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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI011485 | Chr8 | 22363618;22365476 | 22368556 | + | Protein SET DOMAIN GROUP 41 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI011485.m1 | 69 | 143 | PF00856.31 | SET | Family | 30.7 | 3.80E-07 |
LITCHI011485.m2 | 69 | 146 | PF00856.31 | SET | Family | 30.1 | 6.00E-07 |
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>LITCHI011485.m1 ATGTCTTCCGGAGACGCCGACCTCTTATCCACCATCCGTGAGGGAGCCAGGGAGCTGGCG TCACTAAACCATCCCTCCTCTCTCTCCTCCAACGACCTGGCTTTGGAGGAGTCCTTGCTG TGTTTGGTGATGACCAATGCTGTGGAGGTCCAGGATCACACTACTGGCCGCTTGCTAGGG ATCGCCGTCTACGACTCCAACTTCTCGTGGATTAACCACAGTTGCTCTCCCAACGCTTGT TACCGCTTTCTCTTCTCTCACTCCAACACCACCACCAACTCAACCATGCGGATTCTTCCT GCCTCTTTCAATCCTCAAGGACACACTTATGTTCCTGCCACTAGCCCATTAATATCACAA GATGGTCCAATGATCGTTGTTAGGAGTATTAAGAAGATTAACAAAGGCGAGCCCGTCACT ATAGCTTACACTGACTTGTTACAACCTAAGGCAGTGAGACAGGCAGAGTTGTGGTCAAAG TATCGATTTGTTTGTGGCTGCGAGCGATGCACTGCATCACCCGCAACTTATGTAGATCGC ATTTTGGAGGAAATTTCTGCTTTTGATCTGGAGTTGAACTCAAGATTAGATTGTAACTTT GATAGGGATAAAGCAAATCAAAAGTTGAGTGATTACATGGATGAAGTCATAGCTGAGTAT CTGTCAGTTGGTGATCCTGAATCTTGTTGCAAGAAGATGGAGTGCTTCCTTAACCAAGGA CTCCTCTTTGAGCAATCAGAAACTGAGGGAAAAGTAGTGCTGAATTTGAGGTTGCACCCT CTGCACCATCTTGCTTTGAATGCCTATACGACGCTGGCTTCTGCATACAAAATCCGTTCA AGTGACTTATTAGCTCTCAATTCCGACGTTGATGCACATAAGTGTGAAGCATTTGCCTTG AGTAGAATCAGTGCAGCATACTCATTGCTGCTTGCTGGTGCTGCTGACCATCTGTTTCAA 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>LITCHI011485.m1 MSSGDADLLSTIREGARELASLNHPSSLSSNDLALEESLLCLVMTNAVEVQDHTTGRLLG IAVYDSNFSWINHSCSPNACYRFLFSHSNTTTNSTMRILPASFNPQGHTYVPATSPLISQ DGPMIVVRSIKKINKGEPVTIAYTDLLQPKAVRQAELWSKYRFVCGCERCTASPATYVDR ILEEISAFDLELNSRLDCNFDRDKANQKLSDYMDEVIAEYLSVGDPESCCKKMECFLNQG LLFEQSETEGKVVLNLRLHPLHHLALNAYTTLASAYKIRSSDLLALNSDVDAHKCEAFAL SRISAAYSLLLAGAADHLFQSESSLIASAANFWVSAGESLLTLARSSGWNFFVKPGLPVS NSSLEKHKCFKCSLMNKLEVNSPAQNTDFENRSCSFLDCITDLTRKVWPSLSYGCAHLQT YKDPIDFSWLWKSSNVWDLQPHSGSIDEVSYFGSKGSISRRKGLLHTEEVNVSIFQLGVH CLLYGGHLANISYGENSHLTCRIHNVLHSE. >LITCHI011485.m2 MSSGDADLLSTIREGARELASLNHPSSLSSNDLALEESLLCLVMTNAVEVQDHTTGRLLG IAVYDSNFSWINHSCSPNACYRFLFSHSNTTTNSTMRILPASFNPQFMQGHTYVPATSPL ISQDGPMIVVRSIKKINKGEPVTIAYTDLLQPKAVRQAELWSKYRFVCGCERCTASPATY VDRILEEISAFDLELNSRLDCNFDRDKANQKLSDYMDEVIAEYLSVGDPESCCKKMECFL NQGLLFEQSETEGKVVLNLRLHPLHHLALNAYTTLASAYKIRSSDLLALNSDVDAHKCEA FALSRISAAYSLLLAGAADHLFQSESSLIASAANFWVSAGESLLTLARSSGWNFFVKPGL PVSNSSLEKHKCFKCSLMNKLEVNSPAQNTDFENRSCSFLDCITDLTRKVWPSLSYGCAH LQTYKDPIDFSWLWKSSNVWDLQPHSGSIDEVSYFGSKGSISRRKGLLHTEEVNVSIFQL GVHCLLYGGHLANISYGENSHLTCRIHNVLHSE. >LITCHI011485.m3 MQGHTYVPATSPLISQDGPMIVVRSIKKINKGEPVTIAYTDLLQPKAVRQAELWSKYRFV CGCERCTASPATYVDRILEEISAFDLELNSRLDCNFDRDKANQKLSDYMDEVIAEYLSVG DPESCCKKMECFLNQGLLFEQSETEGKVVLNLRLHPLHHLALNAYTTLASAYKIRSSDLL ALNSDVDAHKCEAFALSRISAAYSLLLAGAADHLFQSESSLIASAANFWVSAGESLLTLA RSSGWNFFVKPGLPVSNSSLEKHKCFKCSLMNKLEVNSPAQNTDFENRSCSFLDCITDLT RKVWPSLSYGCAHLQTYKDPIDFSWLWKSSNVWDLQPHSGSIDEVSYFGSKGSISRRKGL LHTEEVNVSIFQLGVHCLLYGGHLANISYGENSHLTCRIHNVLHSE. >LITCHI011485.m4 MDEVIAEYLSVGDPESCCKKMECFLNQGLLFEQSETEGKVVLNLRLHPLHHLALNAYTTL ASAYKIRSSDLLALNSDVDAHKCEAFALSRISAAYSLLLAGAADHLFQSESSLIASAANF WVSAGESLLTLARSSGWNFFVKPGLPVSNSSLEKHKCFKCSLMNKLEVNSPAQNTDFENR SCSFLDCITDLTRKVWPSLSYGCAHLQTYKDPIDFSWLWKSSNVWDLQPHSGSIDEVSYF GSKGSISRRKGLLHTEEVNVSIFQLGVHCLLYGGHLANISYGENSHLTCRIHNVLHSE. >LITCHI011485.m5 MIYNLQFEDGPMIVVRSIKKINKGEPVTIAYTDLLQPKAVRQAELWSKYRFVCGCERCTA SPATYVDRILEEISAFDLELNSRLDCNFDRDKANQKLSDYMDEVIAEYLSVGDPESCCKK MECFLNQGLLFEQSETEGKVVLNLRLHPLHHLALNAYTTLASAYKIRSSDLLALNSDVDA HKCEAFALSRISAAYSLLLAGAADHLFQSESSLIASAANFWVSAGESLLTLARSSGWNFF VKPGLPVSNSSLEKHKCFKCSLMNKLEVNSPAQNTDFENRSCSFLDCITDLTRKVWPSLS YGCAHLQTYKDPIDFSWLWKSSNVWDLQPHSGSIDEVSYFGSKGSISRRKGLLHTEEVNV SIFQLGVHCLLYGGHLANISYGENSHLTCRIHNVLHSE.
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>LITCHI011485.m5 GTTTTCACAAGTGAGGATCCGAACACCTTACTTTTGAACATATGATCCGATCCGAACACC CACGGATCGGACCGGATCAGGGTGTTCGGATCGGTTCCGTGTTTTTGTGCCCACCCCTAG TTCCAATACATCTATTCTTTTTCCTGCTTCTTAATTAACAATTGACACATTTCAAATTGA TAGTTCATGCAGGGACACACTTATGTTCCTGCCACTAGCCCATTAATATCACAAGGTTGT TTTTGTTTATAGTTCATGTCTCTTTTCTATTTCAAGTTTTAAAAGTTTTTGCATTCATGA TCTATAATCTTCAATTTGAAGATGGTCCAATGATCGTTGTTAGGAGTATTAAGAAGATTA ACAAAGGCGAGCCCGTCACTATAGCTTACACTGACTTGTTACAACCTAAGGCAGTGAGAC AGGCAGAGTTGTGGTCAAAGTATCGATTTGTTTGTGGCTGCGAGCGATGCACTGCATCAC CCGCAACTTATGTAGATCGCATTTTGGAGGAAATTTCTGCTTTTGATCTGGAGTTGAACT CAAGATTAGATTGTAACTTTGATAGGGATAAAGCAAATCAAAAGTTGAGTGATTACATGG ATGAAGTCATAGCTGAGTATCTGTCAGTTGGTGATCCTGAATCTTGTTGCAAGAAGATGG AGTGCTTCCTTAACCAAGGACTCCTCTTTGAGCAATCAGAAACTGAGGGAAAAGTAGTGC TGAATTTGAGGTTGCACCCTCTGCACCATCTTGCTTTGAATGCCTATACGACGCTGGCTT CTGCATACAAAATCCGTTCAAGTGACTTATTAGCTCTCAATTCCGACGTTGATGCACATA AGTGTGAAGCATTTGCCTTGAGTAGAATCAGTGCAGCATACTCATTGCTGCTTGCTGGTG CTGCTGACCATCTGTTTCAATCTGAATCGTCTCTGATTGCATCTGCTGCTAATTTCTGGG 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