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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI012124 | Chr2 | 1014292 | 1019033 | + | Two-component response regulator-like APRR5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI012124.m1 | 58 | 169 | PF00072.27 | Response_reg | Domain | 75.5 | 3.70E-21 |
LITCHI012124.m1 | 629 | 671 | PF06203.17 | CCT | Motif | 59.9 | 2.00E-16 |
LITCHI012124.m2 | 58 | 169 | PF00072.27 | Response_reg | Domain | 75.5 | 3.70E-21 |
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>LITCHI012124.m1 ATGCAAAAAGTGCTCAAAGCAGACCACAGCGAGAGGAGAATGGGAGAAGTGGTGTTGAGC AGTGAAGAAATGGAGGCAACAGCAGGAGGAGCAGGAGCAGGAGCAGCAGCAGAAGAGAAG AAAGATGGGTTGGTGAAGTGGGAGAGGTTCTTGCCAAGGATGGCTTTGAGGGTTTTGCTT GTTGAGGCTGATGATTCTACTAGACAAATTATATCTGCCCTTTTGAGGAAATCCAGTTAT AGAGTTAATGCCGTTCCTGATGGCTTGAAGGCTTGGGAGATGCTGAAGGGAGGACCAGAA AACATAGATATCGTATTGACAGAAGTGGATTTACCTTCAATATCTGGATTCGCTCTTCTT ACGCTGATTATGGAGCATGAGATTTGCAAAAACATCCCTGTTATAATGATGTCCTCGCAG GATTCAGTTAGCACAGTGTATAAATGCATGATGAGAGGTGCTGCTGACTATCTTGTTAAG CCTGTAAGGAGAAATGAGTTGAGAAATCTATGGCAGCATGTATGGAGGAGACAAGCTACG ACCACTGGTGGAAACGTTGCCCAAGATGAGAGCGTTGGACAGAAAAAGATTGACGCCTCT TCTGAAAATGATGCTGCAAGTAATCATTCCATTGGTTATGCGGCCTGTGTCCAGAGAGAT GAAGAGTGCAATGAGAAAGGGAGTGACACTCAGAGCTCTTGTACTAAACCGGACTTGGAA GCTGAGAGTACACACATGGAGGATGCGCAGGATTTGTCGATGCAGTTAGGGGGTAAATGC TTACCTGATGACGTAAGGATGCAGAAGCACAAATCATGTGTTAACAACATCCAGAAATCA CTTGTGCATGAGAGTGAAGCTGGAGGATCAGGAGTGGTTGCCGGTGAGCCTGGTAATAGA GAAAAAGTGTATTTGGGCAAGGATGTTGATCCAGAGAATCAAAGGAAGAACCTTATTCGC CCCAGTGAGGCCAGTAATGTCCATGTCAATTTTCCCAGAGAAGTAATTGACTTCATGGGA GCCTTGAACAATCTTAGGACTTTTTCAAACAGTTGCACTAGCAAGTTTGATAATTCTTCA CAATTGGACCTCTCATTGAGAAGATCTCATCCCAGTGGCTTTGAGAACCAAGTTGGTGAA AACAAATTTACCCTCAACCATTCTAATGCCTCAGCCTTTACACGGTATACCAACAAGCCA GTTCAGTCTCTACATTCAGCTTTGACAAGAACGTGCAATCAGCAGAAGGAGTTTGAGTCA GAGAAGAATTTGTCCAACATTGTTGCCACTAGTAACTCAGATACTCCTGTTGCCATGCTA AGTACTCAAAGAAGTATCAATTCCTCGGCTACCTGCCAATCTAAACAATCTGAACTTGAA ACTTCATGTCCTCGACAAAGAGTGTGCTCTATCCAAGTTCCAGTTGAAGGTGTAAGGCTC AATAATGGATGCAATGGCTATGGTTCTGTACTCCCTCATATATTTCGTGCACAATCAGGT CTATCACCAACACCAAGTCCAAGTTCGGCCAGTCGGCAGGAACCTACCTTTCAAGTGAAT CCTATGTATCGCTCCAATGTTGAAAATGGTAATTGCGGACAATTATATGATCGACTTGGT GAAAATGCAATCAATTCCACCAACCAAACCATGCACAGGTTGGATTCTCTGGAGGATCGT GGACATATTTCTCCCACCACTGATCAGAGTGCAAGTAGCAGTTTCTGCAATGGCGCAATA AGTCATCTTAACAGCATGGGTTATGGAAGCACTTGCGGAAGCAACAGCAATGTTGATCAG GGTGCAGTTGGCAGGACTGCTGCTGAGAGTAGAAATGAGGAAGGCTTAATACCTTCGAGC TGTAACTCGCATCGATCAATCCAAAGAGAAGCAGCCCTCACTAAATTCCGTTTGAAGCGG AAAGATAGATGCTATGAGAAGAAGGTTCGCTATGAGAGTAGGAAAAAACTTGCAGAACAG CGCCCCAGAGTGAAAGGACAATTTGTTCGTCAAGTGCACGCTGATCCTGCACCTCCAGAG TCTGAGAATCACAGCTGTTATTCACTTGATGGTTAG >LITCHI012124.m2 ATGCAAAAAGTGCTCAAAGCAGACCACAGCGAGAGGAGAATGGGAGAAGTGGTGTTGAGC AGTGAAGAAATGGAGGCAACAGCAGGAGGAGCAGGAGCAGGAGCAGCAGCAGAAGAGAAG AAAGATGGGTTGGTGAAGTGGGAGAGGTTCTTGCCAAGGATGGCTTTGAGGGTTTTGCTT GTTGAGGCTGATGATTCTACTAGACAAATTATATCTGCCCTTTTGAGGAAATCCAGTTAT AGAGTTAATGCCGTTCCTGATGGCTTGAAGGCTTGGGAGATGCTGAAGGGAGGACCAGAA AACATAGATATCGTATTGACAGAAGTGGATTTACCTTCAATATCTGGATTCGCTCTTCTT ACGCTGATTATGGAGCATGAGATTTGCAAAAACATCCCTGTTATAATGATGTCCTCGCAG GATTCAGTTAGCACAGTGTATAAATGCATGATGAGAGGTGCTGCTGACTATCTTGTTAAG CCTGTAAGGAGAAATGAGTTGAGAAATCTATGGCAGCATGTATGGAGGAGACAAGCTACG ACCACTGGTGGAAACGTTGCCCAAGATGAGAGCGTTGGACAGAAAAAGATTGACGCCTCT TCTGAAAATGATGCTGCAAGTAATCATTCCATTGGTTATGCGGCCTGTGTCCAGAGAGAT GAAGAGTGCAATGAGAAAGGGAGTGACACTCAGAGCTCTTGTACTAAACCGGACTTGGAA GCTGAGAGTACACACATGGAGGATGCGCAGGATTTGTCGATGCAGTTAGGGGGTAAATGC TTACCTGATGACGTAAGGATGCAGAAGCACAAATCATGTGTTAACAACATCCAGAAATCA CTTGTGCATGAGAGTGAAGCTGGAGGATCAGGAGTGGTTGCCGGTGAGCCTGGTAATAGA GAAAAAGTGTATTTGGGCAAGGATGTTGATCCAGAGAATCAAAGGAAGAACCTTATTCGC CCCAGTGAGGCCAGTAATGTCCATGTCAATTTTCCCAGAGAAGTAATTGACTTCATGGGA GCCTTGAACAATCTTAGGACTTTTTCAAACAGTTGCACTAGCAAGTTTGATAATTCTTCA CAATTGGACCTCTCATTGAGAAGATCTCATCCCAGTGGCTTTGAGAACCAAGTTGGTGAA AACAAATTTACCCTCAACCATTCTAATGCCTCAGCCTTTACACGGTATACCAACAAGCCA GTTCAGTCTCTACATTCAGCTTTGACAAGAACGTGCAATCAGCAGAAGGAGTTTGAGTCA GAGAAGAATTTGTCCAACATTGTTGCCACTAGTAACTCAGATACTCCTGTTGCCATGCTA AGTACTCAAAGAAGTATCAATTCCTCGGCTACCTGCCAATCTAAACAATCTGAACTTGAA ACTTCATGTCCTCGACAAAGAGTGTGCTCTATCCAAGTTCCAGTTGAAGGTGTAAGGCTC AATAATGGATGCAATGGCTATGGTTCTGTACTCCCTCATATATTTCGTGCACAATCAGGT CTATCACCAACACCAAGTCCAAGTTCGGCCAGTCGGCAGGAACCTACCTTTCAAGTGAAT CCTATGTATCGCTCCAATGTTGAAAATGGTAATTGCGGACAATTATATGATCGACTTGGT GAAAATGCAATCAATTCCACCAACCAAACCATGCACAGGTTGGATTCTCTGGAGGATCGT GGACATATTTCTCCCACCACTGATCAGAGTGCAAGTAGCAGTTTCTGCAATGGCGCAATA AGTCATCTTAACAGCATGGGTTATGGAAGCACTTGCGGAAGCAACAGCAATGTTGATCAG GGTGCAGTTGGCAGGACTGCTGCTGAGAGTAGAAATGAGGAAGGCTTAATACCTTCGAGC TGTAACTCGCATCGATCAATCCAAAGAGAAGCAGCCCTCACTAAATTCCGTTTGAAGCGG AAAGATAGATGCTATGAGAAGAAGGTATGTAAACTACTAAATAAAAATTGTCTGAACATT TCATTTTCACCAATCGAGACACTTTACGTGCGGGATGTTTTACAATCAATGAAAAATTTG TTATTCTCAGGTTCGCTATGA
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>LITCHI030359.m1 MDGIEWHGSQVLINPSSLWSDQLQDNSVESFTVSNPNCYGAYSGKNMDLNEDMFNPIQVL QKPQSSQLLNSNPERPQETAVAKSGGGGGGGCGGWRDGISSQELCSSLIMINSPCVTSMP LISLGGVDDQFGMDDQTQIVDHGLKNGKVGGGVSTTCSLESLDCLLSATNSNTDTSVEDD GISMIFSDCRNQLWNFGANSTTTAVSSGESENNPSIDGRNKEPEETVSQSSSDQYFNNGR VQEQRPDSTKGSSDRRKLKVGTNKGQFHFLQTPDSSFIEGGFRLISENPPKPKKARSDKR PSSSNINFQQPSSSLSSSMEEPDPEAIAHMKEMIYRAAAFRPVNLGIEVVEKPKRKNVRI STDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLRSQVKALESLG HKLDPMNCPPSSISLPTFSSLPFNNHSITFPMQTHLSLRNPNNPKPI.
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>LITCHI003936.m7 - Up_Stream_Len 2000 ATAACAATAAAGTTACTGCGAAGTTTCCTGAAATCTCTTGTCATGGTGGCCATTCACCAA ATAAAGAACCTTGTACGATTCTATTTTCTGTGTCATAGATATCGAGTTCCTATGAAATTT ATTCTCAGCATGACAATATCACATTTGTTTATCCTTAATTGTATGTATACGATCATATAT ATATATATATATATATATTTAACTCAATCAATATTAACTATCAATTGTTAATTTATATGA CTTATGAGTTTTATGGTTCTGTAGTGGGGTAGTTAGAATTTCGACCATGATGAGTCCGAT AAAAAAAAACATATAATAACTTAACGCAAGATAAATGTATATTAGTATTTAAGAAATTGT TATTAAAAATCTAAATATCATATTTATTATTCTTAAAATATAAGATTATTTAGTTCAAAT TTATGTTAGTGTGGTTTAATTAGTTGTATTTTCCGTGAAATAGGAACAACAAAGAATATT TGTGTATTGAATGGAAACAACCATTGCAACATTCATCAACCCAAAATCAAATGGATTAAG AAGAATCAAATCCAAGCCCAATGAAGATCCAAAAACCAAACCTCAAATTAATACCCAAGC CCAAACCCAAAGGAAGTCAAAAACTCAAAATTAATGAAAATAAAGTACCATGTATCAAAA AAGGCAAAAGAAGACATAATAAGATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGATGTC AGTTATCTTATGGTACAGTGGAAGCACACACAAACAGCTTGTTTCATTACCAAGGTTAGA CATTCGACCTCATTCAACAATAAATATGAGATTTTCTCTCATATATATGAATTATTTCTC ACCTTAATGTGAGTGACCCCTAGTTATATGAGAGTCACTAATTCGGGTTATGTCATTAGA GTCTTATTATTCTAATCTCGATTATTTTTGGATTCATTTTAGTACCTATAATAAAAAAAA AAATGAGAGAGAGAGAACCATGAAGAAAAGATTCATGCTTTGGGAATTCCTTCTCTCGGG AGGAAGAGGGTGACTCATAATAACATTAGCTATTAAAAAGAAATGTCTTTTCAGGGAAAA AAAAAAAAAGGTGATTTATTGGATGAAAAACACTCCAAGCTTTATGTCATTGTTTTAATT ATAGCCATGTCGGTGTGATTTTCATATTTACAAAATGTATTTTTTAATAGACTCATGTAT TTATGAGTACTTAAAATTTAGCACAACATTAATTAATTTCAATGCACATAGAAATGAAAT AGGTTTGTTATCATATTTAAATAAGAATGTAGAATAATTTTATTTTATTTAATCATAATT TAAAATGATATAATTATAAAAAAAATTGCAATAACTTTTTAAAATAATAAAATAAAGGGA AAAAGATTTATTTTATTTTAAACATTATTTAAACTAACATTAAATTTAAGTAAAATATAA ATAATGTACATATCAAATGATCACCCAAAAAGCCGACCTGATTCAAAATAAATAGCCCAC TATCAATTTTAACGGGTAAGAATGCTCCAAACAATATTGACCCGCCCCGATTCTAGTCAC CACCAACTCAACGGCGACCTTGTTTCACGAATCAGATGAGCTCCGAGAAATCCAACACCA GTTCCGATCTCAACACACGTTCGTGCTTCCGTTTCTGATTCTGTTTGTCTCCTCCGTCCG CAACACCCTTCTTGTTTAGGTTAGTTTTTTCTTTTTTCCTTTTTTTTTCCTTTGATTTTT TCAACAATTTATTATTATTATTTATTTAATCATTCATCCTTTAATTGTCAGCTCCGAGAC CCAGTAGTTTTTACTTATTTTACTTTTTGTTTTCTATGGACTTTTTTAGTTTAAATGGAT TTGTTTTGGTGATGTTGTGATGGATTGAGTGAGGTTGACTGATGATGAAGATGATGGATC GGGTGAGGTTGATTCATGAAGAAGATGATGAAGAAGGGTAAGGTTGATGAAGAAGAAAAC GATGAGAAAGGACAGACAAA >LITCHI003936.m5 - 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