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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI012822 | Chr2 | 19846808 | 19851786 | - | Transcription factor MYBC1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI012822.m1 | 142 | 199 | PF00931.25 | NB-ARC | Domain | 54.5 | 9.90E-15 |
LITCHI012822.m1 | 204 | 295 | PF00931.25 | NB-ARC | Domain | 47.4 | 1.50E-12 |
LITCHI012822.m1 | 425 | 472 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 27 | 4.10E-06 |
LITCHI012822.m1 | 603 | 632 | PF00641.21 | zf-RanBP | Domain | 26.5 | 3.10E-06 |
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>LITCHI012822.m1 ATGGTGGCTCATAAGCTGCAAGCTGTGATGACTTTTAATATAGAAGGAGCTGCTTTCTGG GTGGCTGATGAGGTGCCACTTGTAACTACTCGAAAAGATGGAGGAGATCTCGAAATGGCT TATGCTGAGATGGTACCGGAAGGTGTAGGAGATAAGTTGACAAGTGCTGAGATGGAATCA ATATGTGAGGTGCCAGTGCTAACAACTCCAAAAGATGGAGGAGATCTCGAACTGGCTAAT GCTGAGATGGTGCCAGAAGATGTAGAAGATAAGTTGACAATTGTGGGCATGGAATCAATA GTTGATGAAGTTTGGAGATGTCTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAT GATGATCATGATGACGACGTGAACGATGATGATGAAGATGAATATGAAGAAGGAGGAGGA GGAGAGGTGGGGATTGTTGGGATATATGGGATGGGGGGTGTGGGCAAAACTACCTTGTTA AAGCAAATCTACAACAAGCTTCTTGATTTGCAGAACAAATTTGGTTTTGTGATTTGGGTG TCAGTTTCTAAAGACCTGCGACTTGAGAAAATTCAAGAACAGATCGGGATAAAGATTGGC TTGTTTGACGAGTTTAAAGTAAAGTGTTTAGCAGCAGAAGAAGCATGGAAATTGTTTCAA ACGTTGATTGGAGATGAGACTCTTCATGATGGTCATCCTGAAGTTCTTGGCCTTGCTAGA GATGTCTCCAAAGAGTGTTACGGTCTGCCACTTGCACTTGTTCGTATTGCTCAAGCCATG GACGGCAAACAAACACCTCAAGAATGGAGAGATTCTCTTCAAGTCTTCAGAAGATTGAGG TCTTCAATTTCAGAATGCTCTGAGTTGGAAGAGATAATCAAAGTTGGGAAATTAAGTGAA TGTCAGGAATTGATAGGAAATTCAACCCCATTCTCAAAACTAGAAACTCTTAGGCTGTTA AAGCTACCAAATTTGAGGAGCATGTATTGGAATGCCTTGCCCTTGCCAGAGCTCAAAAAA ATCACCATAACTGATTGCCCAAGGCTTCAGATTAATCTTCCACCATGTCTTTTCAACCAG GATGAGAAATGTAAAAGTGAAAGTGAAGAACATAGCATGGAAATTATAAGTTCTCAGGAA GTAAATGTGCCTTCAGAACCATCAGGAGACAAGGCACTTCAACAGCTGGTCCATAGACAC AGTCCCACAAGTTCGGGTGAGTCTGGTGCTTCCTGTGATGAACCTGAAAGAAGTCTCGAG AGACCAAGGCTCGTTTGGACTCCACAGCTACATAAGAAATTTGTCGATGCTGTTGCTCAC TTAGGCATCAAGAATGCTGTCCCCAAGACGATACTGCAACTCATGAGTGTTGATGTTCTC ACCATAGAACAAGTTGACAGTCACTTGCAGAAATACCATCTTTATCTCAAAAGAACGCAA GCACTATCTGGTGGTGGTGGTAGCAGCTTCAACGATACTTCTGCTGCCACCTCTGCCTGT TCAGCCACTGACCAATTGTTTGCCATTTTCCCTATTCCACCCCATCTTTTAAATAAGGTT GAGGAAAGTGAAAGTGAAATTGAAGAACAAGGCATGCATTTTACAATTTCGCAGAAGTCA GATTTATCTTCAGGACAATCAGAAACCAAGAGCAGGCCAGGAGATTGGAGGTGCAGGTCA TGCCAGCACCTTAACTTCCACAGGCGTGTCTCATGCCATCGTTACGGGGACCCCAAGTCT GGTGACTTCAGGGGTTTCAGTGCGAGGGGCGGATCATCATTCTTGTTTTTTACCGGAACT GATGTCCGTCCAGGGGACTGGCACTGCTCCGCCGGGAACTGTGGGGCCCACAACTTTGCT AGTCGGTCAAGCTGCTTCAAGTGTGGTGCATCCAAGGATGATGTTGGTGGAGGCTTTCAT TGTGATATGCCAGGCTCCAAAGATTTAGGCTTTGGTGGTCTGGATGCAATGAACACAACT TTGGTAGCAGAATGGAATGCTTCAGATGCAATGCCCCAAGGGACGTTAGCCATCGACCAA TTGTTTGACAGTTCCTCTACTCCACCCCATCTTTCAAATAAGGTTGAGGAAAGTGAAAGT GAAGCACAAAGCACGCATTTTACAGTTGCATAG
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>LITCHI012822.m1 ATGGTGGCTCATAAGCTGCAAGCTGTGATGACTTTTAATATAGAAGGAGCTGCTTTCTGG GTGGCTGATGAGGTGCCACTTGTAACTACTCGAAAAGATGGAGGAGATCTCGAAATGGCT TATGCTGAGATGGTACCGGAAGGTGTAGGAGATAAGTTGACAAGTGCTGAGATGGAATCA ATATGTGAGGTGCCAGTGCTAACAACTCCAAAAGATGGAGGAGATCTCGAACTGGCTAAT GCTGAGATGGTGCCAGAAGATGTAGAAGATAAGTTGACAATTGTGGGCATGGAATCAATA GTTGATGAAGTTTGGAGATGTCTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAT GATGATCATGATGACGACGTGAACGATGATGATGAAGATGAATATGAAGAAGGAGGAGGA GGAGAGGTGGGGATTGTTGGGATATATGGGATGGGGGGTGTGGGCAAAACTACCTTGTTA AAGCAAATCTACAACAAGCTTCTTGATTTGCAGAACAAATTTGGTTTTGTGATTTGGGTG TCAGTTTCTAAAGACCTGCGACTTGAGAAAATTCAAGAACAGATCGGGATAAAGATTGGC TTGTTTGACGAGTTTAAAGTAAAGTGTTTAGCAGCAGAAGAAGCATGGAAATTGTTTCAA ACGTTGATTGGAGATGAGACTCTTCATGATGGTCATCCTGAAGTTCTTGGCCTTGCTAGA GATGTCTCCAAAGAGTGTTACGGTCTGCCACTTGCACTTGTTCGTATTGCTCAAGCCATG GACGGCAAACAAACACCTCAAGAATGGAGAGATTCTCTTCAAGTCTTCAGAAGATTGAGG TCTTCAATTTCAGAATGCTCTGAGTTGGAAGAGATAATCAAAGTTGGGAAATTAAGTGAA TGTCAGGAATTGATAGGAAATTCAACCCCATTCTCAAAACTAGAAACTCTTAGGCTGTTA AAGCTACCAAATTTGAGGAGCATGTATTGGAATGCCTTGCCCTTGCCAGAGCTCAAAAAA ATCACCATAACTGATTGCCCAAGGCTTCAGATTAATCTTCCACCATGTCTTTTCAACCAG GATGAGAAATGTAAAAGTGAAAGTGAAGAACATAGCATGGAAATTATAAGTTCTCAGGAA GTAAATGTGCCTTCAGAACCATCAGGAGACAAGGCACTTCAACAGCTGGTCCATAGACAC AGTCCCACAAGTTCGGGTGAGTCTGGTGCTTCCTGTGATGAACCTGAAAGAAGTCTCGAG AGACCAAGGCTCGTTTGGACTCCACAGCTACATAAGAAATTTGTCGATGCTGTTGCTCAC TTAGGCATCAAGAATGCTGTCCCCAAGACGATACTGCAACTCATGAGTGTTGATGTTCTC ACCATAGAACAAGTTGACAGTCACTTGCAGAAATACCATCTTTATCTCAAAAGAACGCAA GCACTATCTGGTGGTGGTGGTAGCAGCTTCAACGATACTTCTGCTGCCACCTCTGCCTGT TCAGCCACTGACCAATTGTTTGCCATTTTCCCTATTCCACCCCATCTTTTAAATAAGGTT GAGGAAAGTGAAAGTGAAATTGAAGAACAAGGCATGCATTTTACAATTTCGCAGAAGTCA GATTTATCTTCAGGACAATCAGAAACCAAGAGCAGGCCAGGAGATTGGAGGTGCAGGTCA TGCCAGCACCTTAACTTCCACAGGCGTGTCTCATGCCATCGTTACGGGGACCCCAAGTCT GGTGACTTCAGGGGTTTCAGTGCGAGGGGCGGATCATCATTCTTGTTTTTTACCGGAACT GATGTCCGTCCAGGGGACTGGCACTGCTCCGCCGGGAACTGTGGGGCCCACAACTTTGCT AGTCGGTCAAGCTGCTTCAAGTGTGGTGCATCCAAGGATGATGTTGGTGGAGGCTTTCAT TGTGATATGCCAGGCTCCAAAGATTTAGGCTTTGGTGGTCTGGATGCAATGAACACAACT TTGGTAGCAGAATGGAATGCTTCAGATGCAATGCCCCAAGGGACGTTAGCCATCGACCAA TTGTTTGACAGTTCCTCTACTCCACCCCATCTTTCAAATAAGGTTGAGGAAAGTGAAAGT GAAGCACAAAGCACGCATTTTACAGTTGCATAG
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>LITCHI012822.m1 - Up_Stream_Len 2000 CACACTTGATTTTGGTCAACATTGATTTTTATCGGTCTTTGTCATTTAATATTAGTTGAG AGGTGAACTAAAATTGGTTAAGTTTGAAACTTACATGGAAATTACAACTTGACAATGAAA ATGGGATCTTAGTCTATCTGACAAAAAAAACAACATAAATCATGGAGAAAATTAGAAAAT CACATTTCACGCTTAATTTATGTTAACATCGCTTTTTGTCGGTTAGCATCATTTAATGGT AATTGAGAGGTAAAAAAAAATCATGTAAGTTCAAAACTTACATGAAGATTGCAACTTTAC TTTGAAAGATAAGATCTTAGTCTATTTCATAGAAAAACAATATAAATTAATGAGAAAATT GGAAAAACTACACTTCATGGTTGATTTTGGTTAGCATTGATTCTTATTGATTAGCATAAT TTACAATTAATTGAGAGGTGAAATAAAATTGGGTAAGTTTGAAACTTCCAATGGAGATTG CAATTTAACCTAGAAAAATAGGATTAGAGTCTGTTTTTGTAGAGAAACAATATAAATCAA CAAGAAAATCAGAAAAGCCACACTTCAAGCTAGATATTGGTCAACATTGATTTTTGTTGG TTAGCGTCTTTTGATGTTAATTAAGAGGTGAACTTAATCAGACTAGCTCGAAACTTTTGC TGTGTTTGCAAATTGACCTTGAAAATGGGATATAAGTTCATTTTATAGAGAAACAATATA AATCAATAAGAAAATTTGAAAACCATATTTCAGGCTTGATTTCAATCAATATAGATACTT GTTGGTTAGTATCATTTAATGTTAATTGAGAGGTCATTTGAAATTGAGTCAGCTTGAAAG TTACATGGAAATGACAACTTGACCTTGAAAAATGAAATCTCAATTCGTTATACAGAGAAA CAAAATAAATTAATGAGAAAATTAGAAGAATCACACTTCACGTTTGATTTTGGTCAACGT CGATTCTTGTTGGTCAACATCTTCTAAAGTTAATGGAGAAGGGAATTGAAATCAGGATAG ATTGAAACTTTCATGGATAGTGCAATTTGATCTTGAAAAATGAGATTATAATTTGTTTTC TGTGAAACATTATAAATCAACAAGAAAATTGAAAAAAAAAAAAAATCTCATTTCATATTC AATTTCGGTTAGCGTCAATTCTTGTCAGTCAATGTCATTTAATGAGATGAAATGAAATTG TATTGCTAATTATAATAAATATTTTTAGGTTGTATCCTAGAGTTGACTTGCAAAATTAAT AACTAAATAAATAAATAAATAACAAACTCTTCGAATACGTATGCCTAGAAGTCATTTTGT GCTATGTATATTTTTGGCCTCAACAATTTTGGATGGTGGCTTTATAGTTCTTTTCTTGTC TTGTAGTAGGTGAATCAATGAACCACATTTTAAAATTTCGTCATTGGAATATGTTAATGT CGGTATTAAAGAAATGATTATGTAAAGAGTAAAGAAAAGCACAAAATGTTAATTATTCAA TTGGAAAGGATAGTGTTTGTTTATTTTTATTATCCAACTCTTTAAATATCATTTAATCGC ACATGCTATGGCCGGCAATAATGGTGTTCTAATCTGACCACTTTTAATTTAATTAACATT AAAAAATATGGACCATGACCTTATGATTTTCATTTTCAATAGGCAACTTTCTAGGTTATA GTTTCAAATATTCTTTTCTTTGTTTTCTTCTATATCAGAATCCTAACTCTTTTCAGGTAC CTTTGGATCTTCCTCTTACACAAACTATGGCTAGTTGGGACTTATATGCCGATGATGTAG ATGCTTAGAAGAGTGAATTGGAGAATTTGGCTGAAGCAAGAAACCATGTAACGAAGAGAA TTAATATTGCTGAACAAGATCAACAACAGATGCTGCCGACAAATGAAGTGCAACTGTGGC TTTCGAGGGTGCAAGCTCTGGACACTGAAGTTGGTGAGCTGATACAACAAGCCTCTGAAG AGACTGATGAGTAGAAAGAT
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>LITCHI012822.m1 GenomeSequence - ATGGTGGCTCATAAGCTGCAAGCTGTGATGACTTTTAATATAGAAGGAGCTGCTTTCTGG GTGGCTGATGAGGTGCCACTTGTAACTACTCGAAAAGATGGAGGAGATCTCGAAATGGCT TATGCTGAGATGGTACCGGAAGGTGTAGGAGATAAGTTGACAAGTGCTGAGATGGAATCA ATATGTGAGGTGCCAGTGCTAACAACTCCAAAAGATGGAGGAGATCTCGAACTGGCTAAT GCTGAGATGGTGCCAGAAGATGTAGAAGATAAGTTGACAATTGTGGGCATGGAATCAATA GTTGATGAAGTTTGGAGATGTCTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAT GATGATCATGATGACGACGTGAACGATGATGATGAAGATGAATATGAAGAAGGAGGAGGA GGAGAGGTGGGGATTGTTGGGATATATGGGATGGGGGGTGTGGGCAAAACTACCTTGTTA AAGCAAATCTACAACAAGCTTCTTGATTTGCAGAACAAATTTGGTTTTGTGATTTGGGTG TCAGTTTCTAAAGACCTGCGACTTGAGAAAATTCAAGAACAGATCGGGATAAAGATTGGC TTGTTTGACGAGGTGTGGAGAAAAATTTATCGAAAATTGTTTTCACGACTCGTTCTCTTG AAATTTGTAACCTCATGGAAGCAGACAGGCAGTTTAAAGTAAAGTGTTTAGCAGCAGAAG AAGCATGGAAATTGTTTCAAACGTTGATTGGAGATGAGACTCTTCATGATGGTCATCCTG AAGTTCTTGGCCTTGCTAGAGATGTCTCCAAAGAGTGTTACGGTCTGCCACTTGCACTTG TTCGTATTGCTCAAGCCATGGACGGCAAACAAACACCTCAAGAATGGAGAGATTCTCTTC 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