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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI011140Chr81313592513143765+Protein DA1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI011140.m1115169PF00412.25LIMDomain36.35.40E-09
LITCHI011140.m1265466PF12315.11DA1-likeFamily290.18.90E-87
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LITCHI011140.m10284316PF12315.11DA1-likeFamily27.81.60E-06
LITCHI011140.m2115169PF00412.25LIMDomain36.83.80E-09
LITCHI011140.m2265351PF12315.11DA1-likeFamily110.21.00E-31
LITCHI011140.m33387PF00412.25LIMDomain36.64.40E-09
LITCHI011140.m3183384PF12315.11DA1-likeFamily290.75.60E-87
LITCHI011140.m43387PF00412.25LIMDomain36.64.40E-09
LITCHI011140.m4183384PF12315.11DA1-likeFamily290.75.60E-87
LITCHI011140.m5110311PF12315.11DA1-likeFamily291.63.20E-87
LITCHI011140.m6110311PF12315.11DA1-likeFamily291.63.20E-87
LITCHI011140.m7134188PF00412.25LIMDomain36.25.70E-09
LITCHI011140.m7284485PF12315.11DA1-likeFamily2909.80E-87
LITCHI011140.m83387PF00412.25LIMDomain36.64.40E-09
LITCHI011140.m8183384PF12315.11DA1-likeFamily290.75.60E-87
LITCHI011140.m9134188PF00412.25LIMDomain36.54.60E-09
LITCHI011140.m9284370PF12315.11DA1-likeFamily1101.10E-31
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>LITCHI011140.m1
ATGGGTTGGCTTAGCAAAATTTTTAAAGGCTCCAGTCACGGAATTTCAGAACGGAATTAT
CATGGAAATTATGGAGATGATCCAAATGGCTATGCACCTTCAACTTCAGGGGACATGTGG
CCAGAGCAAAATAATGAAGATATAGATCGTGCTATAGCACTATCCCTCTCAGAAGAAAAT
CAAAGGGGAGCAAACGTAATTGACAGTGCACTTCAAGTGGAAGAAGATGAACAACTTGCT
AGAGCTATGCAAGAAAGCCTGAACTTTGAACCTCCTCCTCAGCATGAAAATGGACATATG
TATCAACCTATCCCTGTCCACTTTCCAGTGGGCTACAGGATCTGTGCTGGTTGCAATACT
GAGATTGGTCACGGTAGATTTCTAAATTGCCTTAATGCATTTTGGCATCCAGAATGCTTC
CAATGCCATATTTGTCACCTGCCAATTTCTGATGCTGAGTTCTCTATGTCTGGGAATCTC
CCTTATCATAAATCTTGCTACAAGGAGCAGTATCATCCAAAATGTGATGTTTGTAAGCAT
TTTATTCCAACGAACCCTTCCGGTCTTATTGAATATAGGGCTCATCCCTTTTGGGTTCAA
AAGTACTGCCCTTCTCATGAACATGATGGTACTCCACGATGCTGCAGCTGTGAGAGAATG
GAGTCACGCGATACAGGATATGTCACCCTTGATGATGGACGGAAGCTCTGTCTAGAGTGT
CTGGACTCTGCAATCATGGATACCAGTCAATGCCAACCCCTTTATTATGATGTACAAGAA
TTTTATGAAAGTTTAAATATGAAAGTGGGGCAGCAAATTCCACTACTCTTGGTTGAAAGG
CAAGCATTAAATGATGCCAGAGAGATTGAAAAGCATGGCCAATATCACACACCAGAGACC
AGAGGACTCTGTCTTTCTGAAGAACAGACTATTACCACTATTCTGAAGCGAGGAAACCGA
GCAACAATGGGCATGATAACAGGGCCATATAGATTGAGAAGGCGTTGTGAGGTGACTGCA
ATTCTGATGTTATACGGCCTTCCAAGATTACTAACTGGGTCAATCCTAGCTCATGAAATG
ATGCATGCCTGGTTGCGACTTCAAGGTTACCGGCCTTTCAATCAGCAGGTTGAAGAAGGG
ATTTGCCAGGTTCTAGCACACATGTGGTTGACTACCGAGCTCAGGTCTATTTCAGGCAGT
AACTTCGCATCTACATCATCCTGCTCTACTTCCAGAAATCCAAGGGGACCAATGTCTCAA
TTTGATAGAAAGATTGGGGCATTTTTCATGAACCAGATTGAATCAGACACCTCCCCAGTG
TATGGAGATGGATTCAGAGCTGGCCTGCGGGCTGTACAAAAATATGGCCTTGAAGCTACC
CTTGAACATATCCGCACAACTGGAACATTTCCAATCTAA
>LITCHI011140.m10
ATGGCTTTATGTGCAGGTAAATACTTCATTGATTATGAGCAGATAACTTTATGTGTTATG
GGTTGGCTTAGCAAAATTTTTAAAGGCTCCAGTCACGGAATTTCAGAACGGAATTATCAT
GGAAATTATGGAGATGATCCAAATGGCTATGCACCTTCAACTTCAGGGGACATGTGGCCA
GAGCAAAATAATGAAGATATAGATCGTGCTATAGCACTATCCCTCTCAGAAGAAAATCAA
AGGGGAGCAAACGTAATTGACAGTGCACTTCAAGTGGAAGAAGATGAACAACTTGCTAGA
GCTATGCAAGAAAGCCTGAACTTTGAACCTCCTCCTCAGCATGAAAATGGACATATGTAT
CAACCTATCCCTGTCCACTTTCCAGTGGGCTACAGGATCTGTGCTGGTTGCAATACTGAG
ATTGGTCACGGTAGATTTCTAAATTGCCTTAATGCATTTTGGCATCCAGAATGCTTCCAA
TGCCATATTTGTCACCTGCCAATTTCTGATGCTGAGTTCTCTATGTCTGGGAATCTCCCT
TATCATAAATCTTGCTACAAGGAGCAGTATCATCCAAAATGTGATGTTTGTAAGCATTTT
ATTCCAACGAACCCTTCCGGTCTTATTGAATATAGGGCTCATCCCTTTTGGGTTCAAAAG
TACTGCCCTTCTCATGAACATGATGGTACTCCACGATGCTGCAGCTGTGAGAGAATGGAG
TCACGCGATACAGGATATGTCACCCTTGATGATGGACGGAAGCTCTGTCTAGAGTGTCTG
GACTCTGCAATCATGGATACCAGTCAATGCCAACCCCTTTATTATGATGTACAAGAATTT
TATGAAAGTTTAAATATGAAAGTGGGGCAGCAAATTCCACTACTCTTGGTTGAAAGGCAA
GCATTAAATGATGCCAGAGAGATTGAAAAGCATGTAAGAAAAAAAGTGTTAAAATCATCT
TATATTTGCAATGACATGTAG
>LITCHI011140.m2
ATGGGTTGGCTTAGCAAAATTTTTAAAGGCTCCAGTCACGGAATTTCAGAACGGAATTAT
CATGGAAATTATGGAGATGATCCAAATGGCTATGCACCTTCAACTTCAGGGGACATGTGG
CCAGAGCAAAATAATGAAGATATAGATCGTGCTATAGCACTATCCCTCTCAGAAGAAAAT
CAAAGGGGAGCAAACGTAATTGACAGTGCACTTCAAGTGGAAGAAGATGAACAACTTGCT
AGAGCTATGCAAGAAAGCCTGAACTTTGAACCTCCTCCTCAGCATGAAAATGGACATATG
TATCAACCTATCCCTGTCCACTTTCCAGTGGGCTACAGGATCTGTGCTGGTTGCAATACT
GAGATTGGTCACGGTAGATTTCTAAATTGCCTTAATGCATTTTGGCATCCAGAATGCTTC
CAATGCCATATTTGTCACCTGCCAATTTCTGATGCTGAGTTCTCTATGTCTGGGAATCTC
CCTTATCATAAATCTTGCTACAAGGAGCAGTATCATCCAAAATGTGATGTTTGTAAGCAT
TTTATTCCAACGAACCCTTCCGGTCTTATTGAATATAGGGCTCATCCCTTTTGGGTTCAA
AAGTACTGCCCTTCTCATGAACATGATGGTACTCCACGATGCTGCAGCTGTGAGAGAATG
GAGTCACGCGATACAGGATATGTCACCCTTGATGATGGACGGAAGCTCTGTCTAGAGTGT
CTGGACTCTGCAATCATGGATACCAGTCAATGCCAACCCCTTTATTATGATGTACAAGAA
TTTTATGAAAGTTTAAATATGAAAGTGGGGCAGCAAATTCCACTACTCTTGGTTGAAAGG
CAAGCATTAAATGATGCCAGAGAGATTGAAAAGCATGGCCAATATCACACACCAGAGACC
AGAGGACTCTGTCTTTCTGAAGAACAGACTATTACCACTATTCTGAAGCGAGGAAACCGA
GCAACAATGGGCATGATAACAGGGCCATATAGATTGAGAAGGCGTTGTGAGGTGACTGCA
ATTCTGATGTTATACGGCCTTCCAAGGTATTTTAGCTTTAGCACTCTTCACTTAATATTT
GATTCTAGAACTAAGTTGAGACAATCTCTTTTAGGTGTCACTCACTGA
>LITCHI011140.m3
ATGCAAGAAAGCCTGAACTTTGAACCTCCTCCTCAGCATGAAAATGGACATATGTATCAA
CCTATCCCTGTCCACTTTCCAGTGGGCTACAGGATCTGTGCTGGTTGCAATACTGAGATT
GGTCACGGTAGATTTCTAAATTGCCTTAATGCATTTTGGCATCCAGAATGCTTCCAATGC
CATATTTGTCACCTGCCAATTTCTGATGCTGAGTTCTCTATGTCTGGGAATCTCCCTTAT
CATAAATCTTGCTACAAGGAGCAGTATCATCCAAAATGTGATGTTTGTAAGCATTTTATT
CCAACGAACCCTTCCGGTCTTATTGAATATAGGGCTCATCCCTTTTGGGTTCAAAAGTAC
TGCCCTTCTCATGAACATGATGGTACTCCACGATGCTGCAGCTGTGAGAGAATGGAGTCA
CGCGATACAGGATATGTCACCCTTGATGATGGACGGAAGCTCTGTCTAGAGTGTCTGGAC
TCTGCAATCATGGATACCAGTCAATGCCAACCCCTTTATTATGATGTACAAGAATTTTAT
GAAAGTTTAAATATGAAAGTGGGGCAGCAAATTCCACTACTCTTGGTTGAAAGGCAAGCA
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ATGGGCATGATAACAGGGCCATATAGATTGAGAAGGCGTTGTGAGGTGACTGCAATTCTG
ATGTTATACGGCCTTCCAAGATTACTAACTGGGTCAATCCTAGCTCATGAAATGATGCAT
GCCTGGTTGCGACTTCAAGGTTACCGGCCTTTCAATCAGCAGGTTGAAGAAGGGATTTGC
CAGGTTCTAGCACACATGTGGTTGACTACCGAGCTCAGGTCTATTTCAGGCAGTAACTTC
GCATCTACATCATCCTGCTCTACTTCCAGAAATCCAAGGGGACCAATGTCTCAATTTGAT
AGAAAGATTGGGGCATTTTTCATGAACCAGATTGAATCAGACACCTCCCCAGTGTATGGA
GATGGATTCAGAGCTGGCCTGCGGGCTGTACAAAAATATGGCCTTGAAGCTACCCTTGAA
CATATCCGCACAACTGGAACATTTCCAATCTAA
>LITCHI011140.m4
ATGCAAGAAAGCCTGAACTTTGAACCTCCTCCTCAGCATGAAAATGGACATATGTATCAA
CCTATCCCTGTCCACTTTCCAGTGGGCTACAGGATCTGTGCTGGTTGCAATACTGAGATT
GGTCACGGTAGATTTCTAAATTGCCTTAATGCATTTTGGCATCCAGAATGCTTCCAATGC
CATATTTGTCACCTGCCAATTTCTGATGCTGAGTTCTCTATGTCTGGGAATCTCCCTTAT
CATAAATCTTGCTACAAGGAGCAGTATCATCCAAAATGTGATGTTTGTAAGCATTTTATT
CCAACGAACCCTTCCGGTCTTATTGAATATAGGGCTCATCCCTTTTGGGTTCAAAAGTAC
TGCCCTTCTCATGAACATGATGGTACTCCACGATGCTGCAGCTGTGAGAGAATGGAGTCA
CGCGATACAGGATATGTCACCCTTGATGATGGACGGAAGCTCTGTCTAGAGTGTCTGGAC
TCTGCAATCATGGATACCAGTCAATGCCAACCCCTTTATTATGATGTACAAGAATTTTAT
GAAAGTTTAAATATGAAAGTGGGGCAGCAAATTCCACTACTCTTGGTTGAAAGGCAAGCA
TTAAATGATGCCAGAGAGATTGAAAAGCATGGCCAATATCACACACCAGAGACCAGAGGA
CTCTGTCTTTCTGAAGAACAGACTATTACCACTATTCTGAAGCGAGGAAACCGAGCAACA
ATGGGCATGATAACAGGGCCATATAGATTGAGAAGGCGTTGTGAGGTGACTGCAATTCTG
ATGTTATACGGCCTTCCAAGATTACTAACTGGGTCAATCCTAGCTCATGAAATGATGCAT
GCCTGGTTGCGACTTCAAGGTTACCGGCCTTTCAATCAGCAGGTTGAAGAAGGGATTTGC
CAGGTTCTAGCACACATGTGGTTGACTACCGAGCTCAGGTCTATTTCAGGCAGTAACTTC
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AGAAAGATTGGGGCATTTTTCATGAACCAGATTGAATCAGACACCTCCCCAGTGTATGGA
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CATATCCGCACAACTGGAACATTTCCAATCTAA
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TATGATGTACAAGAATTTTATGAAAGTTTAAATATGAAAGTGGGGCAGCAAATTCCACTA
CTCTTGGTTGAAAGGCAAGCATTAAATGATGCCAGAGAGATTGAAAAGCATGGCCAATAT
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GACACCTCCCCAGTGTATGGAGATGGATTCAGAGCTGGCCTGCGGGCTGTACAAAAATAT
GGCCTTGAAGCTACCCTTGAACATATCCGCACAACTGGAACATTTCCAATCTAA
>LITCHI011140.m6
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GATGTTTGTAAGCATTTTATTCCAACGAACCCTTCCGGTCTTATTGAATATAGGGCTCAT
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GGCCTTGAAGCTACCCTTGAACATATCCGCACAACTGGAACATTTCCAATCTAA
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TATGAAAGTTTAAATATGAAAGTGGGGCAGCAAATTCCACTACTCTTGGTTGAAAGGCAA
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GGACTCTGTCTTTCTGAAGAACAGACTATTACCACTATTCTGAAGCGAGGAAACCGAGCA
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TTCGCATCTACATCATCCTGCTCTACTTCCAGAAATCCAAGGGGACCAATGTCTCAATTT
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>LITCHI011140.m8
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GAAAGTTTAAATATGAAAGTGGGGCAGCAAATTCCACTACTCTTGGTTGAAAGGCAAGCA
TTAAATGATGCCAGAGAGATTGAAAAGCATGGCCAATATCACACACCAGAGACCAGAGGA
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ATGTTATACGGCCTTCCAAGATTACTAACTGGGTCAATCCTAGCTCATGAAATGATGCAT
GCCTGGTTGCGACTTCAAGGTTACCGGCCTTTCAATCAGCAGGTTGAAGAAGGGATTTGC
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>LITCHI022387.m2
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>LITCHI022387.m1
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GCAGCACTCACACATTTTTCATTTGTCAGGGCACCATTCACGAGGACTCTGGCTTGGATT
CTTCTTCACCGTCAGCGGAC
>LITCHI022387.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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CTTTAATTGGACTTACTTCA
>LITCHI022387.m3 +  Up_Stream_Len 2000
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TGTGACGACTACGCCGCGATCTCTGGCATCCCCAGATGGCAATCCAACGGCTGTGGTTGG
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AGAGAAGGGTTTATTATTGGGATCGTTCGTGTGTACTTTTTTTCCTTTGTAGTTGGCTTT
CTTTAATTGGACTTACTTCA
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>LITCHI022387.m2 GenomeSequence + 
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TGTGACGACTACGCCGCGATCTCTGGCATCCCCAGATGGCAATCCAACGGCTGTGGTTGG
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TTCATTTGTCAGGGCACCATTCACGAGGACTCTGGCTTGGATTCTTCTTCACCGTCAGCG
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GATCTTCACCTTTCATTCCCAGAAATGCAATTCTCACACCTTGGCAACGTTCTTGGAAGT
CATGGCACTCTTGCTAACCCTAATTTCATGGAGACTAAGTACAATGCTATGCTTGATCAG
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CTTGATGGAAATAGTGGCACTTTCATGGACACTTGCCAGAGGATGATGCTCCCATACGAT
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