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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI010652 | Chr8 | 7003262 | 7010554;7014199 | + | MADS-box protein SVP |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI010652.m1 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 87.8 | 2.50E-25 |
LITCHI010652.m1 | 90 | 156 | PF01486.20 | K-box | Family | 46.1 | 4.70E-12 |
LITCHI010652.m2 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 87.8 | 2.50E-25 |
LITCHI010652.m2 | 90 | 156 | PF01486.20 | K-box | Family | 46.1 | 4.70E-12 |
LITCHI010652.m3 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 86.9 | 4.90E-25 |
LITCHI010652.m3 | 90 | 170 | PF01486.20 | K-box | Family | 56.9 | 1.90E-15 |
LITCHI010652.m4 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 86.9 | 4.90E-25 |
LITCHI010652.m4 | 90 | 170 | PF01486.20 | K-box | Family | 56.9 | 1.90E-15 |
LITCHI010652.m5 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 87.4 | 3.30E-25 |
LITCHI010652.m5 | 90 | 170 | PF01486.20 | K-box | Family | 57.3 | 1.40E-15 |
LITCHI010652.m6 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 87.1 | 4.10E-25 |
LITCHI010652.m6 | 90 | 169 | PF01486.20 | K-box | Family | 55.8 | 4.40E-15 |
LITCHI010652.m7 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 86.9 | 4.90E-25 |
LITCHI010652.m7 | 90 | 170 | PF01486.20 | K-box | Family | 56.9 | 1.90E-15 |
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>LITCHI010652.m1 ATGGCGAGAGAGAAGATCAAGATCAAGAAGATTGACAACGTGACGGCCAGGCAAGTCACC TTCTCCAAGCGAAGACGTGGACTTTTCAAGAAAGCCGAAGAGCTTTCTGTTCTCTGCGAC GCTGAAGTTGCTCTCATCATCTTCTCAGCTACTGGCAAGCTCTTTGAGTATTCAAGCTCC AGCATGAAGGATATAATTTCAAGGTATAATCTGCACTCAAGTAACCTGGGCAAATTGAAC CAACCTTCTCTTGAACTGCAGCTGGAAAATAGCAACCACATGAGATTGAGTAAGGAAGTT GCTGATAAGAGTCAACAACTGAGGCAGATGAGAGGAGAGGATCTTCAAGGATTGAATATA GAGGAATTACAACAACTTGAGAAAATGCTTGAATCAGGACTTAGCCGTGTGATTGAGACT AAGGGTGAACGGATTATCAATGAGATTACAACACTCGAAAGAAAGGAGGTTTGA >LITCHI010652.m2 ATGGCGAGAGAGAAGATCAAGATCAAGAAGATTGACAACGTGACGGCCAGGCAAGTCACC TTCTCCAAGCGAAGACGTGGACTTTTCAAGAAAGCCGAAGAGCTTTCTGTTCTCTGCGAC GCTGAAGTTGCTCTCATCATCTTCTCAGCTACTGGCAAGCTCTTTGAGTATTCAAGCTCC AGCATGAAGGATATAATTTCAAGGTATAATCTGCACTCAAGTAACCTGGGCAAATTGAAC CAACCTTCTCTTGAACTGCAGCTGGAAAATAGCAACCACATGAGATTGAGTAAGGAAGTT GCTGATAAGAGTCAACAACTGAGGCAGATGAGAGGAGAGGATCTTCAAGGATTGAATATA GAGGAATTACAACAACTTGAGAAAATGCTTGAATCAGGACTTAGCCGTGTGATTGAGACT AAGGGTGAACGGATTATCAATGAGATTACAACACTCGAAAGAAAGGAGGTTTGA >LITCHI010652.m3 ATGGCGAGAGAGAAGATCAAGATCAAGAAGATTGACAACGTGACGGCCAGGCAAGTCACC TTCTCCAAGCGAAGACGTGGACTTTTCAAGAAAGCCGAAGAGCTTTCTGTTCTCTGCGAC GCTGAAGTTGCTCTCATCATCTTCTCAGCTACTGGCAAGCTCTTTGAGTATTCAAGCTCC AGCATGAAGGATATAATTTCAAGGTATAATCTGCACTCAAGTAACCTGGGCAAATTGAAC CAACCTTCTCTTGAACTGCAGCTGGAAAATAGCAACCACATGAGATTGAGTAAGGAAGTT GCTGATAAGAGTCAACAACTGAGGCAGATGAGAGGAGAGGATCTTCAAGGATTGAATATA GAGGAATTACAACAACTTGAGAAAATGCTTGAATCAGGACTTAGCCGTGTGATTGAGACT AAGGGTGAACGGATTATCAATGAGATTACAACACTCGAAAGAAAGGGAGTTCAGCTGTTA GAAGAGAACAAGCAACTAAAACAAAGGATGGACATGTTATGCAAGGTAAGAAGAGTCGTC ATCATGGAGTCGGATATTGGTATCCAGGAAGAAGGGTTGTCTTCAGAATCTGCTACCAAC GTATGCAGCTGCAGCAGTGGCCCTCCTCTAGAGGATGATAGTTCTGATACTTCTCTTAAA TTAGGGCTTCCCTTCTCTAGTTGA >LITCHI010652.m4 ATGGCGAGAGAGAAGATCAAGATCAAGAAGATTGACAACGTGACGGCCAGGCAAGTCACC TTCTCCAAGCGAAGACGTGGACTTTTCAAGAAAGCCGAAGAGCTTTCTGTTCTCTGCGAC GCTGAAGTTGCTCTCATCATCTTCTCAGCTACTGGCAAGCTCTTTGAGTATTCAAGCTCC AGCATGAAGGATATAATTTCAAGGTATAATCTGCACTCAAGTAACCTGGGCAAATTGAAC CAACCTTCTCTTGAACTGCAGCTGGAAAATAGCAACCACATGAGATTGAGTAAGGAAGTT GCTGATAAGAGTCAACAACTGAGGCAGATGAGAGGAGAGGATCTTCAAGGATTGAATATA GAGGAATTACAACAACTTGAGAAAATGCTTGAATCAGGACTTAGCCGTGTGATTGAGACT AAGGGTGAACGGATTATCAATGAGATTACAACACTCGAAAGAAAGGGAGTTCAGCTGTTA GAAGAGAACAAGCAACTAAAACAAAGGATGGACATGTTATGCAAGGTAAGAAGAGTCGTC ATCATGGAGTCGGATATTGGTATCCAGGAAGAAGGGTTGTCTTCAGAATCTGCTACCAAC GTATGCAGCTGCAGCAGTGGCCCTCCTCTAGAGGATGATAGTTCTGATACTTCTCTTAAA TTAGGGCTTCCCTTCTCTAGTTGA >LITCHI010652.m5 ATGGCGAGAGAGAAGATCAAGATCAAGAAGATTGACAACGTGACGGCCAGGCAAGTCACC TTCTCCAAGCGAAGACGTGGACTTTTCAAGAAAGCCGAAGAGCTTTCTGTTCTCTGCGAC GCTGAAGTTGCTCTCATCATCTTCTCAGCTACTGGCAAGCTCTTTGAGTATTCAAGCTCC AGCATGAAGGATATAATTTCAAGGTATAATCTGCACTCAAGTAACCTGGGCAAATTGAAC CAACCTTCTCTTGAACTGCAGCTGGAAAATAGCAACCACATGAGATTGAGTAAGGAAGTT GCTGATAAGAGTCAACAACTGAGGCAGATGAGAGGAGAGGATCTTCAAGGATTGAATATA GAGGAATTACAACAACTTGAGAAAATGCTTGAATCAGGACTTAGCCGTGTGATTGAGACT AAGGGTGAACGGATTATCAATGAGATTACAACACTCGAAAGAAAGGGAGTTCAGCTGTTA GAAGAGAACAAGCAACTAAAACAAAGGGTAAGTAGTTTTTTAACTATTATTATTCTATTT CTTTGA >LITCHI010652.m6 ATGGCGAGAGAGAAGATCAAGATCAAGAAGATTGACAACGTGACGGCCAGGCAAGTCACC TTCTCCAAGCGAAGACGTGGACTTTTCAAGAAAGCCGAAGAGCTTTCTGTTCTCTGCGAC GCTGAAGTTGCTCTCATCATCTTCTCAGCTACTGGCAAGCTCTTTGAGTATTCAAGCTCC AGCATGAAGGATATAATTTCAAGGTATAATCTGCACTCAAGTAACCTGGGCAAATTGAAC CAACCTTCTCTTGAACTGCAGCTGGAAAATAGCAACCACATGAGATTGAGTAAGGAAGTT GCTGATAAGAGTCAACAACTGAGGCAGATGAGAGGAGAGGATCTTCAAGGATTGAATATA GAGGAATTACAACAACTTGAGAAAATGCTTGAATCAGGACTTAGCCGTGTGATTGAGACT AAGGGTGAACGGATTATCAATGAGATTACAACACTCGAAAGAAAGGGAGTTCAGCTGTTA GAAGAGAACAAGCAACTAAAACAAAGGAAGAGTCGTCATCATGGAGTCGGATATTGGTAT CCAGGAAGAAGGGTTGTCTTCAGAATCTGCTACCAACGTATGCAGCTGCAGCAGTGGCCC TCCTCTAGAGGATGA >LITCHI010652.m7 ATGGCGAGAGAGAAGATCAAGATCAAGAAGATTGACAACGTGACGGCCAGGCAAGTCACC TTCTCCAAGCGAAGACGTGGACTTTTCAAGAAAGCCGAAGAGCTTTCTGTTCTCTGCGAC GCTGAAGTTGCTCTCATCATCTTCTCAGCTACTGGCAAGCTCTTTGAGTATTCAAGCTCC AGCATGAAGGATATAATTTCAAGGTATAATCTGCACTCAAGTAACCTGGGCAAATTGAAC CAACCTTCTCTTGAACTGCAGCTGGAAAATAGCAACCACATGAGATTGAGTAAGGAAGTT GCTGATAAGAGTCAACAACTGAGGCAGATGAGAGGAGAGGATCTTCAAGGATTGAATATA GAGGAATTACAACAACTTGAGAAAATGCTTGAATCAGGACTTAGCCGTGTGATTGAGACT AAGGGTGAACGGATTATCAATGAGATTACAACACTCGAAAGAAAGGGAGTTCAGCTGTTA GAAGAGAACAAGCAACTAAAACAAAGGATGGACATGTTATGCAAGGTAAGAAGAGTCGTC ATCATGGAGTCGGATATTGGTATCCAGGAAGAAGGGTTGTCTTCAGAATCTGCTACCAAC GTATGCAGCTGCAGCAGTGGCCCTCCTCTAGAGGATGATAGTTCTGATACTTCTCTTAAA TTAGGGCTTCCCTTCTCTAGTTGA
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AATTAATATGATCAAAGTCTTGTTAACCCTAAACGAAATATATATGTCAGATGTGGAGAT TGATTACAAAGAAACTGTCCTGTTGATTCCGTAGTCCCGTGGTAGTTGCTGTTATTTACT TTTAAATTATCTCGATGTGTATTATTAATAAAAGACATA >LITCHI010652.m2 CTAACCTTTCCTTTCTTGAACACAGACTAGGCTCACCTGCTTTCTATTTTCCCTTTCTTT TCTCTCTCTTTCTTCAGAATTTGTTTGTGTAATTGGTGGCTTTTGGGTTGCTGTGGTTGG ACCTAACTCTGCTCCGGTCTCTGAACCAGCACTCCAAGAAGGTGCTCAATCTTTTCATTC TTTCAAAATTCTTTGCATGTTCATGACACATGATTGGTGGGTTTTGTTTTCACTTTTTTT TTTTTTTACAATTTTCTGGTTTCTTCAACTGGATCTGAACTGGCCTTCCACTACCTACCT GGCTAGGGTTTCTTCTTCTAAATTTAATAATAAATTAGCAGAAATCCACCCAACTCTTCT TTTTTTACCCTTTTTCCTGGCATTTTATGTTTTTTCTTTCCTTTTACACACACATTTATA GAAACATGTGACCTAATGTTTTAATCCGGGTTCGGTTTCTTCTTTCTTGGAGGGAGAAGA AGAATAAGTAGTAGAACAAATCAATGGCGAGAGAGAAGATCAAGATCAAGAAGATTGACA ACGTGACGGCCAGGCAAGTCACCTTCTCCAAGCGAAGACGTGGACTTTTCAAGAAAGCCG AAGAGCTTTCTGTTCTCTGCGACGCTGAAGTTGCTCTCATCATCTTCTCAGCTACTGGCA AGCTCTTTGAGTATTCAAGCTCCAGCATGAAGGATATAATTTCAAGGTATAATCTGCACT CAAGTAACCTGGGCAAATTGAACCAACCTTCTCTTGAACTGCAGCTGGAAAATAGCAACC 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GGCTAGGGTTTCTTCTTCTAAATTTAATAATAAATTAGCAGAAATCCACCCAACTCTTCT TTTTTTACCCTTTTTCCTGGCATTTTATGTTTTTTCTTTCCTTTTACACACACATTTATA GAAACATGTGACCTAATGTTTTAATCCGGGTTCGGTTTCTTCTTTCTTGGAGGGAGAAGA AGAATAAGTAGTAGAACAAATCAATGGCGAGAGAGAAGATCAAGATCAAGAAGATTGACA ACGTGACGGCCAGGCAAGTCACCTTCTCCAAGCGAAGACGTGGACTTTTCAAGAAAGCCG AAGAGCTTTCTGTTCTCTGCGACGCTGAAGTTGCTCTCATCATCTTCTCAGCTACTGGCA AGCTCTTTGAGTATTCAAGCTCCAGCATGAAGGATATAATTTCAAGGTATAATCTGCACT CAAGTAACCTGGGCAAATTGAACCAACCTTCTCTTGAACTGCAGCTGGAAAATAGCAACC ACATGAGATTGAGTAAGGAAGTTGCTGATAAGAGTCAACAACTGAGGCAGATGAGAGGAG AGGATCTTCAAGGATTGAATATAGAGGAATTACAACAACTTGAGAAAATGCTTGAATCAG GACTTAGCCGTGTGATTGAGACTAAGGGTGAACGGATTATCAATGAGATTACAACACTCG AAAGAAAGGGAGTTCAGCTGTTAGAAGAGAACAAGCAACTAAAACAAAGGAAGAGTCGTC ATCATGGAGTCGGATATTGGTATCCAGGAAGAAGGGTTGTCTTCAGAATCTGCTACCAAC GTATGCAGCTGCAGCAGTGGCCCTCCTCTAGAGGATGATAGTTCTGATACTTCTCTTAAA TTAGGGCTTCCCTTCTCTAGTTGAACTGGGGCACCATACGAGGAATCTATTGCTGCGTGG AATTGGAGATTTACATTGTGTGTTGTGAAGGAGACATTGTTTGGGTTTCTCTTAAATCTC ATCTTGCTGGTGTCGTTGCTATAATGCGTTAGCTAATATATTTGTTTCTAGACATCTTTT AAGATAATTATTTTCTTCTCTTTCTAATTAAGAGCGAGTAACTTCGGTTGTAAACTAATT TATTGGCCTGTTTAATATGCAGGGCCACAAGAAATTAATATGATCAAAGTCTTGTTAACC CTAAACGAAATATATATGTCAGATGTGGAGATTGATTACAAAGAAACTGTCCTGTTGATT CCGTAGTCCCGTGGTAGTTGCTGTTATTTACTTTTAAATTATCTCGATGTGTATTATTAA TAAAAGACATA >LITCHI010652.m5 CTAACCTTTCCTTTCTTGAACACAGACTAGGCTCACCTGCTTTCTATTTTCCCTTTCTTT TCTCTCTCTTTCTTCAGAATTTGTTTGTGTAATTGGTGGCTTTTGGGTTGCTGTGGTTGG ACCTAACTCTGCTCCGGTCTCTGAACCAGCACTCCAAGAAGAAGAATAAGTAGTAGAACA AATCAATGGCGAGAGAGAAGATCAAGATCAAGAAGATTGACAACGTGACGGCCAGGCAAG TCACCTTCTCCAAGCGAAGACGTGGACTTTTCAAGAAAGCCGAAGAGCTTTCTGTTCTCT GCGACGCTGAAGTTGCTCTCATCATCTTCTCAGCTACTGGCAAGCTCTTTGAGTATTCAA GCTCCAGCATGAAGGATATAATTTCAAGGTATAATCTGCACTCAAGTAACCTGGGCAAAT TGAACCAACCTTCTCTTGAACTGCAGCTGGAAAATAGCAACCACATGAGATTGAGTAAGG AAGTTGCTGATAAGAGTCAACAACTGAGGCAGATGAGAGGAGAGGATCTTCAAGGATTGA ATATAGAGGAATTACAACAACTTGAGAAAATGCTTGAATCAGGACTTAGCCGTGTGATTG 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