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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI013065Chr224016531;2401737324019695+Protein CUP-SHAPED COTYLEDON 2

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI013065.m115141PF02365.18NAMFamily163.82.60E-48
LITCHI013065.m2277PF02365.18NAMFamily93.21.90E-26
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>LITCHI013065.m1
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CACCCAACCGATGAAGAGCTCATCATCTACTATCTTCTCAAGAAAGTTCTTGACAGCAAC
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>LITCHI013065.m2
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>LITCHI013065.m1
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GGGTGTTTTTGTTTTTTGCTTTGGTTGTTTTAGGTTGCAAGCACAAAGCCATTGTTGTTT
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TCCACCCAACCGATGAAGAGCTCATCATCTACTATCTTCTCAAGAAAGTTCTTGACAGCA
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CTGGGAAGGCAAAGATGGGTGAGAAAGAATGGTACTTCTTCAGCTTGAGAGACAGGAAGT
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AAGATAGGGAGATTTACAGCTCCAAGACTTGTGCTCTCGTTGGCATGAAGAAGACTCTTG
TCTTCTATAGAGGTAGAGCTCCTAAAGGAGAGAAAAGCAACTGGGTCATGCATGAATATC
GCTTGGAAGGCAAATTTGCCTACCACTATCTCTCTAGAAGCTCCAAGGATGAGTGGGTGA
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ACAGCCACACTCCCTCGCATGAGCACGTGTCCTGTTTCTCCACCATTGCAGCCGCTGCCT
CAGCTGCCGCCTCCGCCGCCACTGCTTTCAACCAGCCCACCTTCGACCTCTCTTCCCCAC
CACCTTCCATGATCAACTCCTCCGCCACTACCTCCACTGACCTAGCTGCCGGTCGGTTCT
CTAGAAACGCTGGCATGTCTGCTTTTCCAAGCTTGAGGTCTCTCCAGGAGAATCTTCAGC
TGCCTTTCTTCTTTTCAGCTCCTTCAATGTCGCCACCTTTTCAGGGTGGTGGTAATGTTG
GTGGCTCCAACTGGCCAATGATGCATGACATGGCGGGGATTGGTGGTGGCCCTTCCGGTG
GTGGCGGCAACAGCAGCGGTAGGATGCCTGTAGGTTCCACTGAACTCGATTGCATGTGGA
CTTACTAAGAGTCAACTTTCAAGAAGCCATGAAAATCTCTCATTTTTCAGTAGAAAATTG
GTGGTGGCGGCGGCAACAGCAGCGGTAGGATGCCTGTAGGTTTCACAGACCTCGATTGCA
TGTGGACTTACTAAGAGTCAACTTTGCAAGAAGCCATAAAAGTTTCTCATTTTTCACTAG
AAAATTGGGAGGTTATTTTCAATTTCTTGTGCATCAACTCTAGACATCTAAGTTTCAATC
AATGTTCTATGTTATCAGTTTTATTGAATCAATGTTCTATGTCATTAGTTTTTTTATTTA
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GTGTATGTTTTTTCTCTCAAGGGGTACCTCATGTGGTTATTAATTAGTTGGTACTTGTTT
GTAGTGTTTAAGTAATTAAAATTCTGAATCAGAGAAGATCATCTTCTGATTGTCTGTTAT
ATATTGATGTGCATGTTCTGATGCTTAGAAAGTGAC
>LITCHI013065.m2
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TTGACTAACTTGAAAGAGTTGATTGGTGACGCATTTGGTTGTTTAAATGGTGTTGGGTGT
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GTCTTCTATAGAGGTAGAGCTCCTAAAGGAGAGAAAAGCAACTGGGTCATGCATGAATAT
CGCTTGGAAGGCAAATTTGCCTACCACTATCTCTCTAGAAGCTCCAAGGATGAGTGGGTG
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ACCAACGCGAACACTGCAGCTGCCGGTGTTGGTGCAGGTGCCGGTGACAGCTGCTCTTTC
GACAGCCACACTCCCTCGCATGAGCACGTGTCCTGTTTCTCCACCATTGCAGCCGCTGCC
TCAGCTGCCGCCTCCGCCGCCACTGCTTTCAACCAGCCCACCTTCGACCTCTCTTCCCCA
CCACCTTCCATGATCAACTCCTCCGCCACTACCTCCACTGACCTAGCTGCCGGTCGGTTC
TCTAGAAACGCTGGCATGTCTGCTTTTCCAAGCTTGAGGTCTCTCCAGGAGAATCTTCAG
CTGCCTTTCTTCTTTTCAGCTCCTTCAATGTCGCCACCTTTTCAGGGTGGTGGTAATGTT
GGTGGCTCCAACTGGCCAATGATGCATGACATGGCGGGGATTGGTGGTGGCCCTTCCGGT
GGTGGCGGCAACAGCAGCGGTAGGATGCCTGTAGGTTCCACTGAACTCGATTGCATGTGG
ACTTACTAAGAGTCAACTTTCAAGAAGCCATGAAAATCTCTCATTTTTCAGTAGAAAATT
GGTGGTGGCGGCGGCAACAGCAGCGGTAGGATGCCTGTAGGTTTCACAGACCTCGATTGC
ATGTGGACTTACTAAGAGTCAACTTTGCAAGAAGCCATAAAAGTTTCTCATTTTTCACTA
GAAAATTGGGAGGTTATTTTCAATTTCTTGTGCATCAACTCTAGACATCTAAGTTTCAAT
CAATGTTCTATGTTATCAGTTTTATTGAATCAATGTTCTATGTCATTAGTTTTTTTATTT
ATGAATGTGTAAGAAAATGACTACTGTTACCTTGTTTGTAGAATTTTGAATTAGATTCGA
TGTGTATGTTTTTTCTCTCAAGGGGTACCTCATGTGGTTATTAATTAGTTGGTACTTGTT
TGTAGTGTTTAAGTAATTAAAATTCTGAATCAGAGAAGATCATCTTCTGATTGTCTGTTA
TATATTGATGTGCATGTTCTGATGCTTAGAAAGTGAC
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ACAGCTTAAATGTTGGCAGTGAATCTTTTTATCTCCCCTCTTTTTCTATTATAATATCTA
TATATATCCGAAGAAAGCTTTGGTGCCTCATTTGGGTATTTTAAAATTCTGAATTAGATA
TAAAGTTTGTGTTGTATTCTGATTTTAATTAAAAATAGGATTAATGCATATATTTGATTA
TCATGTTGGATTTTCACGTATTCTGTGTTTAGGTTTAAGGTTATCTGCTACTGTACTCAC
AATATTAGTCTCTTGTCTTTTGATTTTACACAATACTCTTTTTTATTGAGTTAATGTAAA
AGCATGATCAATTAATGTAAATTTTTGGTTAAATACTTATCAAAAAACATCTATAAAATA
TTTTATTTATATTAATTTTATCTATTTATTTATGAAATTGAATCTTAAAACTCAATGGGG
TGGCCCAGTGACTTCTCCCTAGCAATTCTCAACCAAGAGTTATGGTGTCAAGTGTTAACA
TTTCTTATCTTATAAAATCCTTTTATTAAAAAAAAAAAAAAAGAAGCAAGTTCTGGTTTT
GAATAGTAGCATCATTAAATGTGGATAATTTTGGTTTAATCCATTATACGTGGAGGTAGA
ATTACGTTTAAATTTATTTGATTGAAGGATAGCTATTCAGCTAAATGTGAGTCTTTTTCT
CTCGTGTTAGGAAGTAGAATTATTAATAATACTGTTTGTTCGGATCCAATTTTAGAGTAT
TATTAAATGATCTCGGTAGACATAAAATGTAATTATAACATAAAAGGAAAATAGCGTATA
TAACATTAAAAGACAGTTACCTACGTAGCATATGAATATCACATTATATAAACCATAAAT
ACATAATAAAATAAATAAATAAGTGAAAGCATATATAAATATATAACTGTAGGTGGCGTG
TAAATACAACGGGGGGGTACGTCTCTGTCAAGTTGATAATTTAATCTTGTACTGTGCTGA
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ATCCACCTTTCTATCTATATTATATAATATTTTCTAACCCAAGAGATATTTGAAAAAAAA
AAACCCAAAATAAAAAAAAAATCACTTTTCTCATAAAAACAACGTTCTGTTCCCAATTTT
GTCCTCATCACTAACACAGAAAAAATTAAATTAAATTAAAAATTCAAAAACAAAAAAAAG
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AAACACACTCTTTTTCTTTTATTATTATTATTATTATTTTTGAGTGAACTCTTTTTCTTT
TATTAAATATATCTTGGTTTTTTGTTTTATACAAATATATGCTCTATGAGTATATAACGA
TATATTACATATTTGATGCGGTGCATTGAATTAAAGTAGGATAATTTTCAATCCACTTAA
TTATTTATTGATTAAATAGGGATGGAGTTTTTCAACCCTATTATTTTCACATGGATGCTA
TTATTTTTCATATATATCATCAATAATGTTAATTTAATTTATTTTATTTAATTCATCCCA
ATTCTGAAGCTCTAACGGTCGCTCGTTATTGTTGTTATTATTATTATTATTAATTAGATA
TTCTCCTATTCTCCGTTCTGAATAGTTGGATTTTACCAAATCCCTATAGAAACCACCCCC
CGGCAGGCCACGATATAAACTCTCTCTCCCTCTCGTTTTCTCAACCGACAAAACAGATCC
AAAGCAAAGTCTCTTGTGGGGTGTTTTTGTTTTTTGCTTTGGTTGTTTTAGGTTGCAAGC
ACAAAGCCATTGTTGTTTTA
>LITCHI013065.m2 +  Up_Stream_Len 2000
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TTTTATCTATTTATTTATGAAATTGAATCTTAAAACTCAATGGGGTGGCCCAGTGACTTC
TCCCTAGCAATTCTCAACCAAGAGTTATGGTGTCAAGTGTTAACATTTCTTATCTTATAA
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GTAGACATAAAATGTAATTATAACATAAAAGGAAAATAGCGTATATAACATTAAAAGACA
GTTACCTACGTAGCATATGAATATCACATTATATAAACCATAAATACATAATAAAATAAA
TAAATAAGTGAAAGCATATATAAATATATAACTGTAGGTGGCGTGTAAATACAACGGGGG
GGTACGTCTCTGTCAAGTTGATAATTTAATCTTGTACTGTGCTGACACGAGATATGAAAC
AGCTTTATCGATCCATGGTGAAAATCTCCCCCTTCCTATTTATCTATCCACCTTTCTATC
TATATTATATAATATTTTCTAACCCAAGAGATATTTGAAAAAAAAAAACCCAAAATAAAA
AAAAAATCACTTTTCTCATAAAAACAACGTTCTGTTCCCAATTTTGTCCTCATCACTAAC
ACAGAAAAAATTAAATTAAATTAAAAATTCAAAAACAAAAAAAAGGCCAATGAAATAAGC
CCCTCTACTGCTTCCCTGCACACTCTCTCACGCACGCACGCATACTCTATACAGGGCTCC
ACACAACACATACATCATCACACCTCTGTCTCTCTCCGTCTCTCTCTCTAGCTATGAGGT
TGGCAGAGAGCACCAGATATCCATCAGAACACGACAGACCAGAGAAAACACACTCTTTTT
CTTTTATTATTATTATTATTATTTTTGAGTGAACTCTTTTTCTTTTATTAAATATATCTT
GGTTTTTTGTTTTATACAAATATATGCTCTATGAGTATATAACGATATATTACATATTTG
ATGCGGTGCATTGAATTAAAGTAGGATAATTTTCAATCCACTTAATTATTTATTGATTAA
ATAGGGATGGAGTTTTTCAACCCTATTATTTTCACATGGATGCTATTATTTTTCATATAT
ATCATCAATAATGTTAATTTAATTTATTTTATTTAATTCATCCCAATTCTGAAGCTCTAA
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GTGGGGTGTTTTTGTTTTTTGCTTTGGTTGTTTTAGGTTGCAAGCACAAAGCCATTGTTG
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TTTTGTTGACTAACTTGAAAGAGTTGATTGGTGACGCATTTGGTTGTTTAAATGGTGTTG
GGTGTGCAGGGAAGGCAAAG
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>LITCHI013065.m1 GenomeSequence + 
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TTATTATTATTATTATTATTTTTGAGTGAACTCTTTTTCTTTTATTAAATATATCTTGGT
TTTTTGTTTTATACAAATATATGCTCTATGAGTATATAACGATATATTACATATTTGATG
CGGTGCATTGAATTAAAGTAGGATAATTTTCAATCCACTTAATTATTTATTGATTAAATA
GGGATGGAGTTTTTCAACCCTATTATTTTCACATGGATGCTATTATTTTTCATATATATC
ATCAATAATGTTAATTTAATTTATTTTATTTAATTCATCCCAATTCTGAAGCTCTAACGG
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TGAATAGTTGGATTTTACCAAATCCCTATAGAAACCACCCCCCGGCAGGCCACGATATAA
ACTCTCTCTCCCTCTCGTTTTCTCAACCGACAAAACAGATCCAAAGCAAAGTCTCTTGTG
GGGTGTTTTTGTTTTTTGCTTTGGTTGTTTTAGGTTGCAAGCACAAAGCCATTGTTGTTT
TAATGGATTCCTACCGTCATGTTGATAACAACGAAACCTACTTGCCTCCCGGGTTCAGGT
TCCACCCAACCGATGAAGAGCTCATCATCTACTATCTTCTCAAGAAAGTTCTTGACAGCA
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CTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCCGGTTTTGTTTTGTTTTGTTTT
TGTTGACTAACTTGAAAGAGTTGATTGGTGACGCATTTGGTTGTTTAAATGGTGTTGGGT
GTGCAGGGAAGGCAAAGATGGGTGAGAAAGAATGGTACTTCTTCAGCTTGAGAGACAGGA
AGTACCCAACCGGGTTGAGGACCAACAGAGCCACTGAAGCTGGTTACTGGAAGGCTACTG
GCAAAGATAGGGAGATTTACAGCTCCAAGACTTGTGCTCTCGTTGGCATGAAGAAGACTC
TTGTCTTCTATAGAGGTAGAGCTCCTAAAGGAGAGAAAAGCAACTGGGTCATGCATGAAT
ATCGCTTGGAAGGCAAATTTGCCTACCACTATCTCTCTAGAAGCTCCAAGGTAGACACAT
ACACATCATTTCTCAATGTATTTCAGTTTTTGTTTTCTCGGGGGGCTTGAGTGGTCAAAA
TCATGTAATGAGAAGGGTAAATTTAATGGGGTTGGATGTAGACTAGGCTTTACAGTTGAG
TTTTTATAGCTAAGTTTGGTTTACTGTCGAAAATAGTACAAAGTACTATTGTTCTTCTTC
TCTTAGCTTCGTTTTGCCCCTCATACCACACACAGGCCATTGGTCGTTGATAAGTTTGTG
GTCCTTGTTATTGTAACTACACCAATTGAAGTTAAGTTTTGATTATCGTTCCCTATGTTT
TGTCTTCTTTCTTTGAAGAAGCTGAAAAAGGTATGTTTATTGTTTAATAGTATCAGCATT
GATTTGCAGAATATAGTTTAACCTTTTCTCATTGCTCTTATCGTTGAGGACTATTTGATC
TTGCACCTGTTCATCTTCACTGATGTATACTCAAATAGTGTCGTCTTTTAGTGCATGTTT
GTGAAGTACTTAATGCTACAGTGTGTAATCTCTAATTTGTTCGTTAAGTGATTTTGTTTT
TTGTGTTTAATTTTTTAGATTATATGGTTATCATCTTTTGTTTGAATGATGTCTTTTTAT
AATTCATATAAATGGGTTTGCTTCTTGTTTAAGTTAAATGAGTTGTTTGAAGTGTTTAAA
CAGTTTTTTTTTTTTGTTTGACATTTGTTTGATGTAACTAGTCTTGTTTTTGTCAGGATG
AGTGGGTGATTTCAAGGGTGTTTCAGAAGTGTGGTGGTGGCGCCTCCCCTACCACCACCA
CCACATCCACCAAGAAGACGAGGCTGAGCTGCACCACCACAACCAGCTCCACCATCAACC
ACTCCTACCCAGAACCAAGTTCTCCTTCCTCGGTCTCTCTCCCGGCTCTTCTTGACCACC
CATCAAACACCAACGCGAACACTGCAGCTGCCGGTGTTGGTGCAGGTGCCGGTGACAGCT
GCTCTTTCGACAGCCACACTCCCTCGCATGAGCACGTGTCCTGTTTCTCCACCATTGCAG
CCGCTGCCTCAGCTGCCGCCTCCGCCGCCACTGCTTTCAACCAGCCCACCTTCGACCTCT
CTTCCCCACCACCTTCCATGATCAACTCCTCCGCCACTACCTCCACTGACCTAGCTGCCG
GTCGGTTCTCTAGAAACGCTGGCATGTCTGCTTTTCCAAGCTTGAGGTCTCTCCAGGAGA
ATCTTCAGCTGCCTTTCTTCTTTTCAGCTCCTTCAATGTCGCCACCTTTTCAGGGTGGTG
GTAATGTTGGTGGCTCCAACTGGCCAATGATGCATGACATGGCGGGGATTGGTGGTGGCC
CTTCCGGTGGTGGCGGCAACAGCAGCGGTAGGATGCCTGTAGGTTCCACTGAACTCGATT
GCATGTGGACTTACTAAGAGTCAACTTTCAAGAAGCCATGAAAATCTCTCATTTTTCAGT
AGAAAATTGGTGGTGGCGGCGGCAACAGCAGCGGTAGGATGCCTGTAGGTTTCACAGACC
TCGATTGCATGTGGACTTACTAAGAGTCAACTTTGCAAGAAGCCATAAAAGTTTCTCATT
TTTCACTAGAAAATTGGGAGGTTATTTTCAATTTCTTGTGCATCAACTCTAGACATCTAA
GTTTCAATCAATGTTCTATGTTATCAGTTTTATTGAATCAATGTTCTATGTCATTAGTTT
TTTTATTTATGAATGTGTAAGAAAATGACTACTGTTACCTTGTTTGTAGAATTTTGAATT
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TACTTGTTTGTAGTGTTTAAGTAATTAAAATTCTGAATCAGAGAAGATCATCTTCTGATT
GTCTGTTATATATTGATGTGCATGTTCTGATGCTTAGAAAGTGAC
>LITCHI013065.m2 GenomeSequence + 
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TTGACTAACTTGAAAGAGTTGATTGGTGACGCATTTGGTTGTTTAAATGGTGTTGGGTGT
GCAGGGAAGGCAAAGATGGGTGAGAAAGAATGGTACTTCTTCAGCTTGAGAGACAGGAAG
TACCCAACCGGGTTGAGGACCAACAGAGCCACTGAAGCTGGTTACTGGAAGGCTACTGGC
AAAGATAGGGAGATTTACAGCTCCAAGACTTGTGCTCTCGTTGGCATGAAGAAGACTCTT
GTCTTCTATAGAGGTAGAGCTCCTAAAGGAGAGAAAAGCAACTGGGTCATGCATGAATAT
CGCTTGGAAGGCAAATTTGCCTACCACTATCTCTCTAGAAGCTCCAAGGTAGACACATAC
ACATCATTTCTCAATGTATTTCAGTTTTTGTTTTCTCGGGGGGCTTGAGTGGTCAAAATC
ATGTAATGAGAAGGGTAAATTTAATGGGGTTGGATGTAGACTAGGCTTTACAGTTGAGTT
TTTATAGCTAAGTTTGGTTTACTGTCGAAAATAGTACAAAGTACTATTGTTCTTCTTCTC
TTAGCTTCGTTTTGCCCCTCATACCACACACAGGCCATTGGTCGTTGATAAGTTTGTGGT
CCTTGTTATTGTAACTACACCAATTGAAGTTAAGTTTTGATTATCGTTCCCTATGTTTTG
TCTTCTTTCTTTGAAGAAGCTGAAAAAGGTATGTTTATTGTTTAATAGTATCAGCATTGA
TTTGCAGAATATAGTTTAACCTTTTCTCATTGCTCTTATCGTTGAGGACTATTTGATCTT
GCACCTGTTCATCTTCACTGATGTATACTCAAATAGTGTCGTCTTTTAGTGCATGTTTGT
GAAGTACTTAATGCTACAGTGTGTAATCTCTAATTTGTTCGTTAAGTGATTTTGTTTTTT
GTGTTTAATTTTTTAGATTATATGGTTATCATCTTTTGTTTGAATGATGTCTTTTTATAA
TTCATATAAATGGGTTTGCTTCTTGTTTAAGTTAAATGAGTTGTTTGAAGTGTTTAAACA
GTTTTTTTTTTTTGTTTGACATTTGTTTGATGTAACTAGTCTTGTTTTTGTCAGGATGAG
TGGGTGATTTCAAGGGTGTTTCAGAAGTGTGGTGGTGGCGCCTCCCCTACCACCACCACC
ACATCCACCAAGAAGACGAGGCTGAGCTGCACCACCACAACCAGCTCCACCATCAACCAC
TCCTACCCAGAACCAAGTTCTCCTTCCTCGGTCTCTCTCCCGGCTCTTCTTGACCACCCA
TCAAACACCAACGCGAACACTGCAGCTGCCGGTGTTGGTGCAGGTGCCGGTGACAGCTGC
TCTTTCGACAGCCACACTCCCTCGCATGAGCACGTGTCCTGTTTCTCCACCATTGCAGCC
GCTGCCTCAGCTGCCGCCTCCGCCGCCACTGCTTTCAACCAGCCCACCTTCGACCTCTCT
TCCCCACCACCTTCCATGATCAACTCCTCCGCCACTACCTCCACTGACCTAGCTGCCGGT
CGGTTCTCTAGAAACGCTGGCATGTCTGCTTTTCCAAGCTTGAGGTCTCTCCAGGAGAAT
CTTCAGCTGCCTTTCTTCTTTTCAGCTCCTTCAATGTCGCCACCTTTTCAGGGTGGTGGT
AATGTTGGTGGCTCCAACTGGCCAATGATGCATGACATGGCGGGGATTGGTGGTGGCCCT
TCCGGTGGTGGCGGCAACAGCAGCGGTAGGATGCCTGTAGGTTCCACTGAACTCGATTGC
ATGTGGACTTACTAAGAGTCAACTTTCAAGAAGCCATGAAAATCTCTCATTTTTCAGTAG
AAAATTGGTGGTGGCGGCGGCAACAGCAGCGGTAGGATGCCTGTAGGTTTCACAGACCTC
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TTCAATCAATGTTCTATGTTATCAGTTTTATTGAATCAATGTTCTATGTCATTAGTTTTT
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CTTGTTTGTAGTGTTTAAGTAATTAAAATTCTGAATCAGAGAAGATCATCTTCTGATTGT
CTGTTATATATTGATGTGCATGTTCTGATGCTTAGAAAGTGAC