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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI013065 | Chr2 | 24016531;24017373 | 24019695 | + | Protein CUP-SHAPED COTYLEDON 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI013065.m1 | 15 | 141 | PF02365.18 | NAM | Family | 163.8 | 2.60E-48 |
LITCHI013065.m2 | 2 | 77 | PF02365.18 | NAM | Family | 93.2 | 1.90E-26 |
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>LITCHI013065.m1 ATGGATTCCTACCGTCATGTTGATAACAACGAAACCTACTTGCCTCCCGGGTTCAGGTTC CACCCAACCGATGAAGAGCTCATCATCTACTATCTTCTCAAGAAAGTTCTTGACAGCAAC TTCTCTGGTCGTGCCATTGCTGAAGTCGACCTCAACAAGTGCGAGCCCTGGGAGCTACCT GGGAAGGCAAAGATGGGTGAGAAAGAATGGTACTTCTTCAGCTTGAGAGACAGGAAGTAC CCAACCGGGTTGAGGACCAACAGAGCCACTGAAGCTGGTTACTGGAAGGCTACTGGCAAA GATAGGGAGATTTACAGCTCCAAGACTTGTGCTCTCGTTGGCATGAAGAAGACTCTTGTC TTCTATAGAGGTAGAGCTCCTAAAGGAGAGAAAAGCAACTGGGTCATGCATGAATATCGC TTGGAAGGCAAATTTGCCTACCACTATCTCTCTAGAAGCTCCAAGGATGAGTGGGTGATT TCAAGGGTGTTTCAGAAGTGTGGTGGTGGCGCCTCCCCTACCACCACCACCACATCCACC AAGAAGACGAGGCTGAGCTGCACCACCACAACCAGCTCCACCATCAACCACTCCTACCCA GAACCAAGTTCTCCTTCCTCGGTCTCTCTCCCGGCTCTTCTTGACCACCCATCAAACACC AACGCGAACACTGCAGCTGCCGGTGTTGGTGCAGGTGCCGGTGACAGCTGCTCTTTCGAC AGCCACACTCCCTCGCATGAGCACGTGTCCTGTTTCTCCACCATTGCAGCCGCTGCCTCA GCTGCCGCCTCCGCCGCCACTGCTTTCAACCAGCCCACCTTCGACCTCTCTTCCCCACCA CCTTCCATGATCAACTCCTCCGCCACTACCTCCACTGACCTAGCTGCCGGTCGGTTCTCT AGAAACGCTGGCATGTCTGCTTTTCCAAGCTTGAGGTCTCTCCAGGAGAATCTTCAGCTG CCTTTCTTCTTTTCAGCTCCTTCAATGTCGCCACCTTTTCAGGGTGGTGGTAATGTTGGT GGCTCCAACTGGCCAATGATGCATGACATGGCGGGGATTGGTGGTGGCCCTTCCGGTGGT GGCGGCAACAGCAGCGGTAGGATGCCTGTAGGTTCCACTGAACTCGATTGCATGTGGACT TACTAA >LITCHI013065.m2 ATGGGTGAGAAAGAATGGTACTTCTTCAGCTTGAGAGACAGGAAGTACCCAACCGGGTTG AGGACCAACAGAGCCACTGAAGCTGGTTACTGGAAGGCTACTGGCAAAGATAGGGAGATT TACAGCTCCAAGACTTGTGCTCTCGTTGGCATGAAGAAGACTCTTGTCTTCTATAGAGGT AGAGCTCCTAAAGGAGAGAAAAGCAACTGGGTCATGCATGAATATCGCTTGGAAGGCAAA TTTGCCTACCACTATCTCTCTAGAAGCTCCAAGGATGAGTGGGTGATTTCAAGGGTGTTT CAGAAGTGTGGTGGTGGCGCCTCCCCTACCACCACCACCACATCCACCAAGAAGACGAGG CTGAGCTGCACCACCACAACCAGCTCCACCATCAACCACTCCTACCCAGAACCAAGTTCT CCTTCCTCGGTCTCTCTCCCGGCTCTTCTTGACCACCCATCAAACACCAACGCGAACACT GCAGCTGCCGGTGTTGGTGCAGGTGCCGGTGACAGCTGCTCTTTCGACAGCCACACTCCC TCGCATGAGCACGTGTCCTGTTTCTCCACCATTGCAGCCGCTGCCTCAGCTGCCGCCTCC GCCGCCACTGCTTTCAACCAGCCCACCTTCGACCTCTCTTCCCCACCACCTTCCATGATC AACTCCTCCGCCACTACCTCCACTGACCTAGCTGCCGGTCGGTTCTCTAGAAACGCTGGC ATGTCTGCTTTTCCAAGCTTGAGGTCTCTCCAGGAGAATCTTCAGCTGCCTTTCTTCTTT TCAGCTCCTTCAATGTCGCCACCTTTTCAGGGTGGTGGTAATGTTGGTGGCTCCAACTGG CCAATGATGCATGACATGGCGGGGATTGGTGGTGGCCCTTCCGGTGGTGGCGGCAACAGC AGCGGTAGGATGCCTGTAGGTTCCACTGAACTCGATTGCATGTGGACTTACTAA
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>LITCHI013065.m1 + Up_Stream_Len 2000 CCACAACATATGAACAAACACAGAGATGATTGCTATCCAGTGATTCACATAAATCTTTGG ACAGCTTAAATGTTGGCAGTGAATCTTTTTATCTCCCCTCTTTTTCTATTATAATATCTA TATATATCCGAAGAAAGCTTTGGTGCCTCATTTGGGTATTTTAAAATTCTGAATTAGATA TAAAGTTTGTGTTGTATTCTGATTTTAATTAAAAATAGGATTAATGCATATATTTGATTA TCATGTTGGATTTTCACGTATTCTGTGTTTAGGTTTAAGGTTATCTGCTACTGTACTCAC AATATTAGTCTCTTGTCTTTTGATTTTACACAATACTCTTTTTTATTGAGTTAATGTAAA AGCATGATCAATTAATGTAAATTTTTGGTTAAATACTTATCAAAAAACATCTATAAAATA TTTTATTTATATTAATTTTATCTATTTATTTATGAAATTGAATCTTAAAACTCAATGGGG TGGCCCAGTGACTTCTCCCTAGCAATTCTCAACCAAGAGTTATGGTGTCAAGTGTTAACA TTTCTTATCTTATAAAATCCTTTTATTAAAAAAAAAAAAAAAGAAGCAAGTTCTGGTTTT GAATAGTAGCATCATTAAATGTGGATAATTTTGGTTTAATCCATTATACGTGGAGGTAGA ATTACGTTTAAATTTATTTGATTGAAGGATAGCTATTCAGCTAAATGTGAGTCTTTTTCT CTCGTGTTAGGAAGTAGAATTATTAATAATACTGTTTGTTCGGATCCAATTTTAGAGTAT TATTAAATGATCTCGGTAGACATAAAATGTAATTATAACATAAAAGGAAAATAGCGTATA TAACATTAAAAGACAGTTACCTACGTAGCATATGAATATCACATTATATAAACCATAAAT ACATAATAAAATAAATAAATAAGTGAAAGCATATATAAATATATAACTGTAGGTGGCGTG TAAATACAACGGGGGGGTACGTCTCTGTCAAGTTGATAATTTAATCTTGTACTGTGCTGA CACGAGATATGAAACAGCTTTATCGATCCATGGTGAAAATCTCCCCCTTCCTATTTATCT ATCCACCTTTCTATCTATATTATATAATATTTTCTAACCCAAGAGATATTTGAAAAAAAA AAACCCAAAATAAAAAAAAAATCACTTTTCTCATAAAAACAACGTTCTGTTCCCAATTTT GTCCTCATCACTAACACAGAAAAAATTAAATTAAATTAAAAATTCAAAAACAAAAAAAAG GCCAATGAAATAAGCCCCTCTACTGCTTCCCTGCACACTCTCTCACGCACGCACGCATAC TCTATACAGGGCTCCACACAACACATACATCATCACACCTCTGTCTCTCTCCGTCTCTCT CTCTAGCTATGAGGTTGGCAGAGAGCACCAGATATCCATCAGAACACGACAGACCAGAGA AAACACACTCTTTTTCTTTTATTATTATTATTATTATTTTTGAGTGAACTCTTTTTCTTT TATTAAATATATCTTGGTTTTTTGTTTTATACAAATATATGCTCTATGAGTATATAACGA TATATTACATATTTGATGCGGTGCATTGAATTAAAGTAGGATAATTTTCAATCCACTTAA TTATTTATTGATTAAATAGGGATGGAGTTTTTCAACCCTATTATTTTCACATGGATGCTA TTATTTTTCATATATATCATCAATAATGTTAATTTAATTTATTTTATTTAATTCATCCCA ATTCTGAAGCTCTAACGGTCGCTCGTTATTGTTGTTATTATTATTATTATTAATTAGATA TTCTCCTATTCTCCGTTCTGAATAGTTGGATTTTACCAAATCCCTATAGAAACCACCCCC CGGCAGGCCACGATATAAACTCTCTCTCCCTCTCGTTTTCTCAACCGACAAAACAGATCC AAAGCAAAGTCTCTTGTGGGGTGTTTTTGTTTTTTGCTTTGGTTGTTTTAGGTTGCAAGC ACAAAGCCATTGTTGTTTTA >LITCHI013065.m2 + Up_Stream_Len 2000 TGTAAATTTTTGGTTAAATACTTATCAAAAAACATCTATAAAATATTTTATTTATATTAA TTTTATCTATTTATTTATGAAATTGAATCTTAAAACTCAATGGGGTGGCCCAGTGACTTC TCCCTAGCAATTCTCAACCAAGAGTTATGGTGTCAAGTGTTAACATTTCTTATCTTATAA AATCCTTTTATTAAAAAAAAAAAAAAAGAAGCAAGTTCTGGTTTTGAATAGTAGCATCAT TAAATGTGGATAATTTTGGTTTAATCCATTATACGTGGAGGTAGAATTACGTTTAAATTT ATTTGATTGAAGGATAGCTATTCAGCTAAATGTGAGTCTTTTTCTCTCGTGTTAGGAAGT AGAATTATTAATAATACTGTTTGTTCGGATCCAATTTTAGAGTATTATTAAATGATCTCG GTAGACATAAAATGTAATTATAACATAAAAGGAAAATAGCGTATATAACATTAAAAGACA GTTACCTACGTAGCATATGAATATCACATTATATAAACCATAAATACATAATAAAATAAA TAAATAAGTGAAAGCATATATAAATATATAACTGTAGGTGGCGTGTAAATACAACGGGGG GGTACGTCTCTGTCAAGTTGATAATTTAATCTTGTACTGTGCTGACACGAGATATGAAAC AGCTTTATCGATCCATGGTGAAAATCTCCCCCTTCCTATTTATCTATCCACCTTTCTATC TATATTATATAATATTTTCTAACCCAAGAGATATTTGAAAAAAAAAAACCCAAAATAAAA AAAAAATCACTTTTCTCATAAAAACAACGTTCTGTTCCCAATTTTGTCCTCATCACTAAC ACAGAAAAAATTAAATTAAATTAAAAATTCAAAAACAAAAAAAAGGCCAATGAAATAAGC CCCTCTACTGCTTCCCTGCACACTCTCTCACGCACGCACGCATACTCTATACAGGGCTCC ACACAACACATACATCATCACACCTCTGTCTCTCTCCGTCTCTCTCTCTAGCTATGAGGT TGGCAGAGAGCACCAGATATCCATCAGAACACGACAGACCAGAGAAAACACACTCTTTTT CTTTTATTATTATTATTATTATTTTTGAGTGAACTCTTTTTCTTTTATTAAATATATCTT GGTTTTTTGTTTTATACAAATATATGCTCTATGAGTATATAACGATATATTACATATTTG ATGCGGTGCATTGAATTAAAGTAGGATAATTTTCAATCCACTTAATTATTTATTGATTAA ATAGGGATGGAGTTTTTCAACCCTATTATTTTCACATGGATGCTATTATTTTTCATATAT ATCATCAATAATGTTAATTTAATTTATTTTATTTAATTCATCCCAATTCTGAAGCTCTAA CGGTCGCTCGTTATTGTTGTTATTATTATTATTATTAATTAGATATTCTCCTATTCTCCG TTCTGAATAGTTGGATTTTACCAAATCCCTATAGAAACCACCCCCCGGCAGGCCACGATA TAAACTCTCTCTCCCTCTCGTTTTCTCAACCGACAAAACAGATCCAAAGCAAAGTCTCTT GTGGGGTGTTTTTGTTTTTTGCTTTGGTTGTTTTAGGTTGCAAGCACAAAGCCATTGTTG TTTTAATGGATTCCTACCGTCATGTTGATAACAACGAAACCTACTTGCCTCCCGGGTTCA GGTTCCACCCAACCGATGAAGAGCTCATCATCTACTATCTTCTCAAGAAAGTTCTTGACA GCAACTTCTCTGGTCGTGCCATTGCTGAAGTCGACCTCAACAAGTGCGAGCCCTGGGAGC TACCTGGTATATATGCACATTATACACTACACTCAACAAAAACAAAATAAAACAACACAA AACCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCCGGTTTTGTTTTGTTTTGT TTTTGTTGACTAACTTGAAAGAGTTGATTGGTGACGCATTTGGTTGTTTAAATGGTGTTG GGTGTGCAGGGAAGGCAAAG
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>LITCHI013065.m1 GenomeSequence + CAGAGAGCACCAGATATCCATCAGAACACGACAGACCAGAGAAAACACACTCTTTTTCTT TTATTATTATTATTATTATTTTTGAGTGAACTCTTTTTCTTTTATTAAATATATCTTGGT TTTTTGTTTTATACAAATATATGCTCTATGAGTATATAACGATATATTACATATTTGATG CGGTGCATTGAATTAAAGTAGGATAATTTTCAATCCACTTAATTATTTATTGATTAAATA GGGATGGAGTTTTTCAACCCTATTATTTTCACATGGATGCTATTATTTTTCATATATATC ATCAATAATGTTAATTTAATTTATTTTATTTAATTCATCCCAATTCTGAAGCTCTAACGG TCGCTCGTTATTGTTGTTATTATTATTATTATTAATTAGATATTCTCCTATTCTCCGTTC TGAATAGTTGGATTTTACCAAATCCCTATAGAAACCACCCCCCGGCAGGCCACGATATAA ACTCTCTCTCCCTCTCGTTTTCTCAACCGACAAAACAGATCCAAAGCAAAGTCTCTTGTG GGGTGTTTTTGTTTTTTGCTTTGGTTGTTTTAGGTTGCAAGCACAAAGCCATTGTTGTTT TAATGGATTCCTACCGTCATGTTGATAACAACGAAACCTACTTGCCTCCCGGGTTCAGGT TCCACCCAACCGATGAAGAGCTCATCATCTACTATCTTCTCAAGAAAGTTCTTGACAGCA ACTTCTCTGGTCGTGCCATTGCTGAAGTCGACCTCAACAAGTGCGAGCCCTGGGAGCTAC CTGGTATATATGCACATTATACACTACACTCAACAAAAACAAAATAAAACAACACAAAAC CTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCCGGTTTTGTTTTGTTTTGTTTT 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