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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI013841Chr23617666936180644-Upstream activation factor subunit spp27

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI013841.m1860PF08766.14DEK_CDomain27.23.10E-06
LITCHI013841.m1167237PF02201.21SWIBDomain93.94.20E-27
LITCHI013841.m1269340PF02201.21SWIBDomain67.29.60E-19
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>LITCHI013841.m1
ATGTCGAAGGCGGCGGCGGCGGACGAGGAAGAAATCGCGGAAGCGATACGCGCTCTTTTC
AGCGAAACGGCGAACCCTAACAACGACAACTCGCTAAACGGCGTCGTTCGGCAGCTGGAG
ATGAAGCTCGGCAAAGATGTGTCTGACAAGGTCGACTTCGTTCGCGTTCAGATCCACCAG
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>LITCHI013841.m1
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>LITCHI013841.m1
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AGATTGTGAAGCAGCTGTGGGCTTACATAAGAAAAAACAATCTCCAAGACCCAAGTAACA
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CTCTAAATCCAATGATGATACTGTGTGATGCAAAACTTCAAGATCTCTTTGGTTGCCAAA
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>LITCHI013841.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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AACCATCATTTTACATTTGGTGACTCCACAAAAAATGTGTAGTTAAAACTTATTGTTCGT
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GCCAAAATCCAAAAATTAAAGTAAATAATAACCAAAGAACATGAGATCTGCCCCGTTCTT
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CTCTTACCTCTTAAGGTTAAAAGATTCACTAGTGATTGATATCGGTAACATCATTTTTAT
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TGAGATTAGTTCAAAGATACAATTAGAATGAAATTGGAAGGACACTAGTGGTATGTCAGG
ATAAACGATTTTCATATGATTAAAATCATCTATATTTAGATGAGAGATAATTCATATATA
TGAAAAAATTCATGATTTTTTATGAAAGGATGTGAGATGTACAGTATTTAGGAGAACAGT
GTTTTACCACTCCACTTATTCCCTTTGCGCATTTTGAAGTAGTTATAATCTCATGGATAT
TTTTCCTTTATTTTGTAAAACAAACAAGGGATTACATGGCTAAATGTGAATGGCTGGTCA
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CATAGCTGGAGAGAGAGAGTACTTTTCTTAGAGAGAGAAAAAGAAGTCCGTTAATTTCAG
TTACGATTTTGGCGCCAAAT
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>LITCHI007259.m1 GenomeSequence + 
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TTTGGTCAAGGAGAGATTAACGCTTTAAAATGGAAGAAAGACCAAAATTTTGTGCATGTT
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ATTCTGACTCCTCCTCACTATGTTCAATGATACAAAGCATGACCAACTCGTTTTCTTGTG
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TTTGTTTTCAGGTTAATAAAAAAACTTTGTAACTTCTTGGTGAGTTAATTTGGACTGCAT
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AATAAAAATTAATTTTTTAACATTAAAAAGCCCTTGCCACCCTTCAAATTGCTTTCGAGA
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AACTGGCCAGTATTAAAAACATTGGAAAAGCTGTTAATGATTATTGTGATAAATTTGCTT
GTAAGAAGATAATTTTATCAAATGCTTCTTCAAAAAGTGCTTGTAATTATAATACTATCC
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CTACAAATTTAGAAATAACAAAAGTAGACATGGCATCACTCTCCCATGTCTTTGTTTCTT
TATAAGATGAAGGATAGATTCGTATTAAAAGGCTTATCAATATGTGAGCAATTTTCTTAT
CTTTGTGTGGGTAGTTCTCTTTCATCTTCTAGAAACAGAGATTCGGACTATATTTTAGAG
TTCTATCTCAGCTGATTTCGACAGTAATCTAGTTTATTGTCAAGTAGCCAAAAAAAAAAG
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TTCTTGTGTTAATTTGTGAAATTAGGGGGATCAAGCATCAATCATAGGTGGAGCCATTAA
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AAAACAATCAGCAGATGACTCCGGTTTCTCACCTCTCCTATTCTCAGATTTCTTTTCCTT
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ATTTTCTCGCATGTAATATGCAAAATGTTTTCACTTCTTCAGGACCGTTTTTGTATTTTC
ATGAACCGCTGGATCTTGGACTATATATCTATATATATATATATATATTCTTGTTCTGTT
TTTCTGTACTGTACTAGACATGGAACCTTTCTTTCTTCTCATGCTATCTCTATTTACGTG
TGCCCATCTGAGCTTTGAATAACATGGAAT
>LITCHI007259.m2 GenomeSequence + 
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TGGTTTTCCAAAATGACCAGCCGTTTGGTTCCTGGAGTTGTGACTTTGGTTTTGAAGAGG
AAGCATCAGCTTGTCTTCACGAAACGCTTTTCCAAAACGGAGGTTCTGGTTTTAACACGA
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GGATGACACACATTGCAGTTGAACGGAATCGGAGAAAGCAAATGAATGAATATCTCGCTG
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TTTGTTTTCAGGTTAATAAAAAAACTTTGTAACTTCTTGGTGAGTTAATTTGGACTGCAT
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GAAATTTTCAGATAAAATAGTGGTTTTTTTAGCTAAGTTTATTTTTAGTGCTTTTCAAAA
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TATAAGATGAAGGATAGATTCGTATTAAAAGGCTTATCAATATGTGAGCAATTTTCTTAT
CTTTGTGTGGGTAGTTCTCTTTCATCTTCTAGAAACAGAGATTCGGACTATATTTTAGAG
TTCTATCTCAGCTGATTTCGACAGTAATCTAGTTTATTGTCAAGTAGCCAAAAAAAAAAG
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TTCTTGTGTTAATTTGTGAAATTAGGGGGATCAAGCATCAATCATAGGTGGAGCCATTAA
TTATGTGAAGGAGCTTGAGCAGCATCTCCATTTCCTGGAATCCAACAACCGATTAATCAA
AAAACAATCAGCAGATGACTCCGGTTTCTCACCTCTCCTATTCTCAGATTTCTTTTCCTT
CCCTCAATACTCCGCAGCTTGTTCAAACCTCCACAGCCATCAAAACTGGAAGGACTCAAA
TAATTCAATGGCCGAGAAGCGTTCTGAGCTTGCAGAAGTCGAAGTAACAATGGTGGAAAG
CCATGCAAACCTCAAAATACAGTCAAAGAAACATCCTAAACAGCTCTTGCAGATGGTCAC
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TGTCCTTTACTCTTTCAGTGTTAAGGTTAGTTTACAACTGTTTCTTTTTAAATAGAGGGC
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GTGTCAGCTGGCTACAGTGAATGAGATTGCAGCAGCTATTTATGAGATGGTGGGTAGAAT
ACGAGATGACTCTGCTCTTTAGTTTTAGCTAGATATATATATATTTATATGTCCTTGCTA
ATTTTCTCGCATGTAATATGCAAAATGTTTTCACTTCTTCAGGACCGTTTTTGTATTTTC
ATGAACCGCTGGATCTTGGACTATATATCTATATATATATATATATATTCTTGTTCTGTT
TTTCTGTACTGTACTAGACATGGAACCTTTCTTTCTTCTCATGCTATCTCTATTTACGTG
TGCCCATCTGAGCTTTGAATAACATGGAAT