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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI013047 | Chr2 | 23742622 | 23746328 | + | Transcription elongation factor 1 homolog |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI013047.m1 | 2 | 78 | PF05129.16 | Elf1 | Domain | 104 | 3.50E-30 |
LITCHI013047.m2 | 2 | 68 | PF05129.16 | Elf1 | Domain | 80.7 | 6.50E-23 |
LITCHI013047.m3 | 2 | 63 | PF05129.16 | Elf1 | Domain | 68.7 | 3.50E-19 |
LITCHI013047.m4 | 2 | 63 | PF05129.16 | Elf1 | Domain | 68.7 | 3.50E-19 |
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>LITCHI013047.m1 ATGGGGAAGAGGAAGTCAAGGGCAAAGCCACCTCCTAAGAAGAGAATGGACAAGCTTGAT ACTGTTTTTAGCTGTCCATTCTGCAACCATGGAACCGGTGTTGAATGTCGTATTGACATG AAGAATTTAATTGGTGAGGCTGTCTGTAACATTTGCCAGGAGAGCTTTAGCACAACTATT ACAGCTCTAACTGAACCCATTGACATATATAGTGAATGGATTGATGAATGTGAACGGGTC AACAATATTGAAGATGATGGTGCTTAG >LITCHI013047.m2 ATGGGGAAGAGGAAGTCAAGGGCAAAGCCACCTCCTAAGAAGAGAATGGACAAGCTTGAT ACTGTTTTTAGCTGTCCATTCTGCAACCATGGAACCGGTGTTGAATGTCGTATTGACATG AAGAATTTAATTGGTGAGGCTGTCTGTAACATTTGCCAGGAGAGCTTTAGCACAACTATT ACAGCTCTAACTGAACCCATTGACATGTAA >LITCHI013047.m3 ATGGGGAAGAGGAAGTCAAGGGCAAAGCCACCTCCTAAGAAGAGAATGGACAAGCTTGAT ACTGTTTTTAGCTGTCCATTCTGCAACCATGGAACCGGTGTTGAATGTCGTATTGACATG AAGAATTTAATTGGTGAGGCTGTCTGTAACATTTGCCAGGAGAGCTTTAGCACAACTATT ACAGGTATTAGTTATATCAGTTGCTTTGAACTGTTATGTGTAAATGATCTAAGATGCTAA >LITCHI013047.m4 ATGGGGAAGAGGAAGTCAAGGGCAAAGCCACCTCCTAAGAAGAGAATGGACAAGCTTGAT ACTGTTTTTAGCTGTCCATTCTGCAACCATGGAACCGGTGTTGAATGTCGTATTGACATG AAGAATTTAATTGGTGAGGCTGTCTGTAACATTTGCCAGGAGAGCTTTAGCACAACTATT ACAGGTATTAGTTATATCAGTTGCTTTGAACTGTTATGTGTAAATGATCTAAGATGCTAA
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