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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI012522 | Chr2 | 10862211 | 10866180 | - | Zinc finger protein CO3 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI012522.m1 | 232 | 274 | PF06203.17 | CCT | Motif | 61.2 | 8.10E-17 |
LITCHI012522.m2 | 227 | 269 | PF06203.17 | CCT | Motif | 61.2 | 7.90E-17 |
LITCHI012522.m4 | 154 | 196 | PF06203.17 | CCT | Motif | 61.9 | 4.90E-17 |
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>LITCHI012522.m1 ATGTATGCAGAGACTGGGCTGCTTTACCCTTACATGCAGGATTTCTCTCAAGATTTTCAG CAACTTGAAGAGTATTGTAAATCTAACAAGTCCAATTCTTCAATGTGCAACAACGTGCAG AGCTCCAGCATATCAGAATATGAGCTGGTTGGAGAAGGAGATTTATTCAAAGCTCCAGAG CCCATCGTGGAAGAACCAGTTGGGAGCCTTGATCCTGTGACAGCAGCCATATCGATGATT TCTTGTGGGGAAGATGTCATCACCTCTGCAGGACTCAAGGGTGCAAATCTTGAGTCAATT CAAAGCGAGCAGCTCCTTAGTGAGGTTTTCTATGAATGGGAGAAGGATCTCATGGAAAAA GCTGCTATCGACTCACCACTTTCTGAGGTTCTTGATATCAAGATTCCTGTCTTGAGAACG GACGAAAACCAAATTCAAGAAAACAAATTGCTTCCTGATATCTCATTTCAGAAAAGTGTG AGCTCAGGATGTTTAACCTCAATGGAGTGGATCAACGGCACTGCAATGAAGCCAAATTTC TTGGAGTTTCCCGGAATGGATTTGGGATGTGTTTATGGCATGCGGAGAGCATTTAGTGAA GGAGACATAAAGACTCTCGGTAATGGTAATGTGAGCCTCATCCATTCTCCGCTTGAGCAA CCTTTGATCATCAGCAGCTGCTCTTCCGAGGATCGCAGGGAAAAGCTTTCCAGATACCGA AATAAGAAGACAAAGAGGAACTTTGGCCGGAAAATCAAGTATGCTTGCAGGAAGGCTCTT GCCGACAGTCAACCAAGGATTCGCGGAAGGTTTGCAAAGACTGAAGAGTCGGACGTTTCC AAGAGACAATGA >LITCHI012522.m2 ATGTATGCAGAGACTGGGCTGCTTTACCCTTACATGCAGGATTTCTCTCAAGATTTTCAG CAACTTGAAGAGTATTGTAAATCTAACAAGTCCAATTCTTCAATGAGCTCCAGCATATCA GAATATGAGCTGGTTGGAGAAGGAGATTTATTCAAAGCTCCAGAGCCCATCGTGGAAGAA CCAGTTGGGAGCCTTGATCCTGTGACAGCAGCCATATCGATGATTTCTTGTGGGGAAGAT GTCATCACCTCTGCAGGACTCAAGGGTGCAAATCTTGAGTCAATTCAAAGCGAGCAGCTC CTTAGTGAGGTTTTCTATGAATGGGAGAAGGATCTCATGGAAAAAGCTGCTATCGACTCA CCACTTTCTGAGGTTCTTGATATCAAGATTCCTGTCTTGAGAACGGACGAAAACCAAATT CAAGAAAACAAATTGCTTCCTGATATCTCATTTCAGAAAAGTGTGAGCTCAGGATGTTTA ACCTCAATGGAGTGGATCAACGGCACTGCAATGAAGCCAAATTTCTTGGAGTTTCCCGGA ATGGATTTGGGATGTGTTTATGGCATGCGGAGAGCATTTAGTGAAGGAGACATAAAGACT CTCGGTAATGGTAATGTGAGCCTCATCCATTCTCCGCTTGAGCAACCTTTGATCATCAGC AGCTGCTCTTCCGAGGATCGCAGGGAAAAGCTTTCCAGATACCGAAATAAGAAGACAAAG AGGAACTTTGGCCGGAAAATCAAGTATGCTTGCAGGAAGGCTCTTGCCGACAGTCAACCA AGGATTCGCGGAAGGTTTGCAAAGACTGAAGAGTCGGACGTTTCCAAGAGACAATGA >LITCHI012522.m3 ATGTATGCAGAGACTGGGCTGCTTTACCCTTACATGCAGGATTTCTCTCAAGATTTTCAG CAACTTGAAGAGTATTGTAAATCTAACAAGTCCAATTCTTCAATGTGCAACAACGTGCAG AGCTCCAGCATATCAGAATATGAGCTGGTTGGAGAAGGAGATTTATTCAAAGCTCCAGAG 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AGTGAAGGAGACATAAAGACTCTCGGTAATGGTAATGTGAGCCTCATCCATTCTCCGCTT GAGCAACCTTTGATCATCAGCAGCTGCTCTTCCGAGGATCGCAGGGAAAAGCTTTCCAGA TACCGAAATAAGAAGACAAAGAGGAACTTTGGCCGGAAAATCAAGTATGCTTGCAGGAAG GCTCTTGCCGACAGTCAACCAAGGATTCGCGGAAGGTTTGCAAAGACTGAAGAGTCGGAC GTTTCCAAGAGACAATGA >LITCHI012522.m5 ATGATTTCTTGTGGGGAAGATGTCATCACCTCTGCAGGACTCAAGGGTGCAAATCTTGAG TCAATTCAAAGCGAGCAGCTCCTTAGTGAGGTTTTCTATGAATGGGAGAAGGATCTCATG GAAAAAGCTGCTATCGACTCACCACTTTCTGAGGTTCTTGATATCAAGATTCCTGTCTTG AGAACGGACGAAAACCAAATTCAAGAAAACAAATTGCTTCCTGATATCTCATTTCAGAAA AGTGTGAGCTCAGGATGTTTAACCTCAATGGAGTGGATCAACGGCACTGCAATGAAGCCA AATTTCTTGGAGTTTCCCGGAATGGATTTGGGATGTGTTTATGGCATGCGGAGAGCATTT AGTGAAGGAGACATAAAGACTCTCGGTAATGGTAATGTGAGCCTCATCCATTCTCCGCTT GAGCAACCTTTGATCATCAGCAGCTGCTCTTCCGAGGATCGCAGGGAAAAGCTTTCCAGA TACCGAAATAAGAAGACAAAGAGGAACTTTGGCCGGAAAATCAAGGTAACAACAGATAAG TAA >LITCHI012522.m6 ATGTATGCAGAGACTGGGCTGCTTTACCCTTACATGCAGGATTTCTCTCAAGATTTTCAG CAACTTGAAGAGTATTGTAAATCTAACAAGTCCAATTCTTCAATGTGCAACAACGTGCAG AGCTCCAGCATATCAGAATATGAGCTGGTTGGAGAAGGAGATTTATTCAAAGCTCCAGAG CCCATCGTGGAAGAACCAGTTGGGAGCCTTGATCCTGTGACAGCAGCCATATCGATGATT TCTTGTGGGGAAGATGTCATCACCTCTGCAGGACTCAAGGGTGCAAATCTTGAGTCAATT CAAAGCGAGCAGCTCCTTAGTGAGGTTTTCTATGAATGGGAGAAGGATCTCATGGAAAAA GCTGCTATCGACTCACCACTTTCTGAGGTTCTTGATATCAAGATTCCTGTCTTGAGAACG GACGAAAACCAAATTCAAGAAAACAAATTGCTTCCTGATATCTCATTTCAGAAAAGTGTG AGCTCAGGATGTTTAACCTCAATGGAGTGGATCAACGGCACTGCAATGAAGCCAAATTTC TTGGAGTTTCCCGGAATGGATTTGGGATGTGTTTATGGCATGCGGAGAGCATTTAGTGAA GGAGACATAAAGGTCAGATTTATTACTTTGAGATGTATATTTCTTTGTCGTTTTTGA >LITCHI012522.m7 ATGTATGCAGAGACTGGGCTGCTTTACCCTTACATGCAGGATTTCTCTCAAGATTTTCAG CAACTTGAAGAGTATTGTAAATCTAACAAGTCCAATTCTTCAATGTGCAACAACGTGCAG AGCTCCAGCATATCAGAATATGAGCTGGTTGGAGAAGGAGATTTATTCAAAGCTCCAGAG CCCATCGTGGAAGAACCAGTTGGGAGCCTTGATCCTGTGACAGCAGCCATATCGATGATT TCTTGTGGGGAAGATGTCATCACCTCTGCAGGACTCAAGGGTGCAAATCTTGAGTCAATT CAAAGCGAGCAGCTCCTTAGTGAGGTTTTCTATGAATGGGAGAAGGATCTCATGGAAAAA GCTGCTATCGACTCACCACTTTCTGAGGTTCTTGATATCAAGATTCCTGTCTTGAGAACG 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>LITCHI004083.m1 ATGATTTTCACTGAGTCTCGTGACCGCAAATCACTTCATGAAACTGTATCGTCCGACGCG TATTTTCAAAAAGACAGTATTGTCAAATATCAGACCCAAAGTTCACATGCCTACAGTCTA CACAGAGGAAACATCTTTTGTGGTGCACATTTTCTTTCGAAACTTTCTTTATCTAGAATA GATACTTGCAAGAAACTACGTTCCAGATTATATTCTCTCAGCCTCAGACCTCAGTATAAA AGCCATTATGGCATATGCTTCATGGACTTCTTACATGGGTTTTGTGGATGTCTGTATATA GGTAAGATGTGTTCGATTTTGAGAAAAACCAAACATTCAGGGAAGGCAGATCATGAGACA TCATTAATGATGAAGAATGGAGGAATTTTATTGGAAAAGCTTATTGCCTCTAGTAAAGGT AAATATAATCCGATTCGTTCCTTTTCGGTTGAAGAGATTAAGACAGCAACAAACAACTAT TGTAGACAGAATGTTGTAACGAGAGCTCGTTCTCATGATATCTATAAAGGTTTTCTGCAT GACCGACCAGTGTCTGTTATGAAGTATAGAGATGACTACTCAAAAGCACACGAACATTGT TTTAATAACATCGTATTTGCAGCACAGATGTGTCACAAAAATACTTTGAAGTTAATTGGA TGTTGTTTGGAAACCCAAACTCCCGTTCTGGTTTTTGAACCTGTGAAGTATGGTTCTTTG GCTGATCATATTTATCATGACGCTAAACCTGATTTTGAGCCTTTACTATGGACTCATAGG TTAAAGATTGCGATGGAGATAGCTAATGTAGTTGCATATTTCCATGTTGGATTCTCTAGA CCAATCCTTTTTAGAAATAGAAAACCATCTAACATCTTATTCAATGAAGACCATGTTGTA AAACTGTTGGATTTTTCGTTGTGCGTATCCATTCCCGAAGATAAAACTCATGTAATCGAT ATGGAGCTAATAGGAACTACTGGATATGTTGCACCCGAGTATATCGATTCACAGTATTGT AATGAGAAATATGATGTGTTTAGCTTTGGTGGATTGTTACTAGAGCTTTTGACGGGACTA CGAATGTTTAATAGTTTTATTTTAGCAACTGATGACGAGTTTTCCCCACGGGATCGTCTG CTGAAACATATTGAAAACAATAGGTTGAAAGACATAGTACATCCTATAATAGTTGGAGAT GGGCTCTCTCACGAAAAAGAGCAGCAATTGCGATCTTTTGCGGAGCTTGCCATTAAATGT TACTCAGTGTCACCAGAAAACAGGCCAACAATGGTTGAAGTGGCAAAACAAATAAGGCAA CTAAAACTCAAGCATCCAGGGAAGGCAGATAAGACATCATTAATGATGAAGAATGGGGGA ATTTTATTGGAAAAGCTGATTGCATCTAGTGAAGGTAAATATAATCAGATTCGTTCCTTC TCGGTTGAAGAGGTTAAGACAGCGACAAACAACTTTAATAGACAGAATGTTATAACGAGA GATAGTTTACATGAAGTTTATAAAGGTTTTCTGCATAACCGTCCAGTGTCCGTTATGAAG TATGGAAATGATAGCTCAGAAGCACAAGCATATAGTTTTAATAACATTGTATTTGCAGCA CAAATGTGTCACAAAAATACTTTGAAGTTAATTGGATGTTGTTTAGAAACCCAAACTCCC ATCCTAGTTTTTGAATCTGTTAAATATGGTTCTTTGGATAAGCATATTCATCATGACGGT CAACCTGATTTTGAGCCTTTACCGTGGACTCATAGGTTAAAGATTGCGATGGAGATAGCT AATGTGGTTGCATATTTCCATGTTGGATTCTCTAGACCAATCGTTTTTAGGAATATAAAA CCATCTAACATCTTATTCAATGAAGAGCACATTCCAAAACTGTTTGATTGCTCGCTTTGC ATATCCATTCCAGAAGGTAAAACTTATGTAATTGATCCGGTTGTAGTAGGAACTTTTGGA TATCTTGCACCTGAGTGTTTTGCTTCAAATTATTGTGATGAGAAATGTGACGTGTTTAGC TTTGGTGCATCGTTTTACACAACTGGAGAAGAGTATTGCCTACGGAATTATGTACTGAAA CATATTGTAAACAATAGGTTTAAAGACATAGTAGATCCTATAACAGTTGGAGATGGGCTC CCTCACGAAAAAGAACAGCAATTGCAATCTTTTGCGGACCTTGCCATTAAATGTTACTCA GAGTCACCAGAAAACAGGTCAACAATGGTTGATGTGGCAAAACAAATAAGGCAACTGTAT CTTTCTTGTAACTCTTGTTAA
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>LITCHI004083.m1 + Up_Stream_Len 2000 GATGTTTTGAAACTCTGTCGAATTTGAAGCAGGAGACTATTAACCAGTCAAACTGGAAAA TGGCATGGAAATATTTTCATTTTTTGAAATTGGCACGGGAATATTGATTAACAGTAGATA ATGAAGAGAAAGTTCTGTTATAGCTTGATGTTGATAATGATTTATTTGCTCTCGAATCAT TTATACATTCAGTATGTGATGAATTGGTCTGCCGTAAACTTATCGGATTTGGATCCAGTA TCCTTTTTTAAAAAAATATTTTGAATATTTGATGATATATGATAAACTTTACAAATAAAT AAATGTTTATTTATTATTTATTCTTTTTCTCTCATTTGAAATATAATTTTTTTTTTTTTT TTTGTGTCTTATGTCAAAATATCATTATAGATCATATTAACGCTAAATGGAAGTCTAAAC TATCCAGTCACACATGAGGAACTTTCTAGCTGGCCAAGTACTGCTCAAGACTTGCAATAA TTCAAGTCATGCATGACTTGCAATAATTTAAGTCACCCAAGTACACATCACTTACGGAAA AATTGGCCCATCACAGCCACAAACGGGACCACCCCATCTATAAAGTTTCATGGTTGATAG AGAAGACTTGGGAGTAGTGACAAAGTTTCTGGTTTATCTTCATTTCTAATTTAGATTAAA TTCAAACTCCGAACCCTTTTCTTTTTCTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTCGAATCAGATTA AGTAGCAGACAAATTACTTAGTGTATCTGTTAGGGGTGGGCACAAAAACATGGAACCGAT CCGAACACCCTGATCCGGTCCGATCCGTGGGTGTTCGGATCGGATCACATGTTCAAAAGT AAGGTGTTCGGATCCTCACTTGTGAAAACACCATGTTTCACGGATCGGATCGGATCGGGG TTTTCAAAACCGATCCGATCCGTGAACCCGTGAACAATGATACATACGTAATTTCATATG TCTCTATATAAAGTCTACTTAAGCTAACCCTAACATCCATCTCTCACTCTCTTTCACTCT CATCTCAGTAGCTTGATGAGTTTATTTGCAGCTTTAGCTTGATATTTATATGATTGGGTG TTAGTGTTTTAGTGATTTCTATGCTTATTTGTTATGTTCTGTTGTTGAGTTACATATTTC ATTTGTTGATTATATATATATATATATATATATGTTATTATTGATATGAATAAATGGGAA AAAGTATAAAGAGTGGTGCTAGTGGGATTTGAACTATGATTTCCATTAATATAAAGATGG GCTTATTGAAATTCAGAAGACTTGTTGTTGAAAATGACCTTGAAAACCGAGTGCCCAATT CTCCTATTTATTTTTATTATTATTCTGAGTGGGTAGTTGTCGGTGGTGTTTGATGTTGGT AGCCGGCAAAGGAGATGTTACACATATTTGATGTTGAGTAATTTGTATGAATGTTTACAA AATTTGGGAGATATGTATTACAATTCACGAAGGTACACCAACAAGATATCTCTATTTATC TTTTTATCATAAGTTGAAATTGAAAGTAGGTGTTCTGATCCGGTCCGATCCGTGAACTAG GTGTTCGGATCGGATCGGTTCCTTCTCCTTGATGGATCATGTTCGGATCCAAAAATGGTG ATCCGCGAAGTTACCATGTTCGGATCGGATCCAGTTGGAAGCGATCCGAACATGGTGTTG CCCACCCCTAGTATCTGTTGTAATTTCTTTGAAAATATATTTTGTTAGCGTATTGTAATA GTAAAAGCAATATTGTATACAGTTAAATTAATTTAAATTTATTAAAAAACTATAAGAATA TATGTATATATATCAACTTGTAAAAAAAAATTATTACGACAAAAATAATATATTATTCTT GAGAAAAGTATATTTATAAACAATTAAAAAAAGGCTAAGTATTCAAAAAAAAAAAAGGAT AAGTATAACTCATATACATAATAGATAGACTATATATAAACTTACAACTATTCACTTTAT GCATTAAAAAAAAAAAAATT
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>LITCHI004083.m1 GenomeSequence + ATGATTTTCACTGAGTCTCGTGACCGCAAATCACTTCATGAAACTGTATCGTCCGACGCG TATTTTCAAAAAGACAGTATTGTCAAATATCAGACCCAAAGTTCACATGCCTACAGTCTA CACAGAGGAAACATCTTTTGTGGTGCACATTTTCTTTCGAAACTTTCTTTATCTAGAATA GATACTTGCAAGAAACTACGTTCCAGGTTTATCTTGCTTGTTGCTTCAGATTATATTCTC TCAGCCTCAGACCTCAGGTAATTTCTTTATCTTGATACCCAAATTAATTCTAGCCATCCG CGGTCCCGTCCTATTCGAGCTTTTATATGTACTAATCATGTTCATGTTCTCTGTTAATTA ATTCAACCAAAATGTGAATTCTTTGTATACTATTGGATCAATTCATTTTACCTTCTTAAT AGGCTTAATATAATTTCATATATATAAAGTATAAAAGCCATTATGGCATATGCTTCATGG ACTTCTTACATGGGTTTTGTGGATGTCTGTATATAGGTAAGATGTGTTCGATTTTGAGAA AAACCAAACATTCAGGGAAGGCAGATCATGAGACATCATTAATGATGAAGAATGGAGGAA TTTTATTGGAAAAGCTTATTGCCTCTAGTAAAGGTAAATATAATCCGATTCGTTCCTTTT CGGTTGAAGAGATTAAGACAGCAACAAACAACTATTGTAGACAGAATGTTGTAACGAGAG CTCGTTCTCATGATATCTATAAAGGTTTTCTGCATGACCGACCAGTGTCTGTTATGAAGT ATAGAGATGACTACTCAAAAGCACACGAACATTGTTTTAATAACATCGTATTTGCAGCAC AGATGTGTCACAAAAATACTTTGAAGTTAATTGGATGTTGTTTGGAAACCCAAACTCCCG 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