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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI011979 | Chr8 | 29654370 | 29658438 | - | "Single-stranded DNA-binding protein WHY2, mitochondrial " |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI011979.m1 | 65 | 197 | PF08536.14 | Whirly | Domain | 190 | 1.60E-56 |
| LITCHI011979.m2 | 65 | 174 | PF08536.14 | Whirly | Domain | 157.4 | 1.90E-46 |
| LITCHI011979.m3 | 65 | 174 | PF08536.14 | Whirly | Domain | 157.4 | 1.90E-46 |
| LITCHI011979.m4 | 65 | 197 | PF08536.14 | Whirly | Domain | 190.7 | 1.00E-56 |
| LITCHI011979.m5 | 65 | 172 | PF08536.14 | Whirly | Domain | 158.2 | 1.10E-46 |
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>LITCHI011979.m1 ATGATGAAGCTAGCTCGCTCTCTGCTCCTCTCCAAGAATGCTTTGTCGGAAAAACTGTTA GTTGGGAAAGTTGACAATGTACAAGATGCTTTGTGTTTGCATTCACTTTTATCTCGGGCT GGCATGTCAACTACTGCACAGAGTTTTGGTGGTGGAGGGAATACTTCACTTCGAATATTT GCTCCATATTCTATTTACAAGGGCAAAGCTGCCCTTTCTCTTGATCCTATTCTTCCAACT TTCACTAAATTGGATTCTGGGCATCTTCGAGTTGAGCGTAAAGGTGTCATTTTATTGACA TTTTGGCCTGCTGTTGGTGAGCGCAAGTATGATTGGTCAAAGAGGCAGGTGTTTGCTTTG TCACCAACAGAAATTGGGTCGCTGATAAGTATGAGAGATTCTTCTGAATTCTTCCATGAT CCTTCAATGAAATCCAGCAATGCTGGTCAAGTGAGGAAAAGCTTATCAGTTAAGGCACTT CCAGATGGAAGTGGTTACTTCATCTCTTTGAATGTTGTCAACAACATTGCAAAAACCAAC GAAAAATTTGTTGTTCCTGTCACAACTGCTGAATTTGTAGTGATGAAGACTGCTTGCAGT TATGCATTGCCCCACATCATGGGTTGGCACCGATTAACCAATCAGCTATCTGGAGACAGT GCGAAGAAGTCATCGAGGATTAATCCACAATTGTTGGATTCAGAGTGGGATAAATGA >LITCHI011979.m2 ATGATGAAGCTAGCTCGCTCTCTGCTCCTCTCCAAGAATGCTTTGTCGGAAAAACTGTTA GTTGGGAAAGTTGACAATGTACAAGATGCTTTGTGTTTGCATTCACTTTTATCTCGGGCT GGCATGTCAACTACTGCACAGAGTTTTGGTGGTGGAGGGAATACTTCACTTCGAATATTT GCTCCATATTCTATTTACAAGGGCAAAGCTGCCCTTTCTCTTGATCCTATTCTTCCAACT TTCACTAAATTGGATTCTGGGCATCTTCGAGTTGAGCGTAAAGGTGTCATTTTATTGACA TTTTGGCCTGCTGTTGGTGAGCGCAAGTATGATTGGTCAAAGAGGCAGGTGTTTGCTTTG TCACCAACAGAAATTGGGTCGCTGATAAGTATGAGAGATTCTTCTGAATTCTTCCATGAT CCTTCAATGAAATCCAGCAATGCTGGTCAAGTGAGGAAAAGCTTATCAGTTAAGGCACTT CCAGATGGAAGTGGTTACTTCATCTCTTTGAGATGTTCAAAATATTGCTGTGACATACCA TTAGGCTGTGCTACCACTTTCAGCCTTTTTCTTGAAGAATTTCTGATAAGTTTTTAA >LITCHI011979.m3 ATGATGAAGCTAGCTCGCTCTCTGCTCCTCTCCAAGAATGCTTTGTCGGAAAAACTGTTA GTTGGGAAAGTTGACAATGTACAAGATGCTTTGTGTTTGCATTCACTTTTATCTCGGGCT GGCATGTCAACTACTGCACAGAGTTTTGGTGGTGGAGGGAATACTTCACTTCGAATATTT GCTCCATATTCTATTTACAAGGGCAAAGCTGCCCTTTCTCTTGATCCTATTCTTCCAACT TTCACTAAATTGGATTCTGGGCATCTTCGAGTTGAGCGTAAAGGTGTCATTTTATTGACA TTTTGGCCTGCTGTTGGTGAGCGCAAGTATGATTGGTCAAAGAGGCAGGTGTTTGCTTTG TCACCAACAGAAATTGGGTCGCTGATAAGTATGAGAGATTCTTCTGAATTCTTCCATGAT CCTTCAATGAAATCCAGCAATGCTGGTCAAGTGAGGAAAAGCTTATCAGTTAAGGCACTT CCAGATGGAAGTGGTTACTTCATCTCTTTGAGATGTTCAAAATATTGCTGTGACATACCA TTAGGCTGTGCTACCACTTTCAGCCTTTTTCTTGAAGAATTTCTGATAAGTTTTTAA >LITCHI011979.m4 ATGATGAAGCTAGCTCGCTCTCTGCTCCTCTCCAAGAATGCTTTGTCGGAAAAACTGTTA GTTGGGAAAGTTGACAATGTACAAGATGCTTTGTGTTTGCATTCACTTTTATCTCGGGCT GGCATGTCAACTACTGCACAGAGTTTTGGTGGTGGAGGGAATACTTCACTTCGAATATTT GCTCCATATTCTATTTACAAGGGCAAAGCTGCCCTTTCTCTTGATCCTATTCTTCCAACT TTCACTAAATTGGATTCTGGGCATCTTCGAGTTGAGCGTAAAGGTGTCATTTTATTGACA TTTTGGCCTGCTGTTGGTGAGCGCAAGTATGATTGGTCAAAGAGGCAGGTGTTTGCTTTG TCACCAACAGAAATTGGGTCGCTGATAAGTATGAGAGATTCTTCTGAATTCTTCCATGAT CCTTCAATGAAATCCAGCAATGCTGGTCAAGTGAGGAAAAGCTTATCAGTTAAGGCACTT CCAGATGGAAGTGGTTACTTCATCTCTTTGAATGTTGTCAACAACATTGCAAAAACCAAC GAAAAATTTGTTGTTCCTGTCACAACTGCTGAATTTGTAGTGATGAAGACTGCTTGCAGT GTATGA >LITCHI011979.m5 ATGATGAAGCTAGCTCGCTCTCTGCTCCTCTCCAAGAATGCTTTGTCGGAAAAACTGTTA GTTGGGAAAGTTGACAATGTACAAGATGCTTTGTGTTTGCATTCACTTTTATCTCGGGCT GGCATGTCAACTACTGCACAGAGTTTTGGTGGTGGAGGGAATACTTCACTTCGAATATTT GCTCCATATTCTATTTACAAGGGCAAAGCTGCCCTTTCTCTTGATCCTATTCTTCCAACT TTCACTAAATTGGATTCTGGGCATCTTCGAGTTGAGCGTAAAGGTGTCATTTTATTGACA TTTTGGCCTGCTGTTGGTGAGCGCAAGTATGATTGGTCAAAGAGGCAGGTGTTTGCTTTG TCACCAACAGAAATTGGGTCGCTGATAAGTATGAGAGATTCTTCTGAATTCTTCCATGAT CCTTCAATGAAATCCAGCAATGCTGGTCAAGTGAGGAAAAGCTTATCAGTTAAGGCACTT CCAGATGGAAGTGGTTACTTCATCTCTTTGAGTAAGCACTCTATTTGTGCATAA
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>LITCHI011979.m1 MMKLARSLLLSKNALSEKLLVGKVDNVQDALCLHSLLSRAGMSTTAQSFGGGGNTSLRIF APYSIYKGKAALSLDPILPTFTKLDSGHLRVERKGVILLTFWPAVGERKYDWSKRQVFAL SPTEIGSLISMRDSSEFFHDPSMKSSNAGQVRKSLSVKALPDGSGYFISLNVVNNIAKTN EKFVVPVTTAEFVVMKTACSYALPHIMGWHRLTNQLSGDSAKKSSRINPQLLDSEWDK. >LITCHI011979.m2 MMKLARSLLLSKNALSEKLLVGKVDNVQDALCLHSLLSRAGMSTTAQSFGGGGNTSLRIF APYSIYKGKAALSLDPILPTFTKLDSGHLRVERKGVILLTFWPAVGERKYDWSKRQVFAL SPTEIGSLISMRDSSEFFHDPSMKSSNAGQVRKSLSVKALPDGSGYFISLRCSKYCCDIP LGCATTFSLFLEEFLISF. >LITCHI011979.m3 MMKLARSLLLSKNALSEKLLVGKVDNVQDALCLHSLLSRAGMSTTAQSFGGGGNTSLRIF APYSIYKGKAALSLDPILPTFTKLDSGHLRVERKGVILLTFWPAVGERKYDWSKRQVFAL SPTEIGSLISMRDSSEFFHDPSMKSSNAGQVRKSLSVKALPDGSGYFISLRCSKYCCDIP LGCATTFSLFLEEFLISF. >LITCHI011979.m4 MMKLARSLLLSKNALSEKLLVGKVDNVQDALCLHSLLSRAGMSTTAQSFGGGGNTSLRIF APYSIYKGKAALSLDPILPTFTKLDSGHLRVERKGVILLTFWPAVGERKYDWSKRQVFAL SPTEIGSLISMRDSSEFFHDPSMKSSNAGQVRKSLSVKALPDGSGYFISLNVVNNIAKTN EKFVVPVTTAEFVVMKTACSV. >LITCHI011979.m5 MMKLARSLLLSKNALSEKLLVGKVDNVQDALCLHSLLSRAGMSTTAQSFGGGGNTSLRIF APYSIYKGKAALSLDPILPTFTKLDSGHLRVERKGVILLTFWPAVGERKYDWSKRQVFAL SPTEIGSLISMRDSSEFFHDPSMKSSNAGQVRKSLSVKALPDGSGYFISLSKHSICA.
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>LITCHI011979.m5 CTCGAGACTCGCGAGAGAAGACGAGGTTATTCAAGGTTTCGAGCGAGAATCACCACATCA ACAAACGAAATGACGCTAGAACATATGTCAGTCGGTTTGTTTTCGTACGATTTTCCTGTG TTTTCTTGGTAACCAAACAAGAGAATTGACGAGAAATGAAGAGGCGGCCGAATTGAATCG TCTTTAGATGCAGATCACGAAAGAGGGCTCTCTTCTTCTTCTTCAGTCTCCGACTCAGAC CTTTGAAACAATAAGTGAGAGTCTGGACCGGGTTCGGGTATGTTAACGGATTTTGTTAGA CTTTGCAATCATTATTAATTATTTGATTTTGTTGGGGCATATCGAGAATAGGAAAAGATT GAGAGGTCCCTTTGGAAATTTCATCCACCAATTTTACAACAACATTAGTCTACAATCTAA ATCGTGAGGAGGCATGCAGCAGATCATATCTCCTTTCCCTCCATTTCGACAACAGCGCCA AACGCTGTACTCACCACACCAAATACAAAACTTCCATACATCCACCTCTCTCACAACACG CGTCACTCTCTCGAAGTGACCTCACAGTATTTCCCTGCACCTGCACCCCTCTCTCTGCTC CACATTATACCACCACTGTCTAAAATCCCTCTAAAACCCTAACTCTCTTTCTCTCTCTGA AAATGATGAAGCTAGCTCGCTCTCTGCTCCTCTCCAAGAATGCTTTGTCGGAAAAACTGT TAGTTGGGAAAGTTGACAATGTACAAGATGCTTTGTGTTTGCATTCACTTTTATCTCGGG CTGGCATGTCAACTACTGCACAGAGTTTTGGTGGTGGAGGGAATACTTCACTTCGAATAT TTGCTCCATATTCTATTTACAAGGGCAAAGCTGCCCTTTCTCTTGATCCTATTCTTCCAA CTTTCACTAAATTGGATTCTGGGCATCTTCGAGTTGAGCGTAAAGGTGTCATTTTATTGA 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>LITCHI031373.m1 - Up_Stream_Len 2000 GTGGCACGCCGCCACGTGTTGGTCTTCGAAGAGTCACTTCGAATTTTCTTGGCAGAGAAT TGGAGGTTGTGATTTGTCAAGTCCAAGTGTGTGTTTGTTTGCGTCTTTTGGATTTGTGGT GTGGGGACTCACTCAATTTTTTTATTTTTTTTATTTAATTATTCACACTCAAAGTTGTCT ACCATGAAGTTGGTAGACACAACTAGATATTTTTGATGACTAACCACAAATTTATTCCTT TAATATTGCACCTTTACCTGCTTTGCAACCCAACCTCTTCAGTTTTCTTTAATTTCTAGT TGTTGCCATGTAATTTTCAGATTTTTTGTCTACTCCATCATTGAGGCGCCTAATAGGTCA AACGGGTCAATTCAGTTGTCGTTGTGAGCATGCTACATAGACTAGAATAAGATGATGAGC ATATGCCACGGCTTGATACAATTTATCGGTTTTGGTACTCTTGGTTAATTAATAAACAAA TAAATCATTAATAATTTTTATGTAAATTATTAAAATTTAGATATTGATAATTAAAATATT TAAACATGAGTTCTTGAAGCAAAAAAATAGATATATATTCTAGATAAATTTTAAATTAAA TTGAAATTCTTTTATAAAGAAGATGGATAGAGGTGAACGGGTTCAAGGATATTACCAATG CCCCTTCTCTTAATTTAAAGTCTATAAGAATTTGACATCATTTATATGTTAAGATCGAAT AATCAATTAAAAATGATTTTAAATATTGGATTAGATTCGATGAAAAATATTGTTGTCATT CCCATAATTTTTCAATCCCAACCACTTGTTATAATCATAATTACACCATACATTAAGTAA TAAAAAGGGGGAAAATCTAAAACAACATCCAACAGAACAACAAGACTTGTACCAAAAAAG GTCAAAAAAAAAACCCAAGACTTGGACAGCCAAAACCACAAATAGAATAAAATAAAAGTC CATGATGGCAATAAAAAGTTAAAAACCGACAAACAATCAATAACAATAAAAAGAATAGTG AGGTTCGAGGCGACCGAGGTTTTTGTGGACAAGCGATGTGCATAGAAAAAAGAAAAAAGC CAAGAACACAAGTCATCTTCATCATCCACCACAAAATCACCATAAAAATCCATTTCCAAA ACCACACGACCAAAAATAAACATTCTCACTCCCACATATTATAATAATAGTATTATAAAT AAATAAATAAATTCAAATTCAATTCATTAATATATTTAACTTTTTTTATATATTAATTTT TATTAAAAATGATTGAATATTTCTTTAATTAAAAAATAAAAAATTAACTTTTACTCTTTT ATTTTTTTAACTTTTAAATTATTAAAACTACTAATTTTAATCATTTATTATATTTTTTTT TTATATCACTAATCTTAGTTTTTTATTGTATTTTTTTTTAAAAACACTTATCTAACTGTC ATTCATTGCATTATCTCTTATTCATAAGATTATTAATCTTAATCATTCATTATATTATCT CTCATATTTAATTCAAATATAATGAATTATTCATTGATTCTCTCTCCTAAACTAAAAACA TTTTTATCTCCGATTTAATTCAAATATAATAAATGATCACAATTAATAATATTAATAAAT CTCAGTTACTCATCACATTCTCCTTTATATTATTAAAACCATAATTTATCTAGTCATTGT ATTTTCTCTGCTTAAAATATATTTTTTTTAATTTAATTGAAATCCAATAACTTATTGATG TTAATAATTCTAACAATTTAAAAATTAAGTACACTTATTATAAAATATATATTTGAATAA TTTTTTTTTAGTTTTAAATAATTAGATTATAATTATATAAATAATAAAGAAATTATAAAG GAAGCAGCACCGCCACCCTAATTTTCCCTCTTAAAATTTGTGTCATATTTTGCTCCCTCA AGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCATACAAAATCTTCATCGTTTCGACTTTCG ACACATACAACGAAACTATA
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