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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI011639 | Chr8 | 24775847 | 24780830 | - | Calcium-dependent protein kinase 4 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI011639.m1 | 30 | 286 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 259.6 | 3.20E-77 |
LITCHI011639.m1 | 30 | 279 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 92.9 | 2.10E-26 |
LITCHI011639.m1 | 104 | 174 | PF06293.17 | Kdo | Family | 22.3 | 7.60E-05 |
LITCHI011639.m1 | 316 | 360 | PF13833.9 | EF-hand_8 | Domain | 20.9 | 0.00025 |
LITCHI011639.m1 | 334 | 360 | PF00036.35 | EF-hand_1 | Domain | 32.4 | 3.80E-08 |
LITCHI011639.m1 | 334 | 360 | PF13405.9 | EF-hand_6 | Domain | 29.9 | 2.90E-07 |
LITCHI011639.m1 | 334 | 394 | PF13499.9 | EF-hand_7 | Domain | 39.8 | 5.20E-10 |
LITCHI011639.m1 | 334 | 356 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 26 | 4.60E-06 |
LITCHI011639.m1 | 346 | 396 | PF13833.9 | EF-hand_8 | Domain | 34.5 | 1.40E-08 |
LITCHI011639.m1 | 404 | 465 | PF13499.9 | EF-hand_7 | Domain | 49.4 | 5.20E-13 |
LITCHI011639.m1 | 406 | 433 | PF13405.9 | EF-hand_6 | Domain | 31.2 | 1.10E-07 |
LITCHI011639.m1 | 407 | 432 | PF00036.35 | EF-hand_1 | Domain | 29.4 | 3.60E-07 |
LITCHI011639.m1 | 407 | 428 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 24 | 1.90E-05 |
LITCHI011639.m1 | 418 | 465 | PF13833.9 | EF-hand_8 | Domain | 28.8 | 8.30E-07 |
LITCHI011639.m1 | 440 | 466 | PF00036.35 | EF-hand_1 | Domain | 28.6 | 6.60E-07 |
LITCHI011639.m1 | 445 | 464 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 14.7 | 0.017 |
LITCHI011639.m2 | 30 | 286 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 260.9 | 1.30E-77 |
LITCHI011639.m2 | 30 | 279 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 94.2 | 8.60E-27 |
LITCHI011639.m2 | 104 | 174 | PF06293.17 | Kdo | Family | 23.1 | 4.30E-05 |
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>LITCHI011639.m1 ATGAGTAAAATGAAGAGACCAGAATCGACGAAGCTAGCAAACACTGTTCTTCCGTACCAG ACGCCGAGACTGAGGGACCATTATCTTCTGGGGAAGAAGCTGGGACAAGGGCAGTTCGGG ACGACGTATCTGTGCATACACAAGACAACGAACGCGCATTTTGCATGCAAGTCGATCCCG AAGAGGAAGCTGTTGTGCAAGGAGGATTATGATGACGTTTGGAGGGAGATACAGATCATG CACCACCTCTCGGAGCACCAGAACGTGGTGCAGATCAAAGGGACGTACGAGGACTCGGTG TTCGTGCACCTGGTCATGGAGCTATGCGCTGGTGGGGAGCTCTTTGACAGGATTGTTGCG AAGGGACATTATAGCGAGAGGCAGGCTGCAAAGTTGATAAAGACCATTGTTGGGGTGGTG GAGGCTTGTCACTCTCTTGGGGTCATGCATAGAGATCTCAAGCCTGAGAATTTCTTGTTT GATAGTCCTGGTGATGATGCTAAGCTCAAAGCTACAGACTTTGGCTTGTCTGTCTTCTAC AAGCCAGGACAACCTTTCTGCGACGTAGTTGGAAGCCCCTATTATGTTGCCCCTGAGGTT TTGCTTAAGCATTATGGACCTGAAGTAGATGTATGGAGCGCTGGCGTCATTCTTTACATC TTACTAAGCGGGGTTCCACCTTTTTGGGCGGAAACTGAATCAGGAATCTTCAGACAAATT TTAAAAGGCAAACTAGATTTTGAATCTGAGCCCTGGCCTAGCATATCAGAAAGTGCCAAA GATTTGATAAGAAAGATGCTTGAAAGGGACCCGAAGCAAAGAATTACTGCTCATGAAGCG TTATGTCACCCCTGGATTGTGGATGACACAGTTGCCCCAGACAAACCTTTGGATTCTGCC GTACTGTCGCGCTTGAAGCACTTTTCAGCAATGAATAAACTCAAAAAGATGGCTCTGCGT GTCATAGCTGAAAGACTTTCTGAGGAAGAAATTGGTGGTTTGAAAGAGTTGTTCAAAATG ATAGACACAGACAACAGTGGGACAATAACATTCGAGGAACTTAAAGCAGGTTTGAAAAGA GTGGGATCTCAACTGATGGAATCTGAAATTAAGTCTCTAATGGATGCGGCTGACATTGAT AACAATGGAACGATAGAGTATGGTGAATTTCTCGCTGCTACCTTGCACTTGAATAAGATT GAGAGAGAAGAGCATTTGATCGCAGCCTTCTCATATTTTGACAAAGACGGTAGTGGTTAC ATCACCATTGATGAGCTTCAACAGGCTTGCAAAGAGTTCGGTCTAGGTGAAGTTCCTCTA GATGAGATTGTCAAAGAAATCGATCAAGACAATGATGGAAGGATAGATTACGGGGAGTTT GCCGCAATGATGAAAGCAGCTGATGGAGGAGTTGGGAGGAGCAGGACAATGAGAAGCAAT TTGAACTTTAATTTAGCAGATGCTCTTGGAGTACAAGATTCATCACCTTGA >LITCHI011639.m2 ATGAGTAAAATGAAGAGACCAGAATCGACGAAGCTAGCAAACACTGTTCTTCCGTACCAG ACGCCGAGACTGAGGGACCATTATCTTCTGGGGAAGAAGCTGGGACAAGGGCAGTTCGGG ACGACGTATCTGTGCATACACAAGACAACGAACGCGCATTTTGCATGCAAGTCGATCCCG AAGAGGAAGCTGTTGTGCAAGGAGGATTATGATGACGTTTGGAGGGAGATACAGATCATG CACCACCTCTCGGAGCACCAGAACGTGGTGCAGATCAAAGGGACGTACGAGGACTCGGTG TTCGTGCACCTGGTCATGGAGCTATGCGCTGGTGGGGAGCTCTTTGACAGGATTGTTGCG AAGGGACATTATAGCGAGAGGCAGGCTGCAAAGTTGATAAAGACCATTGTTGGGGTGGTG GAGGCTTGTCACTCTCTTGGGGTCATGCATAGAGATCTCAAGCCTGAGAATTTCTTGTTT GATAGTCCTGGTGATGATGCTAAGCTCAAAGCTACAGACTTTGGCTTGTCTGTCTTCTAC AAGCCAGGACAACCTTTCTGCGACGTAGTTGGAAGCCCCTATTATGTTGCCCCTGAGGTT TTGCTTAAGCATTATGGACCTGAAGTAGATGTATGGAGCGCTGGCGTCATTCTTTACATC TTACTAAGCGGGGTTCCACCTTTTTGGGCGGAAACTGAATCAGGAATCTTCAGACAAATT TTAAAAGGCAAACTAGATTTTGAATCTGAGCCCTGGCCTAGCATATCAGAAAGTGCCAAA GATTTGATAAGAAAGATGCTTGAAAGGGACCCGAAGCAAAGAATTACTGCTCATGAAGCG TTATGTCACCCCTGGATTGTGGATGACACAGTTGCCCCAGACAAACCTTTGGATTCTGCC GTACTGTCGCGCTTGAAGCACTTTTCAGCAATGAATAAACTCAAAAAGATGGCTCTGCGT GTATGTTTTATCAACCTTTTCCTGTTTCCTTCCTGCTTAAAGGTTTTTGTGATTATAGAA AAATTTTGCTATAGTAATCTGGTAGTTGTCGACCTGTTGATAAAAATGTCAATTGCATAG
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GCAGTTTATTCTATATATCTTTGAACCTGTGAATTATGCATTGATTTCTGACATCTGAGA AAACTGTGCAGGTCATAGCTGAAAGACTTTCTGAGGAAGAAATTGGTGGTTTGAAAGAGT TGTTCAAAATGATAGACACAGACAACAGTGGGACAATAACATTCGAGGAACTTAAAGCAG GTTTGAAAAGAGTGGGATCTCAACTGATGGAATCTGAAATTAAGTCTCTAATGGATGCGG CTGACATTGATAACAATGGAACGATAGAGTATGGTGAATTTCTCGCTGCTACCTTGCACT TGAATAAGATTGAGAGAGAAGAGCATTTGATCGCAGCCTTCTCATATTTTGACAAAGACG GTAGTGGTTACATCACCATTGATGAGCTTCAACAGGCTTGCAAAGAGTTCGGTCTAGGTG AAGTTCCTCTAGATGAGATTGTCAAAGAAATCGATCAAGACAATGATGGAAGGATAGATT ACGGGGAGTTTGCCGCAATGATGAAAGCAGCTGATGGAGGAGTTGGGAGGAGCAGGACAA TGAGAAGCAATTTGAACTTTAATTTAGCAGATGCTCTTGGAGTACAAGATTCATCACCTT GAGTCACACTGACTAAAAAGCAATGTTTTGTATAGTTAAGAACCAATGCTCTGTTACAAA AACTGAAAATGTGGAAAAAGGAAAAACAAAAATTGCAAACAAGTCAAACTTGATGACATT AATTTTTCGCTTGGAAGGATCTACTGTGCTTTCGTTATAGGTTTGATGACAGAGGTTCCT TTCATTGAAATTCTTCTCTCCTTGTTGGGAGCTAACATTCGCATCAAGTTTTATCACTTC TTCACAGGGGGGTTAAAACAAAATTAGAGAAATTTGATGTGATAAATTGTTAGGGTGGAT TTTTAACATCATGAATTATGTAGCCATGAATCATGACGAGGCCATTGAATTGTTTGTCAT 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