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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI014549Chr125858182601671-Protein ALWAYS EARLY 3

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI014549.m165100PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain38.31.20E-09
LITCHI014549.m1663764PF06584.16DIRPFamily111.32.40E-32
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LITCHI014549.m24681PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain38.41.20E-09
LITCHI014549.m2644745PF06584.16DIRPFamily111.32.40E-32
LITCHI014549.m2904970PF19438.2LIN9_CDomain26.63.80E-06
LITCHI014549.m3565666PF06584.16DIRPFamily111.52.20E-32
LITCHI014549.m3825891PF19438.2LIN9_CDomain26.73.50E-06
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>LITCHI014549.m1
ATGGGAAGTGGAATTATGGAGGAGTTTTTGGAGTTTTGGATAATTTTTGAGGAAGTTATG
GCCCCATCAAGGAAAGCTAAAAGCGTGAATAAGCGGTCATCTTATACTACTGAGGTTGCT
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ACGCGAAAACCCCTTAACGAGAAAGATATAAAGTATTCTGAAGACAAGTTAAACTATACT
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AAACGGAAGAAACAGCTTTCTAATTGCCTATCAAGGTACCAAGTTCGAAGATGGTGTGTC
TTCGAGTGGTTCTACAGTGCAATCGATTACCCATGGTTTGCTAAAAGGGAGTTTGTGGAG
TACTTGGATCATGTAGGGTTGAGTCATGTTCCAAGATTAACTCGTGTTGAATGGGGTGTC
ATAAGGAGTTCCCTTGGTAGGCCACGGAGATTTTCTGAGCAATTCTTGAAGGAAGAGAAA
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GCTATTCATCCAAGGACAAGAGAGATTCATGATGGAAGTGTACTAACTGTTGATCGTAGT
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TGCATGCCATTAAATCCTTTGGAAAATCTGCCAGCATCTCTTACGAGACAAACAGCAGCT
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GCTCATCTCTCACCTTCACCTAATTATCACATTAACAATTTATCACAGCAGCAAAAGGTG
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GTGGATGATTTAAGTACGTTATCTGTAAGATCTTCTATCCCTGCAGATTCAGTAAACAAC
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TCACAGAACCTCCCCATTTATGCAGAGATACAGAAATGCATGGGAATCATTAAGAACCAA
ATACTGGCACTCATACCTACATAG
>LITCHI014549.m2
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GTAGAAGCGCTTTATACTATGAATAGGGCTTACTTATCTCTTCCAGAGGGCACTGCTTCT
GTGGTTGGACTTATAGCAATGATGACCGATCACTATGGTATTCTGGAAGGAAGTGATAGT
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AAATTACAGAAGTACTCCACGAAAGGATCAGATGAACCATTTCCAGATCTTCTACAATTT
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GATAATGCAGAGAAGTATCTCTCACCAATTAGGCAAGGATTGAAAGCAAAGGTGGGTATG
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GCTCAAGATAAAAGTCATTTGATGGATACAGAAGGTGCTGGTAGAGTTGAATTTCAACAA
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GATGACATAAAGGAAGCCTGTAGTGGGACAGAGGAAGGACATCAAGTGGGCACTGTCAAA
GGCAAATTTGTAATGGAGGTTGCTGATGAAAAATCTTCAAGGTCCTCTGTTAAGGGTCTC
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GCGCCTTTAAAGGAAGAAAAGTCTGGGACTATAGATGAGTCAAAACCAAAGGGGAATCAA
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GACACGCGAAAACCCCTTAACGAGAAAGATATAAAGTATTCTGAAGACAAGTTAAACTAT
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GGTACTAGGGAAGGACTTCCGACTGATTTAGCTCGACCTTTATCTGTTGGGCAACGTATT
ATTGCTATTCATCCAAGGACAAGAGAGATTCATGATGGAAGTGTACTAACTGTTGATCGT
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GATTGCATGCCATTAAATCCTTTGGAAAATCTGCCAGCATCTCTTACGAGACAAACAGCA
GCTTTTGGTAAATTTATTGAGAATTTCAATGAGCTCAAAATGAATGGGCAACCAAGAGAA
AGAAATATGGAAGAATACATAAAATTTACCCAATGTGAGAACCTGGAGAGCGCCCATGGT
CCTGCTCATCTCTCACCTTCACCTAATTATCACATTAACAATTTATCACAGCAGCAAAAG
GTGGTCCCACCAACTCTTAATTCACAAGTTAAAGTCAGGCCTAGTGAAACTGTCAATATC
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CAAGCTCTTTCTGAACTGACTCGTGCCCTTGAAAAGAAGGAGGCTGCGGTGTCTGAGTTG
AGGCGCATGAATGATGAAGTGTTGGAAAACCAAAAAGATGGAGACAGCTCTTTTAAGGAC
TCAGAATCATTTAAAAAGCATTATGCTGCAATAGTTTTAAAGCTGAATGAAATCAATGAG
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GTTATATGGTCAAAACCAACTGCCAACTTAGGTGAACCAGGTGGCCACTCAAGCTCTTTA
GATCCTTCTGCATACCAAACCCTGGAATCTGGATCTCTTGTGGCTGAAATTGTTGAAAGT
TCAAGAACTAAAGCCCAGAAATTGGTTGATGCAGCTGTGCTGGCAGTGTCTTCTTTCAAG
AAACAAGGAAACAGCATCGAGAGAATTGAGGAGGCTATGGATTTTGTAAATAATCAGCTT
TCGGTGGATGATTTAAGTACGTTATCTGTAAGATCTTCTATCCCTGCAGATTCAGTAAAC
AACACTCTACCTTCCCAGGATCAGCAGAACACCAGCACATCAGGTCTGCTAGGGACTAGT
CATCAACCTGATTCTAAGTCGAACAATCTGAATGATGAAAATGCTGGACAAATTCCTTCA
GAGCTAATTTCACACTGTCTTGCTACCATGCTCATGATTCAGAAGTGTACAGAACGCCAA
TTTCCTCCAGGCGATGTTGCCCAGGCACTAGACTCTGCTGTCATAAGTTTGCAGCCATGT
TGTTCACAGAACCTCCCCATTTATGCAGAGATACAGAAATGCATGGGAATCATTAAGAAC
CAAATACTGGCACTCATACCTACATAG
>LITCHI014549.m3
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TCTGTGGTTGGACTTATAGCAATGATGACCGATCACTATGGTATTCTGGAAGGAAGTGAT
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AAAGATAATGCAGAGAAGTATCTCTCACCAATTAGGCAAGGATTGAAAGCAAAGGTGGGT
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CAAAAAGGAAAGAGATGCAATAGCAAGAAGCCAAAATTAGGAGAAAGCATAAACAACCAT
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CTCAGAAAGAGGAGTAAAAAGGTTCTATTTAGAAGAGATGAAGGATCTGACTTTGATGCT
CTGCAAACTCTTGCGGATCTGTCTCTGATGATGCCAGAAACAACTGTTGACACTGAATCA
TCTGCGCCTTTAAAGGAAGAAAAGTCTGGGACTATAGATGAGTCAAAACCAAAGGGGAAT
CAATCAAGTCCTCGAGTAAATTTCATTGCCTCTAAAACATCTAAAGTGGGCAAATATGTG
GATGATGTTAACCTTGTTCCAGAATCAGAGGATCAGATAAATGTTGGAAGCCGCACAAGG
AGACAAAAGTTCTTGCCATATAAACTAAGGATGGATATGCAGAAACCTGTAGATTATACT
GATTCTCAACTGGGTAAATCTCAGAATATTGAGGCTACAGACGAGTTGAAAAAGTTTGTG
AGTAAAGGTAAACGTTCTCATGGTGCTGCACACCCCAAACAAGGAAAATTGGTGAAACCT
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GTGCATGTTCTACCTACAAACCATGTCAACTTACCTACCAAAGTGAGGAGCAGGCGTAAG
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ATACTCAAACGGAAGAAACAGCTTTCTAATTGCCTATCAAGGTACCAAGTTCGAAGATGG
TGTGTCTTCGAGTGGTTCTACAGTGCAATCGATTACCCATGGTTTGCTAAAAGGGAGTTT
GTGGAGTACTTGGATCATGTAGGGTTGAGTCATGTTCCAAGATTAACTCGTGTTGAATGG
GGTGTCATAAGGAGTTCCCTTGGTAGGCCACGGAGATTTTCTGAGCAATTCTTGAAGGAA
GAGAAAGAGAAACTTAATCAATACAGGGAATCTGTTAGAACCCATTATGCTGAACTTCGT
GATGGTACTAGGGAAGGACTTCCGACTGATTTAGCTCGACCTTTATCTGTTGGGCAACGT
ATTATTGCTATTCATCCAAGGACAAGAGAGATTCATGATGGAAGTGTACTAACTGTTGAT
CGTAGTAGATACAGGGTTCAGTTTGACCGACGTGAACTAGGAGTTGAGTTTGTCAAGGAT
ATTGATTGCATGCCATTAAATCCTTTGGAAAATCTGCCAGCATCTCTTACGAGACAAACA
GCAGCTTTTGGTAAATTTATTGAGAATTTCAATGAGCTCAAAATGAATGGGCAACCAAGA
GAAAGAAATATGGAAGAATACATAAAATTTACCCAATGTGAGAACCTGGAGAGCGCCCAT
GGTCCTGCTCATCTCTCACCTTCACCTAATTATCACATTAACAATTTATCACAGCAGCAA
AAGGTGGTCCCACCAACTCTTAATTCACAAGTTAAAGTCAGGCCTAGTGAAACTGTCAAT
ATCCAACAAGCAGCAATGCAGCCATCTATTAGTGCACAGATTCAAGCTAAGGAAGCTGAT
GTCCAAGCTCTTTCTGAACTGACTCGTGCCCTTGAAAAGAAGGAGGCTGCGGTGTCTGAG
TTGAGGCGCATGAATGATGAAGTGTTGGAAAACCAAAAAGATGGAGACAGCTCTTTTAAG
GACTCAGAATCATTTAAAAAGCATTATGCTGCAATAGTTTTAAAGCTGAATGAAATCAAT
GAGCAGGTTTCTGCTGCACTGTTTTGTTTAAGGCAACGTAATACATATCAAGGAAGCATC
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TCAGAGCTAATTTCACACTGTCTTGCTACCATGCTCATGATTCAGAAGTGTACAGAACGC
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TGTTGTTCACAGAACCTCCCCATTTATGCAGAGATACAGAAATGCATGGGAATCATTAAG
AACCAAATACTGGCACTCATACCTACATAG
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>LITCHI020239.m1
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EKKKQRRKVQRKLVDVNNIDDENEDDDNGGSGGTERQREHPFIVTEPGEVARGKKNGLDY
LFHLYEQCRDFLIQVQNIAKERGEKCPTKVTNQVFRYAKKAGASYINKPKMRHYVHCYAL
HCLDEEASNALRKAFKDRGENVGAWRQACYKPLVAIAARQGWDIDAIFNAHPRLAIWYVP
TKIRQLCHAERNTATASSSASGSGDQLPF.
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>LITCHI005662.m1
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TCTCTCTAGAAACCAGAAATCACAGCTCTCTCTCTCTCTCTTCAGGTCTCTTTCACCTCC
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AGTCGCCGGAGAGTCAAAACGGCGACGAATTCGGTTCGCTGTACTCGTCTTTCGTTTTGG
CCGCTCCGGAGACGCCTTTTAGAGAGCCAAGCATGAACGTCAACGACGCGCTCTACTACT
CTCGCCTCTTAATGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACACCAGGACATGGTGAACCGCC
ACAGCCTCTGCCTCACGCGCCTCCGTGACGCGGCGAAGGAGGCCGAGATCCTGCGCCAGG
AGAACGCCTCACTTCGAGCCGTCAACCGCGAGCTCAACAAGCACATCGGCCTGCTTATCA
AGTCCTCCGACGTCCATCACCTGCAGGCAGCTTCTTCCAACGACTTCGACAACAACCGCA
ACAACAACAACAACGTCAACAACAATGCCGCCGCGACGTCGCTTGAGAAAATGGTGAACG
TCGGGATGCGAGGGTTGAACATCGGCGGCGGCGGCGGCGGAGGAGGAGATCATCGGGAGG
AGGTGTGTGTGGAGAGTCCGACGAGCGTGATGGAGAATGTGGACCTGAAGATAGTTTCAC
TGCCGAAGAGTATCTCTGTGAGGTCCAATGGTTACTTGAAGATGGGTCCAGCTGCTGCTG
CTGCTGCCGCCGCTGCGGCCAGTAACAGTAAGGCTCGTCCTCGGACATCCGCTCCTCTCG
CTTCGGCGCACAAGGTCTATGTGCGGGGAGGGAAGAGAGAGGAGGAACCACTGGAACTGG
AAGTGTACAACCAAGGCATGTTCAAGACTGAGCTGTGCAACAAATGGCAGGAGACTGGGG
CCTGCCCGTATGGTGACCACTGCCAGTTTGCTCATGGAATCGAAGAGCTCCGCCCTGTCA
TCCGCCACCCGCGTTACAAGACAGAGGTCTGCAGGATGGTTCTTGCCGGTGATGTTTGCC
CATATGGTCACCGTTGCCATTTTCGCCACGCGCTTACTGAACAAGAGAGGTTCATGGGCC
ACCTGAGCCACCGGTGA
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>LITCHI021264.m1 +  Up_Stream_Len 2000
TTCTATAAGATTAATCTAGTATTGGCTTCTATGAGATTACCTTACGCGAGCTCAACGATC
TGACTTGTTCACCTTCGCGAGTTGAAGATGCATTGAGATAGGTTTAATACAAGTCACGAG
TTGGAGAAGGTAGCAAGCTCACTATTGCGACCTGAGCACTGGGCTTCTCAGGCCCTTCAC
CATTGGGTCCAATTTTTGGACTTTCAGCGACCCATTTATCTATGTTGTGGAAACGACTAT
AACAAATGTGAAGCCTTAAAACCTGCTGGGCATCAATCAAGGAAATGGAGATGCAATCCT
TGATCCACTTTTTTTTTTTATTTTAATATAGGATATTATTGGAATTTTAAATTAATGATT
AATATGGGGTGTACATACAATTTTTCGGGGTGCAATTATTGTCACTCAAAAGTTCAAAAA
CTAACTTCAATTTTATTAACTGATGAAGTGTAAATTTCATTGAAAATTAAGTTTAAAGGC
TGTATTATGGAAGTTCAAGTAAGTTACAGTGGCTAATTACTTGTCATGATAATTTTGAAG
AATAGAGAGATAAAATATGCGCCTATAAATTTCTCATAAATTATTTCTCAGTATCAATAG
TAAAAATTTCTTGTATACATCTATTTTCTTATGGAATTATTACTACAACAATGGAATTGT
CTTATAAGTTATGTGAATTTCTCTTCAAATTTTGTTAAAGTCTTTCAAATTTAGAAATAC
CTATTTCAATGATTTTAGATTTTACCAAAAACTTATTATATATTCTTGTCCATAAGAAAT
TTTCTTTACAATTATCATGAGTCTATAGAAACTTATCAAACTGAATTATAAATTAATTTG
AGTCTACATCGCTTTCAAGGAGATTTATATATATATATATATAAAGCTATATTTAATCCA
TGTATAACTTATGAGTGTGGGTATTGAAGTATCATAAAATTTGCCTTTCTATTAAAAGTG
TGTAAATGTGGATTTTCTTTTCTTGAAAAAATAATAACAAGTTTAGGAGTTAAAGGTAAA
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TCTTGCATTTATTTTAAGATATTAAGATGAACTTAAAAGATAATCAAAATTAAATTAATA
AAATCTTAACAATACGATTTAGATAACTGATGACTGATCTTCGTATAACTAAGACATTAA
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ATATCCAACCCTCACTCTTAAAGTCAAGGTTTGCTGTGCGCTATAAGGCCACTGACGGTG
CTTGTCTTGTCTTGTACACAATAATTAGTGAGGAGATGAAGGAGATAGAGCTGGTGCTTT
TGTAAAATATTATGGGCAGCATCATAATGTATATAATGTTCTTTACGGCCTCCTTTTTTA
ATTTTTTTTAATCTCCTTTGGCTTTTTCTTAATTACTGCTACACTTATCCAACTATAATC
CACAGTATAGCACACCCACCAAACATTTTCAATCAGTGCAACACTTGTGTATATATACCT
CTGACCATAGCCTAATGGGTCCACAAGCATCCCCACCATCAACTAACCATATTCTGCGAT
CTTGACCAAACTTCACCAACATCGAGTGACCAAGATTCATTTGTCCAGTTGTGTCATAAC
TATGAGTCTATGAGCAACAACAGCCAAGAAAATCTGAAGTGTAAAAATCTATACCAACCA
ACAGCTAAGCGTTCAACTACCCATCAAAGTTGGACTAGGGTGTCGTCTATGCAACTACCA
TTCTTGTTGCTTTTTTGTTCCACACCACCCATTCTTCTCCACACACGAAGACCATTTTCT
TTGGAATCTTCTCTCCTATTAATACTTCTCATTAAGTGCCTTCAATTTCACACACACATA
GTTTCTTCACCAAGAGACCATATATATTATTTCTAGTTGTGATATTGGTCTGTTTATTTT
CAACTGGAATTTGAGTCTTG
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>LITCHI023936.m4 GenomeSequence + 
CCACTTTCACTCACCTACTCCACTCTCGAAACTCACCTCCTCACTCGGTCACCCCCGTCA
ATACATTTCAAATAACTTCAAATCCTCTCTTCGCTTCCCAATCCCTTCTCCATTTTGATT
TTTAATTGAGCTGATTGATGCTCCATACCCTAACTTGCTCATCATCTTCAAGCTCACAAT
CTGTAAGTTTTCTCTCTCCTTTTTTTAATTCAGTTTTATTTGTTTTGTGTTGGTGATGGT
TGATTGATTGTGCATTGACTTGTCTACATTTTTTTTTCCTTTCCCTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTGGTTGACCGTTGCTATATTTGATTTTCTTTTGAAAAACTTTGCCGTTTAAGATT
TTATAGATTCACATTTGAAATTTGATTAAAAAAGAAAAAAAAAATAAAAAGGTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTTGAAATTGATTTTTTGGTTTTTGGATTGAATAGTTATTGATTCAAATTG
GGGTGGGTTTTGTATTTTTAAGAGGTGGTTTTGGTTTTGATTTTATATGCTGTTTTATTG
TCTTTTGAGTGGAGAATATATGCTCAGGAATCGTTATCGTTGATCAGATTTGTTTTTGAT
TCGGGGTGTTTATTATTGTTCTTGTAGAAAAGTCAGTTGATTTGAACTGTTTTCAGATTT
TTTGCTACTATTAAAACATGTGTGGTGTTTCGGAGAAGTTAAATTCTAAGGCTTTGGGAC
CTAGTTCCACGCAAAGTGACTCGTCGCTAAGTGGAAGTATGAGTAATATGTGTGAGAAGG
TCGACAGTGGACATTGTTTTTCTCGTTTGCTGGAACTTGCAGCTGATAATGATGTTGAGG
GGTTTAAGGAAGCGGTGGGGGATGGATCTGTTGTTGGTGATGTTGGACTTTGGTATAGTT
TCCATGGGGGGTTGAAAAAGATGGTTCTTGAGTGTAGGACCCCGTTAATGGTTGCTGCCA
AATATGGCAGTGTTGATGTTGTGAAGTTGATTCTTTCTTTTTTGAAGGCTGATGTGAATC
TGTCTTGTGGGGTGGATAAGAGCACTGCATTGCATTGTGCTGCTTCTGGTGGATCTGTTG
ATGCTGTTAGTATTGTCAAACTGCTTCTTGTTGCTGGTGCTGATCCTAATGCTACTGATG
CGAATGGACGTCGTCCATTTGATGTTATTTGTGCTCATCGGAATCTTCCTGATTCTAGAG
CTACCCTTGAAGAGCTTTTGAAGAATGATGGGTCTGTCAGTGTAGACAGTCTGTGGGTTT
CAACTGTTAGTTTGAGGTCCAGTTCACGGTCTCTATCATCGTTGTCAGATAATGGTTCTT
GTGTGTTAGATTTGCCCTTGTCTTCTGTTATCTGCAAGGCTGAGGAGGATATACAGGCTT
CTTCTGCTGTGGAGAAGAAAGAATATCCTATTGATCCGTCTCTTCCTGACATCAAGAATG
GTATCTATTCATCTGATGAGTTTCGGATGTTTTCATTCAAAATCCGGCCTTGTTCTCGAG
CTTATTCCCATGATTGGACTGAGTGTCCTTTTGCCCATCCGGGGGAGAATGCAAGGAGAC
GAGACCCGAGAAAATTTCACTACAGTTGTGTGCCGTGTCCAGATTTTCGTAAGGGGTCAT
GTGAGCGTGGGGATTTGTGTGAATATGCTCATGGAGTTTTTGAGTCCTGGCTACACCCTG
CCCAATATAGGACTAGACTCTGCAAAGATGGCGCAAGTTGTACGCGTCGGGTGTGCTTCT
TTGCTCATGCATCTGAGGAATTGCGTCCCCTTTATCCATCTACTGGGTCTGGAGTTCCAT
CTCCTCGATCAGCCATGGCCATGGATATGGCTGCAGCCTTAAACATGTTGCCTGGTTCTC
CATCAGCTGTTTCTGCTATGTCACCTTCTCCATTTACAGCAGCCATATCACCTTCTCCAT
TTACGGCACCCATGTCACCTAGTAATGATATTTCACACTCATCCATGGGTTGGCCTCAGC
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>LITCHI023936.m3 GenomeSequence + 
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>LITCHI023936.m2 GenomeSequence + 
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GGATGGTGGAACCTATATCCCCAATGAACTCCCGCCTATCTGTTCGTGCTCATCGTGAGA
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