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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI012566 | Chr2 | 12254837 | 12260249 | - | Cold-responsive protein kinase 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI012566.m1 | 49 | 316 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 160.4 | 5.80E-47 |
| LITCHI012566.m1 | 50 | 319 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 156.1 | 1.10E-45 |
| LITCHI012566.m2 | 49 | 316 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 160.4 | 5.80E-47 |
| LITCHI012566.m2 | 50 | 319 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 156.1 | 1.10E-45 |
| LITCHI012566.m3 | 20 | 194 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 92.1 | 4.10E-26 |
| LITCHI012566.m3 | 20 | 197 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 89 | 3.20E-25 |
| LITCHI012566.m4 | 2 | 130 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 45.1 | 8.50E-12 |
| LITCHI012566.m4 | 3 | 133 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 46.2 | 3.80E-12 |
| LITCHI012566.m5 | 2 | 130 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 45.1 | 8.50E-12 |
| LITCHI012566.m5 | 3 | 133 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 46.2 | 3.80E-12 |
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>LITCHI012566.m1 ATGCATTGCTTTTCGTTCTTGTTTAGTAGGAGGGTGGGGCGTTCCTCGACAAAGAAATCC TTTGAGGACATTGAAGAACTTTCTGGCAGTCACAATGTTAAACTCTATACTTACAAAGAG TTAAGCATCGCTACTGATGATTTTAGTGTGATCAATAAAATTGGAGAGGGTGGTTTTGGT TGTGTGTATAAGGGACGACTAAAAGGTGGGAAGATAGCTGCTATAAAAGTTCTTTCGGCT GAATCAAGACAAGGAGTAAAAGAATTCTTAACAGAGCTCAATGTGATCTCAGAAATAGAG CACGAAAACTTGGTAAAGCTCTATGGGTGCTGTGTGGAAGGAAATCATAGAATTTTAGTC TACAACTACCTTGAGAATAATAGCCTTGCACAAACACTTCTTGGTGGAAGCCACAGTAAC ATCCAGTTTAGTTGGCGGACACGATGTAAAATTTGCATTGGGATTGCACGTGGACTTGCA TTCCTTCATGAGGAAATACGGCCACACATTATTCACAGAGATATTAAAGCTAGTAATATT CTCTTAGACAAAGACTTAATGCCCAAAATTTCAGATTTTGGTCTTGCAAAGCTTATCCCA CCCAACATGACTCATGTCAGCACACGTGTGGCTGGAACAATAGGTTATCTAGCACCAGAG TATGCAATAAGAGGTCAATTGACACGAAAAGCAGACATATACAGCTTTGGTGTCCTCCTT GTGGAAATAGTTAGTGGGAGATGTAACACAAATACGCGGTTGCCTATCGAAGAACAGTAT CTCTTAGAACGGACATGGTATCTGTACGAGCGAAAAGAGTTAGTTGGGCTGGTGGATACA TCATTGAATGGGGATTTTGATGCAGAGGAGGCTTGTAGGTTCCTAAAGATTGGTCTTCTC TGCACCCAAGACACTCCTAAGCTTCGGCCATCCATGTCAACTGTTGTCAAAATGTTGACA GGTGAGAACGACATCGATGACAATAAAATAACAAAGCCGGGATTAATTTCTGATTTCATG GACCTCAAAGTAAGAGATCCCCAGAAAACTAATTCGGAGATGAAGAATATGTCTTCCTAC AATGCGTCTAGCTCAGACAATCTATACAATTCGAATGCATCATCTGGAAATACAAGCAGC GCAACTATGACCTTTACTACTCCATATGACAGAAGCACTTAA >LITCHI012566.m2 ATGCATTGCTTTTCGTTCTTGTTTAGTAGGAGGGTGGGGCGTTCCTCGACAAAGAAATCC TTTGAGGACATTGAAGAACTTTCTGGCAGTCACAATGTTAAACTCTATACTTACAAAGAG TTAAGCATCGCTACTGATGATTTTAGTGTGATCAATAAAATTGGAGAGGGTGGTTTTGGT TGTGTGTATAAGGGACGACTAAAAGGTGGGAAGATAGCTGCTATAAAAGTTCTTTCGGCT GAATCAAGACAAGGAGTAAAAGAATTCTTAACAGAGCTCAATGTGATCTCAGAAATAGAG CACGAAAACTTGGTAAAGCTCTATGGGTGCTGTGTGGAAGGAAATCATAGAATTTTAGTC TACAACTACCTTGAGAATAATAGCCTTGCACAAACACTTCTTGGTGGAAGCCACAGTAAC ATCCAGTTTAGTTGGCGGACACGATGTAAAATTTGCATTGGGATTGCACGTGGACTTGCA TTCCTTCATGAGGAAATACGGCCACACATTATTCACAGAGATATTAAAGCTAGTAATATT CTCTTAGACAAAGACTTAATGCCCAAAATTTCAGATTTTGGTCTTGCAAAGCTTATCCCA CCCAACATGACTCATGTCAGCACACGTGTGGCTGGAACAATAGGTTATCTAGCACCAGAG TATGCAATAAGAGGTCAATTGACACGAAAAGCAGACATATACAGCTTTGGTGTCCTCCTT GTGGAAATAGTTAGTGGGAGATGTAACACAAATACGCGGTTGCCTATCGAAGAACAGTAT CTCTTAGAACGGACATGGTATCTGTACGAGCGAAAAGAGTTAGTTGGGCTGGTGGATACA TCATTGAATGGGGATTTTGATGCAGAGGAGGCTTGTAGGTTCCTAAAGATTGGTCTTCTC TGCACCCAAGACACTCCTAAGCTTCGGCCATCCATGTCAACTGTTGTCAAAATGTTGACA GGTGAGAACGACATCGATGACAATAAAATAACAAAGCCGGGATTAATTTCTGATTTCATG GACCTCAAAGTAAGAGATCCCCAGAAAACTAATTCGGAGATGAAGAATATGTCTTCCTAC AATGCGTCTAGCTCAGACAATCTATACAATTCGAATGCATCATCTGGAAATACAAGCAGC GCAACTATGACCTTTACTACTCCATATGACAGAAGCACTTAA >LITCHI012566.m3 ATGAATCTGACTTTTTGTATACACATTTTGCTTTCAGGTGGAAGCCACAGTAACATCCAG TTTAGTTGGCGGACACGATGTAAAATTTGCATTGGGATTGCACGTGGACTTGCATTCCTT CATGAGGAAATACGGCCACACATTATTCACAGAGATATTAAAGCTAGTAATATTCTCTTA GACAAAGACTTAATGCCCAAAATTTCAGATTTTGGTCTTGCAAAGCTTATCCCACCCAAC ATGACTCATGTCAGCACACGTGTGGCTGGAACAATAGGTTATCTAGCACCAGAGTATGCA ATAAGAGGTCAATTGACACGAAAAGCAGACATATACAGCTTTGGTGTCCTCCTTGTGGAA ATAGTTAGTGGGAGATGTAACACAAATACGCGGTTGCCTATCGAAGAACAGTATCTCTTA GAACGGACATGGTATCTGTACGAGCGAAAAGAGTTAGTTGGGCTGGTGGATACATCATTG AATGGGGATTTTGATGCAGAGGAGGCTTGTAGGTTCCTAAAGATTGGTCTTCTCTGCACC CAAGACACTCCTAAGCTTCGGCCATCCATGTCAACTGTTGTCAAAATGTTGACAGGTGAG AACGACATCGATGACAATAAAATAACAAAGCCGGGATTAATTTCTGATTTCATGGACCTC AAAGTAAGAGATCCCCAGAAAACTAATTCGGAGATGAAGAATATGTCTTCCTACAATGCG TCTAGCTCAGACAATCTATACAATTCGAATGCATCATCTGGAAATACAAGCAGCGCAACT ATGACCTTTACTACTCCATATGACAGAAGCACTTAA >LITCHI012566.m4 ATGCCCAAAATTTCAGATTTTGGTCTTGCAAAGCTTATCCCACCCAACATGACTCATGTC AGCACACGTGTGGCTGGAACAATAGGTTATCTAGCACCAGAGTATGCAATAAGAGGTCAA TTGACACGAAAAGCAGACATATACAGCTTTGGTGTCCTCCTTGTGGAAATAGTTAGTGGG AGATGTAACACAAATACGCGGTTGCCTATCGAAGAACAGTATCTCTTAGAACGGACATGG TATCTGTACGAGCGAAAAGAGTTAGTTGGGCTGGTGGATACATCATTGAATGGGGATTTT GATGCAGAGGAGGCTTGTAGGTTCCTAAAGATTGGTCTTCTCTGCACCCAAGACACTCCT AAGCTTCGGCCATCCATGTCAACTGTTGTCAAAATGTTGACAGGTGAGAACGACATCGAT GACAATAAAATAACAAAGCCGGGATTAATTTCTGATTTCATGGACCTCAAAGTAAGAGAT CCCCAGAAAACTAATTCGGAGATGAAGAATATGTCTTCCTACAATGCGTCTAGCTCAGAC AATCTATACAATTCGAATGCATCATCTGGAAATACAAGCAGCGCAACTATGACCTTTACT ACTCCATATGACAGAAGCACTTAA >LITCHI012566.m5 ATGCCCAAAATTTCAGATTTTGGTCTTGCAAAGCTTATCCCACCCAACATGACTCATGTC AGCACACGTGTGGCTGGAACAATAGGTTATCTAGCACCAGAGTATGCAATAAGAGGTCAA TTGACACGAAAAGCAGACATATACAGCTTTGGTGTCCTCCTTGTGGAAATAGTTAGTGGG AGATGTAACACAAATACGCGGTTGCCTATCGAAGAACAGTATCTCTTAGAACGGACATGG TATCTGTACGAGCGAAAAGAGTTAGTTGGGCTGGTGGATACATCATTGAATGGGGATTTT GATGCAGAGGAGGCTTGTAGGTTCCTAAAGATTGGTCTTCTCTGCACCCAAGACACTCCT AAGCTTCGGCCATCCATGTCAACTGTTGTCAAAATGTTGACAGGTGAGAACGACATCGAT GACAATAAAATAACAAAGCCGGGATTAATTTCTGATTTCATGGACCTCAAAGTAAGAGAT CCCCAGAAAACTAATTCGGAGATGAAGAATATGTCTTCCTACAATGCGTCTAGCTCAGAC AATCTATACAATTCGAATGCATCATCTGGAAATACAAGCAGCGCAACTATGACCTTTACT ACTCCATATGACAGAAGCACTTAA
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>LITCHI012566.m1 MHCFSFLFSRRVGRSSTKKSFEDIEELSGSHNVKLYTYKELSIATDDFSVINKIGEGGFG CVYKGRLKGGKIAAIKVLSAESRQGVKEFLTELNVISEIEHENLVKLYGCCVEGNHRILV YNYLENNSLAQTLLGGSHSNIQFSWRTRCKICIGIARGLAFLHEEIRPHIIHRDIKASNI LLDKDLMPKISDFGLAKLIPPNMTHVSTRVAGTIGYLAPEYAIRGQLTRKADIYSFGVLL VEIVSGRCNTNTRLPIEEQYLLERTWYLYERKELVGLVDTSLNGDFDAEEACRFLKIGLL CTQDTPKLRPSMSTVVKMLTGENDIDDNKITKPGLISDFMDLKVRDPQKTNSEMKNMSSY NASSSDNLYNSNASSGNTSSATMTFTTPYDRST. >LITCHI012566.m2 MHCFSFLFSRRVGRSSTKKSFEDIEELSGSHNVKLYTYKELSIATDDFSVINKIGEGGFG CVYKGRLKGGKIAAIKVLSAESRQGVKEFLTELNVISEIEHENLVKLYGCCVEGNHRILV YNYLENNSLAQTLLGGSHSNIQFSWRTRCKICIGIARGLAFLHEEIRPHIIHRDIKASNI LLDKDLMPKISDFGLAKLIPPNMTHVSTRVAGTIGYLAPEYAIRGQLTRKADIYSFGVLL VEIVSGRCNTNTRLPIEEQYLLERTWYLYERKELVGLVDTSLNGDFDAEEACRFLKIGLL CTQDTPKLRPSMSTVVKMLTGENDIDDNKITKPGLISDFMDLKVRDPQKTNSEMKNMSSY NASSSDNLYNSNASSGNTSSATMTFTTPYDRST. >LITCHI012566.m3 MNLTFCIHILLSGGSHSNIQFSWRTRCKICIGIARGLAFLHEEIRPHIIHRDIKASNILL DKDLMPKISDFGLAKLIPPNMTHVSTRVAGTIGYLAPEYAIRGQLTRKADIYSFGVLLVE IVSGRCNTNTRLPIEEQYLLERTWYLYERKELVGLVDTSLNGDFDAEEACRFLKIGLLCT QDTPKLRPSMSTVVKMLTGENDIDDNKITKPGLISDFMDLKVRDPQKTNSEMKNMSSYNA SSSDNLYNSNASSGNTSSATMTFTTPYDRST. >LITCHI012566.m4 MPKISDFGLAKLIPPNMTHVSTRVAGTIGYLAPEYAIRGQLTRKADIYSFGVLLVEIVSG RCNTNTRLPIEEQYLLERTWYLYERKELVGLVDTSLNGDFDAEEACRFLKIGLLCTQDTP KLRPSMSTVVKMLTGENDIDDNKITKPGLISDFMDLKVRDPQKTNSEMKNMSSYNASSSD NLYNSNASSGNTSSATMTFTTPYDRST. >LITCHI012566.m5 MPKISDFGLAKLIPPNMTHVSTRVAGTIGYLAPEYAIRGQLTRKADIYSFGVLLVEIVSG RCNTNTRLPIEEQYLLERTWYLYERKELVGLVDTSLNGDFDAEEACRFLKIGLLCTQDTP KLRPSMSTVVKMLTGENDIDDNKITKPGLISDFMDLKVRDPQKTNSEMKNMSSYNASSSD NLYNSNASSGNTSSATMTFTTPYDRST.
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>LITCHI002226.m1 TATATATATATATATATATATATTTTAACCAGACATGTTACCATATCTGGTTGACAAAAA CAGATCTATCTTAACAAAAAAAAAAAATAAATAAAATGTCTATCTTAGAATGAAAATCAG ACGGCTGATTTGATGGGCACGGTCAAAACTCAATACACGAGAACCCACCTTCCAGTCCAT CAACGCTCGCTCTTCCTACACAACAAAAACTCTCCTTTGTTTCCTAAATTCAATCGACTC AACCCAACCCAAATACAATTCTCTCCCAACAATTCCCAATCTAATATCATTCTTCTAGGG TTTTCCTCCTCAAGTTGAAACCCTAGACTCTTGTTGTCTCTGATTTTACTTTCGAATGGT TTGTGGCTTGTCAATCAATTGCTGGGCTGAGCAGTGAACATCCACCAGACTGTGTAAAAT GGTCAGTTGTTTCGTTTACTTGCCTGTTAACTTTTTATAGGTAAAAAGGTTTCGATTTTC ATATCTCCACTAGACTGTTAGAGGAGGGGGATGGATAGTGAGGTTCTAGAATTTGATATA GGTGTAGGAGGAACAAGTGGTGGTGGTGGGGAAGGAGATGAGGATATTATAGACATTGCA CACCCTGTTGATGATGAGGACCTGGAAGACAGCCCTCTTCCTGCTAGTGGTCCTGGCAGT GGCGAAATTTACCTGCCTGAGGGTGACTTGTTGGATCTCGAACCTTATGAGGGCATGGAA TTTGAGTCTGAAGAGGCTGCCAAGGCCTTTTACAATTCTTATGCCCGTCGTGTTGGCTTC AGTACCCGTGTTAGTTCCTCTCGCCGTTCCAGGCGTGATGGAGCCATTATCCAACGCCAA TTTGTTTGTGCTAAGGAGGGTTTTAGGAATTTGAATGAGAAACGTACCAAGGATAGGGAG ATCAAGCGGCCCCGCACTATTACTAGAGTCGGCTGCAAAGCCTCTTTATCTGTCAAGATG 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TAGCAGTTACACACACACACATCGATTAAGTTATTTTTTAATTTAGGAGGCCAGTCATGT GAATCAGCTGGATCTATCAGAATATTTGCTTGTTCCTTGGGCTGCTTCACGTGATATATA TACACATGCA
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>LITCHI002226.m1 - Up_Stream_Len 2000 TATCTAACAAAAACTCATATGTTGATGTTCAATCCATTGTTCACAGTACCTATTTTAGAC ACCACAAATAGAATCGCTTACAAAATTCAAAGCACAAAGTCAATAATCTTAACAATCACA TCAAAGTGTTTATGCTACAAAAAACCCACTATGAACAACATTACAGTTTTGTTTGTTCAT TTAACATGCATTCATGCATACGATAACAAAAGGGACAATTATTTTATTTGTAATTTCTTT GGCCAATATACTTTGTTGATGTCTTAATTTTAACATCCCACAAACCCATCCAAGAACACT AAACAAAAATTAACACAAACTCTTTGATGTTCATGACTCCTTATTTAAGAGGAGTTATAG ATTCATATGGTGATTATTTGGATTAACTATAGTTCTGTAATACAATGTATAGAAATGAAT GACATAACCCTCAAGCTTGTTGGATTATATTTAAGGAAAATCTTCATAATAAAGGCTAAC TAATGCATGTTTACTTGATAGTTTAATGAAGATTAGCTAAAAATTTCCCATTATTTTTTC CTAAACGATTGATTACTCATGTTACCTATATTTTAAAGTGGGGTTTCTACTTTTCCAGTT GCATCAAACTAGCAATAATGATATTAGAACCATGTGGATTTGAGATGCTCTAGTCATTAA TTAATTAAACAACCATAAAAGTATAACTTGAATGCTCCACAACAGTTGAGTATTTAAAGA TGCTCAAAAGATGGTGTATCAACTTTAAAGGAAAGTGGAAAAAAAAAATAAAAATCTAAG AGCAGTTTGTCCCCTCACAACAATACATTCACATTATAAACACATTACCAAAAACAACTA CCAATATAATTTAACATTCACATTCTAATCATACCTACAAAACCACACACAAAATAGACC AAACAGCCAAAACCCACTTTCAAAATCCTAACCTTGGTTCATATTACCATATTCGGATAC TCAAAGTAAGTAAAGTTAGTCAAATAAACTTACCAGTTGGAGAGAAGAAGAGAGTTAGTT GTGGTTGCAGTTCTTTCACAATCCAAAAAATGAGAGATGTTGGGAACAAGCTAACTGATT CCTTCTTTTGTTGGGCAAGGGAAAAGAGAAGAGAGGTTGGGTGTGGGAAGTGAGAAGAGA GCAAGATGTGGAAAGTGACGAAATAGAGAGCTTTTGGGTATGAGTGTACTGCACAAGAAA ACAATGCATTATTTTTGGGTGGCAGCTATCATTAAGGGCATTTTTGTCCATTAAAGGTTT TTTTTGTAAGAATCTCATAAAGAGGTTGTTTTTCAACTTGACCTTCCAAAGAGGGTTATT TTGGGCATTTTCTCATAATAAAATGATGATATATGGTCTGTCCAGAGAACAATAGTAAAA ATTTGATAAAAAGTGACACATTACCATATTAAAATGATGATAAATGGAATATGGACTGTC CACAGAACAATAGTAAAATTTTGGTACAGCGACATATTACCGCACATATATATATATATA TATATATATATATTTTAACCAGACATGTTACCATATCTGGTTGACAAAAACAGATCTATC TTAACAAAAAAAAAAAATAAATAAAATGTCTATCTTAGAATGAAAATCAGACGGCTGATT TGATGGGCACGGTCAAAACTCAATACACGAGAACCCACCTTCCAGTCCATCAACGCTCGC TCTTCCTACACAACAAAAACTCTCCTTTGTTTCCTAAATTCAATCGACTCAACCCAACCC AAATACAATTCTCTCCCAACAATTCCCAATCTAATATCATTCTTCTAGGGTTTTCCTCCT CAAGTTGAAACCCTAGACTCTTGTTGTCTCTGATTTTACTTTCGAATGGTTTGTGGCTTG TCAATCAATTGCTGGGCTGAGCAGTGAACATCCACCAGACTGTGTAAAATGGTCAGTTGT TTCGTTTACTTGCCTGTTAACTTTTTATAGGTAAAAAGGTTTCGATTTTCATATCTCCAC TAGACTGTTAGAGGAGGGGG
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>LITCHI002226.m1 GenomeSequence - TATATATATATATATATATATATTTTAACCAGACATGTTACCATATCTGGTTGACAAAAA CAGATCTATCTTAACAAAAAAAAAAAATAAATAAAATGTCTATCTTAGAATGAAAATCAG ACGGCTGATTTGATGGGCACGGTCAAAACTCAATACACGAGAACCCACCTTCCAGTCCAT CAACGCTCGCTCTTCCTACACAACAAAAACTCTCCTTTGTTTCCTAAATTCAATCGACTC AACCCAACCCAAATACAATTCTCTCCCAACAATTCCCAATCTAATATCATTCTTCTAGGG TTTTCCTCCTCAAGTTGAAACCCTAGACTCTTGTTGTCTCTGATTTTACTTTCGAATGGT TTGTGGCTTGTCAATCAATTGCTGGGCTGAGCAGTGAACATCCACCAGACTGTGTAAAAT GGTCAGTTGTTTCGTTTACTTGCCTGTTAACTTTTTATAGGTAAAAAGGTTTCGATTTTC ATATCTCCACTAGACTGTTAGAGGAGGGGGATGGATAGTGAGGTTCTAGAATTTGATATA GGTGTAGGAGGAACAAGTGGTGGTGGTGGGGAAGGAGATGAGGATATTATAGACATTGCA CACCCTGTTGATGATGAGGACCTGGAAGACAGCCCTCTTCCTGCTAGTGGTCCTGGCAGT GGCGAAATTTACCTGCCTGAGGGTGACTTGTTGGATCTCGAACCTTATGAGGGCATGGAA TTTGAGTCTGAAGAGGCTGCCAAGGCCTTTTACAATTCTTATGCCCGTCGTGTTGGCTTC AGTACCCGTGTTAGTTCCTCTCGCCGTTCCAGGCGTGATGGAGCCATTATCCAACGCCAA TTTGTTTGTGCTAAGGAGGGTTTTAGGAATTTGAATGAGAAACGTACCAAGGATAGGGAG 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