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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI011438 | Chr8 | 21589001 | 21594983 | - | Transcription factor VIP1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI011438.m1 | 174 | 225 | PF07716.18 | bZIP_2 | Coiled-coil | 33.3 | 4.10E-08 |
LITCHI011438.m1 | 176 | 230 | PF00170.24 | bZIP_1 | Coiled-coil | 32.4 | 8.20E-08 |
LITCHI011438.m2 | 174 | 225 | PF07716.18 | bZIP_2 | Coiled-coil | 33.9 | 2.60E-08 |
LITCHI011438.m2 | 176 | 223 | PF00170.24 | bZIP_1 | Coiled-coil | 33.2 | 4.60E-08 |
LITCHI011438.m3 | 174 | 224 | PF07716.18 | bZIP_2 | Coiled-coil | 33.8 | 2.90E-08 |
LITCHI011438.m3 | 176 | 223 | PF00170.24 | bZIP_1 | Coiled-coil | 37.2 | 2.60E-09 |
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>LITCHI011438.m1 ATGGACGGCGGGAAGCAGCCGATGAGAACGGACATAGAGGAGATGCCAGAGACGCCGCAG CACCGTGGGATCCTCCACCGTCGGGCCCACTCCGACACGTCCTACCGTTTCGACGACCTC CTTCTCTTCGACCCCTCCGACCTCGACCTCTCCTCCCTCGACCTCCCCTCTCCCAGTCCC ACGCCACCACGTGTCCCCCAGCAACAGCAACAGCCGATGTCCGTCGACTCCTCCGACGAC TCCTCTTCCAACAACAAGCACAAGCCTATCAACCACCTCCGTAGCCTCTCTGTTGACTCC GATTTCTTCGACAGCTTGGGTTTGACTTCTGCTGCTCCTGCTGCTTCTGCTGGCGGCAAG AATGCTGTCGTCCCTGGTGCAGGAGAGAAGAGGGGTTATCATAGGCACAGTAACTCCATG GATGGCGCCAGTACGGCTTCCTTTGACGTTGATTCTGTTCTGGGAGATGCCGCCAAGAAA TCCATGGATCGTGATAGGCTTGCTGAGCTCGCTCTTATTGATCCCAAAAGAGCCAAAAGG ATTCTTGCTAATAGGCAGTCTGCTGCGCGGTCCAAGGAGAGAAAGATTAGATATACTAAT GAGCTTGAAAGGAAAGTGCAGACACTTCAAACTGAAGCAACTACCTTGTCCGCACAGGTC ACTATGTTGCAGAGAGACACCACTGGGCTATCAGCTGAGAATAAAGAACTCAAGCTGCGG CTACAAGCTATGGAGCAACAAGCACAGCTTAGAGATGCTCTAAATGAGGCGTTAAGAGAA GAAGTGCAGCGGCTTAAGATAGCTACTGGCCAGATTCCATCTGTCAATGGGAACCCTTTT GGCAGAGCACTACCTCCCCAATTTCCCCAGCACCAGCCTGCCTTACATCACTTTGGTGGC CAGCAGACTCAGCAGCATCAACAGCAGCAGCAGCAGCAACTACAAATGCCTCAGTCAACC AATAATCCAACTCTCCGTGGGCAGTCACACCCTAGTTTCATGGACTTTAACCAGAAGGTC TAG >LITCHI011438.m2 ATGGACGGCGGGAAGCAGCCGATGAGAACGGACATAGAGGAGATGCCAGAGACGCCGCAG CACCGTGGGATCCTCCACCGTCGGGCCCACTCCGACACGTCCTACCGTTTCGACGACCTC CTTCTCTTCGACCCCTCCGACCTCGACCTCTCCTCCCTCGACCTCCCCTCTCCCAGTCCC ACGCCACCACGTGTCCCCCAGCAACAGCAACAGCCGATGTCCGTCGACTCCTCCGACGAC TCCTCTTCCAACAACAAGCACAAGCCTATCAACCACCTCCGTAGCCTCTCTGTTGACTCC GATTTCTTCGACAGCTTGGGTTTGACTTCTGCTGCTCCTGCTGCTTCTGCTGGCGGCAAG AATGCTGTCGTCCCTGGTGCAGGAGAGAAGAGGGGTTATCATAGGCACAGTAACTCCATG GATGGCGCCAGTACGGCTTCCTTTGACGTTGATTCTGTTCTGGGAGATGCCGCCAAGAAA TCCATGGATCGTGATAGGCTTGCTGAGCTCGCTCTTATTGATCCCAAAAGAGCCAAAAGG ATTCTTGCTAATAGGCAGTCTGCTGCGCGGTCCAAGGAGAGAAAGATTAGATATACTAAT GAGCTTGAAAGGAAAGTGCAGACACTTCAAACTGAAGCAACTACCTTGTCCGCACAGGTC ACTATGTTGCAGAGAGACACCACTGGGCTATCAGCTGAGAATAAAGAACTCAAGCTGCGG CTACAAGCTATGGAGCAACAAGCACAGCTTAGAGATGGTAGGCTTGTTTAA >LITCHI011438.m3 ATGGACGGCGGGAAGCAGCCGATGAGAACGGACATAGAGGAGATGCCAGAGACGCCGCAG CACCGTGGGATCCTCCACCGTCGGGCCCACTCCGACACGTCCTACCGTTTCGACGACCTC CTTCTCTTCGACCCCTCCGACCTCGACCTCTCCTCCCTCGACCTCCCCTCTCCCAGTCCC ACGCCACCACGTGTCCCCCAGCAACAGCAACAGCCGATGTCCGTCGACTCCTCCGACGAC TCCTCTTCCAACAACAAGCACAAGCCTATCAACCACCTCCGTAGCCTCTCTGTTGACTCC GATTTCTTCGACAGCTTGGGTTTGACTTCTGCTGCTCCTGCTGCTTCTGCTGGCGGCAAG AATGCTGTCGTCCCTGGTGCAGGAGAGAAGAGGGGTTATCATAGGCACAGTAACTCCATG GATGGCGCCAGTACGGCTTCCTTTGACGTTGATTCTGTTCTGGGAGATGCCGCCAAGAAA TCCATGGATCGTGATAGGCTTGCTGAGCTCGCTCTTATTGATCCCAAAAGAGCCAAAAGG ATTCTTGCTAATAGGCAGTCTGCTGCGCGGTCCAAGGAGAGAAAGATTAGATATACTAAT GAGCTTGAAAGGAAAGTGCAGACACTTCAAACTGAAGCAACTACCTTGTCCGCACAGGTC ACTATGTTGCAGGTACAAATTTTGCTTGTATTATCTTAA
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TTAAATGTTGTTTTTTTGGCGTTTAATTACTTGCAAGTTTTGAATATCTGGAACAATAAA GTAGTTAT
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