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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI013287Chr22731347927319320-Receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-8

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI013287.m178177PF01453.27B_lectinRepeat111.82.20E-32
LITCHI013287.m1209319PF00954.23S_locus_glycopDomain94.36.90E-27
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LITCHI013287.m1523792PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain1544.80E-45
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LITCHI013287.m1794839PF11883.11DUF3403Family34.91.30E-08
LITCHI013287.m278177PF01453.27B_lectinRepeat112.71.10E-32
LITCHI013287.m2209319PF00954.23S_locus_glycopDomain95.23.50E-27
LITCHI013287.m2347405PF08276.14PAN_2Domain51.87.20E-14
LITCHI013287.m378177PF01453.27B_lectinRepeat112.71.10E-32
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LITCHI013287.m4209319PF00954.23S_locus_glycopDomain95.52.90E-27
LITCHI013287.m4347405PF08276.14PAN_2Domain526.10E-14
LITCHI013287.m578177PF01453.27B_lectinRepeat113.27.80E-33
LITCHI013287.m5209319PF00954.23S_locus_glycopDomain95.82.40E-27
LITCHI013287.m5347405PF08276.14PAN_2Domain52.25.30E-14
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>LITCHI013287.m1
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CCTTTCAGCCCAAAGGAATCGAAACTTCAGACTGCAGACGAATGTAAATTGGCTTGCTTC
AAGGACTGTGCTTGCACTGCATATGCTTATAATGGGAGTGCTGTATGTTCCTTATGGTAT
GGAGACCTGTTGAGCCTCAGACAACTTTCAAAGGGCGACCCTGACGGACAAACAATATAT
CTCAAACTTGCTGCTTCAGAATTTCAAAATCCTGGAGAAGTGAAGAAGCTAATATTGGTA
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CTTTTGGGTTGTTGTGTAGAACATGGTGAAAAGATTTTGATCTATGAGTTCATGCCTAAC
AAAAGCTTAGATGCATTTCTCTTTGATCCAACTAAAAAAGGCATTTTAGACTGGGGAACA
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CCCAAAATATCTGATATTGGAATGGCAAGAATTTTTGGTGGTGATGAGTTACAAGCAAAT
ACTAATCGGATCGTTGGAACTTATGGTTATATGTCACCTGAGTATGCTACGGAAGGTCTC
TTCTCAATTAAATCAGATGTTTTTAGTTTTGGAGTGTTGTTGTTGGAGATACTAAGCAGC
AAAAGGAACACAAGCTTTTACAATACCGACTCTCTCAATCTTCTTGGACATGCTTGGGAA
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TTTCCCATACTTGTCAGGTATATTAATGTGGCCCTTCTATGTGTTCAAGAGATTGCGGAG
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AGCGAGCCACAAGTTTGTTCTGTGAATAATGTAACAGTTTCATCCATTGAAGCTCGACAA
CCATCTTGA
>LITCHI013287.m2
ATGTCAAGTAGGAGGGTTTCTTTATGGATTTGTTGGCTGATTTTCTCTTTCTTTTGTATG
CAGTTCTGCATTGTTGTTGGTGGTGTCATTGATAGCATTTCACAAGGACAAGTGCTTACA
CACTCACAAAGCTTGGTATCTTCAGGTAATAACTTTGTGTTGGGCTTTTTTAGAGCAGGA
AATTCAAATGGTTTTTATGTGGGGATATGGTACAAGAAAGTTTCAGAACAAACTGTAGTC
TGGGTAGCTAACCGAGACCAACCGATGAGAGGTAACTCAGCTGTGCTTACTATTAACAAT
GAGGGGAATCTTGTGATAGAGGATGGTAGGATTACATATAGAGTGAGTGAGAGCTCAGTG
AGCCAGAACACAAGTGCCCTTTTACTAGATTCAGGGAATCTTGTTTTAAGAAATGAGAAG
TTAGATATATTGTGGCAGAGCTTTGACCACCCTTCAAATACTTTGTTACCTGGAATGAAA
ATTGGTTATAGTAACAAGGATGGGAAAGTATGGTCACTAACATCATGGAAAAATGCAGAA
GATCCTGACCTTGGGGCTGTTGAGCTGAAAATGGAACCTAAGCAGCCAAATGAACTTTTC
CTTATGAGGGGTTCTCAAATGATTTGGAGAAGTGGGGTATGGCTTTGGCATGAGAGCAGA
TTCTCCCTAATGCCTAAACATAGGTTCTTTCATTACTTGAACTATAGGTTTCATACTGAT
GAAAACAAAACCTACTTCACCTACTCTGTTGTTAATTCGTCTGTAATAGTTAGATATGTT
CTTGATATATCTGGACAATTTGAACAATTGAATTGGTTAGAGGATGCAAAGGGGTGGTTT
ATGTTCTGGTCTCAACCAAGAGATGCGTGTAATATATATGCTTATTGTGGTCCGTTCACC
AGCTGCAGTCGTGATAGTGTATCGTTCTGTCAGTGCTTGCGTGGTTTTAGGCCTTCAGAT
GGTTCGAAACAGTTGAATCCGTCTGTTGGGTGTGTTAGAAGAGTACCATTGCAGTGTGAA
AATAGTTCTTCTGCTAATGGTGATGAAGACAGATTCTTGAAGATGAAGAATGTAAAATTT
CCTTTCAGCCCAAAGGAATCGAAACTTCAGACTGCAGACGAATGTAAATTGGCTTGCTTC
AAGGACTGTGCTTGCACTGCATATGCTTATAATGGGAGTGCTGTATGTTCCTTATGGTAT
GGAGACCTGTTGAGCCTCAGACAACTTTCAAAGGGCGACCCTGACGGACAAACAATATAT
CTCAAACTTGCTGCTTCAGAATTTCAAAATCCTGGAGAAGTGAAGAAGCTAATATTGGTA
ATTGCAACAATTGTTATTTTGGCTGTACTTCTTCTTGCTTCTTACATTGTTTATCGATGG
AGGAGAAAATTCAAAGAGAAAGAGGAGATGGAACAAGGCCAGGATATTTTACTATTTGAT
ATAAATATGAGCATTGAGACAAGTACCAATGAACCATCGGACAAAGAAATAGCTAAAGGT
AAGAGTAAGGACTCTTGGTTGCCATTGTTCAGCTTCTCCAGTGTGTTTGCAGCCACCGAT
AACTTTTCTATAGAAAATAAGCTTGGAGAAGGTGGCTTTGGACCTGTTTACAAGGTACAT
CACTCTTCTATATAA
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GAAAACAAAACCTACTTCACCTACTCTGTTGTTAATTCGTCTGTAATAGTTAGATATGTT
CTTGATATATCTGGACAATTTGAACAATTGAATTGGTTAGAGGATGCAAAGGGGTGGTTT
ATGTTCTGGTCTCAACCAAGAGATGCGTGTAATATATATGCTTATTGTGGTCCGTTCACC
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GGAGACCTGTTGAGCCTCAGACAACTTTCAAAGGGCGACCCTGACGGACAAACAATATAT
CTCAAACTTGCTGCTTCAGAATTTCAAAATCCTGGAGAAGTGAAGAAGCTAATATTGGTA
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AGGAGAAAATTCAAAGAGAAAGAGGAGATGGAACAAGGCCAGGATATTTTACTATTTGAT
ATAAATATGAGCATTGAGACAAGTACCAATGAACCATCGGACAAAGAAATAGCTAAAGGT
AAGAGTAAGGACTCTTGGTTGCCATTGTTCAGCTTCTCCAGTGTGTTTGCAGCCACCGAT
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CACTCTTCTATATAA
>LITCHI013287.m4
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GAGGGGAATCTTGTGATAGAGGATGGTAGGATTACATATAGAGTGAGTGAGAGCTCAGTG
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TTAGATATATTGTGGCAGAGCTTTGACCACCCTTCAAATACTTTGTTACCTGGAATGAAA
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GATCCTGACCTTGGGGCTGTTGAGCTGAAAATGGAACCTAAGCAGCCAAATGAACTTTTC
CTTATGAGGGGTTCTCAAATGATTTGGAGAAGTGGGGTATGGCTTTGGCATGAGAGCAGA
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GAAAACAAAACCTACTTCACCTACTCTGTTGTTAATTCGTCTGTAATAGTTAGATATGTT
CTTGATATATCTGGACAATTTGAACAATTGAATTGGTTAGAGGATGCAAAGGGGTGGTTT
ATGTTCTGGTCTCAACCAAGAGATGCGTGTAATATATATGCTTATTGTGGTCCGTTCACC
AGCTGCAGTCGTGATAGTGTATCGTTCTGTCAGTGCTTGCGTGGTTTTAGGCCTTCAGAT
GGTTCGAAACAGTTGAATCCGTCTGTTGGGTGTGTTAGAAGAGTACCATTGCAGTGTGAA
AATAGTTCTTCTGCTAATGGTGATGAAGACAGATTCTTGAAGATGAAGAATGTAAAATTT
CCTTTCAGCCCAAAGGAATCGAAACTTCAGACTGCAGACGAATGTAAATTGGCTTGCTTC
AAGGACTGTGCTTGCACTGCATATGCTTATAATGGGAGTGCTGTATGTTCCTTATGGTAT
GGAGACCTGTTGAGCCTCAGACAACTTTCAAAGGGCGACCCTGACGGACAAACAATATAT
CTCAAACTTGCTGCTTCAGAATTTCAAAATCCTGGAGAAGTGAAGAAGCTAATATTGGTA
ATTGCAACAATTGTTATTTTGGCTGTACTTCTTCTTGCTTCTTACATTGTTTATCGATGG
AGGAGAAAATTCAAAGAGAAAGGTAAGCTGCTTATGCCCATCTCTCTCTTTTGTGTATGC
GTGTGCTTGTTGTGTTAA
>LITCHI013287.m5
ATGTCAAGTAGGAGGGTTTCTTTATGGATTTGTTGGCTGATTTTCTCTTTCTTTTGTATG
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CACTCACAAAGCTTGGTATCTTCAGGTAATAACTTTGTGTTGGGCTTTTTTAGAGCAGGA
AATTCAAATGGTTTTTATGTGGGGATATGGTACAAGAAAGTTTCAGAACAAACTGTAGTC
TGGGTAGCTAACCGAGACCAACCGATGAGAGGTAACTCAGCTGTGCTTACTATTAACAAT
GAGGGGAATCTTGTGATAGAGGATGGTAGGATTACATATAGAGTGAGTGAGAGCTCAGTG
AGCCAGAACACAAGTGCCCTTTTACTAGATTCAGGGAATCTTGTTTTAAGAAATGAGAAG
TTAGATATATTGTGGCAGAGCTTTGACCACCCTTCAAATACTTTGTTACCTGGAATGAAA
ATTGGTTATAGTAACAAGGATGGGAAAGTATGGTCACTAACATCATGGAAAAATGCAGAA
GATCCTGACCTTGGGGCTGTTGAGCTGAAAATGGAACCTAAGCAGCCAAATGAACTTTTC
CTTATGAGGGGTTCTCAAATGATTTGGAGAAGTGGGGTATGGCTTTGGCATGAGAGCAGA
TTCTCCCTAATGCCTAAACATAGGTTCTTTCATTACTTGAACTATAGGTTTCATACTGAT
GAAAACAAAACCTACTTCACCTACTCTGTTGTTAATTCGTCTGTAATAGTTAGATATGTT
CTTGATATATCTGGACAATTTGAACAATTGAATTGGTTAGAGGATGCAAAGGGGTGGTTT
ATGTTCTGGTCTCAACCAAGAGATGCGTGTAATATATATGCTTATTGTGGTCCGTTCACC
AGCTGCAGTCGTGATAGTGTATCGTTCTGTCAGTGCTTGCGTGGTTTTAGGCCTTCAGAT
GGTTCGAAACAGTTGAATCCGTCTGTTGGGTGTGTTAGAAGAGTACCATTGCAGTGTGAA
AATAGTTCTTCTGCTAATGGTGATGAAGACAGATTCTTGAAGATGAAGAATGTAAAATTT
CCTTTCAGCCCAAAGGAATCGAAACTTCAGACTGCAGACGAATGTAAATTGGCTTGCTTC
AAGGACTGTGCTTGCACTGCATATGCTTATAATGGGAGTGCTGTATGTTCCTTATGGTAT
GGAGACCTGTTGAGCCTCAGACAACTTTCAAAGGGCGACCCTGACGGACAAACAATATAT
CTCAAACTTGCTGCTTCAGAATTTCAAAATCCTGGAGGTAATTTCATTCGTTAA
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>LITCHI008666.m1
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CAATTATAATTAGGCGCAATTAAGGGGAGTTTGTCCTCATCTTAAGCAAAGTTACTGAAA
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CAGTGAAGCAAGTCTACCTCTACAAACTCAGTAACCACCTTAAGACCTGCTTGGACTGCG
AACTCACTTTTCTCTCCTCTGTCAACCACCCCAACATCATTCGCCTTTTCCAAGTCTTCC
AGACTCAAAATTGTAAGTTCCTAGTAATTGAGTTTTGTCCTGGGGGAAATCTGGCTTCCT
ATATTCGACGACATGGAAGAGTTCCACAGAATACTGCTAGGAATTTCATCCAGCAGCTTG
GAGCTGGTTTGGAGGTTCTACACCCTCGACACATCATTCACAGAGACTTGAAACCAGAGG
TAAGACAAGTTTTAAGTATGCACACTAACAATGATGCATTGTTGTTATGTCCTAAATTCT
ACCTATTTGGCATCTGTTCACTGCCAAATAGGTCGCTTTTGGTGGAGCAGAACATTCTAC
TATCTGGTTTGGAGGGTGATTTGGCGCTGAAAATAGCTGATTTTGGCCTTTTAAGTAATC
TACATCCCGGCGAGTATGCTGAGAAAGTTTGTGGGTCCCCTTTATACATGGCTCCTGAGG
TTGACATGTGGAGTGTTGGTGCCTTTCTTTTCCAGCTTCTTAATGGTTATCTGCCTTTCT
GTGGTCAGAATAATGTGCAGTTGCTGCAGAATATCAAGTCATGTACACATCTTCCATTCT
CCCAGCTTATCCTTCCTCAGTTGCAACCAGACTGCCTTGAATTGTGTTTGAAATTGCTTT
CTACTAATCCAGTGGATCGTTTTTCCTTCAATGAATTCTATCAGCATAGATTCTTGAGAA
GAAACTGAGAAACTACAAATAACGTTTGATGTCTCATGAAGGAGGCTTTCCTTGTAGATT
AAATTGGTCATCATCAGTTCCAATATATCAAGGTTATGACACTATGTTGTACACTAAGTT
TTGGACTTCTGATTTCTTCCCTGCTTCTCAGACAATGATAGCAGTTTTATATTTTACACT
AAGGTTTTCTTTATTGTTTCTATGAGCAAATGGTCTTCATTTCTTATATTATCAAGTTAA
AGACAGTGCTAAAGTTCAGTCAAAAAATTAACTAATTTCCAATGTATCATATTAAAAACA
AGGATACTGTATTGATTGCACTTCTTGCAAGAGCTTTAATAACATAGAGAATTTGTCAGG
AAGTAGTGGGGATTTGTAATTTGTGGGAGGTTTTGCCTTTTCAAGAGATAATTGCATGTT
GTAGAGGTTGTTACATACTTATGTACATCATAGTGTATAGGAAAATCTACCGTGACATGT
TGCTTTTCTGTTACATTGACCATAAGTTTGTATCTAAAATTTAAAGTTATTTTAGATCTT
TAAATAGAAGATAGGTAAGTGTCCCCTTCTGTTGTGGGTATTTTTGAGATTACATAAGTG
GG
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>LITCHI007074.m1 -  Up_Stream_Len 2000
TTTTTTAATTTTCTTCATATCAATTTTTATTGTCCATCTTAAAATGGAAATTAACTTTTT
AATTTATTTTATTTTAAAGTTTTAAAATTTATATTTTAAAAAATTAAAAATATGATCAAA
AGATAATTTTACCCCTCGATCTGTTAACTCTAATAGAAATAAGCTAACGGCATGAGGGTT
TATTGTAATAAAATTTAAAACTTGATTCCGTCTGTAATTATTTTTAAATGAGATAACTAA
ATTATAATTTATTCTTATTTAAAATATGCAGCATTTTTATGCGGTTAGAATCGAGAAACA
ATTTTGACCTATAAAATAAATACCTACATCGATGCTAATGGAAAAAAATCAGCAAACAGC
ATAGGGGTTAAAATCTATCTTTCAAAGATAGGCTTGCAAATCTATTAGGATTAGCACTTG
ACTATAACTAGCTGTCTCCAAATATTTAAATTAAATAGGTTTTATTATTTCATCAGTTTC
TTTTGAAATTAATTAAATTCGTTTGTCTTGATGGTATTACATAAGTTACTTTAAACATCT
TGAACATCTTGTTAATCAATATTCCAATTGGTGTACCTTTCATTGCCACATTATTGGCTA
TTATTCTATTCAAATAGTATTCACTCTTTTTTTTTTTCACATTCGTCACTACGTGGGACC
CATTGTGTGTAACTTTTTTTAAAAGATCATCATGTGTAATTAATTATCAATATGTGAAAG
ATTTCTATATATCTATGTATTTATGAAGTAAATCTCCCCATTAAAATAAATATATGAACA
GTTAATATGAGATTTAATTGAGAATTATAATTTTTAGTAGAATTTCAATATAAATAATGT
TTTTTTTCAAAATTATGTTTAAATAATATGATAAATAGGTTGTACCTCCCATACAAAATC
AAGAGACATGTTTCTTACCGTGCTTATGGTTATATTATTTGAGTCTTCTTTCCTTTAAAT
ATGTTTAAAAAAAAAAAAATCCCACTTGGGGACAGCATGCATTTTAATTTGCACAAAAAT
ATTTCTTTTCATGAATCCCTTTTGATTGGGAATAGTCTTTCAAACCGTATCACCAATATT
ATATCTAATTGATCTTCAAAATTCCTGAATATGTTCTAAATACTGTTATGGTACTTAAAA
AAAAAAAAAAAAACCAGGAGAGAAAATGAAAAAAAAATAAATTTATACGGACATAAACCA
AGTCCATTAATTGACGGTCACTCTCCCTTGCTCACTCGTTTTCCACAACGGTTTCTTCTC
AGAGGACTCGGCTTTTACAACCATCCGATGACCTACTCTTTGATTTCCAATTCTCGCATT
CACTGGCAATTTCTCTGATCAGGTACTCTTCTGATTTTGTATTTTTCTTTTTCTCTTAAA
ATTCGTCCTTTGAAATTCGATGCTCAGATATCATTTCTTGATTCACGTGTTGAATTGATT
AAATTATGATGCGACTCTCTTGTTAATTTTCGTCGATTTTGTTTGAATCCGCAGAAATGA
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