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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI011609Chr82446825924469750+Scarecrow-like protein 21

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI011609.m178456PF03514.17GRASFamily315.55.00E-94
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>LITCHI011609.m1
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TGTAGGCCAAAGAGGAAGAGATGGGCAAGTACTTTGATTAACCCTAATTTGAACCATGCA
TGTCATGAAGGTTTTGAAGGGAAGATTTTTAGGCTTCTTCAAATGAGAGATCAAATGTTG
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CTCACCGAGCTCTACCAAACAGTGTCCCTTACCGGTGACTCTGTCCAGAGAGTTGTGGCC
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TCTCCTTACTTCCAATTCGCTCATTTCACTGCCAACCAAGTCATCATCGAGACTTTCGAA
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ATCTCACTTGGGTGGCAAGATAGGTGTTTGCTTAGTGTCTCTGCATGGCTTTGTGTATGA
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>LITCHI011609.m1
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>LITCHI012741.m1
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GACCAGGATGCAAGGTTCAAAGCCTTTGAAATACTATCACATGACAGCCAAACCCAAGTC
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GATTCCTTAGTTTCTTTTCAAATAACTGATGAGACTCGAGAACCTTCTTCATCAAGCATC
AAGCATGCTTATTGA
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>LITCHI012741.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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GAAACGCCAAAATATTTTCTAAGTTCCCTAGTTCGCAGATCGCTCTTACAATGGAGGGCT
TAATCTATGACGAAACGATCTGCGAGCAAGCATCCTACAAACTTAATTTAACAGTTAGCA
TGCATAACAGGCCACAAACAACAGAACAGCTCGCAAACAAGCATGTAACAAGATCAAATC
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TTTGGACTCATTAAATGAGTTGGTAAAAGTCCAGCTTAGGCCCAGTAAGAGGCCCAATAA
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GGCCACCATAAACGCCAGTTCGCCTAGAAACGTAATTAATGCGATATCTTCCAGAAAAGG
CAGTTACCTAATCAAATAATGATTCTCTCTCCAGATATGGAAGTTAATTCAAATTCAAAT
TCAAATCAACCTTATCTCGGATCTTAAGGAGCAGTTTCCTGATTTTATTCAAACAAATTA
GGAAGTGTAATTAATTCATGATTCTCTTCCTATTTCGTTATTTCCTGAATTGTAACGGTA
CTTCCCCTATAAATAGGGGTTAAAAACCATTGTAAAGAGAAGATTGAATATTACACTGTC
ACTCTGTAGAATTTAAGAGAGACAGCCGTGGACGTAAGCACACTTGCTGAACCACGTTAA
AAATCTTGTGCATTCCCTGTTTGATTCCTAGTTCTTTATTGCCTTGTTCTTGTTTTCTGT
GTTTTCTCACATTGATTGCAGGTATTGGGTATTGATTACTTGTCGACTGAAAATCAACGT
CGACAAAAGGTAAGACCGATATATATTAAGTACTTTCTTGTTTGTCAGCAATTGTTGATT
TCTTGAAGTTGTGATTATCTTGGAAGAGTCAGGTATGTTTGCTCTTCTTGACATTAACAT
GTTTGGTTAAATTTTCTTTTCTTTGTTTTGGTATAGAACTTCCTGCATTAGATCTTCAAA
CTGGTTATTTCACCCTTAGACAAATTAAGGCTGCTACCAATAATTTTGACCCTGCAAACA
AGATTGGAGAATGAGGGTTTGGGCCTGTTTATAAGGTAATTATGGTTTTCTAGTCTATGC
ACACATTGGAAAACAGTGGCTAATGGGAAAAAGAATATTCTCTTTACTGTATTCTGAAAT
GCTTATCTGCTTGACTCCAG
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>LITCHI010169.m1 GenomeSequence - 
ATGCAGGGAACGAGTCGAATGGAAGCTCCAGTCTACAACAACTATTCAACAGGTGGTGAG
AGTAGCAGGATAACAACAGGTATTCCTCTATCGCACCCGAACAATCCTCAGGTGATGTTC
GCTTCACGTCCGCATTTGAATCCAAATGCGAACATGAGGCCGACATCGTCATCGCATTAT
TGGTCTCTGCCTCCGTCTTCTGTTTTCGATGCGTTGCCACCCTGGACACCAATGAGTATG
TTGACTATTAATGATAATACTAATAATTACCATTATTATCATCATGAGACACCGTCACCT
TTTGTCGTTGTCAACCAGAGCTTGACAAACAATGTTGTGTCGTCTAGTGTCGAAGGAGGA
GCTGGTAGTTATGTCGCTAACCAGAGCTTGACTAACAATGTCGTGTCGAGTACCGTGGAA
GGAACAGCTGGTAATTATTCACATGGATTATTATCGGCTACTCCTCCTCCTCCTCCTCCT
CCAGTTGTTGTTGGTGGTGGTGGTTGTGAGAATTTGCCGCCAAGAAAAGGACATAGACGG
TGTTTTAGTGACAGTCCGTTGGGATATTCGATGCTTGCGTCATCGCCTCAGCTGGTGCCT
ATAGGGATGAGTAGTAGAGGGGAGAGTAGTTCGGTGAGTCAGAGCGTGAACGTGGAAGGC
TTGTTTATGGGAGAGGGGATGTCGGAAGATGAGATAGTGGAGGATTTGATGAGTGAATAC
ATGAATATGGAGTATGTTGACGTGTTTGATTGTGGTAGTGTTTCGAAGGTGAATGGAGGA
GGGGAGAGCAGTGATAATGAGGTGGAGAGTGGTGGGATTTTGAATGGGGGTGGTTCGAGT
GAGAGGAGGGAGGGAGTTAATAAGAGGAGTGCCGATGGGGATATCGGTCTGACTGCTGGT
GGCCATTACAGGAGCGTGTCCGTCGATAGTTATTTGGAGTTTTTGGATTTTGATTTTGAC
GATGATGGTGTAGCAAAGGTTCCTGTGCAAGCAGGAGGTCAGGTCGTTGAGCAAGTTTCG
CCTGGCGGTGTGGTTGGTGAGAGATTAGCTATGTTGAGAATGAAGTTGAATAGGGAACTA
TCTGAAGATGAACTGAGAAAGATTGCGGCAAATGATAAGCTCACTCAGATTGCGTTTGTG
GATCCCAGGCGTGCCAAAAGGTGGTGTTGTGCATTTGACTTTTGCATGAGATGATCATGT
TTGTGAATGGAGTTACATTAGGTTTGTTTTTCTCATTGTTTGATGTGTTTGTTTGTAGGA
TTCTGGCTAATCGTCAATCAGCTGCACGTTCCAAGGAGCGGAAGGTACGATACATTGCAG
AGTTGGAGCAAAAGGTGAAGACTTTAATGGCAGAGACGAACACATTAAATACTAAGTATG
CAACGTTACAGGTGGACATCTACAGCTTTGATAATTTTCATAGTTATCATCTTAGTGCTA
TGTTTCGTTTAGTTTTGTTAACAGTTAACTTCTTGGTTCTGTTAACCTCTTGTTTGTTTA
CAGAAAGATTCAGAGGAAGTTATAAAAATAAACAAGGAAATGAAATTCCGTCTTGAGGCC
ATGGACCAAGAGGTTAAACTCAAAGATGGTATTAAGTTTTTTCCTTTTTAATTGCCCTCA
TTTTATACATTACTATATTCAAACTGTTCTTATTGCGATATTTGCGGAACACTTAATTTG
TGTGACATATCATAATAGTAGGAATTTCCGTTCTCAGTTTGTTTTGCTGCGTTTGTTTAG
AAAGTTCTTTTAGGGTTTAAGGATAACCCAAAATTCCCTTTTTGATAAATTTTGAGATTT
GCTTGTTTTGATTGATTTAGAAGTCTTAGTCTTAGTTGGATTAGGTTTTTTTTCCTCCCT
ATGTAAGCGAATATTTGAAACATAATTGTTAGTTTTCAAAATATTAATATTGTTTATCAC
TCTTGTCATGAATGTAATTCTCCCCTTAACAGAATTTTTGTGGATGCAATTGTTAGATCT
ACTTGAGGAGCTATTAGTCCCTAGTCCAAAATGATAGTAACCATCCAGCTTGACTCTAGC
TATACTTTTTACTTGTATGGTTTATTTAGACTTGAAATTTTGTCTACACCCAAGCCAATT
CTACAAACGTAGTAGCTTCTGTCGACTTAGCTGCATTTTGCTTGAGATTTATCTCCACGG
TGTTTTTGTGCTTGTCTCAACTAGTTTTGAATGTACATGTCCAAGTTCTATAACATCATT
TCGGTAAATGTATGTTGCTTTACTGCTATAATTATCTGCTCCTATTCTCAACATTGGTGA
ATAATTTTTTGTATCATCATGTAATTATAGATGGAATGTCTATTAATTATCCCAGTATGT
TCTATTTATAACGCGCATAAACAACACATGATTTTCTTGGTTTAACTCGAGTGATTGACG
ATTGTCTATATATTAAGCTGATGATTATAATGTGCATTTGTTCATCATGTAGAGACTAGT
CCTTACTCCTGAAATGGTTTACTTGTTTCTGATTTAAAACATAAGCATTAGTGCTTAATG
CAGTTGTGATATTGTTTAATTTTCTTGGTTTAACTTCAGTAGTTGGTACATGCATGAAGT
TCCTGAAAGTTCTTGCTATTGAGTAGAAATGAATCTTGTTGAATTTTACATGCTTTGCTT
TTCCTGTTATGATTAATTTAAAATATTCCAGTATAGGAGAGTGTATTTTTTATTAGCCCT
GGCAACTACCTGTATATGCACTAGTTTAGCTCATTACTACTCTAGCAGTTCGATCATCGA
GGGCATCATGTGTGCTAGTTTCCTCTTGCTAGTGCGATTTTCACATCTAAATGCTGCTTA
GTGTGGCTTGTCTAATTACATTTTCGTTTTCATAATTTATCACACCATCTTAGAATCATG
CTTATTACGTTGTTTGTCTTTGGCATAAAACATTCATTCTCTTTACTTTTTTTATTTGAT
AGCTTTAAACGAATCATTAAATGCGGAACTCGAAAGAATGAAGCTCGAGATGAACGGAAT
GGCCCAGTTCTCAAGGTTGCTGGCTCAGCAACTTTCCCTCAATAATCAGATTCTCCAAAA
TCAGCATCTGCATTTGGTCTTACCCAACATCTACCAGTTGCAACAGCAGCAACAGGACCT
TCTGCCTAACCAGTTTCAACAGCTGCCTCAACCTAACCTGTTCCAACTGCAGCAACAGAA
TCCTGAGTCTTACCAGTTGCAACTTCAGCAGCAGACTCAGCCTAACCAGTTGCAACCTGA
GCTGCAGAATGGTGAGGCTGCTATAGCTGAGTGAAGTAGTAGACTTCCAAATTGGCTGTG
AAATTCTGTTTGATTCATTGCCTGCAACAATCTAATCATAAGTATCATTTATATCTTATT
GAACATCAGTTGACCATTGTTATGTTCGTGGGTTGGTTTTTCTTGTCCAGACTACAGACT
TGAAGCTAGACTCTACCCTGTTCATTCATTTGTCAGCAACAATGTTCTAGTTTTACATTT
TTTTGGACAAGATTGATCTTTCAGTTTCGATAAATAAATATTAAAAATGTTGGTA