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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI011452Chr82180619321811551+Zinc finger CCCH domain-containing protein 5

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI011452.m1132155PF00642.27zf-CCCHFamily24.51.90E-05
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>LITCHI011452.m1
ATGGAATTGAAGAAGAAAAAGGAGCTAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAGAGAAGGAAGGCT
CTAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCCAAGAGACAGTTACAGCATGGAAGGCGTCAATCA
TCCACTTTGGCTAAAAAGGAGACTCAGTGTGATGAGGATGATGAGTGGGAATATGTTGAA
GAAGGGCCTGCAGAAATTATATGGCAAGGAAACGAGATAATCATTAGGAAGAAAAAGGTC
AGAGTTCCAAAGAAGGAATCAAACCAGCTGAGTGGAAAAGAGGATGTTGATAGGCCTACT
TCAAATCCTCTTCCCCCCCAGTTGGAAGCCGTTATTGATTACAAGAGTGCACAACAGGCG
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GATCACTATCACAGTGAGAGCAGAAGTGATGAAATTCATTCTGATGACAGAGACAAAGAT
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TCTCAGACGATCAAGGTGAATCTGCTCACAAGTTGA
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>LITCHI023980.m1
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>LITCHI023980.m2
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TTTGTTTATGAGTTGATATGATAGTCAAAGCTAAGATTTTGATAGATGGGGTGTTGATAA
GTTGAGCTAATCTGTATTGGGTTTCCTGTGATTGTCAGTTTTCTTGATACCAGTTGTTTG
GTTGCCTGGAAAATGAAGAAAGGTGGGATTTTTAGTTTTCTTATTATGGAAAGTTGAAGG
GAGTTTTTGATGATTGTATGCTTTTGTTTCTGATTATGGAAAAGCTTTTAGCAAACTGGG
TTCTTTTTTTCGGTATTGAAATGATCTCAGGTTGAAATTTTCTTGCTGATCAAACTAGAG
CTTTCGAGGGATTGTAATTCTAGAATTTGGTGTGTTGTGGAATGGATAATTTGGGTATGG
GAGGAGGGTTTTTGTCAGGTTCAAATGGGGGTTTGTTAGACCTTGAAACATCCATGTCTA
GACACCCGCAAAACCAGTTTGGTCATCCATCACTAACTCATCAAAATCACATGAATATGA
TGATGGGTGGTCATGAAAATGATCAGCGCCATGTCAGGTTGATGGAAGTGAAAGGCTCGA
GCATGAAAGGATTTTCAATGGGTTTTGGTAAAGGGAAGTTTGTTAGCCGTGGTAATGTAA
TGAGTGATGGCAATATGAGTGAAGAAGATGAGCCAAGTTTGACAGAAGATGGGAATGGTG
AGAACTCTGATGAGGGTAAGGGTAAAAAGGGTTCTCTGTGGCAGCGAATGAAATGGACCA
ATAATGTGATTAGGCTTCTTATAGCGGTGGTTGCTTTTGTTGGGGATGATTGTATCGGTG
ATGCTGGGGAGGGACTTAAGCGGAAATCAGGGGTTTTGCAAAAGAAGGGTAAGTGGAAAA
CAGTATCGAAGATAATGATTAGTAAGGGTTGTCACGTTTCACCGCAGCAGTGTGAGGATA
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GTTGTCGAGTGGTGGAGAATCCTGCTTTGATGGATTCATTGCCACATCTCTCAGCTAAAT
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CTTACCATAATGGTCAAAAGATACCGAACTGCCATGATATTGATCTACAAGGTTGTTCAG
TACCTCTTGAAGGATGCTCAAAAGATAATAATGTGTCAGATGAGGAAGAAGCTGAGAGGA
ACGATTACACTGAGGATGATGATACGGATGATGAAGACAATCGTAATGATGATGTGGATG
AAGAAAGAATGGATGAACCTGATGAAAGGAAGAATGGCAGAAAAGAGGATGGCCATTTCT
TGTCACAATCTGCTGGGCTGAATGGCTTTGAGGCTGAATTGTCCAGGACATTTCAAAATC
CCTCAAAGTCATTGTGGGAGAGAAGAGAGTGGATTAAAAAACAGAAGTTGCAACTCCAGG
AAGAAAGAGTCACCATCCAGGCTCAAGCTTTTGAGATTGAGAAACAGCGTTTAAAGTGGT
TGAGATATCGCACCAAAAAAGACAGGGAACTAGAGAGGTTGAGACTGGAGAATGAGAAAA
TGAGGTTAGATAATGAGCAAATGATATTGCACCTCAGGCGCAAACAACAGGAGGTAGATT
TCAGGAAGTCAGGGGCAAACTTAGATCCCACCTCATTTGAAATAAGAATGGAAGATAGAA
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TGACGTCAAGTGTGACAAACCATCGAGCAATTCTGTAGTAAAATTTTTGTGCTTAAAAGC
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GTTGTTGAATTTTCTGTTGTGAAGTTGAAAATTTATTGTAATAGCCTTTTGCCGCTGAAC
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TTTAGTTAATGAGTCCAAAGCGTTGACTGAAAACTACAGATTTAGATATAAATTTTCTAC
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AGAAAGTGTACTGTTTTAGATTTAAAAAGTAAACATGAATCCCATTAGGAGTATGTATAA
TTAAAGCTGGTGGGATAAACTCAGTTATTGTCTCCATGTTGGGTGGCATTACACAAGGGC
TATACTTTATTGTTCTTTGTTCATCTCCACTTGGAACTGGAAGAGTTGTGTTAAATTTGT
ATGGTTTGAAGTTATGACAATATATTTTGTCAATATGTTTTTTGGCTGGAAACAGTATGC
TGTACAACATAATTCTACAGGTGTGTGTAGGCTTTTGAATCTCTACAGAAGGACTGTTAG
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TGATTAAACAGAATTAATGGTGAATTTTTACTGCATATTACTTGACCTCCTCACTTGTAT
ATGCATGAACCGAGTTTTTGTCGCGCATGTTATAGTAATTTCCTTTATTTGTAATTATAT
TCTTCAGCATCTTGACCATTCCGGATTAATTTTGAATGTCATCAAGTTCTTCCTAATTTG
CATAGCAACTGAAAGAAATACATATGTTTCTTATGATTGTCATTGAAGATTTTTTATGTA
GTCTCAATTACTTGGCTCTTAAAGAGAAATGTGGTCTGTGTAAGAATTTTAAGGCTTAAA
GTATGAAACATGGATATTTTGATATTTGTATCCTATTTTATATCATCTCAATACTATGTA
TTATACAGGTCGAACTGTGAATAGAGCATCACATTCTTTTACTCTTCCCCAGTAATTTTA
GACTTGGCTTAAATTTTCAAATATCAACTAGATTCCCAAAGG
>LITCHI023980.m1
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TCTTCTTCGAAGGGCCCCCACGTTCCTCCCTGTCTTTGTCTGTGTCCTGTCATCCGACTA
AAATCTCCATTGTTTTTCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAATCTCCATT
GTTGATCACTACAACAGGAATAACAAGAAGAAGTTTTCTTGATACCAGTTGTTTGGTTGC
CTGGAAAATGAAGAAAGGTGGGATTTTTAGTTTTCTTATTATGGAAAGTTGAAGGGAGTT
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TTTTTCGGTATTGAAATGATCTCAGGTTGAAATTTTCTTGCTGATCAAACTAGAGCTTTC
GAGGGATTGTAATTCTAGAATTTGGTGTGTTGTGGAATGGATAATTTGGGTATGGGAGGA
GGGTTTTTGTCAGGTTCAAATGGGGGTTTGTTAGACCTTGAAACATCCATGTCTAGACAC
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GATGGCAATATGAGTGAAGAAGATGAGCCAAGTTTGACAGAAGATGGGAATGGTGAGAAC
TCTGATGAGGGTAAGGGTAAAAAGGGTTCTCTGTGGCAGCGAATGAAATGGACCAATAAT
GTGATTAGGCTTCTTATAGCGGTGGTTGCTTTTGTTGGGGATGATTGTATCGGTGATGCT
GGGGAGGGACTTAAGCGGAAATCAGGGGTTTTGCAAAAGAAGGGTAAGTGGAAAACAGTA
TCGAAGATAATGATTAGTAAGGGTTGTCACGTTTCACCGCAGCAGTGTGAGGATAAGTTT
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GATGATGTGAGAAAGATTCTGAACTCAAAACACTTGTTTTATATGGAAATGTGTGCTTAC
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CTTGAAGGATGCTCAAAAGATAATAATGTGTCAGATGAGGAAGAAGCTGAGAGGAACGAT
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AATTTTGCCTACATTTGTGTGGCTTTAGATTGACATACTGATGACATTAGAATTTGTTGT
TGAATTTTCTGTTGTGAAGTTGAAAATTTATTGTAATAGCCTTTTGCCGCTGAACTTCTT
TCCTTGTACCGATCATGCAGTATATCTGTTTTCCATTATATGATTTTGATTGAGATTTAG
TTAATGAGTCCAAAGCGTTGACTGAAAACTACAGATTTAGATATAAATTTTCTACTTAGT
GGTAAGTTAGAATAATTATTTCTGTGGTGATAGAAAGAGATGGGTCTGGTTATATAGAAA
GTGTACTGTTTTAGATTTAAAAAGTAAACATGAATCCCATTAGGAGTATGTATAATTAAA
GCTGGTGGGATAAACTCAGTTATTGTCTCCATGTTGGGTGGCATTACACAAGGGCTATAC
TTTATTGTTCTTTGTTCATCTCCACTTGGAACTGGAAGAGTTGTGTTAAATTTGTATGGT
TTGAAGTTATGACAATATATTTTGTCAATATGTTTTTTGGCTGGAAACAGTATGCTGTAC
AACATAATTCTACAGGTGTGTGTAGGCTTTTGAATCTCTACAGAAGGACTGTTAGGGTTG
TCTTTATGGACCTCTGATTTACTATAGTAAATTTTCTTCTACATCTGTAAAATTATTTTC
AGTTTCCTATGAAGAAAAGGCAAAATTTTTTGCAAAGCTAACTGCACTTAAACTGGGTTA
ATATTTTTGTTACCAGTATATTGCATGTGGTAGTGGCATGAATACTTGACAAAAGCAACA
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TGCTCCTGGTGTTACTGCTAAGAGAGTTTAGATGAGATTTCATCTTGATTAAACAGAATT
AATGGTGAATTTTTACTGCATATTACTTGACCTCCTCACTTGTATATGCATGAACCGAGT
TTTTGTCGCGCATGTTATAGTAATTTCCTTTATTTGTAATTATATTCTTCAGCATCTTGA
CCATTCCGGATTAATTTTGAATGTCATCAAGTTCTTCCTAATTTGCATAGCAACTGAAAG
AAATACATATGTTTCTTATGATTGTCATTGAAGATTTTTTATGTAGTCTCAATTACTTGG
CTCTTAAAGAGAAATGTGGTCTGTGTAAGAATTTTAAGGCTTAAAGTATGAAACATGGAT
ATTTTGATATTTGTATCCTATTTTATATCATCTCAATACTATGTATTATACAGGTCGAAC
TGTGAATAGAGCATCACATTCTTTTACTCTTCCCCAGTAATTTTAGACTTGGCTTAAATT
TTCAAATATCAACTAGATTCCCAAAGG
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CTCGCCGGACCCTTAAGCTCGTCCCTATGTCAGATTTACTTTAATGCATCCTCAGCTCGC
GATTGTGACAAGGTTTATCTCAACCTGTCTTTAGCTCACATAAGTAAACAGATTGATGAG
CTCGTACCAGGTAGTGTCTTAAAAAGCTAATGTCAAATCGTCCTGATTTCCAAATTTCAC
GTCGACTCAATCTCTACAGTTTCTGATGAGCATTTAATGCAGTGACAACTATACATTTAA
TACGGAGAAGATTTTACTTGAAATATTTAATGCAGGAGTGGACATATAAGAATAATCATT
GTTGTAGCAATAAATGCAGTATGGTCTGAGTCATATTAGTTGATAATAATGATGATTTTT
AGCGTGTAAAATACTCAATTGTCACCCCCCATCCTTTATAAATAGAGGGGATGTTCATTG
TAAAAGGAGACTTAACACTAGTATTATCGTCACTCTGTCAAAATATATTTAGGGTGACCC
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ATAAGACTTTTAAAGTAAGCAATTTTCACCTTTTTAAATTATCCAAAAATTTATTAGAAT
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AAGGAGAGACATTGCAGTTTATATAAATACATTTGCCAGTTTGTGTCTCAATTCACAAAC
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GTTCCTCCCTGTCTTTGTCTGTGTCCTGTCATCCGACTAAAATCTCCATTGTTTTTCTTC
AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAATCTCCATTGTTGATCACTACAACAGGAAT
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TTTCCTGTGATTGTCAGTTTTCTTGATACCAGTTGTTTGGTTGCCTGGAAAATGAAGAAA
GGTGGGATTTTTAGTTTTCTTATTATGGAAAGTTGAAGGGAGTTTTTGATGATTGTATGC
TTTTGTTTCTGATTATGGAAAAGCTTTTAGCAAACTGGGTTCTTTTTTTCGGTATTGAAA
TGATCTCAGGTTGAAATTTTCTTGCTGATCAAACTAGAGCTTTCGAGGGATTGTAATTCT
AGAATTTGGTGTGTTGTGGA
>LITCHI023980.m2 -  Up_Stream_Len 2000
AAAGGACGTATACAGTAGTGAAATGCTCAAAGGGCCCATTCCTCAAGTCGCGACTACGAG
CTCGCCGGACCCTTAAGCTCGTCCCTATGTCAGATTTACTTTAATGCATCCTCAGCTCGC
GATTGTGACAAGGTTTATCTCAACCTGTCTTTAGCTCACATAAGTAAACAGATTGATGAG
CTCGTACCAGGTAGTGTCTTAAAAAGCTAATGTCAAATCGTCCTGATTTCCAAATTTCAC
GTCGACTCAATCTCTACAGTTTCTGATGAGCATTTAATGCAGTGACAACTATACATTTAA
TACGGAGAAGATTTTACTTGAAATATTTAATGCAGGAGTGGACATATAAGAATAATCATT
GTTGTAGCAATAAATGCAGTATGGTCTGAGTCATATTAGTTGATAATAATGATGATTTTT
AGCGTGTAAAATACTCAATTGTCACCCCCCATCCTTTATAAATAGAGGGGATGTTCATTG
TAAAAGGAGACTTAACACTAGTATTATCGTCACTCTGTCAAAATATATTTAGGGTGACCC
GTGGACATAGACATACTTGCCGAACCACGTAAAAATTTTTGTCTTTGCATTCTTCTTTCT
CTCATTCTCTTGTTATTAATTGCTCCTTTACTATCACTCATCTACCTTAATGAGCATTCA
ATTGTTTTTATCACAATTTACCAACCTTAAACAACATTAATTCTTATTTATTATCAGGGT
AGCATTTGGATCTTTGGATCTCCAGGTCGACTGATTCTGAACGTCGACACTAACCTAATT
AGATTCTCATTAGCCCTAATTTTATTAGTATTGGGTTTCTATGTACTAAAGCTCATACTC
AATGGATATTTTTAGAACCTAATTAATATATCATTTATCTGGCCCTATTAAAATAGATAT
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ATAAGACTTTTAAAGTAAGCAATTTTCACCTTTTTAAATTATCCAAAAATTTATTAGAAT
GATTATCAAACAATGTAAGAAAAATTAAATAGAGGTTTGAAGATTAAAAATACACTTGTG
GTCAGTAGGTAATTCGTAATAAACGTGCATTAAAAAGGTTAATCCGAAATCATCGGAACA
AAATTGAAATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGAAAAAAAGATTCTCAGAAACTGT
TTTGGAGAAGGACATGACAAGACTGGCACACCTGAAGCTGCAACTTATTCTTCCGAGTAC
AAGGAGAGACATTGCAGTTTATATAAATACATTTGCCAGTTTGTGTCTCAATTCACAAAC
ACCCACCAACAACTTGACACGTTTTCTCCTTTTTCATCTTCTTCTTCGAAGGGCCCCCAC
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AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAATCTCCATTGTTGATCACTACAACAGGAAT
AACAAGAAGAAGGTAAGCTCTATACAACTCTTCTTCAGTTTTTCTTTTTATGAATCGCCT
GAACAAAATCGACCCTTTGATAAGGGTATCTGTTTTATTTTTGTTTATGAGTTGATATGA
TAGTCAAAGCTAAGATTTTGATAGATGGGGTGTTGATAAGTTGAGCTAATCTGTATTGGG
TTTCCTGTGATTGTCAGTTTTCTTGATACCAGTTGTTTGGTTGCCTGGAAAATGAAGAAA
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TTTTGTTTCTGATTATGGAAAAGCTTTTAGCAAACTGGGTTCTTTTTTTCGGTATTGAAA
TGATCTCAGGTTGAAATTTTCTTGCTGATCAAACTAGAGCTTTCGAGGGATTGTAATTCT
AGAATTTGGTGTGTTGTGGA
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>LITCHI023980.m1 GenomeSequence - 
AAAAAGATTCTCAGAAACTGTTTTGGAGAAGGACATGACAAGACTGGCACACCTGAAGCT
GCAACTTATTCTTCCGAGTACAAGGAGAGACATTGCAGTTTATATAAATACATTTGCCAG
TTTGTGTCTCAATTCACAAACACCCACCAACAACTTGACACGTTTTCTCCTTTTTCATCT
TCTTCTTCGAAGGGCCCCCACGTTCCTCCCTGTCTTTGTCTGTGTCCTGTCATCCGACTA
AAATCTCCATTGTTTTTCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAATCTCCATT
GTTGATCACTACAACAGGAATAACAAGAAGAAGGTAAGCTCTATACAACTCTTCTTCAGT
TTTTCTTTTTATGAATCGCCTGAACAAAATCGACCCTTTGATAAGGGTATCTGTTTTATT
TTTGTTTATGAGTTGATATGATAGTCAAAGCTAAGATTTTGATAGATGGGGTGTTGATAA
GTTGAGCTAATCTGTATTGGGTTTCCTGTGATTGTCAGTTTTCTTGATACCAGTTGTTTG
GTTGCCTGGAAAATGAAGAAAGGTGGGATTTTTAGTTTTCTTATTATGGAAAGTTGAAGG
GAGTTTTTGATGATTGTATGCTTTTGTTTCTGATTATGGAAAAGCTTTTAGCAAACTGGG
TTCTTTTTTTCGGTATTGAAATGATCTCAGGTTGAAATTTTCTTGCTGATCAAACTAGAG
CTTTCGAGGGATTGTAATTCTAGAATTTGGTGTGTTGTGGAATGGATAATTTGGGTATGG
GAGGAGGGTTTTTGTCAGGTTCAAATGGGGGTTTGTTAGACCTTGAAACATCCATGTCTA
GACACCCGCAAAACCAGTTTGGTCATCCATCACTAACTCATCAAAATCACATGAATATGA
TGATGGGTGGTCATGAAAATGATCAGCGCCATGTCAGGTTGATGGAAGTGAAAGGCTCGA
GCATGAAAGGATTTTCAATGGGTTTTGGTAAAGGGAAGTTTGTTAGCCGTGGTAATGTAA
TGAGTGATGGCAATATGAGTGAAGAAGATGAGCCAAGTTTGACAGAAGATGGGAATGGTG
AGAACTCTGATGAGGGTAAGGGTAAAAAGGGTTCTCTGTGGCAGCGAATGAAATGGACCA
ATAATGTGATTAGGCTTCTTATAGCGGTGGTTGCTTTTGTTGGGGATGATTGTATCGGTG
ATGCTGGGGAGGGACTTAAGCGGAAATCAGGGGTTTTGCAAAAGAAGGGTAAGTGGAAAA
CAGTATCGAAGATAATGATTAGTAAGGGTTGTCACGTTTCACCGCAGCAGTGTGAGGATA
AGTTTAATGACCTTAATAAGAGGTACAAGAGGTTGAATGATATTCTTGGCAGGGGGATTA
GTTGTCGAGTGGTGGAGAATCCTGCTTTGATGGATTCATTGCCACATCTCTCAGCTAAAT
TGAAGGATGATGTGAGAAAGATTCTGAACTCAAAACACTTGTTTTATATGGAAATGTGTG
CTTACCATAATGGTCAAAAGATACCGAACTGCCATGATATTGATCTACAAGGTTGTTCAG
TACCTCTTGAAGGATGCTCAAAAGATAATAATGTGTCAGATGAGGAAGAAGCTGAGAGGA
ACGATTACACTGAGGATGATGATACGGATGATGAAGACAATCGTAATGATGATGTGGATG
AAGAAAGAATGGATGAACCTGATGAAAGGAAGAATGGCAGAAAAGAGGATGGCCATTTCT
TGTCACAATCTGCTGGGCTGAATGGCTTTGAGGCTGAATTGTCCAGGACATTTCAAAATC
CCTCAAAGTCATTGTGGGAGAGAAGAGAGTGGATTAAAAAACAGAAGTTGCAACTCCAGG
AAGAAAGAGTCACCATCCAGGCTCAAGCTTTTGAGATTGAGAAACAGCGTTTAAAGTGGT
TGAGATATCGCACCAAAAAAGACAGGGAACTAGAGAGGTTGAGACTGGAGAATGAGAAAA
TGAGGTTAGATAATGAGCAAATGATATTGCACCTCAGGCGCAAACAACAGGAGGTAGATT
TCAGGAAGTCAGGGGCAAACTTAGATCCCACCTCATTTGAAATAAGAATGGAAGATAGAA
ACCAAACTGATATGGGCAGGCATTAATTGCTCCTTTCCATAAGTAATAACATTTTTATGG
TGACGTCAAGTGTGACAAACCATCGAGCAATTCTGTAGTAAAATTTTTGTGCTTAAAAGC
ACATTAATTTTGCCTACATTTGTGTGGCTTTAGATTGACATACTGATGACATTAGAATTT
GTTGTTGAATTTTCTGTTGTGAAGTTGAAAATTTATTGTAATAGCCTTTTGCCGCTGAAC
TTCTTTCCTTGTACCGATCATGCAGTATATCTGTTTTCCATTATATGATTTTGATTGAGA
TTTAGTTAATGAGTCCAAAGCGTTGACTGAAAACTACAGATTTAGATATAAATTTTCTAC
TTAGTGGTAAGTTAGAATAATTATTTCTGTGGTGATAGAAAGAGATGGGTCTGGTTATAT
AGAAAGTGTACTGTTTTAGATTTAAAAAGTAAACATGAATCCCATTAGGAGTATGTATAA
TTAAAGCTGGTGGGATAAACTCAGTTATTGTCTCCATGTTGGGTGGCATTACACAAGGGC
TATACTTTATTGTTCTTTGTTCATCTCCACTTGGAACTGGAAGAGTTGTGTTAAATTTGT
ATGGTTTGAAGTTATGACAATATATTTTGTCAATATGTTTTTTGGCTGGAAACAGTATGC
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GGTTAATATTTTTGTTACCAGTATATTGCATGTGGTAGTGGCATGAATACTTGACAAAAG
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CTTGACCATTCCGGATTAATTTTGAATGTCATCAAGTTCTTCCTAATTTGCATAGCAACT
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>LITCHI023980.m2 GenomeSequence - 
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