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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI012040Chr83009198230092967-Transcription factor IIIA

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI012040.m14970PF00096.29zf-C2H2Domain20.90.00036
LITCHI012040.m176100PF00096.29zf-C2H2Domain210.00035
LITCHI012040.m1105130PF00096.29zf-C2H2Domain18.70.0018
LITCHI012040.m1145169PF00096.29zf-C2H2Domain22.10.00015
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>LITCHI012040.m1
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TGCAGATCCAAGAATTGGTTGGTTCAGGAAGAGAAGGATGAGAAAGAGGTCGATGGAGAT
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>LITCHI027203.m1
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IEGLQNR.
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>LITCHI027203.m1
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ATATGTTCCTCCAGAAGTCCTCAACTCTTCTCCTGCAACATTTGGAAATGATCTCTGGGC
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TGCAAAGTCATTAAGGAATTATCCAGCTGCTGCAGTTCTCAAATTCAACACTATATGTAT
GTATTGTTTTTGTTCTCTCCTCAATCTATACATGGCTGCCA
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>LITCHI016549.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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GAGTAATGTTACATCACCTAAAATTGTATCCAAATTTATTATTCAAATGACGTCATAAAT
CTGTATAATTATTATATTTTCAATACATTATTTTATAATTTATAAATCATTTTCCCACAT
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TTTGCCCAGTTGTAAAGGAATGGGTGAGAGTATAGTATCACATCAACATCCTAGAACAAA
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ATAAAAATTAAAAAAAAAAGAAGGAAAGAAAAGACTACAAGAAGTAGATAGGACTTATAA
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GCTTGCATCATCATCATTTCATTTCTCTTTAAAAGTACTCTGCAATAACAGTGTTGTGAG
TTTTATTTTTTAAAGAAATAAAAATTGTTATTATTATTTGATTTATTTAAAATTTTTGTT
TTTGTACATTTCCTAAAAGCTTGAGTTTTTAAATTCGGAAGAGGAAAGCATAATAGATTG
TTACTCTATTTACACCTCTATCTCAGCACGTTAGCTTGCTGTCTTAGAATAGCCAAAAAA
GCAAATATCTTTCTCAGGAA
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>LITCHI004140.m1 GenomeSequence - 
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GGTGGAGTGGACACCGATCATGGGTTTCCATATTTGCACAGTTGTAGATCCCTAGATATG
CAACTTTTTATTTTTTTTAATTTTTAATGAAATTTAATAATAATATAGTATTATTTTGTT
ACGTAAAAAAACATATTTGTAATTAAAATATTTATTAGTTGTGTATTGATCATTTTACTT
TAGATAATTTTGATACAACGGTAAGAGAAATTTGTATTGAATTTTTAGAACCTTAAGATA
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GTATAAATTTCTCCAAAAGAGATGGCATAAAGTTTGTGCAAATTTCTAAAAAAGAGAGGG
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TGCATGTACGTTGATGTTGTCTATCCGTTCAGGCTAATTTGTCTATTTTAACCTTTCTTT
TGATTTTCTTGTAAAGAATGTCTATTTCAATCTTAATCAACAAAATTCAGCCTTTTTCAA
TGGTCAACCACGTGAATACACTATTACGCAATGGTGCCAATTAGTGCCACTATTGTAAAT
GAAGTGAAATTACTTTTCTACCCTCTCAGTCCTACTTTCAGTCTACTCAACTGCTCTGCC
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TTCTAACCCCAACTGATATTGCAAAACTTGTCCTTCCAACCGAAATTCTTGAGCATATTC
AGACTCCGGTAGGAATACATCATGTAGATTTGCAGGTGATGGATTCAACGAACCAAGAGT
GGACATTCCGTTACTACACTCGACCCACTGGAAGGTATCCAAGGCCCATCTTCACAACCG
GGTGGCTTAAATTTGTTCGAGCTAAAGGTCTTCAAGCTGAAGATAAACTTATCTTTTCTG
GACACCAAGTTGGAGCTGTTGGTGGAGAGTTGAATATGCACTACAAGATTAGGGTGATGA
GACCAACTGAATTCTATTTTCAGGGTGAGCGTATTTATGAGGATGTGGAGAACTTTCCAG
AAGTTTAGCACATACTCTATTCGTATGTGTAATAAATTCTGTTTGTATTACGTACAAATA
TCCTCTTGTTGTAATAAATGAATTCTGTTCTTGTATGCTTGTTAATTGATCTATTGTTTT
AGTCAGGTGGGCTGTTTGTTTGCTGTGTGCACTGTGCGGTGATGCTGGTAGATTATTATG
AAATACTTATGCTTGGTTGTAACAAAAATCAAAGTAATAGAAAGAAATATATAACTAAAA
GACAGAAAAATTATAAAGACTTTCATATAAGGTATAAACGAAAAAGACATGTTGACACGA
CTTCTTCTTTTTCATTTCTCTCCTCTGCTTCCCTTATTTGTTAGTAGATCGAATTTTTAT
CCAAACAAGTTTTAGATAAAAATAGCTCCACCGCCGCTCTCGTAGTCTGAGTCGATTCTC
GCTGGAGCAGGATATGCTGTCTGACGAGAGGCAGGTTCGTCAACAAAGTGACAGTCTTCA
ATTTGGAACTTAGGTAGTCTGCTTTGTTTAATTCTTTAATATTTTTGAATTGAATTGTTG
GTTCGGAGTTTGATTAGTTTGGGTATTGAATGTTATTGTTAATGGAATTTGGTTAGTTGC
TAATATATGAAAATTCAAGTCTTAAATATAATAGTTGAATGCTTAATATATATATATATA
TAATAGTGGAATTCTTTTCTATTAATCTAAACTTTTAGGTGTGATAATAATTAACATTAT
ATCAAAATCTGAAAATTCATAATTTAATCTCTCTCTCTTCTCTTTATCTAAAATTCTAAT
TGCACATATTATAGATATGGGGTGTTTAGTATGTGTCCGTCTATCATAACCTTAAATTTT
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