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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI011652 | Chr8 | 25022058 | 25023900 | - | Zinc-finger homeodomain protein 6 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI011652.m1 | 25 | 79 | PF04770.15 | ZF-HD_dimer | Family | 90.3 | 8.20E-26 |
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>LITCHI011652.m1 ATGGATCTCAGTCTCGTCCCATATCAACAACAACGACAAGAAGACGAAAAGTACAACAAC ACTCACAAGACGATCAAATACAAAGAATGCATGCGCAACCACGCCGCCTCCATCGGCGGC CACGCCAACGACGGCTGCGGCGAGTTCATCCCACGCACTGACTCCACTGGCACCTGTAGT GATTCGCTTATATGTGCTGCATGCGGCTGCCACCGGAATTTTCATCGTCGGGAAACTGCT GGCGGCGGCGAGTCACCGCCTTTCCATCTCCACCACCTCATGCACCAACCACCTCCACCA ATGCTGCTTTATAAATCATATCATCATCAAAGTGGTGGTGGTGGTGGAGGGATGACAGCC GTTGATCATTCGAGAAGTGACTATGATCGACGGTCGGAGACGCCGGAGAGGGAGGAGGTG AACTTGAATGTGGGACCGGGGTCGTCGGGCGCGAGCTCGGGGAAGGCGAAGAGGCATAGG ACCAAGTTCACGCAGGAGCAGAAGGAGAGGATGTTGGAGTTCGCGGAGAGAGCCGGTTGG AGAATGAACCGCCAAGACGATCTGGCACTGAACCGGTTCTGTGCTGAGGTTGGTATCACC AGGAATGTTCTCAAGGTTTGGATGCACAACAACAAGAACGCGCACCGCCGTAGAGATGAA CCGGCTGCTCAGCCTCCCGTGGTGGCTGCGCCGCCGCCCCCGCAACCTGTAGGAGTCTAA
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>LITCHI019286.m1 MGVENYHVIELVGEGSFGKVYKGRRKFSGQTVAMKFIMKHGKSEKDIQNLRQEIEILRKL KHENIIEMLDSFENPQEFCVVTEFAQGELFEILEDDKCLPEEQVQAIAKQLVRALHYLHS NRIIHRDMKPQNILIGAGSVVKLCDFGFARAMSTNTVVLRSIKGTPLYMAPELVREQPYN HTADLWSLGVILYELFVGQPPFYTNSVYALVRHIVKDPVKYPDDMSPNFKSFLKGLLNKV PQNRLTWPALLEHPFVRETSDEVEARELLATAAAARGCEAAWRGEGNNVQMPNGKSNSPA ACEKNIPSSLHSDAQMNCSDRAQDNSSAHEEFPGFASPNDVKPSGSQVLNRLENNSRTVK GAQAIAQDNEALTLILLPLRKWSKGVQINSRGEDFLNSNQSLRILSNLVVAGATISSGLL DDVVSELLDFIATVLSLKSSELNDLISKSFSVIKMLIDDKGSGIASSYFTHWVAVVEIFS QVVSCNEDAFGRILYESASCITIMLSRVAQDYKASSSNPGSEPVSAPVVNETLNQILDHA KTSGLMDQLCLCLATSGSSLNSGSSNMLRAACETCRAIWALIDALEIDFMKGKPYFFPLN ALRNHSLLRVDMRDQERGSLVGIESARVVDTVTRAFLRSKAVQHAINHCLHQHVETTLSA VIQLLLRCCLRSGIVPSVLCGLPSSLPVTTVVSGGADGTIVSEIFSILSWCAQSLNKDTQ TGEISNSKCNALVLHSCLLLATVAQCLKSTLRNSALFMLTTSPKKQQSRLSVLAHHFSFD DGIKASFQPHIASAMLALASILSLESGASVESSISEIAMRLIPRTATLCDHLKITPGNAD EAEPCNQNGILSYWHGLRDGCVGLLESRLRWGGPLAVQQMIASGIPQLLIDLLANGHCKE NNGTRDRVGLSPTGVVSTISSICHCLPGGALTFRHILVKNEHMMVFSNLISDIHLKLVKC 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>LITCHI019609.m1 ATCAATCCATAACATGAGGAATCTTCTGCCAAGGTTCCTATAATAAAACCCCCTGTGGTT TTATTTTCTCACATGTAAAGCCACTCCTCTCTTCACTGCTCATTTCCACAACTTGAGTCC AAACCCTTTATATTTATTTTTTTCTCATTATAATAATATTAAACAAAATCCTCAATGGAG TCTCCGTGTTCCTGGCCGGAAAACTCAACCTCCGATCGAGCCAAAGCCGTCGAGGAGCTC GTCCAAGGTCGTGACTGCGCTCTCCGGCTCCGCTGTCTCCTTAACAAACCATCATCATCA TCATCGGAGAACAACAACAATGATGTTGATGGGGGTGTCCAGAACCAGGATCTTGTGTTG AAGATACTCTCTTCATTCACCAACACACTCTCCATATTGACAAATGACGGTCGTGATCAT CATCGATATTATCAGTCCGATGAGGTCTCTCAGATTCAGACAAATGCTACACACTTCAGC TGGGAAGCAGCTCGCAAATCTGAAGATTCAGGAGAGAGTTGCAAGAGCACTTCAATTGTT AAAGATCGGAGAGGCTGCTATAAAAGAAGAAAGTGTTCAGATTCATGGATCAACGACAGT CCTAACCTGGTAGATGATGGCTATGCATGGAGAAAATATGGACAAAAAGTGATCCTCAAT GCCAAGTACCCCAGGAACTACTTCAGGTGCACACACAAGCATGACCAGGGGTGTATGGCA ACCAAGCAAGTGCAGAGAATTGAAGAAGATCCTCCGCTATACAGGACAACATATTCTGGT CGTCACACTTGCAAGAATTTGCTAAAAGCTTCTCAGCTTTTCATGGATTCCAGCAGGGAT CACAACAACTCTCCAATGATCAGCTTCTGCGACAAAGAAACCGACATCAACAACAGCAGC AACCCATTTCTCTCATCGTTCCCATTTATAAAACAGGAGTACAAGGATGATCAGGAAATC ATGCCAAATCATGATGATGATCACCATCATCATCATGATCTTATGACCCACAACTACCAA TCTGAATCGTCTGATCATTATCTACTCTCGCCTGATCATGATCACCAACTGACCACATAT GACTCCGGGGTTGTTAACTCATCATCCTTGTCGTGTACGGACATGGGGGTGCTGGTTGTG GATTCTGTTGTCAACTTTGACGATGATGATGACTTATTGCATCAGGTTGAATTCTAGATG GGCTGGATTTATAATTTTCTATTGTGTAGAAAGAATATGCTTTTCTGTTAGTTTCCTAGG AAACTGCTCTTGACTGTAGTATCTTTCCCTTACTGGTACTGTATGTTAATTTGGATCAAC GTTTCATTTTGTGTATATGCATTTACTGCTCACCATTCTCATCAATCTTATCATATAAAT CTATACCAAACTGATACGTCATGCTTTTTTGACCCTGGATTGAATGAAATCTATAAAGTT ATGTTCTGCT
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>LITCHI019609.m1 + Up_Stream_Len 2000 CTGTTTCCATTTAATCACAAGGTCACATGCCTCACAACTTGTATGTGCATTGTTATAAAA TGATAGAAGATTTTTTAATAAAACAATTAATATTTGGATTTGGATCCATCATATATAACT ACATGTTTATCCAAACTTGAGTTTATTTATTTATTTTCTCTTTTAAATGCAGTACTAGAT CGGAAGCTGATTAACTACTAGTGTTTTGTCTTTTTTGATATTGAAAATACCCCACATGTT TGCCCCTTTTTTCGACAAAAAACCAAAACCAGACCATCCTCAATGGAGGGTATTTTCGTC TTTTGGTTGTCCAGTTGTGTCTGAGAGGATAAGAAATCGAGGGAATCAAACTCGGAAAAT ATTTATAAGAAAAGCGTTCCAGATGCTGATGTAGCGATAGTGACGTCACCGAGCTAGACG TCACACTACCTCTTCTCACGCGCTTTTGTCAACCTTTTTACACCACGTGCACTGGCCACC TACCATTTTCGAATTAATTGGAAAGAGGAAACATGATAATAGTCCCTTCATCCATATAAT CTAATTCAAGTTTATAAAAAAAGGTATCTTAAAACAATTACTAATAATTTTAGGGAGTAT CTTTTCTAAATTTATCTAAAATCTTTTGTTCAAATAGCATGATAATTGTAGTTGGCTATT GATTTCGTCGATATCAACACCACAACTCTATGTTATGAAAGATATAGTTCTATATCCGGT GATAATTTTTTCCTGTATCAATTTATGTGGGTAGCCCCCCATATCTTGTGGACCGTTATC TCTTGTATGGGAGCAATTCTTTTGACTGTACTATTAGTGCTTTATCCTGATAGGTCCTTA TTATATCTTAAGATTAGTTCTCCTTAAAAAACCATAATAATTATTTCAAAAAAAAAAAAA AAAAAGCATGATAATTAGATTTGTAAGTATGGCATCATAAATATATAATCTCACATAATA AATGCCACACACATTTTTGTAATTAATTGGAAAATGAAATATAAATGGATCGATATAATT AGTCAAAATTAATAAAAATATTGAAAAATATAACTAATTAGGTATTATTTTTCAACCGTA TATCACCTTTTAATATGAATAATTGAATACTTCTTTTGATCCTAAGAGGATAAATGTGAG ATTTAAGTCTCACATTTGTCCTAAAATAAAGTATGCCATTCCCCACCATAAAAAAAGGCA CCATAATTTAATCAGTATCATTATAAATTTCATAACAATAATATTATATTATTGAAAATT TTATTAAAATTAATTATCTAACTAATATAATAGGCTAATTTGTAACCTACATATATATCA TTACCACATAATCTCACATGATTGAGATTATTTTCGGTACTAATCCTTTTGTTCATCTCA ACAATTAAAACACAATATACATCATTTAAAAATATAAAAGTTGAAAGAAAAAATAAATAA ATTAAATGCTAACAATTGATTATGCAAATGACTACATCAAAAAGATTAGAAGAGTGGATG ATCCAAATATTATTCAACAACCAATTTTCACAAATCAACATTTCATATTATTTAAATAAA AATTGATAAATATTAGATTTCATAAATCTTTTATCTAAATTTATACTTAAATGATGTTAT ATATAAGTTTTCTATTAATTATTATACCATCTTATAATTTATAAGTTGTTGATAATTTAT ATGTTATATCATTTAGATAAAAAACTTAAAAAGGTTGACATTATTTATAAAAATTTTAGA CGTTTTGGATGCTGTAATAATAGTTAAATTCAACCATATGGTCTAAAATTTATGGCGTAA AAGCCAGGGAGCGCGTGGGGCAGAACATCAATCCATAACATGAGGAATCTTCTGCCAAGG TTCCTATAATAAAACCCCCTGTGGTTTTATTTTCTCACATGTAAAGCCACTCCTCTCTTC ACTGCTCATTTCCACAACTTGAGTCCAAACCCTTTATATTTATTTTTTTCTCATTATAAT AATATTAAACAAAATCCTCA
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>LITCHI019609.m1 GenomeSequence + ATCAATCCATAACATGAGGAATCTTCTGCCAAGGTTCCTATAATAAAACCCCCTGTGGTT TTATTTTCTCACATGTAAAGCCACTCCTCTCTTCACTGCTCATTTCCACAACTTGAGTCC AAACCCTTTATATTTATTTTTTTCTCATTATAATAATATTAAACAAAATCCTCAATGGAG TCTCCGTGTTCCTGGCCGGAAAACTCAACCTCCGATCGAGCCAAAGCCGTCGAGGAGCTC GTCCAAGGTCGTGACTGCGCTCTCCGGCTCCGCTGTCTCCTTAACAAACCATCATCATCA TCATCGGAGAACAACAACAATGATGTTGATGGGGGTGTCCAGAACCAGGATCTTGTGTTG AAGATACTCTCTTCATTCACCAACACACTCTCCATATTGACAAATGACGGTCGTGATCAT CATCGATATTATCAGTCCGATGAGGTCTCTCAGATTCAGACAAATGCTACACACTTCAGC TGGGAAGCAGCTCGCAAATCTGAAGATTCAGGAGAGAGTTGCAAGAGCACTTCAATTGTT AAAGATCGGAGAGGCTGCTATAAAAGAAGGTAATATTAATCATACAATTTTGCTACCTTA TTATTGATCTGGATAACATTACTCTAACTAATTTTTTTGATAATAATTTTTGGATTGATT GTAAAGATAGTTATTAAAATTTTTTTATAATCAATTATAAAGATAGTTATTAAAAATTTT TATAATCAATTTATGTATAATTATTGAGGACTCTCGTTTAATAACTTTATCTAAATTAGT AAAATAGCCAAACCTTAATCATACATATACTAATATTAATGATGATGATAATCTTATTAT AACAACCATCTTGTTGTTATGTGTTGTTATGTGATGTGGACTTGTTTTCTATGGATTTTT ATATAAGCAATTCGTTTTTTTATAAAAACGTTAACAAGTCTGAATCAGACAGTCTGTACC TGATAAAAAATCAATAAAAAAAATGTTATGGGTATGATAAACAGTTTTTTAAGGGTAATT TAGTAAGTTTGGAGGAAAACGGATGTTTTTTGATGTTTTACTATAGTAATTTCGTGTGTT TCCATTGGCTAGTAAGGATATTTAAACTATTTAGTTACAATTATGTCCCTTTATAAAAAT AGATCTAATTTATTATTTGTTCTTTGATGTATGCTTTAAGGACTGCTTTACTTTTGTTTA CTCGTTCAAGTTCTTACTGGAATTTGAGTTTTTCAGTGGAAATCTAAACATATATATGCA ATTTATGGATTGCAGAAAGTGTTCAGATTCATGGATCAACGACAGTCCTAACCTGGTAGA TGATGGCTATGCATGGAGAAAATATGGACAAAAAGTGATCCTCAATGCCAAGTACCCCAG GTAAATACAATACTACCAACTCACCAATGCATGAGAGCTAGCTCAAAAACATGTTACAAT TCATCTCTAATTTTTTCCTGTTTTCAAAAAATCGTTCAATTAATTGCTCTATATTTCATA TCTCAGATGGGAATTCTGTAAATTTTTTTTGTAAGGACAAGAAAGAATTTGATGTCGAAT TTCTTTGTATATATTTATGTTTCTTTTGAAAATGTAGACGGACTAGATCTCATTTGATCT GAATATGTTTTTCATGCCACCTAAGAGTTATGTTAAGAAGATGGAAAACCCTAATGGGTC CAGTTTTTGTTGTGTATAACGCAGGAACTACTTCAGGTGCACACACAAGCATGACCAGGG GTGTATGGCAACCAAGCAAGTGCAGAGAATTGAAGAAGATCCTCCGCTATACAGGACAAC ATATTCTGGTCGTCACACTTGCAAGAATTTGCTAAAAGCTTCTCAGCTTTTCATGGATTC CAGCAGGGATCACAACAACTCTCCAATGATCAGCTTCTGCGACAAAGAAACCGACATCAA CAACAGCAGCAACCCATTTCTCTCATCGTTCCCATTTATAAAACAGGAGTACAAGGATGA TCAGGAAATCATGCCAAATCATGATGATGATCACCATCATCATCATGATCTTATGACCCA CAACTACCAATCTGAATCGTCTGATCATTATCTACTCTCGCCTGATCATGATCACCAACT GACCACATATGACTCCGGGGTTGTTAACTCATCATCCTTGTCGTGTACGGACATGGGGGT GCTGGTTGTGGATTCTGTTGTCAACTTTGACGATGATGATGACTTATTGCATCAGGTTGA ATTCTAGATGGGCTGGATTTATAATTTTCTATTGTGTAGAAAGAATATGCTTTTCTGTTA GTTTCCTAGGAAACTGCTCTTGACTGTAGTATCTTTCCCTTACTGGTACTGTATGTTAAT TTGGATCAACGTTTCATTTTGTGTATATGCATTTACTGCTCACCATTCTCATCAATCTTA TCATATAAATCTATACCAAACTGATACGTCATGCTTTTTTGACCCTGGATTGAATGAAAT CTATAAAGTTATGTTCTGCT