGCTCACCACAGGCGGCGTAATGGCAAGTCAGAGTTTACCATAGCACAGAATACAAGG
GGAATAAAATCGACGAATGCAGATGATAGTTTCATTGGGATAGTGACAGCTAATCTCATG
GGTTCAAAATACCATATACAAGATCAGACTAGCCGACTCAGTTCCATTGACAAACAATCT
AATCCTCTTCTTGCTGTTGTTATGTTCATGCCTACTATAGCCACTTGGACTGGAAGTTAT
AGAAGTATGCGTGTGTATATACCCAAGCACCAGTCCATGCTGCTTAAAAGCTCCACTCAG
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CAATATGAGTTGGACTTCAGAGACAGAGGAAGAGCTGGACTTAGAATCCAAAGCTCAGTA
AAAAACTTTCAGCTTACTTTGGAGAATGGAAAGCAAACAATTTTGCAGCTTGGAAGGGTG
GGAAAGTCCAAGTATGTTATGGATTTCAGATATCCTTTGACTGGTTACCAAGCATTCTGC
ATATGTTTGGCTTCAATTGATTCAAAGCTTTGTTGCACAATTTGAGTAAATTCGTGATCA
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CACTATATATGCAGGACTAA
>LITCHI012625.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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CACTATATATGCAGGACTAA
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GACCTACTATGGCTGAGGTTGTCAAGATGCTAGAGCAAATCAAATCAGAAAAAGTTGTAA
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>LITCHI012625.m3 GenomeSequence - 
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>LITCHI012625.m1 GenomeSequence - 
CTTTATTTTATGTCATATCAAATCATCAAATGATTCAACACCGGCCACCTGCATTCCTCT
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TCCTAACATCTCCTTTTTACATATATATCTCACCACTGATTTTAGTTACTCGTTTGTTTA
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TCTGACATAGTATTAGAGTTGGGCAAGCTCTATCTAAGTTATATGACCCAAACTTAGTTG
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CACATTAGTTGAAGAAATGAGTTTGTATTAGTTTATAAGGTGAAGGTAAATCTACACTTA
TAAACTAGCTTTTGTAGTGAAATTAGGTCTAAGATCTTTTTCTAACAATTTGGCCACTTG
GGGACAATCCCAGCAGTTTATTCTTGGTTCTATATAAAAGACCTCAAATGACCGTAGACA
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TGGTTATGCAAAAACCAAAATTTGCATATTCATGCTAATCAAATCTGAGATAAAAGTATT
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TACTTGCATGTTTGATTGTAAAGAAGAAAATAATGCAGGGAGATCATTAAACCAGAAGCA
TTTGGATTGGCCATCCAGATACAAAATAGCTGTCGGTGCTGCAAGGGGAATTGCATACCT
TCATCACGACTGCATACCCCACATAATCCATAGAGATATCAAGCCAAGCAACATCTTGCT
GGATCAAAACATGGAGGCTCAAGTGTCCGATTTTGGACTTGCCACATTGATGGAACCTGA
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GCATTAAATAGATAGTCTTGACTTTCCTGTACTTTTGCTTGGTTATCTGATAGATTATAT
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AGAGGAAGGAACTAAGCTTGTGACATGGGTAAATCATGAATATTATCTAAACCTTTAAAG
AGCTGCACCTGTTGTTATCATAAATCAGTGCAGCATTCATTGCAGATATCTCATTAATCT
TTCAAAAATTAAAAAACCTTTGGGCCAAAGAAGTAGTCAGGATGGAGTAAAATACTCTCA
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ATCACTGTCTTATACTTCATCTTACTAATTTGTTGTCAATGTTGCAACAGGTCAAAGCAG
TTGTTCAAGACAAGAGAGAAGAGTACGTACTTGATGCTCGCTTAGAGGATTGTCCGATCA
ATGAGATTAACAATGTATTTAGTGTTGCATTGATGTGCCTTGAATCAGAACCCTCCAAGA
GACCTACTATGGCTGAGGTTGTCAAGATGCTAGAGCAAATCAAATCAGAAAAAGTTGTAA
ATGATTATTAATCTAGCTTTAACCCCTATTGCTTTCTCCCAACATTGGAGTACACATAGA
TTCTTAATCATATTTCATTTTTCTAAGTCGTTTTGCTCTCTTTTTTACTCCATCGGGATA
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TATATCAAATTCACTAATGCTCAAGCAGAAATATTTACGACGACAAGATGCAGCATAAGA
ATTGAGAACAAAACATGTGGAGATGATCAAATAGCAGAAGATATGAGCTAGAACAGAACA
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ATTTAAGCTTGCACTATCTTCAGGCTCTGACTCTGAGGAATTCTAAAACCTCAACCAACC
CAGAATAAACTAGAAGACAGACCATATATTGAGAAAGTAAAAACTAATGCTATTTTCATA
GATCGGATTCAGAAACTGCAAACATTCAGAGCTAGTTCTTGTTATAAACATTTCATGGTA
GTTAGTGCAAGAAAGAACCAAGGTAATAAAGGTGATTCAAGAATTATTAGAACTTGCCTC
AACAGATTATATTACTCAAAATGGTAAAGCATGAAAAATCTGCAAAGAAGATGAAATAAT
ATACTAAGCTCAACTTTACTAGGCATTATTCTCTGTGAAGAAACATTCCTGTATTTCAGT
TTCCTGACTGCTTTTAAGGTCAAAGGAAATACATTGATACAACAAAATTGATAGCTGCTC
CATTTGTTATGAAATTACATACAACAACAGAACCAACATCACATATTGGATTGAATAAAT
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CTGAGGCTTTTAAGGAAGGAGAAACTGGAGCATTCCCAAAAAAGACATCATAAAGGGCAA
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TGTATCTTTGATGAATCCAGCCAAGTTAAAAAGATGAAAGTTCCTTTCTTCAGAGGCCGG
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ATTCTTGGGGAAATGGCATCATCCAAAGCATCCCAGAAAGTTTTTCCATCAACATCTCTG
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