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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI010820 | Chr8 | 9085111 | 9090639 | - | LIM domain-containing protein WLIM1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI010820.m1 | 11 | 65 | PF00412.25 | LIM | Domain | 42.5 | 6.30E-11 |
LITCHI010820.m1 | 111 | 165 | PF00412.25 | LIM | Domain | 44.7 | 1.20E-11 |
LITCHI010820.m2 | 11 | 65 | PF00412.25 | LIM | Domain | 42 | 8.90E-11 |
LITCHI010820.m2 | 161 | 207 | PF00412.25 | LIM | Domain | 36 | 6.70E-09 |
LITCHI010820.m3 | 74 | 120 | PF00412.25 | LIM | Domain | 37.1 | 3.00E-09 |
LITCHI010820.m4 | 24 | 78 | PF00412.25 | LIM | Domain | 46.5 | 3.50E-12 |
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>LITCHI010820.m1 ATGGCAGCATTTGGAGGAACTACCCAGAAATGCAAGGCTTGTGACAAGACTGTGTATCTG GTTGATAAGCTAACAGCTGACAATCGTGTCTACCACAAAGCCTGCTTCAGATGCCACCAC TGCAAAGGAACCCTCAAGCTTGGCAACTACAATTCCTTTGAGGGAGTTCTGTATTGCAGG CCACACTTTGATCAACTGTTTAAAAGAACTGGCAGTTTGGAGAAAAGCTTTGAAGGGACA CCAAAGATTGTAAAACCAGAGAAACCTTTCGATGGCGAGAAACCTATGGCAGCTAAAGTC TCAAGTATGTTTGGTGGAACCAGAGATAAATGTGTTGGCTGTAAGAATACTGTCTATCCA ACTGAGAAGGTTACGGTTAATGGAACTCCTTATCACAAGAGCTGCTTCAAATGCACCCAT GGAGGATGTGTGATTAGCCCATCTAACTACATTGCCCATGAAGGTCGACTGTACTGCAAA CATCACCACACACAGCTCATCAAGGAAAAAGGTAACCTAAGCCAGCTTGAGGGTGAGCTC GAGAAGGGTTTGGTGATTGAGAATGTCAATGGAGAAGAAGTTGCCACTGAATCATAA >LITCHI010820.m2 ATGGCAGCATTTGGAGGAACTACCCAGAAATGCAAGGCTTGTGACAAGACTGTGTATCTG GTTGATAAGCTAACAGCTGACAATCGTGTCTACCACAAAGCCTGCTTCAGATGCCACCAC TGCAAAGGAACCCTCAAGCTTGGCAACTACAATTCCTTTGAGGGAGTTCTGTATTGCAGG CCACACTTTGATCAACTGTTTAAAAGAACTGGCAGTTTGGAGAAAAGCTTTGAAGGGACA CCAAAGATTGTAAAACCAGAGAAACCTTTCGATGGCGAGAAACCTATGGCAGCTAAAGTC TCAAGTATGTTTGGTGGAACCAGAGATAAATGTGTTGGCTGTAAGAATACTGTCTATCCA ACTGAGAAGGTAAGAATATGCTGCAACTTCTCAATAGATTCATATAAGAAACCTAAAAAC ACAGACTTGCTGCACAAAACATCCATGCTAATAATTGTTGTTATTATTATTATTATTACT ATTTATGTTAAAAAGGTTACGGTTAATGGAACTCCTTATCACAAGAGCTGCTTCAAATGC ACCCATGGAGGATGTGTGATTAGCCCATCTAACTACATTGCCCATGAAGGTCGACTGTAC TGCAAACATCACCACACACAGCTCATCAAGGAAAAAGGTAACCTAAGCCAGCTTGAGGGT GAGCTCGAGAAGGGTTTGGTGATTGAGAATGTCAATGGAGAAGAAGTTGCCACTGAATCA TAA >LITCHI010820.m3 ATGCTCTCCTTTGAACAGAAACCTATGGCAGCTAAAGTCTCAAGTATGTTTGGTGGAACC AGAGATAAATGTGTTGGCTGTAAGAATACTGTCTATCCAACTGAGAAGGTAAGAATATGC TGCAACTTCTCAATAGATTCATATAAGAAACCTAAAAACACAGACTTGCTGCACAAAACA TCCATGCTAATAATTGTTGTTATTATTATTATTATTACTATTTATGTTAAAAAGGTTACG GTTAATGGAACTCCTTATCACAAGAGCTGCTTCAAATGCACCCATGGAGGATGTGTGATT AGCCCATCTAACTACATTGCCCATGAAGGTCGACTGTACTGCAAACATCACCACACACAG CTCATCAAGGAAAAAGGTAACCTAAGCCAGCTTGAGGGTGAGCTCGAGAAGGGTTTGGTG ATTGAGAATGTCAATGGAGAAGAAGTTGCCACTGAATCATAA >LITCHI010820.m4 ATGCTCTCCTTTGAACAGAAACCTATGGCAGCTAAAGTCTCAAGTATGTTTGGTGGAACC AGAGATAAATGTGTTGGCTGTAAGAATACTGTCTATCCAACTGAGAAGGTTACGGTTAAT GGAACTCCTTATCACAAGAGCTGCTTCAAATGCACCCATGGAGGATGTGTGATTAGCCCA TCTAACTACATTGCCCATGAAGGTCGACTGTACTGCAAACATCACCACACACAGCTCATC AAGGAAAAAGGTAACCTAAGCCAGCTTGAGGGTGAGCTCGAGAAGGGTTTGGTGATTGAG AATGTCAATGGAGAAGAAGTTGCCACTGAATCATAA
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>LITCHI010820.m1 MAAFGGTTQKCKACDKTVYLVDKLTADNRVYHKACFRCHHCKGTLKLGNYNSFEGVLYCR PHFDQLFKRTGSLEKSFEGTPKIVKPEKPFDGEKPMAAKVSSMFGGTRDKCVGCKNTVYP TEKVTVNGTPYHKSCFKCTHGGCVISPSNYIAHEGRLYCKHHHTQLIKEKGNLSQLEGEL EKGLVIENVNGEEVATES. >LITCHI010820.m2 MAAFGGTTQKCKACDKTVYLVDKLTADNRVYHKACFRCHHCKGTLKLGNYNSFEGVLYCR PHFDQLFKRTGSLEKSFEGTPKIVKPEKPFDGEKPMAAKVSSMFGGTRDKCVGCKNTVYP TEKVRICCNFSIDSYKKPKNTDLLHKTSMLIIVVIIIIITIYVKKVTVNGTPYHKSCFKC THGGCVISPSNYIAHEGRLYCKHHHTQLIKEKGNLSQLEGELEKGLVIENVNGEEVATES . >LITCHI010820.m3 MLSFEQKPMAAKVSSMFGGTRDKCVGCKNTVYPTEKVRICCNFSIDSYKKPKNTDLLHKT SMLIIVVIIIIITIYVKKVTVNGTPYHKSCFKCTHGGCVISPSNYIAHEGRLYCKHHHTQ LIKEKGNLSQLEGELEKGLVIENVNGEEVATES. >LITCHI010820.m4 MLSFEQKPMAAKVSSMFGGTRDKCVGCKNTVYPTEKVTVNGTPYHKSCFKCTHGGCVISP SNYIAHEGRLYCKHHHTQLIKEKGNLSQLEGELEKGLVIENVNGEEVATES.
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>LITCHI010820.m3 CGTTGAATCTCCAACACTCTAAGAGCTCCAAATGCTGTTGTATGCTGTTAGCTTGGATGA TTTTTTAGTTGAGCTTCATCTATACATCAATGATCAACAATCCCGAATGCTTAGAAATGA AGAATGTTTAAGATAACTAATGCAAGATATTTGTGCTTCTGGTGGTCCCTGCCTCTCCCT CTATCCAAAATTTACCATGAAACCATCTCATGGTTCATATTCACAAGACAAAGAAGATAT TTTTGATGTTTCATTGCTGTTTTAATGGAGAAAGAGGCCAGCTATGAAAATGAAATATAG CTGTTTATTATCCATCTGATCAGCACAAGAGCTCTTAAAAGATATTAATACAAGTAGAAA GGTCTTATAAAAACTACCCAACCAAACCAATCAGATTATCAGACTATACATAAATTTGAT TATCAGTTTTGTACAATTATGTTAAAAGGGTATAAAAAAAGAGAGAGAGACAATGGTAGT TAGGTGCTTGAAAGTTGGACTAAAATGATAGCCAAACTTTAATCATCTATAACTCTGCTT TTGGTCTCCGCAATCCCCTGCAACCCACATTTATCTATCCTTCTTTTTCTTATCTTTTCC TCCTGTTTTCTCCTTCCTATTACCCCCCAGTAGTACAAAAACAGCTCATACAAAGGAAAA ACAATAGGCTCTAGTTGCGTTTGCTGAGGAGAGCATTCAAAGCCATGGCAGCATTTGGAG GAACTACCCAGAAATGCAAGGCTTGTGACAAGACTGTGTATCTGGTTGATAAGCTAACAG CTGACAATCGTGTCTACCACAAAGCCTGCTTCAGATGCCACCACTGCAAAGGAACCCTCA AGGTATGTATTACATTGATTATGTTCTTGCAGATATAGATGTTTTGATAGGATGAGAAAT AGTATTCCTGCCTGTTATGTTCTGCTCTTCTGATTTATTTTGATATTGTGGAACCCTAGA 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