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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI013852Chr236293678;3629442636298715+PHD finger protein At3g20280

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI013852.m1410458PF00628.32PHDDomain37.12.40E-09
LITCHI013852.m2263311PF00628.32PHDDomain37.41.90E-09
LITCHI013852.m3263311PF00628.32PHDDomain37.71.60E-09
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>LITCHI013852.m1
ATGGATCCTCCTCCAAACCCACCAGACCTTCCAACAACGATGACGGAAAACCCAGAAAAC
GCAGTCTCCGGCGAGAAGAGGGCGGCGGACAACGGAAATTTCAACGATTCAGAGAACAAC
AAGAGGCCGCGGAGGAGCGAAGGACGTGGGGTAGAGGCAGCGAGGAGGGTGGCGGAGATA
GTGCTGGTTTTGTCAGCGATGTGGAGGATGAGAGGGGGAGAGAGGGCGCCGACGGAGGCG
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GGGAGAGTCAAGGAGCAGAGGTTAGGGTTTCGTGGGCAGAGGTTGAGTATCAAGGAGAAG
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GGCTTCCCGGCTGTGTCGCCATCTGTTCATGTTTCTGCTGCTACTCCTACATCGTTACCA
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CAAGGAACGAATCTTGGTCAAGCTCCACAGATTGGCAACAATCACAGTGAAATTGCTAAA
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GAAACTATAGTTCTTTGTGATGCTTGTGAGAAAGGATTTCACTTGAAGTGTCTTCAATTG
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AAAATGCCTTCTAACACATCAATATTTCAGTCATCTTCAGAAAAGAAAGTAGGTGCAATA
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GAGACCTCATCGGTAACTCACCTGAATAACTCAACTTTGGGGGCCATTTCTGATTCTCCT
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GGATTGATTCGAGGTCTGTGTGAAGTTCTTCCGTCTGCCAAGTTTAGGGAAGAGAGTGAA
AGACGAAGTCAGTTAGGAGCTGAGGCTAATAAAGAAAGACGGCCAATGTTCTTATGCAAG
TATGTATCTTTATTTCATTCATTTCATACAAACTATCACTCTGACTAA
>LITCHI013852.m2
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ACAAATTTTGGCGCAGCAGCTGAAAACCGTGGCACACCACATACAGTTCGCATGTTTCCA
TCAGATAAAACAAGTCCTTCTCCTACTATATCCTCTGGTGGCTTCCCGGCTGTGTCGCCA
TCTGTTCATGTTTCTGCTGCTACTCCTACATCGTTACCACATCCATTGCCTAACAATGAA
GTAAGAGGGCCAACCGTTTCCACTGGGTTGCCCGGCAGCCATTTAGGAAGAGATTTGTCT
TCATTACCTCTGCCTAGGGTTGACAGAGGACCAATAAAATTGGATGGAGGAACAAATGCG
TCTTCTTATGTGTCACAAGTGAATTCTTCTATAAACCATCAGTTGGTGAATTCTTCATCA
AATCACCCATTGGTGAATGCTCCAACTTGGTCTGTACAAACTCATTCTGCCTCATCAGCT
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GCTATGGTCCGGACAGCTTCTCAAGCAGCTTCCCAGACCTTTAGACCATTCAGCACGCAA
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GCTCCACAGATTGGCAACAATCACAGTGAAATTGCTAAATATGTTCAGAGGGTATTGCAT
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ATATTTCAGTCATCTTCAGAAAAGAAAGTAGGTGCAATAGATTCAAAGATTAGTCAGCAG
AAGATAACAGAAAATGGCAGCTCTGCTGGCCCTGGTAATGTAATTATCAATGCCACTGAG
TTGGCATCTGATTCGAAAATTCAAAATGCAAAAGATCAGGAGACCTCATCGGTAACTCAC
CTGAATAACTCAACTTTGGGGGCCATTTCTGATTCTCCTTCTGTTGGTTTGTCCAGTGAA
AAATTAGCTCAGCCCAACCAATTGATTGAATCATCTGTGCATGAAGATAAAGAGGTGTCT
GAATCGAAACCACAACCTTCAGTAATTTCTGAGACAGTTAGTAATAATTCTGATGGTTCC
CAACCTTCACACAATACACTGGTTATCAACTCAGACCCACCAAGTAGTGCTGAAGTTTCA
TTACAGGATAGTCAAAAAAACAATTGTACAGTTAAGCAAGATGAGAAAAATGATGTGCAG
CCAGCTCATGTTGGAAGTTCTGGGTTGTCTGCTGTCTTACACAATGTGGAATGGAGAGGT
GACGTGCTTCAAATTGTGGACGGGAAAAAATTTTACCAGTCTTGTTGCATCAGTGGAGAC
ACATATAAACTGCTGGATAATGCTCTTTTGCAATTTAGCCCCGACAGATTGATACCATCT
AAGCTTCAGGCCATGTGGGAGGAAACTAGAACTGGGTCCAAGTGGGTTATGGTCAATAGA
TGTTTCTTTCCGGGTGACTTGCCCGAGGCTGTTGGCTGCCCATGCGCCCCTGAAAGCAGT
GAGCTCTATGAGTCAAACAATGAAAGCACTGTAATGGCTGGATTGATTCGAGGTCTGTGT
GAAGTTCTTCCGTCTGCCAAGTTTAGGGAAGAGAGTGAAAGACGAAGTCAGTTAGGAGCT
GAGGCTAATAAAGAAAGACGGCCAATGTTCTTATGCAAGTATGTATCTTTATTTCATTCA
TTTCATACAAACTATCACTCTGACTAA
>LITCHI013852.m3
ATGGAAGACTCCAAGAAATTTGCCACACAGCCTACTTCATATGCTTCTCATGGATTGCAA
ACAAATTTTGGCGCAGCAGCTGAAAACCGTGGCACACCACATACAGTTCGCATGTTTCCA
TCAGATAAAACAAGTCCTTCTCCTACTATATCCTCTGGTGGCTTCCCGGCTGTGTCGCCA
TCTGTTCATGTTTCTGCTGCTACTCCTACATCGTTACCACATCCATTGCCTAACAATGAA
GTAAGAGGGCCAACCGTTTCCACTGGGTTGCCCGGCAGCCATTTAGGAAGAGATTTGTCT
TCATTACCTCTGCCTAGGGTTGACAGAGGACCAATAAAATTGGATGGAGGAACAAATGCG
TCTTCTTATGTGTCACAAGTGAATTCTTCTATAAACCATCAGTTGGTGAATTCTTCATCA
AATCACCCATTGGTGAATGCTCCAACTTGGTCTGTACAAACTCATTCTGCCTCATCAGCT
AAAGCTGGTGCAGAAAACCGGTTTCCAAGTCAAAATCCTGCCAAAGTTGAGGGCACTGCT
GCTATGGTCCGGACAGCTTCTCAAGCAGCTTCCCAGACCTTTAGACCATTCAGCACGCAA
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GCTCCACAGATTGGCAACAATCACAGTGAAATTGCTAAATATGTTCAGAGGGTATTGCAT
CCAAAGCTTCCTGAGCATCCCACATGGACCCCTCCTTCAAGGGAATATATGAATAAGGCA
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GCTTGTGAGAAAGGATTTCACTTGAAGTGTCTTCAATTGAATAATCAGAAAGGTATTCCT
AGAAGTGGTGAGTGGCACTGCATTAGTTGCTTGAAGTTAAGTGGTGGAAAACCTCTACCT
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AAGCTTCAGGCAAGAACAGGATCAAGATTCCCTGAATTTCTATACCTGTAA
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>LITCHI014371.m1
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SSSSSNKHNKNKKGVCSLFTYLMAEDPLCRIRFYPVHVMLVAELRENGELVGVVRGCIKC
VGTKFGETYLKLGCILGLRVSPSHRRMGIGFSLVKSIEEWMMRNGAHYTFLATEKNNVAS
TNLFTTKCNYMHFGSLVIFVQPIRFPLKSLSQDIKIEKLHIDQAISLYNNRLRRKDIYPT
DIDSILKDKLSLGTWVSYFKEEEWFELKNDEDFVTKTPSSWVVFSVWNSCEAYKIHIRKS
KSHPLKFVHATLCHAMEKIFPCLKMPISCGSLANPFGFLFLFGLYGEGQRLGELMRSVLS
FASRLAGNVKHCKVIMTELGVTDPLIGHVPQEPSISCIDDLWYLKKMNGYLAGDPHHHHD
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>LITCHI014371.m1
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AGATCATAGAGAACAACAAGCAAGACCAGGAGCAACAGCTTGTCGTGATAAGGGAATTCA
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GTAGTAATAAACATAATAAAAATAAAAAAGGGGTCTGCTCTTTATTCACATACTTGATGG
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AGTTTGGAGAAACTTATCTCAAGTTGGGTTGCATTTTAGGCCTTCGAGTCTCTCCTTCAC
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CCTTGAAGTTTGTACATGCAACTTTGTGCCATGCAATGGAGAAGATTTTCCCTTGTCTTA
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TCTATGGTGAGGGACAGAGGCTTGGAGAGCTCATGAGGTCTGTTTTGAGCTTTGCTTCAA
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TGATGATGATGATGATGGGGCAAATAGGGAATGTTTTTGTTGATCCAAGAGACTTCTAGC
TAGCTAGGGCTACAAACTCTCTAAGAAATTGAAAATGTAATTTATCATAATATAAACTAG
ATATTTGTATGTATCTGCAAATTTTCAGCGGTGGC
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>LITCHI014371.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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ATTTAAAACAGGCAAATCAAATGATTGATACATTACATATTTTTTGCTTGTCTACATAGT
GCTTGGTGTGGCCAAGGCCAACCCTCTTCACATGCTTTACCTGGGCTAAAAAGTGGTTCT
TTCGGGACATCAAAGATGTGTGTTTATCAGAGAATATTGCAGCAAAAACAACAAACGAAT
AACAACACTTGAACGGCTCAGAATATTGCACTAAGACTGGACACAGACTCTCCCCGAGAT
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TGCCAGTTGGGTTTTGCTATGGTTCGATTACGAGATATGTGACTTCAGCATAAAATCGAA
TCTATATAGTTAATATTACTTTCTAGGTACAAATATATGTAAACGTCAAAATAATATAAT
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CTATATATATATATATATATATCCTTTTAGCTCTATAGAAAGATTTGTTTAGGGTTTGAT
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TAAAATCTCATTCATTAACGATGCAAAAATGACAAAATTTCAAAGAACCAATAACATAAA
TGAAAGAGCATTCGAAAATGAATTAAAAATATATATATATATTCATTATAAGTTTAATTA
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AGTAGATTTTCTATTATCTTATAATTATATAAAAAAGAAATAATATATATGTGACAAAGA
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GAGGGTTTTTGGGAAGGTAGCCCATTGGAGAAATGTTTCTGATCTTGTTCTCATACTTTC
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CTATTTAGATAGCTAGAAAA
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>LITCHI014371.m1 GenomeSequence - 
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TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATGAGTATGTGTTATGTATATTTTGAGTTGATGTATGAA
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GCTTAGTATAACTATAAAGCAAATTAGAATTTGTTCTATCAAATTAAAGAAGTTGAAGAA
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CCATGTAGAAATTTGGTGATAGTGAATTCAGTTATTATGTTAACGACTTCTACATACCAG
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TACTTATGCACTTGGTATAATCTAGCTAGTTATATATATTCAAGAGAATTGGAATTAAAA
GTTCGAACTAATAATGTAGGCGGATGGGGATTGGATTCAGTCTAGTTAAATCAATTGAAG
AATGGATGATGAGAAATGGGGCACACTACACATTTTTAGCCACTGAAAAAAACAATGTTG
CTTCCACAAATCTCTTCACTACTAAGTGCAACTACATGCACTTTGGCTCCTTAGTCATTT
TTGTTCAACCAATAAGATTTCCTCTCAAGAGTCTCTCTCAAGATATAAAGATTGAGAAAT
TGCATATAGACCAAGCAATCTCTTTGTACAACAACAGGCTGAGGAGAAAAGACATATATC
CGACCGATATCGACTCGATCTTGAAGGATAAACTCAGTTTGGGGACATGGGTGTCTTACT
TCAAAGAGGAAGAGTGGTTTGAGTTGAAGAATGATGAAGACTTTGTCACCAAAACTCCAA
GCTCTTGGGTTGTTTTTAGTGTATGGAACTCTTGTGAGGCATATAAAATTCACATAAGGA
AGTCAAAGTCACATCCCTTGAAGTTTGTACATGCAACTTTGTGCCATGCAATGGAGAAGA
TTTTCCCTTGTCTTAAAATGCCAATCTCATGTGGCTCACTAGCGAACCCATTTGGGTTCT
TGTTCTTGTTTGGGCTCTATGGTGAGGGACAGAGGCTTGGAGAGCTCATGAGGTCTGTTT
TGAGCTTTGCTTCAAGATTGGCAGGGAATGTTAAACATTGCAAGGTGATCATGACTGAAT
TGGGTGTCACTGATCCTCTAATTGGGCATGTACCACAAGAGCCCTCCATCTCATGCATAG
ATGACCTTTGGTACTTGAAAAAAATGAACGGCTACCTAGCCGGTGATCCTCATCATCACC
ATGATGATCATGAAATGATGATGATGATGATGGGGCAAATAGGGAATGTTTTTGTTGATC
CAAGAGACTTCTAGCTAGCTAGGGCTACAAACTCTCTAAGAAATTGAAAATGTAATTTAT
CATAATATAAACTAGATATTTGTATGTATCTGCAAATTTTCAGCGGTGGC