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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI010952 | Chr8 | 10627419 | 10631589 | + | Transcription factor SPATULA |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI010952.m1 | 140 | 186 | PF00010.29 | HLH | Domain | 53.9 | 1.40E-14 |
LITCHI010952.m2 | 139 | 185 | PF00010.29 | HLH | Domain | 53.9 | 1.40E-14 |
LITCHI010952.m3 | 140 | 186 | PF00010.29 | HLH | Domain | 53.9 | 1.40E-14 |
LITCHI010952.m4 | 140 | 186 | PF00010.29 | HLH | Domain | 54 | 1.30E-14 |
LITCHI010952.m5 | 140 | 186 | PF00010.29 | HLH | Domain | 54.8 | 7.20E-15 |
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>LITCHI010952.m1 ATGGCGGATCTGTACGGAACCACTGCACCAACTTCGGGCCACGAACCCGAAGAAATCTCG GCGTTTTTAAACCAGCTTATCCACAACTCCTCCTCATCATCATCTTGTCTCTGTTTCAAT GCCAAGTACATCAACCACTCCCTGTCCCCGCCGCCGCCGCCGCCTGACGCTAAGTCTGAC TCCGCCGCCTTGATTTCTCAGCCGGAAGATCGCCACCACCGATCGGCAGACCCCCCCTCC GCTGTTCCTGACTCCTCTCCCGGTGGTTTCAACTTCTCCAACTCCCTCGCCACCTGCGTC ACCGCCGTCGACTCTGATACTTATGATAGCGAGAAGGGTCCTGAGGCATCGGAGGCGCCA TCAAACAACAACACAGTTCGCCCGAAACCGCCGTCGAAACGGAGCAGGGCTGCTGAGGTC CACAACATGTCTGAAAAGAGGAGGAGGAGTAGAATTAATGAGAAAATGAAAGCTTTACAG AATTTAATTCCAAATTCTAATAAGACGGATAAAGCTTCGATGCTGGACGAGGCGATTGAG TATCTGAAGCAGCTTCAGCTTCAAGTACAGATGTTAACAATGAGAAATGGATTGAGTTTG CATCCAATGTGGTTACCAGGAGCACTACAACCAGTGCAACTGCCTCAAACAGGAATGGTC TTTGATGAGGAAAATGGATTGCTGAATACCAACAGAGGGACCGGCACATTTTCTGCAAAT GAAGAAGGCTCAATTCAAACTGCTTTTAATATTTGCGATCAATCTACCATCTCAAATCAA CCAATTGCCATATCTTCAGCTGCAAACATCACCACATCATCAGAAACCTCCTTTGGACTC GAACCATTGATTCAAGCTCACTATGGACCCTTTGGTCTCTCCTCATCTTCCAAGGACATC GTTGATGGAGGTGCACCACAACTGCATTTAGATATGAATTTCACTGGGAAGGACTCTTCG TCTGGTATGTCTTAG >LITCHI010952.m2 ATGGCGGATCTGTACGGAACCACTGCACCAACTTCGGGCCACGAACCCGAAGAAATCTCG GCGTTTTTAAACCAGCTTATCCACAACTCCTCCTCATCATCATCTTGTCTCTGTTTCAAT GCCAAGTACATCAACCACTCCCTGTCCCCGCCGCCGCCGCCGCCTGACGCTAAGTCTGAC TCCGCCGCCTTGATTTCTCAGCCGGAAGATCGCCACCACCGATCGGCAGACCCCCCCTCC GCTGTTCCTGACTCCTCTCCCGGTGGTTTCAACTTCTCCAACTCCCTCGCCACCTGCGTC ACCGCCGTCGACTCTGATACTTATGATAGCGAGGGTCCTGAGGCATCGGAGGCGCCATCA AACAACAACACAGTTCGCCCGAAACCGCCGTCGAAACGGAGCAGGGCTGCTGAGGTCCAC AACATGTCTGAAAAGAGGAGGAGGAGTAGAATTAATGAGAAAATGAAAGCTTTACAGAAT TTAATTCCAAATTCTAATAAGACGGATAAAGCTTCGATGCTGGACGAGGCGATTGAGTAT CTGAAGCAGCTTCAGCTTCAAGTACAGATGTTAACAATGAGAAATGGATTGAGTTTGCAT CCAATGTGGTTACCAGGAGCACTACAACCAGTGCAACTGCCTCAAACAGGAATGGTCTTT GATGAGGAAAATGGATTGCTGAATACCAACAGAGGGACCGGCACATTTTCTGCAAATGAA GAAGGCTCAATTCAAACTGCTTTTAATATTTGCGATCAATCTACCATCTCAAATCAACCA ATTGCCATATCTTCAGCTGCAAACATCACCACATCATCAGAAACCTCCTTTGGACTCGAA CCATTGATTCAAGCTCACTATGGACCCTTTGGTCTCTCCTCATCTTCCAAGGACATCGTT GATGGAGGTGCACCACAACTGCATTTAGATATGAATTTCACTGGGAAGGACTCTTCGTCT GGTATGTCTTAG >LITCHI010952.m3 ATGGCGGATCTGTACGGAACCACTGCACCAACTTCGGGCCACGAACCCGAAGAAATCTCG GCGTTTTTAAACCAGCTTATCCACAACTCCTCCTCATCATCATCTTGTCTCTGTTTCAAT GCCAAGTACATCAACCACTCCCTGTCCCCGCCGCCGCCGCCGCCTGACGCTAAGTCTGAC TCCGCCGCCTTGATTTCTCAGCCGGAAGATCGCCACCACCGATCGGCAGACCCCCCCTCC GCTGTTCCTGACTCCTCTCCCGGTGGTTTCAACTTCTCCAACTCCCTCGCCACCTGCGTC ACCGCCGTCGACTCTGATACTTATGATAGCGAGAAGGGTCCTGAGGCATCGGAGGCGCCA TCAAACAACAACACAGTTCGCCCGAAACCGCCGTCGAAACGGAGCAGGGCTGCTGAGGTC CACAACATGTCTGAAAAGAGGAGGAGGAGTAGAATTAATGAGAAAATGAAAGCTTTACAG AATTTAATTCCAAATTCTAATAAGACGGATAAAGCTTCGATGCTGGACGAGGCGATTGAG TATCTGAAGCAGCTTCAGCTTCAAGTACAGATGTTAACAATGAGAAATGGATTGAGTTTG CATCCAATGTGGTTACCAGGAGCACTACAACCAGTGCAACTGCCTCAAACAGGAATGGTC TTTGATGAGGAAAATGGATTGCTGAATACCAACAGAGGGACCGGCACATTTTCTGCAAAT GAAGAAGGCTCAATTCAAACTGCTTTTAATATTTGCGATCAATCTACCATCTCAAATCAA CCAATTGCCATATCTTCAGCTGCAAACATCACCACATCATCAGAAACCTCCTTTGGACTC GAACCATTGATTCAAGCTCACTATGGACCCTTTGGTCTCTCCTCATCTTCCAAGGACATC GTTGATGGAGGTGCACCACAACTGCATTTAGATATGAATTTCACTGGGAAGGACTCTTCG TCTGGTATGTCTTAG >LITCHI010952.m4 ATGGCGGATCTGTACGGAACCACTGCACCAACTTCGGGCCACGAACCCGAAGAAATCTCG GCGTTTTTAAACCAGCTTATCCACAACTCCTCCTCATCATCATCTTGTCTCTGTTTCAAT GCCAAGTACATCAACCACTCCCTGTCCCCGCCGCCGCCGCCGCCTGACGCTAAGTCTGAC TCCGCCGCCTTGATTTCTCAGCCGGAAGATCGCCACCACCGATCGGCAGACCCCCCCTCC GCTGTTCCTGACTCCTCTCCCGGTGGTTTCAACTTCTCCAACTCCCTCGCCACCTGCGTC ACCGCCGTCGACTCTGATACTTATGATAGCGAGAAGGGTCCTGAGGCATCGGAGGCGCCA TCAAACAACAACACAGTTCGCCCGAAACCGCCGTCGAAACGGAGCAGGGCTGCTGAGGTC CACAACATGTCTGAAAAGAGGAGGAGGAGTAGAATTAATGAGAAAATGAAAGCTTTACAG AATTTAATTCCAAATTCTAATAAGACGGATAAAGCTTCGATGCTGGACGAGGCGATTGAG TATCTGAAGCAGCTTCAGCTTCAAGTACAGATGTTAACAATGAGAAATGGATTGAGTTTG CATCCAATGTGGTTACCAGGAGCACTACAACCAGTGCAACTGCCTCAAACAGGAATGGTC TTTGATGAGGAAAATGGATTGCTGAATACCAACAGAGGGACCGGCACATTTTCTGCAAAT GAAGAAGGCTCAATTCAAACTGCTTTTAATATTTGCGATCAATCTACCATCTCAAATCAA CCAATTGCCATATCTTCAGCTGCAAACATCACCACATCATCAGAAACCTCCTTTGGACTC GAACCATTGATTCAAGCTCACTATGGACCCTTTGGTCTCTCCTCATCTTCCAAGGTAAAT TTGTAA >LITCHI010952.m5 ATGGCGGATCTGTACGGAACCACTGCACCAACTTCGGGCCACGAACCCGAAGAAATCTCG GCGTTTTTAAACCAGCTTATCCACAACTCCTCCTCATCATCATCTTGTCTCTGTTTCAAT GCCAAGTACATCAACCACTCCCTGTCCCCGCCGCCGCCGCCGCCTGACGCTAAGTCTGAC TCCGCCGCCTTGATTTCTCAGCCGGAAGATCGCCACCACCGATCGGCAGACCCCCCCTCC GCTGTTCCTGACTCCTCTCCCGGTGGTTTCAACTTCTCCAACTCCCTCGCCACCTGCGTC ACCGCCGTCGACTCTGATACTTATGATAGCGAGAAGGGTCCTGAGGCATCGGAGGCGCCA TCAAACAACAACACAGTTCGCCCGAAACCGCCGTCGAAACGGAGCAGGGCTGCTGAGGTC CACAACATGTCTGAAAAGAGGAGGAGGAGTAGAATTAATGAGAAAATGAAAGCTTTACAG AATTTAATTCCAAATTCTAATAAGACGGATAAAGCTTCGATGCTGGACGAGGCGATTGAG TATCTGAAGCAGCTTCAGCTTCAAGTACAGGAGCACTACAACCAGTGCAACTGCCTCAAA CAGGAATGGTCTTTGATGAGGAAAATGGATTGCTGA
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