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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI010515 | Chr8 | 5571939 | 5573836 | + | Transcription factor MYB16 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI010515.m1 | 31 | 78 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 61.4 | 7.50E-17 |
LITCHI010515.m1 | 34 | 94 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 52.5 | 4.70E-14 |
LITCHI010515.m1 | 84 | 129 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 56.4 | 2.70E-15 |
LITCHI010515.m1 | 87 | 133 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 29 | 1.00E-06 |
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>LITCHI010515.m1 ATGCAGGGAAGCAACCTCCAGCAAATTAACAATATAGATAATAAAAACAAAATGGGAAGG TCTCCTTGTTGTGATGAGAATGGCCTCAAGAAAGGCCCCTGGACTCCAGAAGAAGATCAG ATGCTTGTCCAGTACATCCAAAAACATGGCCATGGAAGCTGGAGGGCTCTTCCCAAGCTT GCAGGTCTGAACAGATGTGGCAAGAGTTGTAGATTGAGATGGACAAACTACTTGAGGCCT GATATTAAGAGAGGGAAATTTTCTCAAGAGGAAGAGCAGACAATTCTCCATCTCCATTCC ATCCTTGGAAACAAGTGGTCAGCAATTGCAACCCACCTACCAGGCCGAACCGATAATGAA ATCAAGAATTTCTGGAACACCCATTTGAAGAAGAAGCTGATTCAGATGGGAATTGATCCA ATGACTCATCAGCCCAGAACTGACATATTCGCTAGCTTGCCTCAACTAATAGCGCTTGCC AACCTCTTAGAGAGTCATCAAATCGATGAGCAAGCTGTGAGATTACAAGCTGAAGCTGTT CAGTTGGCTAAGATTCAATACTTACAATCTCTTCTCCAATCAGCAACTTCTATGTCTACT GCTACCCCATATGACCAAAATGGCATTACAGACATGGAAGCTCTTAATTTATTGAATTCC ACTCCTCCTCTTAAAGAAAACCCTGTTTTAAATTCACCACAAACAGGGAATAGTACTCCT GCAGCCTCATTTTCACAGCTTGAAATTGCAACCTCTCAACCACTCCACCATCCAGGTCTA TTATCTCACTTGCCACCCCCACAAGTCCCTTTCAATTTCCAAACATCGTTGAATAATGAG ATGGGCCAACCTCCTAATGACTTTGCAATGGTCAGCCAAGGTGCTAATGATCACCCACCT GACTCTTCATGGATTCTTCCATCTCCACCTACTGTTCTTCCATCTTTAACTGATCATGAT CAGACATCCATGAGCAATCCAGGAGATGCAAGCAGCACTTCTAGCTATGGTGGAGGAACT TCTTCATACTGGCCTTCTGATCAACTTTATTTCGACGATTCTATTATGCAAGAGATTTCT TAG
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>LITCHI031373.m1 - Up_Stream_Len 2000 GTGGCACGCCGCCACGTGTTGGTCTTCGAAGAGTCACTTCGAATTTTCTTGGCAGAGAAT TGGAGGTTGTGATTTGTCAAGTCCAAGTGTGTGTTTGTTTGCGTCTTTTGGATTTGTGGT GTGGGGACTCACTCAATTTTTTTATTTTTTTTATTTAATTATTCACACTCAAAGTTGTCT ACCATGAAGTTGGTAGACACAACTAGATATTTTTGATGACTAACCACAAATTTATTCCTT TAATATTGCACCTTTACCTGCTTTGCAACCCAACCTCTTCAGTTTTCTTTAATTTCTAGT TGTTGCCATGTAATTTTCAGATTTTTTGTCTACTCCATCATTGAGGCGCCTAATAGGTCA AACGGGTCAATTCAGTTGTCGTTGTGAGCATGCTACATAGACTAGAATAAGATGATGAGC ATATGCCACGGCTTGATACAATTTATCGGTTTTGGTACTCTTGGTTAATTAATAAACAAA TAAATCATTAATAATTTTTATGTAAATTATTAAAATTTAGATATTGATAATTAAAATATT TAAACATGAGTTCTTGAAGCAAAAAAATAGATATATATTCTAGATAAATTTTAAATTAAA TTGAAATTCTTTTATAAAGAAGATGGATAGAGGTGAACGGGTTCAAGGATATTACCAATG CCCCTTCTCTTAATTTAAAGTCTATAAGAATTTGACATCATTTATATGTTAAGATCGAAT AATCAATTAAAAATGATTTTAAATATTGGATTAGATTCGATGAAAAATATTGTTGTCATT CCCATAATTTTTCAATCCCAACCACTTGTTATAATCATAATTACACCATACATTAAGTAA TAAAAAGGGGGAAAATCTAAAACAACATCCAACAGAACAACAAGACTTGTACCAAAAAAG GTCAAAAAAAAAACCCAAGACTTGGACAGCCAAAACCACAAATAGAATAAAATAAAAGTC CATGATGGCAATAAAAAGTTAAAAACCGACAAACAATCAATAACAATAAAAAGAATAGTG AGGTTCGAGGCGACCGAGGTTTTTGTGGACAAGCGATGTGCATAGAAAAAAGAAAAAAGC CAAGAACACAAGTCATCTTCATCATCCACCACAAAATCACCATAAAAATCCATTTCCAAA ACCACACGACCAAAAATAAACATTCTCACTCCCACATATTATAATAATAGTATTATAAAT AAATAAATAAATTCAAATTCAATTCATTAATATATTTAACTTTTTTTATATATTAATTTT TATTAAAAATGATTGAATATTTCTTTAATTAAAAAATAAAAAATTAACTTTTACTCTTTT ATTTTTTTAACTTTTAAATTATTAAAACTACTAATTTTAATCATTTATTATATTTTTTTT TTATATCACTAATCTTAGTTTTTTATTGTATTTTTTTTTAAAAACACTTATCTAACTGTC ATTCATTGCATTATCTCTTATTCATAAGATTATTAATCTTAATCATTCATTATATTATCT CTCATATTTAATTCAAATATAATGAATTATTCATTGATTCTCTCTCCTAAACTAAAAACA TTTTTATCTCCGATTTAATTCAAATATAATAAATGATCACAATTAATAATATTAATAAAT CTCAGTTACTCATCACATTCTCCTTTATATTATTAAAACCATAATTTATCTAGTCATTGT ATTTTCTCTGCTTAAAATATATTTTTTTTAATTTAATTGAAATCCAATAACTTATTGATG TTAATAATTCTAACAATTTAAAAATTAAGTACACTTATTATAAAATATATATTTGAATAA TTTTTTTTTAGTTTTAAATAATTAGATTATAATTATATAAATAATAAAGAAATTATAAAG GAAGCAGCACCGCCACCCTAATTTTCCCTCTTAAAATTTGTGTCATATTTTGCTCCCTCA AGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCATACAAAATCTTCATCGTTTCGACTTTCG ACACATACAACGAAACTATA
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>LITCHI031373.m1 GenomeSequence - CTAATTTTCCCTCTTAAAATTTGTGTCATATTTTGCTCCCTCAAGTCTCTCTCTCTCTCT CTCTCTCTCTCTGCATACAAAATCTTCATCGTTTCGACTTTCGACACATACAACGAAACT ATAATGACGAAGCATGGAGGAGGAGGAGGCCGAACATGTGAGCTCTGCGGACGCGACGCC TCCCTCTACTGTGACTCCGACTCCGCCTTTCTCTGCCGGAGTTGCGACGCTGACGTCCAC CGGGCCAACTTCCTCGTCGCTCGTCATCTCCGCCAGGTCCTTTGTTCGAAATGTAAATCC TTAGCTGGAAGCTTCGTCTCCGGCGCCGCCGTTGGATCCGACTCTCTTCGGCTGCCTCTT TGTAGGTCCTGCACGGCGGAGGAGGAGGACGAGGAGGAGGATTGTGTTTCCAGCGCTGAG AGCTCTGCCGTCACCGGCAAGGCGAAGGCGACGACGGCCGGATTCAAACGCATGGCCAGC TCGTCCAGCTCCGTCTCTGACGTCCTCTCCGGCGAGAATCCCGGATCGTCGGGGAAAAGG AGGAAAACGGCGTCGGATTCAAGGGCCGAGGGTATTTTTGTAAGTTGGAGTAGAAGGCTG GGGCTAAATGGTAATTTGGTGGTCTCGTCGGCCTGTCGAGCGTTGGAGTTGGGTTTGGAT AGACTCAATACGACGACGGTCGTGCTGCCGTTGCGAGTTTGCTTAGCGGCGTCGTTTTGG CTGGGATTGAAAATGTGCGGTCGCGATGTTGCCACGAGTCAGAATCTGAGGAAACTCGAG ACGGTGTCTGGAGTGCCGGCTAAGTTGATCGTGGCCGTCGAAAGGCGTCTGGCGCGTGTG ATCAGACTCCGGAAGCGAAGGTGGATTTGGAGGAGGGTTGGCCGAGTCTGATGTTTGAAT GGGCGCACGTGCGAGTCACGAGTTTAATTTTTTTTTTTTTTTTAATCCGATTAAAAATAG AGATCTTATATTAAAAAAAAAAAATTGTAAAATGATGGGTAGATTTGTAGTGTTTGGGTT TGGAGCGATTAATGGGTGATGATTTTTAGAGACTGACTGATGTACTAAATTTTGAATAAT AATAGTGATAGGTTTTGGGACATATAATATCAACAATTATCAAACTTTTTGATTTTTAAT TTATGATGGTGTTTTGTAGGATATTTGTGATTTGACTTGCCTCTCAATGCATGCCTAATG ATTTCTCTTGATTAAAGTTATTTAAGGATATTTATACACCACTACTTGGTTCTTCAATAC ATAAAATGTGTAGAATTTGATTTTTTTTTTTTT