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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI011466Chr82196874721972737+Trihelix transcription factor GT-2

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI011466.m167152PF13837.9Myb_DNA-bind_4Domain65.83.70E-18
LITCHI011466.m1418504PF13837.9Myb_DNA-bind_4Domain75.92.60E-21
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>LITCHI011466.m1
ATGTTTAGCGACTCAGGTTTATCCGGTGATGTCGCCACCACCACCACCAGTACTACAGCA
GCAGCTAGAGAAGCTCCTGATGAAGCTGGCGGCGGTAGTGAAGCAGCCATGGCGGCAGTG
GTGGCGGCTTCGGCTTCGAATTCAGGTGAAGAAGATAAGAGTAGGGTTTTGGAGGAAAAC
GAGCGTGGTTTTGGAGGAAACCGGTGGCCGAGACAAGAGACTTTGGCTCTGCTGAAAATC
AGGTCCGACATGGACATGGCGTTTCGTGATGCTAGTGTCAAAGGTCCCTTGTGGGACGAG
GTTTCCAGGAAGCTTGCGGGGCTTGGTTATCATCGAAGCGCCAAGAAATGCAAGGAAAAA
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GAAAACGGACCAAAAGGGCCGCTTTGGGAGGAAATCTCAGCTGGGATGAGGAAGCTAGGT
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CAACTTTACGCCTTGTACAAAGAGAAGAACAAGTTTGACACCCCTTCCATTCCATTCAAG
CCTGAAAACTCCGTGCCCTTGATGGTGCGGCCTGAGCAGCAATGGCCTCCTCAGCCTGAC
GACCATCAACACGGACAAGACTCAGCCATGGAAGACATAGACAGCGACCAAAACATAGAC
GATGATGACAAGGATGGCGATGACGATGAGGACGATGATCAAGGCGGCGCCTTTGAGATT
GTACCAAACAAACAAGTTTCATTAGATGCAGGTGAGTGA
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>LITCHI011466.m1
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EHERVAREDAWRMQETTRINREREILAQERSIAAAKDAAVMAFLQKLSEQNPTAPPPVQN
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AGATTGACAAGGAGATCCCCACACATACACACACAAATAAATTAATAAATTCACCATACA
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TCATAAAATTTTATTATTTTTATTTTCATTTTCATTTTTATTTTTTGGAGCCGTTAATTG
CTGTACAAAGAAGAAAGAAAAGAGGGTACAGTATTAGTCCAATCCTATGTTTAGCGACTC
AGGTTTATCCGGTGATGTCGCCACCACCACCACCAGTACTACAGCAGCAGCTAGAGAAGC
TCCTGATGAAGCTGGCGGCGGTAGTGAAGCAGCCATGGCGGCAGTGGTGGCGGCTTCGGC
TTCGAATTCAGGTGAAGAAGATAAGAGTAGGGTTTTGGAGGAAAACGAGCGTGGTTTTGG
AGGAAACCGGTGGCCGAGACAAGAGACTTTGGCTCTGCTGAAAATCAGGTCCGACATGGA
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TGCGGGGCTTGGTTATCATCGAAGCGCCAAGAAATGCAAGGAAAAATTCGAGAACGTTTA
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GTTTTTTGATCAATTAGAAGCTTTTGAGCATCATCACCACTCTTCTTCTCTACCATCGCC
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TAATATGACTAGTACTGCTACTACTACTAGTGTTCCATCAACAACAGTACATGTACAACC
TATAAACCTCACAACATTTGCTTCACTTCCTCCCACCACAACAAACCCTACAATTTTGGC
CCCATCGGGAAACCCTTCTCATACCAATATCCCATCTTCGTTTCAGAATATATCGACAGA
TGTGCTGTCGAATTCGACCTCTTCTTCGACCTCATCGGACTTGGAATTGGAAGGGAGAAG
GAAAAGGAAAAGGAAATGGAAGGACTTTTTCGAGAGGTTGATGAAGGAGGTGATTGAGAA
GCAAGAACAATTGCAAAGGAAGTTCTTGGACACCCTTGAGAAACGCGAGCACGAAAGAGT
GGCTAGAGAAGACGCTTGGAGAATGCAAGAAACGACGAGAATTAATAGAGAGCGAGAAAT
TCTAGCCCAGGAAAGATCAATAGCTGCTGCCAAAGATGCAGCTGTCATGGCCTTTTTGCA
AAAACTATCTGAACAGAATCCTACAGCCCCACCACCTGTACAAAATAACCCTCCAACAGC
CCCACCTCCACCTCCACCTGCGCCACAGCCAGTGTCAGTACCCCCACCTGCTCCTCCTGC
TCCTGCTCCGGTGTTGTCACAACAAGTAGTGAATGCAGGCACATTGAAGACAGACAATGG
GGATCAGCGTAACAGTTTCACGGGAACAAACAGCTCTTCAAGATGGCCTAAAGTTGAAGT
TCAAGCGCTGATCAATCTAAGAACAAGTCTTGATTCCAAGTATCAAGAAAACGGACCAAA
AGGGCCGCTTTGGGAGGAAATCTCAGCTGGGATGAGGAAGCTAGGTTACAATCGTAGCTC
AAAGAGATGCAAAGAGAAATGGGAGAACATAAACAAGTACTTCAAGAAAGTGAAGGAAAG
CAACAAGAAAAGGCCTGAGGACTCCAAAACATGTCCTTACTTTCACCAACTTTACGCCTT
GTACAAAGAGAAGAACAAGTTTGACACCCCTTCCATTCCATTCAAGCCTGAAAACTCCGT
GCCCTTGATGGTGCGGCCTGAGCAGCAATGGCCTCCTCAGCCTGACGACCATCAACACGG
ACAAGACTCAGCCATGGAAGACATAGACAGCGACCAAAACATAGACGATGATGACAAGGA
TGGCGATGACGATGAGGACGATGATCAAGGCGGCGCCTTTGAGATTGTACCAAACAAACA
AGTTTCATTAGATGCAGGTGAGTGAGAGATTTGGTCATGATCATTTTTGGGTCAGTCCAT
GTAATTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTTTAAAAGATACTATTGGATCTGCAAAAATGTGGGT
CAAGAGAGACATGGCGCCGGGTGGCGGTGGGTGGTGGGTTGAGGGACGAATTTGGATTAA
ATTATACTCAATAACATGCACATGGGGGGGGGCTTGTTACTTTGTAGCATATGGTCAGTG
GGATTGATTATATGTTTTGTTTATTTTCATAATTTATTTATTTTTTTTGGCTAATTAACA
AATAACTTAAGGGATGAGAGAGAGACAGAGCGAGTAGGTTGCCACAGAATAAATAAAAAG
AGAGAGAGACTAGTGTTGTAATTTTTATTTTTATTTTTCATGTTAAATTAATTAGTTCAT
GGTGATGTAAGTGTGAGAAATGTTGTTTTGATATCTTTGCATACACCATAATATCTTATG
CAAGTCAATTAAGGGTCATAAAATGATATTACTGATTTATAGGATGGTTATTAAGTTGAG
GTAATTCTGTGATTAATCTCTCATGCTTTTACCAATGTAAATATAAGTTGGAATTACATG
TTATTCTCTTAACTTCTAAATTTATAATAATTAAGAGATCTACAGTTATCTGGAGCTTTT
AAATTGTATATGTATAATAATAATTTTTTAATTTTGTTGGATCGATAATTTATTTAAGTA
GAAATTTAGATTACTAGAAGATTCAATATCGTTTAATTGTTGTAAAGGTAAGATTTTATT
TTCATTTTTATTTTTTTTTTATAGAAATATATGATATATTTATGGTGCACAAATAAGACT
TTGTAGGGAAATTAAATTAGGTAGTTTTTTGCGATTGGGAATTCCCCACAACATGCCAGT
ATTACATGCTGTCATGGACCTCAACAGGGTCCACGAAAAGGAATCTTTCAAGTTTTTGAT
TGAAAGACTTAATTTCGAAATAGTTTCCTATCAAATTATTAATATTGATAATGATCATTA
GATATTTTCATTTGATGATTGAGACTTTAACATCCTTATTTTAACGAACATAAATCTGAC
ATTTTTAGCAATGAATTGCTGTTGATCTCACTAACATCCTAATAAAAATTAGGATTGAAA
ATTAATATATAAAATACTG
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ATTCAACAGTGGATCCCACTTCAAATGTCCTTTTTAAAGATAATGTTTGTATATGGAGAT
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AACTAATAATTACCATCGGCTCTATATGCTGCTGTTTATAAATTATTTATTTATTTAATT
ATATATCTTTCTGTGCCATTTTTTTATTACCAAAGATAACCAATATAAGTCATTTTACAG
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GTATGTATAGGTATAATGCGAATTTGGATAATTTCTTAGTTTTTTTCTGACCTTAACCTA
ATCTTATAATATATAAATAATACAATTAATTAATGGTTGAGATATAATTATTTTTCATAC
TTATTTTTTTAACCACTAATCATATATTTAAAAAAGTTCATTAGGAGACTATTCAAATCT
AGACTTTCCAAGTTTTATGGTGTAAGAATAATGTTAGACTTTCTAAATTTAAGAGTAACG
TTAGGATTTTCAAATTTTTTAATTATCCAAATTCATAAATATGTCATATGAGTTATTAAT
ATCACATTAATTATCATATCATCTTTTGATTTATAAGATATGGATAATTTATTTACTATA
TTATTTAAAAAAAAAAATTTGAAAATCCTAACATATGGCCACGTTTAATTGCAACAAAAA
GTGGCAATGTGCATCCATTATAGTGAAAGAGTCTCTCACACTTTAGTGTCGGTTAAAAAA
AAAAGAAAAAGGGCAAAAAAAAAAGACTGAAGATTCCACAGCCAAAAAAAAAGAAAAAAT
AATAATAAATAATCTCATATAAGCTAGCTTCTTGAGATTGACAAGGAGATCCCCACACAT
ACACACACAAATAAATTAATAAATTCACCATACAAACCATCTCCATAAAACCCTCTGAAG
TGAATTCAGTTCACCTTCGCTTTCTCTTCTTGTATCATAAAATTTTATTATTTTTATTTT
CATTTTCATTTTTATTTTTTGGAGCCGTTAATTGCTGTACAAAGAAGAAAGAAAAGAGGG
TACAGTATTAGTCCAATCCT
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>LITCHI011466.m1 GenomeSequence + 
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TCCACAGCCAAAAAAAAAGAAAAAATAATAATAAATAATCTCATATAAGCTAGCTTCTTG
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TCATAAAATTTTATTATTTTTATTTTCATTTTCATTTTTATTTTTTGGAGCCGTTAATTG
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TTCAATTTCTGGGTGAGTTAATATTTTCTCAAAGAATTTAGCACCAAGGAAAGCAAATTC
AGTGTCAGAATCTGGACTTCGATACGCTTATGTTTTTGGTTTTATCTCGTTTCAGGCATT
GGACTTTTCCCAATGATAATAATATTTTCATTGGGAATAGTAAGCTCAATTCTGTATGTT
TATATAATGGGTTTGTTACTTGTGTCTCTTTCTTCTTTCTTGTTTTCACTTTCATCCTTG
TTAATTAAATCACAAGTGAAGAAAAAAAATTCTGAAGTTACGATAGTGAGAGAGCATATA
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TCAATGAATTCTCTCTATCATCTTTGTTTTGTAAATTTTTATGTTTATTTTATGTGTTGT
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GGTATATATATATATTTTTTAAATTATATAAATTAAATTTTGCAAGTGTTGTTGTATTGT
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TAAAACTTATAGGTTTTTTGATCAATTAGAAGCTTTTGAGCATCATCACCACTCTTCTTC
TCTACCATCGCCGCCGCCACCGCAAAAGATTCAAGCTCCACCGCCGGTGGTGTCAATGCC
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ACATGTACAACCTATAAACCTCACAACATTTGCTTCACTTCCTCCCACCACAACAAACCC
TACAATTTTGGCCCCATCGGGAAACCCTTCTCATACCAATATCCCATCTTCGTTTCAGAA
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GCACGAAAGAGTGGCTAGAGAAGACGCTTGGAGAATGCAAGAAACGACGAGAATTAATAG
AGAGCGAGAAATTCTAGCCCAGGAAAGATCAATAGCTGCTGCCAAAGATGCAGCTGTCAT
GGCCTTTTTGCAAAAACTATCTGAACAGAATCCTACAGCCCCACCACCTGTACAAAATAA
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TGCTCCTCCTGCTCCTGCTCCGGTGTTGTCACAACAAGTAGTGAATGCAGGCACATTGAA
GACAGACAATGGGGATCAGCGTAACAGTTTCACGGGAACAAACAGCTCTTCAAGATGGCC
TAAAGTTGAAGTTCAAGCGCTGATCAATCTAAGAACAAGTCTTGATTCCAAGTATCAAGA
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CAATCGTAGCTCAAAGAGATGCAAAGAGAAATGGGAGAACATAAACAAGTACTTCAAGAA
AGTGAAGGAAAGCAACAAGAAAAGGCCTGAGGACTCCAAAACATGTCCTTACTTTCACCA
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TGAAAACTCCGTGCCCTTGATGGTGCGGCCTGAGCAGCAATGGCCTCCTCAGCCTGACGA
CCATCAACACGGACAAGACTCAGCCATGGAAGACATAGACAGCGACCAAAACATAGACGA
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GGGTCAGTCCATGTAATTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTTTAAAAGATACTATTGGATCTGC
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ATATGGTCAGTGGGATTGATTATATGTTTTGTTTATTTTCATAATTTATTTATTTTTTTT
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TGGAATTACATGTTATTCTCTTAACTTCTAAATTTATAATAATTAAGAGATCTACAGTTA
TCTGGAGCTTTTAAATTGTATATGTATAATAATAATTTTTTAATTTTGTTGGATCGATAA
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ACAAATAAGACTTTGTAGGGAAATTAAATTAGGTAGTTTTTTGCGATTGGGAATTCCCCA
CAACATGCCAGTATTACATGCTGTCATGGACCTCAACAGGGTCCACGAAAAGGAATCTTT
CAAGTTTTTGATTGAAAGACTTAATTTCGAAATAGTTTCCTATCAAATTATTAATATTGA
TAATGATCATTAGATATTTTCATTTGATGATTGAGACTTTAACATCCTTATTTTAACGAA
CATAAATCTGACATTTTTAGCAATGAATTGCTGTTGATCTCACTAACATCCTAATAAAAA
TTAGGATTGAAAATTAATATATAAAATACTG