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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI014405 | Chr1 | 1599787 | 1602178 | + | Transcription factor MYB12 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI014405.m1 | 14 | 61 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 50.7 | 1.70E-13 |
LITCHI014405.m1 | 17 | 75 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 36.2 | 5.70E-09 |
LITCHI014405.m1 | 67 | 112 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 49.7 | 3.30E-13 |
LITCHI014405.m1 | 71 | 124 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 35.2 | 1.20E-08 |
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>LITCHI014405.m1 ATGGGGAGAGCACCATGTTGTGAGAAGGTGGGCTTGAAGAGAGGCAGATGGACAGAAGAA GAAGATCAACTTTTGACCAAATACATTCATGCTAACGGTGAAGGCTCATGGAGGTCACTA CCAAAAAATGCAGGTCTCTTAAGGTGTGGCAAAAGTTGTAGACTGAGATGGATCAACTAC TTGAGAGCTGACCTAAAGAGAGGAAACATCACCACTGAAGAAGAGGATACCATTGTTAAG TTGCATTCTGCTTTGGGTAACAGGTGGTCTTTGATAGCTGCACAATTACCAGGAAGGACA GATAATGAGATAAAGAACTACTGGAACTCTCATTTGAGCAGGAAAATTTGCAGCTTCACT AAGCCATCAAAAAGTAATGATAATTCCGCTTCCGCTTCCATTACACCTTGCAGCAGCGAC ATCAACAACACTATCAAGCTAGCTGAATCTGCATGCAAGCCGACGGATCCCCGAAACCGG ACCCGAACTGGCGGATCATCATCTAAAACCAACAAGAAGTCAGTACGATCACCTAAAAGT GGCACCATAAATCAGGTACTTGATCATCAACCAACTACCAAAGAAAAAGCAACCCAAGTT GCAAATATTAATGCTAGTACTACTGTAGTGGGACAAACTGAGATGGGGGACCCTAAAAGT AGCGCAGAGAATGGTTTGCATGGCTCTTGCATGGACTGTGCTGGAGTTATTAGGGTTTTG GGTGAGTGTAAAGAGAGAGAAAGTGAAGCAAGTAGTAGTATTAGTACTACTACTAGTAAT AATAATAATAACGTTAAAGTTGGTGGTGGAGAGGAGACAAAAAGTGAGGTTTTGGGACCA AATGAGTGGTTAGATAGTGAAATAAAGAGGCTTCATAATACACTAATTCAAGGAGATCAC CAAGCTGTTGAGGTGGTGGATACTCATACAAGTGGGAATAATGATCAAACCCTTGTTAAT CATCATAAACAGAAGATAACTGCAAGTGGGGTGTTGTGTATTGATGGTGAGGAGAGACAA GGAGGGGTCAATGACCGTGACAATGATGATGACAAAATGATGGTGAACGAAAGTGAGGAT ATGAGAGAGAGCTCAAACTATGTTGTTACAGCAAAGAGTTCATGGTTTGATAATGAGGAA TATGAGGTTGATTGGGATCAAGATTGGGCAGATGGTATTGGTGTTGAAAATAATAATAAT AATACTAGTGAATGGGAACTATGGGATGATAAAGAAGGAGACAAGTTGTTGTATTGGTTA TGGGATGGTGGAGTAGAAGATAATTAA
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>LITCHI014405.m1 TCATCTCCTAGGCTACTATAATTAATTGTGCAAGACAACCTTTATACGACTGCAACCTCT CCTCTTCTCTCGCTCTCTTTGTAGGTTGGTGTGCTCTATAGTACAAAATCTCATAGAGAG ACCATGGGGAGAGCACCATGTTGTGAGAAGGTGGGCTTGAAGAGAGGCAGATGGACAGAA GAAGAAGATCAACTTTTGACCAAATACATTCATGCTAACGGTGAAGGCTCATGGAGGTCA CTACCAAAAAATGCAGGTCTCTTAAGGTGTGGCAAAAGTTGTAGACTGAGATGGATCAAC TACTTGAGAGCTGACCTAAAGAGAGGAAACATCACCACTGAAGAAGAGGATACCATTGTT AAGTTGCATTCTGCTTTGGGTAACAGGTGGTCTTTGATAGCTGCACAATTACCAGGAAGG ACAGATAATGAGATAAAGAACTACTGGAACTCTCATTTGAGCAGGAAAATTTGCAGCTTC ACTAAGCCATCAAAAAGTAATGATAATTCCGCTTCCGCTTCCATTACACCTTGCAGCAGC GACATCAACAACACTATCAAGCTAGCTGAATCTGCATGCAAGCCGACGGATCCCCGAAAC CGGACCCGAACTGGCGGATCATCATCTAAAACCAACAAGAAGTCAGTACGATCACCTAAA AGTGGCACCATAAATCAGGTACTTGATCATCAACCAACTACCAAAGAAAAAGCAACCCAA GTTGCAAATATTAATGCTAGTACTACTGTAGTGGGACAAACTGAGATGGGGGACCCTAAA AGTAGCGCAGAGAATGGTTTGCATGGCTCTTGCATGGACTGTGCTGGAGTTATTAGGGTT TTGGGTGAGTGTAAAGAGAGAGAAAGTGAAGCAAGTAGTAGTATTAGTACTACTACTAGT AATAATAATAATAACGTTAAAGTTGGTGGTGGAGAGGAGACAAAAAGTGAGGTTTTGGGA CCAAATGAGTGGTTAGATAGTGAAATAAAGAGGCTTCATAATACACTAATTCAAGGAGAT CACCAAGCTGTTGAGGTGGTGGATACTCATACAAGTGGGAATAATGATCAAACCCTTGTT AATCATCATAAACAGAAGATAACTGCAAGTGGGGTGTTGTGTATTGATGGTGAGGAGAGA CAAGGAGGGGTCAATGACCGTGACAATGATGATGACAAAATGATGGTGAACGAAAGTGAG GATATGAGAGAGAGCTCAAACTATGTTGTTACAGCAAAGAGTTCATGGTTTGATAATGAG GAATATGAGGTTGATTGGGATCAAGATTGGGCAGATGGTATTGGTGTTGAAAATAATAAT AATAATACTAGTGAATGGGAACTATGGGATGATAAAGAAGGAGACAAGTTGTTGTATTGG TTATGGGATGGTGGAGTAGAAGATAATTAAGATATTTATTTATGTTGCTTAATAAGCATA TGTTAATATTTGATTTCAATTACCAGTTGATGAGCTTGTGGAATTGTTAATTAGATTGAT GATAACTGCTTGCTGCTTTAAGAGTTGTGAGATGCACAAAGCTTTAATATTTACTTGTAA AGTTGTAAGTTTGTAGAATGGTGTACTTATATTTATTGATATCCCAACA
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>LITCHI014405.m1 + Up_Stream_Len 2000 AACACATAGATAGTTGGCGGGCTTGAATATGTTGTCATGATCAGGGGACAAGAGGACTAT CAACAGCACTACATGTAACACACTTGTGTCTTACATTTAATGAATAAAGTCGAACAACTG AGGATCAACCTAATTAGAATCGAAGATCCTCATTAGTTTCTAATTTTTGTAATACAAATT TATAGTCCATGCCAAATTTAGGTACCATTTGACATCAAGGTCCGTAGAATAACTAGTATA TAATTGTTTGTTCAATGGAAGTGTATTAGTAAATGAGTTTCCCCAACCCCACCCCCCTTT TTTATACTAAAAGATGTATAAATTTTCAAATCAATATCACAATGAAATGATCGAAAAGAT TATAATACGCGTCTTTCGTTTGTGAATATTATCAATATTAAAAAGAGACTTATTTAGTTC TCTTAATTTTTTGTCATTAACTTAAAATCCAACATTTTTTTTTAATTACTTCATGATATT TCCTCTATGATAAATCCTCTTTACATGTATTAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAG GTGTTATGATAATATGACTTGAATGTTAATCAAAGTACTTCTTCAAACTTCTATTGGAGT GGGGTCAATTCACCAACTTTTAAATCGCTTTCAGACTGTCTATTTTCGCATTCACAGAGT ACAGACTGCATTGCAGACACCCAAGTGGGTACAAGAAGTAATTGTATTGCCGTAAACTTG ACCAACAGTGGACATAAATAATAGAGCAAATTAAGGTTTTTTTAAACAAAAGGTTCCTAT TAATGTGCGAAAAAAATAATAATAATAAGAAATGTCAAATATTATTAGAGGTTATCTTAA AAGAATAAGTAAAAATATTTTATTTATCTTTTTTCATAATTTAAAATAAGATCATCGTTC AGTGGTAGAAGAATATATCATTCAATATTTGAGTGAATACTCACTCCTTGAACCACATTT ATGATTGAGGTTTAAGTCACAAGTTGTACTTTTACTATATATGTGTGAACTGTTATTTAT ATTTACAGTACTGAGTTTATTTAAGTTTAATAGATTTTTTTTTAATGATAGATTTTAGTA AAGTTTATAGATTCTATCAAAGTCATATTAATTTTGTTAGAATTCTTTAAAAAAATATAA TAAAATCTTGATGAGAATTGTAAGATCTATTATAAATTTTTTTCTTCATAAAAATCACTT TAAATTTCATTCAAGTCCATCTAAATCTATCGTCAAAATAAAATCTGTGAAATCAATTAT TTTTTTAATATACTTTAATTTTATTGGATTCATACAAACTAAAATTGAATACACCTAAAT TTTATTAGATTTTATACAAATATTAATTGAATACACTTATGTTTTCTGGATTTCATATAA ATTTGAATTGAATACACTAAACTATATTTGGAACATGAGATTTGAGGTGGGTTTGAGATT CAAAATATCTTAAACTCTCAAATCTCATGTTTGGAGAGTAATTGGTAGGATTCCAAACCT AATCCCAAACTCTCTCAAATCCTCCTCTTATGAGAATGCTCATTCACGACCAAAATGATG AGATTTGATGGGTTTGAGAATGAGTATATCATCTTTACTTTATTTTTTTTCAAATTTTTA AAGAATTTTTTTAAAATTAATTTTAAGTATATTATAAAATATTTAAATTAATTTTATTTC AATATAATCTCATATTATACCAAACATAATATAGTATAATTCTAATCCTATCTCAAGTCT ACCAAATATGGGACAATAATTCGTCAATGCAATATATTTTATTTCAATCTGATCCAATTC ATTTCATTCTCATCCCATGTTACCAAAGTAGCCTAAGCTCCTATACGGCAAATTGTGCTA TAGATTCTACATTCACATCATCTCCTAGGCTACTATAATTAATTGTGCAAGACAACCTTT ATACGACTGCAACCTCTCCTCTTCTCTCGCTCTCTTTGTAGGTTGGTGTGCTCTATAGTA CAAAATCTCATAGAGAGACC
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>LITCHI014405.m1 GenomeSequence + TCATCTCCTAGGCTACTATAATTAATTGTGCAAGACAACCTTTATACGACTGCAACCTCT CCTCTTCTCTCGCTCTCTTTGTAGGTTGGTGTGCTCTATAGTACAAAATCTCATAGAGAG ACCATGGGGAGAGCACCATGTTGTGAGAAGGTGGGCTTGAAGAGAGGCAGATGGACAGAA GAAGAAGATCAACTTTTGACCAAATACATTCATGCTAACGGTGAAGGCTCATGGAGGTCA CTACCAAAAAATGCAGGTACCAACTTTTTTATTGATTGATAAGATGCTTCAAACCTGTTT TTCTTTAAATGGGGTGTCTCCTTTTCTTTTTCTTTATGTTTACTAAATAAGTTTCTAGAC TGATCATAAAAAATATTGAGAGATTTTTATTGGTTTTGAATTGAAGGTCTCTTAAGGTGT GGCAAAAGTTGTAGACTGAGATGGATCAACTACTTGAGAGCTGACCTAAAGAGAGGAAAC ATCACCACTGAAGAAGAGGATACCATTGTTAAGTTGCATTCTGCTTTGGGTAACAGGTAT GTTTAATATTACTTTAATTCGTGAGGATACCATTGTTAAGTTGCATTCTGCTTTGGGTAA CAGGTAGGTTTAATTACTTTAATTCGTTCTAGACAATTGTTTTTTTGGTTCCATTGAAAT CCATATGCATGCGTATATAATATATATAATCACTTAAGGTAAATATGTATAACTTGAAAA TTGTACACTTGGGAAAAATGTTATATATTTCTTCGATTGTTGATCAACATCAAATCATAG TACCTCTTTTCTACTTATCGACCATCAAGTTAAATAAGATTTGTGTGAGAGTTTGATGGC ATACATTCAACTACAAGTGCTGGAATGGTTTGATTAATTTAATTTGTTCCCCTTTTCTCC AACTCAATTATTTACTTTTAGATATGTACATACAGCTCATTAGATCCGGGAAATCTTTAA ATTAGCATATATATGTATTCTAATTTTTAAATTATTAGAACCATTAATCTCGATCATTTA TTACATTTGAATTAAATATGAAAGATAAATGCTTTTAGAAAAGAGAATATCACGAATGAC TAAGATTACTAATCTTAACAATTTAAAATTTATGATGCACTGACCCCATGTATATGTGTA TGTTTATTGATTGATATTTAATGTTGCAGGTGGTCTTTGATAGCTGCACAATTACCAGGA AGGACAGATAATGAGATAAAGAACTACTGGAACTCTCATTTGAGCAGGAAAATTTGCAGC TTCACTAAGCCATCAAAAAGTAATGATAATTCCGCTTCCGCTTCCATTACACCTTGCAGC AGCGACATCAACAACACTATCAAGCTAGCTGAATCTGCATGCAAGCCGACGGATCCCCGA AACCGGACCCGAACTGGCGGATCATCATCTAAAACCAACAAGAAGTCAGTACGATCACCT AAAAGTGGCACCATAAATCAGGTACTTGATCATCAACCAACTACCAAAGAAAAAGCAACC CAAGTTGCAAATATTAATGCTAGTACTACTGTAGTGGGACAAACTGAGATGGGGGACCCT AAAAGTAGCGCAGAGAATGGTTTGCATGGCTCTTGCATGGACTGTGCTGGAGTTATTAGG GTTTTGGGTGAGTGTAAAGAGAGAGAAAGTGAAGCAAGTAGTAGTATTAGTACTACTACT AGTAATAATAATAATAACGTTAAAGTTGGTGGTGGAGAGGAGACAAAAAGTGAGGTTTTG GGACCAAATGAGTGGTTAGATAGTGAAATAAAGAGGCTTCATAATACACTAATTCAAGGA GATCACCAAGCTGTTGAGGTGGTGGATACTCATACAAGTGGGAATAATGATCAAACCCTT GTTAATCATCATAAACAGAAGATAACTGCAAGTGGGGTGTTGTGTATTGATGGTGAGGAG AGACAAGGAGGGGTCAATGACCGTGACAATGATGATGACAAAATGATGGTGAACGAAAGT GAGGATATGAGAGAGAGCTCAAACTATGTTGTTACAGCAAAGAGTTCATGGTTTGATAAT GAGGAATATGAGGTTGATTGGGATCAAGATTGGGCAGATGGTATTGGTGTTGAAAATAAT AATAATAATACTAGTGAATGGGAACTATGGGATGATAAAGAAGGAGACAAGTTGTTGTAT TGGTTATGGGATGGTGGAGTAGAAGATAATTAAGATATTTATTTATGTTGCTTAATAAGC ATATGTTAATATTTGATTTCAATTACCAGTTGATGAGCTTGTGGAATTGTTAATTAGATT GATGATAACTGCTTGCTGCTTTAAGAGTTGTGAGATGCACAAAGCTTTAATATTTACTTG TAAAGTTGTAAGTTTGTAGAATGGTGTACTTATATTTATTGATATCCCAACA