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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI012378 | Chr2 | 6405727 | 6408812 | + | Homeobox-leucine zipper protein ATHB-7 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI012378.m1 | 32 | 85 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 60.5 | 1.20E-16 |
LITCHI012378.m1 | 87 | 128 | PF02183.21 | HALZ | Coiled-coil | 53 | 3.00E-14 |
LITCHI012378.m2 | 32 | 85 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 60.7 | 9.80E-17 |
LITCHI012378.m2 | 87 | 128 | PF02183.21 | HALZ | Coiled-coil | 53.2 | 2.60E-14 |
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>LITCHI012378.m1 ATGGAGTTCCTGACACCATCACCTGATGAACCAAAATCTGATGAGACCACCCCACCACCT TCAAAGAAGATCAAGAAGAACAAGCTCATCAAGAACCAGAGGAGGTTCAGTGATGATCAA ATCAAGCTACTGGAGTCAATTTTTGAGTCTGAAACGAGGCTCGAACCGAGGAAGAAGTTG CAATTAGCAAGGGAGCTAGGGCTGCAGCCCCGCCAGGTTGCTATATGGTTCCAGAACAGA AGAGCTAGATGGAAATCCAAGCAAATTGAGCATGATTACAGGACTCTCCAAGCTGATTAT GACAACTTAGCTTCTCGTTTCGAATCCTTGGAACAAGAGAAAGAATCATTGCTCTTACAG TTACAGAAACTGAATGAACTGCTGGATAAAAAACCTGAAGAAGATGGGAATCCTGGAAGA GACATAGGAACTATAAAGAGTGAGCCTGGCACGAATCTGAGTATTTTCGTGGAGGAAGAA TTGGAGCAGAAAGGATTCAGGAATTCACAGAATGATGATAGAATTGAAACTGGACACTCT AGAGAGGAAGGAAGCAAGCTTCAGGAAATAGCTGAAAGCTTAGAAGGGTCAGAAAAATCG TCTGAAAATTGGTATGGATTTGAATTCAATGGCCTAATAGATCCCTCAGGCAGCAGCAGC TCACACTGGTTAAATTCTTGGGTTTGA >LITCHI012378.m2 ATGGAGTTCCTGACACCATCACCTGATGAACCAAAATCTGATGAGACCACCCCACCACCT TCAAAGAAGATCAAGAAGAACAAGCTCATCAAGAACCAGAGGAGGTTCAGTGATGATCAA ATCAAGCTACTGGAGTCAATTTTTGAGTCTGAAACGAGGCTCGAACCGAGGAAGAAGTTG CAATTAGCAAGGGAGCTAGGGCTGCAGCCCCGCCAGGTTGCTATATGGTTCCAGAACAGA AGAGCTAGATGGAAATCCAAGCAAATTGAGCATGATTACAGGACTCTCCAAGCTGATTAT GACAACTTAGCTTCTCGTTTCGAATCCTTGGAACAAGAGAAAGAATCATTGCTCTTACAG TTACAGAAACTGAATGAACTGCTGGATAAAAAACCTGAAGAAGATGGGAATCCTGGAAGA GACATAGGAACTATAAAGAGTGAGCCTGGCACGAATCTGAGTATTTTCGTGGAGGAAGAA TTGGAGCAGAAAGGATTCAGGAATTCACAGAATGATGATAGAATTGAAACTGGACACTCT AGAGAGGAAGGAAGCAAGCTTCAGGAAATAGCTGAAAGCTTAGAAGGGTCAGAAAAATCG TCTGAAAATTGTTTAAGGCCACGATAG
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>LITCHI012378.m1 + Up_Stream_Len 2000 CCACACATTCATGAATACGAAAAAGAAATTAAAAAAAGGATAATCCCACGTCCCCCAATA TAATTTGATATAATTACAAATTACTTACTGTTGTTTTAGAAAATCTAATTTTATCTCCTA TCATTACTATTATTAGTAAAATAACTGGAATGATCAAAGTGTTTTTATAAGTTTGTTCTT CTTATTAAGGATCAAACTTTGATTTTCAAAATCAACTTTAATAAAAAGAGTTTTTTTTTT TTTTTTGGATATTTTCATAAATTATAGTGGTATTTTATCTATTTCAAAATCGATAAGGGG ATATTAACAATTTTTAAAAATATAGAAAAATTTTGATATTATATTAAACTATAGGGGAAA ATATTATTATCCAAAAAAAAAAAGAATTGTGAAAAATGTAAATATTTTTACTAACTTTCC CTAATTCCCTCAACAAAGATGATTTTTCTCTTTCATTAACCTCAAATTTTGATTAAAATT CGGACTTTCAGTTTTGAAATTCGTAGTAAAATGTATTATGAACTCTCTCTTAAAATTAAC AAAAAGTTTATAAAGCTTTATAAATTAAATTTATTTTGAACCTTCGTTGTAGGGAGCTCT TGACTATTTTGTAAATTAAGTAGATCCAAGTGTAATTAATTAAATCTTATTATAGGTTAG TGAAATTCTTATATAGATCAATGTGGACACAATGTAGAATGGCGAAAAGACCTGCACTAA AGTGAAAGGGCATGGCAAGTTTTTTCCTTTTGAAAAATTGAAGACATTTATACTTTTTTT CTTTTTTCTTTTTAATGGGGAAATTGTATGCTTTTACGGTGACAAGCATACAATTTCTAC TTCTAATCAAACTGATAAAGACAAGACTTGAACAGAAGCAATAACATATGGTTTATTGTT TAGAAATAGAAATTAGAAAGATAAAGAAGACCAGAACCACAAGTCATAACAAGTGTAAAG GCACACGAAATCTAACCTTATTGGTTGTCATAAAACATTCATATCCATCAGTGCATAGTT CCATTACTTGAAAGCAATCACATTTAATATATATTGTTTTCTTAAAACAAAAAAATTGTA TAGGTAACAGACGTACTGTGGATGAAATAAATCCATTTCATTGAAGAGTTTCCCTCAAAT TTGGTCCTGACAGAACAAGTATAGAGTGATGAGTAATCGAATTATGAGTTAACACAACGT AATGATTAAATCAAATTTGATTGATAATTGTCAGGTCAAGTAGTATTCAATCACCTCATC TCTCAATAGAATATTTGATTGTAAAATAAATATTTTAATTATTTTAACTAGTAACATTAA TTCTTTATATAATATTTATGAATCAGATGACAAATAAATTTAATAGAATTGTTAGTTACC AATTCCAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAGAATGGTTAGTTATCATCAAATCCCATTTAA AAGAATTGTTTATCACAAGACATAAAAATTTAAGTTTATAAAAAAGATCTAATTATAGCA TTTAAAACTTCAGCTTACGATATATTAACATGTTCTTTCACGTGTACCATAAACAGATGA TAGATAACAAACAAACATGTTTTAATAAAATTGTTAGTTATCACATGATCCAATTTAATA GATATTAAACACAAAAACTTGAATTGATATATAAGAGTTCATTATAGTATTTAAAACCTC TAAGCTTTGAAACTATATCAATGATAACCATATTAGTTATCATCAAACCCAAAACTTAAT TTGACCTGATAGAAAATGATCTAACTATAATATTTAATACTTGATATTGTGATTCGTTGA CAAACTATAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAATAAAACTCAACTACTTAAGAAGATTAATTA ACCACAAAAATCTCAATTTTGCCCCTATTATAACCTGTAGTCAAAATTAAAATGGGAGGT TAAAAAGGTCACGTATCTTCTATTTATAGTTGTAGATAGAGTTTAACCAAAGAAGATTTC CCAAAACTTAGAGAAATGAA >LITCHI012378.m2 + Up_Stream_Len 2000 CCACACATTCATGAATACGAAAAAGAAATTAAAAAAAGGATAATCCCACGTCCCCCAATA TAATTTGATATAATTACAAATTACTTACTGTTGTTTTAGAAAATCTAATTTTATCTCCTA TCATTACTATTATTAGTAAAATAACTGGAATGATCAAAGTGTTTTTATAAGTTTGTTCTT CTTATTAAGGATCAAACTTTGATTTTCAAAATCAACTTTAATAAAAAGAGTTTTTTTTTT TTTTTTGGATATTTTCATAAATTATAGTGGTATTTTATCTATTTCAAAATCGATAAGGGG ATATTAACAATTTTTAAAAATATAGAAAAATTTTGATATTATATTAAACTATAGGGGAAA ATATTATTATCCAAAAAAAAAAAGAATTGTGAAAAATGTAAATATTTTTACTAACTTTCC CTAATTCCCTCAACAAAGATGATTTTTCTCTTTCATTAACCTCAAATTTTGATTAAAATT CGGACTTTCAGTTTTGAAATTCGTAGTAAAATGTATTATGAACTCTCTCTTAAAATTAAC AAAAAGTTTATAAAGCTTTATAAATTAAATTTATTTTGAACCTTCGTTGTAGGGAGCTCT TGACTATTTTGTAAATTAAGTAGATCCAAGTGTAATTAATTAAATCTTATTATAGGTTAG TGAAATTCTTATATAGATCAATGTGGACACAATGTAGAATGGCGAAAAGACCTGCACTAA AGTGAAAGGGCATGGCAAGTTTTTTCCTTTTGAAAAATTGAAGACATTTATACTTTTTTT CTTTTTTCTTTTTAATGGGGAAATTGTATGCTTTTACGGTGACAAGCATACAATTTCTAC TTCTAATCAAACTGATAAAGACAAGACTTGAACAGAAGCAATAACATATGGTTTATTGTT TAGAAATAGAAATTAGAAAGATAAAGAAGACCAGAACCACAAGTCATAACAAGTGTAAAG GCACACGAAATCTAACCTTATTGGTTGTCATAAAACATTCATATCCATCAGTGCATAGTT CCATTACTTGAAAGCAATCACATTTAATATATATTGTTTTCTTAAAACAAAAAAATTGTA TAGGTAACAGACGTACTGTGGATGAAATAAATCCATTTCATTGAAGAGTTTCCCTCAAAT TTGGTCCTGACAGAACAAGTATAGAGTGATGAGTAATCGAATTATGAGTTAACACAACGT AATGATTAAATCAAATTTGATTGATAATTGTCAGGTCAAGTAGTATTCAATCACCTCATC TCTCAATAGAATATTTGATTGTAAAATAAATATTTTAATTATTTTAACTAGTAACATTAA TTCTTTATATAATATTTATGAATCAGATGACAAATAAATTTAATAGAATTGTTAGTTACC AATTCCAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAGAATGGTTAGTTATCATCAAATCCCATTTAA AAGAATTGTTTATCACAAGACATAAAAATTTAAGTTTATAAAAAAGATCTAATTATAGCA TTTAAAACTTCAGCTTACGATATATTAACATGTTCTTTCACGTGTACCATAAACAGATGA TAGATAACAAACAAACATGTTTTAATAAAATTGTTAGTTATCACATGATCCAATTTAATA GATATTAAACACAAAAACTTGAATTGATATATAAGAGTTCATTATAGTATTTAAAACCTC TAAGCTTTGAAACTATATCAATGATAACCATATTAGTTATCATCAAACCCAAAACTTAAT TTGACCTGATAGAAAATGATCTAACTATAATATTTAATACTTGATATTGTGATTCGTTGA CAAACTATAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAATAAAACTCAACTACTTAAGAAGATTAATTA ACCACAAAAATCTCAATTTTGCCCCTATTATAACCTGTAGTCAAAATTAAAATGGGAGGT TAAAAAGGTCACGTATCTTCTATTTATAGTTGTAGATAGAGTTTAACCAAAGAAGATTTC CCAAAACTTAGAGAAATGAA
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