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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI011466 | Chr8 | 21968747 | 21972737 | + | Trihelix transcription factor GT-2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI011466.m1 | 67 | 152 | PF13837.9 | Myb_DNA-bind_4 | Domain | 65.8 | 3.70E-18 |
LITCHI011466.m1 | 418 | 504 | PF13837.9 | Myb_DNA-bind_4 | Domain | 75.9 | 2.60E-21 |
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>LITCHI011466.m1 ATGTTTAGCGACTCAGGTTTATCCGGTGATGTCGCCACCACCACCACCAGTACTACAGCA GCAGCTAGAGAAGCTCCTGATGAAGCTGGCGGCGGTAGTGAAGCAGCCATGGCGGCAGTG GTGGCGGCTTCGGCTTCGAATTCAGGTGAAGAAGATAAGAGTAGGGTTTTGGAGGAAAAC GAGCGTGGTTTTGGAGGAAACCGGTGGCCGAGACAAGAGACTTTGGCTCTGCTGAAAATC AGGTCCGACATGGACATGGCGTTTCGTGATGCTAGTGTCAAAGGTCCCTTGTGGGACGAG GTTTCCAGGAAGCTTGCGGGGCTTGGTTATCATCGAAGCGCCAAGAAATGCAAGGAAAAA TTCGAGAACGTTTACAAGTACCACAAGAGAACCAAAGACGGGCGCAGCAGCAAAGGAGCA GGTAAAACTTATAGGTTTTTTGATCAATTAGAAGCTTTTGAGCATCATCACCACTCTTCT TCTCTACCATCGCCGCCGCCACCGCAAAAGATTCAAGCTCCACCGCCGGTGGTGTCAATG CCAAGTGTCTCTCATAATATGACTAGTACTGCTACTACTACTAGTGTTCCATCAACAACA GTACATGTACAACCTATAAACCTCACAACATTTGCTTCACTTCCTCCCACCACAACAAAC CCTACAATTTTGGCCCCATCGGGAAACCCTTCTCATACCAATATCCCATCTTCGTTTCAG AATATATCGACAGATGTGCTGTCGAATTCGACCTCTTCTTCGACCTCATCGGACTTGGAA TTGGAAGGGAGAAGGAAAAGGAAAAGGAAATGGAAGGACTTTTTCGAGAGGTTGATGAAG GAGGTGATTGAGAAGCAAGAACAATTGCAAAGGAAGTTCTTGGACACCCTTGAGAAACGC GAGCACGAAAGAGTGGCTAGAGAAGACGCTTGGAGAATGCAAGAAACGACGAGAATTAAT AGAGAGCGAGAAATTCTAGCCCAGGAAAGATCAATAGCTGCTGCCAAAGATGCAGCTGTC ATGGCCTTTTTGCAAAAACTATCTGAACAGAATCCTACAGCCCCACCACCTGTACAAAAT AACCCTCCAACAGCCCCACCTCCACCTCCACCTGCGCCACAGCCAGTGTCAGTACCCCCA CCTGCTCCTCCTGCTCCTGCTCCGGTGTTGTCACAACAAGTAGTGAATGCAGGCACATTG AAGACAGACAATGGGGATCAGCGTAACAGTTTCACGGGAACAAACAGCTCTTCAAGATGG CCTAAAGTTGAAGTTCAAGCGCTGATCAATCTAAGAACAAGTCTTGATTCCAAGTATCAA GAAAACGGACCAAAAGGGCCGCTTTGGGAGGAAATCTCAGCTGGGATGAGGAAGCTAGGT TACAATCGTAGCTCAAAGAGATGCAAAGAGAAATGGGAGAACATAAACAAGTACTTCAAG AAAGTGAAGGAAAGCAACAAGAAAAGGCCTGAGGACTCCAAAACATGTCCTTACTTTCAC CAACTTTACGCCTTGTACAAAGAGAAGAACAAGTTTGACACCCCTTCCATTCCATTCAAG CCTGAAAACTCCGTGCCCTTGATGGTGCGGCCTGAGCAGCAATGGCCTCCTCAGCCTGAC GACCATCAACACGGACAAGACTCAGCCATGGAAGACATAGACAGCGACCAAAACATAGAC GATGATGACAAGGATGGCGATGACGATGAGGACGATGATCAAGGCGGCGCCTTTGAGATT GTACCAAACAAACAAGTTTCATTAGATGCAGGTGAGTGA
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>LITCHI011466.m1 MFSDSGLSGDVATTTTSTTAAAREAPDEAGGGSEAAMAAVVAASASNSGEEDKSRVLEEN ERGFGGNRWPRQETLALLKIRSDMDMAFRDASVKGPLWDEVSRKLAGLGYHRSAKKCKEK FENVYKYHKRTKDGRSSKGAGKTYRFFDQLEAFEHHHHSSSLPSPPPPQKIQAPPPVVSM PSVSHNMTSTATTTSVPSTTVHVQPINLTTFASLPPTTTNPTILAPSGNPSHTNIPSSFQ NISTDVLSNSTSSSTSSDLELEGRRKRKRKWKDFFERLMKEVIEKQEQLQRKFLDTLEKR EHERVAREDAWRMQETTRINREREILAQERSIAAAKDAAVMAFLQKLSEQNPTAPPPVQN NPPTAPPPPPPAPQPVSVPPPAPPAPAPVLSQQVVNAGTLKTDNGDQRNSFTGTNSSSRW PKVEVQALINLRTSLDSKYQENGPKGPLWEEISAGMRKLGYNRSSKRCKEKWENINKYFK KVKESNKKRPEDSKTCPYFHQLYALYKEKNKFDTPSIPFKPENSVPLMVRPEQQWPPQPD DHQHGQDSAMEDIDSDQNIDDDDKDGDDDEDDDQGGAFEIVPNKQVSLDAGE.
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>LITCHI001354.m1 + Up_Stream_Len 2000 GCTCTTGAAATGTTTGAAGAGTATATTTTTTTGTCGGATGCACCCCTACAGTTCAAGTAT CTTCTCAATTCTAAAAGTAAGAAAGTGCAGACCGTCCGTTAGTTTTTCGTTTCTTCTTTG GGCATATGCCCCATTTTTGTATCAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAATGTTACCA TCCTTTTTTGATAAATTCATTTATCTTATTAAATTATCTACATAAAATATTATATATATT TGATTTATTTAAATATTAATTTAAGATATATAAATTGATATTTTCTAATATTTATTACAA ATAAAATTCATTTTATTTAAGATTAGTTATTAATAATTAATTTTAATTAGAATTAATTAT AACAATTAATTTTATTTAGAATTAATTATAAATAATTTATTTTAAAATTTTAAAAATATT TTATTTTATTTTAAAATTAATTCAAACAAAATTTAGACTTAGTTTAATATAATTTAAAAT ATTTCACATGATTTTATTTTTCTTTGAATTAATTAAAAATGATTTTATTGATAACAATAT TAAATAAAAAAACAAGAAAAAAAAAATCCTCCCTCACATGCTTGTCTCTCTCAACATCAA CAAACTAGTTACCATCTCATTTTTTTCTCTCTCATTTCTTCGTCATCTCATTTTTTCAGT CTCTCTCATTTCCCCCTTTTTTATTGATAAAGGTAGTAGGTCATCTAGACGAACACCGAT GCTAATTACTATCAGTTTATTTTTCTTGAAATTTTTTATAATATCCTTAAAATTTATAAA TTTCATTAAAATCTGTCATCAAACCAAATTCACGAGACCCCAAAAAAGTATAGATCGAAT GCATTTCCTTTAGTAAATTTTTAATTATATTAAAAAATAGTAATTATAGCTCAAAAACAA GTCATTTGCAAATAAATAATTTCGAGAACATACTGACATTCAACCAATATTACTCTCACC CAACCAGAGCAGATAGTAGACATGAATAATTAAAAAATTTAGTTGGCGCCTGAGTAATGT ACAGGTGGAAGGCCGAGGCAGCTTGGTCAACTGCGGCGGCCATAGACTTTCCTTCCTCGG AACGTGACATTCTCTTCTCATTTGGCTCTCTTTCTCATACCTCTTTACACGCGGATACAA AAAGGTGCCCACTTTTTGTTTTTCTTCTTTACTACAGTTAATCAACTCATTTCACCAAAA TGGCAACACCACTTTTTCCATCAGTCACAACCTGCTACTACTAGATAGACGTGTTTGATT CGTTCTTAACTTCTTTTAAATGATAACTTGTATCGAATTGATTCCTAATCTAAAGATTAT CTTATTCCTCTCTAGAATTAAAGCTACAAAACTAGTGAAAAAGGTCGTTCGGTTCCATTA TTTTATTCAAAATTTCTGATTGGAACTTAGACTTAATTAATCTTTTTTTCTTAAAAAAAA ATACAATCTGCAATGAAAATGAATCAAAATTTGAAATATTTAGTGTTTCTGTTACTAAAC TATATTAAGTAAGAGTAAATTGACCCAACAATGAATTTACTCCAAATTTACAACTTTAGC TCACTCTATCACAATTCACATCACTTGATGTTTAAGGTGGGTCGAAAATTACTTTTACGA GTGTGTTTATATTAATTTAAAGATCATCAATTTAATTAATCATTTCAAATTCAATTTGGA TCGGTGAATCAGTCACAACAATTTCATTTTCCTACGTCATATCTTGTCTAATTGTCAATC TGATCTAAGTTGTGATTGGCGAGAGTGCATGCAACACATGGAGATAAAAAAGAAGGTGCA ATGAAGAAAGCATATAATCGAGTGCCGCCCAATTCCTAACTTTTGAAGCTTTACGTTGGC ATCTTTTCCAACTTGTCATTATCTGCCATTACCGTGTGAACTCTGGCTCAAAAATTCAAG CCAACCTCGTGCGTAATTTCACTTGGACTGACTCTTGCAATTCCAATCTCCATTTCCACA CACTCTGTCTCCCTACATGC
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>LITCHI001354.m1 GenomeSequence + GGAACTTAGACTTAATTAATCTTTTTTTCTTAAAAAAAAATACAATCTGCAATGAAAATG AATCAAAATTTGAAATATTTAGTGTTTCTGTTACTAAACTATATTAAGTAAGAGTAAATT GACCCAACAATGAATTTACTCCAAATTTACAACTTTAGCTCACTCTATCACAATTCACAT CACTTGATGTTTAAGGTGGGTCGAAAATTACTTTTACGAGTGTGTTTATATTAATTTAAA GATCATCAATTTAATTAATCATTTCAAATTCAATTTGGATCGGTGAATCAGTCACAACAA TTTCATTTTCCTACGTCATATCTTGTCTAATTGTCAATCTGATCTAAGTTGTGATTGGCG AGAGTGCATGCAACACATGGAGATAAAAAAGAAGGTGCAATGAAGAAAGCATATAATCGA GTGCCGCCCAATTCCTAACTTTTGAAGCTTTACGTTGGCATCTTTTCCAACTTGTCATTA TCTGCCATTACCGTGTGAACTCTGGCTCAAAAATTCAAGCCAACCTCGTGCGTAATTTCA CTTGGACTGACTCTTGCAATTCCAATCTCCATTTCCACACACTCTGTCTCCCTACATGCA TGTACAGTGTTCATCACCTACCTAAATCCCCCCACAAACCTTCCCTTTTGCCAGCCAAGA TGTTTGTCCTCCAATGGCCCTCCCTCACTCTTCTTTTCCTTCTCTTTGTTGGGTTCTTTT CTCCTTGCAAATCCGATGAGCTTCAGATATTGCTTAACTTGAAGTCCTCGCTGCAGAAAT CTAACACGGGCGTTTTCAGTTCGTGGACACCAGGTAGTTCGGTGTGCAGCTTCACTGGAG TTGTCTGCAATCCTGATGGACTTGTTAAGGAGATCAATCTCCCCAATCAGCTGCTGGTTG GTGTTCTTCCTTTTGATTCCATCTGCGGTCTTCAGTCATTGGAGAGGATTGATTTTGGTA ACAATTTTTTGCATGGTGCTTTGTCAGAGGACTTGCAAAAGTGTAGGAGATTGCAAGTGT TGGATTTGGGGCGCAATTTTTTCTCTGGAGAAGTGCCTGAGTTGTCTTTGTTAGGGAACC TGAGTTTCTTGAATCTAAACAACAGTGGATTTTCCGGGAAGTTCCCATGGAAGTCCCTGG AAAATCTGACCAAGCTTAGTTTCTTGAGCCTTGGTGACAACCCCTTTGATTCAACTCCAT TTCCTGAGGAGATCCTGAAGCTTGACAAGTTGTATTGGCTTTATCTCACAAATTGCAGCA TCACAGGACAGATTCCAAGTGACATTGGGAAACTTACTCTGCTCGAAAATTTAGAACTTT CGGATAATCAGCTTTCCGGGGAAATTCCATCAGAGATTGTGAACCTCAAGAAACTTCGTC AGCTTGAGCTTTACAACATTTCCTTGACAGGAAAACTTCCTGCAGGATTTGGAAACCTGA CAAGTCTTGAGAACTTTGATGCCTCACAGAATAGTCTTGAAGGTGACCTGTCAGAGTTGA GATTCCTGAACAAACTTGTTTCCTTGCAGCTCTTTGAAAACCAACTTTCAGGGGAGATTC CTGAGGAGTTTGGTGATTTCAAGAGCCTGATAAATCTCTCTCTGTACACAAACAAGCTCA CCGGTACACTTCCTCGGAAGATCGGTTCTTGGGCAGATTTCAATTACATTGATGTTTCAG AGAATTTCCTAACAGGTCCAATACCACCAGACATGTGCAAGAATGGGAAATTGACTGAGC TTCTCCTCCTACAGAACAGGTTCACTGGGACAATCCCGGAAAGCTATGCCAATTGTAAGT CTCTGACGCGTTTACGAATCAACAACAATTCACTTTCCGGGGTTGTTCCTCCTGGAATTT GGAGTTTGCCGAATCTTTTCATCATTGATCTCACCACAAATCAATTTCAAGGTCCAGTGA CAGATGATATCGGTAATGCCAAGTCTCTTGCTCAGTTATTTTTAGCCAACAATCAGTTTT CTGGTGAGTTACCCTCTACAATCTCACAAGCTTCATCATTAGTCTCGATTCAGCTGAGTT CTAATCGATTTTCTGGCCAAATCCCATCAAGTATCTCACAATTGAAGATGCTAAATAGCC TTTATTTGAATGAAAACAAGTTTTCAGGTTCCATACCTGACTCAATAGGTTTATGTGTTT CTCTCACCAGCATCAATTTTGCTCAAAACTTGCTTTCCGGGAAAATTCCTGACAGTTTTG GATCACTACCCTCTTTGAACTCATTGAATATATCTACAAACAACCTTTCTGGTGAAATCC CAGTTTCTCTTTCGCATCTGAAATTAAGCCTTCTTGACTTGTCGAACAATCAATTGTTCG GTCCAATACCTGAACCTTTAAACATTCCAGCCTTCAGAGATGGCTTTGTTGGAAATCTTG GCCTATGTATCCAAAATGATAAGGATTCTCAGTCATGTTCATTTAGTTCTGGAAAAGCCC ATCATAATCTTCCAAAAATTTTGTGGTGTTTTGTAGCTGTAACTCTAGTCCTGCTTATTA CACTAGCCTGTTTCTTGACTGCAAAGCTAAAGCAGAATAATCTAGAGACTCCATTGAAGT TGAAGCAGAATTCGTGGCGAATGAAATCGTTTCGTGTGCTAAGTTTCACGGAAAGGGAAA TCATTAATGCAATCAAGCCAGAGAATTTGATTGGCAGAGGAGGATCAGGGAATGTGTACA AAGTTGTTCTTGATAATGGCAAAGAGCTTGCAGTGAAGCATATTTGGCCTTCAAAATCCA TTGACCAGAAGAGCTGCCGGAGCACCGCAGCCATGATAACTAGTAGGACTTTCCGGTCAA CGGAGTTTGAGGCGGAGGTGGCAACATTGAGTACAGTGAGGCATGTAAATGTGGTGAAGT TGTACTGTAGCATTACAAATGAGGACAGTAATCTGCTGGTTTATGAGTATCTGCCTAATG GGAGCTTGTGGGACCGACTCCACACGTGTCACAAGATCAAGATGGGATGGGAGGTTCGGT ATGCCATCGCAGTGGGGGCTGCAAAGGGATTGGAGTATTTGCATCATGGGTGTAATAGGC CTGTGGTACATCGTGACGTAAAGTCTAGTAACATCTTGTTGGATGAAGAGTGGAAGCCAA GGATTGCTGATTTTGGTCTATCCAAGATTGTTCCGGCTGGTGATGGAGGGGACTGGACTC ACGTCATTGCTGGAACTTATGGATACATAGCTCCTGGTATGTTTTCCTGAAAGATTATTT TACTAATTCGAACTTCTAGTTCTAAATGAACAAATATGTGAATAACTTACTGCTTAAATA AATCTCCTAGATAAATATAGAATCCAAGTACATACTTTTATCTGAAAGTGTTGTGATTTA TCATATAAAACTGATCAATTTTTTTTTCATATTTTGTGATGTTGCAGAGTATGCGTACAC TTACAAGGTGAACCAGAAGACCGATGTGTACAGCTTCGGGGTGGTTCTGATGGAGTTGGT GACAGGAAAAATGCCGATAGAGGCCAAATTTGGAGAGAACAAGGATATAGTGAACTGGGT GTGCAGCAACATGAAGAGCAAAGAGAGTTTGCTTGATGTGGTGGACTCAAGCATCTCTGA GGACCTAAAAGATGACGCTCTCAAAGTTCTGAGCATAGCCATTCATTGCACAGCCAAAAA TCCAGCACACAGACCATCCATGAGAATGGTAGTTCAAATGCTGGAAGAGGCTGAGCCTTG TTTACTTACAAACATTATTGTTGATAAAGAAGACGCAAGGAACCCAAATTCCAAGGCCTA GTAAGAAGTTGCAGTCGCCAATTCGCTTGTTAGTAGTTTAATTTTGCAGGTCTCAGGCTC AGCTTGGAAAACTAGCAGAGCTAATTTTGTAAATATAAATAAACTTTCAGTGAGCAAATA ATATCAGGTTAATAAATTTTGTTACAAAAGCATCAATTTGAGTTAGGTTTTCAATCACAT GCAGAAGTAAAAAAAGTGCCTTTCTTGAACATAAGGCATTTACATTTTGGTCCAGGCATC ACATGATGGATATCCAGATTCTTTAACATTTGTTGATATCTTAACACACAAAAAAAAAAA AAAAAGTATTTGAAAACTAAAATATTAATGCATTTTGAAGAAAAATAAAATGACATTGAA TAGGTGAAAAAAGGGAGAAAAGTATAGAGCATAAATATTTTGATAGAAGTCACATAAGTA TTTTTTGAGACTAAGTCATACAAGGTTTTTAAGTATAATTTTGATGGTAATTGATCATTA GAATTCTATTGTTTCTAGTGTTGCTTTTTTATTTTCTTCTTTCGTACTAAATAGTTTTTT TTTTTTTAAAAAATAAAAATAAAAATTGTAGAATAATTGAAAAAGTTTCACTACTTCATT AACATTTTTTTTTTTTTGGGTTCATAACATCTAATTTACTGTGAATATCTGGAGATTGGT TTTGAGAAGTTCAGTCGTCTTCGAAAAAATTGGACAAGGCCAGAATGAGAAGGCCCAATG TAAGACCATAGCATTCAGTCCAGAAGCCAGCAAGGGATAAACCAGTAAAAATGTGAAATT AAAAAATAATTAGAAAAATGTATTTTACAATTATTTTAAATTTAATGCTATTTAAATATC CTTAGAATTTAATTCCATATTCCTTACTTGTATAAATAGAATAGAATTTAATTCCATATA TCCTTCCTACAATAAACAGAATTAAATGAAAGATAAGTCTGATTATATTCTGATTTTTGA TTACGTATTGGTATTGTGCT