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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI011466Chr82196874721972737+Trihelix transcription factor GT-2

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI011466.m167152PF13837.9Myb_DNA-bind_4Domain65.83.70E-18
LITCHI011466.m1418504PF13837.9Myb_DNA-bind_4Domain75.92.60E-21
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>LITCHI011466.m1
ATGTTTAGCGACTCAGGTTTATCCGGTGATGTCGCCACCACCACCACCAGTACTACAGCA
GCAGCTAGAGAAGCTCCTGATGAAGCTGGCGGCGGTAGTGAAGCAGCCATGGCGGCAGTG
GTGGCGGCTTCGGCTTCGAATTCAGGTGAAGAAGATAAGAGTAGGGTTTTGGAGGAAAAC
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AACCCTCCAACAGCCCCACCTCCACCTCCACCTGCGCCACAGCCAGTGTCAGTACCCCCA
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GACCATCAACACGGACAAGACTCAGCCATGGAAGACATAGACAGCGACCAAAACATAGAC
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GTACCAAACAAACAAGTTTCATTAGATGCAGGTGAGTGA
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>LITCHI011466.m1
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TCATAAAATTTTATTATTTTTATTTTCATTTTCATTTTTATTTTTTGGAGCCGTTAATTG
CTGTACAAAGAAGAAAGAAAAGAGGGTACAGTATTAGTCCAATCCTATGTTTAGCGACTC
AGGTTTATCCGGTGATGTCGCCACCACCACCACCAGTACTACAGCAGCAGCTAGAGAAGC
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TGCGGGGCTTGGTTATCATCGAAGCGCCAAGAAATGCAAGGAAAAATTCGAGAACGTTTA
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GTTTTTTGATCAATTAGAAGCTTTTGAGCATCATCACCACTCTTCTTCTCTACCATCGCC
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TGTGCTGTCGAATTCGACCTCTTCTTCGACCTCATCGGACTTGGAATTGGAAGGGAGAAG
GAAAAGGAAAAGGAAATGGAAGGACTTTTTCGAGAGGTTGATGAAGGAGGTGATTGAGAA
GCAAGAACAATTGCAAAGGAAGTTCTTGGACACCCTTGAGAAACGCGAGCACGAAAGAGT
GGCTAGAGAAGACGCTTGGAGAATGCAAGAAACGACGAGAATTAATAGAGAGCGAGAAAT
TCTAGCCCAGGAAAGATCAATAGCTGCTGCCAAAGATGCAGCTGTCATGGCCTTTTTGCA
AAAACTATCTGAACAGAATCCTACAGCCCCACCACCTGTACAAAATAACCCTCCAACAGC
CCCACCTCCACCTCCACCTGCGCCACAGCCAGTGTCAGTACCCCCACCTGCTCCTCCTGC
TCCTGCTCCGGTGTTGTCACAACAAGTAGTGAATGCAGGCACATTGAAGACAGACAATGG
GGATCAGCGTAACAGTTTCACGGGAACAAACAGCTCTTCAAGATGGCCTAAAGTTGAAGT
TCAAGCGCTGATCAATCTAAGAACAAGTCTTGATTCCAAGTATCAAGAAAACGGACCAAA
AGGGCCGCTTTGGGAGGAAATCTCAGCTGGGATGAGGAAGCTAGGTTACAATCGTAGCTC
AAAGAGATGCAAAGAGAAATGGGAGAACATAAACAAGTACTTCAAGAAAGTGAAGGAAAG
CAACAAGAAAAGGCCTGAGGACTCCAAAACATGTCCTTACTTTCACCAACTTTACGCCTT
GTACAAAGAGAAGAACAAGTTTGACACCCCTTCCATTCCATTCAAGCCTGAAAACTCCGT
GCCCTTGATGGTGCGGCCTGAGCAGCAATGGCCTCCTCAGCCTGACGACCATCAACACGG
ACAAGACTCAGCCATGGAAGACATAGACAGCGACCAAAACATAGACGATGATGACAAGGA
TGGCGATGACGATGAGGACGATGATCAAGGCGGCGCCTTTGAGATTGTACCAAACAAACA
AGTTTCATTAGATGCAGGTGAGTGAGAGATTTGGTCATGATCATTTTTGGGTCAGTCCAT
GTAATTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTTTAAAAGATACTATTGGATCTGCAAAAATGTGGGT
CAAGAGAGACATGGCGCCGGGTGGCGGTGGGTGGTGGGTTGAGGGACGAATTTGGATTAA
ATTATACTCAATAACATGCACATGGGGGGGGGCTTGTTACTTTGTAGCATATGGTCAGTG
GGATTGATTATATGTTTTGTTTATTTTCATAATTTATTTATTTTTTTTGGCTAATTAACA
AATAACTTAAGGGATGAGAGAGAGACAGAGCGAGTAGGTTGCCACAGAATAAATAAAAAG
AGAGAGAGACTAGTGTTGTAATTTTTATTTTTATTTTTCATGTTAAATTAATTAGTTCAT
GGTGATGTAAGTGTGAGAAATGTTGTTTTGATATCTTTGCATACACCATAATATCTTATG
CAAGTCAATTAAGGGTCATAAAATGATATTACTGATTTATAGGATGGTTATTAAGTTGAG
GTAATTCTGTGATTAATCTCTCATGCTTTTACCAATGTAAATATAAGTTGGAATTACATG
TTATTCTCTTAACTTCTAAATTTATAATAATTAAGAGATCTACAGTTATCTGGAGCTTTT
AAATTGTATATGTATAATAATAATTTTTTAATTTTGTTGGATCGATAATTTATTTAAGTA
GAAATTTAGATTACTAGAAGATTCAATATCGTTTAATTGTTGTAAAGGTAAGATTTTATT
TTCATTTTTATTTTTTTTTTATAGAAATATATGATATATTTATGGTGCACAAATAAGACT
TTGTAGGGAAATTAAATTAGGTAGTTTTTTGCGATTGGGAATTCCCCACAACATGCCAGT
ATTACATGCTGTCATGGACCTCAACAGGGTCCACGAAAAGGAATCTTTCAAGTTTTTGAT
TGAAAGACTTAATTTCGAAATAGTTTCCTATCAAATTATTAATATTGATAATGATCATTA
GATATTTTCATTTGATGATTGAGACTTTAACATCCTTATTTTAACGAACATAAATCTGAC
ATTTTTAGCAATGAATTGCTGTTGATCTCACTAACATCCTAATAAAAATTAGGATTGAAA
ATTAATATATAAAATACTG
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>LITCHI011466.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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ATTCAACAGTGGATCCCACTTCAAATGTCCTTTTTAAAGATAATGTTTGTATATGGAGAT
AGAGGAGCCAAATTTTTTCGTTTCTACAATTATCATCAATTCTAAATTATTTGTCAAACT
AAAACAATTGTCACGATCATACGTTGGCCCCCTTTGACGCCACCACTAGTGTACCACAGT
CTCAACCTCAATTTTAAGTCCCATTATGTTTTCAAATCTGTTTCATTATACATGCATTTT
AAATAATTTTTTTTAATATATTTTTCAAATATCACCTACTATATAGTCACTTAACGAATT
TTAGTTGGTAATCTAAATGAATCGGATTTCGTGTAAATTACAACAATTCCAAATTGTACT
TTTTAGTTTGACAAAAAGACCTTGGTTAAATTGTGGATAGAGGGTCTTTTAGGCATTTTC
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AACTAATAATTACCATCGGCTCTATATGCTGCTGTTTATAAATTATTTATTTATTTAATT
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AAAAATTCAAACGCAACTGATATATTATAAATCTTTCATTCCTCTATATATATATTACAT
GTATGTATAGGTATAATGCGAATTTGGATAATTTCTTAGTTTTTTTCTGACCTTAACCTA
ATCTTATAATATATAAATAATACAATTAATTAATGGTTGAGATATAATTATTTTTCATAC
TTATTTTTTTAACCACTAATCATATATTTAAAAAAGTTCATTAGGAGACTATTCAAATCT
AGACTTTCCAAGTTTTATGGTGTAAGAATAATGTTAGACTTTCTAAATTTAAGAGTAACG
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ATCACATTAATTATCATATCATCTTTTGATTTATAAGATATGGATAATTTATTTACTATA
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GTGGCAATGTGCATCCATTATAGTGAAAGAGTCTCTCACACTTTAGTGTCGGTTAAAAAA
AAAAGAAAAAGGGCAAAAAAAAAAGACTGAAGATTCCACAGCCAAAAAAAAAGAAAAAAT
AATAATAAATAATCTCATATAAGCTAGCTTCTTGAGATTGACAAGGAGATCCCCACACAT
ACACACACAAATAAATTAATAAATTCACCATACAAACCATCTCCATAAAACCCTCTGAAG
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CATTTTCATTTTTATTTTTTGGAGCCGTTAATTGCTGTACAAAGAAGAAAGAAAAGAGGG
TACAGTATTAGTCCAATCCT
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>LITCHI029714.m1 GenomeSequence + 
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AGAGAGAGAGAGAGAGTCCGTTTTTTTTCAGTTAAATTTCAAATTTTTTTTTTTTTTTTA
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AGCAGCTCGAAGCCAAGCTCGGCCTCGACTTATCTCACAAAGCCGCTTTCATTAGGGACC
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AGGTTTGGTTTTTAATGGGTTTTTTTGGTCATTTCATAGCTTTGTTCGTTTTAATGTTGC
CTTGGTTTTGTCTGTTCTAGGGTTTCATGTTTAATTGCTTGTTAATTTGGGGAAAAGAAA
AATTAGGGTTATGTTTATGCAAAATTGAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAGAAAAAACT
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AATTTATGTGAATGGTGCTAATTCCAATATTTTTAACATTTGTAGTTGTTGTGCATGTCG
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GCATTCTCTTCAGTGTGTGTCAGTTCGTAATAGATACCTAGCTTTTCATTAAGGAAAATT
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TAATTTTGTTGCAGTGCTCCGGTGGGAGCCAAAAGAAGAGGTGGCCCTGGGGGTTTGAAC
AAAGTTTGTGGTGTTTCGCCTGAACTTCAGGCCATTGTGGGTGAACCAGCCTTGCCAAGG
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GTGATGATGCTTTGCGCGTGGTATTTGAGACAGACTGCACGGACATGTTCAAGATGAATA
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GATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTATGATGACTTTGAATAACCTTTCTG
TCCTTTTTCCTTGAAATTTGACTGCAGAGGAGTCTAGTCAAGCTAAACGGTTAAAGACAG
ATCCTGAATCCACAACTGAAAGTACTGAATCTGGTACATCTCCTGTAATAATATCTGAAG
CGTTGGCTGAGTTTTTGGGCACTGGCGGCAGGGAGATGCTTCAAACAGAGGCAATAAAAC
TTGTTTGGGAGTACATAAAAGTTAACCATTTGGAGGTCGGTCACAAGGGCATTATTTTTT
AATTTCTTTTTGTGAAAGGAATCTACCTGGGAACTTAATTTGTTTGTCTGAAATTTTGGC
ATCTATCTGAGAACTATAACCTTCTAAAATTGGTTTTTAGTTCTTTCTCTTGGTTTCAGT
TTGTCATGATTCATTTGCATCTTTAGTGAAGCTATCAGTTTTCCCACTATCATGTTCACA
AAATTTGTTTTTTAACAGATTTACTGTGGAAATTTCATTTCATTTAAGTTGTTTTTAGAT
ATAGAATATTTCATATCTATTAGAAGAAATTTGTTGGTAATAACTTCCAGTGGTTTAATT
TGTGTGCTTTCAGGATCCTATAAATTCGATGGTGATACTATGTGATGAAAAGCTTCGTGA
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TTGGTGCTCACCTGTTTAATTGTACTCATTTCCTCATGTTTTTATGGTTTGTATGTTTGT
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GTGCATGGACGTGATTAGATAACTTATGTTTTACACTACTTGTTTATTTGTGATTAGAAT
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GTTTTTTGATTGTGACCTTTTGTTTTAAATTCTTGGTGCAATGTTCATGTAAACAAACTC
TCTGCTGGTTGCTTGTGAACTAAGAAGATGCTCCTTACTGTCATCTTCATTGCAATTTTA
GAACAATTCCTAATTCTACTTTTTAAAAACTGTCTAATCTTGATTTGCCCACCAGACAGG
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AGGGGAACTTATGAGAGATTTGTTGCCAGATATTATCTTTAACAGCCTAAAATGTTTGGT
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GTGGGTTCACATAGTCTGTAGTTTTCAGAAATTCCCATTATCAAATAAATAAACAAACAA
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ATAATCCA
>LITCHI029714.m2 GenomeSequence + 
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AGATCACCCTCCTCCTTCGATCTCACCCGACTCCGAATCCGAATCCCAACCCGACTCAGC
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AATTCGCTTTGCAGCAGCAACAACCACCACCGCAACCGCAACAGCAACAGCAACATTTCT
CTCCCCATTTTACCCTCCAGCATCAGCATCACCACGTGTCGCTTCCTCAGGACCTCAACT
TCCGTCACCCGGCTCCGCCTCCGCCGCCGCCGCAGCAGCAGCAGGCTCAGTTGCAGAATG
TCGCGAAACCCGAGGCGTATCAGCAGGTTTCGGCCGAAGCGGCGCCCAAAGAAAGGTAAA
AGGTTTGGTTTTTAATGGGTTTTTTTGGTCATTTCATAGCTTTGTTCGTTTTAATGTTGC
CTTGGTTTTGTCTGTTCTAGGGTTTCATGTTTAATTGCTTGTTAATTTGGGGAAAAGAAA
AATTAGGGTTATGTTTATGCAAAATTGAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAGAAAAAACT
AGGTTTTTTTAATTATTTTTTAAAGGAGAGTTTTTTTTTTTTTTTGGTTAGCTTTACTTT
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ATGTTCAAAAACTGTGTTACTTCTGCAAAATGCTGGTGGGTGGGTTGCTTTGAAGTTTGT
AATTTATGTGAATGGTGCTAATTCCAATATTTTTAACATTTGTAGTTGTTGTGCATGTCG
AAGAAATTAGCATAAATTATTCGATAATTCTCGTGTAAAGGATAAAAAGAGTTTCTAACT
ACATGTTCATTTAGGAAAGATATCTCAAAATCTTTTAAGAAGATTGGATATTAGACTATT
GCATTCTCTTCAGTGTGTGTCAGTTCGTAATAGATACCTAGCTTTTCATTAAGGAAAATT
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TAATTTTGTTGCAGTGCTCCGGTGGGAGCCAAAAGAAGAGGTGGCCCTGGGGGTTTGAAC
AAAGTTTGTGGTGTTTCGCCTGAACTTCAGGCCATTGTGGGTGAACCAGCCTTGCCAAGG
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ATAAGTTTGACTTTAGATTTTTAACACCTCTGCTTTGTTTGATTCAGATTGTGAAACAGT
TATGGGCATACATAAGGAAAAACAACCTCCAAGACCCAAGTAACAAGAGGAAGATAATTT
GTGATGATGCTTTGCGCGTGGTATTTGAGACAGACTGCACGGACATGTTCAAGATGAATA
AGCTGCTGGCTAAACATATAATCCCGCTTGATCCTAACAGTATGTAATGTGGTGTCATGT
GATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTATGATGACTTTGAATAACCTTTCTG
TCCTTTTTCCTTGAAATTTGACTGCAGAGGAGTCTAGTCAAGCTAAACGGTTAAAGACAG
ATCCTGAATCCACAACTGAAAGTACTGAATCTGGTACATCTCCTGTAATAATATCTGAAG
CGTTGGCTGAGTTTTTGGGCACTGGCGGCAGGGAGATGCTTCAAACAGAGGCAATAAAAC
TTGTTTGGGAGTACATAAAAGTTAACCATTTGGAGGTCGGTCACAAGGGCATTATTTTTT
AATTTCTTTTTGTGAAAGGAATCTACCTGGGAACTTAATTTGTTTGTCTGAAATTTTGGC
ATCTATCTGAGAACTATAACCTTCTAAAATTGGTTTTTAGTTCTTTCTCTTGGTTTCAGT
TTGTCATGATTCATTTGCATCTTTAGTGAAGCTATCAGTTTTCCCACTATCATGTTCACA
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ATAGAATATTTCATATCTATTAGAAGAAATTTGTTGGTAATAACTTCCAGTGGTTTAATT
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GCTTCTCAAATGTGAAAGCATTTCTGCATTGGGGATTCACGAGATGTTAGCACGCAATCA
CTTTTTCAGGAAGTCATGATGTCTGCTAGTGTTGAATGGTTAGTATAAGACTTTATATGC
GCTTACTTTCATGTGTTTACATACACTTCTGTGCTTTGTGGTTTATACACAATCATTAAA
AGAATTTCTTTACAGGTTGAGACTTCTGGCTTGACTAAATTAATGTCTGACTTTATTTCC
TCACAAAAAACTGTTTGATTAAGCTCTTGGCATCACCCTTCTTGCTTGACTGAGAACCAC
CCTTGTTGTCCTCTTTTTATTGCTTTATATTGAGAACCTCATTTACCCATTCGGTGAAAC
TTGGTGCTCACCTGTTTAATTGTACTCATTTCCTCATGTTTTTATGGTTTGTATGTTTGT
ATGCTTTTGAATTTCTGGTGTGTGTATATATTTTATCTGTTTTGGTTTGGTCTTTACTTA
AAAATGATGGAATGCGTTGTTGTTCTTGCAGGTGTAGGGACCTTGTCACCTGGTCACTTC
TGATGGTAGTAGAACAGATAGTGAAGACATTTTTCTTTTGTTTTGGCTTTTTGCTTTTTT
GTGCATGGACGTGATTAGATAACTTATGTTTTACACTACTTGTTTATTTGTGATTAGAAT
GACAATGTACAATTAGCCAATGGCGAGGATATGTTGTAGTTATGCCATTGCCAGGGGTGT
AGGTTTAAATGCTTATCTAGTTGTTGTTTTCACTTTTCCAAGCTAACCTTGAATAGTAGA
CTGAATTAAACCAGAACAGAATGACAAATTCATGTTTCTTGGAAGCAATTCGTGGATCTT
GTTTTTTGATTGTGACCTTTTGTTTTAAATTCTTGGTGCAATGTTCATGTAAACAAACTC
TCTGCTGGTTGCTTGTGAACTAAGAAGATGCTCCTTACTGTCATCTTCATTGCAATTTTA
GAACAATTCCTAATTCTACTTTTTAAAAACTGTCTAATCTTGATTTGCCCACCAGACAGG
TTCATTTTATAATGTTAGAGTGATCATCAGGGATCCAAGTGGCCACCATGGAGGGTACAA
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GAGTAGGTACACTGTCTTTTTCTATATGTCAATTGCTTATATTGACTTTTCTGAAGGTAT
TTTCTGTTGCAAGTAATCTTGTAACTGAAGTAGGAGGCCTGTCTTGCTGATAATATTTGA
TTGTGTCAAGCACAGTTCTTGCCATTATATATCTGCTTTTTATGTTTCTGCTGGTGATGA
TTTGGATACATATATGGATAAGATCTGATCTTCTCTAATTGTAAGCCAGTCATGAACTTA
AGCAGTCCATGCGCTTTACCGGGCTATATATTATCTGCTACATGTTTCTTGACTTTTGAA
GTGGGTTCACATAGTCTGTAGTTTTCAGAAATTCCCATTATCAAATAAATAAACAAACAA
TCCCAGCAGTTTTGGTGTATTTGAGTATTAAGAAGTTTAAATGCTGATTCATTGTATGAA
ATGATACATTATGATTCTGTGAACAAGAAAAATGACCCTGATTTTCCCACATGGTTTAAT
ATAATCCAGGTTTTGAGAAGAAGACAAGTACACAAATGAAAAATAGAATAAGCAAGCTCC
TTTTGATCATGTTCTTGGAGACTGCATGATATGAGCTCAATTGATCCATTATTGTCATGA
TATATCCAAATATTTTCTGCCAAAATCCAGAAGACAAGACGCAGAAACTGATGTTATTAC
AAAACTTCTATGTTTCTACAAACTGAAACTACGTGGAAAGCTTCAAACTATTTACCAGTC
TAAAGGGTTCAGTATGGAGGAGTGGCTCCATGAATATCTCCACATTCCTGATTCATTTGT
CGAGAAAAATAGTCACACTTCCAAGTCACCTTTGAAAAACAGAATTTGTAAAATGTTTTC
TAATTTATATTGTCGTTTTACTATACAAGTATGTTATTTGAAAAAAAAATATGTACTTTT
TATAAGAAAAACATGAAGGATGCGTTTAGCATACCTTATAAGGACCTTTCCCTGGTAGAC
TTGGCAAATGTAGAAACTGAAGCCTTTTCCTAGTGGCACATTCTTTTTCTTCCATTCTGC
ACATGATACATTATAAACCAAATGTAAGAAAAAATTGTCTTGGAAAACGAACGATGTTGT
CGATAAACATCAGTGCGTCCTTATTATTAGCATTTCAAAAATATTTATTCGAAAATGAAA
TAACCAGCAAGGCAAACCTAATCTCCATGCCACACCAACATGCATTCCATCATGCAAAGT
TGGTTTCACCACAAACTCTATGTTATTTCCCAAACATCTGATAAGGGAACTGAAAAAATC
CACAACTTGCTGCAAAATTGACCCGGAATAAACTTTAGCCTCTAAAATTGATTTACTAAT
CAAAATCAATGCACGTTATTTTTAAATCAACCTTCGCATACCTTTTTCCCTTGAAAGGGT
TGGAAGGAGAAGAAATTACATACACATCGACATTCATCTCCGATTATATCTGATACTTCA
TGTATATTTTTGTTTTTGATTGCAGAATAAAGCTTGAGAACCGTGTCAAGAGCTTGACGA
TCTTCTTCACTTGACCCCGAGTTATTACCATCAAAGACCACCAATGAACACCGTCTATGC
CCTGAAGAAGAGCTAATTTGATGAATCAATGGTTGGGGAGAAAATGGTGGCGTTATAGGA
GAATAACAAAGACCATCACAGGTTTTGTGTGGATTCTTGTGATTAGAAAACCTATTGAAA
GTAGTAGAATGTGAAGTGATGTGGAGGGAATTTGAGATTAGTTTATTGCAGTTTATGGTT
GAAGATGGAAGAGAGATTGATCTGATCATATTGAGTTAAAAAAAATATTTCAAAATGAGA
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>LITCHI029714.m3 GenomeSequence + 
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>LITCHI029714.m5 GenomeSequence + 
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GTGGGTTCACATAGTCTGTAGTTTTCAGAAATTCCCATTATCAAATAAATAAACAAACAA
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TAATTTATATTGTCGTTTTACTATACAAGTATGTTATTTGAAAAAAAAATATGTACTTTT
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CAAAATCAATGCACGTTATTTTTAAATCAACCTTCGCATACCTTTTTCCCTTGAAAGGGT
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