Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI014298Chr1766427768730-Transcription factor MYB108

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI014298.m12774PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain571.70E-15
LITCHI014298.m13088PF13921.9Myb_DNA-bind_6Domain50.32.30E-13
LITCHI014298.m180123PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain54.11.40E-14
LITCHI014298.m184126PF13921.9Myb_DNA-bind_6Domain26.27.50E-06
Download   Copy
>LITCHI014298.m1
ATGGAAGTCAAAGGAAGGATTGTTACTGCTACTGCTCCAAATAGTTGTCCAACCGAAGAA
GACAACACGGACTTGAGGAGGGGTCCATGGACAGTTGAAGAAGATTTCAAGCTCATCAAT
TACATTGCCAACCATGGCGAGGGTCGCTGGAACTCCCTTTCACGTTGTGCAGGTCTCAAA
CGAACTGGGAAGAGTTGTAGACTGAGATGGCTCAACTATCTCCGCCCGGATGTTCGACGT
GGAAACATCACACTCGAAGAACAACTTCTGATTCTCGAGCTCCACTCTCGTTGGGGAAAC
AGATGGTCAAAAATCGCTCAACACTTGCCGGGAAGAACCGACAATGAAATCAAGAACTAT
TGGAGAACAAGGGTCCAAAAACATGCCAAGCAACTGAAATGTGACGTGAACAGCAAGCAA
TTTAAGGACGCCATGCGTTATCTATGGATGCCAAGATTGGTAGAAAGAATCCAAGCTGCT
AATGCTGCCACCACCACCGCCACTGCCGTCTCCGGTGGCTTCACCACCGCCACAGCCTCG
ACGACCAACATGGTCAACATACCATCTATGGCAAACATTGGTTACAATGACTTCAATGCA
AGTAAAGTTACAAGCAGTTATACTCCGGAGAATTCAAGCACAGCAGCTTCTTCGGACTCG
TTCGGAACTCAGGTTTCTCCGGTTTCCGACCTGACGGATTATTACAATATTCCGGTTAAC
AACAACAGCAATAACAACCCTAATCCGGATTATTTCCAATCCGGACAACTTGGTAACTAT
TCGGAGACCTCCTTGATCAGTACCACTCCCGCAGCTTACTTCAATCCCGAGATGGATTTC
CAGGCTCTCGAGCAAAACAATCAGTTGATGGACTGTGGAGATGCATCCGACAATTTGTGG
AACGTTGAAGATATTTGGTTCTTGCAGCAGCAATTCAGCAACATGTGA
Download   Copy
>LITCHI014298.m1
MEVKGRIVTATAPNSCPTEEDNTDLRRGPWTVEEDFKLINYIANHGEGRWNSLSRCAGLK
RTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLEEQLLILELHSRWGNRWSKIAQHLPGRTDNEIKNY
WRTRVQKHAKQLKCDVNSKQFKDAMRYLWMPRLVERIQAANAATTTATAVSGGFTTATAS
TTNMVNIPSMANIGYNDFNASKVTSSYTPENSSTAASSDSFGTQVSPVSDLTDYYNIPVN
NNSNNNPNPDYFQSGQLGNYSETSLISTTPAAYFNPEMDFQALEQNNQLMDCGDASDNLW
NVEDIWFLQQQFSNM.
Download   Copy
>LITCHI014298.m1
GCCGTATTTTTCTTCTTTTCTCTTTCTATCTCTCTCTCCCCATATTCAAACCTATCCATC
CATCTATAAAAACCCCACACACCCTTTTCCATCTTCCCTGTATTGATCCAAAAACCACCC
TTCTCTTTCTCTCTCTTTCCCGGGAAACTTCTGCTTTTTTCTTCTGTTTCCAATCAATCA
GTCTGCCCATTAAAGGAAAAGCCACAATGGAAGTCAAAGGAAGGATTGTTACTGCTACTG
CTCCAAATAGTTGTCCAACCGAAGAAGACAACACGGACTTGAGGAGGGGTCCATGGACAG
TTGAAGAAGATTTCAAGCTCATCAATTACATTGCCAACCATGGCGAGGGTCGCTGGAACT
CCCTTTCACGTTGTGCAGGTCTCAAACGAACTGGGAAGAGTTGTAGACTGAGATGGCTCA
ACTATCTCCGCCCGGATGTTCGACGTGGAAACATCACACTCGAAGAACAACTTCTGATTC
TCGAGCTCCACTCTCGTTGGGGAAACAGATGGTCAAAAATCGCTCAACACTTGCCGGGAA
GAACCGACAATGAAATCAAGAACTATTGGAGAACAAGGGTCCAAAAACATGCCAAGCAAC
TGAAATGTGACGTGAACAGCAAGCAATTTAAGGACGCCATGCGTTATCTATGGATGCCAA
GATTGGTAGAAAGAATCCAAGCTGCTAATGCTGCCACCACCACCGCCACTGCCGTCTCCG
GTGGCTTCACCACCGCCACAGCCTCGACGACCAACATGGTCAACATACCATCTATGGCAA
ACATTGGTTACAATGACTTCAATGCAAGTAAAGTTACAAGCAGTTATACTCCGGAGAATT
CAAGCACAGCAGCTTCTTCGGACTCGTTCGGAACTCAGGTTTCTCCGGTTTCCGACCTGA
CGGATTATTACAATATTCCGGTTAACAACAACAGCAATAACAACCCTAATCCGGATTATT
TCCAATCCGGACAACTTGGTAACTATTCGGAGACCTCCTTGATCAGTACCACTCCCGCAG
CTTACTTCAATCCCGAGATGGATTTCCAGGCTCTCGAGCAAAACAATCAGTTGATGGACT
GTGGAGATGCATCCGACAATTTGTGGAACGTTGAAGATATTTGGTTCTTGCAGCAGCAAT
TCAGCAACATGTGAGAAAAAAGAAAACAGAGAGACCAAAAAAAAATTTAATAATAATAAT
GGGCGGGGGTGTAAGTGAAATTACAATGAATGTAGAGAATGATTTTTAAATATAGAGAAT
TACTGGGGTCACAGTTATGAAATATAATAATTTAGGATACATAGACAGATCAAGTCTAAT
TGTGGATTATTATTAATCTTCCATTTTTATTCTGTAATTTTCTTTTGGGTGGGGGTACAT
TTGTAATTTGAGTTTTTCTTAATTAATCTCATTCTTTGATATATTATTGATATTGATGGT
TTTTTTAAAAATAAAAATAAAAATAAATCCTCAATTTTATTATACAATACCCGGTATGTC
AAAATTTTGACATGAATTTCGATGATTTGATTGTATTATAGAAAC
Download   Copy
>LITCHI014298.m1 -  Up_Stream_Len 2000
ACTAGGTAGCTTGATTGATGAAAGATTTCACAGTTATAAAAATTATTCTACAATCGTATC
TTATTTATAAATCTAAAATGTTTAATTGATGTTTGAGTTATATTTTTATATAATTTTAAA
AAAATTATAAAATAATATAATTAGAATTGACGAAGCTTAGCCATTTGCTATCGTTTACTC
GGATGTTGCAACCAATTATTATATAAATTATTTATATTGATAATATTACGGGAAACAAAG
TTTGTTCAAAGATCTAGTTTAACTAAATGGCTTCAATTTGAATAGCTATGATCAATTAAG
ATGCTTTCATTTGAGCCAAAAATAGCAAACTAAAAATAGAACCGGAGGGGAGGGTTAGGG
TTTTTGAATCGAGTAGGGTGGTACTTATAGTGATCCTTTAGAGTCGGCAATGCTAAATTA
ATACGGAATCTTCTTCTTCTTCTAATTCGTTTAAATAATAATAATTTATTTTTTATATTT
TAAAATTATGTTTCAAAAATTGAAATAATACTTTTTTAGTTAAGAAGTTGTGGAAACTGT
GGTTGACATAATATTTTAAAACAATTAATTTCCTTTAAAAATTATCATGTATATTTTATC
AAACAAAAAAAATCCATTAAATTTGTGCTCCAAAAAAATTATTTTTTGAAAAATAAATTG
CTTTCAAGATCAAAGTTGTAAAATCTAAACATATTTTTAAAAAATAATTGCATGCTATTG
AAAAATATACAAAAATCTCCTCATATGAAGTTATACATATATAGTTTACATACAACAAAA
ACAAATTCGAACACGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGACTTTTATGTATATTCCATAC
CATATAAATTGTACCAAAACAAATACTGTTTTACATCCTCAAATTGAGTCAAATTTGTTT
GTACCTTGATCTTTAATGTTTTGAAATCGACACTCATTGATTAAGGGTCCATCAAAACAT
GTTGAAATTAGATACTAACAATCTAAATATTTTACTATGGAGGCACCTACTTTTAAAATA
CAAAGAGTAATATATTCTATTAATAAATAGGGACGGTGAGGCTTTAAAGTAGAATGTCTA
AGTGGTACACTCTCGCCCAGCTTGCTTGTTAATAAACAAGAGGATTGGGTTTGAGCATCT
TTATCTACAAAATAGATCATTTTTAAATAGCCTATAAGCGTTAATATGTGGACAATCTAC
TAAAAAATCCAACTAATTTGTTGTCAATTTTCCTTTTATATATGGATAGTTAGTTCCCTC
TTTCATCTATTAGGGAACAATAATAATTCAGATTGCACCTCAGGGGTTTAGATTACGAGA
CCTCAGTAATTGTAATGAGTATTTATACAATTAAAAAAAATGAAAGAAGAGAAAAAAAAA
AGAAAAAAAAAAAAAGAAGGAAACGGTGAGATTGGTGAGACTAAAACCAAATAAGATGTA
ACCCTATTCAAATCATGAGGGAATGTTTAAATAAATTTAGTTTGTTTGTTTTATATGTTT
ATTTATTTATTTTGAAATTGTTTTATATGCTTATGTTTATTACAAATCGTTCCAAAAACA
AAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGAAACAAGAATTCCACTGAAATGATAAGCTCACCA
GCACTGCTGCACACACAGAGAGAGAAAGAGAAAGTCAAAGAGTCAAAACTTCAAAGCCCC
GTGTTTGTTAATTAACTAAAATCATATTACTAAACAAGTTTAACCCAACATAATTAATTT
AATCAAATTTTATTAAATTAATCAAACCCAAGTTCAAAACTGCGGCTCTCACATGCCGTA
TTTTTCTTCTTTTCTCTTTCTATCTCTCTCTCCCCATATTCAAACCTATCCATCCATCTA
TAAAAACCCCACACACCCTTTTCCATCTTCCCTGTATTGATCCAAAAACCACCCTTCTCT
TTCTCTCTCTTTCCCGGGAAACTTCTGCTTTTTTCTTCTGTTTCCAATCAATCAGTCTGC
CCATTAAAGGAAAAGCCACA
Download   Copy
>LITCHI014298.m1 GenomeSequence - 
GCCGTATTTTTCTTCTTTTCTCTTTCTATCTCTCTCTCCCCATATTCAAACCTATCCATC
CATCTATAAAAACCCCACACACCCTTTTCCATCTTCCCTGTATTGATCCAAAAACCACCC
TTCTCTTTCTCTCTCTTTCCCGGGAAACTTCTGCTTTTTTCTTCTGTTTCCAATCAATCA
GTCTGCCCATTAAAGGAAAAGCCACAATGGAAGTCAAAGGAAGGATTGTTACTGCTACTG
CTCCAAATAGTTGTCCAACCGAAGAAGACAACACGGACTTGAGGAGGGGTCCATGGACAG
TTGAAGAAGATTTCAAGCTCATCAATTACATTGCCAACCATGGCGAGGGTCGCTGGAACT
CCCTTTCACGTTGTGCAGGTAATTAAATTTTCTTGTTCTAGTCGAGGTTCATATTTTGAT
TTTATTTTTTTTAAAAGAAATTTAAAGTGTTGCCGTTGTCTTTATGTGGGGAAATTAAAA
CAACCATAGATAGAAGAAAACAAGAAGTTGACAAGTTTAATCAACTTGTTTATGTCATGT
GTCTATCTTCAATCTTCATTTCTGGTGCGAGCTAGCTAGACGTGATTGATTGAAAAACTG
GGCTCTTTTTTTTTTTCTCCTCCTATTTATAGTGATAATGATTGAACCTTCACGAGCACA
AACGAAAACCACCAAATATATTCTCTTTTTGTATATCTTTTATCTCTCTCCTTTTTCTCC
TAAAATTGTGATAAAATCAAAAAAGAAAATATATAGTTTTTGCATCATGAAGATGTTAGA
TATTATAGAGATGATAATGGTTCTTTCTTCCGTACAATACACAACATATGCTTTGTTTGG
CTTGAGTTAGATAGCCTACCTAAAAAGGTTTTTGTCAAAAGCTAACACAATTCATGAAAC
CGAAAAAAGCATACGAGTAATATTTTTTTCCCTTCTTTTTCTAAATTTTCCAATAATCAT
TTCAATATAACTTTACCAAAAACCAATTCAATGGAACAGGTCTCAAACGAACTGGGAAGA
GTTGTAGACTGAGATGGCTCAACTATCTCCGCCCGGATGTTCGACGTGGAAACATCACAC
TCGAAGAACAACTTCTGATTCTCGAGCTCCACTCTCGTTGGGGAAACAGGTAATTATTTG
ACGGTACCAAAAATATTAATTAATTCTACATAAAATATATATATAATAAGAAAACGTAAT
GAGTCTTTCTTGATAATCGATTTTATTAACAATCACGGGTTTATTTATTTTATTTTTTCC
CTATCAGATGGTCAAAAATCGCTCAACACTTGCCGGGAAGAACCGACAATGAAATCAAGA
ACTATTGGAGAACAAGGGTCCAAAAACATGCCAAGCAACTGAAATGTGACGTGAACAGCA
AGCAATTTAAGGACGCCATGCGTTATCTATGGATGCCAAGATTGGTAGAAAGAATCCAAG
CTGCTAATGCTGCCACCACCACCGCCACTGCCGTCTCCGGTGGCTTCACCACCGCCACAG
CCTCGACGACCAACATGGTCAACATACCATCTATGGCAAACATTGGTTACAATGACTTCA
ATGCAAGTAAAGTTACAAGCAGTTATACTCCGGAGAATTCAAGCACAGCAGCTTCTTCGG
ACTCGTTCGGAACTCAGGTTTCTCCGGTTTCCGACCTGACGGATTATTACAATATTCCGG
TTAACAACAACAGCAATAACAACCCTAATCCGGATTATTTCCAATCCGGACAACTTGGTA
ACTATTCGGAGACCTCCTTGATCAGTACCACTCCCGCAGCTTACTTCAATCCCGAGATGG
ATTTCCAGGCTCTCGAGCAAAACAATCAGTTGATGGACTGTGGAGATGCATCCGACAATT
TGTGGAACGTTGAAGATATTTGGTTCTTGCAGCAGCAATTCAGCAACATGTGAGAAAAAA
GAAAACAGAGAGACCAAAAAAAAATTTAATAATAATAATGGGCGGGGGTGTAAGTGAAAT
TACAATGAATGTAGAGAATGATTTTTAAATATAGAGAATTACTGGGGTCACAGTTATGAA
ATATAATAATTTAGGATACATAGACAGATCAAGTCTAATTGTGGATTATTATTAATCTTC
CATTTTTATTCTGTAATTTTCTTTTGGGTGGGGGTACATTTGTAATTTGAGTTTTTCTTA
ATTAATCTCATTCTTTGATATATTATTGATATTGATGGTTTTTTTAAAAATAAAAATAAA
AATAAATCCTCAATTTTATTATACAATACCCGGTATGTCAAAATTTTGACATGAATTTCG
ATGATTTGATTGTATTATAGAAAC