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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI010820 | Chr8 | 9085111 | 9090639 | - | LIM domain-containing protein WLIM1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI010820.m1 | 11 | 65 | PF00412.25 | LIM | Domain | 42.5 | 6.30E-11 |
LITCHI010820.m1 | 111 | 165 | PF00412.25 | LIM | Domain | 44.7 | 1.20E-11 |
LITCHI010820.m2 | 11 | 65 | PF00412.25 | LIM | Domain | 42 | 8.90E-11 |
LITCHI010820.m2 | 161 | 207 | PF00412.25 | LIM | Domain | 36 | 6.70E-09 |
LITCHI010820.m3 | 74 | 120 | PF00412.25 | LIM | Domain | 37.1 | 3.00E-09 |
LITCHI010820.m4 | 24 | 78 | PF00412.25 | LIM | Domain | 46.5 | 3.50E-12 |
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>LITCHI010820.m1 ATGGCAGCATTTGGAGGAACTACCCAGAAATGCAAGGCTTGTGACAAGACTGTGTATCTG GTTGATAAGCTAACAGCTGACAATCGTGTCTACCACAAAGCCTGCTTCAGATGCCACCAC TGCAAAGGAACCCTCAAGCTTGGCAACTACAATTCCTTTGAGGGAGTTCTGTATTGCAGG CCACACTTTGATCAACTGTTTAAAAGAACTGGCAGTTTGGAGAAAAGCTTTGAAGGGACA CCAAAGATTGTAAAACCAGAGAAACCTTTCGATGGCGAGAAACCTATGGCAGCTAAAGTC TCAAGTATGTTTGGTGGAACCAGAGATAAATGTGTTGGCTGTAAGAATACTGTCTATCCA ACTGAGAAGGTTACGGTTAATGGAACTCCTTATCACAAGAGCTGCTTCAAATGCACCCAT GGAGGATGTGTGATTAGCCCATCTAACTACATTGCCCATGAAGGTCGACTGTACTGCAAA CATCACCACACACAGCTCATCAAGGAAAAAGGTAACCTAAGCCAGCTTGAGGGTGAGCTC GAGAAGGGTTTGGTGATTGAGAATGTCAATGGAGAAGAAGTTGCCACTGAATCATAA >LITCHI010820.m2 ATGGCAGCATTTGGAGGAACTACCCAGAAATGCAAGGCTTGTGACAAGACTGTGTATCTG GTTGATAAGCTAACAGCTGACAATCGTGTCTACCACAAAGCCTGCTTCAGATGCCACCAC TGCAAAGGAACCCTCAAGCTTGGCAACTACAATTCCTTTGAGGGAGTTCTGTATTGCAGG CCACACTTTGATCAACTGTTTAAAAGAACTGGCAGTTTGGAGAAAAGCTTTGAAGGGACA CCAAAGATTGTAAAACCAGAGAAACCTTTCGATGGCGAGAAACCTATGGCAGCTAAAGTC TCAAGTATGTTTGGTGGAACCAGAGATAAATGTGTTGGCTGTAAGAATACTGTCTATCCA ACTGAGAAGGTAAGAATATGCTGCAACTTCTCAATAGATTCATATAAGAAACCTAAAAAC ACAGACTTGCTGCACAAAACATCCATGCTAATAATTGTTGTTATTATTATTATTATTACT ATTTATGTTAAAAAGGTTACGGTTAATGGAACTCCTTATCACAAGAGCTGCTTCAAATGC ACCCATGGAGGATGTGTGATTAGCCCATCTAACTACATTGCCCATGAAGGTCGACTGTAC TGCAAACATCACCACACACAGCTCATCAAGGAAAAAGGTAACCTAAGCCAGCTTGAGGGT GAGCTCGAGAAGGGTTTGGTGATTGAGAATGTCAATGGAGAAGAAGTTGCCACTGAATCA TAA >LITCHI010820.m3 ATGCTCTCCTTTGAACAGAAACCTATGGCAGCTAAAGTCTCAAGTATGTTTGGTGGAACC AGAGATAAATGTGTTGGCTGTAAGAATACTGTCTATCCAACTGAGAAGGTAAGAATATGC TGCAACTTCTCAATAGATTCATATAAGAAACCTAAAAACACAGACTTGCTGCACAAAACA TCCATGCTAATAATTGTTGTTATTATTATTATTATTACTATTTATGTTAAAAAGGTTACG GTTAATGGAACTCCTTATCACAAGAGCTGCTTCAAATGCACCCATGGAGGATGTGTGATT AGCCCATCTAACTACATTGCCCATGAAGGTCGACTGTACTGCAAACATCACCACACACAG CTCATCAAGGAAAAAGGTAACCTAAGCCAGCTTGAGGGTGAGCTCGAGAAGGGTTTGGTG ATTGAGAATGTCAATGGAGAAGAAGTTGCCACTGAATCATAA >LITCHI010820.m4 ATGCTCTCCTTTGAACAGAAACCTATGGCAGCTAAAGTCTCAAGTATGTTTGGTGGAACC AGAGATAAATGTGTTGGCTGTAAGAATACTGTCTATCCAACTGAGAAGGTTACGGTTAAT GGAACTCCTTATCACAAGAGCTGCTTCAAATGCACCCATGGAGGATGTGTGATTAGCCCA TCTAACTACATTGCCCATGAAGGTCGACTGTACTGCAAACATCACCACACACAGCTCATC AAGGAAAAAGGTAACCTAAGCCAGCTTGAGGGTGAGCTCGAGAAGGGTTTGGTGATTGAG AATGTCAATGGAGAAGAAGTTGCCACTGAATCATAA
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>LITCHI010820.m1 MAAFGGTTQKCKACDKTVYLVDKLTADNRVYHKACFRCHHCKGTLKLGNYNSFEGVLYCR PHFDQLFKRTGSLEKSFEGTPKIVKPEKPFDGEKPMAAKVSSMFGGTRDKCVGCKNTVYP TEKVTVNGTPYHKSCFKCTHGGCVISPSNYIAHEGRLYCKHHHTQLIKEKGNLSQLEGEL EKGLVIENVNGEEVATES. >LITCHI010820.m2 MAAFGGTTQKCKACDKTVYLVDKLTADNRVYHKACFRCHHCKGTLKLGNYNSFEGVLYCR PHFDQLFKRTGSLEKSFEGTPKIVKPEKPFDGEKPMAAKVSSMFGGTRDKCVGCKNTVYP TEKVRICCNFSIDSYKKPKNTDLLHKTSMLIIVVIIIIITIYVKKVTVNGTPYHKSCFKC THGGCVISPSNYIAHEGRLYCKHHHTQLIKEKGNLSQLEGELEKGLVIENVNGEEVATES . >LITCHI010820.m3 MLSFEQKPMAAKVSSMFGGTRDKCVGCKNTVYPTEKVRICCNFSIDSYKKPKNTDLLHKT SMLIIVVIIIIITIYVKKVTVNGTPYHKSCFKCTHGGCVISPSNYIAHEGRLYCKHHHTQ LIKEKGNLSQLEGELEKGLVIENVNGEEVATES. >LITCHI010820.m4 MLSFEQKPMAAKVSSMFGGTRDKCVGCKNTVYPTEKVTVNGTPYHKSCFKCTHGGCVISP SNYIAHEGRLYCKHHHTQLIKEKGNLSQLEGELEKGLVIENVNGEEVATES.
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>LITCHI028988.m1 ATGGAGCATGTATTGGTAGTGGAAATGGTAATGGTGGTGTTGGTGTCTTTTTTGTTGTTT TTTGTCTTCAAAGTTTCAGCTTCTGACAGTCTGCTTTCTCCCAAAGGCGTTAACTATGAA GTGGCAGCTTTGATGGGTGTGAAGAACAAAATGAGAGATGAGTTGCATGTAATGGATGGT TGGGATATAAACTCTGTGGATCCATGCACTTGGAACATGGTGGGTTGCTCTGCTGAAGGC TTCGTTGTTTCCCTTGAAATGGCGAGTAATGGGTTATCGGGTACACTTTCACCAAGCATT GGGAGTTTGAGTCATCTAAAGACACTGTTGTTGCATAACAATCGGCTATCTGGTCCTATC CCCCCTGAAATAGGGATGCTGTCAGAACTTCAAACACTTGACCTTTCGAGGAACCAATTT GTTGGAGATATTCCAAGTTCGTTGGGGTTTCTTCCGTCTCTAACTTACTTGAGGCTTAAT AATAATAACTTATCTGGTCAAATTCCAGGACCTGTTGCCAATCTCACAAGTCTTTCCTTT TTGGATCTATCTTTCAATAATCTCAGTGGTCCGACTCCCAAAATACTAGCAAAAGGCTAC AGTTTTACTGGGAACAACTTTCTTTGCACTTCATCCTCGGCACAAATTTGCATGGATGTC TCAAAACCGGGAAATGGTTCCTCTCCGAAAGTCCATGGCCATCGTCGATGGGTCCTTTCT GTTGCTGTAGTCATCAGTTGCACATTTGTGGTTTCTGTGATGTTGCTTGTTTGTTGGGTG CATTGCTACAGATCTCGACTTCTCACTACATCTTATGTGCAGCAAGATTATGAATTTAAT ATCGGTCATTTGAAGAGGTTTTCATTTCGAGAGTTACAAGCTGCCACTGGAAATTTTAGT GCCAGAAACATTCTGGGGCAAGGGGGATATGGGGTGGTTTATAAAGGATGTCTTTCAAAT AGAACAGTAGTGGCAGTTAAAAGGCTGAAAGATCCAAATTACACTGGAGAAATACAGTTT CAAACTGAAGTTGAGATGATTGGCTTAGCATTGCATCGAAACCTCTTACGCTTGTATGGC TTCTGCATGACACCTGATGAGAGGCTTCTTATATATCCTTATATGCCAAATGGGAGTGTT GCAGATCGCTTGCGAGCCAAAAGAAACATGCATTGTTGCAATAAACTGGCAGCCATCAGA TGTTGTTATTTTAGAATAGTTAGAACCGTACATGAGGAGAAGAGGCTGGAAGTGCTTGTG GACAGGGATCTGAAGGGTTGTTTCGACGCATCAGAGTTGGAGAAAGCAGTAGAGCTTGCT CTACAATGTACTCAATCAAGTCCTAACCTGCGGCCAAAGATGTCACAAGTCCTGAAAGTG CTTGAAGATCTGGTTGGGCAGTTTGGGATGGAAGAATCACAAGGTGGAAACAACCTTTGT GAGGCACGAGATTGTAGCTTCTCTAGGAACTATAGCGATGTCCATGAATCATCATTTGTC ATTGAAGCCATGGAGCTTTCTGGACCTCGGTAACTAATTATAAACTATCACATAACCCTT CCTAATTCAGCTGTAAATGAGTTTTTCATTTAATTAAGCTTTAATATACTTAAAATTCTA ATCCTTAACATTTTTGCTTAATATGTGATATTGCGTGAGCTTCATGGAAGTTAAAAGTAG TAACTTGTCAACATTGAATCGGAAAATGTTGCTTTCAAATGTGTTAGGTTGCCACCCACA CCCCTTTCATGTGAACATCAAGAAATAACATCAAGATATGCCCCAATAAGAAAACAACTG GCTGAAATTTGATGTATAGAATTGATTTTTTTTTTTTTTTTTAAATAAAAAAATTAGTAC TCATTATTACAAGATATGCATTCTCCCTTAAATGTTCACACATTGTGAACAGAGATGGTT GTAGAAAGATTATATTCATTGTTTTGAAAAACCATTATTGAGCAGCATTTACCTGATCAG ATACCAGACATAACAATAAAAATTGGTTGGCGTGGCGCATGCCATCCCTGAATTTTCTCT CATTGTTCCCTTTGAAGCCTATAGACCAAAGTTTTTGTGATTAATAGAAGAGCATCAACA AAACATGTAACAATCTGCGTACGGGTCCATAGCCTTCCCATCCCTATCTGCATGTGGACA ACAAGGGCTTGAATTGTTAGTGTATATCCATAGAAGATTCATGAATTAAATATGCAACAA GTGAATACCCACTTGCATTAGTTGAGGGTAGGACAGGTAGTTGAGTATCACGAAGTCCAC TAGCCCACCCCACTGCCCCACTTCTTTTTTGTCCATAAGTCTGTCCTTACTAAGTCCATG ATATTCATTGTTCCTATGTGCCTTTCAAGAATTGTTGTTGGCATATCAATTCTCCTTTTC TTGGTTGTGGAAAAGGTAAAGATTCCTTACATTATATCACTCCCATATTTAGTCAAATTT ATTGTTTTTATGTATGTTTTTAATCTTTCAAATTAGTAAAATTTGG
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>LITCHI028988.m1 + Up_Stream_Len 2000 CTTGCTAAATGCTAAGAATGTAATTGTTCCAGCTTAAGGTTCTTTTACCAGTCAGATGTG GTTTTCTTAGTGATGTTTGGTCACGTTGTTTTATAATTTGGACAGTTCCTATTGTGCAGT CAATGCTAAATGATTGTCAATTGTTTTAATTTTTGTTACAGTTGGTTGGGGCTTCTCCAG AGCTCGTTAACAAGTTGATACCAGACCATGTAAAACGGCAACTAGGCTTAAATTTCTTGC ATCCAGCTGGGACATAGGTTGAGACAAGTTATATGGAAGTGACATCTGGCCGTTGATTTC CAACACGAAGGGAATTCTATCTTTGTGTTTAACTACCATGCACTGAGGCTGGACCAGCAT CAGTTCTTGCTCTATCAGGATGCCTAAATTATCAGGCAGCTGGATGGCTGCGTTTTCTTG GTGCTTTATTTTTCTCCTATACCCCTTACCACTTTTTTCTCTTCTCATCTTTCCCCATTC TCTGTCGAAGTGGCTCTTTCTCTTTCGTTATATGTAAATGTTTGATAGTAAAGATAGGCT AAGGTGATAAGATGGACTGATCAGAAAGATGCTAGTAGAGAACAAATTGAGGAGAATGTA TTTGTAGCTAGGAAGAAAAGCCCCTTATAGAATTGCCCTGAAGAAATGGGGGTGGGCATA TTGTTGGTTGTAAGGTTTGGATATTCTGCATGTCTTTTTGGTTTTTTGTTGTGGTTTGTG ATGACTGACTTAAAAACTTGCAGACAATTGTTGTCACCTGTTTGTGCAAAAGTAATGTTC TTGCAATTTACATTCTCTTTCGTAATCATCCCTAGGCTATGCTATTTTAAGTTTTGAAAC TGATGGCTTGTTTGCAAATCTGCTGGTGAAAGACTTGTGAATCTTCATCACTCCAATCGT ATGTTAGTAGATCTAATTAAAACAATCTCAGTAAGTAGTTTGCTCATGCCATTCAACTAC TCAATATCACCACGTTGATTAAATTTCCCTGAATATATTTCCATTAATGACCATAGTGAG CTGCCTTGTGGTTTCGACCACCAGGGGAAGAAAGGTAGAAGTTGGGTGGAAACTACTCAA ATAACTCTCCTGTTTTGCCTTCATTTTTTTATTGTCTAGTCATATCAATAGAATGCCAAA TGCCATTATTGCGCATGCATGATTTGACAAATCTCAAAAGCATTTCCATGAGCATATCAT TGTGTTTTGCCCTTTATTTTGCTTTTTGAATGTGGGAAAGGCATTGAATGAACTTTTGCT ATTTGGGTGAGTGGAGAGGGTCTATATTCAACTAACCTTAGTCATTCAAGCAGAAAAGAC GGTGCATGAAGTGTTAATTCAATTGAATCATTCACCTTCTCTCTCTACCGATTTGCTCCA TGTCCAGCCAAGCATATGGGTCCATTTTCTTTGGGTCAATAGTCCACTCCTAAACAGACC TAACCCAAAATTCAAAGATATGTATGTATGAATTATGATATATTTAAAATATCCCTTGGA GAAAAGTCCAAATTCCGGCAGCATGTATATTCGTGCCACCATCGAGCCCTCCATTCCAAA TGGTGGACCCAAAACATTTTCACGCATTTTCAACCAAAGCCACTCGATAATTCTTTACTG ATCACAAAATCACAACTGTTAACTCCTTGGGTGAAAATCAACGGGCCAACACAATAGTCT TATAGTCGTGGTGATTGGGACAGGACGACAATCTCTGTCGGTTACAAATCTCGAGACTTT TCCCGCTTTTACACAGCTACTGGTCTTTCGATTCTTAAAAATCATTTCCCATTTTTAATT TTCACTTCGGTTCAATAATTAATCTAATGTGACATCGTCGAGGCAGAGATTCCAAAAAGG GTATTTGAAAAGAGATAGAGATGAGTCGTGGTTTGGTGATGACTTTAGTTTCACTTGTGT CAGAGAAGCAGAAAAAGTAGCCAGCAACCTTATATCTTCTTCTTTTTGCTTTTTTGTTTT GTTTGCTGTTGCGAAGTCAA
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>LITCHI028988.m1 GenomeSequence + ATGGAGCATGTATTGGTAGTGGAAATGGTAATGGTGGTGTTGGTGTCTTTTTTGTTGTTT TTTGTCTTCAAAGTTTCAGCTTCTGACAGTCTGCTTTCTCCCAAAGGCGTTAACTATGAA GGTGACAATGCTGCTGATGTTACTGTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGTTTGTGA CATCATAATATGTTGAACAAAAACAGTGGCAGCTTTGATGGGTGTGAAGAACAAAATGAG AGATGAGTTGCATGTAATGGATGGTTGGGATATAAACTCTGTGGATCCATGCACTTGGAA CATGGTGGGTTGCTCTGCTGAAGGCTTCGTTGTTTCCCTGTAAGTCTATTTGCACCTACT AAAACTAAATGTACTAGTATTTCTATTGTTGGTTTGTCGTTAGACTTTTTGCTTTGTTTA ATGTTTTGTTTTCTGGTTTGTTGTTGTTGTAGTGAAATGGCGAGTAATGGGTTATCGGGT ACACTTTCACCAAGCATTGGGAGTTTGAGTCATCTAAAGACACTGTAAGCTCCTCTTTGA TTTTTGTTTGTCTTTAATTACTATAGCTTCAATGGCTTCTAATTAACTGTATTGTTGTAA ATGAGAGTCTTGGTTAGTATAGTTTCAATCAGCTATAAAAATTTTCAAGTTGTTAATGAT TCCCAGTTCATTGACAATTGAACGATTTGTGAATATTACACATTCAAAAGCATGTATTGC TTAGGCAGTTTAGTATTAGTGTAGTTATTAAATAATTGATGTTAATTGTATCGACAAATG TTTTTTTTGTAACGTTTATGAGCTGAGTGGTTGGTTAATTCCGATATTAAAATTGTTAGA AGTCTCAAAAGCAATGTGTATGCAGTTTGCTAAATTTAGTAAATTTTTATGTTAATTGCT 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CCTTTCTGTTGCTGTAGTCATCAGTTGCACATTTGTGGTTTCTGTGATGTTGCTTGTTTG TTGGGTGCATTGCTACAGATCTCGACTTCTCACTACATCTTATGGTACCTCCTCAACCTT AGCCTCTTTTTAATCGCATACTTGATAGATGTAAGAAATATTGATAATTTGAATTTTTTT GCAGTGCAGCAAGATTATGAATTTAATATCGGTCATTTGAAGAGGTTTTCATTTCGAGAG TTACAAGCTGCCACTGGAAATTTTAGTGCCAGAAACATTCTGGGGCAAGGGGGATATGGG GTGGTTTATAAAGGATGTCTTTCAAATAGAACAGTAGTGGCAGTTAAAAGGCTGAAAGAT CCAAATTACACTGGAGAAATACAGTTTCAAACTGAAGTTGAGATGATTGGCTTAGCATTG CATCGAAACCTCTTACGCTTGTATGGCTTCTGCATGACACCTGATGAGAGGCTTCTTATA TATCCTTATATGCCAAATGGGAGTGTTGCAGATCGCTTGCGAGGTTAGTCTCATTTTGTT TATTTCTGTGCTTTTGCTGAGGATGCAGGACTTAGGCTACCTTTTGAATATATGCTGAAG AATTTCATTTCTCTGAGATAGTCGTAGTCCTGTTGCTGATCATGACAACTAATTGGTTAA GAATAATTGTATTTTCCAGAAGTATAGATTTTACTTCTGTCATCAGTCAATATGTCTGAT GATCATGGTGGTTGATAAAATCTCATTTGTAGTTTTTCCTTGGAGGAAAGATACGATGGA CTTTGAAACATGTCCATACTTTCTTACTTAAATTGGAACTAGATTCATTAATAGTTACTT GTCTTTAGCAGACACAGGTCAGGTGAAGCCATCTTTGGATTGGAACAGACGGATGCATAT TGCTCTAGGGACAGCCCGTGGACTTCTATACTTACATGAACAATGTAATCCAAAAATAAT 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