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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI010538 | Chr8 | 5812058 | 5812961 | + | Protein TRANSPARENT TESTA 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
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>LITCHI010538.m1 ATGGATCCTCCTCCAGATATTTCATGTCACTTAAGTATCCTCACTGCTTCTTCTAAAAAG CATGCACATATTGAGCCACTTGATCTCTTTCCAACTGCAACAAAAACTCCCCACGAGTCT ATTTCATTGCTAAGCTGCTTGCATGGCTCGGTGGAAACACCCTTGAGTGGAAACCCTAAA GCATACAATGAAGAAAAAGAGGATGTCACGGTCGCGTTACACATTGGCCTTCCTACTTAT TCCCATAATAGCTCCAACCATACCAATGGGACGGGAAGCACAAAGATGGAAGCTAAAAAA TATTGGATACCAACTCCTGAACAGATACTCATTGGCTTCACCCATTTTTCTTGCCACGTC TGCTTCAAAACCTTCAATCGCTATAACAATCTTCAGATGCACATGTGGGGTCATGGATCA CAATATCGTAAAGGACCTGAATCGCTGAAGGGGACCCAACCGCGAGCCATATTAGGCATT CCATGCTATTGCTGTGCGGAAGGGTGCAAGAACAACATAGAGCATCCAAGGGCAAAGCCG CTCAAAGATTTTCGAACATTACAAACACATTACAAGAGAAAACATGGGCTGAAACCTTTT ATGTGTCGCAAGTGTGGCAAATTCTTGGCTGTAAAAGGTGACTGGCGGACTCATGAAAAA AACTGTGGAAAGCGTTGGCTTTGTGTCTGCGGATCTGATTTCAAACACAAGAGGTCACTC AAAGACCACATCAAAGCATTTGGCTCTGGCCATGGCCCTTTTCCTCCTTCTTTTGATGGC GTTGACGTACTTGGAGATGCTTCAACTTCGTTTCTTGTATAA
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>LITCHI010538.m1 MDPPPDISCHLSILTASSKKHAHIEPLDLFPTATKTPHESISLLSCLHGSVETPLSGNPK AYNEEKEDVTVALHIGLPTYSHNSSNHTNGTGSTKMEAKKYWIPTPEQILIGFTHFSCHV CFKTFNRYNNLQMHMWGHGSQYRKGPESLKGTQPRAILGIPCYCCAEGCKNNIEHPRAKP LKDFRTLQTHYKRKHGLKPFMCRKCGKFLAVKGDWRTHEKNCGKRWLCVCGSDFKHKRSL KDHIKAFGSGHGPFPPSFDGVDVLGDASTSFLV.
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>LITCHI002464.m1 ATGCGCTGGACACAAGAACTTCATGAGGCATTTGTGGAGGCTGTCAATAAACTGGGTGGG AGTGAACGAGCTACGCCGAAGGGCGTGTTAAAGCTCATGAATATTGAAGGGTTAACCATC TATCATGTTAAAAGCCACCTACAGAAGTATAGAACTGCTAGACACAAACCAGAGCCTTCA GAAGAAACATCAAAGAAAAATTTGTCTTCTGAAGATATGAAATCTTTGGGTTTGAAGAAT CCTGTTGCTACCATATTACTTTTCCTGTCAGCTAGTCTAGAATTTTCACTCTCATCAAAT AGATTTTCAAGATACCTTGTAAATGACAATATTCAAAGAACTTTGCAGGTGAGAATCAAA GAACAGGCAAAGTATCTTCAGCAGATGTTTGAGCAACAAAGAAAAATGGAGAACGATAAG TGCAAGGCCTTATCATTCAACCCAAATTATCACTCTGCTGCATTGTCAAAGCCAGAGCAG AATTCTTCCAAAAACGAAAAATCAGATGCCACTGAGTTTAATGTTGCCAAAATAGGTGCC ACTACTGGTCAAGACAACACTGCACAACAAGAAACTGCTGAGGATCTTGTCATTGTCCTA GATCATTCTGACCACACAACCACAAAATGA
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>LITCHI002464.m1 - Up_Stream_Len 2000 AGTGTTCCTTGATTTATGGGGTTTTACTTCTATTATTCATCAGATTGTTTTACATGCTTT GCGTATGTGTGTTTCTAATTGGTTGAAGTAATTGATTTATGAAAATTCTGAGCTGATTTT GAGATCTGGTATGGTTTAACTTGATCTATTATAAACTAACATAATTATTGATAGTATTTT TCAGTCTGAAGGTTGAGAAACACGAAACTGATTCAATATATCTACATTAATGAATTATAT TTTGTGATAAAGATACTTATTGATTAGTCTGTTGCTGATAATGAAAGGAAAATTTTGGTG GTGGTGATGATGATGAGATTGTTGAAGAGGGAGGATTAGAGGATATCGCACCTAGACCCT CTCATCCTCATATACGAATATTATATTATTATTTAATATATTTTATTTTTAAGTGTATAT TCATTTTAGAAAATAGAAAGATTGTGGACGTGTTATTTAGTAATACATAGTTGAACAAAG AGATGGAATTTTTAAACATAATAGATGGAGTGTAATTTTTTAAATATGTAGGTTATATTT CCTAAATACTCAAAAAATTGGAAAAACTCTGTTAAAATTTGTATGAAATTGTTATATGAA GAGTAATCGGTTGTTTGAATTTGTTTTGTCAACTTATATACTAACTATATTTATATATTG TTTTTTATACGAGCTTCAATCAAACAGCTGCATGATGACATTGTTGGAAAGTATGCAAAG GGTGGAAGCTTATTTGAAAATCCGTGAGCCTTCGGATGGTAGAGATGATTCAGATAACAA CAATGATTCTAAAAGCTTTATCCAGGATGGTCACCACTCACCACCCCATCATGACCCACC ATGGTGTTAGCGATGAGGTCCAGCACTTCATATGTAGTGATGACTCGGTAAATTTTGTAT TTATTTTACATTTTAGTCTTACATATCATTCTAAATGTCTAATTTTAAATTTTGATTTTC TTAAAATTGAAGGGAAGGGTTATCCATGAACGGCTTCTACCCCCGAAAAAGAGAAAGAAA GTGTTGAAGGAAGTGATGGCGGAGGTGGCACAATTTCCCCCCTCAGAAGTACGTACTACA GGATCCATTAACCATCCTGAGAAAAGTACCTACTGCGTTGATTCGTTTAAGTGATTTCTT GATTATCTTGAAAACATCCCTGTTCAGACTGATCTGTTGCAAAGCAACACTGGTGATACC ACATTTGACGATCATGGTAAGGGAAGCGAGTGGCAGCGGTGGGCAGAACAATTAATCTCT GTTGATGATGGGCTGGACCCGAATTGCAGTCAGATTCTTGCTGATGTTAATGCAGCAGAT GAAAGATGAAAGGTCAGTTCTTCAACATAAAAATATATTTTGGTGCATGTGCAGCGCTTC ATGATGATTGTTTGGTACATGTCAGGTGCACCTGGGGAATACATGCCTGGTTGCCTCCTT GTTTTTTGATGCTTAAATTGCTGCATCATTCATGGACAAAATATATATTTTCATCCCTAG TACATTTTAGCCTGTCTCACATTGTTAATTGTTCTGATAGATGTTAGAAGTGTTGGTGGT CGGTCAAAGGCATGAGGACACTATCCATAATATCTTTGGAATTGTGTACTTGACTATGAT TATGATTTACCAATAGTGACGTTTATTGCTCCCTTCAATCCAACATGATAATTGGCAAGT TCAGATGCCTACAAATTCATGTCATTGACCTTAATTTTTCTTCTCGTTGGCTGGTTTTCC TTTAGCCTAATATATAAGTGCAGTAGGTGTTACCCTTTCCCAGCCAGGCAAATCAAGTAA AAATGGAACTTGTTTCGTCCACATATTTTTGTCCACTGGTTTCTTTTGGTGTTTAATAGT GCTAGACAATGTAAAAGGTGCCGAAACCATCTAACGATATCTCAGTGCAACAATGCATAA TTAATCAGCAGCAGTCTTTGCGAAATGATCAACCAAATGCTGCTGCCAACCCATCCTCAG CAGCTGCAATTTAATCTAGA
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>LITCHI002464.m1 GenomeSequence - ATGCGCTGGACACAAGAACTTCATGAGGCATTTGTGGAGGCTGTCAATAAACTGGGTGGG AGTGAACGTGAGTACCACGCTAGTAGCATTGTCCTATTTGATCTCATTAGAGCCTGGAAA TTTTGTGATTTCCTGTCATTCTGACAATTAAGTTTATTAACAGGAGCTACGCCGAAGGGC GTGTTAAAGCTCATGAATATTGAAGGGTTAACCATCTATCATGTTAAAAGCCACCTACAG GTCTGTATATAACCTTTATTTTGGTCTGTTTGACAACCTAGTTTAGGTGTTTATCTATAT ACTGATTCAGCTAAAATAATTTTTTGAATGCAGAAGTATAGAACTGCTAGACACAAACCA GAGCCTTCAGAAGGTAAGGGTGATTGTCTGCTTTCTTTAACTTTCCCTTGGTCATAGCAT TGCCATAACGTCTGTGCATGGTGAATTTGGAAGCATACAATTGTTTGAACATATTGTTCT CTTTGCAGAAACATCAAAGAAAAATTTGTCTTCTGAAGATATGAAATCTTTGGGTTTGAA GAAGTAAGCAACTTCTTTCATCTGGAGTTTCAATACGAAGTTGCTAGTTTCTATATATGG ACTTTATTTTATTTTGGAAAGCATTTTTATATGTACAAGATCTTGGCTATAAATGTGTAT AACTGCTAAGATTTGTTTCTCTTTGTTTGAAGTTCATGCATTACTATGACATTGTTATGG TATTTTTATTCAGTAGAAAATTTGCTTGTTGTCAACTTTGTATGTTGTGTTAGCAATGTT GTTGTCATAAGGCTCTATGATTCCTTAGTCCTGTTGCTACCATATTACTTTTCCTGTCAG CTAGTCTAGAATTTTCACTCTCATCAAATAGATTTTCAAGATACCTTGTAAATGACAATG TAAGCATAAATATAATATATGCTATTACATTATTATGAAATTAAATTTCACTATTCTTTA AATATTCTACTCTGCTGTTCATCATTATACTTGATTTCATGCGGTGGTTCTGGTAGGAAC CAGGTCGAGCAGGGATTTGTTTGTTATCACTTTCTCAGAATCATTAAATTCAATCAGTTC ATTTGATGTATTTAAGTTTCACTTCGTTATTAATTTTGTGCTAGTTCCAGTATACTATAT GATTTTAGTGCCAAAAAGGGACTGTATTTTTTTTTTTTTTTTCAATTGAAATGCAGCTGT TTGTAATGTGGTTTCTGTGCTTTGGTTCTTTGTGCTACCTTAGCTACTCCCAAGAACTTT TTACTTAAGTACCCGCAATGTAATAGTGAAAAGTTAGCATTATTTTAGGCTTGCAATTCA TCTATTGTATCGTTGATTTTGACAGCAGTACCATGAGCATCACTGAAGCATCGCAATTGT AGATGGAAGTTCAGAAACGGCTTCATGAACGACTTCAAGTATGCTTCTAATTTTAGCTTC AATTCCTCTATATGTTAAGATATAAGACAAAATATTAACCCGAAGATATATATGCTTCTA TGCTTAATCTTTTGTGTCAAAATTGAGGAAAATAAGTTTTATGAGAAATTAATGATTGAA TAAACTACAAATATGTCCTAAATATAAATAAATGAAAAACAGAGAGACTGCAAATGTGAT GCTTCAGAGAGTAAAACCTGGCAACCTCCTTATTTTATTTATTTATTTTCTTTATGAAAG TATAAAACCTGGCAATTTTGACATGTGACCAAGAGTTCATGCCAAGTGTAAACTTGATGA TAAAGTGTATTGTTTGAAAGTTTGAACAATTAATTCTTTCTTGAACTTCTGAATGGAAGA ATATTTTGTTTTCTAGTTCTAATGTTTTGAGCTCTCAAACTTGCATTTGCCTTCGTAGTT GCACATCTACTGGTTTTCATATTTGCTGATTTCTTCTGCTTGTACACAGATTCAAAGAAC TTTGCAGGTGAGAATCAAAGAACAGGCAAAGTATCTTCAGCAGATGTTTGAGCAACAAAG AAAAATGGAGAACGATAAGTGCAAGGCCTTATCATTCAACCCAAATTATCACTCTGCTGC ATTGTCAAAGCCAGAGCAGAATTCTTCCAAAAACGAAAAATCAGATGCCACTGAGTTTAA TGTTGCCAAAATAGGTGCCACTACTGGTCAAGACAACACTGCACAACAAGAAACTGCTGA GGATCTTGTCATTGTCCTAGATCATTCTGACCACACAACCACAAAATGA