Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI013048Chr22375280923760929+Protein SAWADEE HOMEODOMAIN HOMOLOG 2

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI013048.m1141267PF16719.8SAWADEEDomain141.32.20E-41
Download   Copy
>LITCHI013048.m1
ATGGGTCGGCCACCCAGTAATGGAGGCCCTGCCTTCCGTTTCACACAGACTGAGGTTGTG
GAGATGGAAGGTATATTGCAAGAACACCATAATGCAATGCCTTCACGGGAAATTCTTGTA
TCTCTTGCAGATAAGTTCAGCGAGTCTCCAGATCGCAAAGGAAAGATTCAAGTGCAAATG
AAGCAAGTTTGGAATTGGTTCCAAAATAGGCGGTATGCAATTAGGGCAAAATCAATTAAG
GTCCCTGGGAAGTTAAATGTAATGCCAATGCCTCGGGATGACTCAGCTCTGATGAGAAGT
GTTCCTCAACCTGTAGCTGCTCCAGTTTCTGCTCCTGCTCCTATGCCTGCTGCAATATCT
GTATCTGTTTCAGCTTCTTCAGTTTCAACTGCAGGGAGGGTTGCATCAGAAAATACTTTA
ATGGAGTTTGAAGCTAAATCTGCCAGGGATGGTGCGTGGTATGATGTTGCAACATTTCTA
GCCCAGAGAAATTTAGAGATGGGTGACCTGGAAGTACAGGTTAGGTTTGCTGGTTTTGGG
CCAGAGGAGGACGAGTGGGTTAATGTTAAAAAACATGTCAGGCAGCGTTCTCTCCCATGT
GAAGCTTCAGAATGTGTTGCAGTTCTTCCTGGAGATCTCATACTCTGTTTTCAGGAAGGT
AAAGATCAGGCTCTTTACTATGATGCTCATGTCCTTGATGCTCAACGACGAAGGCATGAT
GTAAGAGGTTGTCGCTGTAGGTTTCTGGTGCGCTATGATCATGATCAGTCTGAGGAAATC
GTGCCTCTCAGAAAGGTCTGTCGTCGGCCTGAAACTGATTACAGGTTGCAGCAACTTCAT
GCTATTAGTGAATCAGTATCCATGGACCAGCAGAAAACTAGTATGGATTTCTCCGCAGGC
AATGCTCCCAGGGTTGTCAGTTCATCTGCTGAGATGATGCAGAAGCCAGGCAATGCAAAT
GGAACGCCAGTAGCCCTAGCAGCCCCAGTATTTCAGGCTCCTGTACCTGCCGCCCCTCGC
ACCGTAGCCCCAGATTCCAAAATTGTTGCAAGTAGCAATGCTGTCAACCCAAGCAATCCT
GCTGTTCCTCCTACTGGTGCTTTGGGAACAAGCGGCACCTCAACAAGTGTCAACCCTGCT
GCCTCCGTCGGAATCAGAAACATGCAAGGAAACTAA
Download   Copy
>LITCHI013048.m1
MGRPPSNGGPAFRFTQTEVVEMEGILQEHHNAMPSREILVSLADKFSESPDRKGKIQVQM
KQVWNWFQNRRYAIRAKSIKVPGKLNVMPMPRDDSALMRSVPQPVAAPVSAPAPMPAAIS
VSVSASSVSTAGRVASENTLMEFEAKSARDGAWYDVATFLAQRNLEMGDLEVQVRFAGFG
PEEDEWVNVKKHVRQRSLPCEASECVAVLPGDLILCFQEGKDQALYYDAHVLDAQRRRHD
VRGCRCRFLVRYDHDQSEEIVPLRKVCRRPETDYRLQQLHAISESVSMDQQKTSMDFSAG
NAPRVVSSSAEMMQKPGNANGTPVALAAPVFQAPVPAAPRTVAPDSKIVASSNAVNPSNP
AVPPTGALGTSGTSTSVNPAASVGIRNMQGN.
Download   Copy
>LITCHI021318.m1
ATGGACTGGACTAGAGGCCGCACCATAGGCCACGGCTCCTCCGCCGTGGTCTCCCTCGCC
ACCTCCCTCTCTGGCGACAACGTCTTCGCTGCCAAATCCGCCGAGCTTTCCGAATCCGAA
TTTTTGCAAAGGGAGCAACAAATTCTCTCTTCTCTAAACTCCCCCCACATAATCACCTAC
AAGGGGTGTGACATTACTAGTGAAGACAATAAGCTTATGTACAATATCTTCATGGAGTAT
GCAACCGGCGGCACCCTCACCGATGCAATCCTCCAGCATGGCGGCCCCCTCGAAGAGCCT
ATGATCGTGTATTACACGCGCCACATGTTACAAGGCCTAGAGTACCTACACTCACAGGGG
TTCGTACATTGTGACATTAAAGGTAGGAATATTTTGATCACCGGAAGTGGCGCCAAAATT
GGCGATTTCGGGTGCGCCAAGTGGCAGTCAGAGGAGGTCTCTACCGGTGGCACGCCAATG
TTCATGGCGCCAGAAGTGGCGCGTGGGGAGCACCAGGGGTTCGCTAGTGATATATGGGCA
ACTGGGTGCACCATAATCGAGATGGCTAGTGGTGGTGCACCGTGGTCCAATGTAACGGAC
CCCGTAACGGTCCTCTACAGGATTGCATATTCTAGTGAATTGCCCGAGCTTCCTGGTTGT
CTATCAAACCAAGCAAAGGATTTCTTGTCAAAGTGTCTAAAAAGAGATCCCAAAGAGAGG
TGGACCGCTAGTCAGCTACTAAACCACCCATTTCTCGAAGAATTCAATTCGTGTACAAAA
CCAATTGTTCAAGAATCTAATTCAACTTCAAATTCTCCTACAAGCATTCTTGATCAAGAC
ATATGGGACTCAGTAGAGGAAACGGAGAGAAGCCTGGGAAATCTGATCTGTTCAAGGTCA
CGAATTAACCTGCTCGGTGAGAGGATCCAACGGTTGTCATCTACTGAGGGGCCCAGTTGG
ACCTGGGATGATAGTTGGATCACAGTTAGAGGATATAATATTATTAGTCCAACAATTCTG
GATGAGATTGAAGGCAAAGATGATTTGATTTGTGGGTCAGTGTTGGATTTTACTGGTGAG
AAATTGTTGTTGGATTTCTCACAAAGCAATATTGGTATTAGTAATGGCAGGGTTAGAAAT
GGGAATTTTTGTGGGCTATGTACATATAACAAAAATTTTAATGTTGTAATTAGACATAGT
GTAAGGGAAGTTGGGTTAATTGGCACGACTCATGATGGGTACAAATTTGGTATACTCCAA
TTAAAATCCAGCCCAGCTTCTCTGTATTTTGTATCAGTTGGTAAAGCGAGAATAAATTTC
GAGTTCCCTAGCAAATGA
Download   Copy
>LITCHI021318.m1 -  Up_Stream_Len 2000
AACTAAAACACTTATAATGTGTTTACTTTATAGATTAGGGAATGAGAATGGGGAATGTGA
TTGATTGATAGTGTTTACTTGCTCAAAATTCATTCCGTAATGGGAATGAAAGTGTGAGCC
CCACATCAATTTGGGATTATGGAATGGGAATCCCATTCCCCCAACCTACTTGGGAATCCC
ATTCTCATTCATTTTGTTGGGATAAAAAGTCTTTTATATCATTCTTTAAAAAAAAAAAAA
ACCTATTTTACTTTATATTAAAAAAAAAAAAAACTGACTATTATAATAAAAAACTACACA
CTATTAGTTTTTCATTACCAATTTCTTAATTATCATAATGGACTATTAAAATAATATACA
ATTTTTTTTTTTAATTATAATATGTAATTTTTTATTTGATATTAAAAAAAAAAATCGAAC
ACTAGGTTAGTGGACTATTAAAATAATATGTAATTTTTTTATTATAATATCCAGTTTTAT
ATTTAATATTAAAAAAATGCATATTATAGTAAGAAACTATACACTATTATAATTAATCCA
TAATTTTAATTAAGGGTATTTTTGTAACTTATAAATAATTTATTCCGATTCCAAAGCAAA
GTAAACAGTTCAATGGAAATACTGCTGATTCCGATTCCGATTCCTGCAGTTGATGTAAAC
AATTTATTCTAATTCCGATAGTTCATTCCGATTTCTTCAAATAAAGTAAACGCACCATTA
TAAAGTTATTTGTTCAAACCCTAGGAAGCCATCTTATTGTTCAAATAGAACATGACAATG
CCTATATTCTGCCACACCCCTCTAAAGATAAGGTCAAAAAACCCTCACGCTCCGACTAAG
GGTTCAAATATGGTATCAACAATCAAAGAACTATTAAAATATGCTAACATCAAGTACTAG
TTACGTGATTCAAATTCTATTATCATAAATGGGGGAGGTAATTACTCTTATGATAAGAGG
GGAAAAAAAAAAAAAACTCACAAATCTTCATTATATAAATCAATTTTGATATTAAGATTT
ATATCAAATTTGATAAATTTCACAATTAAATTAATTGATACCCATATGAATGCAGACTAG
ACGTAAATTTGACATGATTTAGAGTATAATTTCAACCACGTGCAACTTAATAATATAAAT
ATGGTAGGAATAGAAGGTTTACGGTATCCAACATTGGATGCAAATTTCTTGAAGTAAAAC
CATAAATGAAAGCAGTCGACTATTAAAATATCATCTAAAGGTGCACAGTTTTGGAATTAA
TTGGTCAAGCCTTCTCTTTTAATTCCAAAATGTTAAAATATCTATTTGGTGTTCCCACTT
CGGACTTGTAAATTGACTTTGACAAAGTACCGGTACTTCTCCTCCTCCTTCGTAAACGGA
CTTTAATATTGAAATTTGATAGAAACATCTGATAAAGCCACCAATTCAACCCACTAGAAG
CACCAAATGATACTAAAATTCAACCATATCCGGTGGTTCAACCCACCCCACAACACCTCA
TCCCTCACCTCACCAAAAACCCCCTAATTCAATCTTCAAAGTCTTCTCTTATTCAAATAC
AAAACAAAGCATCCATAGCTTTCGTATTTATCTATCTATACAAATCTACCAAAATCCACC
CTCCCTCCTCACCATTTGTACCCATTGACCCAACCAAAATGGAAAGAATACATATAAATA
CATTCCCATAATTACACGTGCACACGTGCCGTTTCGCCATGTTGCCGCCGACTAGACGTC
CAAACCTGTCAACACCAACTATAATTTGACACGTTGTGCACTCACGTTAAAGGACTTGTC
AACTATATATTGTGAGAAAGAGAAAGGGCCAAGTCACCCCCAACCTACCAATAAAGCAAA
CCTTTTTAAATATCCAAAACCTTATTACTTATTGGAATCCTCCTATATATAAAGCCACTT
TGCGATAACAAACTTTGTAGACCCAACCAAACTCTCTTTTCATTTTTCAGAGTTCGTATC
CACCACCTCCCACCAAATAA
Download   Copy
>LITCHI021318.m1 GenomeSequence - 
ATGGACTGGACTAGAGGCCGCACCATAGGCCACGGCTCCTCCGCCGTGGTCTCCCTCGCC
ACCTCCCTCTCTGGCGACAACGTCTTCGCTGCCAAATCCGCCGAGCTTTCCGAATCCGAA
TTTTTGCAAAGGGAGCAACAAATTCTCTCTTCTCTAAACTCCCCCCACATAATCACCTAC
AAGGGGTGTGACATTACTAGTGAAGACAATAAGCTTATGTACAATATCTTCATGGAGTAT
GCAACCGGCGGCACCCTCACCGATGCAATCCTCCAGCATGGCGGCCCCCTCGAAGAGCCT
ATGATCGTGTATTACACGCGCCACATGTTACAAGGCCTAGAGTACCTACACTCACAGGGG
TTCGTACATTGTGACATTAAAGGTAGGAATATTTTGATCACCGGAAGTGGCGCCAAAATT
GGCGATTTCGGGTGCGCCAAGTGGCAGTCAGAGGAGGTCTCTACCGGTGGCACGCCAATG
TTCATGGCGCCAGAAGTGGCGCGTGGGGAGCACCAGGGGTTCGCTAGTGATATATGGGCA
ACTGGGTGCACCATAATCGAGATGGCTAGTGGTGGTGCACCGTGGTCCAATGTAACGGAC
CCCGTAACGGTCCTCTACAGGATTGCATATTCTAGTGAATTGCCCGAGCTTCCTGGTTGT
CTATCAAACCAAGCAAAGGATTTCTTGTCAAAGTGTCTAAAAAGAGATCCCAAAGAGAGG
TGGACCGCTAGTCAGCTACTAAACCACCCATTTCTCGAAGAATTCAATTCGTGTACAAAA
CCAATTGTTCAAGAATCTAATTCAACTTCAAATTCTCCTACAAGCATTCTTGATCAAGAC
ATATGGGACTCAGTAGAGGAAACGGAGAGAAGCCTGGGAAATCTGATCTGTTCAAGGTCA
CGAATTAACCTGCTCGGTGAGAGGATCCAACGGTTGTCATCTACTGAGGGGCCCAGTTGG
ACCTGGGATGATAGTTGGATCACAGTTAGAGGATATAATATTATTAGTCCAACAATTCTG
GATGAGATTGAAGGCAAAGATGATTTGATTTGTGGGTCAGTGTTGGATTTTACTGGTGAG
AAATTGTTGTTGGATTTCTCACAAAGCAATATTGGTATTAGTAATGGCAGGGTTAGAAAT
GGGAATTTTTGTGGGCTATGTACATATAACAAAAATTTTAATGTTGTAATTAGACATAGG
TTGTTACCTCCTTTGATATCAACTTCTTCAATATCATGACTTTTTTACCTCTATAAATCT
TTATTCTAATCTTTTTTTGGCTGAACTGTGATAGTAATAATGTATACGAGACAGTGGAAT
AGTGGCACTTTGGGTAGTCAATGGTGCCCATAACCTAATCCTATCTTCTGCTATTGTGGG
TGCACTTGAAGTAGTGCTTATTAGGCTGCCAAATTGCCCATCGGGCCAACTTCCAATAAC
TATTTTTCCAATTCCTATACTGATATTGAATACTTAAACAGTTATGATTTAATTCGAAAA
TATCATTCATTAAATCTAATGGCTGTAACTTTTGAATTCGAAAATACCATTCATTAAATC
TAGTTGCTGTAATGCACTGGATTTGACAAGATGGTTGAAAATATGTCCTTTGTTTCATTT
ATAGTGTAAGGGAAGTTGGGTTAATTGGCACGACTCATGATGGGTACAAATTTGGTATAC
TCCAATTAAAATCCAGCCCAGCTTCTCTGTATTTTGTATCAGTTGGTAAAGCGAGAATAA
ATTTCGAGTTCCCTAGCAAATGA