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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI013841 | Chr2 | 36176669 | 36180644 | - | Upstream activation factor subunit spp27 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI013841.m1 | 8 | 60 | PF08766.14 | DEK_C | Domain | 27.2 | 3.10E-06 |
| LITCHI013841.m1 | 167 | 237 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 93.9 | 4.20E-27 |
| LITCHI013841.m1 | 269 | 340 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 67.2 | 9.60E-19 |
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>LITCHI013841.m1 ATGTCGAAGGCGGCGGCGGCGGACGAGGAAGAAATCGCGGAAGCGATACGCGCTCTTTTC AGCGAAACGGCGAACCCTAACAACGACAACTCGCTAAACGGCGTCGTTCGGCAGCTGGAG ATGAAGCTCGGCAAAGATGTGTCTGACAAGGTCGACTTCGTTCGCGTTCAGATCCACCAG CACCTCCTCCTCCTCCAACAAGAGAATCCTCGAGTTTTGAGGGAGAATGACGGTTTTGCC CTCCAGCAGTCTACGGATTTACTCCCTCATTTGTCTCCTGCCACGTCAGCTCTTCAGTCG TTCTCTGCTCAGCCGTCTGCGCCTGTTAAAAACGAAGCAGCGGAGGAGCCAACAAAGCAG GGTGTCTGTTTGGTTTGTAAGGAAGTGAAGGAAAATTTTGACAGTTCGTGTTTGGTTGCC GAGAAAGTGAAGGAAAGTTTTGACAGTGGCCAGACCAAAGCTAAGAGAAGAGGTGGTGCT GGTGGTCTAAACAAACTTTGCGGTGTTTCACCTGAACTTGAGGCCATTGTTGGCCAACCG ACTCTACCGAGGACTGAGATTGTGAAGCAGCTGTGGGCTTACATAAGAAAAAACAATCTC CAAGACCCAAGTAACAAAAGGAAAATCATTTGCAATGATGAGCTGCGCTTGGTGTTTGAG ACTGACTGTACCGATATGTTCAAGATGAACAAATTGCTGGCAAAACATATCATCCCTCTT GAACCTACAAAACAGTCAGGTATGAAGAGGCAGAAGGTAGATGTGGAGTCTGGAATGAGA AGTTCTGAAGTCAGTCCTTCTGTCATTATATCCGAAGGACTGGCCAGTTTCTTTGGCGTT GGGGGAAGGGAGATGCTGCAATCAGAGGTTTTAGGACGTATATGGGAATACATAAAGGTC AACCATCTGGAGGATCCTCTAAATCCAATGATGATACTGTGTGATGCAAAACTTCAAGAT CTCTTTGGTTGCCAAAGCATATCTGCACTGGGGATACCCGAACTTTTGACGCGTCATATC CGTAGGAGATGA
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>LITCHI013841.m1 MSKAAAADEEEIAEAIRALFSETANPNNDNSLNGVVRQLEMKLGKDVSDKVDFVRVQIHQ HLLLLQQENPRVLRENDGFALQQSTDLLPHLSPATSALQSFSAQPSAPVKNEAAEEPTKQ GVCLVCKEVKENFDSSCLVAEKVKESFDSGQTKAKRRGGAGGLNKLCGVSPELEAIVGQP TLPRTEIVKQLWAYIRKNNLQDPSNKRKIICNDELRLVFETDCTDMFKMNKLLAKHIIPL EPTKQSGMKRQKVDVESGMRSSEVSPSVIISEGLASFFGVGGREMLQSEVLGRIWEYIKV NHLEDPLNPMMILCDAKLQDLFGCQSISALGIPELLTRHIRRR.
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>LITCHI007690.m1 ATTTATTATATATATATATTATTTATTTTTTTAAAGGAACAAAGGAGTCTTGTCCAAACG CGGCTTAACACAAATTCATTCCCGCCAACGTCTTTGGTTCCATTTTCAATCAAACTCTCG TTCAAGGAAAAGATTGAATTTTGTTTGCCATGGCATCTGCTAGAAAGAGAAGGGTCCAGG CGGTTGAGGCGCCCGGTAGGAGTGTAGATGTTTCTGGAGTTATGAAATCTATGAAGAGAA CGGTTGTGGAGTGCGGTAACACAACTGGGAAAAATGGTGATCATATAATTGAAAACGATG TGAAATCTTCACCTTCTAGCCCAGCTGTAGCACTGTGTCCACAGATTTCAGACAACAATG CATACATTATGGAAGCAAGAAAAGAATTAGTAGTTGATAGTTATCCAGGACAAATTCTCC TGCCGTCTTCAAAGATCAAGTTGCAGCTTTTTCCCATTGATGAAGGTACTCGCATGGGAC TGGAAAAGGATGGATTTAATCCGTACTTGGAACTCACTCTAAGTGCTAGGAAGAAGATAT CTTCTGTGGTTAAGCATCTCAATAGCAAGTGGGGTGGTTCAAGTGTTGCTCTTGGTGAAC CTATGCTCTTTCCATATGACACTGTGGACAATTTGACTAGTTACAGATGGACAATGAATG ACAACTGCATCACTGCGGCAGATGTTTATGCTGCTATAAAAAACCCCGCTGTTTTCCGGT ATGGCTGGATATCCGCTGCTGAAGCTAAAGCCCTTGGTGTGCCTTCTACATCAGCGCCAA CAGGGGGTCATTTAAAAGTTGAAGAGACACAAAGGGTTTGTGGTAATAAAGAAGAATTTG GCAAAGTACAACAAATAGAAACAGTTGAAGAGACACAAAGGGTTTGTGGAGGAGCAAACT CCAATATTGGGGAGAAGATGCCTTTTGATAGACAAATTGAACCAGTGGACAATGAAGTGA AGGCTAATAGTGGCATTTCATCGCTGTGGGCTGACAGTCTAACTAACATAAGTATTGGAG GATTGCTATCTGAAGCATCCTTACAGGGAAGAAATTGTGATGCAAAATCAAACGGGAGTA ATGCAGGCTTGCAGCCTTCTCAGTTAATCTCAGATTCATTTGATGCGTTTCTTTCTGACC AACTGAATCATTCTCAAGATCTGAGGCCTCCCCCTCTTGATTCACACTCATCAATTCTAG ATGCTGAAGACACATGTCATGCATTTGCATTTCCAAAATGCTCTTCCTTGAATAAAGATT CTCAACTGTTTGTTGGAAGTGCTTTTTCTAAGCCCTGCAGTCAGGATGCTAGTACCAAGT CATTCAAGGTTCCTTATTCAACTGAGGCCAACATGCAATCTGGGATTCTGCAGGACCATA CATGTCAAGAATCTGAAACAGACATGAAGCTTTGTTCACGAGTCCATAATGATGAAAGTA GCCTTGGACTATCAGGCATCAATTGGACCGACTCTTTGGGACCCTTCGATCTTGGCTTAT CATCCTCTCGAAAGATCAACAGCGGAGACAGTATCAGCTTGAGTGGAACTGCTGCAGCAT TTGAAAACAGCATCAAAATACAGGAAAACTCAGGACTTTTTAGGATTAAATTACAATGGT CTATTTTGGGGGCTTTGAGGAAGCTGCTGATGGGGTGTGTTCAGGGCAAACGCTCTATGA ATTCGCCAGATCCTCAGCTTGAGATGCTGAAAGCGAAAAATGGGTATGTTAAGGGAGTGA GCAGAGGAAGAGTCATTTTGGTGACAAATGATGGTTCTAGTGGACCTGCTGGAGAAGCAG AGAAAAGGGTTCCTGGAGAAGCTGTGAAGGTGAAGAATAGTGCTGGCGGTGGTTCAAGGA GGAGTTTTAGGAAGAAGATTGCAGATGATGAACTTGTGGATGGTTGGCCCAAATGGCTTG TTGAGAACATCTCTGGAGAATTTTTGGCTGGTTTGGTTCCTAAAAGTGTGGATTCGTATG ATAAATTAGCTAAGGTTGGCCAAGGAACATACAGCAATGTGTACAAAGCTAGAGACAGAG ATACAGGGAAGGTTGTTGCTTTGAAGAAGGTCAGGTTCGACACATCAGAGCCCGCAAGTG TCAGGTTTATGGCAAGAGAGATACTAATACTGCAGAAGCTGGACCATCCCAATGTCATCA AGCTTGAAGGACTAGCCACATCAAGGATGCAATATAGCCTGTATCTTGTTTTCGATTATA TGCAGACTGATTTAACTAGAGTCATCTGCCGTCCAGGCCAGAGGCTCACTCAACCACAGA CTTTTGGTCTAACGGTTGACAACAACATCCACAATGATGAACTAAGCCATTTTGATGTCA AGTCCTATATGCAGCAGCTGCTTGCAGGTCTGGAGCACTGTCACGAAAGAGGAATTTTGC ATCGAGACATCAAAGCTTCCAACTTATTGATAGACAAAAATGGGGTGCTAAAGATTGCAG ACTTTGGCCTTGCAAATTTCTTCATTCCTAAACCAAAACACGGCCTTACAAGTCGAGTTG TGACACTCTGGTACAGAGCTCCAGAGCTACTTTTGGGGTCTACGGATTATGGAGTTGGGA TAGATCTTTGGAGCGCTGGATGCTTATTAGCTGAGATGTTTATAGGAAGACCAATTTTGC CCGGGAGGACTGAGGTTGAGCAAATTCATAGGATATTTAAGCTCTGTGGTTCTCCCTCAG AAGATTATTGGAAGAAATTCAAGGCGACAACAACGTTTCGACCTGCACAACTTTATAAGC CTAGTTTGCAAGAGGCATTTGGAGATTTCCCTCCTTCCTCATTCAGTATCTTAACCACGC TTCTAGCTCTGGACCCAGCAAATCGTGGCACGGCTGCTTCTGCTCTCCAAAGTGAATTCT TCAGTTCAAGTCCATTGCCATGTAAGCTCTCGGAATTACCTGTAATGAACAAGGTGGAAG ATGAGTCAGCTCAAACCAACAAACCCAAAAGGCGCAGGAGTACAAAAGCGAAAAAATACA CTCATAAAAATAAAGGTCATCGAAGAAAGGATTCGACTGCAGAACGAGGCAAAGGAGATA GTGAATCTTCTAAAGAGATGGAGAAGACTCAAGAGCTGATCATGCAGGGCCCTAACAGTG CAAGCAGCAGCACTTGCTCTACTGTGAAAACATTTAGGCGGCATGAAGACAGCTTGAATG TCTCCCTCTCTCCGATCCTTCGTTCCGATACGAAAAGATCTCCGAAAACTGAGGGTCATC CTAATGCTCTTAGGAACATTCAGAACTACGCTCTATTACAGGCTTCCATATCAGATATCG TCAACCACAGAGAACGCAATGCATTTGCTCCATATAGCAGGACTCTCTCTACCTTGGATT TCCGAACACTTGATCCCGAAAAGATATCAGAACTCCTTGGACTAGACAAAGATTAG
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>LITCHI021823.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTACCTTATAGGATATGAGGGTAAATTTATATGAATTTAGTCTCCCCTCCCCGTCATTTA AAAATAAATAAATAAAAAAAACTCAATTATTTTGTACAATAATTTTAACCACATAAAAAT AAATTTTAAAATATAATTATAATATTAATTACATTAACTTATTTTCGTGGAGAGAGAAGT CAACTTAGTGGTAAAGGTTGTATCCCTCTCATGACTAGTTATGGGATCAAATTTGCACAC CCCACATTTATTAATAAAATAGTGGAATTTTCTCATATGTATATAAGTTGTCTCTCATTC ATATGTGGATGACTCCCAGTTATATGAGAGCCGTTTATCCAAACCATATCATCAGTGTCA TATCGACATGGTCTAATTGTGATCTAGGTAAGTCCCAATAACTAAAAATATATATATTAA AAAATATTATTGAATAAAATAATAATTGACTTATTATTATCAATAAATAATTTTAATTCA CGAATTATTATTAACATGTAAATAAATTTGGATGTACAATTTATCATAGTGTTGGGATCT CAACCTATTCTTTTGCCATTTGTTCTCGTAAGGTAGGATAACATCATTAAGGTTTGAATG ACAAGTTTGTCATGGTGATCCAAGGCAAGTTCGGGTTCAAATCTTAGGACATTGTCTACG TTACGGGGCAAAAAAGCCAAGACCCTATGGAGACAAAAGAACGAAAAATTGGACTATAGT CCTAACACATGATATAATTTTTAGCTATCTACATAATTTCAAACAAAAACACATAATAAT TAATGATAATGCTAGGCTTTTTAAATTTTTATCTAAATTCATGCTTAAATTATGTAATAT ATGAATCATCAATATCTAATAAATTATGAAATAATATGATAATTAATATGATGTTTATAT GTTATTTGGACATAAATTTGAGTAAAAAATTTAAAAACTTAATATTACTCATAATTATGT GTTAATAAAAATATAAACATAAAATATTTATTTCTAAATGTGTATATATATATTTTGGTG AAGACATTTCCAAATGTTTCAATCTTTAAATAAAAGAACACTGAAATGTGATTTGGTGCT GCTCTATTTGATGTTGTGACTTGAGGTAATAAACAGCCTCTTATGGCAACTTGACCTAAA ATAAACAAACAAAGGGTGAAAACATCAAAAACAGTCAACATAGAAGCAGAACAATAACCG TGTCAGTGACAAAACAGCACTTTCCGCGGGTACCACCCACTAATGCTAGTGTTTCTCGTC TTCTCCGTAGATAAAATCACGAAGAGACTGCATGGAGCCGCCTCTCACTCTCTCTAAATC GCAAAACCAAAACCAGGGTGTTTGAGAGAGAATCCAAAAATGGGAGTTTTCACACCCACT AAACGACCCGGTGGGCTCCACACCCACCCACACGAGGGAGGTCTCCTCTCCAAATCCCAA TTACCTAGCCTGTGACGGCTCGTAACGGCAAGCAGTTTTGGCGGCAAAACAACCTGGCGC ACGCCACGTGTTGAAACTCCATTGGCTCGTCATGATGCATGCCCATTATCCAAGTACATC CACCATGTCATGTTGTGTATTTTTCCCGCGCTTAGACATGGATAGGGTTTTCCCTTAAGT TAAAATAGAGTTTCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAACACACAAAACTCAAGTGAGGGAAAC CTAAGACTGAAAAACAAAATAAATATAAAAATTTCTAGGGTGCCTGGTCTCGTCGATCTG CATACAACGGTGCCGTTCTCGTGGAATCGGTAGGGTTTCGGTTGCTGGATCTTCAGATTG TGGAAATTTGAGAGATCTGCGTCCGAGAACGGTAAGTTTCTGCTTTTACCGTGCTTTTCT TTTATCAGTTTTTGTTTTTCGTTTCCGTAGATAAGAATCGGCCATGAGCTTGCAATTGAA GTCATTGATGTGTTTTGTTAATTTGAAATGAGGTGTGTTAGATGGGTTAGTGTTGTGGTT GAGTGTAGCTGGTCTGGAGA
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>LITCHI021823.m1 GenomeSequence + CAATATCTAATAAATTATGAAATAATATGATAATTAATATGATGTTTATATGTTATTTGG ACATAAATTTGAGTAAAAAATTTAAAAACTTAATATTACTCATAATTATGTGTTAATAAA AATATAAACATAAAATATTTATTTCTAAATGTGTATATATATATTTTGGTGAAGACATTT CCAAATGTTTCAATCTTTAAATAAAAGAACACTGAAATGTGATTTGGTGCTGCTCTATTT GATGTTGTGACTTGAGGTAATAAACAGCCTCTTATGGCAACTTGACCTAAAATAAACAAA CAAAGGGTGAAAACATCAAAAACAGTCAACATAGAAGCAGAACAATAACCGTGTCAGTGA CAAAACAGCACTTTCCGCGGGTACCACCCACTAATGCTAGTGTTTCTCGTCTTCTCCGTA GATAAAATCACGAAGAGACTGCATGGAGCCGCCTCTCACTCTCTCTAAATCGCAAAACCA AAACCAGGGTGTTTGAGAGAGAATCCAAAAATGGGAGTTTTCACACCCACTAAACGACCC GGTGGGCTCCACACCCACCCACACGAGGGAGGTCTCCTCTCCAAATCCCAATTACCTAGC CTGTGACGGCTCGTAACGGCAAGCAGTTTTGGCGGCAAAACAACCTGGCGCACGCCACGT GTTGAAACTCCATTGGCTCGTCATGATGCATGCCCATTATCCAAGTACATCCACCATGTC ATGTTGTGTATTTTTCCCGCGCTTAGACATGGATAGGGTTTTCCCTTAAGTTAAAATAGA GTTTCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAACACACAAAACTCAAGTGAGGGAAACCTAAGACTG AAAAACAAAATAAATATAAAAATTTCTAGGGTGCCTGGTCTCGTCGATCTGCATACAACG 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