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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI012040 | Chr8 | 30091982 | 30092967 | - | Transcription factor IIIA |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI012040.m1 | 49 | 70 | PF00096.29 | zf-C2H2 | Domain | 20.9 | 0.00036 |
LITCHI012040.m1 | 76 | 100 | PF00096.29 | zf-C2H2 | Domain | 21 | 0.00035 |
LITCHI012040.m1 | 105 | 130 | PF00096.29 | zf-C2H2 | Domain | 18.7 | 0.0018 |
LITCHI012040.m1 | 145 | 169 | PF00096.29 | zf-C2H2 | Domain | 22.1 | 0.00015 |
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>LITCHI012040.m1 ATGAAAGAAAGGGCTATATTCAGAGACGTAAGGCGTTACTACTGTGATTATTGTGGGATT TGCAGATCCAAGAATTGGTTGGTTCAGGAAGAGAAGGATGAGAAAGAGGTCGATGGAGAT GTGAGAGCAGGAGAAAAATCTAATACTTGCGAAGAATGTGGTGCTACTTTCAAAAAACCT GCCTACTTGAAACAACACATGCACAGTCATTCACTTGAGAGGGCATTTACTTGTCCATTA GATGATTGTCATGCTAGCTATAGAAGAAAAGATCACTTGACTCGCCACCTTCTTCAGCAC CAGGGGAAGCTATTTAAGTGCCCGATTGACAACTGCAATCGTGAATTTGGCTATCAGGGT AACATGACAAGACATTTGAAAGAATTTCATGATGACGATGATGATGATTCCTCAGCTACC ATTCCCAAGCAGTATGTGTGTCAGGAAACTGGGTGTGGAAAAGTATTCAAATATGCATCT AAGCTCAGAAGGCATGAAGATTCTCATGGCAAGTTGCTTCTGGATTTTTTTTTCTTCTAG
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>LITCHI016549.m1 - Up_Stream_Len 2000 ATTGATTATGTATATTACTAGAAAAAATATCAATATCAGAGCGGATCTCATATAATTGAG ATAATCTTATCTATTTATCTATATTATATCTTTTTATTACCGATCATTATAAAATTTATT TATTTACATCATATGGGAAAGAATGCATAGGTTAATTTTTAATTGTTTTATTAAATTTTT TTCCTAAAAAATGTTTTCAATCCCCCTAGTTTTTGGCTGAATCTTTTCTTTTTATTAAAT AAAACTCTAAAAATTGGGAATAATACGATTTAAACCCATAACTCAATTGATGTAGGTATG AAAGGCTTACCACTAGATTATACAATTAATATAAATTGTTATAAACAATTAAAAATCAAC CGTACATACATATACTCCCTAATGTTCTTACAAGCTTTGAGTTTTCATATATACAATTGG ACTTCTAGATGTGAATTTAATTTTTATAACAATGTGGATACCTTACCACTATCCCACCAA ATGATATGCAAATATGCAAGCGTAGATATAAACAATTTAAGTATATAAGTGCACAAATTG AAGAATTTTGGAATAGAGAAATCAAACATAATAATTTATAGTGGTTCAACTCTACTTCGT GCATATATCCACTTTCAAGCTTAAGTCTTCTATTATCTCCTATTAGACTTCTGGGTTAAT TAAACCTTTACAACAGTGTAAATATCTCACTACAATCCCAACAAATGACATAATTTATTA TCCACAAAATGCACACATCTAAAATAATATACAAATTTGCAAGCATAAATACGAACAATT GAATTATATAAGTGCACAAATTAAAGAGTTTAGGGATAGAGAAATCAAACATAATAGTTT GAGTAATGTTACATCACCTAAAATTGTATCCAAATTTATTATTCAAATGACGTCATAAAT CTGTATAATTATTATATTTTCAATACATTATTTTATAATTTATAAATCATTTTCCCACAT CATTTAACTAAAAAATTTGCAAACATTTTTTATAATTCCAATATTATTCTAATAATTTGT AGTGGTGTGGCTTACATGTGTACCTACATCCATTCCCCAAGCTTGAATCGTTTACAATCT TCAATTGAAATTGCCAATGCAAGCTTTATAACAATGCGGATGCTTCATCACCACAATCCC ACCAAGTGAAACCTCTCATCTTAAGAAAATACAATAAAACAAAATAAAAAGAAATTCCGA AAACAATCGAAAAGGGTATATGATGATTGATGAAGAACAAGCTTTTCTATTATAAACCCA CAAATGAAAGTTAGCAAGATATTGTTTATAATTTGTGAACGTTGGTTAAGCAAATCAGAG GGGGTCCTCAGTTACTAGGACAGAAAGTTACCCATAAGCTAAAATTACAGGAGTGTTGCA TTTGCCCAGTTGTAAAGGAATGGGTGAGAGTATAGTATCACATCAACATCCTAGAACAAA CACCCATAGGGATTTGAGACACCTTGGAAACATTAATTCATCTGGAGAACAACATCATGA TCCAAGAACAATTTTTTTTTTTAAGAAAAAAAAAAATCATTAGGTCTCAAATTGTAGTGT GTGGATGTTTTGATAATAGTATAGCATGCATGCAATGCACATGATGAGCACTCCCATAAA ATAAAAATTAAAAAAAAAAGAAGGAAAGAAAAGACTACAAGAAGTAGATAGGACTTATAA TTGCCTCAATAAATTCGTCAAAGATCTTTCCATCAGATTTCCTCATCATCTTTGGCTTAT GCTTGCATCATCATCATTTCATTTCTCTTTAAAAGTACTCTGCAATAACAGTGTTGTGAG TTTTATTTTTTAAAGAAATAAAAATTGTTATTATTATTTGATTTATTTAAAATTTTTGTT TTTGTACATTTCCTAAAAGCTTGAGTTTTTAAATTCGGAAGAGGAAAGCATAATAGATTG TTACTCTATTTACACCTCTATCTCAGCACGTTAGCTTGCTGTCTTAGAATAGCCAAAAAA GCAAATATCTTTCTCAGGAA
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>LITCHI004140.m1 GenomeSequence - ATGGTGGTGGAGTGGAGATTTGTAGTTGGTGGTGGAGTGGAGTGGAGAAGGAGAGACCAT GGTGGAGTGGACACCGATCATGGGTTTCCATATTTGCACAGTTGTAGATCCCTAGATATG CAACTTTTTATTTTTTTTAATTTTTAATGAAATTTAATAATAATATAGTATTATTTTGTT ACGTAAAAAAACATATTTGTAATTAAAATATTTATTAGTTGTGTATTGATCATTTTACTT TAGATAATTTTGATACAACGGTAAGAGAAATTTGTATTGAATTTTTAGAACCTTAAGATA GGTACAATTTTTTTAAATATCTTCATTTTTATGTGATTATATCAAATCTCAGGAAGGTAT GTATAAATTTCTCCAAAAGAGATGGCATAAAGTTTGTGCAAATTTCTAAAAAAGAGAGGG TCCATAATTTCTCCAAAAGAGATGGCATAAAGTTTGTGCAAATTTCTAAAACAAAGAGGG TGCATGTACGTTGATGTTGTCTATCCGTTCAGGCTAATTTGTCTATTTTAACCTTTCTTT TGATTTTCTTGTAAAGAATGTCTATTTCAATCTTAATCAACAAAATTCAGCCTTTTTCAA TGGTCAACCACGTGAATACACTATTACGCAATGGTGCCAATTAGTGCCACTATTGTAAAT GAAGTGAAATTACTTTTCTACCCTCTCAGTCCTACTTTCAGTCTACTCAACTGCTCTGCC CTTAGTGGTCATCTTAACGTCTGCACTTCTGATTTGTGTCATGCGCTTATAAGTTGCATC TAACAATACTGATTTGCCATGCAGTTACACATACCATGGCAGATTTTATGATCACTAAGT TTCTAACCCCAACTGATATTGCAAAACTTGTCCTTCCAACCGAAATTCTTGAGCATATTC AGACTCCGGTAGGAATACATCATGTAGATTTGCAGGTGATGGATTCAACGAACCAAGAGT GGACATTCCGTTACTACACTCGACCCACTGGAAGGTATCCAAGGCCCATCTTCACAACCG GGTGGCTTAAATTTGTTCGAGCTAAAGGTCTTCAAGCTGAAGATAAACTTATCTTTTCTG GACACCAAGTTGGAGCTGTTGGTGGAGAGTTGAATATGCACTACAAGATTAGGGTGATGA GACCAACTGAATTCTATTTTCAGGGTGAGCGTATTTATGAGGATGTGGAGAACTTTCCAG AAGTTTAGCACATACTCTATTCGTATGTGTAATAAATTCTGTTTGTATTACGTACAAATA TCCTCTTGTTGTAATAAATGAATTCTGTTCTTGTATGCTTGTTAATTGATCTATTGTTTT AGTCAGGTGGGCTGTTTGTTTGCTGTGTGCACTGTGCGGTGATGCTGGTAGATTATTATG AAATACTTATGCTTGGTTGTAACAAAAATCAAAGTAATAGAAAGAAATATATAACTAAAA GACAGAAAAATTATAAAGACTTTCATATAAGGTATAAACGAAAAAGACATGTTGACACGA CTTCTTCTTTTTCATTTCTCTCCTCTGCTTCCCTTATTTGTTAGTAGATCGAATTTTTAT CCAAACAAGTTTTAGATAAAAATAGCTCCACCGCCGCTCTCGTAGTCTGAGTCGATTCTC GCTGGAGCAGGATATGCTGTCTGACGAGAGGCAGGTTCGTCAACAAAGTGACAGTCTTCA ATTTGGAACTTAGGTAGTCTGCTTTGTTTAATTCTTTAATATTTTTGAATTGAATTGTTG GTTCGGAGTTTGATTAGTTTGGGTATTGAATGTTATTGTTAATGGAATTTGGTTAGTTGC TAATATATGAAAATTCAAGTCTTAAATATAATAGTTGAATGCTTAATATATATATATATA TAATAGTGGAATTCTTTTCTATTAATCTAAACTTTTAGGTGTGATAATAATTAACATTAT ATCAAAATCTGAAAATTCATAATTTAATCTCTCTCTCTTCTCTTTATCTAAAATTCTAAT TGCACATATTATAGATATGGGGTGTTTAGTATGTGTCCGTCTATCATAACCTTAAATTTT AACTACTATAATTGGACATTTTTCTATCAGGTTTAACTTATCTCACTTATATATATTATA ATATATCATTATATTATAAGAAAAAATATATATCTGACTATATTTTCTTTAGATATAATG ATATATATCTGATTATATTATAATATATATATATATCAAATAAGTAAGAGTAGAGAAGAA AGACATGAAGACAGCGACATGATAAAGTGA