Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI014405Chr115997871602178+Transcription factor MYB12

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI014405.m11461PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain50.71.70E-13
LITCHI014405.m11775PF13921.9Myb_DNA-bind_6Domain36.25.70E-09
LITCHI014405.m167112PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain49.73.30E-13
LITCHI014405.m171124PF13921.9Myb_DNA-bind_6Domain35.21.20E-08
Download   Copy
>LITCHI014405.m1
ATGGGGAGAGCACCATGTTGTGAGAAGGTGGGCTTGAAGAGAGGCAGATGGACAGAAGAA
GAAGATCAACTTTTGACCAAATACATTCATGCTAACGGTGAAGGCTCATGGAGGTCACTA
CCAAAAAATGCAGGTCTCTTAAGGTGTGGCAAAAGTTGTAGACTGAGATGGATCAACTAC
TTGAGAGCTGACCTAAAGAGAGGAAACATCACCACTGAAGAAGAGGATACCATTGTTAAG
TTGCATTCTGCTTTGGGTAACAGGTGGTCTTTGATAGCTGCACAATTACCAGGAAGGACA
GATAATGAGATAAAGAACTACTGGAACTCTCATTTGAGCAGGAAAATTTGCAGCTTCACT
AAGCCATCAAAAAGTAATGATAATTCCGCTTCCGCTTCCATTACACCTTGCAGCAGCGAC
ATCAACAACACTATCAAGCTAGCTGAATCTGCATGCAAGCCGACGGATCCCCGAAACCGG
ACCCGAACTGGCGGATCATCATCTAAAACCAACAAGAAGTCAGTACGATCACCTAAAAGT
GGCACCATAAATCAGGTACTTGATCATCAACCAACTACCAAAGAAAAAGCAACCCAAGTT
GCAAATATTAATGCTAGTACTACTGTAGTGGGACAAACTGAGATGGGGGACCCTAAAAGT
AGCGCAGAGAATGGTTTGCATGGCTCTTGCATGGACTGTGCTGGAGTTATTAGGGTTTTG
GGTGAGTGTAAAGAGAGAGAAAGTGAAGCAAGTAGTAGTATTAGTACTACTACTAGTAAT
AATAATAATAACGTTAAAGTTGGTGGTGGAGAGGAGACAAAAAGTGAGGTTTTGGGACCA
AATGAGTGGTTAGATAGTGAAATAAAGAGGCTTCATAATACACTAATTCAAGGAGATCAC
CAAGCTGTTGAGGTGGTGGATACTCATACAAGTGGGAATAATGATCAAACCCTTGTTAAT
CATCATAAACAGAAGATAACTGCAAGTGGGGTGTTGTGTATTGATGGTGAGGAGAGACAA
GGAGGGGTCAATGACCGTGACAATGATGATGACAAAATGATGGTGAACGAAAGTGAGGAT
ATGAGAGAGAGCTCAAACTATGTTGTTACAGCAAAGAGTTCATGGTTTGATAATGAGGAA
TATGAGGTTGATTGGGATCAAGATTGGGCAGATGGTATTGGTGTTGAAAATAATAATAAT
AATACTAGTGAATGGGAACTATGGGATGATAAAGAAGGAGACAAGTTGTTGTATTGGTTA
TGGGATGGTGGAGTAGAAGATAATTAA
Download   Copy
>LITCHI014405.m1
MGRAPCCEKVGLKRGRWTEEEDQLLTKYIHANGEGSWRSLPKNAGLLRCGKSCRLRWINY
LRADLKRGNITTEEEDTIVKLHSALGNRWSLIAAQLPGRTDNEIKNYWNSHLSRKICSFT
KPSKSNDNSASASITPCSSDINNTIKLAESACKPTDPRNRTRTGGSSSKTNKKSVRSPKS
GTINQVLDHQPTTKEKATQVANINASTTVVGQTEMGDPKSSAENGLHGSCMDCAGVIRVL
GECKERESEASSSISTTTSNNNNNVKVGGGEETKSEVLGPNEWLDSEIKRLHNTLIQGDH
QAVEVVDTHTSGNNDQTLVNHHKQKITASGVLCIDGEERQGGVNDRDNDDDKMMVNESED
MRESSNYVVTAKSSWFDNEEYEVDWDQDWADGIGVENNNNNTSEWELWDDKEGDKLLYWL
WDGGVEDN.
Download   Copy
>LITCHI014405.m1
TCATCTCCTAGGCTACTATAATTAATTGTGCAAGACAACCTTTATACGACTGCAACCTCT
CCTCTTCTCTCGCTCTCTTTGTAGGTTGGTGTGCTCTATAGTACAAAATCTCATAGAGAG
ACCATGGGGAGAGCACCATGTTGTGAGAAGGTGGGCTTGAAGAGAGGCAGATGGACAGAA
GAAGAAGATCAACTTTTGACCAAATACATTCATGCTAACGGTGAAGGCTCATGGAGGTCA
CTACCAAAAAATGCAGGTCTCTTAAGGTGTGGCAAAAGTTGTAGACTGAGATGGATCAAC
TACTTGAGAGCTGACCTAAAGAGAGGAAACATCACCACTGAAGAAGAGGATACCATTGTT
AAGTTGCATTCTGCTTTGGGTAACAGGTGGTCTTTGATAGCTGCACAATTACCAGGAAGG
ACAGATAATGAGATAAAGAACTACTGGAACTCTCATTTGAGCAGGAAAATTTGCAGCTTC
ACTAAGCCATCAAAAAGTAATGATAATTCCGCTTCCGCTTCCATTACACCTTGCAGCAGC
GACATCAACAACACTATCAAGCTAGCTGAATCTGCATGCAAGCCGACGGATCCCCGAAAC
CGGACCCGAACTGGCGGATCATCATCTAAAACCAACAAGAAGTCAGTACGATCACCTAAA
AGTGGCACCATAAATCAGGTACTTGATCATCAACCAACTACCAAAGAAAAAGCAACCCAA
GTTGCAAATATTAATGCTAGTACTACTGTAGTGGGACAAACTGAGATGGGGGACCCTAAA
AGTAGCGCAGAGAATGGTTTGCATGGCTCTTGCATGGACTGTGCTGGAGTTATTAGGGTT
TTGGGTGAGTGTAAAGAGAGAGAAAGTGAAGCAAGTAGTAGTATTAGTACTACTACTAGT
AATAATAATAATAACGTTAAAGTTGGTGGTGGAGAGGAGACAAAAAGTGAGGTTTTGGGA
CCAAATGAGTGGTTAGATAGTGAAATAAAGAGGCTTCATAATACACTAATTCAAGGAGAT
CACCAAGCTGTTGAGGTGGTGGATACTCATACAAGTGGGAATAATGATCAAACCCTTGTT
AATCATCATAAACAGAAGATAACTGCAAGTGGGGTGTTGTGTATTGATGGTGAGGAGAGA
CAAGGAGGGGTCAATGACCGTGACAATGATGATGACAAAATGATGGTGAACGAAAGTGAG
GATATGAGAGAGAGCTCAAACTATGTTGTTACAGCAAAGAGTTCATGGTTTGATAATGAG
GAATATGAGGTTGATTGGGATCAAGATTGGGCAGATGGTATTGGTGTTGAAAATAATAAT
AATAATACTAGTGAATGGGAACTATGGGATGATAAAGAAGGAGACAAGTTGTTGTATTGG
TTATGGGATGGTGGAGTAGAAGATAATTAAGATATTTATTTATGTTGCTTAATAAGCATA
TGTTAATATTTGATTTCAATTACCAGTTGATGAGCTTGTGGAATTGTTAATTAGATTGAT
GATAACTGCTTGCTGCTTTAAGAGTTGTGAGATGCACAAAGCTTTAATATTTACTTGTAA
AGTTGTAAGTTTGTAGAATGGTGTACTTATATTTATTGATATCCCAACA
Download   Copy
>LITCHI014405.m1 +  Up_Stream_Len 2000
AACACATAGATAGTTGGCGGGCTTGAATATGTTGTCATGATCAGGGGACAAGAGGACTAT
CAACAGCACTACATGTAACACACTTGTGTCTTACATTTAATGAATAAAGTCGAACAACTG
AGGATCAACCTAATTAGAATCGAAGATCCTCATTAGTTTCTAATTTTTGTAATACAAATT
TATAGTCCATGCCAAATTTAGGTACCATTTGACATCAAGGTCCGTAGAATAACTAGTATA
TAATTGTTTGTTCAATGGAAGTGTATTAGTAAATGAGTTTCCCCAACCCCACCCCCCTTT
TTTATACTAAAAGATGTATAAATTTTCAAATCAATATCACAATGAAATGATCGAAAAGAT
TATAATACGCGTCTTTCGTTTGTGAATATTATCAATATTAAAAAGAGACTTATTTAGTTC
TCTTAATTTTTTGTCATTAACTTAAAATCCAACATTTTTTTTTAATTACTTCATGATATT
TCCTCTATGATAAATCCTCTTTACATGTATTAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAG
GTGTTATGATAATATGACTTGAATGTTAATCAAAGTACTTCTTCAAACTTCTATTGGAGT
GGGGTCAATTCACCAACTTTTAAATCGCTTTCAGACTGTCTATTTTCGCATTCACAGAGT
ACAGACTGCATTGCAGACACCCAAGTGGGTACAAGAAGTAATTGTATTGCCGTAAACTTG
ACCAACAGTGGACATAAATAATAGAGCAAATTAAGGTTTTTTTAAACAAAAGGTTCCTAT
TAATGTGCGAAAAAAATAATAATAATAAGAAATGTCAAATATTATTAGAGGTTATCTTAA
AAGAATAAGTAAAAATATTTTATTTATCTTTTTTCATAATTTAAAATAAGATCATCGTTC
AGTGGTAGAAGAATATATCATTCAATATTTGAGTGAATACTCACTCCTTGAACCACATTT
ATGATTGAGGTTTAAGTCACAAGTTGTACTTTTACTATATATGTGTGAACTGTTATTTAT
ATTTACAGTACTGAGTTTATTTAAGTTTAATAGATTTTTTTTTAATGATAGATTTTAGTA
AAGTTTATAGATTCTATCAAAGTCATATTAATTTTGTTAGAATTCTTTAAAAAAATATAA
TAAAATCTTGATGAGAATTGTAAGATCTATTATAAATTTTTTTCTTCATAAAAATCACTT
TAAATTTCATTCAAGTCCATCTAAATCTATCGTCAAAATAAAATCTGTGAAATCAATTAT
TTTTTTAATATACTTTAATTTTATTGGATTCATACAAACTAAAATTGAATACACCTAAAT
TTTATTAGATTTTATACAAATATTAATTGAATACACTTATGTTTTCTGGATTTCATATAA
ATTTGAATTGAATACACTAAACTATATTTGGAACATGAGATTTGAGGTGGGTTTGAGATT
CAAAATATCTTAAACTCTCAAATCTCATGTTTGGAGAGTAATTGGTAGGATTCCAAACCT
AATCCCAAACTCTCTCAAATCCTCCTCTTATGAGAATGCTCATTCACGACCAAAATGATG
AGATTTGATGGGTTTGAGAATGAGTATATCATCTTTACTTTATTTTTTTTCAAATTTTTA
AAGAATTTTTTTAAAATTAATTTTAAGTATATTATAAAATATTTAAATTAATTTTATTTC
AATATAATCTCATATTATACCAAACATAATATAGTATAATTCTAATCCTATCTCAAGTCT
ACCAAATATGGGACAATAATTCGTCAATGCAATATATTTTATTTCAATCTGATCCAATTC
ATTTCATTCTCATCCCATGTTACCAAAGTAGCCTAAGCTCCTATACGGCAAATTGTGCTA
TAGATTCTACATTCACATCATCTCCTAGGCTACTATAATTAATTGTGCAAGACAACCTTT
ATACGACTGCAACCTCTCCTCTTCTCTCGCTCTCTTTGTAGGTTGGTGTGCTCTATAGTA
CAAAATCTCATAGAGAGACC
Download   Copy
>LITCHI014405.m1 GenomeSequence + 
TCATCTCCTAGGCTACTATAATTAATTGTGCAAGACAACCTTTATACGACTGCAACCTCT
CCTCTTCTCTCGCTCTCTTTGTAGGTTGGTGTGCTCTATAGTACAAAATCTCATAGAGAG
ACCATGGGGAGAGCACCATGTTGTGAGAAGGTGGGCTTGAAGAGAGGCAGATGGACAGAA
GAAGAAGATCAACTTTTGACCAAATACATTCATGCTAACGGTGAAGGCTCATGGAGGTCA
CTACCAAAAAATGCAGGTACCAACTTTTTTATTGATTGATAAGATGCTTCAAACCTGTTT
TTCTTTAAATGGGGTGTCTCCTTTTCTTTTTCTTTATGTTTACTAAATAAGTTTCTAGAC
TGATCATAAAAAATATTGAGAGATTTTTATTGGTTTTGAATTGAAGGTCTCTTAAGGTGT
GGCAAAAGTTGTAGACTGAGATGGATCAACTACTTGAGAGCTGACCTAAAGAGAGGAAAC
ATCACCACTGAAGAAGAGGATACCATTGTTAAGTTGCATTCTGCTTTGGGTAACAGGTAT
GTTTAATATTACTTTAATTCGTGAGGATACCATTGTTAAGTTGCATTCTGCTTTGGGTAA
CAGGTAGGTTTAATTACTTTAATTCGTTCTAGACAATTGTTTTTTTGGTTCCATTGAAAT
CCATATGCATGCGTATATAATATATATAATCACTTAAGGTAAATATGTATAACTTGAAAA
TTGTACACTTGGGAAAAATGTTATATATTTCTTCGATTGTTGATCAACATCAAATCATAG
TACCTCTTTTCTACTTATCGACCATCAAGTTAAATAAGATTTGTGTGAGAGTTTGATGGC
ATACATTCAACTACAAGTGCTGGAATGGTTTGATTAATTTAATTTGTTCCCCTTTTCTCC
AACTCAATTATTTACTTTTAGATATGTACATACAGCTCATTAGATCCGGGAAATCTTTAA
ATTAGCATATATATGTATTCTAATTTTTAAATTATTAGAACCATTAATCTCGATCATTTA
TTACATTTGAATTAAATATGAAAGATAAATGCTTTTAGAAAAGAGAATATCACGAATGAC
TAAGATTACTAATCTTAACAATTTAAAATTTATGATGCACTGACCCCATGTATATGTGTA
TGTTTATTGATTGATATTTAATGTTGCAGGTGGTCTTTGATAGCTGCACAATTACCAGGA
AGGACAGATAATGAGATAAAGAACTACTGGAACTCTCATTTGAGCAGGAAAATTTGCAGC
TTCACTAAGCCATCAAAAAGTAATGATAATTCCGCTTCCGCTTCCATTACACCTTGCAGC
AGCGACATCAACAACACTATCAAGCTAGCTGAATCTGCATGCAAGCCGACGGATCCCCGA
AACCGGACCCGAACTGGCGGATCATCATCTAAAACCAACAAGAAGTCAGTACGATCACCT
AAAAGTGGCACCATAAATCAGGTACTTGATCATCAACCAACTACCAAAGAAAAAGCAACC
CAAGTTGCAAATATTAATGCTAGTACTACTGTAGTGGGACAAACTGAGATGGGGGACCCT
AAAAGTAGCGCAGAGAATGGTTTGCATGGCTCTTGCATGGACTGTGCTGGAGTTATTAGG
GTTTTGGGTGAGTGTAAAGAGAGAGAAAGTGAAGCAAGTAGTAGTATTAGTACTACTACT
AGTAATAATAATAATAACGTTAAAGTTGGTGGTGGAGAGGAGACAAAAAGTGAGGTTTTG
GGACCAAATGAGTGGTTAGATAGTGAAATAAAGAGGCTTCATAATACACTAATTCAAGGA
GATCACCAAGCTGTTGAGGTGGTGGATACTCATACAAGTGGGAATAATGATCAAACCCTT
GTTAATCATCATAAACAGAAGATAACTGCAAGTGGGGTGTTGTGTATTGATGGTGAGGAG
AGACAAGGAGGGGTCAATGACCGTGACAATGATGATGACAAAATGATGGTGAACGAAAGT
GAGGATATGAGAGAGAGCTCAAACTATGTTGTTACAGCAAAGAGTTCATGGTTTGATAAT
GAGGAATATGAGGTTGATTGGGATCAAGATTGGGCAGATGGTATTGGTGTTGAAAATAAT
AATAATAATACTAGTGAATGGGAACTATGGGATGATAAAGAAGGAGACAAGTTGTTGTAT
TGGTTATGGGATGGTGGAGTAGAAGATAATTAAGATATTTATTTATGTTGCTTAATAAGC
ATATGTTAATATTTGATTTCAATTACCAGTTGATGAGCTTGTGGAATTGTTAATTAGATT
GATGATAACTGCTTGCTGCTTTAAGAGTTGTGAGATGCACAAAGCTTTAATATTTACTTG
TAAAGTTGTAAGTTTGTAGAATGGTGTACTTATATTTATTGATATCCCAACA