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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI012566 | Chr2 | 12254837 | 12260249 | - | Cold-responsive protein kinase 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI012566.m1 | 49 | 316 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 160.4 | 5.80E-47 |
| LITCHI012566.m1 | 50 | 319 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 156.1 | 1.10E-45 |
| LITCHI012566.m2 | 49 | 316 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 160.4 | 5.80E-47 |
| LITCHI012566.m2 | 50 | 319 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 156.1 | 1.10E-45 |
| LITCHI012566.m3 | 20 | 194 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 92.1 | 4.10E-26 |
| LITCHI012566.m3 | 20 | 197 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 89 | 3.20E-25 |
| LITCHI012566.m4 | 2 | 130 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 45.1 | 8.50E-12 |
| LITCHI012566.m4 | 3 | 133 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 46.2 | 3.80E-12 |
| LITCHI012566.m5 | 2 | 130 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 45.1 | 8.50E-12 |
| LITCHI012566.m5 | 3 | 133 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 46.2 | 3.80E-12 |
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>LITCHI012566.m1 ATGCATTGCTTTTCGTTCTTGTTTAGTAGGAGGGTGGGGCGTTCCTCGACAAAGAAATCC TTTGAGGACATTGAAGAACTTTCTGGCAGTCACAATGTTAAACTCTATACTTACAAAGAG TTAAGCATCGCTACTGATGATTTTAGTGTGATCAATAAAATTGGAGAGGGTGGTTTTGGT TGTGTGTATAAGGGACGACTAAAAGGTGGGAAGATAGCTGCTATAAAAGTTCTTTCGGCT GAATCAAGACAAGGAGTAAAAGAATTCTTAACAGAGCTCAATGTGATCTCAGAAATAGAG CACGAAAACTTGGTAAAGCTCTATGGGTGCTGTGTGGAAGGAAATCATAGAATTTTAGTC TACAACTACCTTGAGAATAATAGCCTTGCACAAACACTTCTTGGTGGAAGCCACAGTAAC ATCCAGTTTAGTTGGCGGACACGATGTAAAATTTGCATTGGGATTGCACGTGGACTTGCA TTCCTTCATGAGGAAATACGGCCACACATTATTCACAGAGATATTAAAGCTAGTAATATT CTCTTAGACAAAGACTTAATGCCCAAAATTTCAGATTTTGGTCTTGCAAAGCTTATCCCA CCCAACATGACTCATGTCAGCACACGTGTGGCTGGAACAATAGGTTATCTAGCACCAGAG TATGCAATAAGAGGTCAATTGACACGAAAAGCAGACATATACAGCTTTGGTGTCCTCCTT GTGGAAATAGTTAGTGGGAGATGTAACACAAATACGCGGTTGCCTATCGAAGAACAGTAT CTCTTAGAACGGACATGGTATCTGTACGAGCGAAAAGAGTTAGTTGGGCTGGTGGATACA TCATTGAATGGGGATTTTGATGCAGAGGAGGCTTGTAGGTTCCTAAAGATTGGTCTTCTC TGCACCCAAGACACTCCTAAGCTTCGGCCATCCATGTCAACTGTTGTCAAAATGTTGACA GGTGAGAACGACATCGATGACAATAAAATAACAAAGCCGGGATTAATTTCTGATTTCATG GACCTCAAAGTAAGAGATCCCCAGAAAACTAATTCGGAGATGAAGAATATGTCTTCCTAC AATGCGTCTAGCTCAGACAATCTATACAATTCGAATGCATCATCTGGAAATACAAGCAGC GCAACTATGACCTTTACTACTCCATATGACAGAAGCACTTAA >LITCHI012566.m2 ATGCATTGCTTTTCGTTCTTGTTTAGTAGGAGGGTGGGGCGTTCCTCGACAAAGAAATCC TTTGAGGACATTGAAGAACTTTCTGGCAGTCACAATGTTAAACTCTATACTTACAAAGAG TTAAGCATCGCTACTGATGATTTTAGTGTGATCAATAAAATTGGAGAGGGTGGTTTTGGT TGTGTGTATAAGGGACGACTAAAAGGTGGGAAGATAGCTGCTATAAAAGTTCTTTCGGCT GAATCAAGACAAGGAGTAAAAGAATTCTTAACAGAGCTCAATGTGATCTCAGAAATAGAG CACGAAAACTTGGTAAAGCTCTATGGGTGCTGTGTGGAAGGAAATCATAGAATTTTAGTC TACAACTACCTTGAGAATAATAGCCTTGCACAAACACTTCTTGGTGGAAGCCACAGTAAC ATCCAGTTTAGTTGGCGGACACGATGTAAAATTTGCATTGGGATTGCACGTGGACTTGCA TTCCTTCATGAGGAAATACGGCCACACATTATTCACAGAGATATTAAAGCTAGTAATATT CTCTTAGACAAAGACTTAATGCCCAAAATTTCAGATTTTGGTCTTGCAAAGCTTATCCCA CCCAACATGACTCATGTCAGCACACGTGTGGCTGGAACAATAGGTTATCTAGCACCAGAG TATGCAATAAGAGGTCAATTGACACGAAAAGCAGACATATACAGCTTTGGTGTCCTCCTT GTGGAAATAGTTAGTGGGAGATGTAACACAAATACGCGGTTGCCTATCGAAGAACAGTAT CTCTTAGAACGGACATGGTATCTGTACGAGCGAAAAGAGTTAGTTGGGCTGGTGGATACA TCATTGAATGGGGATTTTGATGCAGAGGAGGCTTGTAGGTTCCTAAAGATTGGTCTTCTC TGCACCCAAGACACTCCTAAGCTTCGGCCATCCATGTCAACTGTTGTCAAAATGTTGACA GGTGAGAACGACATCGATGACAATAAAATAACAAAGCCGGGATTAATTTCTGATTTCATG GACCTCAAAGTAAGAGATCCCCAGAAAACTAATTCGGAGATGAAGAATATGTCTTCCTAC AATGCGTCTAGCTCAGACAATCTATACAATTCGAATGCATCATCTGGAAATACAAGCAGC GCAACTATGACCTTTACTACTCCATATGACAGAAGCACTTAA >LITCHI012566.m3 ATGAATCTGACTTTTTGTATACACATTTTGCTTTCAGGTGGAAGCCACAGTAACATCCAG TTTAGTTGGCGGACACGATGTAAAATTTGCATTGGGATTGCACGTGGACTTGCATTCCTT CATGAGGAAATACGGCCACACATTATTCACAGAGATATTAAAGCTAGTAATATTCTCTTA GACAAAGACTTAATGCCCAAAATTTCAGATTTTGGTCTTGCAAAGCTTATCCCACCCAAC ATGACTCATGTCAGCACACGTGTGGCTGGAACAATAGGTTATCTAGCACCAGAGTATGCA ATAAGAGGTCAATTGACACGAAAAGCAGACATATACAGCTTTGGTGTCCTCCTTGTGGAA ATAGTTAGTGGGAGATGTAACACAAATACGCGGTTGCCTATCGAAGAACAGTATCTCTTA GAACGGACATGGTATCTGTACGAGCGAAAAGAGTTAGTTGGGCTGGTGGATACATCATTG AATGGGGATTTTGATGCAGAGGAGGCTTGTAGGTTCCTAAAGATTGGTCTTCTCTGCACC CAAGACACTCCTAAGCTTCGGCCATCCATGTCAACTGTTGTCAAAATGTTGACAGGTGAG AACGACATCGATGACAATAAAATAACAAAGCCGGGATTAATTTCTGATTTCATGGACCTC AAAGTAAGAGATCCCCAGAAAACTAATTCGGAGATGAAGAATATGTCTTCCTACAATGCG TCTAGCTCAGACAATCTATACAATTCGAATGCATCATCTGGAAATACAAGCAGCGCAACT ATGACCTTTACTACTCCATATGACAGAAGCACTTAA >LITCHI012566.m4 ATGCCCAAAATTTCAGATTTTGGTCTTGCAAAGCTTATCCCACCCAACATGACTCATGTC AGCACACGTGTGGCTGGAACAATAGGTTATCTAGCACCAGAGTATGCAATAAGAGGTCAA TTGACACGAAAAGCAGACATATACAGCTTTGGTGTCCTCCTTGTGGAAATAGTTAGTGGG AGATGTAACACAAATACGCGGTTGCCTATCGAAGAACAGTATCTCTTAGAACGGACATGG TATCTGTACGAGCGAAAAGAGTTAGTTGGGCTGGTGGATACATCATTGAATGGGGATTTT GATGCAGAGGAGGCTTGTAGGTTCCTAAAGATTGGTCTTCTCTGCACCCAAGACACTCCT AAGCTTCGGCCATCCATGTCAACTGTTGTCAAAATGTTGACAGGTGAGAACGACATCGAT GACAATAAAATAACAAAGCCGGGATTAATTTCTGATTTCATGGACCTCAAAGTAAGAGAT CCCCAGAAAACTAATTCGGAGATGAAGAATATGTCTTCCTACAATGCGTCTAGCTCAGAC AATCTATACAATTCGAATGCATCATCTGGAAATACAAGCAGCGCAACTATGACCTTTACT ACTCCATATGACAGAAGCACTTAA >LITCHI012566.m5 ATGCCCAAAATTTCAGATTTTGGTCTTGCAAAGCTTATCCCACCCAACATGACTCATGTC AGCACACGTGTGGCTGGAACAATAGGTTATCTAGCACCAGAGTATGCAATAAGAGGTCAA TTGACACGAAAAGCAGACATATACAGCTTTGGTGTCCTCCTTGTGGAAATAGTTAGTGGG AGATGTAACACAAATACGCGGTTGCCTATCGAAGAACAGTATCTCTTAGAACGGACATGG TATCTGTACGAGCGAAAAGAGTTAGTTGGGCTGGTGGATACATCATTGAATGGGGATTTT GATGCAGAGGAGGCTTGTAGGTTCCTAAAGATTGGTCTTCTCTGCACCCAAGACACTCCT AAGCTTCGGCCATCCATGTCAACTGTTGTCAAAATGTTGACAGGTGAGAACGACATCGAT GACAATAAAATAACAAAGCCGGGATTAATTTCTGATTTCATGGACCTCAAAGTAAGAGAT CCCCAGAAAACTAATTCGGAGATGAAGAATATGTCTTCCTACAATGCGTCTAGCTCAGAC AATCTATACAATTCGAATGCATCATCTGGAAATACAAGCAGCGCAACTATGACCTTTACT ACTCCATATGACAGAAGCACTTAA
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>LITCHI026836.m1 MLGPIWIRIRFLLHYLWTLLLLLLLVAPAAVKTRSFRPLPPTAALIPPPLLLFLKYKNNF VLRLRLLLSFVFSLAVSLSPLMTPVAFPTQSAKHESCQKLLPPENEHDFVEKDPTGRYVR YDEVLGKGAFKTVYKAFDEVDGIEVAWSLVKIDDVLRSPDDLEKLYSEVHLLKSLKHENI IRFYKSWVDDKKKTVNMITELFTSGSLRQYRKKHKSVDVKVIKNWARQILHGLVHLHGQN PPIIHRDLKCDNIFVNGNQGEIKIGDLGLAVVMQQPTAKSVIGTPEFMAPELYEEEYNEL VDVYSFGMCMLEMVTFEYPYSECKNPAQIYKRVTSGIKPASLAKVNDPQIKDFIEKCLLP ASERLSAKDLLKDPFLQVENPKDPMWDPLQLPNRNLKVLNLPKPGPLSMDIDAEYKQLSQ STFTGSNIESPECPVLEFRRTHQNNEFRLKGKKNDDNSISLTLRIGDSFGRVRNIHFLFY IDSDTAVSVAAEMVEQLELANHDVAFIAEFIDFLIMKLLPRWKPSSDCSSCGISFYGESP LGDGKISMACPWDAMLTSVHLEMMTEQDAISMIASAIDGSLPTQAENMSAPMSYGNYPSS PSLAYLEDLESHASYFTNLLSEDASFKNDTASESNDSNIDGSCKNMSGYVSEFEDMYHDD YKSTRDYYSSSTDGEGILLNEQAKNSGVLFPNLSGVMSLRSSCSSLSLVDKDVDELRQEL KAIETQYQRWFQELSKMREEAMEATRKRWLAKKKLAVH. >LITCHI026836.m2 MITELFTSGSLRQYRKKHKSVDVKVIKNWARQILHGLVHLHGQNPPIIHRDLKCDNIFVN GNQGEIKIGDLGLAVVMQQPTAKSVIGTPEFMAPELYEEEYNELVDVYSFGMCMLEMVTF EYPYSECKNPAQIYKRVTSGIKPASLAKVNDPQIKDFIEKCLLPASERLSAKDLLKDPFL QVENPKDPMWDPLQLPNRNLKVLNLPKPGPLSMDIDAEYKQLSQSTFTGSNIESPECPVL EFRRTHQNNEFRLKGKKNDDNSISLTLRIGDSFGRVRNIHFLFYIDSDTAVSVAAEMVEQ LELANHDVAFIAEFIDFLIMKLLPRWKPSSDCSSCGISFYGESPLGDGKISMACPWDAML TSVHLEMMTEQDAISMIASAIDGSLPTQAENMSAPMSYGNYPSSPSLAYLEDLESHASYF TNLLSEDASFKNDTASESNDSNIDGSCKNMSGYVSEFEDMYHDDYKSTRDYYSSSTDGEG ILLNEQAKNSGVLFPNLSGVMSLRSSCSSLSLVDKDVDELRQELKAIETQYQRWFQELSK MREEAMEATRKRWLAKKKLAVH. >LITCHI026836.m3 MQQPTAKSVIGTPEFMAPELYEEEYNELVDVYSFGMCMLEMVTFEYPYSECKNPAQIYKR VTSGIKPASLAKVNDPQIKDFIEKCLLPASERLSAKDLLKDPFLQVENPKDPMWDPLQLP NRNLKVLNLPKPGPLSMDIDAEYKQLSQSTFTGSNIESPECPVLEFRRTHQNNEFRLKGK KNDDNSISLTLRIGDSFGRVRNIHFLFYIDSDTAVSVAAEMVEQLELANHDVAFIAEFID FLIMKLLPRWKPSSDCSSCGISFYGESPLGDGKISMACPWDAMLTSVHLEMMTEQDAISM IASAIDGSLPTQAENMSAPMSYGNYPSSPSLAYLEDLESHASYFTNLLSEDASFKNDTAS ESNDSNIDGSCKNMSGYVSEFEDMYHDDYKSTRDYYSSSTDGEGILLNEQAKNSGVLFPN LSGVMSLRSSCSSLSLVDKDVDELRQELKAIETQYQRWFQELSKMREEAMEATRKRWLAK KKLAVH.
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>LITCHI007603.m1 CTTTTATATATTTTTTTATTTTAAGATTATTACAGAGTGCAAACTATAGTTGGCTTTTTT GTTACCCTTCCAAGAGTACGTGATCTTACAGAATTCTTACATCAATCAGAAAACCGAAAA AAGAAAATTGAGTTTGGGATTATAACAAACATATTACGATGTAATCAAAAAGACTAATTA AAGCATAGACGGGGCACTGGGGCAAGGAGGAATGGAAATGTCAGTGATGCCTTCTAACAT CAAGACCACGCTCTTCATGGATGGACGAAGTGCTGGTTCGTCTTGGACACACCAAAGCCC TACCTTCACCATGTTCTCCAATGTATTCTTGTCCACCTCTTGACCATGTACAAGGTTCTC CAGCTCCCGATCAATGAAGCATTTGTATACCCATTTAGTCAGAACTATTTCCTCTGGTTT TGATATATCAACTTCCAGGTTTTTTCGGCAGCACACTATTTCCAAAAGCATCACTCCGAA ACTATAAACATCTACTTTCACTGATATTGGAGTGTTCTTGTACCATTCAGGAGCCAAGTA CCCTCTTGTCCCTCTAATTAATGTGAAAGTTCTTGTTTGGTCAGGCATTAGCAATTTTGC CAGACCAAAATCTGATATTTTAGCTGTCCAGGATTCATCCATGAGGATGTTTTGAGGCTT TATATCACAATGAATGATGGGTGCTTCACATTCCTCATGGAGATAGAGGATTCCTTTGGC AACATCTAATGCGATTCTCACTCTCTCATTCCAAACTGGGGAGTTTTGGGAGCGGAAAAT TAGGTCTGCGAGGGAGCCATTGCTCATGTATTCATAGACAAGAAGCCTCTTTGAGTCCTC AGCACAGTAGCCAAACAGCCGCACCAAGTTCTTGTGATGTGTTCGACCTATTACATGCAT TTCCGCTTGGAATTCCCTTTCGCCTTCATTCACTACCTTCTCCAACCTCTTGACCGCAAC AAGTTTTTCCCCTTTTTGAAAAGAGCCTTTGTAAACTGCACCGAAAGAGCCCTTCCCTAA CAATTGTTTGAATCCATTGGTTGCCTTCTTCAGCTCACTGTAAGAGAATGAGCGTAGACA AAGCTCTTCACTTGAGCCAAAGTAATTTCCTGTTTCCAGCAACCGCTTGTATTTATGGAC TCGATGCTTAAACACGAAATAGCCAGAGGTTGCAAGGAAAATACACGAACAAGTCGCAAA CACTAATGTGATAACAAGAATTAGTATGATGGCCTTCTTGCTTGGGACTCTGATTGTATT GAAACCATTGTCTCTTCTGATACTTTTTGAACCCATCTTGAAGTAAGCTACTGTGTCCCG GCCCGAAGTTAATTGTCCTGTTTGATCTCTCTTAGCAGATTTGAGTGGAAGCTTGTGTTT CTAGCAGGATCCTGGATCCCACAACACAGCATCACAATTGCAGTCCTCCAAACAGGAATT TTTGCAACCATCTTCTGACATCGATTCTTTGAGATATGGATAATCTTTCCATGTCATTTT CTCCATGGGAGCCATGTAATAACCTTTTTTACTTCCTCCGCACTTTTCATCACTGAAATT TCTCTGACATAACCTTTGATTAGAGTCAACAGGTTCAGTACCAGGAAGACAATGACAGAC GGGTTTATCATCAGATAATGCGCAGTATCTGTTTAAACCACAGAAACTACTCACATCACA ATTGCTTTTTGGTGTACTAAATTGGATGGATGTTTTGTTCTCTTCAGAGAAAAAATAATA ATACAACCGAAAAATTCCATCATAACCTAGTGTTGCACGGCAGATGATTGAACTGTTGTA CGAAGATGAATCATCATAGTGCAACCCGGCGACGATAGACATGTTATCATTGAGGAGAAC TAGATCACCCGTGTAATTAAGATATAAGTGAACCTGTCCTTCATAATAAACTGAACTACT 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>LITCHI002782.m1 - Up_Stream_Len 2000 TCTCGGCTTGGAATTGCTTTTCACCTTCTTTCACTATCTTCTCCAACCTCTTGACCGCAA CAAGCTTTTCTCCTTTTCGAAAAGCACCTTTGTAAACAGCACCAAAAGAGCCATTGCCCA ACAATTCTTTGAAACCATTGGTGGCCTTCTTCAGCTCTGTGTAAGAAAATGAGCGCAGAG TAAGTTCATCATTTGAGCCAAAGTAATTCCCGGTTTCCAGCAGTCGCTTGTATTTAAGCA CCCGATACTTAAACACGAAATAACCAGAGGTTGCAAGGAAAACACAAGAGCAAGTGGTGA AGCCTAATGTGATGACCATAATTAGTATGATCGCCTTCTTGCCTGTGCTTGTTGGCTCAT TTGCTGTGGGATGGGAACCATTATCAATTTTGATACTTTTGAGGCCTGTCTTGAAGTAAG CTGTATAGGACTTGCTCGATTCTCCTTGAATTCTCTTAGCAGATTTCAGAGGAAGCTTGT ATTTCTCACAATATCCTGATCTGTACAACACAGCATCGCAACTACAGTCCTCCAAACAAG ATGTCTTGCAATCTTCTTCTTGAAGATCTTCTTTGAGATAAGGATAATCATCCCATGTCA TCTTCTCCAAGGAAGTCATGTAATAGGTTCCTCCACTTCCTTTGCACCCTTGATCAGTGA AGTTTCTCTCACATCCAGCATACATTTGATTAGGATCAACAGGATCAGTACCAGGAAGAC AACGGCACATGGTTGATCGTCATACAATGTGCAGTAGCTATTTAAACCACAGAAAGTCTT CACATCACACATGTCCGTGGGGACTTGGTACATGATGGATATGTTGTACTCACCTTCATG GGATATATTTTGAGAATACAACCGAAAAATTCCATCATGGCCTAGTTTTGCACGGTAGCT GATTGATTCACTGTAGGAAGATGAATAAGACAATGTTTTGATTGTAGACATATTAGAGTC GAAGAGAGCTAGATTGCCGGTGTTATTCAGATATAGGCGAGTCTGGGCCATGTTGTTATC ATTAGTGTCAGTGGCCCAATAAGCCTCTGTGTACTCATCTATGGTGTTTATGGGATACAG AACAAGATTCCCATCGTCTTGCATTTTCAGACGAAACCTTCCAGATGAGCTATTAAATTC AGATGCACTGGAAACCAGTTCAGACCCCGCGTTTAGATATTGTTCTCCCAAGATGGTATC AGTGGGAGAGTCGAAACTTGACCAAATGATACCAGAGCTTTTATTATAGAGCACAAAATT ACCTGAATCAAGCATGGAAGCAGAAGTGGCAGACTCTGAGATATTAGCAATGAGTTTATC CTCCTTATCAGTACTGATAATGAGCTTGCCTTCCTAGTTAGTCTAAGCGTAGCATTTGAT GGCAAGGGTGGATCATCTCGATTTGCTGTCCAAACAACAGTAATCTCTGGAGTGGTGACT AACCAGCTTCCCACTAGAAAGCCACTGCCTTGTTGGTAGAACCCGAATGCAAATCTGCCA GAAGGTGAGATCCATGAATGGAGTTTGTTGGTGGGGGACAGTGAAGAGCCTAAGCTTATA TTTGATTGTTGTTTTAGTGCAGCATTAGATTTAGCTTTAAGAATGAATATGAAGAGCAAT AAAACAACATGAGCAGAAGCCATGACTGAAAATGAGAGAAATCTTTGATAGTATTGTCCT CAATTATTAAGGTTTCTCACTAAAGATGGTGAAAAACTTGAACAAAACGTGGGTTCATAT CGTCCATAGTTTCATTCAATGAATTTCAATAATTCATACTGTTCCGTACGAGTTTAAATT CAAAAATATTGAATGATACATAAGTCTACTTTGTGGGACCAATTACAGCTTGTGTGGCTG AAACTTTCCTAAAAATTCTGCTTCATGTGAAAAGCAAAACATTGGGAAAAAAAAAAAGTC ATGTTGTCAACTTGGAAATCAAGCTCCTGAGAATGTCTTCATAAAGTGGAGAACTTTTAT TTCTTGAAAATCTCTCTCTG
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