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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI011582 | Chr8 | 24087259 | 24094330 | + | Somatic embryogenesis receptor kinase 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI011582.m1 | 26 | 65 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 41.9 | 9.80E-11 |
LITCHI011582.m1 | 302 | 573 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 151.7 | 2.60E-44 |
LITCHI011582.m1 | 304 | 575 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 148.7 | 1.90E-43 |
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>LITCHI011582.m1 ATGGAGATAAAGGTCTTGGCTTTGTGTCTGGTTTGGCTGATCTTGCTGCTCCACTCATTA TGGCCTGTCTCTTCTAACACGGAAGGTGATGCATTGCATAGTCTACGGACCAGCTTAACT GATCCTAACAATGTCCTGCAGAGTTGGGATCCTACCCTGGTCAATCCCTGCACATGGTTT CATGTCACATGCAATAATGATAATAGTGTAATAAGAGTTGATCTTGGAAATGCAGCTTTG TCTGGTCAATTAGTTCCACAGCTTGGCTTGCTCAAGAATTTGCAATACCTGGAGCTTTAT AGTAACAACATAAGTGGACCAATTCCTAGTGATCTTGGGAATTTAACTAGCTTGGTGAGC TTGGATCTGTACTTGAATAGTTTCTCTGGTCCTATCCCAGACACATTGGGAAAGCTAGCA AAATTGCGATTCCTCCGGCTCAACAACAACACTTTGACAGGTCCCATTCCTATGTCATTG ACCAATATCTCTGCACTTCAAGTATTGGATCTATCAAACAATCAGCTTTCTGGAGTGGTC CCAGACAATGGCTCATTCTCATTATTTACGCCCATCAGTTTTGCTAACAACTTAAATCTA TGTGGCCCGGTTACTGGACGGCCCTGCCCAGGATCTCCTCCATTTTCTCCTCCCCCTCCA TTTGTTCCACCTCCCCCAATTTCTTCACAGAGTGGGAATAGTGCTACCGGAGCAATTGCT GGAGGTGTGGCTGCTGGGGCTGCCTTACTGTTTGCTGCCCCTGCAATAGCATTTGCGTGG TGGCGTCGGAGAAAACCTCAGGAATTTTTCTTTGATGTACCTGCGGAGGAGGATCCAGAA GTTCATCTGGGGCAACTAAAAAGGTTTTCACTGCGAGAACTACAAGTTGCAACAGATAGT TTTAGCAATAAAAACATTTTGGGTAGAGGTGGATTTGGTAAGGTTTACAAAGGACGCCTG GCAGATGGTTCACTTGTAGCTGTTAAAAGATTGAAAGAAGAGCGTACCCCTGGTGGGGAG CTGCAGTTTCAAACGGAAGTAGAGATGATCAGTATGGCTGTTCATCGCAATCTCCTTCGC TTACGTGGATTCTGCATGACACCTACTGAGCGATTGCTTGTTTATCCCTACATGGCAAAT GGAAGTGTTGCATCATGTTTAAGAGAGCGGCCTCCATCACAACCTCCTCTTGATTGGCCA ACACGGAAGCAGATCGCCTTGGGATCTGCTAGAGGTCTTTCATATTTGCACGATCATTGT GATCCAAAGATTATCCACCGTGATGTGAAAGCTGCAAACATTTTGCTGGATGAGGACTTT GAGGCTGTTGTTGGGGACTTTGGGCTGGCCAAACTCATGGACTACAAGGATACTCATGTC ACTACTGCCGTCCGTGGTACCATCGGGCATATAGCTCCAGAGTACCTCTCTACTGGGAAG TCATCAGAGAAAACTGATGTTTTTGGATATGGGATTATGCTTCTAGAGCTCATCACTGGA CAGCGGGCATTTGATCTTGCTCGTCTTGCAAATGATGATGATGTCATGTTGCTTGATTGG GTGAAAGGACTTTTAAAGGAGAAAAAACTAGAAATGCTGGTTGACCCTGATCTTCAGAAA AACTACGTGGAAGCTGAAGTGGAGCAATTGATCCAAGTTGCCCTGCTTTGCACACAGGGA TCCCCGATGGATCGACCTAAGATGTCAGAGGTGGTGAGAATGCTTGAAGGCGATGGCTTG GCCGAGAGATGGGACGAGTGGCAAAAGGTGGAAGTCCTCCGCCAGGAGGTGGAGCTAGCC CCACACACTAATTCCGATTGGATAGTTGACTCGACAGAGAATCTGCATGCAGTTGAGTTA TCCGGTCCAAGGTGA
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>LITCHI011582.m1 MEIKVLALCLVWLILLLHSLWPVSSNTEGDALHSLRTSLTDPNNVLQSWDPTLVNPCTWF HVTCNNDNSVIRVDLGNAALSGQLVPQLGLLKNLQYLELYSNNISGPIPSDLGNLTSLVS LDLYLNSFSGPIPDTLGKLAKLRFLRLNNNTLTGPIPMSLTNISALQVLDLSNNQLSGVV PDNGSFSLFTPISFANNLNLCGPVTGRPCPGSPPFSPPPPFVPPPPISSQSGNSATGAIA GGVAAGAALLFAAPAIAFAWWRRRKPQEFFFDVPAEEDPEVHLGQLKRFSLRELQVATDS FSNKNILGRGGFGKVYKGRLADGSLVAVKRLKEERTPGGELQFQTEVEMISMAVHRNLLR LRGFCMTPTERLLVYPYMANGSVASCLRERPPSQPPLDWPTRKQIALGSARGLSYLHDHC DPKIIHRDVKAANILLDEDFEAVVGDFGLAKLMDYKDTHVTTAVRGTIGHIAPEYLSTGK SSEKTDVFGYGIMLLELITGQRAFDLARLANDDDVMLLDWVKGLLKEKKLEMLVDPDLQK NYVEAEVEQLIQVALLCTQGSPMDRPKMSEVVRMLEGDGLAERWDEWQKVEVLRQEVELA PHTNSDWIVDSTENLHAVELSGPR.
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>LITCHI011582.m1 CCCAACTCCAAAACTCTCGTCTCTTCTCGTCTCAGCACGCTTCACTCTAAAATTACCAAA AATATTTTAAATTTTAAATAAAAAAAAGTAAAAAATAAAAAAATAAGCAGACAGATAACA ATTAACAACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCACTTACACAGAGAGAC ACTCACTCCCTTCTTGTTAGAAAGCAGAGGTTGGAAAAAAGGGAAATTTTATTTGGTGTT GCCCAGAAAGGAGAGTCAGTCAGTTGGAGGGTGGGGAAAAGAGAAAGGAGTGATTTTTGG TGTGTTTTGGAGGTGGGTATTGCATGAATGAGACCAAGATTTGATATGTGAAGGTGGGTG ATTTCCTTTTGGGCTGTTGTGGGGAGCTTAGCTTAGTGTAGTAGGTTTTGAAAAGGTTGG GGTTTTTTTTTTTTGTTTTGGAGTTGGTTTCGTGGGGGGGTGGTGTTAGTGACATGGTTT GTTTATTGTTTGGATCTGAGGGTAGTAGCTAAGTAGAGTTACAAATGGAGATAAAGGTCT TGGCTTTGTGTCTGGTTTGGCTGATCTTGCTGCTCCACTCATTATGGCCTGTCTCTTCTA ACACGGAAGGTGATGCATTGCATAGTCTACGGACCAGCTTAACTGATCCTAACAATGTCC TGCAGAGTTGGGATCCTACCCTGGTCAATCCCTGCACATGGTTTCATGTCACATGCAATA ATGATAATAGTGTAATAAGAGTTGATCTTGGAAATGCAGCTTTGTCTGGTCAATTAGTTC CACAGCTTGGCTTGCTCAAGAATTTGCAATACCTGGAGCTTTATAGTAACAACATAAGTG GACCAATTCCTAGTGATCTTGGGAATTTAACTAGCTTGGTGAGCTTGGATCTGTACTTGA ATAGTTTCTCTGGTCCTATCCCAGACACATTGGGAAAGCTAGCAAAATTGCGATTCCTCC GGCTCAACAACAACACTTTGACAGGTCCCATTCCTATGTCATTGACCAATATCTCTGCAC TTCAAGTATTGGATCTATCAAACAATCAGCTTTCTGGAGTGGTCCCAGACAATGGCTCAT TCTCATTATTTACGCCCATCAGTTTTGCTAACAACTTAAATCTATGTGGCCCGGTTACTG GACGGCCCTGCCCAGGATCTCCTCCATTTTCTCCTCCCCCTCCATTTGTTCCACCTCCCC CAATTTCTTCACAGAGTGGGAATAGTGCTACCGGAGCAATTGCTGGAGGTGTGGCTGCTG GGGCTGCCTTACTGTTTGCTGCCCCTGCAATAGCATTTGCGTGGTGGCGTCGGAGAAAAC CTCAGGAATTTTTCTTTGATGTACCTGCGGAGGAGGATCCAGAAGTTCATCTGGGGCAAC TAAAAAGGTTTTCACTGCGAGAACTACAAGTTGCAACAGATAGTTTTAGCAATAAAAACA TTTTGGGTAGAGGTGGATTTGGTAAGGTTTACAAAGGACGCCTGGCAGATGGTTCACTTG TAGCTGTTAAAAGATTGAAAGAAGAGCGTACCCCTGGTGGGGAGCTGCAGTTTCAAACGG AAGTAGAGATGATCAGTATGGCTGTTCATCGCAATCTCCTTCGCTTACGTGGATTCTGCA TGACACCTACTGAGCGATTGCTTGTTTATCCCTACATGGCAAATGGAAGTGTTGCATCAT GTTTAAGAGAGCGGCCTCCATCACAACCTCCTCTTGATTGGCCAACACGGAAGCAGATCG CCTTGGGATCTGCTAGAGGTCTTTCATATTTGCACGATCATTGTGATCCAAAGATTATCC ACCGTGATGTGAAAGCTGCAAACATTTTGCTGGATGAGGACTTTGAGGCTGTTGTTGGGG ACTTTGGGCTGGCCAAACTCATGGACTACAAGGATACTCATGTCACTACTGCCGTCCGTG GTACCATCGGGCATATAGCTCCAGAGTACCTCTCTACTGGGAAGTCATCAGAGAAAACTG ATGTTTTTGGATATGGGATTATGCTTCTAGAGCTCATCACTGGACAGCGGGCATTTGATC TTGCTCGTCTTGCAAATGATGATGATGTCATGTTGCTTGATTGGGTGAAAGGACTTTTAA AGGAGAAAAAACTAGAAATGCTGGTTGACCCTGATCTTCAGAAAAACTACGTGGAAGCTG AAGTGGAGCAATTGATCCAAGTTGCCCTGCTTTGCACACAGGGATCCCCGATGGATCGAC CTAAGATGTCAGAGGTGGTGAGAATGCTTGAAGGCGATGGCTTGGCCGAGAGATGGGACG AGTGGCAAAAGGTGGAAGTCCTCCGCCAGGAGGTGGAGCTAGCCCCACACACTAATTCCG ATTGGATAGTTGACTCGACAGAGAATCTGCATGCAGTTGAGTTATCCGGTCCAAGGTGAC CCTGGCATAGCTACAAGTAAAGAGAAGAAATATTTACTACCTATTTTTTTTTATCATAAA ATTTCTTTTTCTTTTTTGTTAATTTAATGACCATATCCTGATATCTGTAAGCCCATTCTG CATTGTATTCATTACACCTGTGCATATGAGTAAAGCTTGGTTGAGGTGCAATTTGTATAA CCTGCAGACACTGCTGCAGTTTGACAGATCTTTGATGTTTCTAAATAGATGCAGCTGTGG CAGTTTAATCCACTCTAATTTTTATTTCATTGTATGATATAGGCCATGAAGATTGCTAAG TATCCATGCATGGAATTTTCCATAGCCATGGAGCACTATATTTTTTTTGGTGTTTCAATT CATTGTACATCCATGTTTGACTTTAAACCATTATTATTGTTATCATTATTATCATTACAA AATTTAACACTGCGGATCATTTGACAAGTGGGTTTTGGATGGTTAGATTACATCACACAT CCTATATTTCATATGCTTTGTTTCCAAGAACATTCTCATCACCCTCAAACCAATGTCAAG TCTCAACATTTCCACTTTA
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>LITCHI011582.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTTGGATAATTTTCTCAATATATTGTAATAGTAGATTTCGATTAGAGCTTATAAAGTGAG GACGATTAACATGTACACTTTCCAACCATCTTGTTGTCTCTATCTTTGATCATTGACATT TGATTATAAGATTGATTGAGGAGTTGAAAAAGACGTAAAAAAAGAAAAAAAAAATGTAAT AATGTTATGTTTCCTAAAAATTTTGTCAAAATCGATACCTAAATGATATGATTTGTGAGT TGTCAAAATCTTATAAATTATAAGAGAATTTGATAATTAATAGAATATTAACAACTCATA TGCTACATTATTTTGATATAGATTTAGATAAAATTTTTAGAAAATCTTGCATTACTCAAA AAAATGGGAAAAAAACTCGGTGACATATAGTTTGGGCAAATAATAAAAGAGTAATGTTAG ATTTTTCAAATATTTTGTTAAAATCAATGTCCAAACAATATGACATGTGAATTGTTAATA TTTTGTTAATTATAACATCATTTCATAATTTATAAGATTTTAAAAACTTATATACCACAT TATTTTGGTATGAATTTAGATAAAATTTTTGAAAAACTTAGCATTACTCAAAAAAAAAAA AAATTTGGTGACATACAATTTGGGCAAATAATAAAAGAATAATGTTAGACTTTCCAAATA TTTTGTCTAAATTTATACATAAATAAAATGACATATGAATTATCAAATTTTATTTATTAT TACATTATCTTATAATTTACAATATTTTGATAACTCAAATACTATATTATTTGAACAAAA TATTTGAGAAACTTAGATGGTGTTTGGATGCATTTTTTAAAATAGTTATTCATTTTTAAA AAAAACAAAAAATGAGATAAAGTTGCTTGATAAATTATTTTTGAAAATGAAAACACTTTT TTTCTTTTTCTAATGATAACTAAAAGTTGGAAAACAATTTTTTTTATGTTTTTCATCATT TTCATAACATATTTTTAAAATAAATCATTATTTTTTCTCTTTAAATAATTATTTTACTTA TTTTCAAAAGTAACACCAAGAATATTTATTTCATTTTTTATTTTTAAAAATAAATTTTAA GAAATCATTCCAAACATATTACATGTTCAAAAACACATTTTAAAAATGCTTTCAAATACA TTTATAGTATTTTCTACTTTTGAAAATAACTTTTAAAAAATCTTATCAAATACATTATAT TTTAAAAAACATTATTTTTAAAACACGTTTTTTATTTTTAAAAATGATTTTCAAAAACAC AATTTTAAAAAATATTCCAAACGTACCCTTAGCATTACACACACGATAAAAATGATTTGG ATTTCGGACCGAATCGACGTGGCAGTGATGTGGACCCCACAGGGGCGAAATTTTGACCAA AAAATCGTTGGGTCGTTCCGTCACGTCATTTTCCACGATATAGCGCGAAGGCGTTTTGAC TGCGTACGGGTAGCGGTCAGCTCCCCCTTCGGGCAGCCCAACTCCAAAACTCTCGTCTCT TCTCGTCTCAGCACGCTTCACTCTAAAATTACCAAAAATATTTTAAATTTTAAATAAAAA AAAGTAAAAAATAAAAAAATAAGCAGACAGATAACAATTAACAACCTCTCTCTCTCTCTC TCTCTCTCTCTCTCTGTCTCACTTACACAGAGAGACACTCACTCCCTTCTTGTTAGAAAG CAGAGGTTGGAAAAAAGGGAAATTTTATTTGGTGTTGCCCAGAAAGGAGAGTCAGTCAGT TGGAGGGTGGGGAAAAGAGAAAGGAGTGATTTTTGGTGTGTTTTGGAGGTGGGTATTGCA TGAATGAGACCAAGATTTGATATGTGAAGGTGGGTGATTTCCTTTTGGGCTGTTGTGGGG AGCTTAGCTTAGTGTAGTAGGTTTTGAAAAGGTTGGGGTTTTTTTTTTTTGTTTTGGAGT TGGTTTCGTGGGGGGGTGGTGTTAGTGACATGGTTTGTTTATTGTTTGGATCTGAGGGTA GTAGCTAAGTAGAGTTACAA
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>LITCHI011582.m1 GenomeSequence + CCCAACTCCAAAACTCTCGTCTCTTCTCGTCTCAGCACGCTTCACTCTAAAATTACCAAA AATATTTTAAATTTTAAATAAAAAAAAGTAAAAAATAAAAAAATAAGCAGACAGATAACA ATTAACAACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCACTTACACAGAGAGAC ACTCACTCCCTTCTTGTTAGAAAGCAGAGGTTGGAAAAAAGGGAAATTTTATTTGGTGTT GCCCAGAAAGGAGAGTCAGTCAGTTGGAGGGTGGGGAAAAGAGAAAGGAGTGATTTTTGG TGTGTTTTGGAGGTGGGTATTGCATGAATGAGACCAAGATTTGATATGTGAAGGTGGGTG ATTTCCTTTTGGGCTGTTGTGGGGAGCTTAGCTTAGTGTAGTAGGTTTTGAAAAGGTTGG GGTTTTTTTTTTTTGTTTTGGAGTTGGTTTCGTGGGGGGGTGGTGTTAGTGACATGGTTT GTTTATTGTTTGGATCTGAGGGTAGTAGCTAAGTAGAGTTACAAATGGAGATAAAGGTCT TGGCTTTGTGTCTGGTTTGGCTGATCTTGCTGCTCCACTCATTATGGCCTGTCTCTTCTA ACACGGAAGGTCAGTTTTCCTCTTCATCTTTGTATTGTCTATGTTCTCCTGCACCTCAAC TATATTTATTTTTTTATTTTTTATTTGGACATTTTGATCTTTGTTTCTACATTTTATGTT GGTTTATGCAAATGTGTAATTTTTATTTATTTATTTATTTTAAGTGAAAAGTAGGTGTGT TCTTTGATGATATTATTTTGGATTTTTAACCTTGTTTCCTTTCTTACTGCTTCATTTCTT TGTCTAATGGTGTTTAAGTTGATGAGTTGGGAGGTATCTTATAGCATGCTAGACTCGTAT 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