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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI010169Chr827630172766551-Transcription factor RF2a

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI010169.m1381432PF07716.18bZIP_2Coiled-coil32.57.40E-08
LITCHI010169.m1383437PF00170.24bZIP_1Coiled-coil35.96.70E-09
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>LITCHI010169.m1
ATGCAGGGAACGAGTCGAATGGAAGCTCCAGTCTACAACAACTATTCAACAGGTGGTGAG
AGTAGCAGGATAACAACAGGTATTCCTCTATCGCACCCGAACAATCCTCAGGTGATGTTC
GCTTCACGTCCGCATTTGAATCCAAATGCGAACATGAGGCCGACATCGTCATCGCATTAT
TGGTCTCTGCCTCCGTCTTCTGTTTTCGATGCGTTGCCACCCTGGACACCAATGAGTATG
TTGACTATTAATGATAATACTAATAATTACCATTATTATCATCATGAGACACCGTCACCT
TTTGTCGTTGTCAACCAGAGCTTGACAAACAATGTTGTGTCGTCTAGTGTCGAAGGAGGA
GCTGGTAGTTATGTCGCTAACCAGAGCTTGACTAACAATGTCGTGTCGAGTACCGTGGAA
GGAACAGCTGGTAATTATTCACATGGATTATTATCGGCTACTCCTCCTCCTCCTCCTCCT
CCAGTTGTTGTTGGTGGTGGTGGTTGTGAGAATTTGCCGCCAAGAAAAGGACATAGACGG
TGTTTTAGTGACAGTCCGTTGGGATATTCGATGCTTGCGTCATCGCCTCAGCTGGTGCCT
ATAGGGATGAGTAGTAGAGGGGAGAGTAGTTCGGTGAGTCAGAGCGTGAACGTGGAAGGC
TTGTTTATGGGAGAGGGGATGTCGGAAGATGAGATAGTGGAGGATTTGATGAGTGAATAC
ATGAATATGGAGTATGTTGACGTGTTTGATTGTGGTAGTGTTTCGAAGGTGAATGGAGGA
GGGGAGAGCAGTGATAATGAGGTGGAGAGTGGTGGGATTTTGAATGGGGGTGGTTCGAGT
GAGAGGAGGGAGGGAGTTAATAAGAGGAGTGCCGATGGGGATATCGGTCTGACTGCTGGT
GGCCATTACAGGAGCGTGTCCGTCGATAGTTATTTGGAGTTTTTGGATTTTGATTTTGAC
GATGATGGTGTAGCAAAGGTTCCTGTGCAAGCAGGAGGTCAGGTCGTTGAGCAAGTTTCG
CCTGGCGGTGTGGTTGGTGAGAGATTAGCTATGTTGAGAATGAAGTTGAATAGGGAACTA
TCTGAAGATGAACTGAGAAAGATTGCGGCAAATGATAAGCTCACTCAGATTGCGTTTGTG
GATCCCAGGCGTGCCAAAAGGATTCTGGCTAATCGTCAATCAGCTGCACGTTCCAAGGAG
CGGAAGGTACGATACATTGCAGAGTTGGAGCAAAAGGTGAAGACTTTAATGGCAGAGACG
AACACATTAAATACTAAGTATGCAACGTTACAGAAAGATTCAGAGGAAGTTATAAAAATA
AACAAGGAAATGAAATTCCGTCTTGAGGCCATGGACCAAGAGGTTAAACTCAAAGATGCT
TTAAACGAATCATTAAATGCGGAACTCGAAAGAATGAAGCTCGAGATGAACGGAATGGCC
CAGTTCTCAAGGTTGCTGGCTCAGCAACTTTCCCTCAATAATCAGATTCTCCAAAATCAG
CATCTGCATTTGGTCTTACCCAACATCTACCAGTTGCAACAGCAGCAACAGGACCTTCTG
CCTAACCAGTTTCAACAGCTGCCTCAACCTAACCTGTTCCAACTGCAGCAACAGAATCCT
GAGTCTTACCAGTTGCAACTTCAGCAGCAGACTCAGCCTAACCAGTTGCAACCTGAGCTG
CAGAATGGTGAGGCTGCTATAGCTGAGTGA
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>LITCHI010169.m1
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WSLPPSSVFDALPPWTPMSMLTINDNTNNYHYYHHETPSPFVVVNQSLTNNVVSSSVEGG
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CFSDSPLGYSMLASSPQLVPIGMSSRGESSSVSQSVNVEGLFMGEGMSEDEIVEDLMSEY
MNMEYVDVFDCGSVSKVNGGGESSDNEVESGGILNGGGSSERREGVNKRSADGDIGLTAG
GHYRSVSVDSYLEFLDFDFDDDGVAKVPVQAGGQVVEQVSPGGVVGERLAMLRMKLNREL
SEDELRKIAANDKLTQIAFVDPRRAKRILANRQSAARSKERKVRYIAELEQKVKTLMAET
NTLNTKYATLQKDSEEVIKINKEMKFRLEAMDQEVKLKDALNESLNAELERMKLEMNGMA
QFSRLLAQQLSLNNQILQNQHLHLVLPNIYQLQQQQQDLLPNQFQQLPQPNLFQLQQQNP
ESYQLQLQQQTQPNQLQPELQNGEAAIAE.
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>LITCHI010169.m1
ATGCAGGGAACGAGTCGAATGGAAGCTCCAGTCTACAACAACTATTCAACAGGTGGTGAG
AGTAGCAGGATAACAACAGGTATTCCTCTATCGCACCCGAACAATCCTCAGGTGATGTTC
GCTTCACGTCCGCATTTGAATCCAAATGCGAACATGAGGCCGACATCGTCATCGCATTAT
TGGTCTCTGCCTCCGTCTTCTGTTTTCGATGCGTTGCCACCCTGGACACCAATGAGTATG
TTGACTATTAATGATAATACTAATAATTACCATTATTATCATCATGAGACACCGTCACCT
TTTGTCGTTGTCAACCAGAGCTTGACAAACAATGTTGTGTCGTCTAGTGTCGAAGGAGGA
GCTGGTAGTTATGTCGCTAACCAGAGCTTGACTAACAATGTCGTGTCGAGTACCGTGGAA
GGAACAGCTGGTAATTATTCACATGGATTATTATCGGCTACTCCTCCTCCTCCTCCTCCT
CCAGTTGTTGTTGGTGGTGGTGGTTGTGAGAATTTGCCGCCAAGAAAAGGACATAGACGG
TGTTTTAGTGACAGTCCGTTGGGATATTCGATGCTTGCGTCATCGCCTCAGCTGGTGCCT
ATAGGGATGAGTAGTAGAGGGGAGAGTAGTTCGGTGAGTCAGAGCGTGAACGTGGAAGGC
TTGTTTATGGGAGAGGGGATGTCGGAAGATGAGATAGTGGAGGATTTGATGAGTGAATAC
ATGAATATGGAGTATGTTGACGTGTTTGATTGTGGTAGTGTTTCGAAGGTGAATGGAGGA
GGGGAGAGCAGTGATAATGAGGTGGAGAGTGGTGGGATTTTGAATGGGGGTGGTTCGAGT
GAGAGGAGGGAGGGAGTTAATAAGAGGAGTGCCGATGGGGATATCGGTCTGACTGCTGGT
GGCCATTACAGGAGCGTGTCCGTCGATAGTTATTTGGAGTTTTTGGATTTTGATTTTGAC
GATGATGGTGTAGCAAAGGTTCCTGTGCAAGCAGGAGGTCAGGTCGTTGAGCAAGTTTCG
CCTGGCGGTGTGGTTGGTGAGAGATTAGCTATGTTGAGAATGAAGTTGAATAGGGAACTA
TCTGAAGATGAACTGAGAAAGATTGCGGCAAATGATAAGCTCACTCAGATTGCGTTTGTG
GATCCCAGGCGTGCCAAAAGGATTCTGGCTAATCGTCAATCAGCTGCACGTTCCAAGGAG
CGGAAGGTACGATACATTGCAGAGTTGGAGCAAAAGGTGAAGACTTTAATGGCAGAGACG
AACACATTAAATACTAAGTATGCAACGTTACAGAAAGATTCAGAGGAAGTTATAAAAATA
AACAAGGAAATGAAATTCCGTCTTGAGGCCATGGACCAAGAGGTTAAACTCAAAGATGCT
TTAAACGAATCATTAAATGCGGAACTCGAAAGAATGAAGCTCGAGATGAACGGAATGGCC
CAGTTCTCAAGGTTGCTGGCTCAGCAACTTTCCCTCAATAATCAGATTCTCCAAAATCAG
CATCTGCATTTGGTCTTACCCAACATCTACCAGTTGCAACAGCAGCAACAGGACCTTCTG
CCTAACCAGTTTCAACAGCTGCCTCAACCTAACCTGTTCCAACTGCAGCAACAGAATCCT
GAGTCTTACCAGTTGCAACTTCAGCAGCAGACTCAGCCTAACCAGTTGCAACCTGAGCTG
CAGAATGGTGAGGCTGCTATAGCTGAGTGAAGTAGTAGACTTCCAAATTGGCTGTGAAAT
TCTGTTTGATTCATTGCCTGCAACAATCTAATCATAAGTATCATTTATATCTTATTGAAC
ATCAGTTGACCATTGTTATGTTCGTGGGTTGGTTTTTCTTGTCCAGACTACAGACTTGAA
GCTAGACTCTACCCTGTTCATTCATTTGTCAGCAACAATGTTCTAGTTTTACATTTTTTT
GGACAAGATTGATCTTTCAGTTTCGATAAATAAATATTAAAAATGTTGGTA
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>LITCHI010169.m1 -  Up_Stream_Len 2000
AAAAACTTGAATAAAATTACATTGATGTAGATTTGAGAAAATGTGGCAATCGTGTTTGTG
TCAGACCACGAATATTATCAGCACAAGTCATCAGCCAGGGATAACTGTAATATATATGTT
CTCATCATACACAAACACTGCTGAGATATATAAAATATATATACATAAAGAAAAAACAGA
CATTTTGATAAAAACCAAATTGTTAAAGTGAAAATATTAATTTTTTTAAAAAAAAAGTGA
CAAAACAAAACTATAGAGAAGCCTCAGACCGTCCTAGTTCATGAGTTTCTAACATTGATG
CAAGTCTAAACTACTTGCACTTCTGTCAACCTTAAAAAACAGTCATCACTGGCTCTATCA
AAACACAATTAAAATAATTTTAAACCTAAAGAGAAAGTGTGTTGATCTGGAAAGTGTCAG
ACTTGATGAAATATCAGCACATTATATAAATCAGACAGGGATAACTGTATATTTCATGTT
TTCTCTTCATCCACAAAACCAGATTTTGAAAATTAAAAAAAAAAAAATGAAGAAAATGAG
AACAAAAGAGAAGCATCAGATCTTCCTATTCAATGAAATAGAATCATCACACCCAAAACA
AAAGAATGAGTATTCAGCCATTTCGAATGTTCATCATTTGAACCTCTCTCTCCAAATCTC
TACACAAAACACAATCACACAGAAAGCAACAAAGATCAAAAAATAATAATAATAGTACAA
AAAAGGAACCTTTTCAAACCCAGAAACTGAAAACGAAGAAGAAGAAGAGAGCTACGGCCA
CTATAAACTAGGGTTTTAAATTTGTGCGAAACCGACCCCAATATCCCCTTTTATAACAAA
AATTTCCTGACTGGTTTTGATTGTAATCCGACGGCTGAGATTTAATACCGCCCTGGTCAT
AAACTCGCTCTCACAGACAAGTTTCATAATGCCACGTCGCCCACAGAATAGACTCGCAAG
ATATAGAAAAAACGCGTGTACGCGTCTACGCGGCATACATAGGGTGGGCATCTCGGCCCA
ATCCAGTCCGATTGTTTTTAATAGATTGAATTAAATTAGATCTTAAAAAATTGGGTTGGA
TTGGGTTATACTTGAAAATTAAATTAGGTCTGATTGAGTTGAAAAATTTTCGGCTCCACC
CAATAAACGGTCCTACTTAATTTTAAATTTAAAATTTTCTCATCTTTCTGAAGAACACTT
GTTAGGGATGAAGATTAATGACAGTTTCTATGATAGATTGAATCTTTTATTCATAATCAT
TGAATTTTAGTTTGTACTCGTTATATTTGTAATCAAATAGTCAAGACTATAAAAATTAGA
CTTTTGTGTCTTTACCATGGATTAAATCTAATTCAATCAATTCAATTTAATCCAAATCGA
CTATTAGTAGGTTTGATTGGGTTGGGTTAAAGAATTTTCAATCCAACCCACCTTGAGTTG
AGAGATTTCAAACCAAATCCAACCCGAACTTGAAAACGTCCATCCCTAGGCACCCTAGCA
CTTTTTTTTTTTTTTTGACATTCTCTAAATTGTTATTTGTTCTTTTAATTTTTTAAATTT
GACCAAAAATTATTAAAAAAAATTAAAAATCCAGTCTTGTCGCTATAAACACGCCTTGTG
TGCCGGTCTCGGCAATTTTAAGGTAGCACACAGATTTTAATTAATTAATCTAATTTTTAA
CTTTATCCAAAACTTGGCAAGCTTGTAAAACATTCGTGTCATGACTACTCATCCCTCCAT
GTCTGTGCCAGACTCACTTGATATACTTGTCACTCAGTTGCCTTGTACAGCCGTCACTTT
CCATGTTTATGGATTCATTGTATGCACTCAAACCTGTAACCGCCAAACACAAACACTCTG
GCAATACAATCCATCATAGATGCATTTCTCAACGTTCCTGTTTTATATATACATGCTACA
GTCTCAGAATTTTTAGGATTCTAATCAGACTCAGAGCAATATAGAGTGAGTAGTGAGTGA
GTGATCAAGCAGTTGCCAAC
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>LITCHI010169.m1 GenomeSequence - 
ATGCAGGGAACGAGTCGAATGGAAGCTCCAGTCTACAACAACTATTCAACAGGTGGTGAG
AGTAGCAGGATAACAACAGGTATTCCTCTATCGCACCCGAACAATCCTCAGGTGATGTTC
GCTTCACGTCCGCATTTGAATCCAAATGCGAACATGAGGCCGACATCGTCATCGCATTAT
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TTGACTATTAATGATAATACTAATAATTACCATTATTATCATCATGAGACACCGTCACCT
TTTGTCGTTGTCAACCAGAGCTTGACAAACAATGTTGTGTCGTCTAGTGTCGAAGGAGGA
GCTGGTAGTTATGTCGCTAACCAGAGCTTGACTAACAATGTCGTGTCGAGTACCGTGGAA
GGAACAGCTGGTAATTATTCACATGGATTATTATCGGCTACTCCTCCTCCTCCTCCTCCT
CCAGTTGTTGTTGGTGGTGGTGGTTGTGAGAATTTGCCGCCAAGAAAAGGACATAGACGG
TGTTTTAGTGACAGTCCGTTGGGATATTCGATGCTTGCGTCATCGCCTCAGCTGGTGCCT
ATAGGGATGAGTAGTAGAGGGGAGAGTAGTTCGGTGAGTCAGAGCGTGAACGTGGAAGGC
TTGTTTATGGGAGAGGGGATGTCGGAAGATGAGATAGTGGAGGATTTGATGAGTGAATAC
ATGAATATGGAGTATGTTGACGTGTTTGATTGTGGTAGTGTTTCGAAGGTGAATGGAGGA
GGGGAGAGCAGTGATAATGAGGTGGAGAGTGGTGGGATTTTGAATGGGGGTGGTTCGAGT
GAGAGGAGGGAGGGAGTTAATAAGAGGAGTGCCGATGGGGATATCGGTCTGACTGCTGGT
GGCCATTACAGGAGCGTGTCCGTCGATAGTTATTTGGAGTTTTTGGATTTTGATTTTGAC
GATGATGGTGTAGCAAAGGTTCCTGTGCAAGCAGGAGGTCAGGTCGTTGAGCAAGTTTCG
CCTGGCGGTGTGGTTGGTGAGAGATTAGCTATGTTGAGAATGAAGTTGAATAGGGAACTA
TCTGAAGATGAACTGAGAAAGATTGCGGCAAATGATAAGCTCACTCAGATTGCGTTTGTG
GATCCCAGGCGTGCCAAAAGGTGGTGTTGTGCATTTGACTTTTGCATGAGATGATCATGT
TTGTGAATGGAGTTACATTAGGTTTGTTTTTCTCATTGTTTGATGTGTTTGTTTGTAGGA
TTCTGGCTAATCGTCAATCAGCTGCACGTTCCAAGGAGCGGAAGGTACGATACATTGCAG
AGTTGGAGCAAAAGGTGAAGACTTTAATGGCAGAGACGAACACATTAAATACTAAGTATG
CAACGTTACAGGTGGACATCTACAGCTTTGATAATTTTCATAGTTATCATCTTAGTGCTA
TGTTTCGTTTAGTTTTGTTAACAGTTAACTTCTTGGTTCTGTTAACCTCTTGTTTGTTTA
CAGAAAGATTCAGAGGAAGTTATAAAAATAAACAAGGAAATGAAATTCCGTCTTGAGGCC
ATGGACCAAGAGGTTAAACTCAAAGATGGTATTAAGTTTTTTCCTTTTTAATTGCCCTCA
TTTTATACATTACTATATTCAAACTGTTCTTATTGCGATATTTGCGGAACACTTAATTTG
TGTGACATATCATAATAGTAGGAATTTCCGTTCTCAGTTTGTTTTGCTGCGTTTGTTTAG
AAAGTTCTTTTAGGGTTTAAGGATAACCCAAAATTCCCTTTTTGATAAATTTTGAGATTT
GCTTGTTTTGATTGATTTAGAAGTCTTAGTCTTAGTTGGATTAGGTTTTTTTTCCTCCCT
ATGTAAGCGAATATTTGAAACATAATTGTTAGTTTTCAAAATATTAATATTGTTTATCAC
TCTTGTCATGAATGTAATTCTCCCCTTAACAGAATTTTTGTGGATGCAATTGTTAGATCT
ACTTGAGGAGCTATTAGTCCCTAGTCCAAAATGATAGTAACCATCCAGCTTGACTCTAGC
TATACTTTTTACTTGTATGGTTTATTTAGACTTGAAATTTTGTCTACACCCAAGCCAATT
CTACAAACGTAGTAGCTTCTGTCGACTTAGCTGCATTTTGCTTGAGATTTATCTCCACGG
TGTTTTTGTGCTTGTCTCAACTAGTTTTGAATGTACATGTCCAAGTTCTATAACATCATT
TCGGTAAATGTATGTTGCTTTACTGCTATAATTATCTGCTCCTATTCTCAACATTGGTGA
ATAATTTTTTGTATCATCATGTAATTATAGATGGAATGTCTATTAATTATCCCAGTATGT
TCTATTTATAACGCGCATAAACAACACATGATTTTCTTGGTTTAACTCGAGTGATTGACG
ATTGTCTATATATTAAGCTGATGATTATAATGTGCATTTGTTCATCATGTAGAGACTAGT
CCTTACTCCTGAAATGGTTTACTTGTTTCTGATTTAAAACATAAGCATTAGTGCTTAATG
CAGTTGTGATATTGTTTAATTTTCTTGGTTTAACTTCAGTAGTTGGTACATGCATGAAGT
TCCTGAAAGTTCTTGCTATTGAGTAGAAATGAATCTTGTTGAATTTTACATGCTTTGCTT
TTCCTGTTATGATTAATTTAAAATATTCCAGTATAGGAGAGTGTATTTTTTATTAGCCCT
GGCAACTACCTGTATATGCACTAGTTTAGCTCATTACTACTCTAGCAGTTCGATCATCGA
GGGCATCATGTGTGCTAGTTTCCTCTTGCTAGTGCGATTTTCACATCTAAATGCTGCTTA
GTGTGGCTTGTCTAATTACATTTTCGTTTTCATAATTTATCACACCATCTTAGAATCATG
CTTATTACGTTGTTTGTCTTTGGCATAAAACATTCATTCTCTTTACTTTTTTTATTTGAT
AGCTTTAAACGAATCATTAAATGCGGAACTCGAAAGAATGAAGCTCGAGATGAACGGAAT
GGCCCAGTTCTCAAGGTTGCTGGCTCAGCAACTTTCCCTCAATAATCAGATTCTCCAAAA
TCAGCATCTGCATTTGGTCTTACCCAACATCTACCAGTTGCAACAGCAGCAACAGGACCT
TCTGCCTAACCAGTTTCAACAGCTGCCTCAACCTAACCTGTTCCAACTGCAGCAACAGAA
TCCTGAGTCTTACCAGTTGCAACTTCAGCAGCAGACTCAGCCTAACCAGTTGCAACCTGA
GCTGCAGAATGGTGAGGCTGCTATAGCTGAGTGAAGTAGTAGACTTCCAAATTGGCTGTG
AAATTCTGTTTGATTCATTGCCTGCAACAATCTAATCATAAGTATCATTTATATCTTATT
GAACATCAGTTGACCATTGTTATGTTCGTGGGTTGGTTTTTCTTGTCCAGACTACAGACT
TGAAGCTAGACTCTACCCTGTTCATTCATTTGTCAGCAACAATGTTCTAGTTTTACATTT
TTTTGGACAAGATTGATCTTTCAGTTTCGATAAATAAATATTAAAAATGTTGGTA