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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI010170Chr827694852773137-Protein BASIC PENTACYSTEINE6

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI010170.m11336PF06217.15GAGA_bindDomain363.51.80E-108
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>LITCHI010170.m1
ATGGATGACGGCGGGCATCGTGAAAATGGCAGACACAAAGCTGATCAGTATAAAGCAGCT
CAGGGACAGTGGTTTGTGCATCATCAACCATCTATGAAACAGATAATGTCTCTTATGGCT
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>LITCHI010170.m1
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NKLLSRLAAEGHDLSNPVDLKDHWAKHGTNRYITIK.
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>LITCHI010170.m1
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CTCAACAACAACAAATAACAAACTACAAGATGGTCTTTTTGTTGGGGTAGCGCGCAGTGA
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GGGGTGTTGAACAGCATCTTGTTACATATCATCACTGATAGGAAGTGTTAATTGGGGACA
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AAGAAAGAAATTTAGCTCTTTCTGAGAAGAAGGCAGCCATTGCTGAGCGAGACATGGCAT
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CTATTGCAAATCTTCAGTATCGAGAAAACTCCTTGAGTACTAGTAACATGCCTTCTTGTC
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TTGCAGCTGAAGGGCATGATTTGTCGAATCCAGTCGACTTAAAGGACCATTGGGCCAAGC
ATGGAACAAACCGTTACATCACAATTAAGTAG
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>LITCHI010170.m1 -  Up_Stream_Len 2000
CTCTCACTGTGTTTACCTCTCTTGTGAGTTTCATTTCTTCTCAAGTTGTATTTTATTTGT
TATGTGTGTTTTTAATTTTCAAGTATCTGATGTTTTTTATTGTTTTGTGACTTGAAATTT
GTGTTTTTGTTTTGTTACTTGAAATGGGTTTTTGGGAAAATGGTTGAAGTTATGTTAGTG
TGTACTTTTGTTGAATTTTGGTTATTGTGTGTGGCAGTGAAGCTTGCTTTTGACTGGCTG
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GTTTTAGGTTGGAGTTGAAGATTAGGGCCAGTTTTAAGTGGTTTGACTTTAAGAAAAATT
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GTTATTGATAGGTTTATAATTTGTAGTACATGCCTGGGAGGGGGTGTTGAACAGCATCTT
GTTACATATCATCACTGATAGGAAGTGTTAATTGGGGTAATTGTGTTTAATTGATTAGGA
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GATCCATTGAAACTGTTGTATGATCAGACACTAAAACCCGGAACCTTGAAATTTCTGGTC
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ATCTGTTTCTCTACATGCATGATCACATTTGTGCAGATTTATACTGACCTTGTTGAAGTA
TCTATGTACTTCTTAATTTGTTTGTCTCAATTTTGCAGATAGTATGCAAGCTTAAGAATA
ATAAACCGACTTGCAATGAATATTTGTAGGATTGGCTATGTATGAAATGGATAAGATTGT
TTGGTTAAAAGTAGAAGTTTCCATGTTTTCTGGTAGAATCTTAAGATTTTAAAAGAGAAA
GTGAAATTAATTAATAATATTTAGATGGTTATTTAAAGCGCAAGAAGTAATGATTGCTTT
GATCAGTTCCGTTACTAGTATGTGACACGTGGGATGCATGTCCTCAAAGCCTTGTTTTGG
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ATCTATTCTTGCTTGCATGTTTCCACATATTTTCTTGTTCTGGCTGTTGAGAAACTGTGT
AGGCCGGTGTTTTAAGTTTAGAATCTCCAGTGTATTTAAAACCTTCTAGACCTCATCTTA
ACTGTTTTGGCATTTAACTTAGTTGAAATTTTACTTATCCTGTTGGTGCATCAGTGCTAC
ACATATGCGAGTGATCTCAATTTTATGGTAAGAAATATAAGCCTCCCTTTCAGCAACATG
AGAAAGAGGTGCCATAATGTTTGGAATGTGAATGCTCTTATTTTGCCCGGTCACTATCAA
AACTTTTCCTATGCAGTTGTGCTTCTTGTGATCATGCATTTTTGGGTTCTTGTTTGTTTA
TGTATTTTTTGGCTTTCATTTAATTTCTTCACTATAGGTTGTATGTGCTTTACTTAAGTG
TTCCTAGCATCTAATTTTTCATCGAGGGTTTGCTTCTGCAGCGTCATGCTCAGCCTTTGT
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ATTTTGCTTCCTCATTTCTTTACTTTGATTTGCAGGACATTCAGCCATGAAAACAATTTG
ATGCTTAATTGATTGAGTATCACACTTAAATTGAAGTAGTCTTTCTGTTGTCTGCTATTA
CAACTTTTTGTTGATCCCAA
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>LITCHI010170.m1 GenomeSequence - 
AAGGAGGAGCCCATGAAAATGAAACGGTCACTATCTTGTCTTTTTCTGCACACTTAACCC
ACCAAAGCGTGAACCCTGGATCGTCCATCTAACAGGAATCTTGAGGCAGAGCCCACATTG
GACGGTCGAAACTGACTCTTGTCTATGGCCCGTTTTCACTTCTCATCAGAAACCAACACC
CTCAACAACAACAAATAACAAACTACAAGATGGTCTTTTTGTTGGGGTAGCGCGCAGTGA
CTCTTCGAAGTTTTTAACTTTTGTTAGAATTTTTTTTTTGATAAAATTGAAACACTAACT
GAAACTATTATATAAAAGGGAAACACAAAGACAATAGTAGATGTGTATTTTAGAAGTGAA
AAAAAAAAATGTAAAATACCCAACAAAGAAGATATAAAGTAGAAAAAATTCTCTCGCCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTATCTGTCTCTTCTCTTCTACTGTTGTCTTCCACGGATTTTTCG
CTTTCCAATTAGGGTTGTTGCTCTCACTGTGTTTACCTCTCTTGTGAGTTTCATTTCTTC
TCAAGTTGTATTTTATTTGTTATGTGTGTTTTTAATTTTCAAGTATCTGATGTTTTTTAT
TGTTTTGTGACTTGAAATTTGTGTTTTTGTTTTGTTACTTGAAATGGGTTTTTGGGAAAA
TGGTTGAAGTTATGTTAGTGTGTACTTTTGTTGAATTTTGGTTATTGTGTGTGGCAGTGA
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AAGGGTTGTTTGAGATTGTTTAGCGGGTGGATTTTGAATGGTCTATTTGAAGTATTGGTA
GCAAATTTGATGTTTTTCAAGTTTTAGGTTGGAGTTGAAGATTAGGGCCAGTTTTAAGTG
GTTTGACTTTAAGAAAAATTGGATCTTTTTTCAGTTTTGGGGATTATTGATACTCCAATG
CTTGATTTGTGCAAAACAAAACTGATCTTTTAGTATTGTTGTTGAAGTTTTGCATAAAAA
TTCAAGCTTTTAATTTTATTGTTATTGATAGGTTTATAATTTGTAGTACATGCCTGGGAG
GGGGTGTTGAACAGCATCTTGTTACATATCATCACTGATAGGAAGTGTTAATTGGGGTAA
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GTATGTGAGTTTAGACTTTTGATCCATTGAAACTGTTGTATGATCAGACACTAAAACCCG
GAACCTTGAAATTTCTGGTCTTTGTGGGTATTGCATGCAACTGATGTTGAAATCTCTGGT
CTTTGTGGGTATTGCATGCAACCGATTGTATGCATGACTTCCTTAGACCATTTTAATTGC
TTGTCTAGATGGTTGCTGATATCTGTTTCTCTACATGCATGATCACATTTGTGCAGATTT
ATACTGACCTTGTTGAAGTATCTATGTACTTCTTAATTTGTTTGTCTCAATTTTGCAGAT
AGTATGCAAGCTTAAGAATAATAAACCGACTTGCAATGAATATTTGTAGGATTGGCTATG
TATGAAATGGATAAGATTGTTTGGTTAAAAGTAGAAGTTTCCATGTTTTCTGGTAGAATC
TTAAGATTTTAAAAGAGAAAGTGAAATTAATTAATAATATTTAGATGGTTATTTAAAGCG
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TCCTCAAAGCCTTGTTTTGGCATTGAAATCAAATTTTCAAGTTGCTATATATATTTAGGT
TCCATTAATCATTGTCTAGTATCTATTCTTGCTTGCATGTTTCCACATATTTTCTTGTTC
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ACCTTCTAGACCTCATCTTAACTGTTTTGGCATTTAACTTAGTTGAAATTTTACTTATCC
TGTTGGTGCATCAGTGCTACACATATGCGAGTGATCTCAATTTTATGGTAAGAAATATAA
GCCTCCCTTTCAGCAACATGAGAAAGAGGTGCCATAATGTTTGGAATGTGAATGCTCTTA
TTTTGCCCGGTCACTATCAAAACTTTTCCTATGCAGTTGTGCTTCTTGTGATCATGCATT
TTTGGGTTCTTGTTTGTTTATGTATTTTTTGGCTTTCATTTAATTTCTTCACTATAGGTT
GTATGTGCTTTACTTAAGTGTTCCTAGCATCTAATTTTTCATCGAGGGTTTGCTTCTGCA
GCGTCATGCTCAGCCTTTGTTTGCTCGTTTGTTTTTCATTTATTGAGGATATGCACTAGA
AACCAGGTCTGAATAGTCTTATTTTGCTTCCTCATTTCTTTACTTTGATTTGCAGGACAT
TCAGCCATGAAAACAATTTGATGCTTAATTGATTGAGTATCACACTTAAATTGAAGTAGT
CTTTCTGTTGTCTGCTATTACAACTTTTTGTTGATCCCAAATGGATGACGGCGGGCATCG
TGAAAATGGCAGACACAAAGCTGATCAGTATAAAGCAGCTCAGGGACAGGTAGATACAAA
CAATTCTTCAGATAATTGAATGTGTTTAAGCAAATATGAATTTCATTCATTTGTCTTGTA
TGCAGAGTTTAGCTTTCCACATTATTCTGTCTGATGATAGGTTTTTTTTTTTTTCACTGG
TGTTATAACAGTGGTTTGTGCATCATCAACCATCTATGAAACAGATAATGTCTCTTATGG
CTGAGAGAGATGCAGCTGTGCAAGAAAGAAATTTAGCTCTTTCTGAGAAGAAGGCAGCCA
TTGCTGAGCGAGACATGGCATTCCTGCAGCGAGATACAGCAATTGCAGAAAGAAATAATG
CTATTATGGAGCGAGACAATGCTATTGCAAATCTTCAGTATCGAGAAAACTCCTTGAGTA
CTAGTAACATGCCTTCTTGTCCACCTGGATGCCAAATCTCACGCGGGGTGAAGCATATGC
ACCATCAACAGCAACATGTACATCATATGCCCCACATGAATGAAGCTGCTTATAGCACAA
GGGAAATGCACCCAAGTGATGCTCTTCCGGTGTCTCCCGGTGCTTCTGAGCCTGCGAAGC
CAAGGCGGGGTAAAAGGGCAAAAGAGGCCAAGGCTGTGTCACCTAACAAGAAGACTTTGA
AATCTCCTAGGAAAATCAAGAGGGAGAACGAGGATCTGAACAAGATTGTGTTTGGGAAGT
CAAATGAGTGGAAGAGTGCACAGGATTTGGAGGGTGACGATGAAGTGAACAAACAGTTGG
TAGCATCAAAATCCGACTGGAAGGGTCAGGTCCTGGGTTTGAACCAGGTCACATTCGATG
AGTCAACCATGCCAGCGCCAGTATGCTCATGTACTGGGGTCCTAAGGCAGTGTTACAAGT
GGGGAAATGGAGGGTGGCAGTCTGCTTGTTGCACAACCACATTGTCAATGTATCCACTGC
CAGCAGTCCCCAATAAGCGACATGCACGTGTAGGTGGCCGGAAAATGAGTGGAAGCGCAT
TCAACAAGCTACTTAGCCGTCTTGCAGCTGAAGGGCATGATTTGTCGAATCCAGTCGACT
TAAAGGACCATTGGGCCAAGCATGGAACAAACCGTTACATCACAATTAAGTAG