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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI013791 | Chr2 | 35736981 | 35737466 | + | Scarecrow-like transcription factor PAT1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI013791.m1 | 1 | 161 | PF03514.17 | GRAS | Family | 199.5 | 8.70E-59 |
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>LITCHI013791.m1 ATGCCAGATGAAAGTGTGAGCATCGAGAATCATCGAGACAGACTTTTGAGGTTGGCGAGA AGCTTGTCTCCCAAGGTTGTAACTCTTGTCGAGCAAGAAGCAAATACCAATACAGCCCCT TTCTTTCACCGTTTCCTTGAGACAATGAATCATTACATGGCCATCTTTGATTCCGTTGAG GCTGCTCTGCCAAGAGAGCACAAAGATAGAATCAACGTTGAGCAGCACTGTCTGGCTCGG GAGATTGTCAACATCATTGCATGTGAAGGACCTGAAAGAGTGGAACGTCATGAGCTTCTG GGCAAGTGGAGATCACGTTTTACAATGGCTGGCTTTACACCATATCCATTAAGCCCTTTC GTGAATGCAACCATCAAAACTTTGCTGGGATCTTACAGCAACAATTACACTCTTATAGAG AGGGATGGAGTACTCTTGCTTGGGTGGAAAAATCAAGTTATAGTCGTTTCTTGCGCATGG AGGTGA
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>LITCHI024932.m1 ATGAATCATTTGCAATTTGACCATGGTTTAGGACCTTTAGGTTCAGTTTATTCAAACCAA AATCACGTTGATGGGTTCAAAAATGATGGTGATAAGACTCATCATGAAGACCCTTCTCAC CCACTTGAAAACAATACACACCAAACTAAGGACTCAGGTCCATGTTCTGGTGGGAGCTCA GAGGGGGTTTCTTCGGATTTTTGTATTGAGCTGAACCATGCAACTCTTAAGTACATAAGT GATATGCTTATGGAAGAAGATCTGGAGGGTAAGACATGTATGTTGCAGGATTGTTTGGCC CTCCAAGCTGCTGAGAAACCCTTCTATGAAATACTTGGCCAGGAATACCCGCCTTTGCTG AATCAAATGTCTTGTTATCTGAATCAAAACTTGGAGAATGCGGATGATTGTTGTACGACT AATAGTCGTGTTGATAGTAGTAACAGCATTGTTACTGCTAGCAACTTGGTTGATCCCGAT TGGGTTACTAGTCAGGGCAAATTCAAGTCCTCTTGGATGATTCAGACCTCCCCTATTGAC TCTCCTGACAGTGCTGCTCTGGTGCCAAATTTATGTGGGGAGAGACAGATAAGTGGACAG CTAGGTGGGCCTAGAAAGTCCCTTCCAAAGGATGATTCTTTGAGCAATCCATCAAGGCCT CGAGAAGAGGCGGTTGACAGTTCAGCAACAGCAGGGAGTTACAATTTGTCGTATGGGTCA AGGGGAAGGAAAAGTTATCAGCTAGAGGATAGTGATAATGGGGAACAAAGGAGGAGTAAT AAGCAGTTGGCAACAGCTGTTTCTGAATCTGAGCCATCAAAGATGTTTGATGATGTGTTG CTATGCAACTGCGAGAACAAAGATGCTGTACAATGTCTAGTTCACGGAATCAAGTTGAAT AAATCAGATGAAAAGGTGCAGCAGAATGAGCGACCAAAGTCGTCTGGTGGTAAGACAAGA CGTGGGAAGAAGAAAGGTAAGAAAGGCGAACTGGTGGATTTGTGGACTCTGTTAACTGTT TGTGCACAAGCTGTGGCTAACTATGATCAAAGGACAGCAAATGATCTATTGCAGCAGATA AGGCAACACTCTTCAGCTTTTGGTGATGGAACACAAAGATTGGCGCATTACTTTGCTCAT GGCCTTGAGGTGCGCCTGGCAGGGACTCAGACGCCAATTGCAATACATCTTAGTACTAGG GCATCGGCTGCTGATGTTCTACAAGCTTACAGAGTGTATATATCATCATGCCCTTTCAAT AGGATGTCATTTTTCATGTCAAATAGAACAATTTTGAAACTATCAGAGACAGCAACAAGG CTCCATATTATTGATTTTGGCATTGGATATGGTTTCCAATGGCCTTGCTTTATTCACCGC GTCGCTCAGAGACCTGGCGGTCCTCCCAAGCTTCGAATTACAGGTATTGAGTTTCCTCAA CCAGGGTTCCGGCCTGCAGAAAGGGTTGAAGAGACAGGGCATCGATTAAAAGCCTATTGT GATAGATTTAGGGTCCCATTTGAGTACACTGCCATAGCCAAGAAATGGCATACAATCCAA CTAGAGGATCTCAAGATTGACAGCGAAGAGATGACAGTCGTTAGCTGTATGTACCGAATG AGGCACCTGCCTGATGACACAGTGGTTGTTAGCAGTCCAAGAGATACTGTCTTAAAACTG ATCAAGAGTATAAATCCAGACATATTCATCCATGCAGTTGTTAATGGTACTCACAATGCA CCTTTCTTTCTCCCACGATTCAGGGAGGCTTTATTCCATTTCTCTACATTGTTTGATATA TTTGAGGCTACTTTATTTCGCGAAGATCAAGGGAGGATGGTGTTTGAGAGAGAAATATTT GGGAAAGACGCCATGAATGTTATCGCCTGTGAGGGTGTAGAGAGGGTTGAAAGGCCGGAG ACATATAAGCAATGGCATGCAAGGAATCAGAGAATTGGGTTTAGGCAACTCCCACTAGAT AGGGGTTTATATGAAATGGTCATGAATTTGGTGAAATCAAACTATCATCAAGATTTTATT ATTGATGAAGATGGCCAGTGGCTGTTGCAGGGGTGGAAAGGAAGAATATGCTATGCTCTT TCTGTCTGGAAACCTGTCCAGGAACAATGA
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>LITCHI010912.m1 - Up_Stream_Len 2000 GATTTCGTAACAATGAGTCAAATGTTATGAATAGAAGAATATAATTGTAAGAATAAATGT CTATCAATCCATGAAAATAAATTCTATTTTTTTCATTAATTTGTTATCATGATTTATTTT ATGATTTATTATATTGTAATTGTTAACTTATAATAGTAAGTTGTGATAGTGAGACTATTA TATGAGCTCTTACCGTTGTATCTGTATGTTATTTGATGGAAATTTTGGGAAATTAAAGAA TTTCTTCTTTTGGACTATCATTTTCTTAGGGTGGGTTAGAGGTATTAAATTCAGTAAAAA TTATTTATATTTGTGTTTTAAGATAAGAGTGAGATTTGAATCTTTTACCTTTTAGGATCA AGAAAAATACTCAATCACTTTTACTAAGTGTTGGTGTGTATCATTTTCTTTTCTCTCTCT TTGTGTTATTGTGTTTTAATTTCATTATTAGTAATCAATATACCTGCAGTAAGTTAGTGT TATACATATGGCATTGTTGCTTCTGCCTGTAACTAACTGTATCCTCTTTGTTTGGGAACT TGCTAGATCCACACTATATAATTTGCCCTAAATTTATCCAGAAATACATATAAAATCATC GTCTTTGATAATTATATACAATATACATGTTGTTGGCTCAAATCAAGTTAATTAGGTTGG AATAGATTACGAGGCCCTGTGGCTAACGTTTTCGTTGCAGTGGTGGTCAGACCTCAGAAT CCCAAATTGGACGACATAAGCTTTTTTCATGAAAATTAAAAAGTATTCATGCCATCTATA TTCCTAGAGAGGTATCCAGACCTACCCAGTCTCCTAATGGTAGACAAGCAAAAGCTGACT TACTGGAAACGTTTGATTGAGGAAAATTCAAGCAACGTGCAATACCCGTAAGCTATATAT AATATATATTTTTCAAACAAAATATTGCTATGTCATTTACAAATTAAATTCAAGAGTTTT GATTTAAATTCATAGCTCAACCCATATTCTATCCTTTGTTAGTATTTAATTTATCAAAAT TACAATGAGTTGATCATTTGCTATAGTATTCTCAAGCACAGGTCTAATTCTTGGTTGCAG CACCAAATTGTGAACCATAGCATTGAAAAGAGTGTGTTTATACAAAATCTTCCTCCTTAG TTTGTTATTAAGCATAAGCACAGAGAATATTTATAAGAATTAAACAAATATACCATTGTC TCAAATTAAATATATAATAATCAGACTTTGAACTTTTGAAGCTGTGAAACTGCGGTAGGA CGTTTTCGTTGGTTCTTTTACTTTTGACCAAGACATTTTGTTTCATATAAATTACCACTA AATTCATTAAATAAAGCTAGGTTTAAAATGAACCCGAGGTAGTACGTTACCATGCATTTT ATTTTTTTCTTGCCATCAAACAAAGCACAGTAATCTCACTAAGAGATAAGAATGTCCTGG ACTTGGACCACCTGGCTTCTCCGAATTGGTGCATCTGCTTTCAGGTTTCCAAAGTGTGGA AACAGCAGATGCATGTCGGAAAAACCAGGCCGTACGTAAAAGTAAAAGTAATCACATTTT CTACTAGCGCGCTCAAAACGCTGCCTTGTATCGAGGGTAACTACTTGGAAATAAAATGAA GAAATGAGTGCTCTAAAATTCCTTAGAGTTCTTAGTTATTGTTGTTGTTGATAGATGGAA AATGCAAGTCTTGTTTTCTTGTTGTTTGGGGCGCAGATATTATTTAAACCCTATTAGAGT GGGAATTTTAATGATCACATATCTGACGTATGGATATCTCAATTTCCTTGCTTATTCTTT TTCTTTTGCCAACTCCTATATCTTCCTCTAAAACATTTGATCATGTTCTCACACAAGGCT CATCTTTATCTGTGGAGAGATCAAGCGACCGTTTAACTTCATCAAACGGTGTTTACTCAG CAGGGTTCTTCTCCGTTGGCAATAATGCTTTCACCTTTGCTGTATGGTTCGCCAAATCTT CACCACCCACTGCGGCTTAG
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>LITCHI021928.m9 GenomeSequence - GTGAAGTTAACGCGCGAGGAGAGTCACGTGGACGTAGGCAGCGTAATTGAAAATCCCAAA TAGGGCTCTAACAAAATCAATTCTAGGTAAAATTAGAATTCTCGAGTGTTGTTGCAGATT TTGTAGAAGAGGCACCAAAAGAGATTGAAAAAACAAAAATGGTATAAAAATGGAGAGAGC AAAGCGAGGTGGAGAGAGGGGAACGGAATCAAAATCGAAATCGTTGGAGGAGTCTGGAGA GCGGGAGATGAGCTTCTTGTACGACGCCGTTTGCCGCTCACGCTCGCGGTCCGCCTTGGA CACGTATTACGTCGCCTGCGAGGCCTTCTCCGAACAGCATCAGCTTCTCCGTCTCTCGGT TTCGGTTCCGATTTGTGTCAAATTCAAGTACCTGCTCTGATAGATAGATAGATTTTTTTT TTTTTTTTTAAATTTTAATTCTTGGATTTGGATTCTGGTGGTCGGTCGGGTCTTTTTTGT TTGTTTTGTGGTGTTTTTGGATTGAATTTTTGTGAATATGGATTCCGGTTCGGGTTTTGG GAATTCGGAAGGTGAGGATGGTGAGTTCGCCGAAAAGGATCCGTCGGGTCGTTACTGTCG GGTACGGATCACGTTCTTTATTTTTATTTAATTTTTAATAATCATCAATTTTTGAGTTTT TAGATATTCGTGTTACAAATTATATTATAATTTTTTTGTTTATGTTAAATTGAGTGAAAA TTATAGTAGTTCAGTCATGTTCAACGTGCGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTTT TTTTTTTTCTTTTTACCATTTTAAATTTTGGTTTTATCAGTCATTTTTATTGATGGGTTG GTTTAGGGATGAGATTAGTTTTAAAGATGGATTTGAAGTTTGATTCTTTATGGAATTCAA 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