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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI013083Chr22422493324227910-Squamosa promoter-binding-like protein 5

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI013083.m169152PF03110.17SBPDomain87.36.70E-25
LITCHI013083.m269142PF03110.17SBPDomain106.95.30E-31
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>LITCHI013083.m1
ATGGATTGCACAAGCCTTGAAGGAAAGTATTCCGTAAAGGAAAAGATTGTCAAGGATTGC
ATTGTTCAAGAAGACATGGAGAATGACATGGAAGAAGAAGAGGATCAAGTAAGTGCCGAT
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>LITCHI013083.m2
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>LITCHI013083.m1
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>LITCHI013083.m2
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>LITCHI013083.m2
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TCATTCACAAGTTCAATTATTTCAATGCTGAGTTTTTCTGGAATCCTTCTTTTTATTAAA
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>LITCHI013083.m1
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TATCAATTACCAGATAACATAAGTGTATTAATGTCATCATTAACAACAACTGGAGTAAGA
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TCATCACCCTGTCTAGCATGTTTTATATTTAAGTGGCAGCGCTGGTCAATGAGCTCAAAT
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AATGCAATTTATCCTAGTATGTACATCCTGGTGATTATTGATGAACAATACAAGAATAAT
TTGTGTGAACCTCATATTCGTATATATTTCATGCTCTGGACCACCTTGGGTTGCAATTAT
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AAAAACAAATTTACAGTTCTCCTTTTTAGTTTCTAATCATTTTAAATCACTCAGAAACAA
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CTTCACTACTTCAGGTTCCAACACTTTCATCATATATACTTATATATATATATATATATA
TACACACACACACATCACTCCATTGTTATAATCGTCTTCTAGAATGGATTGCACAAGCCT
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TAAAATAGTTTCTAAGGTATTTATGAAAACATAAAGACTGTAATACACTTTCAAGCTAAT
GTTTTGGCTTCTAGTGTAACCCGGGCATGTTAAGACTTTAACAGGGACTAGGATTTAAGA
GTTCCTGTATTCTATGGAGTTGAATGTGAGCTGAATGTTAGTTCCTCTAGTTATTGAACT
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CTCAAGTTGCTGATGAAAACAGCAGTTTTCTACTCCAATACTTTAGAGATTTATCAAGTT
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TTTTTATGCTTTAATCTAAAATCAAGTGGATATAAATGATTTCAAGATTCCTCATAAGCC
TTCTCTAAATTTCTGAAATTCATCTAAACCTAGCCTGTAGGAGAAACTTCAGCTGGTTAG
CAACTGTCTGAACGTTTCTAGTTCCATTGTGGTGCATCCACCTAACGTTTAGAATTTTCG
CTTAGCGATGTTGCTTGGTTAACTCCTCTCTTTAAACTTTTTAATATTCTTCTTTGCAAT
TTGTGTTTGAATAATTTTTTTTTTCTTTTTTCATTCACAAGTTCAATTATTTCAATGCTG
AGTTTTTCTGGAATCCTTCTTTTTATTAAATTTGCATCAGCAA
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>LITCHI013083.m2 -  Up_Stream_Len 2000
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TTGCAAAGCTGTGAGTAGACTAAATGGTTTCATTGAATCATGAACTGATTGCTAGGACTG
TTTCTTGACTAATTGACTAACTAAATTACATGAACAAATGAGCTGGATCTCAGATATCAA
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TGTATTAATGTCATCATTAACAACAACTGGAGTAAGACATAAGCTAAAACAAACAAACAA
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TTTTAGTTTCTAATCATTTTAAATCACTCAGAAACAATAAAATGTAGCTAGTGGTCCTAC
CCCATCTTTTTCACCTTTTTCCTTACACTCTCTTTACCTTCACTACTTCAGGTTCCAACA
CTTTCATCATATATACTTATATATATATATATATATATACACACACACACATCACTCCAT
TGTTATAATCGTCTTCTAGA
>LITCHI013083.m1 -  Up_Stream_Len 2000
ATTCCCAGGTTTTGTTACAAACTTGAAAAGAAAACAAGTCTTTATTTCTAAGTAAAAATT
TTGCAAAGCTGTGAGTAGACTAAATGGTTTCATTGAATCATGAACTGATTGCTAGGACTG
TTTCTTGACTAATTGACTAACTAAATTACATGAACAAATGAGCTGGATCTCAGATATCAA
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CAGCAAAGAATTAGGCATGCATACACTCAAACGTAATGATTTCCGATTCGTCAGAAACTT
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GTCGTGTAAAACTTGGATTGCAACCACAGCATAAAAAAAAAACAAATTTACAGTTCTCCT
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CTTTCATCATATATACTTATATATATATATATATATATACACACACACACATCACTCCAT
TGTTATAATCGTCTTCTAGA
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>LITCHI021987.m1 GenomeSequence - 
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ATGACAATGGCTCCAACTCCGAGGTTGCCTCCCATGTTACCACAGCTGTAAAACGAACCG
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AATTAAGGGGAGAATTAATGGGTAATTAAGTACAATGGGAGGGGATTAATATTCTTTTTA
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TCTGTTGCCGAGTCAGCATCCAATCCACACTTGCCATTGGATCTCCTCTTTTCCTGGGCT
CACACTTCGCCACGTGTTCTAATCCGGGTTATGCGGCGCCCAGTAAAACATCTCCGATCC
TTGCCGGAATCTCTTAATTCCGGTGAACTCTCAATTAAATCTAATTTACAAAAAACAAAA
AAAAAAAAAAAAAAACTCAAACGTTATTTAACTAATTTACGGGGTTGTGTGGATCCTATA
AAAGAGTTGGTCATCTTTCCACCTCGACACTTCGTCTTCTCCTCTCTCACTCTCTCAAAA
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ATTAGAGGTCCTTTAAGAGTTACAAAAATCTCCCACAAATAGCAGGACCTGTCTCCGATA
AGTTACCTACAAAAGCATTGTCTGTCCAACAACGGTGCCCGTTTCATTTCAAGACATTTA
TTCTCTTTTCCTTTCCGGTAAAGCAACAACCTCCCTAAAAAACAAAACACTGTTACAGTG
ACACCCTTTTGCTTTTCTTCCATCAAGGCATCAACTTTCAGTCAACTTTTTTTTCATATA
TATACATATATTTATATTTTCAGCTCGAACAAGAAGCTCTAGTCCTCTCTCTCTCTCTCA
CTCACTCACCATATCTCTCTGCTTTTGTGGTGTATGTATGTGAGTAACTTTCGTTGAAAT
TTCTTGGTTCTTTTAATAGCTTTTTGAGAGATTATTCTATATATTCAATTCATATAATGG
TAGGTTTCTCTTTCTCTCGGTTTCAAGCTTCCCTTTAACGGGTTCTTTGGTTTCCTTTAT
TTATCTCTCTTTATTCTCTCCTCGTGTGTGTCTACTCTCAAAAGAATATCTCTTCTCTTC
TCACCCTTTTTCCCCATTCTATTTCACCACATACACGCTCGCTTTCAATGCGAATCTGAC
CAGACCAATAACCCATAATACCACTCTCTCTCACTCACTAGAAAAGAAACACTATCATGG
AACAAAGTTTTGTCAAGTACACTGAACACTGTCACCAGACGAAGCTCATGACCCGTTTTT
CGACGACTTGTCAGGAAATGAAGCAACCCAGAGTCGTGAGAGTCTCGGTGACTGATGGGG
ACGCAACAGATTCGTCCAGTGATGAAGAGAGTGAGGTTTGTTACTTGAGGCCTCGAGTGA
AGAGGTTTGTTAATGAGATTACCATCGAGACGTCGTCGTCGTCTTCTACGACGTCGTGTT
CGAATGAGACTCACGATGGTGGTGTGGTTTCGAGGCGGAGGTTTTCGAAGAGTCGGAAGA
GGGCGGGTGGGAAGGTGGGGGCGCCGGGGAGTCTGAAGACGGCGGCGGCGGCGGCAGGTG
GGAAGAAGTTTAGGGGTGTACGGCAGCGGCCGTGGGGCAAATGGGCTGCGGAAATCAGAG
ACCCTCTCCGCCGTGTGCGGCTGTGGCTTGGGACTTACGATACGGCGGAGGAGGCTGCTA
TGGTGTATGATAACGCCGCCATTCAGCTGCGTGGACCCGACGCGCTCACCAACTTCGCTA
CTCCTCCTCCTCCACCTCCGCCGCAAGACAAGCAGGTCGTTGTCAGCTCCGGCTACAACT
CCGGCAACGAGTCTCACAACCACCACCACCTGGCCTCTCCGGTCTCCGTCCTGCGCTGCC
CCTCTCCGTCCAACGAAGAGGCCGACTCTCATCAGTCTCAGACCAGCGCCAAAGACTGCA
GAGACGAATCCAGTGTGTCGGAGAGCTTCTCCGACCTCTCCGCTTACTCCTCCACTTTCG
ACTCCGTCTTCCAAAACGACGTCGTCTTCGATTTCAAATCCTCCGCCCCGGACTTGTTCG
AAGAGAACAATAACATTTTCGGCGACGATTTCGGCGAAATGTTTTTATCTTCGGGAATGA
ACTTCGGTTTCGGATCCTCAAGTTGGCACATGGATGACCATTTTCAAGATATCGGGGATC
TATTCGCGTCCGATCCTCTCCTCGCCATTTGAATCTCTCTCTCACTTATAGTCTCGCCCG
AGTAAATGCCTGTTTCTCGGCTAGTTTTGTATCGGCGGGAACCCAAATGAATATATCGGA
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ACTTTATTACTATATTAATATGAACTCCGTCACAGTAACGGTGACGGACGAGTTTGTCTA
CGTGTTGTGGTCTTTTTTTTGTTTTCCTTTTGTTTTTGCACTTTTGGGTCCATTTTTGTC
AAGCACCTGTCCTTGCAGGTGACTGGAAAACATGTGTGACGTGTCTCTGATATTTGTATT
TGGCAAACAAACTAGATACTGGTTATAAATTTTATATATTTGTATAATTTGGTTTTCTAA
TCACTGACCTTATTTTGCAAATTTTTTATAAAAGAAAAGAATGCACATTCATGTGTAAGA
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CCTGAAGTGGAGAAGCATTGATGCAAAACATCTAGAACTGCACTGATATGACACATACAA
TTATTGGGTTTTTATTCGTAAGTAGGTTTTTTTTTTTAAGACTGGAA