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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI011404 | Chr8 | 20572047 | 20576193 | - | LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RCH1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI011404.m1 | 26 | 67 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 27.4 | 3.40E-06 |
LITCHI011404.m1 | 288 | 347 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28.6 | 9.40E-07 |
LITCHI011404.m1 | 408 | 430 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 11.1 | 0.53 |
LITCHI011404.m1 | 504 | 563 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 32.3 | 6.80E-08 |
LITCHI011404.m1 | 769 | 1038 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 156.3 | 1.10E-45 |
LITCHI011404.m1 | 770 | 1040 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 145.5 | 1.80E-42 |
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>LITCHI011404.m1 ATGTCAAGCAATAATGGAATGACAATTATTATCTTGTTCCTTAACATCTCTCTGTTACCA GCCATCTTTGCCTTGAATGAAGAAGGTGTCTCTCTGCTTTCATGGCTTTCAGCATTTGGT TCTTCTTCATCAGCCACTTTCTTCTCTTCATGGAATCCAAGCCACCAAAATCCATGCAAC TGGGATTACATCAAATGTTCCAGTGATGGACATGTTTCAGAAATCACTATAACTTCCATA CATATTCCCACCAGGTTCCCGAGTCAGCTACTCTCCTTGAGTCAGCTCACCAATCTAGTC CTTTCGAATGCAAACCTGACAGGAGAAATTCCTTCTTCTGTAGGAAATTTGTCCTCATTG GTTAACTTGGACCTCAGCTTCAATGCACTGACCGGGAACATCCCAGCTGAAATAGGAAAG TTAGCTGAACTGCAGTTTCTAAAACTGAATTCCAATATCTTACATGGTCAAATCCCAAGA GATATTGGAAACTGTTCGAAGCTTCGACAACTTGAACTTTTCGATAACCAGCTATCAGGA AAGATTCCTCCTGAAATAGGAAAGCTGCAGGGTTTACAGATTTTTCGCGGTGGTGGCAAT TCAGGAATTCATGGTGAGATTCCTTGGGAGATATCCAACTGCAAAGGGCTAGTTTTCCTT GGTCTTGCAGACACAGGGATTTCAGGGCAGCTTCCAAGTAGTATTGGGGAGTTGAAGAAT CTCAAGACTCTTTCAATATACACAGCCAATATCAGTGGTAATATCCCACCAGAAATCGGT AACTGCTCAGCTTTAGAGAACCTGTTTCTGTATGAAAATCAAATCTCTGGGAAGATTCCA GATGAGTTGGGTTCATTGAAAAATCTCAGAAAGTTGTTACTGTGGCAGAACGATCTGAGG GGGAGCATTCCAGAAGCTTTAGGAAATTGTTCTAGTTTGACAGTTATTGACATCTCGTTG AATTCTTTAAGTGGAGAGGTTCCTCTATCTCTTGCAAATTTAGTTGCATTGGAGGAGCTT CTTTTGTCTATGAACAACATTTCTGGAGAGATACCATCATTTATTGGCAACTTTTCTGGT CTAAAGCAACTGGAATTAGATAACAACAGATTTTTCGGTGAGATTCCACCCGTCATTGGG CAATTGAAGGAGCTTTTGCTGTTTTTTGCCTGGCAGAATCAGCTTCATGGAAGCATACCA GCCGAACTAGCCAACTGTAAGAAACTTCAAGCATTGGATCTTTCACACAATTTCCTTGCA GGGTCAGTTCCGAATTCTCTTTTCAATCTCAACAACTTGACCCAGTTGATGTTGATATCA AACCGTTTTTCAGGTGAACTGCCACCTGATATTGGCAGTTGCACAGGTTTGATCCGTCTA CGACTAGGATCAAATAACTTCTCTGGTCATATTCCATCACAAATAGGGCTTCTCCATAGA CTCAGCTTCCTTGAACTGTCAGAAAACCAATTCATGGGAGACATACCTCCTGAAATTGGC AACTGCACTCAGTTAGAACTGGTAGATTTACACAAAAATAAGCTTCAAGGCACAATCCCA TCATCTTTCGAATTTCTTGTTGGTCTTAATGTTTTAGACCTTTCGAAAAACAGTATAGGA GGCACCATTCCTGAGAATCTGGGCAAGCTTACTTCCCTAAACAAACTGGTACTCAGAGAA AATAACATCACTGGCTTGATTCCCAAGTCACTCGGGCTCTGTAAGGATTTGCAACTGTTG GATGTGAGCAGCAACAGATTAACAGGTTCGATACCAGTAGAGATCGGTTGCTTGCAAGAA CTAGACATCCTCTTGAACTTGAGCTCTAATGCTCTAACCAGTCCCATTCCAGAAAGTTTT TCGAACCTCTCAAAGCTTGCCAACTTAGACCTCTCCAACAACATGCTATCAGGAAGCTTG AGGGCACTGGGTATTCTTGACAATCTTGTTTCACTGGATGTCTCAAACAATAATTTTTCT GGCAACCTCCCAAACACTAAGCTCTTTCGTGAGCTCCCTGCCTCTGCATTTGCTGGCAAT CCGGACCTTTGTATTAACAGAAGTCAGTGCAACAGAGGTGATAGTCTACATGGCAGTAGG TCCACCAAAAATCTTGTTCTCTACGCTTTTCTCAGTGTAACTGCAACTATGCTGATTCTA CTTTTTGGAGTTGTTTTGATTATCAGAGTTCGCGGAACCGCATACAGTGGGAATGATGAA GAAGAAAGTGATTTGGAATGGAATTTTACTCCATTTCAAAAGCTTAATTTCTCTGTAAAC GATGTTGTGACAAAGCTGTCAGATACAAATGTCATTGGCAAAGGTTGTTCAGGCATGGTT TACCGTGTGGAGACTCCAACAAAACAGATCATTGCAGTAAAGAAGCTATGGTCAGTTAAA AATGGAGAGGCTCCACAGAGAGACCTCTTCTCTGCAGAGGTCCAGACTTTGGGATCCATC AGGCATAAGAACATCGTCAGGCTTCTGGGATGTTGCAACAACGGAAGAACGAGACTGCTC TTGTTTGATTACATCAGCAATGGGAGCCTGGCTAGTTTGCTGCATGAGAAGAAGGTTTTC TTGGACTGGGATGCAAGGTATAAGATCATACTAGGAGCAGCGCATGGTTTAGCTTATCTT CACCATGACTGCATTCCTCCCATTGTTCACCGCGATATCAAGGCCAACAACATCTTGGTA GGACCACAATTTGAAGCTTACCTTGCAGATTTTGGACTGGCAAAGCTTATAGATTCTTCA GAATGCTCAACAGTTTCCAACACAGTTGCAGGTTCCTATGGCTACATAGCTCCCGAATAT GGATACAGTTTGAAGATCACGGAGAAGAGTGATGTGTACAGCTATGGCGTTGTGCTTCTA GAGGTATTAACTGGAAAGGAACCTACAGATAACCGGATTCCGGAGGGTGCCCACATTATC ACTTGGATTAACAGGGAACTCAGAGAAAGAAAAAGGGATTTCACAGCAATTCTGGACCAG CAACTACTAATGAGGTCAAGTACACAAATTCAAGAGATGCTTCAAGTGCTCGGCGTGGCT CTCCTCTGCGTAAATTCTTGCCCAGAGGAACGACCAACAATGAAAGATGTAACAGCAATG CTTAAAGAGATCATACATGAAAATGATGATTGTGAAAAGCCAATTTCTCTTGGCAAAGTA GTGACCAACCCAAATACAGCAGTTCACTGTTCCAGTTTCTCCAGATCATCCGAACCTCTA ATTAGATCACCTTCCTAA
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>LITCHI011404.m1 GTGGCATAATAACTCAGTAAGAGGAGAATAAGCAAGCAGAAAATTCTTTACTAAAAATAA GTACATAAAATGAATCAATATGAAGGGCAATAGTTTGGCAATAATTTAAAAGGAAGACAA GCTTTTCATCACCCCAATCATAAAGTATGCAAATTTGGGCACTTTATTCCCAAAATATGC ATCTAATAGCATAAATCCTTTCTATTTCTCTTGTTATTGGAAACGATAACTTGATCTGTA CCTCCTTTCTCTACAATCTACCTCATGACAACAAATGCTTGCTTTTCAAAAAACTGTTAC GGAAGGTTTCAAGATTGCATTTGCTGAAAAGGAGCCCAGAAGTGTATGCAAGGATTCCAC TAATCCACAAGAAGTGGAACATTGAGAAAGATTTGAGGGGCTGGTGTTGCCAAAACCAGA TGAGTTAGAAAAAGGACACACAGCCTCACCATGTCAAGCAATAATGGAATGACAATTATT ATCTTGTTCCTTAACATCTCTCTGTTACCAGCCATCTTTGCCTTGAATGAAGAAGGTGTC TCTCTGCTTTCATGGCTTTCAGCATTTGGTTCTTCTTCATCAGCCACTTTCTTCTCTTCA TGGAATCCAAGCCACCAAAATCCATGCAACTGGGATTACATCAAATGTTCCAGTGATGGA CATGTTTCAGAAATCACTATAACTTCCATACATATTCCCACCAGGTTCCCGAGTCAGCTA CTCTCCTTGAGTCAGCTCACCAATCTAGTCCTTTCGAATGCAAACCTGACAGGAGAAATT CCTTCTTCTGTAGGAAATTTGTCCTCATTGGTTAACTTGGACCTCAGCTTCAATGCACTG ACCGGGAACATCCCAGCTGAAATAGGAAAGTTAGCTGAACTGCAGTTTCTAAAACTGAAT TCCAATATCTTACATGGTCAAATCCCAAGAGATATTGGAAACTGTTCGAAGCTTCGACAA CTTGAACTTTTCGATAACCAGCTATCAGGAAAGATTCCTCCTGAAATAGGAAAGCTGCAG GGTTTACAGATTTTTCGCGGTGGTGGCAATTCAGGAATTCATGGTGAGATTCCTTGGGAG ATATCCAACTGCAAAGGGCTAGTTTTCCTTGGTCTTGCAGACACAGGGATTTCAGGGCAG CTTCCAAGTAGTATTGGGGAGTTGAAGAATCTCAAGACTCTTTCAATATACACAGCCAAT ATCAGTGGTAATATCCCACCAGAAATCGGTAACTGCTCAGCTTTAGAGAACCTGTTTCTG TATGAAAATCAAATCTCTGGGAAGATTCCAGATGAGTTGGGTTCATTGAAAAATCTCAGA AAGTTGTTACTGTGGCAGAACGATCTGAGGGGGAGCATTCCAGAAGCTTTAGGAAATTGT TCTAGTTTGACAGTTATTGACATCTCGTTGAATTCTTTAAGTGGAGAGGTTCCTCTATCT CTTGCAAATTTAGTTGCATTGGAGGAGCTTCTTTTGTCTATGAACAACATTTCTGGAGAG ATACCATCATTTATTGGCAACTTTTCTGGTCTAAAGCAACTGGAATTAGATAACAACAGA TTTTTCGGTGAGATTCCACCCGTCATTGGGCAATTGAAGGAGCTTTTGCTGTTTTTTGCC TGGCAGAATCAGCTTCATGGAAGCATACCAGCCGAACTAGCCAACTGTAAGAAACTTCAA GCATTGGATCTTTCACACAATTTCCTTGCAGGGTCAGTTCCGAATTCTCTTTTCAATCTC AACAACTTGACCCAGTTGATGTTGATATCAAACCGTTTTTCAGGTGAACTGCCACCTGAT ATTGGCAGTTGCACAGGTTTGATCCGTCTACGACTAGGATCAAATAACTTCTCTGGTCAT ATTCCATCACAAATAGGGCTTCTCCATAGACTCAGCTTCCTTGAACTGTCAGAAAACCAA TTCATGGGAGACATACCTCCTGAAATTGGCAACTGCACTCAGTTAGAACTGGTAGATTTA CACAAAAATAAGCTTCAAGGCACAATCCCATCATCTTTCGAATTTCTTGTTGGTCTTAAT GTTTTAGACCTTTCGAAAAACAGTATAGGAGGCACCATTCCTGAGAATCTGGGCAAGCTT ACTTCCCTAAACAAACTGGTACTCAGAGAAAATAACATCACTGGCTTGATTCCCAAGTCA CTCGGGCTCTGTAAGGATTTGCAACTGTTGGATGTGAGCAGCAACAGATTAACAGGTTCG ATACCAGTAGAGATCGGTTGCTTGCAAGAACTAGACATCCTCTTGAACTTGAGCTCTAAT GCTCTAACCAGTCCCATTCCAGAAAGTTTTTCGAACCTCTCAAAGCTTGCCAACTTAGAC CTCTCCAACAACATGCTATCAGGAAGCTTGAGGGCACTGGGTATTCTTGACAATCTTGTT TCACTGGATGTCTCAAACAATAATTTTTCTGGCAACCTCCCAAACACTAAGCTCTTTCGT GAGCTCCCTGCCTCTGCATTTGCTGGCAATCCGGACCTTTGTATTAACAGAAGTCAGTGC AACAGAGGTGATAGTCTACATGGCAGTAGGTCCACCAAAAATCTTGTTCTCTACGCTTTT CTCAGTGTAACTGCAACTATGCTGATTCTACTTTTTGGAGTTGTTTTGATTATCAGAGTT CGCGGAACCGCATACAGTGGGAATGATGAAGAAGAAAGTGATTTGGAATGGAATTTTACT CCATTTCAAAAGCTTAATTTCTCTGTAAACGATGTTGTGACAAAGCTGTCAGATACAAAT GTCATTGGCAAAGGTTGTTCAGGCATGGTTTACCGTGTGGAGACTCCAACAAAACAGATC ATTGCAGTAAAGAAGCTATGGTCAGTTAAAAATGGAGAGGCTCCACAGAGAGACCTCTTC TCTGCAGAGGTCCAGACTTTGGGATCCATCAGGCATAAGAACATCGTCAGGCTTCTGGGA TGTTGCAACAACGGAAGAACGAGACTGCTCTTGTTTGATTACATCAGCAATGGGAGCCTG GCTAGTTTGCTGCATGAGAAGAAGGTTTTCTTGGACTGGGATGCAAGGTATAAGATCATA CTAGGAGCAGCGCATGGTTTAGCTTATCTTCACCATGACTGCATTCCTCCCATTGTTCAC CGCGATATCAAGGCCAACAACATCTTGGTAGGACCACAATTTGAAGCTTACCTTGCAGAT TTTGGACTGGCAAAGCTTATAGATTCTTCAGAATGCTCAACAGTTTCCAACACAGTTGCA GGTTCCTATGGCTACATAGCTCCCGAATATGGATACAGTTTGAAGATCACGGAGAAGAGT GATGTGTACAGCTATGGCGTTGTGCTTCTAGAGGTATTAACTGGAAAGGAACCTACAGAT AACCGGATTCCGGAGGGTGCCCACATTATCACTTGGATTAACAGGGAACTCAGAGAAAGA AAAAGGGATTTCACAGCAATTCTGGACCAGCAACTACTAATGAGGTCAAGTACACAAATT CAAGAGATGCTTCAAGTGCTCGGCGTGGCTCTCCTCTGCGTAAATTCTTGCCCAGAGGAA CGACCAACAATGAAAGATGTAACAGCAATGCTTAAAGAGATCATACATGAAAATGATGAT TGTGAAAAGCCAATTTCTCTTGGCAAAGTAGTGACCAACCCAAATACAGCAGTTCACTGT TCCAGTTTCTCCAGATCATCCGAACCTCTAATTAGATCACCTTCCTAACTGCCATACTTT CCCAAAATCTTGCACTTCAGGCATATATATATATATATATATATATA
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>LITCHI022167.m1 - Up_Stream_Len 2000 ACAATGCCAAAATTAATTAAAAAGCTGGACCACATACGGCTTTGTTTTCGCAAGGTACGT TGCAAATGCGGGGACCGTTCACTTTTCACCATTGGCCATCTCTGCCGCTAGATTTCGACT GGGTTCAACTTAATTAGTAAGACCAGGGGTTGAAACCTTGTAATGTAATGTACTGAAACT TTCATAGCATTGAAAAAGCTTTTAAAAAAAGATGTAATTGACATTGAAAAGTTGCCATAC CATCGATTAAAGGTTGATTTTCTTTAGCAGACTCATACAAGATATAGCCTTTGACATACA GAGGCTTCTGTTCCTTTATCATCTTCCTATTTCTCTGTTGCTCTGAATTCTTGTATGATT GAAGCAATACTTCGACACAAAAAAGTTAAATAACTTAACTAATCATCTGTGTTTCCGTGC ATGTATCTCTGATAATTTGATTTTAGATTAATTATAAATACATCCGTAGTAAAAATATTG TTGTAATAGAGAATAAGGGTGTTAGTATGGTAAACCATTGTCACCTGTCTTTTAAATGAT AATTCGATTTTCAACAGTCTTATCATTTATGTGGACAATCCTCTTCCGATATTTAAAGTT GTAATCCTAATTATATGATTAGAGTTTCATTTAGACTCATTTCGATAGTAATCTGAGTGG TAAAAAGGTGTTTAATAATAAAAAATATATATTATTGTAATAAATAACACAGTGCATCCT TTCTAAATTTTCTTAAACTATTGACGTGACCTTTTGAGTTTTTTACAGTTAAACGGTTTA GAAATGACAGCTACTAAACTGTCAAAATCAGTACTGCAAAGTTGCTGAGTAAAAAGGCAA CAACTTGGGGGTCCAAAGACAAAGACTCTGCCAACTCCTCTAGTCCAGTATGAGCCCTAA AGAACATTTTTGGAGGGGCACACATCCGAAGGCAAAGCATGAAGTGTCCACACCAATTTG CAAGTTTTGATTTCGACACGTGGCACACTAGAAAATTTTATTTATATGGATCTATGGCCG TCATCGACCAGAAAATTAGCGTCCAAATTGAGAGGTTGGTAAATGAAGCCAAAACACCGG TATTATTGGTCTTTTGCTCTTTAGACACATCAGTTCTCACCAGTCACTGCCACCACCACC ACCTTCACTCTGCCAATTTATCATCTTACATTTACATTATATTGTCCCTACAGTTTTAGT CATTCATCTTCTTCTTCTGTGTATATATGCATAGTCACATCAACCTTTCACTATCAATTT TTTCTAGCATTTGCATTGCGATGCACCCTCCGAAAACGACTAAAGTTTTGATAGATTTAA CACTACCAAGTACCAAAATTTACTGAGATATTTTCTACCAGAAGAGGTTGAAGATGGGAA TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCGTTGTTATGTAGCGTGGAAAATTTAGATTAGATTTTC ATGGGCCATTGTAGTGAGAGTGTGAACAGCTTTTGGCAGGAGGAGACAGTGCTATCGACA ATGAAGGGACTGTGTCCTTACGAGTCTGACGAACAAGGAACATGAACATGAGCATCATTT TGGTAGCATGTAAACATCTTAATTAAAAATGCTAAACTAAAAAACAAATGAGGACAAGTG TCGGATTAGGGTCTTAAGTTTGCACCAAGCTCTGTAACCCAAGTGAGAAACTGACAAATT TGATAGGTGCAGGTTTAAGGATTTAATTAGCAAGACCCCACCAAATCATAGGCCCATGTG ATGCAGATTTGTGGGACAAATTACATATGCCCTTCTTAATTGAACTTACCAAATATCACA ATGTCCCTATTAATGCTATTTTCAAGTAACTTATGTTGTGTCTTGCCAGCCCCCACTTCA CTCACTCTCTTTTTAAGTTGCTTGTGCTGCCCCATTTTAACTTCCCCACAAAGCCACTGA TAGTAGCAGTAGAGGACTACTACCATTAGCAGCACTACGAGAGTTTAAAAAAGAGAGCAA GCTCACTCACAGCTTCAAAT
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>LITCHI022167.m1 GenomeSequence - GTTTGCACCAAGCTCTGTAACCCAAGTGAGAAACTGACAAATTTGATAGGTGCAGGTTTA AGGATTTAATTAGCAAGACCCCACCAAATCATAGGCCCATGTGATGCAGATTTGTGGGAC AAATTACATATGCCCTTCTTAATTGAACTTACCAAATATCACAATGTCCCTATTAATGCT ATTTTCAAGTAACTTATGTTGTGTCTTGCCAGCCCCCACTTCACTCACTCTCTTTTTAAG TTGCTTGTGCTGCCCCATTTTAACTTCCCCACAAAGCCACTGATAGTAGCAGTAGAGGAC TACTACCATTAGCAGCACTACGAGAGTTTAAAAAAGAGAGCAAGCTCACTCACAGCTTCA AATATGTCTAGCCAACGTACTAGTTCTGGTTCAAAGATAACAGAAGATCAGATTAATCAT CTCATCTCCAAGCTACAAGAATTGCTACCTCAGCTTAATGGACGACGCAACGGAAAGGTA CAACTTATAAGCATGCAGCTAGCTATATTATACCTTTGGTTGATTGAGGGTTGCCTATTG TGACATAATAATAACAATAATAATGCATGCTAATTCATGACCATGGTTGGTTTTTAATTT TCTTGGAAAAACTTCTGTGCCAGGTATCAGCATCAAAAGTCTTGAAGGAAACATGCAGTT ACATCAGGAGATTACACAGTGAAGTAGATGACCTGAGTGAAAAATTGTCTCAACTGCTGA ATTCAGTGGGCATCACTAATGTTGATGACATTCTAGAGCTTTGATAAAAAAATTTACTGC ATCATAATTAATAGTCCTTTCTCTGTTGTAACAGCACCTGAGAAAGATATCTCTCTGTCT CTGTTCTCTCTCTCTATATATATACATATAGAATTGTATTTTCCTCTATTTTATATATAT 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