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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI013889 | Chr2 | 36553000 | 36554439 | - | Upstream activation factor subunit spp27 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI013889.m1 | 24 | 95 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 78.3 | 3.10E-22 |
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>LITCHI013889.m1 ATGTTGCCACAACGAGTGAAGAAGACGATTATAGACAATCCGAAGAAGCTTGCTAACTTG ATTGACCTTGTGAATTTGCCTTCAACGCTTAGAGAGTTTGTGGGTCAGTCTCAGACCTCT CGTTTAGGCTGTTTTATGCGTGTTTGGTCTTACATCAAGACCAACAATCTCCAGGATCCA AATAACAAGAATGTGGTTAATTGCGACAAAAAGTTGAAGAGTATTTTGATGGGCAAGCCC CAGGTTGAATTAGCGGACCTTCCTGCATTGATCAAACTGCATTTTCCCAAGGAGCCAAAG TAA
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>LITCHI013889.m1 - Up_Stream_Len 2000 GCACCAAAAAAAAACGTGTTATGCTTTTTTGGTTCGGCCCAGATGGGCCAGTACATGCTT ATTTAATTTAAACAGAAGCAAGGGTCCAGGAGGCCTAAAGATGGAACTAGAAGTTGCAAG CCCAACTCGTGAGGTCATCCGGGTCGCGAGCCAACGGCAGTTCTCAGAATGCCCCTTGTT CGTACCTTCAGCTCGGGGAGCTCGCGAGGTCGCGAGCTCGCATAGACCCCCAGATCGCTT TACCTCTCCTCTTGGCCACGTTAGCTCTCCTCCAGAATGCATCACCTGGTTGACCTGAAG GCTTCCTCAGGAGATATCATGTACAACAAGTTGTCAGAATTACCAACTCTCATGATTTTC CGTCGAAAACTGCCTACACAATTACCCAGAAGCATTTAATGAAGTGAAGACCTCTTCAGG TATAATTAATGCAGACTTGTGCAGGGAGGAAATCATCATTATCTTTACAATTAATGCAGC ATGGCAGTGTCAGGATTAGCTGAAACTAGCCGTTGTCAATAACTTGTATAACTTTCTTTT ATATTTTTTATTGTGATCTCCTCTTCTATAAAGATGTGAGACATTCTACTGTACAAAAAA GCTTAACATACAAAAGAACTGTCACTCTGCCGGAATTACTTCAGAGTGGCCGTGGACGTA GGTGCAATCACCGAACCACGTAAAAACCCTTGTGTTTCTTCTTTCTCTCTCTCTTTCCTT TAATTTCTTGCTGAACACCTTATTAAATCCGACCAACCACCAAGTCCGACATTCCTTCAC CTGGATTAATCACCACCTACCTTGAACTTCATTAATTGATCATTTACTATCCTTCAATCA GTACAATCAATAAATTAATTACCAAGTTCGCCGTCTGGACCCCAGAATCCCTGGTTGACC GTTTCCGAACGTCAACAAAACGTGTTAGTAATTTTTTCTTTTTATTCTTAGAATAATTGT TTTCTTATTACGAAAGTACTAATCGATCTTAGTAAATCTTAATAAAACTCTTATACATTA ATCATTTAACTTTAAAAAAAAAAAAAAAAACATAAAAGGGATTAATGCATTTTTTTCTTC ATATCTATAATCAAGTTGAGTCCTACCATATAAAAGAAATCGAATAAAGTTGTCCATTTT AACCAAAACAAAATTCTATCCGCATCTTTTCTTTAAAAAAAAAAATCTATCCACCTCTAT CAATAACGTTGGTGACAATAACAAAAATATATTTGGTGACTTCGCCTATTTTCAAAAATT ATGTTGACTAAACCAATAACTGAAATATCAAGGGACCTAACCAAATCTTATATATATATA TATATATTTTTGAAGTACAAAATCTTATATATTTATCTTTCTGCTGACTTCAAAATCGTG TCCAATCTCAATCAGACCGAAGAGTTGCAGGCATTTCTCTTTCAAAGTACGATTTTTGAA CTGTCTCAAGCTTTTATTTCTTCGCAATTGTAATTACCCACTTTTTATCTTTTAATTTTA CGGCTACTAGTGCTTGAAAATCGGATTCTACGGTGGTTTTATATATGTGTATATATTTAG AAATGCATGCCAGATGTTCGATAAAATGCCTCTTAGACTTTGTTGGGTTGTTGATGATTG CTCTGTGGAGTCAATTAAGTTAGTTTTGTTTGTAGTTTCAAGAACCCAATTCAATGTATT GTGAGAATGATGAAAAATTTAGACATTTTGTTCACTTATAAGCTGTGCATTGAACATTCT TGTAATGTCATTTTGATTGCTTTTTAAAGTTAATTTTGATGACTGAAAGTGGTTGTGAAG AAAGTTATTGTGGAAAGTGTAATGTAGCTGCATTTTTATCCTTTGGTTGGTGTTTATAGC TTGGAGGAGGTGACAGGAGGGAGTTTTGATATGAGTAGTTTTTAGAGACTTTAAGTAAGA GATGCATGATTATCAGGTTATGCATCCCGGTTTAACTTATTTATTATTGGTTTTTGAGGT ATAGAGACGGGGTTGTTATA
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>LITCHI013889.m1 GenomeSequence - AATCTATCCACCTCTATCAATAACGTTGGTGACAATAACAAAAATATATTTGGTGACTTC GCCTATTTTCAAAAATTATGTTGACTAAACCAATAACTGAAATATCAAGGGACCTAACCA AATCTTATATATATATATATATATTTTTGAAGTACAAAATCTTATATATTTATCTTTCTG CTGACTTCAAAATCGTGTCCAATCTCAATCAGACCGAAGAGTTGCAGGCATTTCTCTTTC AAAGTACGATTTTTGAACTGTCTCAAGCTTTTATTTCTTCGCAATTGTAATTACCCACTT TTTATCTTTTAATTTTACGGCTACTAGTGCTTGAAAATCGGATTCTACGGTGGTTTTATA TATGTGTATATATTTAGAAATGCATGCCAGATGTTCGATAAAATGCCTCTTAGACTTTGT TGGGTTGTTGATGATTGCTCTGTGGAGTCAATTAAGTTAGTTTTGTTTGTAGTTTCAAGA ACCCAATTCAATGTATTGTGAGAATGATGAAAAATTTAGACATTTTGTTCACTTATAAGC TGTGCATTGAACATTCTTGTAATGTCATTTTGATTGCTTTTTAAAGTTAATTTTGATGAC TGAAAGTGGTTGTGAAGAAAGTTATTGTGGAAAGTGTAATGTAGCTGCATTTTTATCCTT TGGTTGGTGTTTATAGCTTGGAGGAGGTGACAGGAGGGAGTTTTGATATGAGTAGTTTTT AGAGACTTTAAGTAAGAGATGCATGATTATCAGGTTATGCATCCCGGTTTAACTTATTTA TTATTGGTTTTTGAGGTATAGAGACGGGGTTGTTATAATGTTGCCACAACGAGTGAAGAA GACGATTATAGACAATCCGAAGAAGCTTGCTAACTTGATTGACCTTGTGAATTTGCCTTC AACGCTTAGAGAGTTTGTGGGTCAGTCTCAGACCTCTCGTTTAGGCTGTTTTATGCGTGT TTGGTCTTACATCAAGACCAACAATCTCCAGGTTGGTCATCTTTCTTGTCAATTTTGTGT TTTTATTTTTCATTCTTTCTATTAGAAGTGTGTCTTGCTATCAAAGAACCAGTGATTGTT TTCATAACTCAGAATTAGATCTTCAAGTTATCTGATGATAAGATGATTTAACTGATTTGG AGGAGTTAAAGTTGTTCTTAGTGCTTTTGATTTTAAGGAGCTAATGCTGGACTGCATGGT GCATTCTCTTTCCTTTTATATCTGTTTTAGTTTATAACTATGATGACTGGTTTTTGTGCT TTGATATCCTTATCTTCATTAACCCTGGCGCGTATATTTTTAATGAATTAGGATCCAAAT AACAAGAATGTGGTTAATTGCGACAAAAAGTTGAAGAGTATTTTGATGGGCAAGCCCCAG GTTGAATTAGCGGACCTTCCTGCATTGATCAAACTGCATTTTCCCAAGGAGCCAAAGTAA