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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI010375 | Chr8 | 4401387 | 4404659 | + | Auxin response factor 17 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI010375.m1 | 125 | 226 | PF02362.24 | B3 | Family | 78.3 | 3.60E-22 |
LITCHI010375.m1 | 254 | 335 | PF06507.16 | Auxin_resp | Family | 85.4 | 2.60E-24 |
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>LITCHI010375.m1 ATGCCTCAGCAACGACGCCCCTCTCCCTCCCAGCCAAGCCGGGTCGACCCGGCCGTCTGG CGCGCTTGCGCCGGTTCTCTTGTTCAAATCCCTGCCGTCCATTCTAGGGTTTACTACTTC CCCCAAGGCCACCTGGAGCGATCCTCTCCCTCCCCTACCGTCCTCTCCTCTCTCAACATC TCCAGTGCCGTCATCCAATGCGTCGTCTCACAACTTCACTTCCTCGCCGACCCCGTCACC GACCAAGTCTTCGCCAAAGTGCTTCTCACGCCTGTCAACACTCTAGAGCATTCCAGAGAG CAGCAGCAACCACGGCACCAAATGGAGGACAGGAATGTCGAGAACTATGTTCACGAGAAT GTCGTGGCTCCGTTTGCTAAGATTTTAACGCCGTCAGATGCTAATAACGGCGGCGGCTTC TCCGTCCCGAGATTCTGCGCCGATTCGATCTTCCCGCCGCTGAACTACCAGGCGGATCCT CCCGTGCAAACCCTATCCATCACCGACATCCACGGCCACGTTTGGGATTTCCGCCACATT TACCGGGGGACGCCTCGGCGCCACCTCTTGACCACCGGCTGGAGCAAGTTCGTCAACCGC AAGAAACTGATCGCTGGTGATTCCGTCGTTTTCATGAGAGATTCGATGGGGATGCTGTTC GTCGGAATCCGGCGGGCAGAGAGGTATGGGAGCAGTGGAGGAGACGGTGCGCGGTGGGGG GAGCATTCGGGAGTCAAGGTGGAGGCGGTGACGGAGGCGCTGGAGAGGGCGTCGCTGGGG CTCCCTTTCGAGGTGGTGTATTATCCTAGGACTGGATGGCCGGATTTTATAGTAAGGGCT GATGTTGTGGAGGCCGCCATGAAGATCTTTTGGACAGCTGGCGTGAGAGTGAAGATGGTG ACAGAGACGGAGGATTCCTCAAGGGTCACGTGGTTTCAGGGGACCGTTAGCGATGCTTCT ATGCCCACTACTGGGCCTTGGTGTGGCTCTCCATGGCGGATGCTTGAGGTTACATGGGAT GAACCTGAAATTCTGCTGAACGTGAAGAGAGTAAGCCCTTGGCAACTTGAGTTTGTGTCA TCCTCCCTACCACTTCATACCCCTTTCCCCTCAGCAAAGAGATTGAAATTTCCTCAGAAT TCTGGGTTGGTGACTGATGGAGAGGAGGACATCTTCTCTCCGCTGAGAGGATTAACTAAT TCAACAATGGGGCAGATGAACCCTTCATCGTTGAATTGTAATACTTTTCCTGTTGGCATG CAGGGAGCCAGGCAAAATACTAATAGCATTTTTAGTTTATCAAATTTCATAAGTGAGAAT ACTCATCAGACATGCACTGAGAATACCACTGGCATCAACATTGTGCCAAAGTTGAAAAAT GTGTGCACTGAGTTGAACATGGGCAGTTCACAGTCTGAGAACTTGTCACCTGATAGCCAT AGTAGTGCATACTCCTTTGGCACTGAACTTGGAAATCAGGGATGCAACTCCTCTAAAATT GGGGCTAGTTCATTTCAATTGTTTGGTAAGATCATACATATGAATCAGCCTGTTGAAAGT GGTTTTGATGATGTTGCTTGTGTAGAAGATGATGGTGGCAAGGAGTTCAATGAAACTGAA GGTGCGAACAAGCCAACAGATCTTTCCTTGACTTACACGGCACTGCTTAACAGGTTTGGT GTCCAATGCCAAGGCGAATCAGCAGATGAAGAAACTTGCTCTTTATGA
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>LITCHI010375.m1 MPQQRRPSPSQPSRVDPAVWRACAGSLVQIPAVHSRVYYFPQGHLERSSPSPTVLSSLNI SSAVIQCVVSQLHFLADPVTDQVFAKVLLTPVNTLEHSREQQQPRHQMEDRNVENYVHEN VVAPFAKILTPSDANNGGGFSVPRFCADSIFPPLNYQADPPVQTLSITDIHGHVWDFRHI YRGTPRRHLLTTGWSKFVNRKKLIAGDSVVFMRDSMGMLFVGIRRAERYGSSGGDGARWG EHSGVKVEAVTEALERASLGLPFEVVYYPRTGWPDFIVRADVVEAAMKIFWTAGVRVKMV TETEDSSRVTWFQGTVSDASMPTTGPWCGSPWRMLEVTWDEPEILLNVKRVSPWQLEFVS SSLPLHTPFPSAKRLKFPQNSGLVTDGEEDIFSPLRGLTNSTMGQMNPSSLNCNTFPVGM QGARQNTNSIFSLSNFISENTHQTCTENTTGINIVPKLKNVCTELNMGSSQSENLSPDSH SSAYSFGTELGNQGCNSSKIGASSFQLFGKIIHMNQPVESGFDDVACVEDDGGKEFNETE GANKPTDLSLTYTALLNRFGVQCQGESADEETCSL.
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>LITCHI010375.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTGGTACTGAACCGTGCTAACTCTGCTTTTCGTATACTTATTGAACAGCCCGTTTGATTG AGGCAGTTGCTTCTTAACCTACAATTTAGGCCTACATTCTTTATTGTGGCCTACGTATGT TTTCTTTTCTACTTTCTAGGTGCCATTTATTGGCATCTCTTAATTAGATTTTACATTAAT TTATATAATACATATTTATATATAAGGAACAAATATTCTTGCTTCCGAAAAAAAAAAAAA GAAAGAAAGAAAGAAAGAAACGAATATTCTGTCTAAAATGAGTAACTGTCTAAGAGGAGT GAATTCATGTGCCGACGGATTTAAATCCCATTTATTTACGAGGATTTAATTATTATGCGG AAAACAAACATGCGGTTATAAAGAAGAATTGTTTTTCTATTAACACATTGTCAACAATAC TAGTAATGAAATATTTGTAAATTTTGCCAACATATTTGGTGGAAGTACCGATATGCGATT TGGTGAAGTTCGTTGTGTGAACAGGATTATGCTTAGTGATTGTGAAGTACAGATATGCAA TTTGGCGAGGTTGGTTCTATAAATAGAATTTTTTCATGTTCTCGTTCAAATTTCGAACTG GCATTTGCAATTTGTATAGGGTGGGGATTAAGATAATATAAAAATTATCCTTTTCTCTGA AATCGAATTAAGATATATATATCTGTGTATATATATATCACATAATTTTAGTGATATATA TCCAACAAAATTAAAGTATATCTTAAAAAAACACTAATTTATAAATTCAAGTCAGACAAT CATAATTTTTCTTTTTGTCAGAAAAAAAATGTAAATATTCGTGTGTGGTGGGTAATAAAA CAGTTGAAAAAACAAGGGACATGTCGGCAGCAGGGCATACCAGTAGACTAGAGCATTAAG AGTCCGATCAGTGCTTTGTCCTTTCAGTCATGTTTTTGTGTTCAGATTTGCTAATCCCAA CATACCATTTACGAGTTGCTAACACATCCTCAAATCTCAATCTTCACCAGTCGGGGCTCG AATTAATTTTGCAGTTCAATATTCCGCTTTTCGTCGTTATTAAATTCTGTACTGTTCGCT ATTTCCAAAAAAAAAATTCTGTAATCTATTCTCTATATTGCAGCTAAAGTAGAATAAATG TCACTAAAGTCTATGATTTTATCAGGGTTATTTATGACATTTCATATTTGCTCAATATAT CGAAGATAAATTACTGTGAATGAGTATTATTTTTTTTTCATTTTTTATGAGAAAATGAGT ATTATTTTTCAGTACATGAATTCCGCTGCAGAGTTGAGATTTATACAACAAACAAACGCT TATCCTTTGCCTACAAAATCGTGTGCTCTCTACTTGAAAAAAAAAAAAAGAATTGTGTAC TCTCTACTTGATAGGCTCCCTGTCTCTTCCGACTCTCCTGTCTTCAAATCACCTGTGCCT TGTGGCCATTACATCACAAAGATAATTCAAAACAATTCTTGTAAAAATTAAATATCAAGT TTTAAAATAAAAACTTGTCAAAAAAATCTAAAATAAAAAAATCAATATTGATTCTATCAA TTTTCAATATATAAATAGAATAAATTAAAAAAAAAAAATCAATTAAGCAGAATTTGTTAA ATTATATACTAGACCACAAAAATCTTAATAAGTAGACTAGAGTGCTGATAAGATTTATTT ATTTATTAAAAAGTGCATAATTGACGTTGATGCCATAATGTTGCAAGGAGGGTGGCCCAC GGCCCACTTAAAGTGTAGGGTAAAAGTGTAAAAAAGTGGTCTGGGACGTATAGAGTAGGG AGAAACTGAGCTCCGATATATTGTTTAGGTTGGCTGGTGATTCTCCGACCCCAACACGTC TCTCTCTCTTGCCCTCCTCAAGACACACTAATGTACTCACTCTCACACGCTATAATTACT GTTTTTAGGAGGGAGACACGCACCAGAATCCCACTCTATGTTAAAACTCTCTGATTTTTG CAAAACCAAAACCCTAACTG
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>LITCHI010375.m1 GenomeSequence + ATGCCTCAGCAACGACGCCCCTCTCCCTCCCAGCCAAGCCGGGTCGACCCGGCCGTCTGG CGCGCTTGCGCCGGTTCTCTTGTTCAAATCCCTGCCGTCCATTCTAGGGTTTACTACTTC CCCCAAGGCCACCTGGAGCGATCCTCTCCCTCCCCTACCGTCCTCTCCTCTCTCAACATC TCCAGTGCCGTCATCCAATGCGTCGTCTCACAACTTCACTTCCTCGCCGACCCCGTCACC GACCAAGTCTTCGCCAAAGTGCTTCTCACGCCTGTCAACACTCTAGAGCATTCCAGAGAG CAGCAGCAACCACGGCACCAAATGGAGGACAGGAATGTCGAGAACTATGTTCACGAGAAT GTCGTGGCTCCGTTTGCTAAGATTTTAACGCCGTCAGATGCTAATAACGGCGGCGGCTTC TCCGTCCCGAGATTCTGCGCCGATTCGATCTTCCCGCCGCTGAACTACCAGGCGGATCCT CCCGTGCAAACCCTATCCATCACCGACATCCACGGCCACGTTTGGGATTTCCGCCACATT TACCGGGGGACGCCTCGGCGCCACCTCTTGACCACCGGCTGGAGCAAGTTCGTCAACCGC AAGAAACTGATCGCTGGTGATTCCGTCGTTTTCATGAGAGATTCGATGGGGATGCTGTTC GTCGGAATCCGGCGGGCAGAGAGGTATGGGAGCAGTGGAGGAGACGGTGCGCGGTGGGGG GAGCATTCGGGAGTCAAGGTGGAGGCGGTGACGGAGGCGCTGGAGAGGGCGTCGCTGGGG CTCCCTTTCGAGGTGGTGTATTATCCTAGGACTGGATGGCCGGATTTTATAGTAAGGGCT GATGTTGTGGAGGCCGCCATGAAGATCTTTTGGACAGCTGGCGTGAGAGTGAAGATGGTG ACAGAGACGGAGGATTCCTCAAGGGTCACGTGGTTTCAGGGGACCGTTAGCGATGCTTCT ATGCCCACTACTGGGCCTTGGTGTGGCTCTCCATGGCGGATGCTTGAGGTATAACATAAA TCATTTACAATAAAATAATCTTATCTATTGTATGGAACCTTGTTTCCTTATTATTAAAGC TGCATTGATATTGAATATGGATGTTATTGCTTCCAGACTAAGAGATTATTTGCACAAATA GGACAGGGGAATTCAGCTTGTTAGATGGCTTGTAATTAAGACTGCATTGTTATTCACTGT GGAATTGTTGTCATTGTTTCCAGAATAAGATTCAGTGCACTAGATGGGTCTTTAATACTG GACTAGGAAGTGTGCACCATGTTTAGTACTATAGGGATGCAGCTTGATAGGTTGGTAATT TCAATTTTGAGTAGAAGGCATATTTATGAATGAATATGGCTTAACAACCCTCGATGTTTC CAAAAAGTTAGTTCAAGGATTGTGTCACAATTGGCTTTTACTCTTTCTGAAATTGGTGAA ATTGATTGAAGTTTAAAATTTGAAGAGTTTAGAGTCTAATTTTTTGTAGGATGATTGTTG TGTAACACATTGTATGCCACTTATCTTTAGATGTCATATGAGGCTTCTTAAGTTTATATA AACTTTTCTTGAGAAAGAAAACCTCACTGTGTATTGATCCCTTTGAGGAAAACTGAATAT TTCCACATTTTTTAATAATTGGTCTGATCTTGTTTTGCAGAAAGGGAAAAGTGGAACAAT TTTTTTGGTTGTAAATTCTAGTGTTTTGGGATGAACCATGATAAATATGGTACTAAAGAA TATTTGTTTGACCATGTAAAATGTTGTAGCCTCTGCTTGGCTTTGAATTGTAGGAGGCAG TTTTCACATCAAATGTGAAGATAAATGCCTGAAGAGCCATTTTTAACTTCAATTTTACAA AGCGCGCCTAGAATTATGTTTATAGATTCATTTGATGCAAAATTGTGAGCAGATAGGTGG TCTTGATATGAATTGGTTAAAAGTATAGAATTCAAAAATAAAGTAATGAACTCGTATGTA TAGTATTCTTTTACTGATTTCTATTTTAAAAGCCTTGTATCGTCACTATTAATTTCTCAA GTCTGTAGCTTTGTGTGTATGGTGTTTGTGCACTGTTAGCAGCTTTGTTACTAATACATT ATCTCAAATATTGAAGTTTAGTAGCTTCTTGTTTTATTAATCTTCTTACCCTTTTAAGAC TGAAAATGCCATTTTATTGTTCAATTGAAGACAGAGATCTTGTGCAACATAGTTTTCTGA AAATGATATTGCCCAACATATATTGTTGATTGCAAGTTATGCTATAATCTTAATATAAGG TTATATAAGCTTGCTTAAATTAGATCCTGCTTAGAACTTGATTTTACTACTTTACATGGC ATGTGATTACTTTATTTGAGTGATGAGGAAACAATAGAACTATTTATCTGTATAGTTTAG GTCTCATAGTTGCAGACCTGCTGTGACGTTTTAGGATATGATTATAAGAAGTCATGAAAA GAGTTAGATTAGTTTTTCTATTTCTGTAACTTAACTAATATTTCTACAGTCTTTTCATTT TAGCCTATTTAAGATTTAAAATTTTTGTCATAGGTTACATGGGATGAACCTGAAATTCTG CTGAACGTGAAGAGAGTAAGCCCTTGGCAACTTGAGTTTGTGTCATCCTCCCTACCACTT CATACCCCTTTCCCCTCAGCAAAGAGATTGAAATTTCCTCAGAATTCTGGGTTGGTGACT GATGGAGAGGAGGACATCTTCTCTCCGCTGAGAGGATTAACTAATTCAACAATGGGGCAG ATGAACCCTTCATCGTTGAATTGTAATACTTTTCCTGTTGGCATGCAGGGAGCCAGGCAA AATACTAATAGCATTTTTAGTTTATCAAATTTCATAAGTGAGAATACTCATCAGACATGC ACTGAGAATACCACTGGCATCAACATTGTGCCAAAGTTGAAAAATGTGTGCACTGAGTTG AACATGGGCAGTTCACAGTCTGAGAACTTGTCACCTGATAGCCATAGTAGTGCATACTCC TTTGGCACTGAACTTGGAAATCAGGGATGCAACTCCTCTAAAATTGGGGCTAGTTCATTT CAATTGTTTGGTAAGATCATACATATGAATCAGCCTGTTGAAAGTGGTTTTGATGATGTT GCTTGTGTAGAAGATGATGGTGGCAAGGAGTTCAATGAAACTGAAGGTGCGAACAAGCCA ACAGATCTTTCCTTGACTTACACGGCACTGCTTAACAGGTTTGGTGTCCAATGCCAAGGC GAATCAGCAGATGAAGAAACTTGCTCTTTATGA