Search Result
On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI010820 | Chr8 | 9085111 | 9090639 | - | LIM domain-containing protein WLIM1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI010820.m1 | 11 | 65 | PF00412.25 | LIM | Domain | 42.5 | 6.30E-11 |
| LITCHI010820.m1 | 111 | 165 | PF00412.25 | LIM | Domain | 44.7 | 1.20E-11 |
| LITCHI010820.m2 | 11 | 65 | PF00412.25 | LIM | Domain | 42 | 8.90E-11 |
| LITCHI010820.m2 | 161 | 207 | PF00412.25 | LIM | Domain | 36 | 6.70E-09 |
| LITCHI010820.m3 | 74 | 120 | PF00412.25 | LIM | Domain | 37.1 | 3.00E-09 |
| LITCHI010820.m4 | 24 | 78 | PF00412.25 | LIM | Domain | 46.5 | 3.50E-12 |
Download Copy
>LITCHI010820.m1 ATGGCAGCATTTGGAGGAACTACCCAGAAATGCAAGGCTTGTGACAAGACTGTGTATCTG GTTGATAAGCTAACAGCTGACAATCGTGTCTACCACAAAGCCTGCTTCAGATGCCACCAC TGCAAAGGAACCCTCAAGCTTGGCAACTACAATTCCTTTGAGGGAGTTCTGTATTGCAGG CCACACTTTGATCAACTGTTTAAAAGAACTGGCAGTTTGGAGAAAAGCTTTGAAGGGACA CCAAAGATTGTAAAACCAGAGAAACCTTTCGATGGCGAGAAACCTATGGCAGCTAAAGTC TCAAGTATGTTTGGTGGAACCAGAGATAAATGTGTTGGCTGTAAGAATACTGTCTATCCA ACTGAGAAGGTTACGGTTAATGGAACTCCTTATCACAAGAGCTGCTTCAAATGCACCCAT GGAGGATGTGTGATTAGCCCATCTAACTACATTGCCCATGAAGGTCGACTGTACTGCAAA CATCACCACACACAGCTCATCAAGGAAAAAGGTAACCTAAGCCAGCTTGAGGGTGAGCTC GAGAAGGGTTTGGTGATTGAGAATGTCAATGGAGAAGAAGTTGCCACTGAATCATAA >LITCHI010820.m2 ATGGCAGCATTTGGAGGAACTACCCAGAAATGCAAGGCTTGTGACAAGACTGTGTATCTG GTTGATAAGCTAACAGCTGACAATCGTGTCTACCACAAAGCCTGCTTCAGATGCCACCAC TGCAAAGGAACCCTCAAGCTTGGCAACTACAATTCCTTTGAGGGAGTTCTGTATTGCAGG CCACACTTTGATCAACTGTTTAAAAGAACTGGCAGTTTGGAGAAAAGCTTTGAAGGGACA CCAAAGATTGTAAAACCAGAGAAACCTTTCGATGGCGAGAAACCTATGGCAGCTAAAGTC TCAAGTATGTTTGGTGGAACCAGAGATAAATGTGTTGGCTGTAAGAATACTGTCTATCCA ACTGAGAAGGTAAGAATATGCTGCAACTTCTCAATAGATTCATATAAGAAACCTAAAAAC ACAGACTTGCTGCACAAAACATCCATGCTAATAATTGTTGTTATTATTATTATTATTACT ATTTATGTTAAAAAGGTTACGGTTAATGGAACTCCTTATCACAAGAGCTGCTTCAAATGC ACCCATGGAGGATGTGTGATTAGCCCATCTAACTACATTGCCCATGAAGGTCGACTGTAC TGCAAACATCACCACACACAGCTCATCAAGGAAAAAGGTAACCTAAGCCAGCTTGAGGGT GAGCTCGAGAAGGGTTTGGTGATTGAGAATGTCAATGGAGAAGAAGTTGCCACTGAATCA TAA >LITCHI010820.m3 ATGCTCTCCTTTGAACAGAAACCTATGGCAGCTAAAGTCTCAAGTATGTTTGGTGGAACC AGAGATAAATGTGTTGGCTGTAAGAATACTGTCTATCCAACTGAGAAGGTAAGAATATGC TGCAACTTCTCAATAGATTCATATAAGAAACCTAAAAACACAGACTTGCTGCACAAAACA TCCATGCTAATAATTGTTGTTATTATTATTATTATTACTATTTATGTTAAAAAGGTTACG GTTAATGGAACTCCTTATCACAAGAGCTGCTTCAAATGCACCCATGGAGGATGTGTGATT AGCCCATCTAACTACATTGCCCATGAAGGTCGACTGTACTGCAAACATCACCACACACAG CTCATCAAGGAAAAAGGTAACCTAAGCCAGCTTGAGGGTGAGCTCGAGAAGGGTTTGGTG ATTGAGAATGTCAATGGAGAAGAAGTTGCCACTGAATCATAA >LITCHI010820.m4 ATGCTCTCCTTTGAACAGAAACCTATGGCAGCTAAAGTCTCAAGTATGTTTGGTGGAACC AGAGATAAATGTGTTGGCTGTAAGAATACTGTCTATCCAACTGAGAAGGTTACGGTTAAT GGAACTCCTTATCACAAGAGCTGCTTCAAATGCACCCATGGAGGATGTGTGATTAGCCCA TCTAACTACATTGCCCATGAAGGTCGACTGTACTGCAAACATCACCACACACAGCTCATC AAGGAAAAAGGTAACCTAAGCCAGCTTGAGGGTGAGCTCGAGAAGGGTTTGGTGATTGAG AATGTCAATGGAGAAGAAGTTGCCACTGAATCATAA
Download Copy
>LITCHI010820.m1 MAAFGGTTQKCKACDKTVYLVDKLTADNRVYHKACFRCHHCKGTLKLGNYNSFEGVLYCR PHFDQLFKRTGSLEKSFEGTPKIVKPEKPFDGEKPMAAKVSSMFGGTRDKCVGCKNTVYP TEKVTVNGTPYHKSCFKCTHGGCVISPSNYIAHEGRLYCKHHHTQLIKEKGNLSQLEGEL EKGLVIENVNGEEVATES. >LITCHI010820.m2 MAAFGGTTQKCKACDKTVYLVDKLTADNRVYHKACFRCHHCKGTLKLGNYNSFEGVLYCR PHFDQLFKRTGSLEKSFEGTPKIVKPEKPFDGEKPMAAKVSSMFGGTRDKCVGCKNTVYP TEKVRICCNFSIDSYKKPKNTDLLHKTSMLIIVVIIIIITIYVKKVTVNGTPYHKSCFKC THGGCVISPSNYIAHEGRLYCKHHHTQLIKEKGNLSQLEGELEKGLVIENVNGEEVATES . >LITCHI010820.m3 MLSFEQKPMAAKVSSMFGGTRDKCVGCKNTVYPTEKVRICCNFSIDSYKKPKNTDLLHKT SMLIIVVIIIIITIYVKKVTVNGTPYHKSCFKCTHGGCVISPSNYIAHEGRLYCKHHHTQ LIKEKGNLSQLEGELEKGLVIENVNGEEVATES. >LITCHI010820.m4 MLSFEQKPMAAKVSSMFGGTRDKCVGCKNTVYPTEKVTVNGTPYHKSCFKCTHGGCVISP SNYIAHEGRLYCKHHHTQLIKEKGNLSQLEGELEKGLVIENVNGEEVATES.
Download Copy
>LITCHI011648.m1 CCCCACTAGTGGGGGGCCACTTGTACATTTGAAGGGACCCACCTAATTGATTGTCTTTTG GCATCCTGTGTCTCTTTCTATCTCTCACCTACTCTTGCCTCTACACACACACACACACAC ACACACTAGTCAAGTCAACCACAAAGTAAGAAAATTAGAAAATACCCAAGCACTATTAGT GGCACTGGTGTGCAGTTACCATCACGACACAGAGACGCAAAACCTCCTTTCCTCTCAGTT TCAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTCCTTTCCTCTCAACCCTCAAACCATACCAACCCCACAA AACCCTACTTTCTTCTCTTTCCACAAATGATTAGATTACTTCCATGTCTTCATATGGTCC TCAACGATTTTAACCACAGTAACTTATTTCATTATCATTAGAATTTATTATTCGAAGAAT CATAATCACGACAAACTTTTTTTTAAAACTAATTTCGAAGATACTCAACTAATTATACGA AGAGATAGCGTGTATAATCACAACAATTTTCACCCCCTTTTACACTTAACGTTCGTGTTT AATATTAATAATATTACTGGACTGAAGAAATAACTTTGAAAATTTTATATATATATATAT ATATATGGATATTATAACAAGTGGGGTATCATTCAACAAAAGGAAAGGTTGATGAACATA ATGGAGCCAGAGAAGCAGCACCAAATTGTCACAGACCACCACCGCAACCACGACGGTGGT CTTAAACAAGAAGCTTCAAACAAGCCAGCTCTTGGGTCCACAGAAGTGTCCTTCAATATG GGGTCCATTAACTCGAACCCCACCACGAAAACAGCGGCAAAAAGGCCGTCCAAGGACCGC CACACCAAGGTGGATGGACGCGGCCGCCGCATACGGATGCCGGCCATCTGCGCTGCCAGA GTCTTCCAGTTGACGAGAGAATTGGGTCACAAGTCCGACGGCGAGACCATCGAGTGGCTC CTGCAGCAGGCGGAGCCAGCTGTCATCGCCGCCACCGGAACCGGCACCATCCCCGCCAAT TTTTCCTCCCTTAACGTCTCCTTACGAAGCAGCAGCAGGAGCTCCACCGTGTCGGCGCCG CTCTCGTCGAAGTCTCCTCCGCAAGCTACTTCTTTTTTCGGCGGTTCTTATAACAATCAG TTGTTTTCTCAGTTTAGAGAGAGTCTCTTCAAAGAAACAAGTGGTGTAACTGTAATAACT ACTTCTTCATCGACCAGTGCAGCAGTTGCAGAGAGAACAGGCGGTCAGCAGCATGAACCG GTTCCGGTTCATCTCCGGTCGAATAGCAATGTGGTGCCGGTTCCGGCTATGTGGGCAGTT GGACCAGCCGCCACTAATGGCGGGAATACCTTCTGGATGCTGCCGGTGGCTGGCGGTGGT GCTACGGCGGAAACCCAGATGTGGAGTTTTAATCCAGCCCAGTACTGCGGAGTTGGACCG ATGAACCCGGTTCAACTGAGTGCTGCTGGGAGTTACGGTTTGAGCATGAGTTTGGAGAAA AATGTTCACGGAGAAAACCGGAGTCAAGCTAGTGAGAGTGGAGAAGAAAATCGTACGGAT TCTCAATAATTTGAAGAAAAGTTTGTTGACAAATTTCATTTCATTTTATTTTTTTGTTTC GTTTTCTGGTATTAGATTCTTGTTAGATTTCTTTTTGAGCAACGATTGTAAATATTTTAT TTTTCTTTGTTTTTGGAAGAAATTATGTTTTTAATTGTTAGTTGTGCTTTTTTCGGATGC TGTAATGGAGCTTGTCCTTGTGGAATTAAAATTAAATATGCAATGAAATTCATCCAACTT ATAAATTTCTAGCTATAAGCTAGGCAAATATCACTATAACACAAGTATTGATATGTCATT TGCATATGTCCAAGTCACTTACATTGTATCACATAAATATATCATATAATTTATTATTTA TGTTACATGACATGATTTCAAATTATGGGAATGTATTCATCTCAAAAATTATGAGAATGT GTATACAAGATCCATAAATATTGAAGCATTTCTCATAAAATTGACTTACCAAGTCATTTA TGATATGACTGTCAAGTGTGTTTTTAGAGATAACACATATCATAAATTGAAATCAAAATT GAAGTATAAGTCAGGATGTGTAACATTATTTGTTTAACATTACAATCATAATTTATAATC TTTTGATAATCATATCACATTATCTCATTAAAACTAAGATATCGAACAAATAACACAAAA CAAGTTTCTAGAAAATTGAGAGAAGGTAACAACGTATTTTTTTTTTAAATATTGGAATCA GTCCATGATACAACCAAGATCAACAACAATAGATATTATAACGCAACTCAAGCATCGACC ACAAAAACTGAGGGGCATCCTACAAATAGTGAGAGAAAATTGCCATCCTACTTTGGTTGT GGATGAGTTTTGAACCTAGTGCACACATGTCAAGTGGATTGCTACCACTAAGGCAATCCT ACTACACTCATGACAATGTAATTGTGTTCTCATTTGGTGTTGTTCGTGACATTCACTACA AGTTATACTATTACTTTCCCAAAAAATGTAAGAACC
Download Copy
>LITCHI011648.m1 - Up_Stream_Len 2000 CTCCCCCGAGCCCGAAAATAAGGCACAAATCAAGCCATTCCCCGTCATACCTAACCCAAT GCACTATCCTCCCGATTTTCTATACATTAAATTAGTTTTAAACGAGTCTCAAATTTTAAA ATCAAGGGTATAAAAAGTGCATAATTTCATCTTAATCTACCTATGCATAGGTAAATTATA TAAATATCTTCAGTTGGAGGATAATTTTATTATTTAAGTGTGGATCACTCTCTTTTGCCC ATTAGAAAGTAGAGTTAAAATGATGTTGAGTTTTGGAATGTACCTTAGACTTTGTTTGAC ACACGATATTATAATGAAATGAATTGGATTGAATTAAGCTGGAATGGATTGGACTAAAAA AGTATTATCCCATGTTTGGTGAAACTTGAGATTGTATTAAAATTATACATTATTATATTT GGTGTAGATTAAGAATGGATTGAAATAAAATTAATTTAAATATTTTACTATATACTTAAA ATTAATTAATTTTATGAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGGTTATCTAGGTTCTCTATAG TCTTTAAGCTTCAAGATCATCTACCCCAGTTCATCAACATCATCTCCTATGGTCTTCAAC ATCATCAATAACATCACAACGTCATTATCTCCGATAATAACAATAACATCATCAAAATAG TTTATCAGGAAAAAAATTCAAAATAGTTTATCAAAAAAAAAAATACACATCAAAATACCA GGATAGACGCAAATGAAGAACTTCATTTGGGTTCCATTACAACCCAAATGAACAATCGAA CCCAGATGATTGCAACCACACGCATATTAAAATAATAATAATAATAATAAAGAAGATAGA GTGGTCTTCAGTTGTTGTTGGTGGTTTGTCACCATGGATGGAGAAGGAGATGAGAGAGAT AAGTAATGTTTTGTGGTGGAGCTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAAG TATTGTATGAAGAGAGGAATTTTGTTTGGTAAGAGAGGAAGAATTAAAAAAATTAAAAAA TATATATTTCCATTCCTAAGCTTGGAAACCGAAGCTTTCGCTTAGGATTCCATTTTCCAC ATTGGATGGGAATGAAGGTGGATCTGAAAATAAAAAATTTATTTTTCTTTCTGACTTCAA ACGTGAGGTGTGAAAGAATGGAAAAAAAAATAAATAAATAACGAATGTCACTCTAATTCT CATGCATCAAACGTATCGTTAGAGCTTTTATCAAGGGACCCCCCCTGGAAATGTCTTGTA ATATCAAAAAAGAAAATGAAAAAAAAAAAAAAATTATGGATATGGTAGGTCTTAAAGCCA ATAACAATTAATTGTGAAAACTGTAGAGACCCCACTAGTGGGGGGCCACTTGTACATTTG AAGGGACCCACCTAATTGATTGTCTTTTGGCATCCTGTGTCTCTTTCTATCTCTCACCTA CTCTTGCCTCTACACACACACACACACACACACACTAGTCAAGTCAACCACAAAGTAAGA AAATTAGAAAATACCCAAGCACTATTAGTGGCACTGGTGTGCAGTTACCATCACGACACA GAGACGCAAAACCTCCTTTCCTCTCAGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTCCTTTCCTC TCAACCCTCAAACCATACCAACCCCACAAAACCCTACTTTCTTCTCTTTCCACAAATGAT TAGATTACTTCCATGTCTTCATATGGTCCTCAACGATTTTAACCACAGTAACTTATTTCA TTATCATTAGAATTTATTATTCGAAGAATCATAATCACGACAAACTTTTTTTTAAAACTA ATTTCGAAGATACTCAACTAATTATACGAAGAGATAGCGTGTATAATCACAACAATTTTC ACCCCCTTTTACACTTAACGTTCGTGTTTAATATTAATAATATTACTGGACTGAAGAAAT AACTTTGAAAATTTTATATATATATATATATATATGGATATTATAACAAGTGGGGTATCA TTCAACAAAAGGAAAGGTTG
Download Copy
>LITCHI011648.m1 GenomeSequence - CCCCACTAGTGGGGGGCCACTTGTACATTTGAAGGGACCCACCTAATTGATTGTCTTTTG GCATCCTGTGTCTCTTTCTATCTCTCACCTACTCTTGCCTCTACACACACACACACACAC ACACACTAGTCAAGTCAACCACAAAGTAAGAAAATTAGAAAATACCCAAGCACTATTAGT GGCACTGGTGTGCAGTTACCATCACGACACAGAGACGCAAAACCTCCTTTCCTCTCAGTT TCAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTCCTTTCCTCTCAACCCTCAAACCATACCAACCCCACAA AACCCTACTTTCTTCTCTTTCCACAAATGATTAGATTACTTCCATGTCTTCATATGGTCC TCAACGATTTTAACCACAGTAACTTATTTCATTATCATTAGAATTTATTATTCGAAGAAT CATAATCACGACAAACTTTTTTTTAAAACTAATTTCGAAGATACTCAACTAATTATACGA AGAGATAGCGTGTATAATCACAACAATTTTCACCCCCTTTTACACTTAACGTTCGTGTTT AATATTAATAATATTACTGGACTGAAGAAATAACTTTGAAAATTTTATATATATATATAT ATATATGGATATTATAACAAGTGGGGTATCATTCAACAAAAGGAAAGGTTGATGAACATA ATGGAGCCAGAGAAGCAGCACCAAATTGTCACAGACCACCACCGCAACCACGACGGTGGT CTTAAACAAGAAGCTTCAAACAAGCCAGCTCTTGGGTCCACAGAAGTGTCCTTCAATATG GGGTCCATTAACTCGAACCCCACCACGAAAACAGCGGCAAAAAGGCCGTCCAAGGACCGC CACACCAAGGTGGATGGACGCGGCCGCCGCATACGGATGCCGGCCATCTGCGCTGCCAGA GTCTTCCAGTTGACGAGAGAATTGGGTCACAAGTCCGACGGCGAGACCATCGAGTGGCTC CTGCAGCAGGCGGAGCCAGCTGTCATCGCCGCCACCGGAACCGGCACCATCCCCGCCAAT TTTTCCTCCCTTAACGTCTCCTTACGAAGCAGCAGCAGGAGCTCCACCGTGTCGGCGCCG CTCTCGTCGAAGTCTCCTCCGCAAGCTACTTCTTTTTTCGGCGGTTCTTATAACAATCAG TTGTTTTCTCAGTTTAGAGAGAGTCTCTTCAAAGAAACAAGTGGTGTAACTGTAATAACT ACTTCTTCATCGACCAGTGCAGCAGTTGCAGAGAGAACAGGCGGTCAGCAGCATGAACCG GTTCCGGTTCATCTCCGGTCGAATAGCAATGTGGTGCCGGTTCCGGCTATGTGGGCAGTT GGACCAGCCGCCACTAATGGCGGGAATACCTTCTGGATGCTGCCGGTGGCTGGCGGTGGT GCTACGGCGGAAACCCAGATGTGGAGTTTTAATCCAGCCCAGTACTGCGGAGTTGGACCG ATGAACCCGGTTCAACTGAGTGCTGCTGGGAGTTACGGTTTGAGCATGAGTTTGGAGAAA AATGTTCACGGAGAAAACCGGAGTCAAGCTAGTGAGAGTGGAGAAGAAAATCGTACGGAT TCTCAATAATTTGAAGAAAAGTTTGTTGACAAATTTCATTTCATTTTATTTTTTTGTTTC GTTTTCTGGTATTAGATTCTTGTTAGATTTCTTTTTGAGCAACGATTGTAAATATTTTAT TTTTCTTTGTTTTTGGAAGAAATTATGTTTTTAATTGTTAGTTGTGCTTTTTTCGGATGC TGTAATGGAGCTTGTCCTTGTGGAATTAAAATTAAATATGCAATGAAATTCATCCAACTT ATAAATTTCTAGCTATAAGCTAGGCAAATATCACTATAACACAAGTATTGATATGTCATT TGCATATGTCCAAGTCACTTACATTGTATCACATAAATATATCATATAATTTATTATTTA TGTTACATGACATGATTTCAAATTATGGGAATGTATTCATCTCAAAAATTATGAGAATGT GTATACAAGATCCATAAATATTGAAGCATTTCTCATAAAATTGACTTACCAAGTCATTTA TGATATGACTGTCAAGTGTGTTTTTAGAGATAACACATATCATAAATTGAAATCAAAATT GAAGTATAAGTCAGGATGTGTAACATTATTTGTTTAACATTACAATCATAATTTATAATC TTTTGATAATCATATCACATTATCTCATTAAAACTAAGATATCGAACAAATAACACAAAA CAAGTTTCTAGAAAATTGAGAGAAGGTAACAACGTATTTTTTTTTTAAATATTGGAATCA GTCCATGATACAACCAAGATCAACAACAATAGATATTATAACGCAACTCAAGCATCGACC ACAAAAACTGAGGGGCATCCTACAAATAGTGAGAGAAAATTGCCATCCTACTTTGGTTGT GGATGAGTTTTGAACCTAGTGCACACATGTCAAGTGGATTGCTACCACTAAGGCAATCCT ACTACACTCATGACAATGTAATTGTGTTCTCATTTGGTGTTGTTCGTGACATTCACTACA AGTTATACTATTACTTTCCCAAAAAATGTAAGAACC