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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI011716 | Chr8 | 25923735 | 25930396 | + | Agamous-like MADS-box protein AGL12 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI011716.m1 | 10 | 56 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 79.8 | 7.80E-23 |
| LITCHI011716.m1 | 90 | 173 | PF01486.20 | K-box | Family | 76.2 | 1.80E-21 |
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>LITCHI011716.m1 ATGGCTCGTGGAAAGGTTCAGATGAAACGCATCGAGAACCCGGTGCACAGGCAGGTTACC TTCTGCAAGCGCCGTGCTGGCCTCCTCAAGAAGGCTAAGGAGCTCTCTGTGCTTTGTGAT GCTGATATTGGCGTCTTCATTTTCTCCGCCCATGGAAAGCTCTATGAACTCGCCACCAAA GGGTCAACCATGCAAGGGCTTATTGAGAGGTACACTAAGACCAGCCGTGGGGCTCAGAGT GAGCCACCAATGGAGATGCAGACACCGGATGCAAAAGAGGAGATCAATATGCTGAAACAA GAGATTGAAATACTCCAAAAGGGTCTCAGGTATATGTTTGGAGGTGGAGCAGGGACAATG ACACTGGATGAACTTCTTGTGCTTGAAAAGCATCTTGAATTATGGATTTATAACATTCGC TCAGCTAAGATGGACATTATGTTTCAAGAGATCAATGTGTTGAGGAACAAGGAGGGAATA CTGAAAGCTGCAAATAAGTATTTGCAAGATAAGATAGAGGAGAATACTGTGATTGCTAAC TTTGAGCCGGTGACAACTAACATTGACAACCCACTAATTGTACCGAATCAGATATTTCAG TTTTAG
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>LITCHI011716.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATAAATATTTTAGTGTAGGAACAAGCAGATTCTAGATGGGTAATGTATATATAATGTATA CCTCAAAATCATGTATATATATGTGTCTCATCCGATGGTATCTATTCTCTTCTTTCCAAA ATTCATTAAATAGATCCATCTTCTAGACCTATTTGTTATTGGTTAATTAGGTTTTAATTA ATCTTTATCAACTTTTTTTTTTAATCAAGTTTTAAGTTGCAATTTTAACCAAGTCATTTA TAGATGTTCCCATTTCAAATACAACAAAAATTGATAAATTTTTTTCACCACAATTTGGAG GCTGCCTACCACAATTGTTTTATTTGTAATGACTGAAAGCACATGCTTTTCCCAAGAACC CAGTTAACTTTAACCCTCCAAAGTTAGAATTATTTGTAAAACAATATATATCCTCGAATC TAAAGCTTTATGCAAATGAACATAGAGAAATAATATTTGTCCACATGGCAATGTCTGGGA TAGTTACAAGTGTCAAACATATAACTCTCTTCAAATAGCATATGATATAGATGTCAGAGG GAAATCTCTTCTAGGGTTTCTATTGAATGTTAAGTGATTTAACAAGATTCTTGTCTTCAA AGTTAAGACGATGGAGAGAATATTTTTGCGTTCCATTTTTTATTCATTTTTTGATGCATG AAAGAGTGGTGGGGGCTGATCTGATTTTTATTGGCTTAGTATAATTCTAAAGCTCAAAGA ATCCTTTTTTTTTTTTTTTTCAATTTTTGAGTGACGGGTTTTGTCACACAAACAAAGAGC AACGCGTGAAGGCCAACAAATAGGGAAAAACTAATTGAGGAAAATATAAAATGGTCGAAG AGATGGGTTGCACGTGAAATAGCAATTGCATGCTGACTAGACTATGATGTGCCCCACAAA AGCCCTTATGATCAATCTTCAATTCAAAGCTGCACGGCCTCACAAAGCACTATAACCGAA GCAGCACTTTTGGACCCACTGATCATGTGAAGTTGAGAAGGAATCAATTAGGGTTGCAGT TCTCTACACAGCCTCCATAAAAATGGCGACAGCAATCCACGCATTACATATTGACATGTC ATGGTCCTAGGCCAACAGTGTATATATATGCGAAAAGCAATTAAGATTCTTTGTTGATCT AACTTTAACTTATTTTTCAAACGATGCAATAAATAATGGTAAACTTTCTTCTAGTGTAAG GTTAAGAGTTGTTTCTTAATTATTGTTTGGTACAGTGTCGTGATCAGATAAGATATATAT TTTGTGATCACATAATTCTTGTTAAATTATAAAATTATAAACATTTTTACTAATATTTTA CTTTATAATTAACTTACATGTATGCAAATTTTATATGTGAATCAACGTGGTAGAATCTTT TACAGAGATTTTAATAAAATTCTATATTGTTATGTATTCGCTTTTCACCTGTTGCGTAGT GATTACAAACCCTATTTTCACTCAAATAGGAACTTGTATCAGCAAATATCAGCAATACAC TTAAAACGTTGACATGTACGCTCATTGTGGATGAGTTGGTACAGCATATATATACACTCA ACAAATCAATTCTATTGCACCATTTTTAATGTATGATTTGACTAAACATGTATCATTTTA ATTAATATCTTAAAGTAGGCACTACTATAATGCTAAATTAAATAAAGTAATTTAGAGAAC AGTAATGATGTGTGAGGGATTAAACAAAGTTTAATGAAGTGTAAAGGAAACAGCAGACAA ATTATTCTTATGTGCTCAAGAGCGATTGAGAGATTCCGTGTCAAGTATTTAAGGTTTGCA AGCAGCCACAACAGAGAGGCAAAATTTCGACTTCCAAGTTCTTGAGAGGGAAAGGGGCAT TTTGCAGCAGCAACCTCGAAGCTAGTTCAAACTAGTGGGAGGTTGTGTGTGTACACACAC ACACACACAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAATTACTGTACTCAACACCACAAAA GTTGATCGATCAAATTTTAC
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>LITCHI005054.m1 GenomeSequence + CACAGCCACAAAGAAAGGTTGAGGTGAAGAGAAAGGGTAAGGTGGTGATGATGGTGATTG GTGGACTGAAGAGAGAGAAGATCATCATATTCATGTTGGTGATTAGTGGGGTCCATGTTC TCTTATCCTGCTCAACCACACCCACCACATTGAGACAATTAAATATGGGAAGTAGAGACA ACGAAATCTTTCTCAAACAGGTACCGAAGATGCCAAGTTGACGGTCGAGACACACTTTGT TTCTCCACCATCTCTTTTTTATTATTTTTCTCCTTTTAGTTTTATCATTACTATTTCATC AAATCTCTACGTTAGTTTCCACTAATATGCAGACATTTTGCACCAACTATATGCATTACT TTCAACAACAAATTAAATATATTTATTGATATGGAATAAGATAACTTATCTAACTTTATT TTTTTCTTGATTTTATATTATTTTAAATAGGATAGGATTTTATAGAGATTTCTACAGATT TTTTTTAATGAAAATCTTTTAATTTCTGTAGTTGAAAAATCATTTGACGACTTCTAAAAT CATTAAAACAACTTGTTTATATAATCCAAAAACTTAAACAGTTTCATTGCTTTTTAAAGA ACATATTTTAATTAACTCATTATTCTAACATAAACACATGTCGACTAGCCATTGGAGGGC TAAGCACTAGCTGCGGATAGGTTAAATCTGGGCCAGCCAATAACCAGAATCAGATTGGTG GAAACAAAGAATATACCAATATCTACAATTAAAAATGTTTAATTGCCAAATGCGTGAGAT CAAAGGGTGATCATTGGACGATGGCCAGGATTTTTTTTTCTTTTTTAAATTTTTAATTAT CAAACGTCTGCCCATGATGAGATGATATTACTAGAACATTTTGTTTCGGTCGTATCGTAG TGAGGTGAGACACATTGGACGGTCCTGATTCAGGTTGTGGTACAATATATAGCAGTCAAT GGTTCTGCGAAGCATTGTGACGTAACCTTTCCTATAGATTTCACTAACCACCATTCAGAA GCACAAAACAAAATCCTTAATATCTCTCAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAAACA AAAAAAGAAAAACAAAATCCTAAATAAAACAGCCCTCGCTATCATTTTTTTTCTCTATAT AAATCAAGTAATTGCACTAGAAGTCATTTTTCCTATTCCTTTTTATTTTTCTCTTGTTGC ATGGACTGAGAGAGATTATATTAGACTTTCTCTCTCTTATAAATTTTCTTTCTGTCTCTT GGAACCAGCAAGCAAGCAAGTACAACAAGAAGAAAGAAGATGTCTCGCAGCTGCTCGCAG TGTGGAAACAACGGCCACAACTCGCGCACCTGCGCTGAGGCTGCTGGTGGTGGAAGCAGC GGCGCTGGCTCCTCTGCCGAGAACGGAATCATGCTGTTTGGTGTGCGAGTCACTGAGGCC TCCTCCTCCTTTAGAAAAAGTGTTAGCATGAACAATCTCTCCCAATTCGATCAGCCTCCT CAGGATTCAAACGCCGATGCTGGCTATGCCTCTGATGACGTCGTCCACCCCTCCGGTAGA AGCCGTGAACGCAAGAGAGGTACTTTTTTTTGGGTTTATTTTTATTTTGTTGTGTTTAGA TGAATATATTTATATATAACTGAGAATATTTTATTTTAAGATCCGATCATGAAAATTTGT TAGATTCTTTTTCGCGTGTGCAGGAGTTCCATGGACAGAAGAAGAGCACAAGCTATTCTT GTTAGGGTTGCAAAAAGTTGGAAAAGGAGATTGGAGAGGAATTTCAAGAAACTTTGTGAA GACACGTACACCTACTCAGGTTGCTAGTCATGCCCAGAAGTACTTTCTCCGTCGCTTCAA CCAGAACCGGAGGCGCCGCAGATCTAGCCTTTTTGACATCACTACTGATACTGTATGTTT CCATTATTATATATGTACAAACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATTAATCTTTTTCACA TATTTGTCTTGTTTCACATGCGGGTTGTAGAACATTTATTTACTAAGTTTTTCGATATTA TACTAAGACGTTGTTGTTGTTATCGATTTGCAGTTCATGGGGTCGTCAATGGAAGTAGAC GAACAAGCTCATCAGGACAAGGTGACTCTACCTCCACCACAGCCACAGCCACAGTCTCAA CGGGCTTTAACTTGCAATCTAGGGTCATTTCCAGATGTGTCGACAGCTTATCCGGTGAAA CTGAGTACGGTGGTGTTACCGGTGACCGGGGAAAGTCCTAACTCTGTGGAGAATTTCACT TTAGGAACAACCAACCAACAGAGAACATCATCAGCAAAGCTCATCCGTCCAATACCGATT CTTCCGGTTCCTCCTTCTTCAAAAATGGCTGATCTTAACCTGAACCAAAAGCCCAACCAC GTGGACCCACTGCCTTTATCACTCAAGCTGCCATCTACATCAACTCCCGAGGAGCAGTCA TCAACACCGACACAACAACAACAACAACAACAACAACAACTACAAGTTCTCACTCGTCAG CTTTTCAGGCCATGTCCAGCGGCGATAGCATCATCAGTGTTGCTTGAAGAAACATATATA TGATGACGATATATAAATTTGTTGACCAAATTAGATATGTTGTAAATTAAGGGTTGGGAG TGGGAAAGTTGGGAATATTTTGAATTAGATTAATGATAATGTTGGATTAATCAAGTTAAT TAAAAAGATTAGGTAATTAAATTATTATTAGGGCGATTAGGTGATTCCTTGTTTGTACAG GTTAGAAGATGAGACAGAGATGGGCTGTCTTTTTCGTTTGTGGGGGATTCTTGTTTGTTT TGTCCAGTTTGTTTTGTTGTGAAATGACACAGAACCGGGTACGCTTTGCCTAGTTGTGTT CTTTGATTGGTCATACACTTGAAACGTCAACACAAGTAGGTAAAATATCTTGAAACTGAA TATTCTGTTTTGAGTGATTTTCTATTTTGATGCTATTATGATTTTGTGGAGAATAATCTA ATAAGCTGTTATTCATTACTTTTTCTATAATAGAAACCTATAATGATCTCTTTAATTACA TAATATCCAAGGACCATACCCTCAGGCTGGGTGGGATCCCGTTACATAGCTGTGAGAAAT CTAATAATTTGGTCGTTTTAATTTGTGTTATTGGTTCTTGGAAGATCTTGTGATTTTTTT TTCTGAAGTACATGTGATTTTTCTTGTTATTCGTGGTTGTGTGTAAGCAAAAAAGATTAA AAA