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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI011716Chr82592373525930396+Agamous-like MADS-box protein AGL12

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI011716.m11056PF00319.21SRF-TFDomain79.87.80E-23
LITCHI011716.m190173PF01486.20K-boxFamily76.21.80E-21
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>LITCHI011716.m1
ATGGCTCGTGGAAAGGTTCAGATGAAACGCATCGAGAACCCGGTGCACAGGCAGGTTACC
TTCTGCAAGCGCCGTGCTGGCCTCCTCAAGAAGGCTAAGGAGCTCTCTGTGCTTTGTGAT
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GGGTCAACCATGCAAGGGCTTATTGAGAGGTACACTAAGACCAGCCGTGGGGCTCAGAGT
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>LITCHI011716.m1
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>LITCHI011716.m1
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>LITCHI011716.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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ACACACACAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAATTACTGTACTCAACACCACAAAA
GTTGATCGATCAAATTTTAC
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>LITCHI011716.m1 GenomeSequence + 
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AAAGGGGCATTTTGCAGCAGCAACCTCGAAGCTAGTTCAAACTAGTGGGAGGTTGTGTGT
GTACACACACACACACACAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAATTACTGTACTCAA
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TGGACTATCTGCATGTTTTTCTTTTCGAACCCACAGAAACTCAAACGTAGAGATATTTGT
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GAGTATTTATTTTATTTATTTTCATTGTATGTAATATATAGAACCATGCAAGGGCTTATT
GAGAGGTACACTAAGACCAGCCGTGGGGCTCAGAGTGAGCCACCAATGGAGATGCAGACA
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ATATACTTAACAAAATATTCACAACTTTTTGCAGGCCCCATAGTTGTGTTTTGCATAATT
TATGCATGATATCTGATTTTGTTAGGTTAGATTATGGCGCTAGTTGGATGTGTAATAGAT
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GTCTTTCTATAACACGAACTGGAAACAGGAATTCAAAAGATAGATAATAAAGAACGAGCA
AAACTATATCCTTCTCACACTGTCACTCATGCATGCTGATTCGAAATGAGAATATATATT
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AAAGTCCACATGGACAAATAGTCACTGTGATGACCAACTCACTGCAATTGTAAGTTTGTA
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TCTGAAAAAGTTAAAATCGTATTATTTAATAATTTTGGTATAAAAGATGTACTTATTAAA
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ATATAGTTACTTTTATAAATAATTATGAAATGGTCTATTATAGGATTTAATAAATCTTTT
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GTATATTAAATTATATTACTAAATATGAATTTAAAAAATATATTTTTTGATAAATTTTGG
ACATTTATATATTGACACCAATTAACATAAAATTTACTAAATGTATGCATTTGGTTAGTT
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GACACTGGATGAACTTCTTGTGCTTGAAAAGCATCTTGAATTATGGATTTATAACATTCG
CTCAGCTAAGGTATTTCAGATATATATTTTAATTTCAGATTATTTAGTAATTAAAATTTA
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ATTATTAATGTAGATGGACATTATGTTTCAAGAGATCAATGTGTTGAGGAACAAGGTTAG
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GTATAATTTGTTTTTCCCTATGTTAGTTATTTCCAATGCCTATTTTAAATACTAAATCTT
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AATACATGGAGCTTCTCTTTTCCAAGTTTGAGCCTTTGCCTCTTATTCTCCCCTCTTGCA
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CTGAAAGCTGCAAATAAGTATTTGCAAGATAAGGTAAATAAATACTAATATTATTATACT
TTTTTCTTCTAAATGAAAAAGAAGTACAGAAAAATAACATTTTGTGTTTTTTTTTGTTGT
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TTGCTCCAATTTAGCATACCTTTGATGGAGCATTAATATATAATATTAATAATTAAGAAG
ATTATATTATTAATGTGCATGTAGTAAGCAAGTAATTAAAGCTTAATACTTAGTCCTATG
TC