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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI012124 | Chr2 | 1014292 | 1019033 | + | Two-component response regulator-like APRR5 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI012124.m1 | 58 | 169 | PF00072.27 | Response_reg | Domain | 75.5 | 3.70E-21 |
| LITCHI012124.m1 | 629 | 671 | PF06203.17 | CCT | Motif | 59.9 | 2.00E-16 |
| LITCHI012124.m2 | 58 | 169 | PF00072.27 | Response_reg | Domain | 75.5 | 3.70E-21 |
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>LITCHI012124.m1 ATGCAAAAAGTGCTCAAAGCAGACCACAGCGAGAGGAGAATGGGAGAAGTGGTGTTGAGC AGTGAAGAAATGGAGGCAACAGCAGGAGGAGCAGGAGCAGGAGCAGCAGCAGAAGAGAAG AAAGATGGGTTGGTGAAGTGGGAGAGGTTCTTGCCAAGGATGGCTTTGAGGGTTTTGCTT GTTGAGGCTGATGATTCTACTAGACAAATTATATCTGCCCTTTTGAGGAAATCCAGTTAT AGAGTTAATGCCGTTCCTGATGGCTTGAAGGCTTGGGAGATGCTGAAGGGAGGACCAGAA AACATAGATATCGTATTGACAGAAGTGGATTTACCTTCAATATCTGGATTCGCTCTTCTT ACGCTGATTATGGAGCATGAGATTTGCAAAAACATCCCTGTTATAATGATGTCCTCGCAG GATTCAGTTAGCACAGTGTATAAATGCATGATGAGAGGTGCTGCTGACTATCTTGTTAAG CCTGTAAGGAGAAATGAGTTGAGAAATCTATGGCAGCATGTATGGAGGAGACAAGCTACG ACCACTGGTGGAAACGTTGCCCAAGATGAGAGCGTTGGACAGAAAAAGATTGACGCCTCT TCTGAAAATGATGCTGCAAGTAATCATTCCATTGGTTATGCGGCCTGTGTCCAGAGAGAT GAAGAGTGCAATGAGAAAGGGAGTGACACTCAGAGCTCTTGTACTAAACCGGACTTGGAA GCTGAGAGTACACACATGGAGGATGCGCAGGATTTGTCGATGCAGTTAGGGGGTAAATGC TTACCTGATGACGTAAGGATGCAGAAGCACAAATCATGTGTTAACAACATCCAGAAATCA CTTGTGCATGAGAGTGAAGCTGGAGGATCAGGAGTGGTTGCCGGTGAGCCTGGTAATAGA GAAAAAGTGTATTTGGGCAAGGATGTTGATCCAGAGAATCAAAGGAAGAACCTTATTCGC CCCAGTGAGGCCAGTAATGTCCATGTCAATTTTCCCAGAGAAGTAATTGACTTCATGGGA GCCTTGAACAATCTTAGGACTTTTTCAAACAGTTGCACTAGCAAGTTTGATAATTCTTCA CAATTGGACCTCTCATTGAGAAGATCTCATCCCAGTGGCTTTGAGAACCAAGTTGGTGAA AACAAATTTACCCTCAACCATTCTAATGCCTCAGCCTTTACACGGTATACCAACAAGCCA GTTCAGTCTCTACATTCAGCTTTGACAAGAACGTGCAATCAGCAGAAGGAGTTTGAGTCA GAGAAGAATTTGTCCAACATTGTTGCCACTAGTAACTCAGATACTCCTGTTGCCATGCTA AGTACTCAAAGAAGTATCAATTCCTCGGCTACCTGCCAATCTAAACAATCTGAACTTGAA ACTTCATGTCCTCGACAAAGAGTGTGCTCTATCCAAGTTCCAGTTGAAGGTGTAAGGCTC AATAATGGATGCAATGGCTATGGTTCTGTACTCCCTCATATATTTCGTGCACAATCAGGT CTATCACCAACACCAAGTCCAAGTTCGGCCAGTCGGCAGGAACCTACCTTTCAAGTGAAT CCTATGTATCGCTCCAATGTTGAAAATGGTAATTGCGGACAATTATATGATCGACTTGGT GAAAATGCAATCAATTCCACCAACCAAACCATGCACAGGTTGGATTCTCTGGAGGATCGT GGACATATTTCTCCCACCACTGATCAGAGTGCAAGTAGCAGTTTCTGCAATGGCGCAATA AGTCATCTTAACAGCATGGGTTATGGAAGCACTTGCGGAAGCAACAGCAATGTTGATCAG GGTGCAGTTGGCAGGACTGCTGCTGAGAGTAGAAATGAGGAAGGCTTAATACCTTCGAGC TGTAACTCGCATCGATCAATCCAAAGAGAAGCAGCCCTCACTAAATTCCGTTTGAAGCGG AAAGATAGATGCTATGAGAAGAAGGTTCGCTATGAGAGTAGGAAAAAACTTGCAGAACAG CGCCCCAGAGTGAAAGGACAATTTGTTCGTCAAGTGCACGCTGATCCTGCACCTCCAGAG TCTGAGAATCACAGCTGTTATTCACTTGATGGTTAG >LITCHI012124.m2 ATGCAAAAAGTGCTCAAAGCAGACCACAGCGAGAGGAGAATGGGAGAAGTGGTGTTGAGC AGTGAAGAAATGGAGGCAACAGCAGGAGGAGCAGGAGCAGGAGCAGCAGCAGAAGAGAAG AAAGATGGGTTGGTGAAGTGGGAGAGGTTCTTGCCAAGGATGGCTTTGAGGGTTTTGCTT GTTGAGGCTGATGATTCTACTAGACAAATTATATCTGCCCTTTTGAGGAAATCCAGTTAT AGAGTTAATGCCGTTCCTGATGGCTTGAAGGCTTGGGAGATGCTGAAGGGAGGACCAGAA AACATAGATATCGTATTGACAGAAGTGGATTTACCTTCAATATCTGGATTCGCTCTTCTT ACGCTGATTATGGAGCATGAGATTTGCAAAAACATCCCTGTTATAATGATGTCCTCGCAG GATTCAGTTAGCACAGTGTATAAATGCATGATGAGAGGTGCTGCTGACTATCTTGTTAAG CCTGTAAGGAGAAATGAGTTGAGAAATCTATGGCAGCATGTATGGAGGAGACAAGCTACG ACCACTGGTGGAAACGTTGCCCAAGATGAGAGCGTTGGACAGAAAAAGATTGACGCCTCT TCTGAAAATGATGCTGCAAGTAATCATTCCATTGGTTATGCGGCCTGTGTCCAGAGAGAT GAAGAGTGCAATGAGAAAGGGAGTGACACTCAGAGCTCTTGTACTAAACCGGACTTGGAA GCTGAGAGTACACACATGGAGGATGCGCAGGATTTGTCGATGCAGTTAGGGGGTAAATGC TTACCTGATGACGTAAGGATGCAGAAGCACAAATCATGTGTTAACAACATCCAGAAATCA CTTGTGCATGAGAGTGAAGCTGGAGGATCAGGAGTGGTTGCCGGTGAGCCTGGTAATAGA GAAAAAGTGTATTTGGGCAAGGATGTTGATCCAGAGAATCAAAGGAAGAACCTTATTCGC CCCAGTGAGGCCAGTAATGTCCATGTCAATTTTCCCAGAGAAGTAATTGACTTCATGGGA GCCTTGAACAATCTTAGGACTTTTTCAAACAGTTGCACTAGCAAGTTTGATAATTCTTCA CAATTGGACCTCTCATTGAGAAGATCTCATCCCAGTGGCTTTGAGAACCAAGTTGGTGAA AACAAATTTACCCTCAACCATTCTAATGCCTCAGCCTTTACACGGTATACCAACAAGCCA GTTCAGTCTCTACATTCAGCTTTGACAAGAACGTGCAATCAGCAGAAGGAGTTTGAGTCA GAGAAGAATTTGTCCAACATTGTTGCCACTAGTAACTCAGATACTCCTGTTGCCATGCTA AGTACTCAAAGAAGTATCAATTCCTCGGCTACCTGCCAATCTAAACAATCTGAACTTGAA ACTTCATGTCCTCGACAAAGAGTGTGCTCTATCCAAGTTCCAGTTGAAGGTGTAAGGCTC AATAATGGATGCAATGGCTATGGTTCTGTACTCCCTCATATATTTCGTGCACAATCAGGT CTATCACCAACACCAAGTCCAAGTTCGGCCAGTCGGCAGGAACCTACCTTTCAAGTGAAT CCTATGTATCGCTCCAATGTTGAAAATGGTAATTGCGGACAATTATATGATCGACTTGGT GAAAATGCAATCAATTCCACCAACCAAACCATGCACAGGTTGGATTCTCTGGAGGATCGT GGACATATTTCTCCCACCACTGATCAGAGTGCAAGTAGCAGTTTCTGCAATGGCGCAATA AGTCATCTTAACAGCATGGGTTATGGAAGCACTTGCGGAAGCAACAGCAATGTTGATCAG GGTGCAGTTGGCAGGACTGCTGCTGAGAGTAGAAATGAGGAAGGCTTAATACCTTCGAGC TGTAACTCGCATCGATCAATCCAAAGAGAAGCAGCCCTCACTAAATTCCGTTTGAAGCGG AAAGATAGATGCTATGAGAAGAAGGTATGTAAACTACTAAATAAAAATTGTCTGAACATT TCATTTTCACCAATCGAGACACTTTACGTGCGGGATGTTTTACAATCAATGAAAAATTTG TTATTCTCAGGTTCGCTATGA
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>LITCHI012124.m2 AATAATGCATATTGAAAGGAACGAGAAGCGAGAGAGAGAGCCACACAAAGAGAGGGAGAA GCAGAGAGAGCCTCCCAATGAGACTTTGCCTTTTGATCTGTCAGAAAATCTGCTGACTTG GCAAGTGTAGGCCACACAAACAAACCACAACTGTGCCCTCTTCTTTCTAGATATTTTTTA TGTTTTTCAAAACTCTTCTCTCTCACATTACATTTCAGATATTTTTGCTTATATGTATTG GTTTCTAGATATTACTAGGTGATATGCAAAAAGTGCTCAAAGCAGACCACAGCGAGAGGA GAATGGGAGAAGTGGTGTTGAGCAGTGAAGAAATGGAGGCAACAGCAGGAGGAGCAGGAG CAGGAGCAGCAGCAGAAGAGAAGAAAGATGGGTTGGTGAAGTGGGAGAGGTTCTTGCCAA GGATGGCTTTGAGGGTTTTGCTTGTTGAGGCTGATGATTCTACTAGACAAATTATATCTG CCCTTTTGAGGAAATCCAGTTATAGAGTTAATGCCGTTCCTGATGGCTTGAAGGCTTGGG AGATGCTGAAGGGAGGACCAGAAAACATAGATATCGTATTGACAGAAGTGGATTTACCTT CAATATCTGGATTCGCTCTTCTTACGCTGATTATGGAGCATGAGATTTGCAAAAACATCC CTGTTATAATGATGTCCTCGCAGGATTCAGTTAGCACAGTGTATAAATGCATGATGAGAG GTGCTGCTGACTATCTTGTTAAGCCTGTAAGGAGAAATGAGTTGAGAAATCTATGGCAGC ATGTATGGAGGAGACAAGCTACGACCACTGGTGGAAACGTTGCCCAAGATGAGAGCGTTG GACAGAAAAAGATTGACGCCTCTTCTGAAAATGATGCTGCAAGTAATCATTCCATTGGTT ATGCGGCCTGTGTCCAGAGAGATGAAGAGTGCAATGAGAAAGGGAGTGACACTCAGAGCT 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TATATATATATCTATTGTTCTGTTGAAATGTAACATTTTGTATCTATACGAAAAGAGTGC TAAAAATGAC >LITCHI012124.m1 AATAATGCATATTGAAAGGAACGAGAAGCGAGAGAGAGAGCCACACAAAGAGAGGGAGAA GCAGAGAGAGCCTCCCAATGAGACTTTGCCTTTTGATCTGTCAGAAAATCTGCTGACTTG GCAAGTGTAGGCCACACAAACAAACCACAACTGTGCCCTCTTCTTTCTAGATATTTTTTA TGTTTTTCAAAACTCTTCTCTCTCACATTACATTTCAGATATTTTTGCTTATATGTATTG GTTTCTAGATATTACTAGGTGATATGCAAAAAGTGCTCAAAGCAGACCACAGCGAGAGGA GAATGGGAGAAGTGGTGTTGAGCAGTGAAGAAATGGAGGCAACAGCAGGAGGAGCAGGAG CAGGAGCAGCAGCAGAAGAGAAGAAAGATGGGTTGGTGAAGTGGGAGAGGTTCTTGCCAA GGATGGCTTTGAGGGTTTTGCTTGTTGAGGCTGATGATTCTACTAGACAAATTATATCTG CCCTTTTGAGGAAATCCAGTTATAGAGTTAATGCCGTTCCTGATGGCTTGAAGGCTTGGG AGATGCTGAAGGGAGGACCAGAAAACATAGATATCGTATTGACAGAAGTGGATTTACCTT CAATATCTGGATTCGCTCTTCTTACGCTGATTATGGAGCATGAGATTTGCAAAAACATCC CTGTTATAATGATGTCCTCGCAGGATTCAGTTAGCACAGTGTATAAATGCATGATGAGAG GTGCTGCTGACTATCTTGTTAAGCCTGTAAGGAGAAATGAGTTGAGAAATCTATGGCAGC ATGTATGGAGGAGACAAGCTACGACCACTGGTGGAAACGTTGCCCAAGATGAGAGCGTTG 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>LITCHI012124.m2 + Up_Stream_Len 2000 AAATATATATTTTTATGTTTTTCAGTATTTTCAAAACATATTTTCCAAATAAATCATTAG TTTTCTCTTCAAACAGATATTTTACTCATTTTTAAAATGAATATCACATATATTTATATA ATTTTCTGTTTTTGAAATTAAATTTTGAAAAATCCTATCAAATATATTGCATTTTTAAAG TATATTTTTCATTTTTAAAAATATTATTTTAAAAACGATTTCAAACATGTTTTTATATTC ATAATGATTTAACTTGTTAGATTTATATATATTCGATTATTATTTTATAGATTGGATAAG ATTATTTATTAATAATAATTTTTAAATTAATTATAAAAATAATTATTAAAGAATATTTAA AATTTAAATTAATAAAATCGGTGTATTCGTACAAATATAATATACGTGGCGAAGTTAAAA ACGACAAAGCGGTGGATCTTTGGCAGCCATCCATCCCCAAATTTGACGGGGCAAAAGGAA ACCATTGGAAAAGAGTGCACGTCGTCGTGATGCCATCTCATCCTCTTATCGCGAACCGCC AAGGTTACTTTAGTAATTGACAGGGACCCAATTTTTGACCCCATCCAATCAGAGCTCGGC AGCGCTTGGATTTCACCCAATCAAAGAGCGAGTAGAGAGAGTTCTAGAATCGCCCGCGAC TGCCACAGCGAACGTTAAATGATAGCGTTATTTGACGTTTGACAACTTCAAAACCACAAA TGAAGCCTCCCCTGATAGGAATCCACGTGGCGAAATCCTGTCCATGAGATTAAAAGTATC TCAAAATATCTAACCAGGAAACTAATATTAAAATCTCTCCAAAAACTTTGTGGGTCCCTC TCCTGCCCACCCACAAAAATATCACAAAAAATTTGGTTGACTCTTTTGATAATGGAGAAT TACCGAATAAGTGCCCTGTATTTTAAATAATTTTGTACCATTTCTACTTTTAACTGAATT AATCCCTATATTTTTCATAATAACCAAATTAGCACCTTCAATTGTACATGTTACCCACTC TTAATTCTTATTAGGGTGCGAAGTTATACATCTTGTTGGTTGTAAGAAATTAGGAACAAT TTTTTTATTTTTATAAATATTTTATTTTGATAATTATTAAATAAATATAATTAATTTACG TATAAATCTTAAAAGTTTACAGAATGAGATTGCATTTTATAATTACTTATAAAATTATGA TAAAGTAAATCATATTCCTTTACAAATTTGTATGGTGATAGAAGTAGTTATTGTCATCGT ATTACAATTTAAAGATTCATGAAATTAAAGGTTTGAAATTTAAAAAATTTGAAATCTAAA AAAATCATTTATAACATAATGTTTTACTAATTATATAGATATTTTATAATAGTTAAACTT ATTAAAGGTTTAACTTTTCAAGGTTTCTGCTGAAGTCTAAATAAATAATATAATAATTAT GAAGAAAACTAATTTGATCATTTTGAAAAAATTAAAGCAATTTGATGATTATTAAAAAAA TGTCTCATACTACAAAAATATATTTTACTTTTTTATAAATTATATATAATATTTTAAATC CAAATAAAAATAAAATTTTTATTCTCTCCATACATAAGAGTCTATATAATACTCCAATAA CATATTAATACTTTTTAAAATTATATAGAGATTGGTCAATGTTATGTATTATGGCAGATA AAATGGATATAAAATACTTAAGAATAAAATAAAGTTAAAATATAGGGAGTTGTTAGTAAT AATGCATATTGAAAGGAACGAGAAGCGAGAGAGAGAGCCACACAAAGAGAGGGAGAAGCA GAGAGAGCCTCCCAATGAGACTTTGCCTTTTGATCTGTCAGAAAATCTGCTGACTTGGCA AGTGTAGGCCACACAAACAAACCACAACTGTGCCCTCTTCTTTCTAGATATTTTTTATGT TTTTCAAAACTCTTCTCTCTCACATTACATTTCAGATATTTTTGCTTATATGTATTGGTT TCTAGATATTACTAGGTGAT >LITCHI012124.m1 + Up_Stream_Len 2000 AAATATATATTTTTATGTTTTTCAGTATTTTCAAAACATATTTTCCAAATAAATCATTAG TTTTCTCTTCAAACAGATATTTTACTCATTTTTAAAATGAATATCACATATATTTATATA ATTTTCTGTTTTTGAAATTAAATTTTGAAAAATCCTATCAAATATATTGCATTTTTAAAG TATATTTTTCATTTTTAAAAATATTATTTTAAAAACGATTTCAAACATGTTTTTATATTC ATAATGATTTAACTTGTTAGATTTATATATATTCGATTATTATTTTATAGATTGGATAAG ATTATTTATTAATAATAATTTTTAAATTAATTATAAAAATAATTATTAAAGAATATTTAA AATTTAAATTAATAAAATCGGTGTATTCGTACAAATATAATATACGTGGCGAAGTTAAAA ACGACAAAGCGGTGGATCTTTGGCAGCCATCCATCCCCAAATTTGACGGGGCAAAAGGAA ACCATTGGAAAAGAGTGCACGTCGTCGTGATGCCATCTCATCCTCTTATCGCGAACCGCC AAGGTTACTTTAGTAATTGACAGGGACCCAATTTTTGACCCCATCCAATCAGAGCTCGGC AGCGCTTGGATTTCACCCAATCAAAGAGCGAGTAGAGAGAGTTCTAGAATCGCCCGCGAC TGCCACAGCGAACGTTAAATGATAGCGTTATTTGACGTTTGACAACTTCAAAACCACAAA TGAAGCCTCCCCTGATAGGAATCCACGTGGCGAAATCCTGTCCATGAGATTAAAAGTATC TCAAAATATCTAACCAGGAAACTAATATTAAAATCTCTCCAAAAACTTTGTGGGTCCCTC TCCTGCCCACCCACAAAAATATCACAAAAAATTTGGTTGACTCTTTTGATAATGGAGAAT TACCGAATAAGTGCCCTGTATTTTAAATAATTTTGTACCATTTCTACTTTTAACTGAATT AATCCCTATATTTTTCATAATAACCAAATTAGCACCTTCAATTGTACATGTTACCCACTC TTAATTCTTATTAGGGTGCGAAGTTATACATCTTGTTGGTTGTAAGAAATTAGGAACAAT TTTTTTATTTTTATAAATATTTTATTTTGATAATTATTAAATAAATATAATTAATTTACG TATAAATCTTAAAAGTTTACAGAATGAGATTGCATTTTATAATTACTTATAAAATTATGA TAAAGTAAATCATATTCCTTTACAAATTTGTATGGTGATAGAAGTAGTTATTGTCATCGT ATTACAATTTAAAGATTCATGAAATTAAAGGTTTGAAATTTAAAAAATTTGAAATCTAAA AAAATCATTTATAACATAATGTTTTACTAATTATATAGATATTTTATAATAGTTAAACTT ATTAAAGGTTTAACTTTTCAAGGTTTCTGCTGAAGTCTAAATAAATAATATAATAATTAT GAAGAAAACTAATTTGATCATTTTGAAAAAATTAAAGCAATTTGATGATTATTAAAAAAA TGTCTCATACTACAAAAATATATTTTACTTTTTTATAAATTATATATAATATTTTAAATC CAAATAAAAATAAAATTTTTATTCTCTCCATACATAAGAGTCTATATAATACTCCAATAA CATATTAATACTTTTTAAAATTATATAGAGATTGGTCAATGTTATGTATTATGGCAGATA AAATGGATATAAAATACTTAAGAATAAAATAAAGTTAAAATATAGGGAGTTGTTAGTAAT AATGCATATTGAAAGGAACGAGAAGCGAGAGAGAGAGCCACACAAAGAGAGGGAGAAGCA GAGAGAGCCTCCCAATGAGACTTTGCCTTTTGATCTGTCAGAAAATCTGCTGACTTGGCA AGTGTAGGCCACACAAACAAACCACAACTGTGCCCTCTTCTTTCTAGATATTTTTTATGT TTTTCAAAACTCTTCTCTCTCACATTACATTTCAGATATTTTTGCTTATATGTATTGGTT TCTAGATATTACTAGGTGAT
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>LITCHI012124.m2 GenomeSequence + AATAATGCATATTGAAAGGAACGAGAAGCGAGAGAGAGAGCCACACAAAGAGAGGGAGAA GCAGAGAGAGCCTCCCAATGAGACTTTGCCTTTTGATCTGTCAGAAAATCTGCTGACTTG GCAAGTGTAGGCCACACAAACAAACCACAACTGTGCCCTCTTCTTTCTAGATATTTTTTA TGTTTTTCAAAACTCTTCTCTCTCACATTACATTTCAGATATTTTTGCTTATATGTATTG GTTTCTAGATATTACTAGGTGATATGCAAAAAGTGCTCAAAGCAGACCACAGCGAGAGGA GAATGGGAGAAGTGGTGTTGAGCAGTGAAGAAATGGAGGCAACAGCAGGAGGAGCAGGAG CAGGAGCAGCAGCAGAAGAGAAGAAAGATGGGTTGGTGAAGTGGGAGAGGTTCTTGCCAA GGATGGCTTTGAGGGTTTTGCTTGTTGAGGCTGATGATTCTACTAGACAAATTATATCTG CCCTTTTGAGGAAATCCAGTTATAGAGGTATTGATGGATGGTTCTGTTGTTTTTGTTTTT GAATTGATGTTTACTTTATTGGTTCTTGTAAAGATTGTAGCTTTGATGGGAATTTGGTTG GTTCATTGATTGAATTGTGTTTTGTTTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTTTGTGTATTGCTT TAAAGGGTTGTTTTGTTGTTTGAGTGAGAGCAAGTTTTGATTATCAAGTTCAGGTTTTGG TTATGTCATATTGATGTTCAAGCTTGAGTTTGTGAAGTTGATAGTTTTTGTGTTTTTCCC TTAGTTGGTTTTTTCCCTTTTACTATTGTAGGCTTGTTTTAATTGCATCAAACAAAATTA AAAAAAAAAAATCAATTTTTTTTGGATCGGTCGATTTTATCTGTTTTACAATTAAGGGCT 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