Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI011340Chr81867136318673126-Scarecrow-like protein 1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI011340.m1219587PF03514.17GRASFamily453.74.80E-136
Download   Copy
>LITCHI011340.m1
ATGTCATTAGTTAGGTCTGCAGAGCCATCTACTACATCGTATGGAAATTCTAAGCTTTAT
TCGTTAAAGGGGAGGGGTGACAATTCTGCCTTGTCTACTCAAGTATTCAGCTCTGACAAA
CATAAGATGATGTACATGACTGATTCTTACAGCAGTGAGAGCTACGAGAAGTACTTCCTT
GACTCTCCAACAGAAGAACTCGTGCATCCTTCAAGTTCTACTGTCTCAGACAATTACTTT
CCCCCGGAAGATGCCTCTTCTTACCAGCTAAGAGTTGGTTCAAACTCCACCATGGCTGTG
CAAAACCCACTGAATACTTCTTTCATGTCCATGAGACTTCGTGATAGCTATCAATCCAAC
TTTGAGTGTGATTATCTGGAAAGTCCAAGCCTAGATCATTTAGACTATGATGAAATAACG
ATGAGATTGAAGCTTCAAGAACTTGAGAGAGCATTGCTTGATGATAATGATGGTGATGAT
GACAATGACATGTTTGCTACTGGTCAAAACATGGAAGTTGATGGTGAATGGTCTGACCCG
GTCCAGAATGTGCCATTCCACGACTCACCGAAGGAGTCTTCATCCTCAGATTCTAACCTT
AGCAGCATCAGCTGCAACAAAGAAGTATCGCAGATATCTCCTCGGAGTCCTAAGCAAATG
CTTATAGATTGTGCTGCTGTGCTTTCAGAAGGAAACATTGAGGAAGCAACAGCTATAATA
AATGAACTCCGGCAGATGGTCTCAATTCAAGGAGATCCTCCTCAAAGGATTGCAGCCTAC
ATGGTGGAAGGGCTTGCAGCTCGCATGGCTGCTTCTGGAAAGTTTCTCTATAAAGCTCTG
AAATGCAAAGAGCCTCCTTCTTCTGATAGGCTTGCAGCGATGCAGATCCTCTTTGAGGTG
TGCCCTTGTTTTAAATTTGGATTTATGGCAGCAAATGGTGCAATTATTGAGGCATTTAAA
GATGAAAAGAGAGTGCATATAATAGATTTTGACATAAATCAAGGTAGTCAATACATAACA
TTGATACAAACAATTTCTTCACAGTCTGGTAAGCCACCCCATTTAAGGTTAACTGGGGTT
GATGACCCTGAGTCAGTTCAACGGCCTGTTGGAGGCCTTCAAATTATTGGATTAAGACTT
GAGAAGCTAGCCGAAGCACTGGGGGTACCGTTTGAGTTTCATATAGTGCCTTCAAAGACT
TCAATTGTCACTCCATCAATGCTCGACTGCAGGCCTGGGGAAGCACTTATTGTAAACTTT
GCTTTTCAGCTTCATCATATGCCTGATGAGAGTGTTTCAACTGTAAATCAGCGAGACCAG
CTGCTTCGGATGATTAAGAGCTTAAATCCGAAACTTGTAACTGTTGTTGAACAAGATGTG
AACACAAACACTGCCCCCTTTTTTCCAAGGTTTATTGAAGCCTACAATTACTACTCTGCT
GTGTTTGAGTCTCTTGATGCAACTCTCCCAAGGGAGAGTCAGGACAGGATGAATGTTGAA
CGACAATGCCTGGCACGGGATATAGTTAACATTGTTGCATGTGAGGGAGAGGAGCGAATA
GAGCGGTATGAGGTTGCAGGGAAATGGAGGGCAAGGATGAAGATGGCCGGCTTCACTTCG
TGTCCAGTGAGTCAGAATGTGATTGATATGATTCAGAAACTTATAAAGCAATACTGTGAC
AGGTACAAGATGAGGGAGGAAATGGATCTGCTGCATTTTGGGTGGGAAGACAAAAGCTTG
ATCGTTGCTTCAGCCTGGAGGTAA
Download   Copy
>LITCHI011340.m1
MSLVRSAEPSTTSYGNSKLYSLKGRGDNSALSTQVFSSDKHKMMYMTDSYSSESYEKYFL
DSPTEELVHPSSSTVSDNYFPPEDASSYQLRVGSNSTMAVQNPLNTSFMSMRLRDSYQSN
FECDYLESPSLDHLDYDEITMRLKLQELERALLDDNDGDDDNDMFATGQNMEVDGEWSDP
VQNVPFHDSPKESSSSDSNLSSISCNKEVSQISPRSPKQMLIDCAAVLSEGNIEEATAII
NELRQMVSIQGDPPQRIAAYMVEGLAARMAASGKFLYKALKCKEPPSSDRLAAMQILFEV
CPCFKFGFMAANGAIIEAFKDEKRVHIIDFDINQGSQYITLIQTISSQSGKPPHLRLTGV
DDPESVQRPVGGLQIIGLRLEKLAEALGVPFEFHIVPSKTSIVTPSMLDCRPGEALIVNF
AFQLHHMPDESVSTVNQRDQLLRMIKSLNPKLVTVVEQDVNTNTAPFFPRFIEAYNYYSA
VFESLDATLPRESQDRMNVERQCLARDIVNIVACEGEERIERYEVAGKWRARMKMAGFTS
CPVSQNVIDMIQKLIKQYCDRYKMREEMDLLHFGWEDKSLIVASAWR.
Download   Copy
>LITCHI021216.m1
CTAAAATAAAAATCCTTGATTAGTTTTAAAATTGATTGACTTAAATTTAATTGGAAGCCA
TAATGAAAATGCTATATGGTTAACTTTTAACTCAACTAGTTACTGTAAAGTATTTATTTT
TTTTTAATAGATATACTGTAAAAGTATTTTCTTGACCACAAGTTCAAATTCCATACTCTA
AAACGACAAGAAAGCAACTAAGAAAAGCAAAGACAGATTTGTCATTTACTGGCCACTTAT
GTCCTCATGCCAATTCTGATTGCATGTGAAGCTATCACAATTTCAAAAGCCTATAACACA
TACCCTTTATAAATATGGTCATGTTTTCATCAACCAAACTCCAATTTCCATCCAATTTGA
GAGTCATATTAGATTTCCAGTTCCACAAACATGTGTAGAGGCATTCAAGATCAGCAGGCA
AGCCAACCCTTTCGCTCTTCCAGAGAACATGTTTCATCACATGTAAACTCTTCAGGTTTT
GTGTCTTGTGAGCTATGTGGGTCGAGGGCTTCCTTGTATTGCCAGGCTGATGATGCTTTC
CTATGTCGAAAGTGTGACAAGTGGGTGCATGAAGCTAACTTCTTGGCTCTCAGGCATGTC
AGGTGCTTTCTATGCAACTCCTGTCACAACCTCACCCAGAGATATCTTGTTGGGGTCTCC
GTTGAAGTTATGCTTCCAACTATTCTGAGATGGATAGAGAGCAGCAGGAGGTTATGTGGT
AGTGATTCCAAGGTTGATGTTAGAATTCGCTCAAGAAATATCCCTCGAAGGACTTTTCAG
TTCCTTTGATTTTGTGTCTTTTATTTTGTGGTTGTTGTCATGGTTTTTGTGTTTTTTGTC
TAGTGAGACAATATCAGATCAAATTCAGGGAGATTACGAAGAGGAGAAAGGCAGCTTTTA
GGACAATTAGATACTGAAAAAAAATTTGACAAAAATCACCTTGAAATTTATCATGTTTAT
GTAATGTAACCTGATGATTATGTTATGCAGAAACAAAATGACTTGTTCTTTGTTGTTTAC
AATCATAGATATAAATATTATCATGGTAGATGCATAATTTACATGTATTTTAGACTTGAA
CAAGTTTTATGTACGTACTAGATCATGTGTTTTATTGTGTTAATAATTTGTTTTTGTTTA
TCGAATTCTATATAAAATAAGACTGAGAGATTTAAGTTGATGCGCTTTTTTATTTGTGGT
TGATGATGTTACAAGAATCAAGTGAGGACAAAATTTGCTTTACATCACAGGGAGAGGGAA
GAGTAGTGAGATCTGGCGTCAGCATAAAAATTTAAAAGAGTACATATACAAATGCAAATA
GCATCAGACAGATGTTATTCGGATAACACTGTAAGTTTATAACCACAATTT
Download   Copy
>LITCHI021216.m1 +  Up_Stream_Len 2000
GTATGTCAGTTTAGTTAGCATAATCTTCTTTCTTGTAAACTCTTTTATGGAAGATGAGTG
AATGATAGTGTTATGTTTATTCATAGTTTAAGTGGTTAAATGTATTTTTCCTCTATATTT
GTGGTAGAGATTTGTTCACTATACATATATATGGGGAGTTGTCTCCCATGATGGTTGATT
TTGTGCTGTTTGATCCTAACAAACCTAAGCATTTGTGTCAAATTATTTTATGATTATATG
AGAAAAAAAAAAAAAAGAGAATTATGTGATGAGTGGGATGACAATACTAATTCAATTCAT
GAAAAGGTGAGGAATAGTAATTGAGAAGCAAGTAGTTTTACTCAAAAAAATTATACCATA
TCGTCCTTATAGAAAATACATCAATTAGTTATTTTAGTTGTGAATTTATTTTTTTCAATA
AAAATTTGAGTTCAATCGAGTAGGAGTTTATTAATTGGAATTTATCGAAATTAAACATAA
AATGTCTACCCTTACAACCTAAAATTATAATAATAATAATAAGATTCACAGAATGTAGAT
CTTTATAACCATTAACTCAACCAACCGACTTTGTATATACTTTTTGGATTTAGTTTATTC
AAACAAATTTATCTGAAATACAAGCATTGTTACTTCAAACCTATTGCAATTGTCTTTGGT
TGTTGACATCGTTGGTAAACCGTCAGCAACTCCCATGCCTTAGTGGCATGGGTTCGACAC
TTACCTCGTTAATCCTAATAATAATAATAATAATAACACAACAACAACAGTTCTCTCATT
ATTATATATGAATTGCTCTTTCATCCTAATGTAGGTTTTTCCTTCACTTTCATATGGAGC
AATATCTCGAACTGCGTCACTAATGTTTCTATTTCGATTGATTTTAACAATCTTTTAGAC
TCGTTTTAATTCTTAAATAAATCAAAAAAAAAAACTACCTACTGCAACTACAAATTGAAT
TTGGGATTATATATTATAGAGATATATATATATATATATATATGTACATATACATATCTG
TGTGCGTGTGAAATACGTGAAAAATGTCACTAGTACTAGACAATGGAGTGGACGGCCTAC
AAGAGCTAGAAGCTTTCAAGTATCAACCACACAAGTGGATTGATGTTATACAAATCAAAC
ACTAAGCAAAGATGTGGACAAGGACATCCCTTCCATTGTTGCCTCTCCACGTACCCCCTC
CTCTACCAAAGTAAAATTAACTCATTATTGTACCCCAAAAATCTGTCAAATCACTTCCAG
CCTCAACCTCTTCTATTTCCAAATAACTCCACATCATCAAATTTGTGGGAACCACTCACC
AAGTGCTTTAATTTTAGACCATACAACAATCTTCTTCTTTAGTAAAACAAATTGACTTGG
TAACCGCTCAGTTTCAAAAATCATGGTTGAAAACCTCCCCTCAAGCATCTCATAAAGCTT
CCAGCTTACTCATATATATATATATATATATATATTTCTGTTTTGACAAAATTAGTGGCT
TCACAGCTCATGTTGTACAATTATTTCTAGCCTTTATAGGGATTATCAATTTTAGTTTCA
ACCACTTTCATTAAAATTTAATGTGATTTGCTATCAACAATTTTTTTTTACTAAAATAAA
AATCCTTGATTAGTTTTAAAATTGATTGACTTAAATTTAATTGGAAGCCATAATGAAAAT
GCTATATGGTTAACTTTTAACTCAACTAGTTACTGTAAAGTATTTATTTTTTTTTAATAG
ATATACTGTAAAAGTATTTTCTTGACCACAAGTTCAAATTCCATACTCTAAAACGACAAG
AAAGCAACTAAGAAAAGCAAAGACAGATTTGTCATTTACTGGCCACTTATGTCCTCATGC
CAATTCTGATTGCATGTGAAGCTATCACAATTTCAAAAGCCTATAACACATACCCTTTAT
AAATATGGTCATGTTTTCATCAACCAAACTCCAATTTCCATCCAATTTGAGAGTCATATT
AGATTTCCAGTTCCACAAAC
Download   Copy
>LITCHI013700.m1 GenomeSequence - 
ATGCAAGACGTCGTGATTGCCCCGCAAACCACCAACATGAACACCCCTAATGAAGTTGTG
AATGATCATGAGAAACGTCCCCTTAACTCATCACCGCCCCAATCGGGTGCCCCCCGCGAG
CAGGACATGTACATGCCCATCGCGAATGTGGTCCGTATCATGCGAAGCATTCTCCCGGAA
TATGCAAAGATCTCCGACGACGCCAAAGAGGCCATGCAGGAATGTGTTTCCGAGTACATA
CACTTCCTAACCGGAGAGGCCAACATCCGTTGCCAAAGGGAGCACCGCAAGACCATCACC
GCGGAAGATATTATTTGGGCCATGAAAGAGACAGGCTTCGACGATTACTTTGGGCCCATC
ACTATGTTCAAGGACCGCTATCGAGAGAGTCAGCATGGACGATCTTCAGCCCAAAATCAG
CCCACTATGAAATGTCACGGTCATGGTCAAGCTGTGGACTATAAGTCTTTTAAGGTCGGT
AATGGTGGGTCTCTCAGGCTGGGCTATGCTAGGCCTTTGGGGATGGGCAGTATTACACCT
TTTGGGTTTCTTAGGCCTGTTGGGTCTATGGGGCCTGTTGGGCATAGTGGGCCCATTGGG
TCTGTTGGGTCTATTCCATCTGTCTGGTCCATGGGGCCGGTTGCTTCTGTTGGGCCTGTT
GGGTCTATTCCTTCTAACGGGTCTATGGGGCATGTTAGGTCTTCAATTGCTCCTGTTGAG
CCTAGTGGGCCTATTGGATCTCATCCATCTTTTGGGTCTTTTGGGAATGCAACTTGTAAC
ATAAGCCCCCAACCACCTTTTTATGATCCATTGCAGGTGAATCCTTGCAATTTCAAGAAC
AACAATTCGGATTCTGCTGGAGCATCATCCTCTTCTCAGGCTCATCTGCCCGAATTCGAC
CCGTATGCTTAG