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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI014517 | Chr1 | 2352047 | 2353671 | + | "Transcription termination factor MTERF2, chloroplastic " |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI014517.m1 | 78 | 286 | PF02536.17 | mTERF | Family | 93.4 | 1.30E-26 |
LITCHI014517.m1 | 247 | 354 | PF02536.17 | mTERF | Family | 70.1 | 1.60E-19 |
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>LITCHI014517.m1 ATGTTTAACTTTGTATGCAAATCATTCTTATGTGTCCGCCATTGGAGGCGTTGTAATACT ACTCTCAGAGATGAATGTCTTTCATTATTGTCTATTAGATGCATGTCAACCACTGAAACT TCAAAGCAACAACCTTTGACAGTCTCATACCTCATTAACACATATGGCTTCTCTCCTAAA TCTGCCTTATTAGTTTCGAACAAGTTCCAGCTAGAGAAAGTAGAGAAAGTTATTAGTTTT TTCAAGAGCCATGGTTTCTCTCAGACTCACATCTCAAAAATCGTTAAAAGTAATCCACGA GTGATTCTGTGTGATCCTGAGAAAACCCTTTTGCCCAAACTTGAGTTTTTTTACTCCAAA GGCTTTTCAAGTCATGACCTTGCCAATGTTTTATCTAAATGTCCCTCTCTTTTCAATAGA AATCTAGAGAGGCATATAATTCCAACTTTTAACTACCTTGATGATTTGTTTGAATCTCAG GAGAGGGCCATTGTTTCTATTAAACGCAAACCTTTTTTACTTTATAGTGATTTACAAACT TATCTGGCACCTCAAGTCAACATTTTGCTAGAGTATGGTGTGACCAAATCCAATATTGTC ATGTCTATGAATTATTGGTCTTACTCATCAATGACAGATGAGAAATTGTTTAAAGAGGTA GTGGAGGAAGTGAAGGAAATGGGTTTTAATCCTTTGAGATCACCTTTTATTATGGCAATT AGTTTAAAAACGGGGATGAGCAGATCACTGTGGGAAAGCAAGGTGAGTATGTATAAGAAG TGGGGTTGGTCTGAAGAAGAATTCTTGGAAGCATTCCGGAAGTGTCCGCAGATTATGAGG GTGTCCAAGGATAAGATTATGGCGGTAATGGACTTCTTTGTGAACGAAATGAGTTTGGAG TCTTCAGATATTGCTAAATATCCTATTTTTGTTTCATATAGTCTGCACAAGAGGATTATT CCAAGGGCTGCAGTGTTTCAATTTCTGTTATCGAAAGGTTTGATTAAGCGCGAGCATACT AGCTTAAATGCATTGTTTAAGTGGTCTGAGAAGGCCTTCCTCGAAAGGATTGTGAATTCT TATGATGAAGCACCCCAGCTAATGAAGCTGTACAATGACAAGTTGAATCTTTCAAGGAAT ATAAATTGA
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>LITCHI014517.m1 + Up_Stream_Len 2000 AAAAAAAAAAGAAGTTGAAGTTGGCCAAATGGAATCACTTTTATTTTTATTTATTTATTT ATTTTATCTTTCTGGCACCATTTCTAAGTGAGGAGTCTATCTACACCAATCTTTATAAGA TTCTGATAGTATAGTTTAGATATCGTTTCCAAATATCGAGAGAGGTGCTCCTATCATTGT GAATATTAACACAAAGGATGAGATTGGAAACTCGAACCTCAGATAGTAGTAGATAAAGGT GGTTAAACCATTATGTCTCCTCACTTATGAGTCTAATCACTTTTATTTGATACTCTCCTC CTTATAAACTCTCACAAATATTGAAGGATTGTGTGACACATAAATACAATCATTAGTTTA AGGCATTAGAAGCTTATGTTTATTTGGATTTAAGACATCAGAAGTTTACATTTATTCAGA TTTGAGTTTGAATCAAGAGAAATCATTTTTTACTAAATTAAAACCGAATCTTTTTATCGA TTTCCGTTTAAGAATCTCATTTTTGGGATGAAGGGTGCAAGAAACTTGTTGACTTAAGAG GTCTATTCTTTTTAATCATCAATAGGATCCCACTTGTTTCTGCACACCTCATCTTTTTAA AAGCTTGTTGGCCTTTCGAGTTTGCAAAAGTGATGCTACCATAGAAGCCTTGCTCATTCT ATAATGATTTTGAGACACTCTATTTGAATGGTTCGTATGAGTATTTTGACTCAACCACAA AGATTTGACATTCTTGACATGATCTCAGTAGCTTCTTGTGTTCTTCAAAGGTTGCTTTCT TTTTTTCTTTTATTATTTCTTGTGCTGTTGACCAAAATGTACGGTGTGGGCATGTATTGG TGACTACTACAACTCATTCGAATATAAACAAAACATCTTATAAAATCAAATTTCGACAAA ATTCATAAGTTTATGATAAGTCTCAAATAAAGCTATTGACTACCTTTAAGAAATAATTTA TAAATTCACTAACTTGAAAAAATGTTAAGAAGTTTTCAAAAGATGAACTAACATATAGCT TTTGAAAAAGTTGACGAACATGAATGGTTGAAGTCTAGAGAATTCTCAATTCTCATTGTG AAAATTAATATCCAAACCTATCATGAACACTTAATTTTTTAAAATTTTGATAAATGCTTA CTTTTTTAATGTTAGATCTTAATTGGTATCAATAGTTTCCTTTTTACATTTGCTTATTTC GATGTAGATTAAAAATATATATATAATCGTAAGATCATTTTAAAAATTAATGAAATAAGA TAATTTAACTAAATAAATCATCTTAATGATCCATGATGAAGTTCATATAAAATGAGGAAA ATCTATGTGTCAAGGTAAAACTTCAATTTAGTCATTAAATTTTAATGTTATCTCCATTTT AAATCTGTTTGTTTAAATACTTATCGTGGTTTCCAAATTATTAGAAGAACTTCATTTTAA TCTCCGATATCAAATTTTTGTTAGTTGACAGTGACGGAAACAATAAAAAGACACTATTTC CCTTGACAGTTTGTGTAGAATAGCAGAGGACAATTTTACAGTTACTGAAGATAAATATCT ACAATTTTACCTCATTGTTGTTTTACCCTTGCTACTATTTAAAATACTAAATTACCATTT TAACCTAAAATCATTAATAATGTATTAAGTTGTCATCCACCATAATCCAATACAAATTTG ACACATGTCATATAAATTTTAAAATTTTAAAAATAGCTAATTTACAACCACTTAAAATCC AACACATATCACCATTTTACAATTAAAATATTTAATTACTACAAAAATAAATAATAATTT TTTAGAAAAATCTGATAATGCGAAAACGACAACGTTTCTATTAGTTTGGAGTTTGGAGTG GAGTGAGCAAAATAGGGGTTTTGTCAAGCAAGACAGGCCGTCCCGATATTTTCTGCAGTG GAGTTTAACTTCATGAAGATAATTGTGAGTCGAGAAGAAGAGGTTAGTTGAGTCAGATTC CCTAACTAGTTTCAGCTGAC
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>LITCHI014517.m1 GenomeSequence + GCAAAATAGGGGTTTTGTCAAGCAAGACAGGCCGTCCCGATATTTTCTGCAGTGGAGTTT AACTTCATGAAGATAATTGTGAGTCGAGAAGAAGAGGTTAGTTGAGTCAGATTCCCTAAC TAGTTTCAGCTGACATGTTTAACTTTGTATGCAAATCATTCTTATGTGTCCGCCATTGGA GGCGTTGTAATACTACTCTCAGAGATGAATGTCTTTCATTATTGTCTATTAGATGCATGT CAACCACTGAAACTTCAAAGCAACAACCTTTGACAGTCTCATACCTCATTAACACATATG GCTTCTCTCCTAAATCTGCCTTATTAGTTTCGAACAAGTTCCAGCTAGAGAAAGTAGAGA AAGTTATTAGTTTTTTCAAGAGCCATGGTTTCTCTCAGACTCACATCTCAAAAATCGTTA AAAGTAATCCACGAGTGATTCTGTGTGATCCTGAGAAAACCCTTTTGCCCAAACTTGAGT TTTTTTACTCCAAAGGCTTTTCAAGTCATGACCTTGCCAATGTTTTATCTAAATGTCCCT CTCTTTTCAATAGAAATCTAGAGAGGCATATAATTCCAACTTTTAACTACCTTGATGATT TGTTTGAATCTCAGGAGAGGGCCATTGTTTCTATTAAACGCAAACCTTTTTTACTTTATA GTGATTTACAAACTTATCTGGCACCTCAAGTCAACATTTTGCTAGAGTATGGTGTGACCA AATCCAATATTGTCATGTCTATGAATTATTGGTCTTACTCATCAATGACAGATGAGAAAT TGTTTAAAGAGGTAGTGGAGGAAGTGAAGGAAATGGGTTTTAATCCTTTGAGATCACCTT TTATTATGGCAATTAGTTTAAAAACGGGGATGAGCAGATCACTGTGGGAAAGCAAGGTGA GTATGTATAAGAAGTGGGGTTGGTCTGAAGAAGAATTCTTGGAAGCATTCCGGAAGTGTC CGCAGATTATGAGGGTGTCCAAGGATAAGATTATGGCGGTAATGGACTTCTTTGTGAACG AAATGAGTTTGGAGTCTTCAGATATTGCTAAATATCCTATTTTTGTTTCATATAGTCTGC ACAAGAGGATTATTCCAAGGGCTGCAGTGTTTCAATTTCTGTTATCGAAAGGTTTGATTA AGCGCGAGCATACTAGCTTAAATGCATTGTTTAAGTGGTCTGAGAAGGCCTTCCTCGAAA GGATTGTGAATTCTTATGATGAAGCACCCCAGCTAATGAAGCTGTACAATGACAAGTTGA ATCTTTCAAGGAATATAAATTGATGAGTATAAACAGAAAGGGCTGCAGCTGTTGTAAAAT GTTTCCATCATAAATCCAAACCGATTTAGATTTTTATTTCTTGTACTTAATCTAATTAAA TTCTTTGTCAAATTAGTAATGGCTTATTAGCAATTTTTGCTTCTTGTCGTTAGATATTGT CGACTGAAATTTGAGTTTAGCAATATGATTTGTGTATCTATACCTGGATATCATACAATG ATCTCTGATCTTACTAGTTTGTTGGGTTTTTTTTTTTAATTATTTTAAATACCGTGTTAT AATTATAGTGAGGTAACTAGTATTTGGTAACCAACCAATCAAATTTTATGACAATGGTTT CCTAT