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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI010169Chr827630172766551-Transcription factor RF2a

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI010169.m1381432PF07716.18bZIP_2Coiled-coil32.57.40E-08
LITCHI010169.m1383437PF00170.24bZIP_1Coiled-coil35.96.70E-09
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>LITCHI010169.m1
ATGCAGGGAACGAGTCGAATGGAAGCTCCAGTCTACAACAACTATTCAACAGGTGGTGAG
AGTAGCAGGATAACAACAGGTATTCCTCTATCGCACCCGAACAATCCTCAGGTGATGTTC
GCTTCACGTCCGCATTTGAATCCAAATGCGAACATGAGGCCGACATCGTCATCGCATTAT
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TTGACTATTAATGATAATACTAATAATTACCATTATTATCATCATGAGACACCGTCACCT
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GGAACAGCTGGTAATTATTCACATGGATTATTATCGGCTACTCCTCCTCCTCCTCCTCCT
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TTGTTTATGGGAGAGGGGATGTCGGAAGATGAGATAGTGGAGGATTTGATGAGTGAATAC
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GGGGAGAGCAGTGATAATGAGGTGGAGAGTGGTGGGATTTTGAATGGGGGTGGTTCGAGT
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GATCCCAGGCGTGCCAAAAGGATTCTGGCTAATCGTCAATCAGCTGCACGTTCCAAGGAG
CGGAAGGTACGATACATTGCAGAGTTGGAGCAAAAGGTGAAGACTTTAATGGCAGAGACG
AACACATTAAATACTAAGTATGCAACGTTACAGAAAGATTCAGAGGAAGTTATAAAAATA
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TTAAACGAATCATTAAATGCGGAACTCGAAAGAATGAAGCTCGAGATGAACGGAATGGCC
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CATCTGCATTTGGTCTTACCCAACATCTACCAGTTGCAACAGCAGCAACAGGACCTTCTG
CCTAACCAGTTTCAACAGCTGCCTCAACCTAACCTGTTCCAACTGCAGCAACAGAATCCT
GAGTCTTACCAGTTGCAACTTCAGCAGCAGACTCAGCCTAACCAGTTGCAACCTGAGCTG
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>LITCHI010169.m1
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GHYRSVSVDSYLEFLDFDFDDDGVAKVPVQAGGQVVEQVSPGGVVGERLAMLRMKLNREL
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>LITCHI010169.m1
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GCTTCACGTCCGCATTTGAATCCAAATGCGAACATGAGGCCGACATCGTCATCGCATTAT
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TTTGTCGTTGTCAACCAGAGCTTGACAAACAATGTTGTGTCGTCTAGTGTCGAAGGAGGA
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GGAACAGCTGGTAATTATTCACATGGATTATTATCGGCTACTCCTCCTCCTCCTCCTCCT
CCAGTTGTTGTTGGTGGTGGTGGTTGTGAGAATTTGCCGCCAAGAAAAGGACATAGACGG
TGTTTTAGTGACAGTCCGTTGGGATATTCGATGCTTGCGTCATCGCCTCAGCTGGTGCCT
ATAGGGATGAGTAGTAGAGGGGAGAGTAGTTCGGTGAGTCAGAGCGTGAACGTGGAAGGC
TTGTTTATGGGAGAGGGGATGTCGGAAGATGAGATAGTGGAGGATTTGATGAGTGAATAC
ATGAATATGGAGTATGTTGACGTGTTTGATTGTGGTAGTGTTTCGAAGGTGAATGGAGGA
GGGGAGAGCAGTGATAATGAGGTGGAGAGTGGTGGGATTTTGAATGGGGGTGGTTCGAGT
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GGCCATTACAGGAGCGTGTCCGTCGATAGTTATTTGGAGTTTTTGGATTTTGATTTTGAC
GATGATGGTGTAGCAAAGGTTCCTGTGCAAGCAGGAGGTCAGGTCGTTGAGCAAGTTTCG
CCTGGCGGTGTGGTTGGTGAGAGATTAGCTATGTTGAGAATGAAGTTGAATAGGGAACTA
TCTGAAGATGAACTGAGAAAGATTGCGGCAAATGATAAGCTCACTCAGATTGCGTTTGTG
GATCCCAGGCGTGCCAAAAGGATTCTGGCTAATCGTCAATCAGCTGCACGTTCCAAGGAG
CGGAAGGTACGATACATTGCAGAGTTGGAGCAAAAGGTGAAGACTTTAATGGCAGAGACG
AACACATTAAATACTAAGTATGCAACGTTACAGAAAGATTCAGAGGAAGTTATAAAAATA
AACAAGGAAATGAAATTCCGTCTTGAGGCCATGGACCAAGAGGTTAAACTCAAAGATGCT
TTAAACGAATCATTAAATGCGGAACTCGAAAGAATGAAGCTCGAGATGAACGGAATGGCC
CAGTTCTCAAGGTTGCTGGCTCAGCAACTTTCCCTCAATAATCAGATTCTCCAAAATCAG
CATCTGCATTTGGTCTTACCCAACATCTACCAGTTGCAACAGCAGCAACAGGACCTTCTG
CCTAACCAGTTTCAACAGCTGCCTCAACCTAACCTGTTCCAACTGCAGCAACAGAATCCT
GAGTCTTACCAGTTGCAACTTCAGCAGCAGACTCAGCCTAACCAGTTGCAACCTGAGCTG
CAGAATGGTGAGGCTGCTATAGCTGAGTGAAGTAGTAGACTTCCAAATTGGCTGTGAAAT
TCTGTTTGATTCATTGCCTGCAACAATCTAATCATAAGTATCATTTATATCTTATTGAAC
ATCAGTTGACCATTGTTATGTTCGTGGGTTGGTTTTTCTTGTCCAGACTACAGACTTGAA
GCTAGACTCTACCCTGTTCATTCATTTGTCAGCAACAATGTTCTAGTTTTACATTTTTTT
GGACAAGATTGATCTTTCAGTTTCGATAAATAAATATTAAAAATGTTGGTA
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>LITCHI010169.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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TCAGACCACGAATATTATCAGCACAAGTCATCAGCCAGGGATAACTGTAATATATATGTT
CTCATCATACACAAACACTGCTGAGATATATAAAATATATATACATAAAGAAAAAACAGA
CATTTTGATAAAAACCAAATTGTTAAAGTGAAAATATTAATTTTTTTAAAAAAAAAGTGA
CAAAACAAAACTATAGAGAAGCCTCAGACCGTCCTAGTTCATGAGTTTCTAACATTGATG
CAAGTCTAAACTACTTGCACTTCTGTCAACCTTAAAAAACAGTCATCACTGGCTCTATCA
AAACACAATTAAAATAATTTTAAACCTAAAGAGAAAGTGTGTTGATCTGGAAAGTGTCAG
ACTTGATGAAATATCAGCACATTATATAAATCAGACAGGGATAACTGTATATTTCATGTT
TTCTCTTCATCCACAAAACCAGATTTTGAAAATTAAAAAAAAAAAAATGAAGAAAATGAG
AACAAAAGAGAAGCATCAGATCTTCCTATTCAATGAAATAGAATCATCACACCCAAAACA
AAAGAATGAGTATTCAGCCATTTCGAATGTTCATCATTTGAACCTCTCTCTCCAAATCTC
TACACAAAACACAATCACACAGAAAGCAACAAAGATCAAAAAATAATAATAATAGTACAA
AAAAGGAACCTTTTCAAACCCAGAAACTGAAAACGAAGAAGAAGAAGAGAGCTACGGCCA
CTATAAACTAGGGTTTTAAATTTGTGCGAAACCGACCCCAATATCCCCTTTTATAACAAA
AATTTCCTGACTGGTTTTGATTGTAATCCGACGGCTGAGATTTAATACCGCCCTGGTCAT
AAACTCGCTCTCACAGACAAGTTTCATAATGCCACGTCGCCCACAGAATAGACTCGCAAG
ATATAGAAAAAACGCGTGTACGCGTCTACGCGGCATACATAGGGTGGGCATCTCGGCCCA
ATCCAGTCCGATTGTTTTTAATAGATTGAATTAAATTAGATCTTAAAAAATTGGGTTGGA
TTGGGTTATACTTGAAAATTAAATTAGGTCTGATTGAGTTGAAAAATTTTCGGCTCCACC
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GTTAGGGATGAAGATTAATGACAGTTTCTATGATAGATTGAATCTTTTATTCATAATCAT
TGAATTTTAGTTTGTACTCGTTATATTTGTAATCAAATAGTCAAGACTATAAAAATTAGA
CTTTTGTGTCTTTACCATGGATTAAATCTAATTCAATCAATTCAATTTAATCCAAATCGA
CTATTAGTAGGTTTGATTGGGTTGGGTTAAAGAATTTTCAATCCAACCCACCTTGAGTTG
AGAGATTTCAAACCAAATCCAACCCGAACTTGAAAACGTCCATCCCTAGGCACCCTAGCA
CTTTTTTTTTTTTTTTGACATTCTCTAAATTGTTATTTGTTCTTTTAATTTTTTAAATTT
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TGCCGGTCTCGGCAATTTTAAGGTAGCACACAGATTTTAATTAATTAATCTAATTTTTAA
CTTTATCCAAAACTTGGCAAGCTTGTAAAACATTCGTGTCATGACTACTCATCCCTCCAT
GTCTGTGCCAGACTCACTTGATATACTTGTCACTCAGTTGCCTTGTACAGCCGTCACTTT
CCATGTTTATGGATTCATTGTATGCACTCAAACCTGTAACCGCCAAACACAAACACTCTG
GCAATACAATCCATCATAGATGCATTTCTCAACGTTCCTGTTTTATATATACATGCTACA
GTCTCAGAATTTTTAGGATTCTAATCAGACTCAGAGCAATATAGAGTGAGTAGTGAGTGA
GTGATCAAGCAGTTGCCAAC
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>LITCHI026320.m1 GenomeSequence - 
ATGTCTATCGCCCACTACACCCTCCTTTGCCTCCTCTTCACAGCCTTCACCAACTCTTCA
TACTCCGTGACTGCGCAACAGAACAGTTCCTGCCCGCTGGACTTCGCTGTCTTACGCCGT
ATAGTCTGGTCGAGCGAGCCGACGAGGAGGTGTCAGCTCATTCAACAAGGGCTTCGACTC
GTGCTTTCCGACTACCTCCAGAAAACGGGGCTTTTCTTGCCGCCACTTGACTCGTCAGAC
TCTTGCTGGGTCGCTTATCAAACCCTCATCGACCAGTTCGTTCCGGGTTTCGATATCCGG
TCGGGTTGCGGGTTCGAGACCAGATGGATCTCTCAAGGTTGCGTGAACATCACCACACGA
TCGGAGTTCGAGGCGCGGGTACCCAATACGACGTTGAACGACGTCGTTTCGAACTGCAAC
CAGTCGCTGGAAAACGCCTCTCCTTGCGCGGCTTGCATGACCAGCTTGTCCTCCTTGCAG
GCCTCGTATCTTTCCGGCCGGTCCGTCGGTAATGTGTCGAATGTCAGGATTATGCGACTA
TTTACGCGGCGGGCGTCGTCAACTATCTTGGACCGAGCGATATAGGTACTACAAAGTGTT
TGTTCTCGCTTAATTTTATTGGGTCTAAAAAGGTTGCTACTAAGAGAAAAGTTGTGATTG
TGGTGGTTTTCATAGTTTGCAGTGTTGTGTTGTTGGTTGTTTTAGCTGGGGTTTGGTTTT
TTTGGCGTAGATACGTGAATTTGAAGAGAAAAAAGCACAACAGAAATGCAGTTGATAGAA
GTGATTTGGAGTTGGAGTCTATAAGTGAGAGTACTACTTTGGTGAGGTTCACATTTGATG
AGATTAAAAAAGCTACTAGGAATTTCTCTAGCCGCAACATGGTTGGTAGAGGAGGTTATG
GTAATGTTTATAAAGGGCTTTTGCGTGATGGGTCTGAGGTTGCTTTCAAGAGGTTCAAGA
ATTGTTCTGCTGCTGGTGACGCGGATTTTGCGCATGAAGTAGAGGTCATTGCCAGTGTCA
GGCATGTCAATCTTGTTGCTTTGAGAGGGTATTGTACTGCTACAACTCCTATGGAGGGTC
ACCAGAGGATTATTGTGTGTGATTATATGCGGAACGGCAGTGTTTATGATCATTTGTTTG
CTTCTGTGGAGGGGAAGCTTAGTTGGCCTATTAGACAGAAGATTGCGCTTGGGACTGCCA
GGGGATTGGCTTATTTGCATTATGGTGCACAACCAACAATCTTTCATAGAGATATTAAAG
CTAGTAATATACTTTTGGACGAGAAGTTTGAGCCCAAGGTGGCTGATTTTGGGCTTGCGA
AGTTCAATCCGGAGGGTATGTCTCATTTGAGTACTAGGGTGGCTGGGACAATGGGATATG
TTGCTCCTGAGTATGCTTTGTATGGGCAATTGACAGATAGGAGTGATGTGTATAGTTTTG
GCGTTGTCCTTCTTGAGCTTTTGAGTGGCAGGAAGGTTCTCGTTACGAGTGATGATGGTC
AACCTTCTCTTGTGACGGATTGGGCATGGTCATTGGTGAGGGAAGGGAGAGCTCTGGATG
TTATTGAAGACGGCATGCCTGAGATTGGTTCTGCAGAGGTTTTGGAGAAGTATGTATTGG
TTGCTGTACTTTGTTCTCATCCACAGTTATATGCTAGACCAACAATGGATCAGGTTGTGA
AGATGTTGGAAACAGAGTTGTCTGTTCACTCAATCCCAGAACGACCAATTCCTCTTGTAG
CTGAGATGGACGAGATTGAGAGATCGGTGAGCAGTAATGGTTCAGGTCAGCTCTCTAGTC
CTGCTGGCTTCCAGTGCTTTACCGATAAGGATAGCCATTCA