Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI010170Chr827694852773137-Protein BASIC PENTACYSTEINE6

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI010170.m11336PF06217.15GAGA_bindDomain363.51.80E-108
Download   Copy
>LITCHI010170.m1
ATGGATGACGGCGGGCATCGTGAAAATGGCAGACACAAAGCTGATCAGTATAAAGCAGCT
CAGGGACAGTGGTTTGTGCATCATCAACCATCTATGAAACAGATAATGTCTCTTATGGCT
GAGAGAGATGCAGCTGTGCAAGAAAGAAATTTAGCTCTTTCTGAGAAGAAGGCAGCCATT
GCTGAGCGAGACATGGCATTCCTGCAGCGAGATACAGCAATTGCAGAAAGAAATAATGCT
ATTATGGAGCGAGACAATGCTATTGCAAATCTTCAGTATCGAGAAAACTCCTTGAGTACT
AGTAACATGCCTTCTTGTCCACCTGGATGCCAAATCTCACGCGGGGTGAAGCATATGCAC
CATCAACAGCAACATGTACATCATATGCCCCACATGAATGAAGCTGCTTATAGCACAAGG
GAAATGCACCCAAGTGATGCTCTTCCGGTGTCTCCCGGTGCTTCTGAGCCTGCGAAGCCA
AGGCGGGGTAAAAGGGCAAAAGAGGCCAAGGCTGTGTCACCTAACAAGAAGACTTTGAAA
TCTCCTAGGAAAATCAAGAGGGAGAACGAGGATCTGAACAAGATTGTGTTTGGGAAGTCA
AATGAGTGGAAGAGTGCACAGGATTTGGAGGGTGACGATGAAGTGAACAAACAGTTGGTA
GCATCAAAATCCGACTGGAAGGGTCAGGTCCTGGGTTTGAACCAGGTCACATTCGATGAG
TCAACCATGCCAGCGCCAGTATGCTCATGTACTGGGGTCCTAAGGCAGTGTTACAAGTGG
GGAAATGGAGGGTGGCAGTCTGCTTGTTGCACAACCACATTGTCAATGTATCCACTGCCA
GCAGTCCCCAATAAGCGACATGCACGTGTAGGTGGCCGGAAAATGAGTGGAAGCGCATTC
AACAAGCTACTTAGCCGTCTTGCAGCTGAAGGGCATGATTTGTCGAATCCAGTCGACTTA
AAGGACCATTGGGCCAAGCATGGAACAAACCGTTACATCACAATTAAGTAG
Download   Copy
>LITCHI010170.m1
MDDGGHRENGRHKADQYKAAQGQWFVHHQPSMKQIMSLMAERDAAVQERNLALSEKKAAI
AERDMAFLQRDTAIAERNNAIMERDNAIANLQYRENSLSTSNMPSCPPGCQISRGVKHMH
HQQQHVHHMPHMNEAAYSTREMHPSDALPVSPGASEPAKPRRGKRAKEAKAVSPNKKTLK
SPRKIKRENEDLNKIVFGKSNEWKSAQDLEGDDEVNKQLVASKSDWKGQVLGLNQVTFDE
STMPAPVCSCTGVLRQCYKWGNGGWQSACCTTTLSMYPLPAVPNKRHARVGGRKMSGSAF
NKLLSRLAAEGHDLSNPVDLKDHWAKHGTNRYITIK.
Download   Copy
>LITCHI010170.m1
AAGGAGGAGCCCATGAAAATGAAACGGTCACTATCTTGTCTTTTTCTGCACACTTAACCC
ACCAAAGCGTGAACCCTGGATCGTCCATCTAACAGGAATCTTGAGGCAGAGCCCACATTG
GACGGTCGAAACTGACTCTTGTCTATGGCCCGTTTTCACTTCTCATCAGAAACCAACACC
CTCAACAACAACAAATAACAAACTACAAGATGGTCTTTTTGTTGGGGTAGCGCGCAGTGA
CTCTTCGAAGTTTTTAACTTTTGTTAGAATTTTTTTTTTGATAAAATTGAAACACTAACT
GAAACTATTATATAAAAGGGAAACACAAAGACAATAGTAGATGTGTATTTTAGAAGTGAA
AAAAAAAAATGTAAAATACCCAACAAAGAAGATATAAAGTAGAAAAAATTCTCTCGCCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTATCTGTCTCTTCTCTTCTACTGTTGTCTTCCACGGATTTTTCG
CTTTCCAATTAGGGTTGTTGCTCTCACTGTGTTTACCTCTCTTGTGAGTTTCATTTCTTC
TCAAGTTGTATTTTATTTGTTATGTGTGTTTTTAATTTTCAAGTATCTGATGTTTTTTAT
TGTTTTGTGACTTGAAATTTGTGTTTTTGTTTTGTTACTTGAAATGGGTTTTTGGGAAAA
TGGTTGAAGTTATGTTAGTGTGTACTTTTGTTGAATTTTGGTTATTGTGTGTGGCAGTGA
AGCTTGCTTTTGACTGGCTGAGAAGGGTTTTGATTTTTGTGGTTGGAGCTTTTGTGGGAG
AAGGGTTGTTTGAGATTGTTTAGCGGGTGGATTTTGAATGGTCTATTTGAAGTATTGGTA
GCAAATTTGATGTTTTTCAAGTTTTAGGTTGGAGTTGAAGATTAGGGCCAGTTTTAAGTG
GTTTGACTTTAAGAAAAATTGGATCTTTTTTCAGTTTTGGGGATTATTGATACTCCAATG
CTTGATTTGTGCAAAACAAAACTGATCTTTTAGTATTGTTGTTGAAGTTTTGCATAAAAA
TTCAAGCTTTTAATTTTATTGTTATTGATAGGTTTATAATTTGTAGTACATGCCTGGGAG
GGGGTGTTGAACAGCATCTTGTTACATATCATCACTGATAGGAAGTGTTAATTGGGGACA
TTCAGCCATGAAAACAATTTGATGCTTAATTGATTGAGTATCACACTTAAATTGAAGTAG
TCTTTCTGTTGTCTGCTATTACAACTTTTTGTTGATCCCAAATGGATGACGGCGGGCATC
GTGAAAATGGCAGACACAAAGCTGATCAGTATAAAGCAGCTCAGGGACAGTGGTTTGTGC
ATCATCAACCATCTATGAAACAGATAATGTCTCTTATGGCTGAGAGAGATGCAGCTGTGC
AAGAAAGAAATTTAGCTCTTTCTGAGAAGAAGGCAGCCATTGCTGAGCGAGACATGGCAT
TCCTGCAGCGAGATACAGCAATTGCAGAAAGAAATAATGCTATTATGGAGCGAGACAATG
CTATTGCAAATCTTCAGTATCGAGAAAACTCCTTGAGTACTAGTAACATGCCTTCTTGTC
CACCTGGATGCCAAATCTCACGCGGGGTGAAGCATATGCACCATCAACAGCAACATGTAC
ATCATATGCCCCACATGAATGAAGCTGCTTATAGCACAAGGGAAATGCACCCAAGTGATG
CTCTTCCGGTGTCTCCCGGTGCTTCTGAGCCTGCGAAGCCAAGGCGGGGTAAAAGGGCAA
AAGAGGCCAAGGCTGTGTCACCTAACAAGAAGACTTTGAAATCTCCTAGGAAAATCAAGA
GGGAGAACGAGGATCTGAACAAGATTGTGTTTGGGAAGTCAAATGAGTGGAAGAGTGCAC
AGGATTTGGAGGGTGACGATGAAGTGAACAAACAGTTGGTAGCATCAAAATCCGACTGGA
AGGGTCAGGTCCTGGGTTTGAACCAGGTCACATTCGATGAGTCAACCATGCCAGCGCCAG
TATGCTCATGTACTGGGGTCCTAAGGCAGTGTTACAAGTGGGGAAATGGAGGGTGGCAGT
CTGCTTGTTGCACAACCACATTGTCAATGTATCCACTGCCAGCAGTCCCCAATAAGCGAC
ATGCACGTGTAGGTGGCCGGAAAATGAGTGGAAGCGCATTCAACAAGCTACTTAGCCGTC
TTGCAGCTGAAGGGCATGATTTGTCGAATCCAGTCGACTTAAAGGACCATTGGGCCAAGC
ATGGAACAAACCGTTACATCACAATTAAGTAG
Download   Copy
>LITCHI029655.m1 +  Up_Stream_Len 2000
ATTGGGTTGGTACTTGAGTCTATCCATAACCCAATACACTCAAATGGCTGAAGAAGTAGG
TAGCAGGCATATTAGTTTTTCCATCAAATGGATTAGTCTTTTTAGGCCAGGAAACAGACA
TTTATATATTCTTGGAAAAAGCGAGCACTCAAATTCATTCTTCCCTTTACTAATGTTTTT
ATATATTCTAAAGAGAATATGATAATAGGTGAGGATATCACTATGTCGTTTTGATTAGCT
AGCCTATATAGAACTTGTTACAAAGGAGAGATTGGCTTTAATTGCTTTTCACCAAATAAT
CATCATAACAGCATGTGCCATCGTGTTCGGTACTTGTTAGTAGTGCATTGTACTGATCAT
TATAATTAATTAATCAAAAGAAGGAAACTCATGTTTACAAGATTAGTACTAGTAATTGAT
GACACACACAAATGAAAATCACATGCCTACTAACAAGTAACACTATATTGTTTCTCTACA
ATGCATGTTTAATTTCTTTAATTATCTTCTTAATTGCTTTTGTGTCCCCAAAAAACAAGG
AGTGATACTTCAAAAGAGATTCTTTCCAGCTATGTAGATCTTCAAATGGATTCTCTCCAT
AATTGGATTAGGCAACCAAAATTCCAGAAGCATCATACAAGAGCTTGAAGTTGGCTATAA
AATCCTAAATCAAGGGAAAATTAATTGAATTCTCTCCATTCAATGCTTCTAATCATCTAT
AAAACAAAGAAACAAAGCACAAATGGCAAACACATTTAACATATGTATAATGTATAGTAG
TTATTATTGTATTATCATGCATATTTGGATCCTCTATCTGTGGATCGCAGTCACAACAGC
CCCTTTTTGAAAGCATTTTTGACAACAGATAAATTTTAATTAGTTGTACCATTATAATTT
CATCTATTGCATTTGCTGTAATACATGTGTCATGTGTGTGCTGTGTATAGTGATCAATTC
ATTTATATCCTGTACTAATTAATCAGATCCAATTATGCAACTCATATTACGTGTTTCCTC
TTTATGATGACTAGATGATGTTCTATAAGATTGAAAATTATGCCTAGTATTAATGATTAG
TATATATGAGTCAGACACAAGATCCAAGACTTTTGAGAGATCAGTATTTATAGAGGTGAG
GATGTGAGATTATCGACTTACATAGGTCAAGATGGATGTAGTGAGGATAACATTTAAGAT
ATGATCAAAATCCCGCTTGCTTTATTAGATAAGATCTTTAGGTTATATATGTAGAAACTT
ATAAAAAAATTAGTATGAGATCTTTCAGTTAAAAACCTAAGCACAAAAATGAGCGAACAA
GTTTGATGACAAACTAAAATAACAATATAATATGAATGGTTACAGGTGAGAGCAACGTGC
TGAAATATGCCACTTTTGATAAATTTGTAGGATGCATTCACACAATACCCACTACTTGTC
AGTTAGGGTCTTACATATAATTTAATTCAAAAGATAAGGCCATGAGGATCAAAAACAGTA
TCAGCAATTCTTAATTAGTTAATTAATCAACCAAGTTTTATTATACTTTAACATAAACTT
CAAGTACGTTTCATGATTAAACATCTCCCACGCCAGCAGCAGTCCTCTGGTGAGTCCTTT
TTAAGTTCTTCAACTACACCAAATTTGATTCCTACAAGAGCATGTGAGGCCAACGAAAGT
TTTATTTTATCCTCTCTCTTTGTACTAGATTTTTTTAATTTTTCCAAGGCCACCTAACAC
TACCCTATAAGGGAAATTATTAAAGGTCTCTTCTTCACAATTATAATCACCTCTAGCTCA
ATTAACAATACAAATGTTCCCCATTTGGTTTCCAATCTTCCTCCTCCAACCTCACATAAT
CTCTCAAAGTTATGTCCTTGTTGTTTTAAACTCAAACATAATCATGTTTAATGTGACCCA
CTTGACAATATTTGTGCATAAATCATCATTTTGTTACACATTTTCCTTCAAAGCCACCGG
GGATTTCTCTTGCATGAAGC
Download   Copy
>LITCHI023699.m1 GenomeSequence + 
GACAGGGTCTGCAGACCCTGTCCATTTTGCCATCCTTAGTTTCAAAAAACGAATTCTGGT
CCTGCTCTGTAGACCAATGGAGACAGGAAGATAAGCTTCAATGCAATAGGTTTAAATGGT
TATACATACATTGTACCATTCATTTGGAACCAGAAAATCAGAAACTGTGCTTGAAACCCT
CAGGTATTGCAGACAAAATTCTAGCAACAGGTTGAAAAGTATCAAAAAGCAATAAACTGA
CTACATCAATCAAGCTGCGGTTCTGCTTGTATTTGTTTTAACTAATAAATTATATTCAAT
TCAAGCTTTCTACGTGCAGAAATCTGCCACAGCAAAGCAGTTCTCCTGGAGCAGCCCAGA
GTACACTTGAAAGGAGGAATTGTAGTTAATGACACTGATGGACTGCTACCCTACGGCCCA
AACCAGAAATGTCAGTGGAACATCCAACATCTAAATGCAAAGTTCATAAGTTTTACCATC
AACTACCCTGCAATTGCAGCAGGCAGTGATGATCACCTCTTAGTTTGTCAGTCATATTCA
AGTCTTGTCAATTGCTCTGTTACTCAGGCAAGTACTGGTGAGTTCGACAAGAAATTCAAG
GTAATTGTCTCAAATGCTTATATTGAGTTCACAAGTGGTGATCATGTTCCCTTTGAATTG
AGAGGATGTGGGAGCTTAGCTTTTCTGCAGCTATCAAAATCTAAGCTAGTTTTTTCAAAT
CAACTTCATTAATTAAAAATAAAACAATTAAAATGGTATGGCTATTGTAGGGCTTTGCGA
TGGAAGGGAAGATGTTTATAGCCATCATGGTGACTATTGGCTACACTTCATCTACCAGCT
TTTCATACGTAGGTCTTAGTTGCCAATGGATTCTCCATGGGAAACCAGGAACTCTTGTAT
CCTTGAGTTTCACTCACATTAACATCTCTAAAGATTTGGATTTTATTGCAACATATAATG
GCACAAAGCAGCAGATTGCTAACTTCTCTGGACTTTATTCTGGGTCTGGTCATCCACAAA
TGAACTTGACTGGTGAGGTCAGGATTTCATTCGCTACTCAGACAGATAAAGAGGAAGGTT
AGTCAGCTAAATTTTACACTGCTTCTCCTGTTAATCGAGACAAAAAGGTTTTGATTGTCA
CTGTTGTTGTTTTAGCAATTGTTGCAGTGAGTATTTCTCTCACTTCCATCATATTAGCTA
TGCTTAAAAGAAAAGAAGGCATATAAGCTCTATGAACACAGACGAGGGCAGCCTAATGCT
AATTAGAGTAAATGCTGAAAGAGAAGAGAACTGAATCAGTGAAGGTCCTTCTGCAGTCAT
AAATAGAGCAGTTTCAATGAACAGGAATGTAGTAGCAGTTAAAGCTAGAAGGGATATGGC
CTCACAGACAGAATTAGAAGAAGAAATCTTGCTCAAATCCCCGTCTCACCTAAACATTGT
TTTCTTACTGGGGTATTCTCAAGATGGACTTCGCAGAAGATATTTGGTTTTCGAGTTTAT
GCAAAGGGGAAGTTTGAGCTGGAACCTGAGAGAAAGAGGAGGGACACTGAATTGGGAAAA
GAGATTAGCAATAGCATTACAAATCTGCTCTGCAATTCAAAAGCTGCACATGTACCCAAA
ACCACCGATATATCATGGAAATATAACATCAGAGAACATTCTTCTGGATGAATTCTGCAA
TGCCAAGTTAGGAGGTTTTGGTACTGCAAACTACTGCAGCAGCAACAGGACATATCCTGA
GCCAACATCAGAAATGGCAGAGGATATATGGAGTTTCGGACTGTCGTTAGTTGAGCTTTT
ACGAGGAGACCCTATTGTGAACAGGGATGGTTATAAGAATATTGCAAGCCCTGACCAGAT
AAATGATCTTGTTGGTGGCCAGGAGTGCCTTGATAGAAGCTTGGATACTCCTACGAAAAA
TGCAAGATCATAG