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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI012920 | Chr2 | 22027702 | 22034849 | + | Cold-responsive protein kinase 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI012920.m1 | 118 | 200 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 50.9 | 1.50E-13 |
LITCHI012920.m1 | 119 | 202 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 54.6 | 1.00E-14 |
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>LITCHI012920.m1 ATGTGTGCATTAGGTGCTTGCTTATGGCTGCAGCCTGCTTTGAATGTTTTCTGTGTCTTT ACTGAAGTTCATAAGGCTCTACTCAACTTCTGCAATGTGGTTGTGCTTGTTGAGAGTGCT TATGGGCTCTTGTTTCTCAGCAACAAGTTGCATTTGACCTTTGTACTCCTTTTTGAGGTT ATGAATCTAGTGTGGCACCTTGTGATGACTTGTTTTGGTTCATGTTTCAGAAAGAAGAGA GCTTCGCAGCCTACACGCGCAGTAGAAGTTGATGATGAGGTTTCAGGTATTCACAATACT AACTTGTATACTTATGTGGAGTTGAGAAGGGCAACCGAAAACTTCAGTCCAGCCAATAAA ATAGGACAGGGTGGTTTTGGTTCTGTCTACAAGGGAAGGCTCCGAGATGGCACTCTGGCT GCTGTAAAGGTACTATCAGCTTTCTCAAGGCAAGGTGTAAAGGAGTTTTTGACAGAAATA AATGTGATTGCTGACATAAAGCATGATAACCTGGTTAACTTACTAGGTTGTTGTGTGGAA GAACGCCATAGAATTTTGGTCTATGGTTATCTTGAGAATAACAGTCTAGCACAGACACTT CTTGTTGTGAATCTGACATTGGTTTTATTTGTTAAGTTTTTGTATTCGAAGCTTAGTATT GCATGGGAACTGTATGAGAGCGGGAATCTGGTGAGCTTGGTGGATACATCAATGAATGAT GATGAAGATATTAAAGAAGCTCATACATATCTGAAGGTTGCTCTGCTCTGCACCCAAGAT ATGCCAAAACTTCGACCGTCCATGTCTACCATAGTTGACATGCTAACAGGTGATATAGAT GTAAATCCAGAGAAGATATCAAAGCCTGGCCTTCTTTCTGAGTTATTAGGCCTCAAAGGT GGCAAGGGCCAGAAAAAGTCCAATATGAACAAATCTTACATGGCATCTGCCGACACCAGC AACCTGGATTGTTCCTCTTCGTCTACAGGATATATGGACACCTCTTATGGCACCATGACC TTCAATTCTATATATGACCGAAGCAATTGA
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>LITCHI012920.m1 ATGTGTGCATTAGGTGCTTGCTTATGGCTGCAGCCTGCTTTGAATGTTTTCTGTGTCTTT ACTGAAGTTCATAAGGCTCTACTCAACTTCTGCAATGTGGTTGTGCTTGTTGAGAGTGCT TATGGGCTCTTGTTTCTCAGCAACAAGTTGCATTTGACCTTTGTACTCCTTTTTGAGGTT ATGAATCTAGTGTGGCACCTTGTGATGACTTGTTTTGGTTCATGTTTCAGAAAGAAGAGA GCTTCGCAGCCTACACGCGCAGTAGAAGTTGATGATGAGGTTTCAGGTATTCACAATACT AACTTGTATACTTATGTGGAGTTGAGAAGGGCAACCGAAAACTTCAGTCCAGCCAATAAA ATAGGACAGGGTGGTTTTGGTTCTGTCTACAAGGGAAGGCTCCGAGATGGCACTCTGGCT GCTGTAAAGGTACTATCAGCTTTCTCAAGGCAAGGTGTAAAGGAGTTTTTGACAGAAATA AATGTGATTGCTGACATAAAGCATGATAACCTGGTTAACTTACTAGGTTGTTGTGTGGAA GAACGCCATAGAATTTTGGTCTATGGTTATCTTGAGAATAACAGTCTAGCACAGACACTT CTTGTTGTGAATCTGACATTGGTTTTATTTGTTAAGTTTTTGTATTCGAAGCTTAGTATT GCATGGGAACTGTATGAGAGCGGGAATCTGGTGAGCTTGGTGGATACATCAATGAATGAT GATGAAGATATTAAAGAAGCTCATACATATCTGAAGGTTGCTCTGCTCTGCACCCAAGAT ATGCCAAAACTTCGACCGTCCATGTCTACCATAGTTGACATGCTAACAGGTGATATAGAT GTAAATCCAGAGAAGATATCAAAGCCTGGCCTTCTTTCTGAGTTATTAGGCCTCAAAGGT GGCAAGGGCCAGAAAAAGTCCAATATGAACAAATCTTACATGGCATCTGCCGACACCAGC AACCTGGATTGTTCCTCTTCGTCTACAGGATATATGGACACCTCTTATGGCACCATGACC TTCAATTCTATATATGACCGAAGCAATTGAGTCTAATAAAATATCCTTTAGGTACCATCA GGTCGGCATTTTAATTGTACTCTTTGTTTTTGTTCGAGTAAAGTCTAATACAGGTTTCAC TTTCTGAGCATTGATTTCTATCAAGGAAAAGAATATTTCCAAAATAGAAGTGGTGAGAAG TCCATATGTTCACAACATGATGTAAATTTTCTGTAAGGTGGTAGGTAATTAGTCTTTTTG GTTTTGTTGTATTTTGTGTCCTCTCCTATTTTTGATCTTTGAGGAGAAGGAACTCTTCTC TACTTCTCACTAGTTACAGGATAGCCAAAATCAATGCAAGTTTATATTCATTTATTTATT TGTTCTTTATGATTTCATGACGATGAGCATTCTCGATCGTGCAAGATCTTCTCCAGCTTT GTTCTGCCCTTTTTTTCATCATATGATTCACTCATATTTTATATGAAATAAGGAAGCCAG TTTCGGTGTGCAAATGTTCTTTTTATTCCTTAGCTTGATTATCCTAATCTCCATATGCTA TCTACCCGTCAGCTCACAACTACATCTGTAGTGAATTCAATCCGCCTTCGACCTTTGTAC TTGTGTTTTGATTCTGTGAGGAAGAAGGTTAGCTATGGCTGGACTGTTGTTATGATAGTA CGAACAAGTACAGGAAACAATGGGAAGGTTGACACAGAATGCAAATCGAAAATGTGATAC TATGAACATTTTAAAGAGGATTAGGAAAATTTAATCAGGTATGCTACATACTGGTTGCTA GGATGCAAACTGCAGAAACAATTATATCATGTGATGAATTGAACCAATTTTATTTTGCCT CATTTTCATTTATGTCAATGTAAGTACAAGCTACAAGTCTTTTACCAATGAATCTGTAAA AGTAACAATCATGCATAAGTTTGATTATAGTAAAGCAAAATGAGTAAAAGAATAAGACAA AGGTGAAAAAATAATTGAAAAAAGAAAGAAAAAACAGCATTCATATGTCTGTCCTTGTTC TGTAGCATCTACACCACAAGATGAGAAAACAAAGCAGTCTATAGGCAATGATGAAACTGA ATATAACAGCTAAATTGCTCCATTTCTGTGACTCTTGGAGGTGTTGCTGGCTTAGGAACC CATTTCCATATAAACTGCATTCTTGTTGCTGAAACTCCAAGCACCTTGTTTTTCCTTGCT CTCCTCCATACTCATTTATCATAAAACACTCAAATGGGTACTTAAACATACTCAAATAAT GCATGAAAATCCAGTAATCAGGTATGTTGTCCTTGGATATAAAATACCCAGAAAAGAGAA AGAAAGACCCCATTAGCCCTGCAATGACTGATGTCCCCATGATGAAATTTGGCACCAGAG CACTGAAACATGCTACAAATGAATTGGACATCAGGAGGACCATCCACACCACTAGAGAGA AGTAGAGGAAACCATCAATTTCCCTTCTCAAGCCAATCAGCCAGTAAACCGGGGTGGTGA AGAGAAGACCAACCATCAAAAGAAAAGGAATGAAAATGAGGGTGTTGGATAAAACATAGG ATGAAACTCTATAAGCCCCCCTTGAAGTTTCTCTCATTAGAATTCGTCTCTCTTGCAGGA AAATTGGGAGGCCTTCTGTTGTGGAAGATAACAAGAAGGTGAGGCTGAAAGCAAAGAAAC CGATTCGAGTTTGCAGTGCTATTTGTCCTTCTTTGTCATTGCTAACATTAAAGAATATGC TTCCAAGTACTAATCCAGCTACCAAGGCTTGTATCACTCTCGTGGCAAATAGTTCTCTGG TCCTAAATATGTTGCTGCAAAATCTTTGTCCTAGTATTAGGACCTCCTGGAATTGAGAGT TGGGATAGGACACAAGCTTTTCCTCAAGATGACTGGAGTACGCAATCCTCAGTTTATGAT GATCTCCATTTGCCCTGCGACAACGCTGGCCTGCTGTTCGTATGGCCAAGCTTTCTATGA CATCAATGGCGAATTCTAGCACATTGACATGGCGAGGAATGTAGTGTCCAGCAAGCTTGA GCCTCTCTTCAAGAAGATTCAGTGTTCCATTGTGGACAACAAATCCATTTGAGAGCAACA CAAGCCGATCAAATAGTTGGAGAATTCGAAAACCAGGTTGATGGATGGTTAAAACAATGG TTTTACCTTGATTAAATACCATTGATTTAAGCAGTGTCATCACATGGAGAGCTGAAGCTG AATCCAACCCTGAAGTAGGTTCATCAATCAAAACAACGGCAGGATCATGAACCAAATCAA CTCCAATCGAAACTCTTCGCCTTTCCCCACCCGAAATGCCACCAATTCTTGAATTTGCAA CATGCTCTAGTCCAAGCTCCTTCAACAGCCCTCTCACTCTAGTAACAGCCTCTTTTCGCC CACCCGGCAGCCTCAGCATTGCACTGTACATTAAGGTTTCTTCAACTGTAAGCAATGGAA ATAGAGCATCATCTTGTGTGACATAACCGGAGAGTCTCCGGAAACGTTGAGCATCCATAG GCCTCTCATTGACAAGCACTTGGCCAGACACTTCACTCGAAATCTTCCCAGCAAGAATCT CTAGCAATGTTGTTTTTCCTGCTCCACTAGGACCAGCTATAGCAGTTATCTCCCCAGGCC TAGCCTCACAATTTACATCCTTCAAAATGAACTTAGGACTTGTCTTTGCACGAAACCAAC TGAACTCATCAAACTTGCCACACAATTTGTATGACAAATTCGTGGCTTCTAATCTGCATG AGGCTCTCCGGGTGCCGGGAACCGGCGTCTTCACTGGCAACTCCATGATGATCAAAAAAG CGTAGTGAGAAAGTGAGACAGAATATTGAGAGCAAGCAAGAGGTGAGAGATAAGTTGATG CATAAGAGAAGATGAGCTAACTCACCAAACAAAGTGTTACTAGTACACACAAGTTATATT AATACAAGAAAGGGACAACTGTCAATAGAGATATATATATATATATATATATGTATATAG ATAGCATGCAAAGCCCTCCTATGAGGGCACTAATTACCAATTGGTCCCTCTAGTTGGAGG GCCAAATTTCCCCATCCAGGATGGGATCCCAGTCTCCCTGTTTAGCTAGGGGTGTCTAAT AATTATTGTGGTTCAAGTTGTTCCTAAGAGTTAGTATCAAGAGAGCCTAACAGCTATAAA TGTACTTATAACATCAATATATACATATATATATATATATATACACATACACAAAAAGGC ATAAATACAAGAGTTGGTTTTTGTGTATGGTTTTGCTCAAGGAAAAGGAGGCTTTTTGGT GGGGTGGGGGGGGTTTTGGAGAGTTGCAAGAAAACCAAAGAAGAAAAAAGTGAGTTGCTT GCTTGTAAGGAGAAGCATGTTCAGTTGAACTGTATGTTGACTGTGCAGAGTTGGTGTTGG TGGTCTTCCCATCTTCCCAAACCTTAACCGACAACTCAATGTAGTTTGGTTCAAGGCTGC TGAATTGAATTGGTGAGGCATGCACTTCGTGTACAACAATAGTCAAAATATAGTACTTGT GCTGCTCAAGGAAAATTAGAACAAAAGGCTCCAGATTTCAAACTGGGAGAAATTTGCATG AATAATTGTTGTAGATGTGTAGCTAATTAGCTTTTCAATTTTCTTTGAAAAAAAAAATTA GGTTGAAA
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>LITCHI012920.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATTAGATGGATACTTTCTGCCTTTAGACTCTATTGGATAATGGTAATCATTAATTTTGAT TATTAATAAAAAATAATTTCACTCAATCAATTAAGTTTCATTTCACGGTAAAATTTACAA TTATTTTATTTATTTATTTCTTTTTTTACTTAGAACTCAGTTTCATAAAAATATGTCATA AAGGGAGTTTTTTTCTAATCAAGTTTGGTCCACTTACATCATTGTAGACCTTAAGTTGCA TTGGTACTAATTGATTTGGATCGGTGTAATTAATTAATGGAAAAACCTGACTAGAGAATT ATTATTAAAATAAAACTAGAATTCATTAGTATGTTTTTACAAGATTGTATTAAGCTTATT ATTACTATAATATCTATAAATTAGGATTAATTTATTATTCAAACTCAAAAATATTTATCT AGATAAAAAAAGATTGATTTGGTGAAACATTCTTCACATTATTGAAGTTGTAAACCCATC CAAGTTTTCGAAAATTAGGATGTCAAAGCTTGTTATTGGATTATAATATAATCTTAAAAA AAAAAATCTATAGCTAATAATATCTGAAATTCTAAAACTAAAATTTAAAAATAATATGAT AAATAGTTTTGATGAGTAAAAATTCTCCATTTTTTTTTTTGTTATGTTTTTGATAATATA ATTATACATTCACATAAAAAAAAAATGGATAATTAAGATTGTTCAATTTTTTTTCTCTCA TACATCATCTAAACTTAAATTTCTCTAACAAAAAATTTAGCATAAATAAAAAATTGATAG AAAATCTTTGCTTAGTTTTGATTTAGTTTCTCTATGTTTAATTAAAATCATGATATAATG TGATTTAATATCGAATTACACTAATTCAACTTTTTTATATTTTATCTTTAAAACATCTCA AAATCCAACTTGGAAGGTATATGAAAGAAAATAATATTTAATTTCTTAAATATTTTATTT AAATTTATATTTAAATAATATGATATATGAGTGGAAAATATTATCATTTTATTATTTATA AGATATGATCCCAAAAATTAAAGGGGAAAGAAAAAAAAAATTCCGTGTAAGACAAAATAA CGAAAGGCTATTCAAAAACAGGAAAAAAAAAACAAAAAACAGGATAAATAACGAAAGGTG ATGTAACCGTGAGACACTTGATATGAGAACATCTTATGTGTCCTGTGTCTTGTGTTTTGA CATTTCAACTTGTTCATGTTCTTCTTCTTCTTCTTGTACGGCCTGTAACTGCTAAATCTA TATTAACTTACGGACATCAACATTCTCTCTCTCTTTTTCTCTCTATCTTGCATGTTCAAG CCCTCTTTTCCTTTCACTTGACTTCAAGGTGAGTGCTTCCAACTAACTTACACAGCTTTT TCACTTCTTTTTCTTTTTTTCTTGTTTGGTTGCCAAGAAAATATGGGTAAGAATTCTGGG TTAATCCTCTTTTGTTTCCGAACTCTGTCACCTATATGGCTTCAACTTTGTTTTCATGGC CTCTAAGTTGTTTTTTTTTCTTCTCTACTTTGCTTTCTGTTGGTTACTGTATTGATTGTG AGATGCAATCTTGTGCGTTAGCTTGATAACATAGAAGATGGATTGTTAACTATGTGCCAT GAGTTGTTATTATATTTAGATCGTGGAAGCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTCTT TTTTTTTTTAATTGTTTTATCTATGATTTTGGAGTAAAGGGTTATTTTGAAAATGGATAT ATGTCTCATATGCTAGTTTGATTGGATCTATCATATCAAACAATTCATCTAAGTTTGCAT ATTTGTGTTTAAAGTTTATGTTTTGTATTATCAACAGCATCATTTTTCATCCTTAAAGAT TGACTTGTGCAAGATACATATATATATAGTCACATACACACACACATATGGAGTTTTAGA TCCTAGAACTTTCAAATTTGATTATAGAATGAAGAATGATTTGATGAGTATGCTCAATTT CCATATTCCAAGGGAGGGAG
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