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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI014217 | Chr1 | 158832 | 160586 | - | Transcription factor HY5-like |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI014217.m1 | 98 | 157 | PF00170.24 | bZIP_1 | Coiled-coil | 44.5 | 1.30E-11 |
LITCHI014217.m1 | 99 | 148 | PF07716.18 | bZIP_2 | Coiled-coil | 34.6 | 1.60E-08 |
LITCHI014217.m2 | 98 | 156 | PF00170.24 | bZIP_1 | Coiled-coil | 45.6 | 6.20E-12 |
LITCHI014217.m2 | 99 | 148 | PF07716.18 | bZIP_2 | Coiled-coil | 34.8 | 1.40E-08 |
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>LITCHI014217.m1 ATGTCAATCACTGCGGGAGGCAGTAGAGATGGTAAATCCAACAACTCCATGGTGGAGGCT GAAGTTGAGGTTAGCTCTTCTTCACGAGGAACGTCCAACATTCATGATATCAACACCACC AATCTCATTTCACACTACAACCCCAGCAAACTTGAAGAAAGCGATGAAGATTTATTAACG GTTCCAGATGTCGAAGCAAGACCAGCCATGGATTCCACTAATAATAACAGTAACAATAAT ATAGATCAGAATCAAAACCAGAAGCGGCGCAGGGGTCGTAACCCTGTTGATAAGGAGTAT AGAAGGCTCAAGAGGTTGCTGAGGAATAGAGTGTCAGCTCAACAAGCCAGAGAAAGGAAG AAAGTGTATGTCAATGACCTGGAATCACGAGCCAAAGAATTGCAGGACCTTAACTCTAAA TTAGAGGAGAGAATTTCTACTATGATTAATGAAAACACCATGCTTCGCAAGGTACTTCTG AACACTAGGCCTAAAGTTGATGACACTACTGGTACCGAGCAAAAGCAGGATCAACTTGCC AAGAGCTGA >LITCHI014217.m2 ATGTCAATCACTGCGGGAGGCAGTAGAGATGGTAAATCCAACAACTCCATGGTGGAGGCT GAAGTTGAGGTTAGCTCTTCTTCACGAGGAACGTCCAACATTCATGATATCAACACCACC AATCTCATTTCACACTACAACCCCAGCAAACTTGAAGAAAGCGATGAAGATTTATTAACG GTTCCAGATGTCGAAGCAAGACCAGCCATGGATTCCACTAATAATAACAGTAACAATAAT ATAGATCAGAATCAAAACCAGAAGCGGCGCAGGGGTCGTAACCCTGTTGATAAGGAGTAT AGAAGGCTCAAGAGGTTGCTGAGGAATAGAGTGTCAGCTCAACAAGCCAGAGAAAGGAAG AAAGTGTATGTCAATGACCTGGAATCACGAGCCAAAGAATTGCAGGACCTTAACTCTAAA TTAGAGGAGAGAATTTCTACTATGATTAATGAAAACACCATGCTTCGCAAGGTTTATACA TATATGCATATATATTTCCTAATTTCTTAA >LITCHI014217.m3 ATGTCAATCACTGCGGGAGGCAGTAGAGATGGTAAATCCAACAACTCCATGGTGGAGGCT GAAGTTGAGGTTAGCTCTTCTTCACGAGGAACGTCCAACATTCATGATATCAACACCACC AATCTCATTTCACACTACAACCCCAGCAAACTTGAAGAAAGCGATGAAGATTTATTAACG GTTCCAGATGTCGAAGCAAGACCAGCCATGGATTCCACTAATAATAACAGTAACAATAAT ATAGATCAGAATCAAAACCAGAAGCGGCGCAGGGGTCGTAACCCTGTTGATAAGGAGTAT AGAAGGCTCAAGAGGTATCAAGAATATATTCATCAACTCGTCTGTGTATATATATTTAAA TTATTTATCAAGATATTCTGGTTGCATGCAGCTCCCATAAAATTTAAAATCGGTTGA
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