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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI010678 | Chr8 | 7271677 | 7273296 | - | Serine/threonine-protein kinase CTR1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI010678.m1 | 1 | 88 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 76.8 | 1.70E-21 |
LITCHI010678.m1 | 1 | 86 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 49.6 | 3.80E-13 |
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>LITCHI010678.m1 ATGGCTCCTGAATTTCTTCGTGGAGAGCCTTCAAATGAGAAGTCGGATGTTTATAGTTTT GGAGTAATCCTTTGGGAGCTTGTGACGATGCAACAACCTTGGAGTGGACTTAGTCCAGCC CAGGTGGTTGGAGCCGTTGCTTTTCAGAATAGGAAACTTACTATCCCACCGAATACCTCA CCAACATTGACTTCTCTCATGGAATCTTGCTGGGCCGACGATCCGGTTCAGCGCCCATCT ATTGCTAATATAGTAGAGTCGCTGAAGAAGTTGCTGAAGTCTCCAGCCCAGTTGATACAA ATGGGTGGATAA
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>LITCHI010678.m1 - Up_Stream_Len 2000 GTGTCCGCCATCCAAATGTGGTTCTTTTCATGGGTGCAGTTACAAAGCGTCCTCATCTGT CAATTGTGACAGAATATCTGCCAAGGTAAAAAATTCATGTGCTTTGCATGGTAATTGATT CAATATTATCTGAGAACAAACTGCTTAAGATTCTTGGTTTGTAAAACAGGGGTAGTCTAT ATCGGCTCATACACAGACCAGCTTCTGGGGAATTGCTGGATCAAAGGAGACGGTTACGTA TGGCATTGGATGTGGTCTGCAATATTTGTTATCGTAATTTTCATATAATTTTATCTGCCA CTATTGTTCTGTCAGAAAATATTAATTTTGGGTTTTGGAAGCAGGCCAAGGGGATCAATT ATCTCCATAATCTAAGTCCTCCTATACTTCATTGGGACCTTAAATCTCCGAATTTGTTGG TTGATAAAAATTGGACAGTGAAGGTGTGTTAACATCTGTTTAAATCCTTCTTAAATTTCT GCATTTTTTTATGACTGCCTTATCAGATATATGATATGTTGCATTTCATATTTATAGGTG TGTGATTTTGGATTGTCAAGATTTAAAGCGAATACCTTTGTTTCATCGAAATCTGTTGCT GGAACAGTGAGTCATAATCTAAGTCTCTCTCTCTCTCTAAGTATATTAGAATGTTATTGA TATATCTTGATAATTAAGAGTACTTTGGTATCTTCAATAAATTAAGAGTACTTTGGTGTG TGATTTTGGATTGTCAAGATTTAAAGCGAATACCTTTGTTTCATCGAAATCTGTTGCTGG AACAGTGAGTCATAATCTAAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACTCCAAGTATATT AGAATGTTATTGATATATCTTGATAATTAAGAGTACTTTGGTTCATAGGCGTTAGTTACT TGCAGTATACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCTCACACACACACACACACACACAC ACACACAGATTCCCCTAAGCCAAGTATGTTAGTGTGTATTGATATATCTTGATAATTAAG AGTACTTTGGTTTCGTATGCATTGGTTACTTTCTCTTTCTCTCTCAGAGTCCCCTATGCC GAGTATATTAGTGTGTTTATTGATATATCTTGATAATTAAGAGTACTTTGGTTTCATAGG CGTCATTAACTTGCAGTATAAATACCTAACTTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT CACAGCCCCCAACGCCAAATTTATTGGTGTGTATTGATATATCTTGATAATTAAGAGTAC TTCGGTTTCATAGGCATCAGTTACTTGCATTATAGATATCTAACTAGTAAATACCAATCT GTGTTTGTATTGATATATCTTGATAATTAAGAGTACTTTGGTTTCATAGGTGTTAGTTAC TTGCAGTATAGATATCTAACTAGTAAGTAGCCGTCTCTTTGTGACTCAGATACCTGATTA ATCTTTTGAAGTTTTTAGTAATTGGCAGCTGTTCCAGAGGTCTCAGAGCAATTCGACTTT AAACACAATATATAACTGACATTTTTAGCTTGAAGATACTCCCAAGTTATCCCTGATGCT CCTTATCTGTTATTTAAGTGATTAGATAAATGATTATGAAAAAAAGATTACTTCTGGATC GAATTGTAGGGGTGACTTGACTGTAGGGTGAAAACAACAGGTTAAAGGGGTTTGTTGTTG ATGATAAAATTTCCTTTAACGTAGCTCAGGAAATCAAGCTTTTGGAACTGGGAAGGGCAA CTTGTCTGAAATGAACGCTCCCTAGTAGTTGGCTTGAGTTGTATTGTCATGGGAGACAAT CTTCATATATCGCTATTCAACCTTTTGGTGTTATTTTTCAATGATTATAAATGTTTTCCA TTATCCACTATAGAATAGGTTCATTTTCTGTACACTTTGGAAAGTCAGTTATTTCCATCA ATACCTTGCAGGTTGAAAATTTCCTTCGCAGCACATCAATCAGCATGTAACTCTCTTGCT TTTATTTTCAGCCTGAGTGG
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>LITCHI022117.m1 GenomeSequence - ATAGAACCCATTAACACAATAACCCTAGCTAGAACTCAAATTTTGGAACCATGAGGCAAC CGGGGACGTATTCGGGAATACTTTCTGCGAGTATGGCAGGACGAATCGGGCCACATTCAT TGCCCTTGGCAAGGATAAAGAAGATCATGAAAAAATCTGGTGATGATGTTAAGATGATAT CCGGGGAGGCCCCGATCGTGTTTTCCAAGGCTTGTGAGCTGTTCATTGAAGAGATAACGA AAAGGTCGTGGATGGTGACCGTGCAAGGCAAGAGGAGGACACTGCACAAGGAAGATGTTG CATCTGCTGTTGTGGCAACCGATATATTTGATTTTCTTGTCAACTTGGTTTCTGACTCCA CCACCACAAATGAGGCCGAAAACCCTGAAGAAAATGATAAATTATAGAGTCGTCCAACGT GATAATGAGGAGCATATATAGACTTTGTAAGCGCAAGCTATAACTACCAAATTAAGCTTT AATTTTCCTTGTTTTATCGATTAAAATGATGAAATTAATCAATATCT